Publications HAL

2018

Journal articles

auteur
Cinzia Di Giusto, Franck Delaplace, Jean-Louis Giavitto, Hanna Klaudel, Antoine Spicher, Anna Gambin, Monika Heiner
titre
Activity Networks with Delays an Application to Toxicity Analysis
article
Fundamenta Informaticae, Polskie Towarzystwo Matematyczne, 2018, 160 (1-2), pp.119 - 142. 〈10.3233/FI-2018-1677〉
Accès au bibtex
BibTex

2017

Conference papers

auteur
Pierre Donat-Bouillud, Jean-Louis Giavitto
titre
Typing heterogeneous dataflow graphs for static buffering and scheduling
article
ICMC 2017 - 43rd International Computer Music Conference, Oct 2017, Shanghai, China. Proceedings of the 43rd International Computer Music Conference 〈http://www.icmc2017.com〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01585489/file/antescofo_icmc2017.pdf BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto, José-Manuel Echeveste, Arshia Cont, Philippe Cuvillier
titre
Time, Timelines and Temporal Scopes in the Antescofo DSL v1.0
article
International Computer Music Conference (ICMC), Oct 2017, Shanghai, China. ISBN 978-0-0845274-6-5, Prooceedings of the 2017 ICMC / EMS conférence : Hearing the self. 〈http://www.icmc2017.com〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01638115/file/antescofo_dsl_v2.pdf BibTex

Book sections

auteur
Antoine Spicher, Jean-Louis Giavitto
titre
Interaction-based Programming in MGS
article
Andrew Adamatzky. Advances in Unconventional Computing - Volume 1: Theory, 22, Springer, pp.305-342, 2017, Series: Emergence, Complexity and Computation, 978-3-319-33923-8. 〈10.1007/978-3-319-33924-5〉. 〈http://link.springer.com/book/10.1007%2F978-3-319-33924-5〉
Accès au bibtex
BibTex

2016

Journal articles

auteur
Jonathan Pascalie, Martin Potier, Taras Kowaliw, Jean-Louis Giavitto, Olivier Michel, Antoine Spicher, René Doursat
titre
Developmental Design of Synthetic Bacterial Architectures by Morphogenetic Engineering
article
ACS Synthetic Biology, American Chemical Society, 2016, 5 (8), pp.842-861. 〈10.1021/acssynbio.5b00246〉
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Nicolás Schmidt Gubbins, Arshia Cont, Jean-Louis Giavitto
titre
First steps toward embedding real-time audio computing in Antescofo
article
Journal de Investigación de Pregado (Investigación, Interdisciplina, Innovación), Pontificia Universidad Católica de Chile, 2016, 6, 〈http://web.ing.puc.cl/~ipre/site/journal〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01257524/file/Schmidt%20et%20al%202015-1.pdf BibTex

Conference papers

auteur
Pierre Donat-Bouillud, Jean-Louis Giavitto, Arshia Cont, Nicolas Schmidt, Yann Orlarey
titre
Embedding native audio-processing in a score following system with quasi sample accuracy
article
ICMC 2016 - 42th International Computer Music Conference, Sep 2016, Utrecht, Netherlands. 〈http://www.icmc2016.com/〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01349524/file/antescofo_ICMC2016.pdf BibTex

Book sections

auteur
Jean-Louis Giavitto, Antoine Spicher
titre
A Topological Approach of Musical Relationships
article
Jordan B L Smith (National Institute for Advanced Industrial Research and Technology (AIST) Japan); Elaine Chew (Queen Mary University of London, UK); Gérard Assayag (IRCAM - UMPC - CNRS, Science and Technology of Music and Sound Lab, France). Mathemusical Conversations - Mathematics and Computation in Music Performance and Composition, Lecture Notes Series, Institute for Mathematical Sciences, National University of Singapore (32), World Scientific, pp.283--298, 2016, 978-981-3140-09-7 〈http://www.worldscientific.com/worldscibooks/10.1142/10046〉
Accès au bibtex
BibTex

Reports

auteur
Franck Delaplace, Cinzia Di Giusto, Jean-Louis Giavitto, Hanna Klaudel
titre
Activity Networks with Delays An application to toxicity analysis
article
[Research Report] Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia-Antipolis (I3S) / Equipe BIOINFO MDSC - Modèles Discrets pour les Systèmes Complexes. 2016
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01152719/file/journal.pdf BibTex

2015

Journal articles

auteur
Anton Freund, Moreno Andreatta, Jean-Louis Giavitto
titre
Lattice-based and topological representations of binary relations with an application to music
article
Annals of Mathematics and Artificial Intelligence, Springer Verlag, 2015, 73 (3-4), pp.311-334. 〈http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10472-014-9445-3〉. 〈10.1007/s10472-014-9445-3〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01256854/file/FCA_and_simplicial_complexes-v3_versionHAL.pdf BibTex

Conference papers

auteur
Jean-Louis Giavitto
titre
A topological approach of musical relationships
article
Mathemusical Conversations, Feb 2015, Singapour, Singapore. 〈https://sites.google.com/site/mathemusicalconversations/〉
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jonathan Pascalie, Martin Potier, Taras Kowaliw, Jean-Louis Giavitto, Olivier Michel, Antoine Spicher, René Doursat
titre
Spatial Computing in Synthetic Bioware: Creating Bacterial Architectures
article
13th European Conference on Artificial Life (ECAL 2015), Jul 2015, York, United Kingdom. MIT Press, 2015, Proceedings of the 13th European Conference on Artificial Life (ECAL'2015). 〈10.7551/978-0-262-33027-5-ch115〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01257528/file/978-0-262-33027-5-ch115.pdf BibTex
auteur
Iris Yuping Ren, René Doursat, Jean-Louis Giavitto
titre
Synchronization in Music Group Playing
article
Mitsuko Aramaki; Richard Kronland-Martinet; Sølvi Ystad. International Symposium on Computer Music Multidisciplinary Research (CMMR), Jun 2015, Plymouth, United Kingdom. Springer, http://cmr.soc.plymouth.ac.uk/cmmr2015, 510--517 (in electronic proceedings), Lecture Note in Computer Science. 〈http://cmr.soc.plymouth.ac.uk/cmmr2015/〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01257540/file/ren_doursat_giavitto%20-%20Synchronization%20in%20Music%20Group%20Playing%20-%20final_in_proceedings.pdf BibTex

2014

Journal articles

auteur
Jean Bresson, Jean-Louis Giavitto
titre
A Reactive Extension of the OpenMusic Visual Programming Language
article
Journal of Visual Languages and Computing, Elsevier, 2014, 25 (4), pp.363-375. 〈10.1016/j.jvlc.2014.03.003〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00965747/file/om-reactif-jvlc-personal.pdf BibTex

Conference papers

auteur
Thomas Coffy, Jean-Louis Giavitto, Arshia Cont
titre
AscoGraph: A User Interface for Sequencing and Score Following for Interactive Music
article
ICMC 2014 - 40th International Computer Music Conference, Sep 2014, Athens, Greece. 2014
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01024865/file/icmcsmc2014ascograph.pdf BibTex
auteur
Arshia Cont, José Echeveste, Jean-Louis Giavitto
titre
The Cyber-Physical System Approach for Automatic Music Accompaniment in Antescofo
article
Acoustical Society Of America, May 2014, Providence, Rhode Island, United States. 2014
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto, José Echeveste
titre
Real-Time Matching of Antescofo Temporal Patterns
article
PPDP 2014 - 16th International Symposium on Principles and Practice of Declarative Programming, Sep 2014, Canterbury, United Kingdom. ACM, pp. 93-104 2014, 〈10.1145/2643135.2643158〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01054667/file/ppdp-declarative-pattern-version-Hal.pdf BibTex
auteur
Jérôme Nika, José-Manuel Echeveste, Marc Chemillier, Jean-Louis Giavitto
titre
Planning Human-Computer Improvisation
article
International Computer Music Conference, Sep 2014, Athens, Greece. 2014, 〈http://icmc14-smc14.net〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01053834/file/NIka_Revised2.pdf BibTex

Book sections

auteur
Jean-Louis Giavitto
titre
Du temps écrits au temps produit en informatique musicale
article
Hugues Vinet. Produire le temps, Hermann, pp.73-106, 2014, 978 2 7056 8818 9
Accès au bibtex
BibTex

Directions of work or proceedings

auteur
Laurence Duchien, Jean-Louis Giavitto
titre
Editorial
article
Laurence Duchien and Jean-Louis Giavitto. 33, Technique et Science Informatiques, pp.4, 2014, 3
Accès au bibtex
BibTex

Reports

auteur
Jean Bresson, Jean-Louis Giavitto
titre
Specification of a reactive computation model for OpenMusic
article
[Research Report] IRCAM. 2014, pp.17
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00959312/file/inedit-L3.3.b.pdf BibTex

2013

Journal articles

auteur
José Echeveste, Arshia Cont, Jean-Louis Giavitto, Florent Jacquemard
titre
Operational semantics of a domain specific language for real time musician-computer interaction
article
Discrete Event Dynamic Systems, Springer Verlag, 2013, 23 (4), pp.343-383. 〈http://dx.doi.org/10.1007/s10626-013-0166-2〉. 〈10.1007/s10626-013-0166-2〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00854719/file/10.1007_s10626-013-0166-2.pdf BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto
titre
Rencontres nationales des systèmes complexes 2012 - Entretiens de Sète
article
Natures Sciences Sociétés, EDP Sciences, 2013, 21 (3), pp.320-324. 〈10.1051/nss/2013113〉
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto, Olivier Michel, Antoine Spicher
titre
Unconventional and Nested Computations in Spatial Computing
article
International Journal of Unconventional Computing, Old City Publishing, 2013, 9 (1-2), pp.71-95
Accès au bibtex
BibTex

Conference papers

auteur
Louis Bigo, Jean-Louis Giavitto, Moreno Andreatta, Olivier Michel, Antoine Spicher
titre
Computation and Visualization of Musical Structures in Chord-Based Simplicial Complexes
article
Jason Yust and Jonathan Wild and John Ashley Burgoyne. MCM 2013 - 4th International Conference Mathematics and Computation in Music, Jun 2013, Montreal, Canada. Springer, 7937, pp.38-51, 2013, Lecture notes in computer science. 〈10.1007/978-3-642-39357-0_3〉
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Louis Bigo, Jean-Louis Giavitto, Antoine Spicher
titre
Spatial Programming for Musical Transformations and Harmonization
article
Spatial Computing Workshiop (SCW), May 2013, Saint-Paul, Minesota, United States. p. 9-16, 2013, AAMAS satellite workshop W09
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Arshia Cont, Jean-Louis Giavitto, Florent Jacquemard
titre
From Authored to Produced Time in Computer-Musician Interactions
article
CHI 2013 Workshop on Avec le Temps! Time, Tempo, and Turns in Human-Computer Interaction, Apr 2013, Paris, France. ACM, 2013
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00787033/file/Mutant_CHIM_2013.pdf BibTex

Book sections

auteur
Jean-Louis Giavitto, Olivier Michel, Antoine Spicher
titre
Interaction−Based Modeling of Morphogenesis in MGS
article
R. Doursat and H. Sayama. Morphogenetic Engineering, Springer, pp.409-440, 2013, Understanding Complex Systems, 978-3-642-33901-1. 〈10.1007/978-3-642-33902-8_16〉
Accès au bibtex
BibTex

Books

auteur
Jean-Louis Giavitto, Stefan Dulman, Antoine Spicher, Mirko Viroli
titre
Proceedings of the Spatial Computing Workshop (SCW 2013) colocated with AAMAS (W09)
article
IFAMAAS (International Foundation for Autonomous Agents and Multiagent Systems), pp.92, 2013
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00821901/file/corrected_prooceedings-workshop-9_spatial-computing.pdf BibTex

Reports

auteur
José Echeveste, Jean-Louis Giavitto, Arshia Cont
titre
A Dynamic Timed-Language for Computer-Human Musical Interaction
article
[Research Report] RR-8422, INRIA. 2013
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00917469/file/RR-8422.pdf BibTex

2012

Journal articles

auteur
Jean-Louis Giavitto, François Rechenmann
titre
Sous le signe du calcul
article
Interstices, INRIA, 2012, 〈https://interstices.info/jcms/int_69639/sous-le-signe-du-calcul〉
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto, Joanna Jongwane
titre
À propos des nouveaux langages de programmation
article
Interstices, INRIA, 2012
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto, François Reichenmann
titre
Sous le signe du calcul
article
DocSciences, CRDP Versailles, 2012, 14 (Alan Turing : la pensée informatique), pp.12-15
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00769278/file/docsciences-turing_draft_giavitto_rechenmann.pdf BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto, Hanna Klaudel, Franck Pommereau
titre
Integrated Regulatory Networks (IRNs): Spatially organized biochemical modules
article
Theoretical Computer Science, Elsevier, 2012, 431, pp.219--234. 〈10.1016/j.tcs.2011.12.054〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00769275/file/giavitto_klaudel_pommereau-integrated_regulatory_network.pdf BibTex

Conference papers

auteur
Arshia Cont, José Echeveste, Jean-Louis Giavitto, Florent Jacquemard
titre
Correct Automatic Accompaniment Despite Machine Listening or Human Errors in Antescofo
article
ICMC 2012 - International Computer Music Conference, Sep 2012, Ljubljana, Slovenia. 2012
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00718854/file/Antescofo_ICMC2012_new.pdf BibTex
auteur
Antoine Spicher, Olivier Michel, Jean-Louis Giavitto
titre
Arbitrary Nesting of Spatial Computations
article
IFAMAAS (International Foundation for Autonomous Agents and Multiagent Systems). Spatial Computing Workshop, Jun 2012, Valencia, Spain. pp.25-32, 2012
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00769286/file/spicher_michel_giavitto_arbitrary_nesting_of_spatial_computations.pdf.pdf BibTex
auteur
Antoine Spicher, Olivier Michel, Jean-Louis Giavitto
titre
Spatial Computing in MGS
article
Jérôme Durand-Lose, Nataša Jonoska. 11th International Conference Unconventional Computation & Natural Computation (UCNC 2012)., Sep 2012, Orléans, France. Springer, 7445, pp.63-69, 2012, 〈10.1007/978-3-642-32894-7_7〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00769284/file/spicher_michel_giavitto_spatial_computing_in_mgs-1.pdf BibTex
auteur
Susan Stepney, Ada Diaconescu, René Doursat, Jean-Louis Giavitto, Taras Kowaliw, Ottoline Leyser, Bruce Maclennan, Olivier Michel, Julian Miller, Igor Nikolic, Antoine Spicher, Christof Teuscher, Gunnar Tufte, Francisco Vico, Lidia Yamamoto
titre
Gardening Cyber-Physical Systems
article
Unconventionnal Computation and Natural Computation (UCNC'2012), Sep 2012, Orléans, France. pp.1-1, 2012
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01161014/file/index.pdf BibTex

Books

auteur
Jacob Beal, Stefan Dulman, Jean-Louis Giavitto, Antoine Spicher
titre
Proceedings of the Spatial Computing Workshop (SCW 2012) colocated with AAMAS (W21)
article
IFAMAAS (International Foundation for Autonomous Agents and Multiagent Systems), pp.60, 2012
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00769288/file/w21_workshop_on_spatial_computing_scw_proceedings_2012.pdf BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto, Jacob Beal, Stefan Dulman, Antoine Spicher
titre
Proceedings of the Int. Workshop on Spatial Computing (SCW 2012)
article
IFAMAAS (International Foundation for Autonomous Agents and Multiagent Systems). pp.1-1, 2012
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01161006/file/index.pdf BibTex

2011

Journal articles

auteur
Jean-Louis Giavitto
titre
Calculer différemment
article
Interstices, INRIA, 2011, 〈https://interstices.info/jcms/i_58661/calculer-differemment〉
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Vic Norris, Abdallah Zemirline, Patrick Amar, Jean Nicolas Audinot, Pascal Ballet, Eshel Ben-Jacob, Gilles Bernot, Guillaume Beslon, Armelle Cabin, Eric Fanchon, Jean-Louis Giavitto, Nicolas Glade, Patrick Greussay, Yohann Grondin, James A Foster, Guillaume Hutzler, Jürgen Jost, Francois Kepes, Olivier Michel, Franck Molina, Jacqueline Signorini, Pasquale Stano, Alain R Thierry
titre
Computing with bacterial constituents, cells and populations: from bioputing to bactoputing
article
Theorie in den Biowissenschaften / Theory in Biosciences, Springer Verlag, 2011, 130 (3), pp.211-228. 〈10.1007/s12064-010-0118-4〉
Accès au bibtex
BibTex

Conference papers

auteur
Louis Bigo, Jean-Louis Giavitto, Antoine Spicher
titre
Building Topological Spaces for Musical Objects
article
Mathematics and Computation in Music, Jun 2011, Paris, France. pp.1-1, 2011
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01161290/file/index.pdf BibTex
auteur
Antoine Dautriche, Jean-Louis Giavitto, Hanna Klaudel, Franck Pommereau
titre
State space exploration of spatially organized populations of agents
article
5th IEEE Conference on Self-Adaptive and Self-Organizing Systems Workshops (SASOW 2011), Oct 2011, Ann Arbor, MI, United States. pp.79-84, 2011, 〈10.1109/SASOW.2011.9〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00745245/file/scw2011_dautriche_giavitto_klaudel_pommereau.pdf BibTex
auteur
José Echeveste, Arshia Cont, Jean-Louis Giavitto, Florent Jacquemard
titre
Formalisation des relations temporelles dans un contexte d'accompagnement musical automatique
article
Hermès. 8e Colloque sur la Modélisation des Systèmes Réactifs (MSR'11), Nov 2011, Lille, France. 45, pp.109-124, 2011
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00642921/file/AMA_MSR.pdf BibTex
auteur
José Echeveste, Arshia Cont, Florent Jacquemard, Jean-Louis Giavitto
titre
Formalisation des relations temporelles entre une partition et une performance musicale dans un contexte d’accompagnement automatique
article
Modélisation des systèmes réactifs (MSR 11), Nov 2011, Lille, France. pp.109-124, 2011
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01156639/file/index.pdf BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto, Antoine Spicher
titre
MGS, a declarative spatial computing programming language
article
New World Of Computation 2011, May 2011, Orléans, France. 2011
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto
titre
The Modeling and the Simulation of the Fluid Machines of Synthetic Biology
article
Revised and Selected papers of the Twelfth International Conference on Membrane Computing (CMC12), Aug 2011, Fontainebleau, France. pp.17-32, 2012
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01161007/file/index.pdf BibTex

Book sections

auteur
Jean-Louis Giavitto
titre
Calculer différemment
article
Interstices (http://interstices.info). Interstices, un site web de vulgarisation dédié à l'Informatique, 2011
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto, Antoine Spicher
titre
Computer Morphogenesis
article
Springer. Morphogenesis, Origins of Patterns and Shapes, pp.315-340, 2011
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Antoine Spicher, Olivier Michel, Jean-Louis Giavitto
titre
Interaction-Based Simulations for Integrative Spatial Systems Biology
article
W. Dubitzky, J Southgate and H. Fuss. Understanding the Dynamics of Biological Systems: Lessons Learned from Integrative Systems Biology, SpringeVerlag Berlin, Heidelberg, pp.195--231, 2011, 〈10.1007/978-1-4419-7964-3_10〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00645911/file/ibss.pdf BibTex

2010

Journal articles

auteur
Jean-Louis Giavitto
titre
Des calculateurs universels
article
Interstices, INRIA, 2010, 〈https://interstices.info/jcms/i_57108/des-calculateurs-universels〉
Accès au bibtex
BibTex

Conference papers

auteur
Pascal Fradet, Jean-Louis Giavitto, Marnes Hoff
titre
Refinement of Chemical Programs using Strategies
article
International workshop on strategies in rewriting, proving and programming, Jul 2010, Edimburg, United Kingdom. 2010
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto, Hanna Klaudel, Franck Pommereau
titre
Qualitative modelling and analysis of regulations in multi-cellular systems using Petri nets and topological collections
article
4th Workshop on Membrane Computing and Biologically Inspired Process Calculi (MeCBIC 2010), Aug 2010, Jena, Germany. (elec. proc.), 2010, 〈10.4204/EPTCS.40.11〉
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto
titre
A domain specific language for complex natural and artificial systems simulations
article
10th Workshop on Language Descriptions, Tools and Applications (LDTA 2010), Mar 2010, Paphos, Cyprus. (elec. proc), 2010, 〈10.1145/1868281.1868282〉
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Antoine Spicher, Olivier Michel, Jean-Louis Giavitto
titre
Spatial computing as intensional data parallelism
article
4th IEEE International Conference on Self-Adaptive and Self-Organizing Systems Workshop (SASOW 2010), Sep 2010, Budapest, Hungary. pp.196--205, 2010, 〈10.1109/SASOW.2010.73〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00869214/file/spatial-computing09.pdf BibTex
auteur
Antoine Spicher, Olivier Michel, Jean-Louis Giavitto
titre
Declarative mesh subdivision using topological rewriting in MGS
article
5th International Conference on Graph Transformations (ICGT 2010), Sep 2010, Enschede, Netherlands. 6372, pp.298--313, 2010, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-15928-2_20〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00820206/file/spicher_michel_giavitto-icgt2010.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

auteur
Julien Cohen, Jean-Louis Giavitto, Olivier Michel
titre
Variable elimination for building interpreters
article
33 pages. 2010
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00482002/file/article.pdf BibTex

2009

Journal articles

auteur
Jean-Louis Giavitto
titre
Le calcul, une notion difficile à attraper
article
Interstices, INRIA, 2009, 〈https://interstices.info/jcms/c_36733/le-calcul-une-notion-difficile-a-attraper〉
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Olivier Michel, Antoine Spicher, Jean-Louis Giavitto
titre
Rule-based programming for integrative biological modeling Application to the modeling of the λ phage genetic switch
article
Natural Computing, Springer Verlag, 2009, 8 (4), pp.25. 〈10.1007/s11047-008-9105-9〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00644440/file/naco09.pdf BibTex

Other publications

auteur
David Chavalarias, Paul Bourgine, Edith Perrier, Fréderic Amblard, François Arlabosse, Pierre Auger, Jean-Bernard Baillon, Olivier Barreteau, Pierre Baudot, Elisabeth Bouchaud, Soufian Ben Amor, Hugues Berry, Cyrille Bertelle, Marc Berthod, Guillaume Beslon, Giulio Biroli, Daniel Bonamy, Daniele Bourcier, Nicolas Brodu, Marc Bui, Yves Burnod, Bertrand Chapron, Catherine Christophe, Bruno Clément, Jean-Louis Coatrieux, Jean-Philippe Cointet, Valérie Dagrain, Katia Dauchot, Olivier Dauchot, François Daviaud, Silvia De Monte, Guillaume Deffuant, Pierre Degond, Jean-Paul Delahaye, René Doursat, Francesco D'Ovidio, Marc Dubois, Berengère Dubruelle, Marie Dutreix, Robert Faivre, Emmanuel Farge, Patrick Flandrin, Sara Franceschelli, Cédric Gaucherel, Jean-Pierre Gaudin, Michael Ghil, Jean-Louis Giavitto, Francesco Ginelli, Vincent Ginot, François Houllier, Bernard Hubert, Pablo Jensen, Ludovic Jullien, Zoi Kapoula, Daniel Krob, François Ladieu, Gabriel Lang, Chrsitophe Lavelle, André Le Bivic, Jean-Pierre Leca, Christophe Lecerf, Pierre Legrain, Denis L'Hôte, Maud Loireau, Jean-Francois Mangin, Olivier Monga, Michel Morvan, Jean-Pierre Muller, Ioan Negrutiu, Nadine Peyreiras, Denise Pumain, Ovidiu Radulescu, Jean Sallantin, Eric Sanchis, D Schertzer, Marc Schoenauer, Michèle Sebag, Eric Simonet, Adrien Six, Fabien Tarissan, Patrick Vincent
titre
French Roadmap for complex Systems 2008-2009
article
This second issue of the French Complex Systems Roadmap by the French National Network for Comple.. 2009
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00392486/file/FrenchCSRoadMap2008-2009HalVersion.pdf BibTex

2008

Journal articles

auteur
Jean-Louis Giavitto, Antoine Spicher
titre
Topological Rewriting and the Geometrization of Programming
article
Physica D: Nonlinear Phenomena, Elsevier, 2008, 237 (9), pp.1302--1314. 〈10.1016/j.physd.2008.03.039〉
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Christophe Lavelle, Hugues Berry, Guillaume Beslon, Francisco Ginelli, Jean-Louis Giavitto, Zoi Kapoula, André Le Bivic, Nadine Peyriéras, Ovidiu Radulescu, Adrien Six, Véronique Thomas-Vaslin, Paul Bourgine
titre
From Molecules to Organisms: Towards Multiscale Integrated Models of Biological Systems
article
Theoretical Biology Insights, Libertas Academica, 2008, 1, pp.13-22
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Antoine Spicher, Olivier Michel, Mikolaj Cieslak, Jean-Louis Giavitto, Przemyslaw Prusinkiewicz
titre
Stochastic P systems and the simulation of biochemical processes with dynamic compartments
article
BioSystems, Elsevier, 2008, 91 (3), pp.458--472. 〈10.1016/j.biosystems.2006.12.009〉
Accès au bibtex
BibTex

Conference papers

auteur
Jean-Louis Giavitto
titre
Modelling and simulation of dynamical systems with a dynamical structure
article
FoodSim'08, Jun 2008, Dublin, Ireland. pp.5--6, 2008
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto, Olivier Michel
titre
Topological Structure of Interactions
article
1st European Workshop on Correlations in Computer Science, Aug 2008, Vielsalm, Belgium. (elec. proc.), 2008
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto, Olivier Michel
titre
Topologie combinatoire et programmation
article
Rencontre toulousaine graphes et topologie, Jun 2008, Toulouse, France. (elec. proc.), 2008
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto
titre
Ça se calcule, c'est un calcul, parce que ça calcule. In La thèse de Church: hier, aujourd'hui, demain - Regards croisés de philosophes et de théoriciens du calcul
article
Colloque d'Histoire et Philosophie de l'informatique, Apr 2008, Paris, France. (elec. proc.), 2008
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Victor Norris, Abdallah Zemirline, Patrick Amar, Pascal Ballet, Eshel Ben Jacob, Gilles Bernot, Guillaume Beslon, Eric Fanchon, Jean-Louis Giavitto, Nicolas Glade, Patrick Greussay, Yohann Grondin, James A. Foster, Guillaume Hutzler, François Képès, Olivier Michel, Gradimir Misevic, Franck Molina, Jacqueline Signorini, Pasquale Stano, Alain Thierry
titre
From bioputing to bactoputing: computing with bacteria
article
Proceedings of the Lille Spring School on Modelling Complex Biological Systems in the Context of Genomics, 2008, France
Accès au bibtex
BibTex

Book sections

auteur
Jean-Louis Giavitto, Antoine Spicher
titre
Simulation of self-assembly processes using abstract reduction systems
article
Krasnogor, Natalio and Gustafson, Steve and Pelta, David and Verdegay, Jose L. Systems Self-Assembly: multidisciplinary snapshots, Elsevier, pp.199--225, 2008
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto, Olivier Michel, Antoine Spicher
titre
Spatial Organization of the Chemical Paradigm and the Specification of Autonomic Systems
article
M. Wirsing, J. Banâtre, M. Hölzl, A. Rauschmayer. Software-Intensive Systems and New Computing Paradigms, Springer Verlag Berlin, Heidelberg, pp.235--254, 2008, Lecture Notes in Computer Science, vol. 5380, 〈10.1007/978-3-540-89437-7_15〉
Accès au bibtex
BibTex

2007

Conference papers

auteur
Jean-Louis Giavitto
titre
Spatial Computing
article
InterLink workshop. Working group on "Software Intensive Systems and New Computing Paradigms", 2007, France. pp.ERREUR_CHAMPS_NON_SPECIFIE, 2007
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto
titre
Spatial Programming and Autonomic Computing
article
InterLink workshop. Working group on "Software Intensive Systems and New Computing Paradigms", 2007, Munchen, Germany. pp.n.a., 2007
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto
titre
The Chemical Paradigm, Programming in Space and the Implementation of Autonomic Systems
article
Unconventional computation: Quo Vadis, 2007, United States. pp.n.a., 2007
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto
titre
Programming language, distributed computing and the reconstruction of biological systems in What are the theoretical tools most useful for understanding biological systems ?
article
colloque de l'IHES, 2007, France. pp.(Elec. Proc.), 2007
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Aurélien Hazan, Vincent Vigneron, Jean-Louis Giavitto, Olivier Michel, Hichem Maaref
titre
A relationist and descriptive approach to stationary time series
article
Proceedings of the European Conference on Complex Systems (ECCS07), 2007, Dresden, Germany. pp.n.a., 2007
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Olivier Michel, Jean-Louis Giavitto
titre
Incremental Extension of a Domain Specific Language Interpreter
article
19th International Symposium on Implementation and Application of Functional Languages (IFL 2007), Sep 2007, Freiburg, Germany. (elec. proc.), 2007
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00945006/file/ifl07.pdf BibTex

2006

Journal articles

auteur
Olivier Michel, Jean-Pierre Banâtre, Pascal Fradet, Jean-Louis Giavitto
titre
Challenging Questions for the Rationale of Non-Classical Programming Languages
article
International Journal of Unconventional Computing, Old City Publishing, 2006, 2, pp.337--347
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00340128/file/final-ijuc-michel-banatre-fradet-giavitto-position-paper.pdf BibTex
auteur
Alain R. Thierry, François Képès, Patrick Amar, Georgia Barlovatz-Meimon, Gilles Bernot, Marie Beurton-Aimar, Marie Dutreix, Jean-Louis Giavitto, Janine Guespin, Jean-Pierre Mazat, Victor Norris, Vincent Schächter, Philippe Tracqui, Christophe Godin, Franck Molina
titre
Modelling of biological complex systems in the context of genomics. An account of a multidisciplinary thematic seminar held in Montpellier (France) in April 2005
article
Journal of Biological Physics and Chemistry, Basel, Switzerland : Collegium Basilea (Institute of Advanced Study) ; Tbilisi : Association of Modern Scientific Investigation (AMSI), 2006, 6, pp.103--107
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Alain Thierry, François Képès, Patrick Amar, Georgia Barlovatz-Meimon, Gilles Bernot, Marie Beurton-Aimar, Marie Dutreix, Jean-Louis Giavitto, Janine Guespin, Jean-Pierre Mazat, Vic Norris, Vincent Schafter, Philippe Tracqui, Christophe Godin, Franck Molina
titre
Modelling of complex biological systems in the context of genomics: an account of a multidisciplinary thematic seminar held in Montpellier (France) in April 2005
article
Journal of Biological Physics and Chemistry, Basel, Switzerland : Collegium Basilea (Institute of Advanced Study) ; Tbilisi : Association of Modern Scientific Investigation (AMSI), 2006, 6, pp.103-107
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00830064/file/thierry06.pdf BibTex

Book sections

auteur
Jean-Louis Giavitto, Antoine Spicher
titre
Morphogenèse informatique
article
Lesne, Annick and Bourgine, Paul. Morphogenèse, Belin, pp.178--198, 2006
Accès au bibtex
BibTex

Directions of work or proceedings

auteur
Olivier Danvy, Andrzej Filinski, Jean-Louis Giavitto, Andy King, Pierre-Etienne Moreau, Carolyn L. Talcott
titre
Editorial (special issue on rule based programming)
article
n.a., pp.343--344, 2006, 〈10.1007/s10990-006-0478-0〉
Accès au bibtex
BibTex
auteur
André De Hon, Jean-Louis Giavitto, Frédéric Gruau
titre
Computing Media and Languages for Space-Oriented Computation
article
Dagsthul, pp.n.a., 2006
Accès au bibtex
BibTex

2005

Conference papers

auteur
Francesco Bernardini, Marian Gheorghe, Natalio Krasnogor, Jean-Louis Giavitto
titre
On self-assembly in Population P systems
article
Proc. of UC'05 - Fourth International Conference on Unconventional Computation, 2005, Sevilla, Spain. 3699, pp.46--57, 2005, Lecture Notes in Computer Science
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Jean-Louis Giavitto, Olivier Michel, Julien Cohen, Antoine Spicher
titre
Computation in Space and Space in Computation
article
Unconventional Programming Paradigms (UPP'04), 2005, France. 3566, pp.137--152, 2005, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/11527800_11〉
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00340488/file/upp04-version-finale-lncs.pdf BibTex
auteur
Olivier Michel, Jean-Pierre Banâtre, Pascal Fradet, Jean-Louis Giavitto
titre
Challenging Questions for the Rationals of Non-Classical Programming Languages
article
The Grand Challenge in Non-Classical Computation, 2005, The King's Manor, York, United Kingdom. pp.93--103, 2005
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00340491/file/michel-banatre-fradet-giavitto-position-paper-version2.pdf BibTex
auteur
Antoine Spicher, Olivier Michel, Jean-Louis Giavitto
titre
Algorithmic self-assembly by accretion and by carving in MGS
article
7th International Conference on Artificial Evolution, 2005, France. 3871, pp.189--200, 2005, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/11740698_17〉
Accès au bibtex
BibTex

Book sections

auteur
Jean-Louis Giavitto, Olivier Michel
titre
Modeling Developmental Processes in MGS
article
Gheorghe, M. Molecular computation models: unconventional approaches, Idea Group Publishing, pp.150--189, 2005
Accès au bibtex
BibTex

Directions of work or proceedings

auteur
Jean-Pierre Banâtre, Pascal Fradet, Jean-Louis Giavitto, Olivier Michel
titre
Unconventional Programming Paradigms (UPP'04)
article
Springer Verlag, pp.n.a., 2005
Accès au bibtex
BibTex

2003

Journal articles

auteur
Victor Norris, Patrick Amar, Gilles Bernot, Jean-Louis Giavitto, Christophe Godin, Janine Guespin, Hélène Pollard, Philippe Tracqui, François Képès
titre
Modelling and simulation of biological processes in the context of genomics
article
Journal of Biological Physics and Chemistry, Basel, Switzerland : Collegium Basilea (Institute of Advanced Study) ; Tbilisi : Association of Modern Scientific Investigation (AMSI), 2003, 3, pp.106-110
Accès au bibtex
BibTex

2002

Journal articles

auteur
Patrick Amar, Pascal Ballet, Georgia Barlovatz-Meimon, Arndt Benecke, Gilles Bernot, Yves Bouligand, Paul Bourguine, Franck Delaplace, Jean-Marc Delosme, Maurice Demarty, Itzhak Fishov, Jean Fourmentin-Guilbert, Joe Fralick, Jean-Louis Giavitto, Bernard Gleyse, Christophe Godin, Roberto. Incitti, François Képès, Catherine Lange, Lois Le Sceller, Corinne Loutellier, Olivier Michel, Franck Molina, Chantal Monnier, René Natowicz, Vic Norris, Nicole Orange, Hélène Pollard, Derek Raine, Camille Ripoll, Josette Rouviere-Yaniv, Milton Saier, Paul Soler, Pierre Tambourin, Michel Thellier, Philippe Tracqui, Dave Ussery, Jean-Claude Vincent, Jean-Pierre Vannier, Philippa Wiggins, Abdallah Zemirline
titre
Hyperstructures, genome analysis and I-Cells
article
Acta Biotheoretica, Springer Verlag, 2002, 50 (4), pp.357-373. 〈10.1023/A:1022629004589〉
Accès au bibtex
BibTex
auteur
V. Norris, P. Amar, P. Ballet, G. Bernot, Y. Bouligand, P. Bourguine, J.-M. Delosme, M. Demarty, I. Fishov, J. Fralick, J.-L. Giavitto, B. Gleyse, C. Godin, R. Incitti, C. Lange, L. Le Sceller, C. Loutellier, O. Michel, F. Molina, C. Monnier, C. Moreno, N. Orange, H. Pollard, D. Raine, A. Rambourg, J. Ramsden, C. Ripoll, J. Rouviere-Yaniv, M. Saier Jnr., P. Soler, M. Thellier, Ph. Tracqui, D. Ussery, J.-M. Valleton, J.-P. Vannier, P. Wiggins, A. Zemirline, F. Képès
titre
Hyperstructures, genome analysis and i-cell
article
Acta Biotheoretica, Springer Verlag, 2002, 50, pp.357-373
Accès au bibtex
BibTex

Conference papers

auteur
Jean-Louis Giavitto, Christophe Godin, Olivier Michel, Premyslaw Prusinkiewicz
titre
Computational models for integrative and developmental biology
article
Actes du Colloque Modélisation et simulation de processus biologiques dans le contexte de la génomique, 2002, Autrans, France. pp.43, 2002
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Abdallah Zemirline, Pascal Ballet, Lionel Marcé, Patrick Amar, Gilles Bernot, Franck Delaplace, Jean-Louis Giavitto, Olivier Michel, Jean-Marc Delosme, Roberto Incitti, Paul Bourgine, Christophe Godin, François Képès, Philippe Tracqui, Victor Norris, Janine Guespin, Maurice Demarty, Camille Ripoll
titre
Cellular automata, reaction-diffusion and multiagents systems for artificial cell modelling
article
Amar, Patrick and Képès, François and Norris, Victor and Tracqui, Philippe. Actes du Colloque Modélisation et simulation de processus biologiques dans le contexte de la génomique, 2002, Autrans, France. pp.257-280, 2002
Accès au bibtex
BibTex