2024
- titre
- Plant response to intermittent heat stress involves modulation of mRNA translation efficiency
- auteur
- Arnaud Dannfald, Marie-Christine Carpentier, Rémy Merret, Jean-Jacques Favory, Jean-Marc Deragon
- article
- Plant Physiology, 2024, 197 (2), pp.kiae648. ⟨10.1093/plphys/kiae648⟩
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-
- titre
- Can heat-stress variations of tRNA epitranscriptome adapt translation to set up plant memory ?
- auteur
- Arnaud Dannfald, Jean-Jacques Favory, Jean-Marc Deragon
- article
- Post-transcriptional Gene Regulation in Plants (PGRP 2024), Sep 2024, Banyuls-sur-Mer, France
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-
2022
- titre
- Can heat-stress variations of tRNA epitranscriptome adapt translation to set up plant memory ?
- auteur
- Arnaud Dannfald, Jean-Jacques Favory, Jean-Marc Deragon
- article
- Post-Transcriptional Gene Regulation in Plants (PGRP 2022), May 2022, State College, United States
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-
- titre
- The methyl phosphate capping enzyme Bmc1/Bin3 is a stable component of the fission yeast telomerase holoenzyme
- auteur
- Jennifer Porat, Moaine El Baidouri, Jorg Grigull, Jean-Marc Deragon, Mark Bayfield
- article
- Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.1277. ⟨10.1038/s41467-022-28985-3⟩
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-
2021
- titre
- LARP6C orchestrates post-transcriptional reprogramming of gene expression during hydration to promote pollen tube guidance
- auteur
- Elodie Billey, Said Hafidh, Isabel Cruz-Gallardo, Celso G Litholdo, Viviane Jean, Marie-Christine Carpentier, Claire Picart, Vinod Kumar, Katarina Kulichova, Eric Maréchal, David Honys, Maria R Conte, Jean-Marc Deragon, Cécile Bousquet-Antonelli
- article
- The Plant cell, 2021, 33 (8), pp.2637-2661. ⟨10.1093/plcell/koab131⟩
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-
- titre
- Variations in transfer and ribosomal RNA epitranscriptomic status can adapt eukaryote translation to changing physiological and environmental conditions
- auteur
- Arnaud Dannfald, Jean-Jacques Favory, Jean-Marc Deragon
- article
- RNA Biology, 2021, 18, pp.4-18. ⟨10.1080/15476286.2021.1931756⟩
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-
- titre
- The Ecology of the Genome and the Dynamics of the Biological Dark Matter
- auteur
- Alheli Flores-Ferrer, Anne Nguyen, Sylvain Glémin, Jean-Marc Deragon, Olivier Panaud, Sébastien Gourbière
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2021, 518, pp.110641. ⟨10.1016/j.jtbi.2021.110641⟩
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-
2020
- titre
- Distribution, organization an evolutionary history of La and LARPs in eukaryotes
- auteur
- Jean-Marc Deragon
- article
- RNA Biology, 2020, pp.1-9. ⟨10.1080/15476286.2020.1739930⟩
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-
- titre
- Monitoring of XRN4 targets reveals the importance of co-translational decay during Arabidopsis development
- auteur
- Marie-Christine Carpentier, Jean-Marc Deragon, Viviane Jean, Seng Hour Vichet Be, Cecile Bousquet-Antonelli, Rémy Merret
- article
- Plant Physiology, 2020, pp.00942.2020. ⟨10.1104/pp.20.00942⟩
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-
- titre
- The plant mobile domain proteins MAIN and MAIL1 interact with the phosphatase PP7L to regulate gene expression and silence transposable elements in Arabidopsis thaliana
- auteur
- Melody Nicolau, Nathalie Picault, Julie Descombin, Yasaman Jami-Alahmadi, Suhua Feng, Etienne Bucher, Steven Jacobsen, Jean-Marc Deragon, James Wohlschlegel, Guillaume Moissiard
- article
- PLoS Genetics, 2020, 16 (4), pp.e1008324. ⟨10.1371/journal.pgen.1008324⟩
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-
2019
- titre
- The analogous and opposing roles of double-stranded RNA-binding proteins in bacterial resistance
- auteur
- Gah-Hyun Lim, Shifeng Zhu, Kai Zhang, Timothy Hoey, Jean-Marc Deragon, Aardra Kachroo, Pradeep Kachroo
- article
- Journal of Experimental Botany, 2019, 70 (5), pp.1627-1638. ⟨10.1093/jxb/erz019⟩
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-
- titre
- Epitranscriptomics of the Heat-Stress Response in Arabidopsis thaliana
- auteur
- Rémy Merret, Jérémy Scutenaire, Jean-Jacques Favory, Cécile Bousquet-Antonelli, Jean-Marc Deragon
- article
- Next-Generation Epitranscriptomics in Health and Disease, Gordon Research Conference, Mar 2019, Lucca (Barga), Italy
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-
- titre
- Readers of the m6A epitranscriptomic code
- auteur
- Soizik Berlivet, Jérémy Scutenaire, Jean-Marc Deragon, Cécile Bousquet-Antonelli
- article
- Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms , 2019, 1862 (3), pp.329-342. ⟨10.1016/j.bbagrm.2018.12.008⟩
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-
2018
- titre
- COP1, a negative regulator of photomorphogenesis, positively regulates plant disease resistance via double-stranded RNA binding proteins
- auteur
- Gah-Hyun Lim, Timothy Hoey, Shifeng Zhu, Marion Clavel, Keshun Yu, Duroy Navarre, Aardra Kachroo, Jean-Marc Deragon, Pradeep Kachroo, Hui-Shan Guo
- article
- PLoS Pathogens, 2018, 14 (3), pp.e1006894. ⟨10.1371/journal.ppat.1006894⟩
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-
- titre
- The YTH Domain Protein ECT2 Is an m 6 A Reader Required for Normal Trichome Branching in Arabidopsis
- auteur
- Jérémy Scutenaire, Jean-Marc Deragon, Viviane Jean, Moussa Benhamed, Cécile Raynaud, Jean-Jacques Favory, Rémy Merret, Cécile Bousquet-Antonelli
- article
- The Plant cell, 2018, 30 (5), pp.986-1005. ⟨10.1105/tpc.17.00854⟩
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-
2017
- titre
- Arabidopsis proteins with a transposon-related domain act in gene silencing
- auteur
- Yoko Ikeda, Thierry Pélissier, Pierre Bourguet, Claude Becker, Marie-Noelle Pouch-Pelissier, Romain Pogorelcnik, Magdalena Weingartner, Detlef Weigel, Jean-Marc Deragon, Olivier Mathieu
- article
- Nature Communications, 2017, 8, ⟨10.1038/ncomms15122⟩
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-
- titre
- Sulfur availability regulates plant growth via glucose-TOR signaling
- auteur
- Yihan Dong, Marleen Silbermann, Anna Speiser, Ilaria Forieri, Eric Linster, Gernot Poschet, Arman Allboje Samami, Mutsumi Wanatabe, Carsten Sticht, Aurelio Teleman, Jean-Marc Deragon, Kazuki Saito, Rüdiger Hell, Markus Wirtz
- article
- Nature Communications, 2017, 8 (1), pp.1174. ⟨10.1038/s41467-017-01224-w⟩
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-
- titre
- Heat Shock Protein HSP101 Affects the Release of Ribosomal Protein mRNAs for Recovery after Heat Shock.
- auteur
- Rémy Merret, Marie-Christine Carpentier, Jean-Jacques Favory, Claire Picart, Julie Descombin, Cécile Bousquet-Antonelli, Pascal Tillard, Laurence Lejay-Lefebvre, Jean-Marc Deragon, Yee-Yung Charng
- article
- Plant Physiology, 2017, 174 (2), pp.1216-1225. ⟨10.1104/pp.17.00269⟩
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-
2016
- titre
- Evolutionary history of double-stranded RNA binding proteins in plants: identification of new cofactors involved in easiRNA biogenesis
- auteur
- M. Clavel, Thierry Pélissier, T. Montavon, M.A. Tschopp, M.N. Pouch-Pélissier, J. Descombin, V. Jean, P. Dunoyer, C. Bousquet-Antonelli, J.M. Deragon
- article
- Plant Molecular Biology, 2016, 91 (1-2), pp.131-147. ⟨10.1007/s11103-016-0448-9⟩
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-
2015
- titre
- The La-related protein 1-specific domain repurposes HEAT-like repeats to directly bind a 5'TOP sequence.
- auteur
- Roni L. Lahr, Seshat M. Mack, Annie Heroux, Sarah P. Blagden, Cécile Bousquet-Antonelli, Jean Marc Deragon, Andrea J. Berman
- article
- Nucleic Acids Research, 2015, 43 (16), pp.8077-8088. ⟨10.1093/nar/gkv748⟩
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-
- titre
- The role of LARP1 in translation and beyond
- auteur
- Jean‐Marc Deragon, Cécile Bousquet-Antonelli
- article
- Wiley Interdisciplinary Reviews-RNA, 2015, Topics in Current Genetics, 6 (4), pp.399-417. ⟨10.1002/wrna.1282⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Heat-induced ribosome pausing triggers mRNA co-translational decay in Arabidopsis thaliana.
- auteur
- Rémy Merret, Vinay K Nagarajan, Marie-Christine Carpentier, Sunhee Park, Jean-Jacques Favory, Julie Descombin, Claire Picart, Yee-Yung Charng, Pamela J Green, Jean-Marc Deragon, Cécile Bousquet-Antonelli
- article
- Nucleic Acids Research, 2015, 43 (8), pp.4121-32
- Accès au bibtex
-
- titre
- Parallel action of AtDRB2 and RdDM in the control of transposable element expression
- auteur
- Marion Clavel, Thierry Pelissier, Julie Descombin, Viviane Jean, Claire Picart, Cyril Charbonel, Julio Sáez-Vasquez, Cécile Bousquet-Antonelli, Jean-Marc Deragon
- article
- BMC Plant Biology, 2015, 15 (1), pp.70. ⟨10.1186/s12870-015-0455-z⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2013
- titre
- XRN4 and LARP1 are required for a heat-triggered mRNA decay pathway involved in plant acclimation and survival during thermal stress.
- auteur
- Rémy Merret, Julie Descombin, Yu-Ting Juan, Jean-Jacques Favory, Marie-Christine Carpentier, Cristian Chaparro, Yee-Yung Charng, Jean-Marc Deragon, Cécile Bousquet-Antonelli
- article
- Cell Reports, 2013, 5 (5), pp.1279-93. ⟨10.1016/j.celrep.2013.11.019⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Uridylation prevents 3' trimming of oligoadenylated mRNAs
- auteur
- F. Sement, E. Ferrier, H. Zuber, R. Merret, M. Alioua, J.-M. Deragon, C. Bousquet-Antonelli, H. Lange, D. Gagliardi
- article
- Nucleic Acids Research, 2013, 41 (14), pp.7115-7127. ⟨10.1093/nar/gkt465⟩
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-
2012
- titre
- SINE Exaptation as Cellular Regulators Occurred Numerous Times During Eukaryote Evolution
- auteur
- Jean-Marc Deragon
- article
- Plant Transposable Elements., pp.253-271, 2012
- Accès au bibtex
-
- titre
- The association of a La module with the PABP-interacting motif PAM2 is a recurrent evolutionary process that led to the neofunctionalization of La-related proteins
- auteur
- R. Merret, L. Martino, C. Bousquet-Antonelli, S. Fneich, J. Descombin, E. Billey, R. Conte, J.-M. Deragon
- article
- RNA, 2012, 19 (1), pp.36-50. ⟨10.1261/rna.035469.112⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- International Congress on Transposable Elements (ICTE) 2012 in Saint Malo and the sea of TE stories.
- auteur
- Abdelkader Aïnouche, Mireille Bétermier, Mick Chandler, Richard Cordaux, Gaël Cristofari, Jean-Marc Deragon, Pascale Lesage, Olivier Panaud, Hadi Quesneville, Chantal Vaury, Cristina Vieira, Clémentine Vitte
- article
- Mobile DNA, 2012, 3 (1), pp.17. ⟨10.1186/1759-8753-3-17⟩
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-
2011
- titre
- Double-stranded RNA binding proteins DRB2 and DRB4 have an antagonistic impact on polymerase IV-dependent siRNA levels in Arabidopsis
- auteur
- Thierry Pelissier, Marion Clavel, Cristian Chaparro, Marie-Noelle Pouch-Pelissier, Herve Vaucheret, Jean-Marc Deragon
- article
- RNA, 2011, 17 (8), pp.1502 - 1510. ⟨10.1261/rna.2680711⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Sublethal Cadmium Intoxication In Arabidopsis thaliana Impacts Translation at Multiple Levels
- auteur
- F Sormani, E. Delannoy, S. Lageix, F. Bitton, E. Lanet, J. Saez-Vasquez, J. Deragon, J. Renou, C. Robaglia, R. Sormani
- article
- Plant and Cell Physiology, 2011, 52 (2), pp.436 - 447. ⟨10.1093/pcp/pcr001⟩
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-
2009
- titre
- Impact of transposable elements on the human genome
- auteur
- Jean-Marc Deragon, Pierre Capy
- article
- Annals of Medicine, 2009, 32 (4), pp.264-273. ⟨10.3109/07853890009011771⟩
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-
- titre
- Detailed analysis of a contiguous 22-Mb region of the maize genome.
- auteur
- Fusheng Wei, Joshua C Stein, Chengzhi Liang, Jianwei Zhang, Robert S Fulton, Regina S Baucom, Emanuele de Paoli, Shiguo Zhou, Lixing Yang, Yujun Han, Shiran Pasternak, Apurva Narechania, Lifang Zhang, Cheng-Ting Yeh, Kai Ying, Dawn H Nagel, Kristi Collura, David Kudrna, Jennifer Currie, Jinke Lin, Hyeran Kim, Angelina Angelova, Gabriel Scara, Marina Wissotski, Wolfgang Golser, Laura Courtney, Scott Kruchowski, Tina A Graves, Susan M Rock, Stephanie Adams, Lucinda A Fulton, Catrina Fronick, William Courtney, Melissa Kramer, Lori Spiegel, Lydia Nascimento, Ananth Kalyanaraman, Cristian Chaparro, Jean-Marc Deragon, Phillip San Miguel, Ning Jiang, Susan R Wessler, Pamela J Green, Yeisoo Yu, David C Schwartz, Blake C Meyers, Jeffrey L Bennetzen, Robert A Martienssen, W Richard Mccombie, Srinivas Aluru, Sandra W Clifton, Patrick S Schnable, Doreen Ware, Richard K Wilson, Rod A Wing
- article
- PLoS Genetics, 2009, 5 (11), pp.e1000728. ⟨10.1371/journal.pgen.1000728⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Novel long non-protein coding RNAs involved in Arabidopsis differentiation and stress responses.
- auteur
- Besma Ben Amor, Sonia Wirth, Francisco Merchan, Philippe Laporte, Yves d'Aubenton-Carafa, Judith Hirsch, Alexis Maizel, Allison Mallory, Antoine Lucas, Jean Marc Deragon, Herve Vaucheret, Claude Thermes, Martin Crespi
- article
- Genome Research, 2009, 19 (1), pp.57-69. ⟨10.1101/gr.080275.108⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Exceptional diversity, non-random distribution, and rapid evolution of retroelements in the B73 maize genome.
- auteur
- Regina S Baucom, James C Estill, Cristian Chaparro, Naadira Upshaw, Ansuya Jogi, Jean-Marc Deragon, Richard P Westerman, Phillip J Sanmiguel, Jeffrey L Bennetzen
- article
- PLoS Genetics, 2009, 5 (11), pp.e1000732. ⟨10.1371/journal.pgen.1000732⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The B73 maize genome: complexity, diversity, and dynamics.
- auteur
- Patrick S Schnable, Doreen Ware, Robert S Fulton, Joshua C Stein, Fusheng Wei, Shiran Pasternak, Chengzhi Liang, Jianwei Zhang, Lucinda Fulton, Tina A Graves, Patrick Minx, Amy Denise Reily, Laura Courtney, Scott S Kruchowski, Chad Tomlinson, Cindy Strong, Kim Delehaunty, Catrina Fronick, Bill Courtney, Susan M Rock, Eddie Belter, Feiyu Du, Kyung Kim, Rachel M Abbott, Marc Cotton, Andy Levy, Pamela Marchetto, Kerri Ochoa, Stephanie M Jackson, Barbara Gillam, Weizu Chen, Le Yan, Jamey Higginbotham, Marco Cardenas, Jason Waligorski, Elizabeth Applebaum, Lindsey Phelps, Jason Falcone, Krishna Kanchi, Thynn Thane, Adam Scimone, Nay Thane, Jessica Henke, Tom Wang, Jessica Ruppert, Neha Shah, Kelsi Rotter, Jennifer Hodges, Elizabeth Ingenthron, Matt Cordes, Sara Kohlberg, Jennifer Sgro, Brandon Delgado, Kelly Mead, Asif Chinwalla, Shawn Leonard, Kevin Crouse, Kristi Collura, Dave Kudrna, Jennifer Currie, Ruifeng He, Angelina Angelova, Shanmugam Rajasekar, Teri Mueller, Rene Lomeli, Gabriel Scara, Ara Ko, Krista Delaney, Marina Wissotski, Georgina Lopez, David Campos, Michele Braidotti, Elizabeth Ashley, Wolfgang Golser, Hyeran Kim, Seunghee Lee, Jinke Lin, Zeljko Dujmic, Woojin Kim, Jayson Talag, Andrea Zuccolo, Chuanzhu Fan, Aswathy Sebastian, Melissa Kramer, Lori Spiegel, Lidia Nascimento, Theresa Zutavern, Beth Miller, Claude Ambroise, Stephanie Muller, Will Spooner, Apurva Narechania, Liya Ren, Sharon Wei, Sunita Kumari, Ben Faga, Michael J Levy, Linda Mcmahan, Peter van Buren, Matthew W Vaughn, Kai Ying, Cheng-Ting Yeh, Scott J Emrich, Yi Jia, Ananth Kalyanaraman, An-Ping Hsia, W Brad Barbazuk, Regina S Baucom, Thomas P Brutnell, Nicholas C Carpita, Cristian Chaparro, Jer-Ming Chia, Jean-Marc Deragon, James C Estill, Yan Fu, Jeffrey A Jeddeloh, Yujun Han, Hyeran Lee, Pinghua Li, Damon R Lisch, Sanzhen Liu, Zhijie Liu, Dawn Holligan Nagel, Maureen C Mccann, Phillip Sanmiguel, Alan M Myers, Dan Nettleton, John Nguyen, Bryan W Penning, Lalit Ponnala, Kevin L Schneider, David C Schwartz, Anupma Sharma, Carol Soderlund, Nathan M Springer, Qi Sun, Hao Wang, Michael Waterman, Richard Westerman, Thomas K Wolfgruber, Lixing Yang, Yeisoo Yu, Lifang Zhang, Shiguo Zhou, Qihui Zhu, Jeffrey L Bennetzen, R Kelly Dawe, Jiming Jiang, Ning Jiang, Gernot G Presting, Susan R Wessler, Srinivas Aluru, Robert A Martienssen, Sandra W Clifton, W Richard Mccombie, Rod A Wing, Richard K Wilson
- article
- Science, 2009, 326 (5956), pp.1112-5. ⟨10.1126/science.1178534⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A comprehensive analysis of the La-motif protein superfamily.
- auteur
- Cécile Bousquet-Antonelli, Jean-Marc Deragon
- article
- RNA, 2009, 15 (5), pp.750-64. ⟨10.1261/rna.1478709⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2008
- titre
- $Arabidopsis$ eIF2α kinase GCN2 is essential for growth in stress conditions and is activated by wounding
- auteur
- Sébastien Lageix, Elodie Lanet, Marie-Noëlle Pélissier, Marie-Claude Espagnol, Christophe C. Robaglia, Jean-Marc Deragon, Thierry Pélissier
- article
- BMC Plant Biology, 2008, 8, pp.134. ⟨10.1186/1471-2229-8-134⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- SINE RNA Induces Severe Developmental Defects in Arabidopsis thaliana and Interacts with HYL1 (DRB1), a Key Member of the DCL1 Complex
- auteur
- Marie-Noëlle Pouch-Pélissier, Thierry Pélissier, Taline Elmayan, Hervé Vaucheret, Drasko Boko, Michael Jantsch, Jean-Marc Deragon
- article
- PLoS Genetics, 2008, 4 (6), pp.e1000096. ⟨10.1371/journal.pgen.1000096⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- On the Evolution and Expression of Chlamydomonas reinhardtii Nucleus-Encoded Transfer RNA Genes
- auteur
- Valérie Cognat, Jean-Marc Deragon, Elizaveta Vinogradova, Thalia Salinas, Claire Remacle, Laurence Maréchal-Drouard
- article
- Genetics, 2008, 179 (1), pp.113-123. ⟨10.1534/genetics.107.085688⟩
- Accès au bibtex
-
2007
- titre
- The nanovirus-encoded Clink protein affects plant cell cycle regulation through interaction with the retinoblastoma-related protein.
- auteur
- Sébastien Lageix, Olivier Catrice, Jean-Marc Deragon, Bruno Gronenborn, Thierry Pélissier, Bertha Cecilia Ramírez
- article
- Journal of Virology, 2007, 81 (8), pp.4177-85. ⟨10.1128/JVI.02103-06⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- A bona fide La protein is required for embryogenesis in Arabidopsis thaliana.
- auteur
- Sophie Fleurdépine, Jean-Marc Deragon, Martine Devic, Jocelyne Guilleminot, Cécile Bousquet-Antonelli
- article
- Nucleic Acids Research, 2007, 35 (10), pp.3306-21. ⟨10.1093/nar/gkm200⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Common evolutionary trends for SINE RNA structures
- auteur
- Feng-Jie Sun, Sophie Fleurdépine, Cécile Bousquet-Antonelli, Gustavo Caetano-Anollés, Jean-Marc Deragon
- article
- Trends in Genetics, 2007, 23 (1), pp.26-33. ⟨10.1016/j.tig.2006.11.005⟩
- Accès au bibtex
-
2005
- titre
- Encyclopedia of Life Sciences
- auteur
- Jean-Marc Deragon
- article
- Transposons, 1, Wiley, 2005, ⟨10.1038/npg.els.0005064⟩
- Accès au bibtex
-
2004
- titre
- Synthesis and processing of tRNA-related SINE transcripts in Arabidopsis thaliana
- auteur
- Thierry Pélissier, Cécile Bousquet-Antonelli, Laurence Lavie, Jean-Marc Deragon
- article
- Nucleic Acids Research, 2004, 32 (13), pp.3957-3966. ⟨10.1093/nar/gkh738⟩
- Accès au bibtex
-
2001
- titre
- La relation SINE/LINE : Un exemple de parasitisme moléculaire ?
- auteur
- Jean-Marc Deragon
- article
- Médecine/Sciences, 2001, 17 (1), pp.103. ⟨10.4267/10608/1795⟩
- Accès au bibtex
-