Publications HAL de la collection LGDP

2024

titre
Proteomic profiling of Arabidopsis nuclei reveals distinct protein accumulation kinetics upon heat stress
auteur
Eduardo Muñoz-Diaz, Isabel Fuenzalida-Valdivia, Tommy Darriere, A Debures, Francisca Blanco-Herrera, Magali Rompais, Christine Carapito, Julio Saez-Vasquez
article
Scientific Reports, 2024, ⟨10.1038/s41598-024-65558-4⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-04632486/file/41598_2024_65558_Author.pdf BibTex
titre
Redox regulation of epigenetic and epitranscriptomic gene regulatory pathways in plants
auteur
Juline Auverlot, Avilien Dard, Julio Sáez-Vásquez, Jean-Philippe Reichheld
article
Journal of Experimental Botany, In press, ⟨10.1093/jxb/erae165⟩
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https://hal.science/hal-04555742/file/Auverlot%20et%20al..pdf BibTex
titre
Mechanisms and impact of ribosomal RNA methylation in plants
auteur
Sara Alina Neumann, Jacinthe Azevedo-Favory, Rémy Merret, Marie-Christine Carpentier, Julien Henry, V. Marchand, Anne Debures, Magali Rompais, Christine Carapito, Yuri Motorin, Julio Sáez-Vásquez
article
The 2024 Post-transcriptional Gene Regulation in Plants meeting, Sep 2024, Banyuls-Sur-Mer, France.
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https://hal.science/hal-04841568/file/Sara%20Alina%20Neumann%20et%20al_PGRP_2024.pdf BibTex
titre
Plant ribosomes as a score to fathom the melody of 2’- O -methylation across evolution
auteur
Sara Alina Neumann, Christine Gaspin, Julio Sáez-Vásquez
article
RNA Biology, 2024, 21 (1), pp.70-81. ⟨10.1080/15476286.2024.2417152⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04771739/file/Plant%20ribosomes%20as%20a%20score%20to%20fathom%20the%20melody%20of%202%20-O-methylation%20across%20evolution.pdf BibTex
titre
Mechanisms and impact of ribosomal RNA methylation in plants
auteur
Sara Alina Neumann, Jacinthe Azevedo-Favory, Rémy Merret, Marie-Christine Carpentier, Julien Henry, V. Marchand, Anne Debures, Magali Rompais, Christine Carapito, Christine Gaspin, Iouri Motorine, Julio Sáez-Vásquez
article
8ème colloque RNAOcc’ Club RNA Occitanie, Jun 2024, Toulouse, France
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2023

titre
From mapping to mechanism: Ribosomal RNA methylation in plants
auteur
S A Neumann, J Azevedo-Favory, C Gaspin, V. Marchand, Yuri Motorin, Julio Sáez-Vásquez
article
RNAOcc’ Club RNA Occitanie, Jun 2023, Montpellier, France
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titre
From mapping to mechanism: Ribosome rRNA methylation in plants
auteur
Sara Alina Neumann, Jacinthe Azevedo-Favory, Christine Gaspin, V. Marchand, Yuri Motorin, J. Sáez-Vásquez
article
47th FEBS Congress, Jul 2023, Tour, France
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titre
rRNA processing is compromised in A. thaliana upon heat stress
auteur
Tommy Darriere, Eduardo Muñoz Díaz, Pascale Comella, Sébastien Gourbière, Julio Sáez-Vásquez
article
International Conference on Transcription mechanism and regulation by archeal RNA polymerases I, III, IV and V (OddPols 2023), May 2023, Jaen, Spain
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titre
Facts or fiction ? Nucleolar sequestration of proteins in Arabidopsis thaliana under heat stress
auteur
Eduardo Muñoz Díaz, Anne Debures, Alicia Camuel, Magali Rompais, Christine Carapito, Julio Sáez-Vásquez
article
OddPols 2023 - International Conference on Transcription mechanism and regulation by archeal RNA polymerases I, III, IV and V, May 2023, Jaén, Spain.
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https://hal.science/hal-04842133/file/Munoz-Diaz%20et%20al_OddPols_2023.pdf BibTex
titre
45S rDNA Diversity In Natura as One Step towards Ribosomal Heterogeneity in Arabidopsis thaliana
auteur
Valérie Delorme-Hinoux, Assane Mbodj, Sophie Brando, Anne de Bures, Christel Llauro, Fabrice Covato, Joseph Garrigue, Claude Guisset, Jacques Borrut, Marie Mirouze, Jean-Philippe Reichheld, Julio Sáez-Vásquez
article
Plants, 2023, 12 (14), pp.2722. ⟨10.3390/plants12142722⟩
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https://hal.science/hal-04270325/file/Delorme-Hinoux%20et%20al_plants-12-02722-v2.pdf BibTex
titre
Arabidopsis SMO2 modulates ribosome biogenesis by maintaining the RID2 abundance during organ growth
auteur
Zhengfei Guo, Xiaoyu Wang, Yan Li, Aiming Xing, Chengyun Wu, Daojun Li, Chunfei Wang, Anne de Bures, Yonghong Zhang, Siyi Guo, Julio Sáez-Vásquez, Zhenguo Shen, Zhubing Hu
article
The Plant Journal, 2023, 114 (1), pp.96 - 109. ⟨10.1111/tpj.16121⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-04116674/file/The%20Plant%20Journal%20-%202023%20-%20Guo%20-%20Arabidopsis%20SMO2%20modulates%20ribosome%20biogenesis%20by%20maintaining%20the%20RID2%20abundance%20during.pdf BibTex
titre
Nicotianamine synthase activity affects nucleolar iron accumulation and impacts rDNA silencing and RNA methylation in Arabidopsis
auteur
Charlotte Montacié, Christophe Riondet, Lili Wei, Tommy Darrière, Alizée Weiss, Frédéric Pontvianne, Marie-Line Escande, Anne de Bures, Edouard Jobet, A. Barbarossa, Marie-Christine Carpentier, Mark G.M. Aarts, Aurore Attina, Christophe Hirtz, Alexandre David, V. Marchand, Yuri Motorin, Catherine Curie, Stéphane Mari, Jean‐philippe Reichheld, J. Sáez-Vásquez
article
Journal of Experimental Botany, 2023, 74 (15), pp.4384-4400. ⟨10.1093/jxb/erad180⟩
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https://hal.univ-lorraine.fr/hal-04097969/file/MontacieC.-et%20al-InPress-J.ExpBot-2023.pdf BibTex

2022

titre
Mapping rRNA 2'-O-Methylations and identification of C/D snoRNAs in Arabidopsis thaliana
auteur
Jacinthe Azevedo-Favory, Christine Gaspin, Lilia Ayadi, Charlotte Montacié, V. Marchand, Edouard Jobet, Magali Rompais, Christine Carapito, Yuri Motorin, Julio Sáez-Vásquez
article
Ribosome Synthesis, Aug 2022, Engelberg, Switzerland
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titre
Nucleolus structure and processing of ribosomal RNA are compromised in Arabidopsis thaliana upon heat stress
auteur
Tommy Darriere, Edouard Jobet, Marie-Line Escande, Anne Debures, Attina Aurore, Christophe Hirtz, Alexandre David, Sébastien Gourbière, Julio Sáez-Vásquez
article
RNAOcc’ Club RNA Occitanie, Jun 2022, Toulouse, France
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titre
Nuclear dynamics: Formation of bodies and trafficking in plant nuclei
auteur
Eduardo Muñoz-Díaz, Julio Sáez-Vásquez
article
Frontiers in Plant Science, In press, ⟨10.3389/fpls.2022.984163⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-03761315/file/Munoz-Diaz_%20Frontiers%20in%20Plant%20Scicence%202022_r.pdf BibTex
titre
Upon heat stress processing of ribosomal RNA precursors into mature rRNAs is compromised after cleavage at primary P site in Arabidopsis thaliana
auteur
T. Darriere, E. Jobet, D. Zavala, M.L. Escande, N. Durut, A. de Bures, F. Blanco-Herrera, E.A. Vidal, M. Rompais, C. Carapito, S. Gourbiere, J. Sáez-Vásquez
article
RNA Biology, 2022, 19 (1), pp.719 - 734. ⟨10.1080/15476286.2022.2071517⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-03674753/file/Darriere%20et%20al.%20RNA%20Biology%202022.pdf BibTex
titre
Tackling Nucleolar Sequestration of Proteins in Arabidopsis plants
auteur
Eduardo Muñoz Díaz, Tommy Darriere, Anne Debures, Magali Rompais, Christine Carapito, Julio Sáez-Vásquez
article
12ème SifrARN Structure, Integration, Function & Reactivity of RNA, Oct 2022, Bordeaux, France
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titre
Processing of ribosomal RNA is compromised in A. thaliana upon heat stress
auteur
Darriere Tommy, Azevedo-Favory Jacinthe, Anne de Bures, Christine Gaspin, V. Marchand, Yuri Motorin, Julio Sáez-Vásquez
article
12ème SifrARN Structure, Integration, Function & Reactivity of RNA, Oct 2022, Bordeaux, France
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titre
Editorial: Molecular organization, evolution, and function of ribosomal DNA
auteur
Roman Volkov, Nikolai Borisjuk, Sònia Garcia, Aleš Kovařík, Julio Sáez-Vásquez
article
Frontiers in Plant Science, 2022, 13, ⟨10.3389/fpls.2022.994380⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-03761332/file/fpls-13-994380_editorial_Volkov%202022.pdf BibTex

2021

titre
Mapping rRNA 2'-O-Methylations and identification of C/D snoRNAs in Arabidopsis thaliana
auteur
Jacinthe Azevedo-Favory, Christine Gaspin, L Ayadi, Charlotte Montacié, V. Marchand, Magali Rompais, Christine Carapito, Yuri Motorin, Julio Sáez-Vásquez
article
RNAOcc’ Club RNA Occitanie, Jun 2021, Virtuel, France
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BibTex
titre
Mapping rRNA 2’-O-methylations and identification of C/D snoRNAs in Arabidopsis thaliana plants
auteur
Jacinthe Azevedo-Favory, Christine Gaspin, Lilia Ayadi, Charlotte Montacié, Virginie Marchand, Edouard Jobet, Magali Rompais, Christine Carapito, Yuri Motorin, Julio Sáez-Vásquez
article
RNA Biology, 2021, 18 (11), pp.1-18. ⟨10.1080/15476286.2020.1869892⟩
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https://hal.univ-lorraine.fr/hal-03150158/file/15476286.2020.pdf BibTex
titre
Thiol-mediated redox regulation of DICER-LIKE RNaseIII and small RNA metabolism
auteur
Cyril Charbonnel, Adnan Khan Niazi, Emilie Elvira-Matelot, Matthias Zytnicki, Anne de Bures, Edouard Jobet, Pascale Comella, Alisson Opsomer, Marcin Nowotny, Christine Carapito, Nahid Shamandi, Hervé Vaucheret, Julio Sáez-Vásquez, Jean-Philippe Reichheld
article
SFRR-E 2021 annual meeting “Redox Biology in the 21st Century: A New Scientific Discipline”, Jun 2021, Belgrade, Serbia. pp.S61-S62, ⟨10.1016/j.freeradbiomed.2021.08.051⟩
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BibTex
titre
D-Peptidase Activity in a Marine Mollusk Detoxifies a Nonribosomal Cyclic Lipopeptide: An Ecological Model to Study Antibiotic Resistance
auteur
Laurine Darcel, Louis Bornancin, Delphine Raviglione, Isabelle Bonnard, Suzanne Mills, Julio Sáez-Vásquez, Bernard Banaigs, Nicolas Inguimbert
article
Journal of Medicinal Chemistry, In press, ⟨10.1021/acs.jmedchem.1c00249⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-03212973/file/JMedChem_LDarcel_2021.pdf BibTex

2020

titre
An In Vitro Approach To Study RNase III Activities of Plant RTL Proteins
auteur
Cyril Charbonnel, Anne de Bures, Julio Sáez-Vásquez
article
RNA Remodeling Proteins, pp.363 - 385, 2020, ⟨10.1007/978-1-0716-0935-4_23⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-03121899/file/Chapter%2023%2C%20MiMB%20Charbonnel%20et%20al..pdf BibTex
titre
SMALL ORGAN4 Is a Ribosome Biogenesis Factor Involved in 5.8S Ribosomal RNA Maturation
auteur
Rosa Micol-Ponce, Raquel Sarmiento-Mañús, Sara Fontcuberta-Cervera, Adrián Cabezas-Fuster, Anne de Bures, Julio Sáez-Vásquez, María Rosa Ponce
article
Plant Physiology, 2020, 184 (4), pp.2022-2039. ⟨10.1104/pp.19.01540⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-03121916/file/Micol-Ponce%20Plant%20Physiol%202020.pdf BibTex
titre
Redox Modification of the Iron-Sulfur Glutaredoxin GRXS17 Activates Holdase Activity and Protects Plants from Heat Stress
auteur
Laura Martins, Johannes Knuesting, Laetitia Bariat, Avilien Dard, Sven Freibert, Christophe Marchand, David Young, Nguyen Ho Thuy Dung, Wilhelm Voth, Anne Debures, Julio Saez-Vasquez, Stéphane Lemaire, Roland Lill, Joris Messens, Renate Scheibe, Jean-Philippe Reichheld, Christophe Riondet
article
Plant Physiology, 2020, 184 (2), pp.676-692. ⟨10.1104/pp.20.00906⟩
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https://hal.science/hal-03012709/file/Martins%20et%20al%20pp.20.00906.full.pdf BibTex
titre
The Importance of Earth Reference Controls in Spaceflight -Omics Research: Characterization of Nucleolin Mutants from the Seedling Growth Experiments
auteur
Aránzazu Manzano, Alicia Villacampa, Julio Sáez-Vásquez, John Kiss, F. Javier Medina, Raúl Herranz
article
iScience, 2020, 23 (11), pp.101686. ⟨10.1016/j.isci.2020.101686⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-03121938/file/Manzano%20et%20al.%20iScience%202020.pdf BibTex

2019

titre
Mapping rRNA 2'-O-Methylation by RiboMethSeq and characterization of snoRNAs in Arabidopsis
auteur
Charlotte Montacié, V. Marchand, Jacinthe Azevedo-Favory, L Ayadi, Edouard Jobet, Magali Rompais, Christine Carapito, Christine Gaspin, Yuri Motorin, Julio Sáez-Vásquez
article
24th annual RNA Meetting, Jun 2019, Cracovie, Poland
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titre
NUCLEOLIN: Similar and Antagonistic Roles in Arabidopsis thaliana
auteur
Nathalie Durut, Mohamed Abou-Ellail, Pascale Comella, Edouard Jobet, Anne Debures, Julio Sáez-Vásquez
article
26th ELGRA Biennial Symposium. ESA Topical Team Meetings, Sep 2019, Granada (Spain), Spain
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2013

titre
NTR/NRX define a new thioredoxin system in the nucleus of Arabidopsis thaliana cells.
auteur
Corinne Marchal, Valérie Delorme-Hinoux, Laetitia Bariat, Wafi Siala, Christophe Belin, Julio Saez-Vasquez, Christophe Riondet, Jean-Philippe Reichheld
article
Molecular Plant Pathology, 2013, 7 (1), pp.30-44
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2010

titre
Genome organization and function: a view from yeast and Arabidopsis.
auteur
Julio Sáez-Vásquez, Olivier Gadal
article
Molecular Plant, 2010, 3 (4), pp.678-90. ⟨10.1093/mp/ssq034⟩
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titre
Nucleolin is required for DNA methylation state and the expression of rRNA gene variants in Arabidopsis thaliana.
auteur
Frédéric Pontvianne, Mohamed Abou-Ellail, Julien Douet, Pascale Comella, Isabel Matia, Chinmayi Chandrasekhara, Anne Debures, Todd Blevins, Richard Cooke, Francisco J Medina, Sylvette Tourmente, Craig S Pikaard, Julio Sáez-Vásquez
article
PLoS Genetics, 2010, 6 (11), pp.e1001225. ⟨10.1371/journal.pgen.1001225⟩
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BibTex
titre
Identification of protein factors and U3 snoRNAs from a Brassica oleracea RNP complex involved in the processing of pre-rRNA.
auteur
Hala Samaha, Valérie Delorme, Frederic Pontvianne, Richard Cooke, Francois Delalande, Alain van Dorsselaer, Manuel Echeverria, Julio Sáez-Vásquez
article
The Plant Journal, 2010, 61 (3), pp.383-98. ⟨10.1111/j.1365-313X.2009.04061.x⟩
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2009

titre
Processing of a dicistronic tRNA-snoRNA precursor: combined analysis in vitro and in vivo reveals alternate pathways and coupling to assembly of snoRNP.
auteur
Nicolas Barbezier, Giusy Canino, Julie Rodor, Edouard Jobet, Julio Saez-Vasquez, Anita Marchfelder, Manuel Echeverría
article
Plant Physiology, 2009, 150 (3), pp.1598-610. ⟨10.1104/pp.109.137968⟩
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2007

titre
Characterization of AtNUC-L1 reveals a central role of nucleolin in nucleolus organization and silencing of AtNUC-L2 gene in Arabidopsis.
auteur
Frederic Pontvianne, Isabel Matía, Julien Douet, Sylvette Tourmente, Francisco J Medina, Manuel Echeverria, Julio Sáez-Vásquez
article
Molecular Biology of the Cell, 2007, 18 (2), pp.369-79. ⟨10.1091/mbc.E06-08-0751⟩
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2005

titre
Reinforcement of silencing at transposons and highly repeated sequences requires the concerted action of two distinct RNA polymerases IV in Arabidopsis.
auteur
Dominique Pontier, Galina Yahubyan, Danielle Vega, Agnès Bulski, Julio Saez-Vasquez, Mohamed-Ali Hakimi, Silva Lerbs-Mache, Vincent Colot, Thierry Lagrange
article
Genes and Development, 2005, 19 (17), pp.2030-2040. ⟨10.1101/gad.348405⟩
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