Publications HAL

2024

Journal articles

titre
Genome-Centric Metatranscriptomics Reveals Multiple Co-occurring Routes for Hydrocarbon Degradation in Chronically Contaminated Marine Microbial Mats
auteur
Adrien Vigneron, Remy Guyoneaud, Marisol Goñi
article
Environmental Science and Technology, 2024, 58 (3), pp.1551-1562. ⟨10.1021/acs.est.3c08386⟩
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2023

Journal articles

titre
Consortia cultivation of the Desulfobacterota from macrophyte periphyton: tool for increasing the cultivation of microorganisms involved in mercury methylation
auteur
Diva Scuvée, Marisol Goñi, Claire Gassie, B.K. Hassani, Remy Guyoneaud
article
Microbiological Research, 2023, 273, pp.127415. ⟨10.1016/j.micres.2023.127415⟩
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https://univ-pau.hal.science/hal-04132256/file/Scuv%C3%A9e%20et%20a%20l2023%20.pdf BibTex
titre
Coupling fluorescent probes to characterize S-containing compounds in a sulfate reducing bacteria involved in Hg methylation
auteur
Ikram Bakour, M.-P. Isaure, Sophie Barrouilhet, Marisol Goñi, Mathilde Monperrus
article
Talanta Open, 2023, 7, pp.100228. ⟨10.1016/j.talo.2023.100228⟩
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https://univ-pau.hal.science/hal-04117983/file/Talanta%20Open%207%20%282023%29%20100228.pdf BibTex
titre
Bacterial diversity of an acid mine drainage beside the Xichú River (Mexico) accessed by culture-dependent and culture-independent approaches
auteur
Elcia Margareth Souza Brito, Remy Guyoneaud, César Augusto Caretta, Manon Joseph, Marisol Goñi-Urriza, Bernard Ollivier, Agnès Hirschler-Réa
article
Extremophiles, 2023, 27 (1), pp.5. ⟨10.1007/s00792-023-01291-6⟩
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titre
Effect of Exogenous and Endogenous Sulfide on The Production and The Export of Methylmercury by Sulfate Reducing Bacteria
auteur
Sophie Barrouilhet, Mathilde Monperrus, Emmanuel Tessier, B.K. Hassani, Remy Guyoneaud, M.-P. Isaure, Marisol Goñi‐urriza
article
Environmental Science and Pollution Research, 2023, 30, pp.3885-3846. ⟨10.1007/s11356-022-22173-y⟩
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https://univ-pau.hal.science/hal-03781209/file/dc54b568-ff0c-4e32-995c-88ee7e04c224.pdf BibTex
titre
Into the darkness of the microbial dark matter in situ activities through expression profiles of Patescibacteria populations
auteur
Adrien Vigneron, Perrine Cruaud, Remy Guyoneaud, Marisol Goñi
article
Frontiers in Microbiology, 2023, 139, pp.1073483. ⟨10.3389/fmicb.2022.1073483⟩
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https://univ-pau.hal.science/hal-03977890/file/fmicb-13-1073483.pdf BibTex

Conference papers

titre
Cobalt effect on prokaryotes communities within freshwater biofilms: Impact over the colonization kinetics, diversity and functional potential
auteur
Sarah Gourgues, Marisol Goñi, Patrick Baldoni-Andrey, Nicholas B. Gurieff, Clémentine Gelber, Séverine Le Faucheur
article
EcotoxicoMicYR_2023, Oct 2023, Webinaire [en ligne], France
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titre
Effets du cobalt sur les biofilms de rivière : impact sur la cinétique de colonisation, la diversité et les fonctions des communautés procaryotes
auteur
Sarah Gourgues, Marisol Goñi, Patrick Baldoni-Andrey, Nicholas B. Gurieff, Clémentine Gelber, Séverine Le Faucheur
article
11e congrès de l’Association Francophone d’Écologie Microbienne, Université de Toulon (laboratoires MAPIEM et MIO), Oct 2023, Carqueiranne, France
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2022

Journal articles

titre
A consensus protocol for the recovery of mercury methylation genes from metagenomes
auteur
Eric Capo, Benjamin D Peterson, Minjae Kim, Daniel S Jones, Silvia G Acinas, Marc Amyot, Stefan Bertilsson, Erik Björn, Moritz Buck, Claudia Cosio, Dwayne A Elias, Cynthia Gilmour, Marisol Goñi‐urriza, Baohua Gu, Heyu Lin, Yu‐rong Liu, Katherine Mcmahon, John W Moreau, Jarone Pinhassi, Mircea Podar, Fernando Puente‐sánchez, Pablo Sánchez, Veronika Storck, Yuya Tada, Adrien Vigneron, David A Walsh, Marine Vandewalle‐capo, Andrea G Bravo, Caitlin M Gionfriddo
article
Molecular Ecology Resources, 2022, ⟨10.1111/1755-0998.13687⟩
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https://univ-pau.hal.science/hal-03766637/file/FULLTEXT01.pdf BibTex

2021

Journal articles

titre
Transcriptomic evidence for versatile metabolic activities of mercury cycling microorganisms in brackish microbial mats
auteur
Adrien Vigneron, Perrine Cruaud, Johanne Aubé, Remy Guyoneaud, Marisol Goñi
article
npj Biofilms and Microbiomes, 2021, 7 (83), ⟨10.1038/s41522-021-00255-y⟩
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https://univ-pau.hal.science/hal-03515719/file/s41522-021-00255-y.pdf BibTex
titre
Chemical contamination alters the interactions between bacteria and phytoplankton
auteur
Olivier Pringault, Marc Bouvy, Claire Carré, Kaouther Mejri, Chrystelle Bancon-Montigny, Catherine Gonzalez, Christophe Leboulanger, Asma Sakka Hlaili, Marisol Goñi
article
Chemosphere, 2021, 278, pp.130457. ⟨10.1016/j.chemosphere.2021.130457⟩
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https://hal.science/hal-03369101/file/Pringault%20et%20al%20Chemosphere%20Phytoplankton%20Bacterioplankton%20interactions.pdf BibTex

2020

Journal articles

titre
Microbial Communities and Sulfate-Reducing Microorganisms Abundance and Diversity in Municipal Anaerobic Sewage Sludge Digesters from a Wastewater Treatment Plant (Marrakech, Morocco)
auteur
Abdelaziz El Houari, Magali Ranchou-Peyruse, Anthony Ranchou-Peyruse, Rhizlane Bennisse, Radia Bouterfas, Marisol Goñi, Abdel-Ilah Qatibi, Rémy Guyoneaud
article
Processes, 2020, 8 (10), pp.1284. ⟨10.3390/pr8101284⟩
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https://hal.science/hal-04516929/file/processes-08-01284.pdf BibTex
titre
Relationship Between Hg Speciation and Hg Methylation/Demethylation Processes in the Sulfate-Reducing Bacterium Pseudodesulfovibrio hydrargyri: Evidences From HERFD-XANES and Nano-XRF
auteur
M.-P. Isaure, Marine Albertelli, Isabelle Kieffer, Rémi Tucoulou, Melina Petrel, Etienne Gontier, Emmanuel Tessier, Mathilde Monperrus, Marisol Goñi
article
Frontiers in Microbiology, 2020, 11, pp.584715. ⟨10.3389/fmicb.2020.584715⟩
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https://hal.science/hal-02995211/file/fmicb-11-584715.pdf BibTex
titre
Meta-omics Provides Insights into the Impact of Hydrocarbon Contamination on Microbial Mat Functioning
auteur
Johanne Aubé, Pavel Senin, Patricia Bonin, Olivier Pringault, Céline Jeziorski, Olivier Bouchez, Christophe C. Klopp, Remy Guyoneaud, Marisol Goñi
article
Microbial ecology, 2020, 80 (2), pp.286-295. ⟨10.1007/s00248-020-01493-x⟩
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https://hal.science/hal-03065790/file/Aube_etal_MicEco_revised.pdf BibTex
titre
Marine mercury-methylating microbial communities from coastal to Capbreton Canyon sediments (North Atlantic Ocean)
auteur
Alyssa Azaroff, Marisol Goñi, Claire Gassie, Mathilde Monperrus, Remy Guyoneaud
article
Environmental Pollution, 2020, 262, pp.114333. ⟨10.1016/j.envpol.2020.114333⟩
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https://hal.science/hal-02543039/file/S0269749119367430.pdf BibTex
titre
Genome insights of mercury methylation among Desulfovibrio and Pseudodesulfovibrio strains
auteur
Marisol Goñi, Christophe C. Klopp, Magali Ranchou-Peyruse, Anthony Ranchou-Peyruse, Mathilde Monperrus, B.K. Hassani, Remy Guyoneaud
article
Research in Microbiology, 2020, 171 (1), pp.3-12. ⟨10.1016/j.resmic.2019.10.003⟩
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https://hal.science/hal-02390352/file/1-s2.0-S0923250819301214-am.pdf BibTex
titre
Prospecting bacterial consortia from a geothermal site for metals biotransformation
auteur
Elcia Margareth Souza Brito, M. Rodríguez-Galván, L. Hernández-Espino, César Augusto Caretta, Marisol Goñi, O. Malm, J.P.M. Torres, Remy Guyoneaud
article
Biodegradation, 2020, 31, pp.235-247. ⟨10.1007/s10532-020-09906-x⟩
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titre
Microbial Communities and Sulfate-Reducing Microorganisms Abundance and Diversity in Municipal Anaerobic Sewage Sludge Digesters from a Wastewater Treatment Plant (Marrakech, Morocco)
auteur
Abdelaziz El Houari, Magali Ranchou-Peyruse, Anthony Ranchou-Peyruse, Rhizlane Bennisse, Radia Bouterfas, Maria Goni, Abdel-Ilah Qatibi, Remy Guyoneaud
article
Processes, 2020, 8 (10), pp.1284. ⟨10.3390/pr8101284⟩
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https://hal.science/hal-02985369/file/processes-08-01284.pdf BibTex

2019

Journal articles

titre
Extreme Arsenic Bioaccumulation Factor Variability in Lake Titicaca, Bolivia
auteur
Geraldine Sarret, Stéphane Guédron, Dario C. Acha, Sarah Bureau, Florent Arnaud-Godet, Delphine Tisserand, Marisol Goñi, Claire Gassie, Celine Duwig, Olivier Proux, Anne-Marie Aucour
article
Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-47183-8⟩
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https://hal.science/hal-02339758/file/Sarret_et_al-2019-Scientific_Reports.pdf BibTex
titre
Pseudodesulfovibrio mercurii sp. nov., a mercury-methylating bacterium isolated from sediment
auteur
Cynthia Gilmour, Ally Bullock Soren, Caitlin Gionfriddo, Mircea Podar, Judy Wall, Steven Brown, Joshua Michener, Marisol Goñi, Dwayne Elias
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2019, 71 (3), ⟨10.1099/ijsem.0.004697⟩
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titre
The bacterial diversity on steam vents from Paricutín and Sapichu volcanoes
auteur
Elcia Margareth Souza Brito, Víctor Manuel Romero-Núñez, César Augusto Caretta, Pierre Bertin, Julio César Valerdi-Negreros, Remy Guyoneaud, Marisol Goñi
article
Extremophiles, 2019, 23 (2), pp.249-263. ⟨10.1007/s00792-019-01078-8⟩
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2018

Journal articles

titre
Linking Microbial Activities and Low-Molecular-Weight Thiols to Hg Methylation in Biofilms and Periphyton from High-Altitude Tropical Lakes in the Bolivian Altiplano
auteur
Sylvain Bouchet, Marisol Goñi, Mathilde Monperrus, Remy Guyoneaud, Pablo Fernandez, Carlos Heredia, Emmanuel Tessier, Claire Gassie, David Point, Stéphane Guédron, Dario C. Acha, David Amouroux
article
Environmental Science and Technology, 2018, 52 (17), pp.9758-9767
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titre
Pseudodesulfovibrio hydrargyri sp. nov., a mercury-methylating bacterium isolated from a brackish sediment
auteur
Magali Ranchou-Peyruse, Marisol Goñi, Marion Guignard, Marjorie Goas, Anthony Ranchou-Peyruse, Remy Guyoneaud
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2018, 68 (5), pp.1461 - 1466. ⟨10.1099/ijsem.0.002173⟩
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titre
Biosensor for screening bacterial mercury methylation: example within the Desulfobulbaceae
auteur
Yannick Colin, Jérôme Gury, Mathilde Monperrus, Sophie Gentès, Paola Ayala Borda, Marisol Goñi, Remy Guyoneaud
article
Research in Microbiology, 2018, 169 (1), pp.44-51. ⟨10.1016/j.resmic.2017.09.005⟩
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titre
Consequences of contamination on the interactions between phytoplankton and bacterioplankton.
auteur
Marisol Goñi, Moussard Helene, Lafabrie Celine, Claire Carré, Bouvy Marc, Sakka Hlaili Asma, Olivier Pringault
article
Chemosphere, 2018, 195, pp.212-222. ⟨10.1016/j.chemosphere.2017.12.053⟩
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Conference papers

titre
Role of microorganisms in marine mercury cycling: current knowledge and future directions
auteur
Andrea Garcia Bravo, Claudia Cosio, Léa Cabrol, Benjamin Misson, Cynthia Gilmour, Marisol Goñi, Remy Guyoneaud, Marianne Quemeneur, Lars-Eric Heimbürger-Boavida, Silvia G Acinas, Alexandre J. Poulain
article
MISTRALS Contamination & Pollution workshop, Nov 2018, Marseille, France
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2017

Journal articles

titre
Reprint of: Contribution of enrichments and resampling for sulfate reducing bacteria diversity assessment by high-throughput cultivation
auteur
Yannick Colin, Maria Soledad Goni-Urriza, Pierre Caumette, Remy Guyoneaud
article
Journal of Microbiological Methods, 2017, 138, pp.100-105. ⟨10.1016/j.mimet.2017.05.015⟩
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titre
Distribution of Sulfate-Reducing Communities from Estuarine to Marine Bay Waters
auteur
Yannick Colin, Marisol Goñi, C. Gassie, E. Carlier, Mathilde Monperrus, Remy Guyoneaud
article
Microbial ecology, 2017, 73 (1), pp.39-49. ⟨10.1007/s00248-016-0842-5⟩
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https://hal.science/hal-01499135/file/2017_distribution%20of%20sulfate-reducing%20communities_%7B810CBC15-B1E8-4940-851A-AAEB84D2A101%7D.pdf BibTex
titre
Unraveling the environmental and anthropogenic drivers of bacterial community changes in the Estuary of Bilbao and its tributaries
auteur
Mikel Aguirre, David Abad, A. Albaina, Lauren Cralle, Maria Soledad Goni-Urriza, Andone Estonba, Iratxe Zarraonaindia
article
PLoS ONE, 2017, 12 (6), ⟨10.1371/journal.pone.0178755⟩
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https://hal.science/hal-01563521/file/journal.pone.0178755-1.pdf BibTex
titre
Draft Genome Sequence of Desulfovibrio BerOc1, a Mercury-Methylating Strain
auteur
Marisol Goñi, Claire Gassie, Remy Guyoneaud, Oliver Bouchez, Christophe C. Klopp
article
Genome Announcements, 2017, 5 (3), pp.e01483-16. ⟨10.1128/genomeA.01483-16⟩
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https://hal.science/hal-01481298/file/Draft%20genome%20sequence%20of%20Desulfovibrio%20BerOc1%20a%20Mercury-Methylating%20Strain_1.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
The impact of long-term hydrocarbon exposure on the structure, activity, and biogeochemical functioning of microbial mats
auteur
Johanne Aubé, Pavel Senin, Olivier Pringault, Patricia Bonin, Bruno Deflandre, Olivier Bouchez, Noëlle Bru, Edurne Biritxinaga-Etchart, Christophe C. Klopp, Remy Guyoneaud, Marisol Goñi
article
Marine Pollution Bulletin, 2016, 111 (1-2), pp.115-125. ⟨10.1016/j.marpolbul.2016.07.023⟩
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BibTex
titre
Diurnal variability and biogeochemical reactivity of mercury species in an extreme high-altitude lake ecosystem of the Bolivian Altiplano
auteur
Lucia Alanoca, David Amouroux, Mathilde Monperrus, Emmanuel Tessier, Maria Goni, Remy Guyoneaud, Dario C. Acha, Claire Gassie, Stéphane Audry, Maria Eugenia Garcia, J Quintanilla, David Point
article
Environmental Science and Pollution Research, 2016, Environ Sci Pollut Res, 23, pp.6919-6933. ⟨10.1007/s11356-015-5917-1⟩
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https://hal.science/hal-01439880/file/Diurnal%20variability%20and%20biogeochemical%20reactivity%20of%20mercury%20species.pdf BibTex

Conference papers

titre
Biogeoquímica del mercurio en el lago tropical de altura Uru Uru (Altiplano boliviano)
auteur
Lucia Alanoca, Stéphane Guédron, Mathilde Monperrus, David Amouroux, Emmanuel Tessier, Patrick Seyler, Marisol Goñi, Remy Guyoneaud, Dario C. Acha, Stéphane Audry, Maria Eugenia Garcia, J Quintanilla, David E Point
article
International colloquium on current and ancient contamination in Andes aquatic ecosystems = Coloquio internacional sobre la contaminación actual y histórica en los ecosistemas acuáticos Andinos = Colloque international sur la contamination actuelle et historique des écosystèmes aquatiques andins, May 2016, La Paz, Bolivia
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2015

Journal articles

titre
Relationships between bacterial energetic metabolism, mercury methylation potential, and hgcA/hgcB gene expression in Desulfovibrio dechloroacetivorans BerOc1
auteur
Marisol Goñi, Yannick Corsellis, Laurent Lanceleur, Emmanuel Tessier, Jérôme Gury, Mathilde Monperrus, Remy Guyoneaud
article
Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (18), pp.13764-13771. ⟨10.1007/s11356-015-4273-5⟩
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titre
Contribution of enrichments and resampling for sulfate reducing bacteria diversity assessment by high-throughput cultivation
auteur
Yannick Colin, Marisol Goñi, Pierre Caumette, Remy Guyoneaud
article
Journal of Microbiological Methods, 2015, 110, pp.92-97. ⟨10.1016/j.mimet.2015.01.003⟩
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BibTex
titre
Contrasted effects of natural complex mixtures of PAHs and metals on oxygen cycle in a microbial mat
auteur
O. Pringault, Johanne Aubé, Olivier Bouchez, C. Klopp, J. Mariette, F. Escudie, P. Senin, Marisol Goñi
article
Chemosphere, 2015, 135, pp.189-201. ⟨10.1016/j.chemosphere.2015.04.037⟩
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titre
Impact of hydrocarbons, PCBs and heavy metals on bacterial communities in Lerma River, Salamanca, Mexico: Investigation of hydrocarbon degradation potential
auteur
Elcia M. de La Cruz Barrón Auteur Brito, M. de La Cruz Barrón, César Augusto Caretta, Marisol Goñi, L.H. Andrade, German Cuevas-Rodríguez, O. Malm, J.P.M. Torres, Maryse Simon, Remy Guyoneaud
article
Science of the Total Environment, 2015, 521-522, pp.1-10. ⟨10.1016/j.scitotenv.2015.02.098⟩
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2014

Journal articles

titre
Benthic foraminifera from the deep-water Niger delta (Gulf of Guinea): Assessing present-day and past activity of hydrate pockmarks
auteur
C. Fontanier, K.A. Koho, Marisol Goñi, B. Deflandre, Galaup Serge, A. Ivanovsky, N. Gayet, B. Dennielou, A. Grémare, S. Bichon, C. Gassie, P. Anschutz, Robert Duran, G.J. Reichart
article
Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers, 2014, 94, pp.87-106. ⟨10.1016/j.dsr.2014.08.011⟩
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titre
Microbial diversity in Los Azufres geothermal field (Michoacán, Mexico) and isolation of representative sulfate and sulfur reducers
auteur
E.M.S. Brito, N. Villegas-Negrete, I.A. Sotelo-González, C.A. Caretta, Marisol Goñi, Claire Gassie, Florence Hakil, Yannick Colin, Robert Duran, F. Gutiérrez-Corona, H.A. Piñón-Castillo, G. Cuevas-Rodríguez, O. Malm, J.P.M. Torres, A. Fahy, G.E. Reyna-López, Remy Guyoneaud
article
Extremophiles, 2014, 18 (2), pp.385-398. ⟨10.1007/s00792-013-0624-7⟩
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2013

Journal articles

titre
Bacterial biodiversity from anthropogenic extreme environments: A hyper-alkaline and hyper-saline industrial residue contaminated by chromium and iron
auteur
E.M.S. Brito, H.A. Piñón-Castillo, Remy Guyoneaud, C.A. Caretta, J.F. Gutiérrez-Corona, Robert Duran, G.E. Reyna-López, G.V. Nevárez-Moorillón, A. Fahy, Marisol Goñi
article
Applied Microbiology and Biotechnology, 2013, 97 (1), pp.369-378. ⟨10.1007/s00253-012-3923-5⟩
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titre
Combination of high throughput cultivation and dsrA sequencing for assessment of sulfate-reducing bacteria diversity in sediments
auteur
Yannick Colin, Marisol Goñi, Pierre Caumette, Remy Guyoneaud
article
FEMS Microbiology Ecology, 2013, 83 (1), pp.26-37. ⟨10.1111/j.1574-6941.2012.01452.x⟩
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BibTex
titre
Three-year survey of sulfate-reducing bacteria community structure in Carnoulès acid mine drainage (France), highly contaminated by arsenic
auteur
L. Giloteaux, Robert Duran, C. Casiot, O. Bruneel, F. Elbaz-Poulichet, Marisol Goñi
article
FEMS Microbiology Ecology, 2013, 83 (3), pp.724-737. ⟨10.1111/1574-6941.12028⟩
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https://hal.science/hal-01631885/file/Giloteaux%20et%20al%202013.pdf BibTex
titre
Impact of a simulated oil spill on benthic phototrophs and nitrogen-fixing bacteria in mudflat mesocosms
auteur
P.-M. Chronopoulou, A. Fahy, F. Coulon, S. Païssé, Marisol Goñi, L. Peperzak, L. Acuña Alvarez, B.A. Mckew, T. Lawson, K.N. Timmis, Robert Duran, G.J.C. Underwood, T.J. Mcgenity
article
Environmental Microbiology, 2013, 15 (1), pp.242--252. ⟨10.1111/j.1462-2920.2012.02864.x⟩
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2012

Journal articles

titre
Central role of dynamic tidal biofilms dominated by aerobic hydrocarbonoclastic bacteria and diatoms in the biodegradation of hydrocarbons in coastal mudflats
auteur
F. Coulon, P.-M. Chronopoulou, A. Fahy, S. Païssé, Marisol Goñi, L. Peperzak, L.A. Alvarez, B.A. Mckew, C.P.D. Brussaard, G.J.C. Underwood, K.N. Timmis, Robert Duran, T.J. Mcgenity
article
Applied and Environmental Microbiology, 2012, 78 (10), pp.3638-3648. ⟨10.1128/AEM.00072-12⟩
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titre
Ring-hydroxylating dioxygenase (RHD) expression in a microbial community during the early response to oil pollution
auteur
S. Païssé, Marisol Goñi, T. Stadler, H. Budzinski, Robert Duran
article
FEMS Microbiology Ecology, 2012, 80 (1), pp.77-86. ⟨10.1111/j.1574-6941.2011.01270.x⟩
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2011

Journal articles

titre
Are alkane hydroxylase genes (alkB) relevant to assess petroleum bioremediation processes in chronically polluted coastal sediments?
auteur
S. Païssé, Robert Duran, F. Coulon, Marisol Goñi
article
Applied Microbiology and Biotechnology, 2011, 92 (4), pp.835-844. ⟨10.1007/s00253-011-3381-5⟩
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Book sections

titre
Impact of hydrocarbons on marine microbial communities
auteur
Christine Cagnon, Magalie Stauffert, Cristiana Cravo-Laureau, Marisol Goñi, Sylvain Bordenave, S. Païssé, Pierre Caumette, Robert Duran
article
Ceccaldi HJ, Dekeyser, I., Girault, M., Stora, G. Global Change: Mankind-Marine Environment Interactions, Springer, pp.335-339, 2011, ISBN 978-90-481-8630-3
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titre
Hydrocarbon degradation in coastal muddy areas and anoxic ecosystems (DHYVA project): Role of bacterial mechanisms and bioturbation effects on the biodisponibility of organic pollutants
auteur
Magalie Stauffert, Lionel Huang, Isabelle Vitte, Ronan Jézéquel, Cristiana Cravo-Laureau, Georges Stora, Christophe Pécheyran, Christine Cagnon, Franck Gilbert, Marisol Goñi, François-Xavier Merlin, David Amouroux, Philippe Cuny, Robert Duran
article
Ceccaldi, H.-J., Dekeyser, I., Girault, M., Stora, G. Global Change: Mankind-Marine Environment Interactions, Springer, pp.393-395, 2011, ISBN 978-90-481-8630-3
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2010

Journal articles

titre
Hexavalent chromium reduction by bacterial consortia and pure strains from an alkaline industrial effluent
auteur
H.A. Piñon-Castillo, E.M.S. Brito, Marisol Goñi, Remy Guyoneaud, Robert Duran, G.V. Nevarez-Moorillon, J.F. Gutierrez-Corona, C.A. Caretta, G.E. Reyna-Lopez
article
Journal of Applied Microbiology, 2010, 109 (6), pp.2173-2182. ⟨10.1111/j.1365-2672.2010.04849.x⟩
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titre
Bacterial community structure of sediments of the bizerte lagoon (Tunisia), a southern mediterranean coastal anthropized lagoon
auteur
O.B. Said, Marisol Goñi, M.E. Bour, P. Aissa, Robert Duran
article
Microbial ecology, 2010, 59 (3), pp.445-456. ⟨10.1007/s00248-009-9585-x⟩
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How a Bacterial Community Originating from a Contaminated Coastal Sediment Responds to an Oil Input
auteur
S. Païssé, Marisol Goñi, F. Coulon, Robert Duran
article
Microbial ecology, 2010, 60 (2), pp.394-405. ⟨10.1007/s00248-010-9721-7⟩
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titre
Nested PCR and new primers for analysis of sulfate-reducing bacteria in low-cell-biomass environments
auteur
L. Giloteaux, Marisol Goñi, Robert Duran
article
Applied and Environmental Microbiology, 2010, 76 (9), pp.2856-2865. ⟨10.1128/AEM.02023-09⟩
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2009

Journal articles

titre
A case study of in situ oil contamination in a mangrove swamp (Rio De Janeiro, Brazil)
auteur
E.M.S. Brito, Robert Duran, Remy Guyoneaud, Marisol Goñi, T. García De Oteyza, M.A.C. Crapez, I. Aleluia, J.C.A. Wasserman
article
Marine Pollution Bulletin, 2009, 58 (3), pp.418-423. ⟨10.1016/j.marpolbul.2008.12.008⟩
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2008

Journal articles

titre
Microbial population changes during bioremediation of nitroaromatic - and nitramine-contaminated lagoon
auteur
G. Perchet, M. Sangely, Marisol Goñi, G. Merlina, J.-C. Revel, E. Pinelli
article
International Biodeterioration & Biodegradation, 2008, 61 (4), pp.304-312. ⟨10.1016/j.ibiod.2007.10.003⟩
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https://hal.science/hal-01631895/file/Perchet_3727.pdf BibTex
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Diversity of ring-hydroxylating dioxygenases in pristine and oil contaminated microbial mats at genomic and transcriptomic levels
auteur
S. Bordenave, Marisol Goñi, C. Vilette, S. Blanchard, Pierre Caumette, Robert Duran
article
Environmental Microbiology, 2008, 10 (12), pp.3201-3211. ⟨10.1111/j.1462-2920.2008.01707.x⟩
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titre
Mercury methylation by a microbial community from sediments of the Adour Estuary (Bay of Biscay, France)
auteur
Robert Duran, Magali Ranchou-Peyruse, V. Menuet, Mathilde Monperrus, Gilles Bareille, Marisol Goñi, J.C. Salvado, David Amouroux, Remy Guyoneaud, Olivier François Xavier Donard, Pierre Caumette
article
Environmental Pollution, 2008, 156 (3), pp.951-958. ⟨10.1016/j.envpol.2008.05.007⟩
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Archaeal diversity in a Fe-As rich acid mine drainage at Carnoulès (France)
auteur
O. Bruneel, N. Pascault, M. Egal, C. Bancon-Montigny, Marisol Goñi, F. Elbaz-Poulichet, J.-C. Personné, Robert Duran
article
Extremophiles, 2008, 12 (4), pp.563-571. ⟨10.1007/s00792-008-0160-z⟩
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https://hal.science/hal-01631896/file/Bruneel%20et%20al%202008.pdf BibTex
titre
Structure of bacterial communities along a hydrocarbon contamination gradient in a coastal sediment
auteur
S. Païssé, F. Coulon, Marisol Goñi, L. Peperzak, T.J. Mcgenity, Robert Duran
article
FEMS Microbiology Ecology, 2008, 66 (2), pp.295-305. ⟨10.1111/j.1574-6941.2008.00589.x⟩
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titre
Characterization of aerobic polycyclic aromatic hydrocarbon-degrading bacteria from Bizerte lagoon sediments, Tunisia
auteur
O. Ben Said, Marisol Goñi, M. El Bour, M. Dellali, P. Aissa, Robert Duran
article
Journal of Applied Microbiology, 2008, 104 (4), pp.987-997. ⟨10.1111/j.1365-2672.2007.03621.x⟩
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2007

Journal articles

titre
Effects of heavy fuel oil on the bacterial community structure of a pristine microbial mat
auteur
S. Bordenave, Marisol Goñi, Pierre Caumette, Robert Duran
article
Applied and Environmental Microbiology, 2007, 73 (19), pp.6089-6097. ⟨10.1128/AEM.01352-07⟩
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titre
Bacterial community structure along the Adour estuary (French Atlantic coast): Influence of salinity gradient versus metal contamination
auteur
Marisol Goñi, David Point, David Amouroux, Remy Guyoneaud, Olivier François Xavier Donard, Pierre Caumette, Robert Duran
article
Aquatic Microbial Ecology, 2007, 49 (1), pp.47-56. ⟨10.3354/ame01128⟩
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2006

Journal articles

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Characterization of hydrocarbonoclastic bacterial communities from mangrove sediments in Guanabara Bay, Brazil
auteur
Elcia Margareth Souza Brito, Remy Guyoneaud, Marisol Goñi, A. Ranchou-Peyruse, A. Verbaere, M.A.C. Crapez, J.C.A. Wasserman, Robert Duran
article
Research in Microbiology, 2006, 157 (8), pp.752-762. ⟨10.1016/j.resmic.2006.03.005⟩
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2004

Journal articles

titre
Structure and functional analyses of bacterial communities changes in microbial mats following petroleum exposure
auteur
S. Bordenave, A. Fourçans, S. Blanchard, Marisol Goñi, Pierre Caumette, Robert Duran
article
Ophelia, 2004, 58 (3), pp.195-203. ⟨10.1080/00785236.2004.10410227⟩
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titre
Degradation of the "Erika" oil
auteur
S. Bordenave, R. Jézéquel, A. Fourçans, H. Budzinski, F.X. Merlin, T. Fourel, Marisol Goñi, R. Guyonaud, R. Grimaud, P. Caumette, Robert Duran
article
Aquatic Living Resources, 2004, 17, pp.261-267
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Conference papers

titre
Mercury transformation by anaerobic bacterial communities selected from estuarine sediments
auteur
Marisol Goñi, M Dias, Mathilde Monperrus, J.C. Salvado, David Amouroux, Robert Duran, Olivier François Xavier Donard, Pierre Caumette, Remy Guyoneaud
article
7th International Conference on mercury as a global pollutant, Jun 2004, Ljubjana, Slovenia. pp.1006-1009
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2003

Journal articles

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Mercury methylation rates in coastal sediments versus microbial diversity and specific activity
auteur
Mathilde Monperrus, Remy Guyoneaud, Emmanuel Tessier, Robert Duran, Marisol Goñi, David Amouroux, Olivier François Xavier Donard, Pierre Caumette
article
Journal de Physique IV Proceedings, 2003, 107 (II), pp.883-886
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titre
Monitoring bacterial communities adaptation to mercury contamination in estuarine sediments maintained in slurries
auteur
Robert Duran, V. Menuet, Mathilde Monperrus, Remy Guyoneaud, Marisol Goñi, Emmanuel Tessier, David Amouroux, Olivier François Xavier Donard, Pierre Caumette
article
Journal de Physique IV Proceedings, 2003, 107 (I), pp.393-396
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Conference papers

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Transfer of metallic contaminants at the sediment-water interface in a coastal lagoon: role of the biological and microbial activity
auteur
David Amouroux, Mathilde Monperrus, D. Point, Emamnuel Tessier, Gilles Bareille, Olivier François Xavier Donard, Laurent Chauvaud, Gérard Thouzeau, F. Jean, J. Grall, Aude Leynaert, Jacques Clavier, Remy Guyoneaud, Robert Duran, Marisol Goñi, P. Caumette
article
XIIth international conference on Heavy metals in the environment, ICHMET, May 2003, Grenoble, France. pp.41-44
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2002

Journal articles

titre
Type II topoisomerase quinolone resistance-determining regions of Aeromonas caviae, A. hydrophila, and A. sobria complexes and mutations associated with quinolone resistance
auteur
Marisol Goñi, C. Arpin, M. Capdepuy, V. Dubois, Pierre Caumette, C. Quentin
article
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2002, 46 (2), pp.350-359. ⟨10.1128/AAC.46.2.350-359.2002⟩
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2000

Journal articles

titre
Antimicrobial resistance of mesophilic Aeromonas spp. isolated from two European rivers
auteur
Marisol Goñi, L. Pineau, M. Capdepuy, C. Roques, Pierre Caumette, C. Quentin
article
Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 2000, 46 (2), pp.297-301
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titre
Impact of an urban effluent on antibiotic resistance of riverine Enterobacteriaceae and Aeromonas spp.
auteur
Marisol Goñi, M. Capdepuy, C. Arpin, N. Raymond, Pierre Caumette
article
Applied and Environmental Microbiology, 2000, 66 (1), pp.125-132
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1999

Journal articles

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Impact of an urban effluent on the bacterial community structure in the Arga River (Spain), with special reference to culturable Gram-negative rods
auteur
Marisol Goñi, M. Capdepuy, N. Raymond, C. Quentin, Pierre Caumette
article
Canadian Journal of Microbiology, 1999, 45 (10), pp.826-832
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titre
Effect of macrofaunal bioturbation on bacterial distribution in marine sandy sediments, with special reference to sulphur-oxidising bacteria
auteur
Marisol Goñi, X. de Montaudouin, Remy Guyoneaud, G. Bachelet, R. de Wit
article
Journal of Sea Research (JSR), 1999, 41 (4), pp.269-279. ⟨10.1016/S1385-1101(99)00008-8⟩
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