2025

Journal articles

titre

Unveiling G-Protein-Coupled Receptor Conformational Dynamics via Metadynamics Simulations and Markov State Models

auteur

Rita Ann Roessner, Nicolas Floquet, Maxime Louet

article

Journal of Chemical Information and Modeling, 2025, 65 (9), pp.4630-4642. ⟨10.1101/2025.01.21.634062⟩

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Conference papers

titre

An intricate link between membrane lipids and GPCR signaling

auteur

Damian Marjorie, Michela Di Michele, Pauline Henri, Ludovic Berto, Maxime Louet, Nicolas Floquet, Julie Kniazeff, Jean‐louis Baneres

article

Symposium on GPCR Conformational Dynamics, Daniel Huster, Université de Leipzig, Jan 2025, Leipzig (DE), Germany

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2024

Journal articles

titre

Extended Sampling of Macromolecular Conformations from Uniformly Distributed Points on Multidimensional Normal Mode Hyperspheres

auteur

Antoniel A S. Gomes, Mauricio G S Costa, Maxime Louet, Nicolas Floquet, Paulo M Bisch, David Perahia

article

Journal of Chemical Theory and Computation, 2024, 20 (24), pp.10770-10786. ⟨10.1021/acs.jctc.4c01054⟩

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Preprints, Working Papers, ...

titre

Lipids modulate the dynamics of gpcr:β-arrestin interaction

auteur

Antoniel Gomes, Michela Di Michele, Rita Ann Roessner, Marjorie Damian, Paulo M Bisch, Nathalie Sibille, Maxime Louet, Jean‐louis Baneres, Nicolas Floquet

article

2024

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2023

Journal articles

titre

Sodium is a negative allosteric regulator of the ghrelin receptor

auteur

Guillaume Ferré, Antoniel A.S. Gomes, Maxime Louet, Marjorie Damian, Paulo Bisch, Olivier Saurel, Nicolas Floquet, Alain Milon, Jean-Louis Banères

article

Cell Reports, 2023, 42 (4), pp.112320. ⟨10.1016/j.celrep.2023.112320⟩

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titre

MDexciteR: Enhanced Sampling Molecular Dynamics by Excited Normal Modes or Principal Components Obtained from Experiments

auteur

Mauricio Costa, Paulo R Batista, Antoniel Gomes, Leonardo S Bastos, Maxime Louet, Nicolas Floquet, Paulo M Bisch, David Perahia

article

Journal of Chemical Theory and Computation, 2023, 19 (2), pp.412-425. ⟨10.1021/acs.jctc.2c00599⟩

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2021

Journal articles

titre

Concerted conformational dynamics and water movements in the ghrelin G protein-coupled receptor

auteur

Maxime Louet, Marina Casiraghi, Marjorie Damian, Mauricio Gs Costa, Pedro Renault, Antoniel As Gomes, Paulo R Batista, Céline M'Kadmi, Sophie Mary, Sonia Cantel, Severine Denoyelle, Khoubaib Ben Haj Salah, David Perahia, Paulo M Bisch, Jean-Alain Fehrentz, Laurent J Catoire, Nicolas Floquet, Jean-Louis Banères

article

eLife, 2021, 10, pp.e63201. ⟨10.7554/elife.63201⟩

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titre

Allosteric modulation of ghrelin receptor signaling by lipids

auteur

Marjorie Damian, Maxime Louet, Antoniel Augusto Severo Gomes, Céline M’kadmi, Séverine Denoyelle, Sonia Cantel, Sophie Mary, Paulo M Bisch, Jean-Alain Fehrentz, Laurent J Catoire, Nicolas Floquet, Jean‐louis Baneres

article

Nature Communications, 2021, 12 (1), pp.3938. ⟨10.1038/s41467-021-23756-y⟩

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titre

Cryo–electron microscopy structure of the antidiuretic hormone arginine-vasopressin V2 receptor signaling complex

auteur

Julien Bous, Hélène Orcel, Nicolas Floquet, Cédric Leyrat, Josephine Lai Kee Him, Gérald Gaibelet, Aurélie Ancelin, Julie Saint-Paul, Stefano Trapani, Maxime Louet, Rémy Sounier, Héléne Démèné, Sébastien Granier, Patrick Bron, Patrick Bron, Bernard Mouillac

article

Science Advances , 2021, 7 (21), pp.eabg5628. ⟨10.1126/sciadv.abg5628⟩

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2020

Preprints, Working Papers, ...

titre

Structure of the antidiuretic hormone vasopressin receptor signalling complex.

auteur

Julien Bous, Hélène Orcel, Nicolas Floquet, Cedric Leyrat, Josephine Lai-Kee-Him, Gérald Gaibelet, Aurelie Ancelin, Julie Saint-Paul, Stefano Trapani, Maxime Louet, Rémy Sounier, Héléne Démèné, Sébastien Granier, Patrick Bron, Bernard Mouillac

article

2020

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2019

Journal articles

titre

Molecular Dynamics Simulations of the Allosteric Modulation of the Adenosine A2a Receptor by a Mini-G Protein

auteur

Pedro Renault, Maxime Louet, Jacky Marie, Gilles Labesse, Nicolas Floquet

article

Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-41980-x⟩

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titre

Structure and dynamics of G protein-coupled receptor–bound ghrelin reveal the critical role of the octanoyl chain

auteur

Guillaume Ferré, Maxime Louet, Oliver Saurel, Bartholomé Delort, Georges Czaplicki, Céline M’kadmi, Marjorie Damian, Pedro Renault, Sonia Cantel, Laurent Gavara, Pascal Demange, Jacky Marie, Jean-Alain Fehrentz, Nicolas Floquet, Alain Milon, Jean-Louis Banères

article

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2019, 116 (35), pp.17525-17530. ⟨10.1073/pnas.1905105116⟩

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Conference papers

titre

Structure and dynamics of GPCR-bound ghrelin reveal the critical role of the octanoyl chain

auteur

Guillaume Ferré, Maxime Louet, Oliver Saurel, Bartholomé Delort, Georges Czaplicki, Céline M'Kadmi, Marjorie Damian, Pedro Renault, Sonia Cantel, Laurent Gavara, Pascal Jean-Pierre Demange, Jacky Marie, Jean-Alain Fehrentz, Nicolas Floquet, Alain Milon, Jean‐louis Baneres

article

Joint 12th EBSA congress and 10th ICBP – IUPAP Biophysics congress (EBSA-IUBAP 2019), European Biophysical Societies' Association (EBSA); International Union for Pure and Applied Biophysics (IUPAB); Sociedad de Biofísica de España, Jul 2019, Madrid, Spain

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2018

Journal articles

titre

Crystal structure and functional domains of the Mambaquaretin-1, a vasopressin type 2 receptor peptide inhibitor for kidney cysts treatment

auteur

Laura Droctové, Justyna Ciolek, Manon Lancien, Enrico Stura, Laura Vera, Nicolas Floquet, Ralph Witzgall, Bernard Mouillac, Christiane Mendre, Gilles Mourier, Denis Servent, Nicolas Gilles

article

Toxicon, 2018, 149, pp.91-92. ⟨10.1016/j.toxicon.2017.12.021⟩

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titre

GHSR-D2R heteromerization modulates dopamine signaling through an effect on G protein conformation

auteur

Marjorie Damian, Véronique Pons, Pedro Renault, Céline M’kadmi, Bartholomé Delort, Lucie Hartmann, Ali Kaya, Maxime Louet, Didier Gagne, Khoubaib Ben Haj Salah, Séverine Denoyelle, Gilles Ferry, Jean A. Boutin, Renaud Wagner, Jean-Alain Fehrentz, Jean Martinez, Jacky Marie, Nicolas Floquet, Céline Galés, Sophie Mary, Heidi Hamm, Jean-Louis Banères

article

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2018, 115 (17), pp.4501-4506. ⟨10.1073/pnas.1712725115⟩

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titre

Structure and Dynamics of the Receptor-Bound Ghrelin Lipopeptide

auteur

Guillaume Ferré, Marjorie Damian, Céline M'Kadmi, Olivier Saurel, Georges Czaplicki, Pascal Jean-Pierre Demange, Jacky Marie, Nicolas Floquet, Jean-Alain Fehrentz, Alain Milon, Jean-Louis Banères

article

Biophysical Journal, 2018, 114 (3), pp.235a. ⟨10.1016/J.BPJ.2017.11.1308⟩

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2017

Journal articles

titre

Use of Molecular Modeling to Design Selective NTS2 Neurotensin Analogues

auteur

Roberto Fanelli, Nicolas Floquet, Élie Besserer-Offroy, Bartholomé Delort, Mélanie Vivancos, Jean-Michel Longpré, Pedro Renault, Jean Martinez, Philippe Sarret, Florine Cavelier

article

Journal of Medicinal Chemistry, 2017, 60 (8), pp.3303-3313. ⟨10.1021/acs.jmedchem.6b01848⟩

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titre

Coarse-Grained Prediction of Peptide Binding to G-Protein Coupled Receptors

auteur

Bartholomé Delort, Pedro Renault, Landry Charlier, Florent Raussin, Jean Martinez, Nicolas Floquet

article

Journal of Chemical Information and Modeling, 2017, 57 (3), pp.562-571. ⟨10.1021/acs.jcim.6b00503⟩

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2016

Journal articles

titre

Structural and Molecular Determinants of Membrane Binding by the HIV-1 Matrix Protein

auteur

Peter Mercredi, Nadine Bucca, Burk Loeliger, Christy Gaines, Mansi Mehta, Pallavi Bhargava, Philip Tedbury, Landry Charlier, Nicolas Floquet, Delphine Muriaux, Cyril Favard, Charles Sanders, Eric Freed, Jan Marchant, Michael Summers

article

Journal of Molecular Biology, 2016, 428 (8), pp.1637-1655. ⟨10.1016/j.jmb.2016.03.005⟩

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2015

Journal articles

titre

Conformational Equilibrium of CDK/Cyclin Complexes by Molecular Dynamics with Excited Normal Modes

auteur

Nicolas Floquet, Mauricio g.S. Costa, Paulo r. Batista, Pedro Renault, Paulo m. Bisch, Florent Raussin, Jean Martinez, May c. Morris, David Perahia

article

Biophysical Journal, 2015, 109 (6), pp.1179-1189. ⟨10.1016/j.bpj.2015.07.003⟩

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titre

Identification of TAX2 peptide as a new unpredicted anti-cancer agent

auteur

Albin Jeanne, Emilie Sick, Jerôme Devy, Nicolas Floquet, N. Belloy, Louis Theret, Camille Boulagnon-Rombi, Marie-Danièle Diebold, Manuel Dauchez, Laurent Martiny, Christophe Schneider, Stephane Dedieu

article

Oncotarget, 2015, 6, pp.17981-18000. ⟨10.18632/oncotarget.4025⟩

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2014

Journal articles

titre

Coarse-Grained Simulations of the HIV-1 Matrix Protein Anchoring: Revisiting Its Assembly on Membrane Domains.

auteur

Landry Charlier, Maxime Louet, Laurent Chaloin, Patrick Fuchs, Jean Martinez, Delphine Muriaux, Cyril Favard, Nicolas Floquet

article

Biophysical Journal, 2014, 106 (3), pp.577-585. ⟨10.1016/j.bpj.2013.12.019⟩

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2013

Journal articles

titre

Conformational restriction of G-proteins Coupled Receptors (GPCRs) upon complexation to G-proteins: A putative activation mode of GPCRs?

auteur

Maxime Louet, Esra Karakas, Alexandre Perret, David Perahia, Jean Martinez, Nicolas Floquet

article

FEBS Letters, 2013, 587 (16), pp.2656-2661. ⟨10.1016/j.febslet.2013.06.052⟩

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titre

Design of thrombospondin-binding peptides exhibiting strong anti- angiogenesis and anti-tumor properties

auteur

A. Jeanne, E. Sick, C. Schneider, Nicolas Floquet, J. Devy, N. Belloy, Marie-Danièle Diebold, M. Dauchez, L. Martiny, S. Dedieu

article

FEBS Journal, 2013, 280 (S1), pp.307-307. ⟨10.1111/febs.12340⟩

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titre

Interaction between the elastin peptide VGVAPG and human elastin binding protein.

auteur

Charlotte Blanchevoye, Nicolas Floquet, Amandine Scandolera, Stéphanie Baud, Pascal Maurice, Olivier Bocquet, Sébastien Blaise, Christelle Ghoneim, Benoît Cantarelli, Frédéric Delacoux, Manuel Dauchez, Roman G Efremov, Laurent Martiny, Laurent Duca, Laurent Debelle

article

Journal of Biological Chemistry, 2013, 288 (2), pp.1317-1328. ⟨10.1074/jbc.M112.419929⟩

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titre

Interaction between the Elastin Peptide VGVAPG and Human Elastin Binding Protein

auteur

Charlotte Blanchevoye, Nicolas Floquet, Amandine Scandolera, Stéphanie Baud, Pascal Maurice, Olivier Bocquet, Sébastien Blaise, Christelle Ghoneim, Benoît Cantarelli, Frédéric Delacoux, Manuel Dauchez, Roman G Efremov, Laurent Martiny, Laurent Duca, Laurent Debelle

article

Journal of Biological Chemistry, 2013, 288 (2), pp.1317-1328. ⟨10.1074/jbc.M112.419929⟩

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Other publications

titre

Nos récepteurs déroulent leur mécanique !

auteur

Maxime Louet, Landry Charlier, Jean Martinez, Nicolas Floquet

article

2013, pp.380:26

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2012

Journal articles

titre

Dissociation of Membrane-Anchored Heterotrimeric G-Protein Induced by Gα Subunit Binding to GTP.

auteur

Maxime Louet, Landry Charlier, Jean Martinez, Nicolas Floquet

article

Journal of Chemical Information and Modeling, 2012, 52 (11), pp.3022-3027. ⟨10.1021/ci3003717⟩

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titre

Ligands and signaling proteins govern the conformational landscape explored by a G protein-coupled receptor.

auteur

Sophie Mary, Marjorie Damian, Maxime Louet, Nicolas Floquet, Jean-Alain Fehrentz, Jacky Marie, Jean Martinez, Jean-Louis Banères

article

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2012, 109 (21), pp.8304-9. ⟨10.1073/pnas.1119881109⟩

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titre

Chemical optimization of new ligands of the low-density lipoprotein receptor as potential vectors for central nervous system targeting.

auteur

Jean-Daniel Malcor, Nadine Payrot, Marion David, Aude Faucon, Karima Abouzid, Guillaume Jacquot, Nicolas Floquet, Franck Debarbieux, Geneviève Rougon, Jean Martinez, Michel Khrestchatisky, Patrick Vlieghe, Vincent Lisowski

article

Journal of Medicinal Chemistry, 2012, 55 (5), pp.2227-41. ⟨10.1021/jm2014919⟩

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titre

GDP release preferentially occurs on the phosphate side in heterotrimeric G-proteins.

auteur

Maxime Louet, Jean Martinez, Nicolas Floquet

article

PLoS Computational Biology, 2012, 8 (7), pp.e1002595. ⟨10.1371/journal.pcbi.1002595⟩

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2011

Journal articles

titre

L-Arginine Binding to Human Inducible Nitric Oxide Synthase: An Antisymmetric Funnel Route toward Isoform-Specific Inhibitors?

auteur

Nicolas Floquet, Jean-François Hernandez, Jean-Luc Boucher, Jean Martinez

article

Journal of Chemical Information and Modeling, 2011, 51, pp.1325-1335. ⟨10.1021/ci100422v⟩

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titre

A Concerted Mechanism for Opening the GDP Binding Pocket and Release of the Nucleotide in Hetero-Trimeric G-Proteins

auteur

Maxime Louet, David Perahia, Jean Martinez, Nicolas Floquet

article

Journal of Molecular Biology, 2011, 411, pp.296-312. ⟨10.1016/j.jmb.2011.05.034⟩

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2010

Journal articles

titre

The YSNSG cyclopeptide derived from tumstatin inhibits tumor angiogenesis by down-regulating endothelial cell migration.

auteur

Jessica Thevenard, Laurent Ramont, Jérome Devy, Bertrand Brassart, Aurélie Dupont-Deshorgue, Nicolas Floquet, Laurence Schneider, Farid Ouchani, Christine Terryn, François-Xavier Maquart, Jean-Claude Monboisse, Sylvie Brassart-Pasco

article

International Journal of Cancer Supplement, 2010, 126 (5), pp.1055-1066. ⟨10.1002/ijc.24688⟩

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titre

Activation of the Ghrelin Receptor is Described by a Privileged Collective Motion: A Model for Constitutive and Agonist-induced Activation of a Sub-class A G-Protein Coupled Receptor (GPCR)

auteur

Nicolas Floquet, C. Mikadmi, D. Perahia, Didier Gagne, Gilbert Berge, Jacky Marie, Jean-Louis Baneres, Jean-Claude Galleyrand, Jean-Alain Fehrentz, Jean Martinez

article

Journal of Molecular Biology, 2010, 395 (4), pp.769-784. ⟨10.1016/j.jmb.2009.09.051⟩

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titre

Involvement of tryptophan W276 and of two surrounding amino acid residues in the high constitutive activity of the ghrelin receptor GHS-R1a

auteur

C. Goze, Gilbert Berge, Celine M\'Kadmi, Nicolas Floquet, Didier Gagne, Jean-Claude Galleyrand, Jean-Alain Fehrentz, Jean Martinez

article

European Journal of Pharmacology Molecular Pharmacology, 2010, 643 (2-3), pp.153-161. ⟨10.1016/j.ejphar.2010.06.018⟩

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titre

The YSNSG cyclopeptide derived from tumstatin inhibits tumor angiogenesis by down-regulating endothelial cell migration

auteur

Jessica Thévenard, Laurent Ramont, Bertrand Brassart, Aurélie Dupont-Deshorgue, Nicolas Floquet, Laurence Schneider, Farid Ouchani, François-Xavier Maquart, Jean-Claude Monboisse, Sylvie Brassart-Pasco

article

International Journal of Cancer, 2010, 126 (5), pp.1055-1066

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2009

Journal articles

titre

Expanding the borononucleotide family: synthesis of borono-analogues of dCMP, dGMP and dAMP.

auteur

Anthony R. Martin, Kishor Mohanan, Delphine Luvino, Nicolas Floquet, Carine Baraguey, Michaël Smietana, Jean-Jacques Vasseur

article

Organic & Biomolecular Chemistry, 2009, 7 (21), pp.4369-4377. ⟨10.1039/b912616c⟩

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titre

Collective motions in glucosamine-6-phosphate synthase: influence of ligand binding and role in ammonia channelling and opening of the fructose-6-phosphate binding site.

auteur

Nicolas Floquet, Philippe Durand, Bernard Maigret, Bernard Badet, Marie-Ange Badet-Denisot, David Perahia

article

Journal of Molecular Biology, 2009, 385 (2), pp.653-664. ⟨10.1016/j.jmb.2008.10.032⟩

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titre

The role of aspartyl-rich pentapeptides in comparative complexation of actinide(IV) and iron(III). Part 1

auteur

Aurélie Jeanson, Claude Berthon, S. Coantic, Christophe den Auwer, Nicolas Floquet, Harald Funke, Denis Guillaneux, Christoph Hennig, Jean Martinez, Philippe Moisy, Sébastien Petit, Olivier Proux, Eric Quéméneur, Pier Lorenzo Solari, Gilles Subra

article

New Journal of Chemistry, 2009, 33 (5), pp.976-985. ⟨10.1039/B813523A⟩

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titre

The spirocyclopropyl moiety as a methyl surrogate in the structure of L-fucosidase and L-rhamnosidase inhibitors

auteur

Morwenna Pearson, Nicolas Floquet, Claudia Bello, Pierre Vogel, Richard Plantier-Royon, Jan Szymoniak, Philippe Bertus, Jean-Bernard Behr

article

Bioorganic and Medicinal Chemistry, 2009, 17 (23), pp.8020-8026. ⟨10.1016/j.bmc.2009.10.010⟩

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2008

Journal articles

titre

Human thrombospondin’s (TSP-1) C-terminal domain opens to interact with the CD-47 receptor: A molecular modeling study

auteur

Nicolas Floquet, Stéphane Dedieu, Laurent Martiny, Manuel Dauchez, David Perahia

article

Archives of Biochemistry and Biophysics, 2008, 478 (1), pp.103-109. ⟨10.1016/j.abb.2008.07.015⟩

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2007

Journal articles

titre

Ammonia channeling in bacterial glucosamine-6-phosphate synthase (Glms): Molecular dynamics simulations and kinetic studies of protein mutants.

auteur

Nicolas Floquet, Stéphane Mouilleron, Rasha Daher, Bernard Maigret, Bernard Badet, Marie-Ange Badet-Denisot

article

FEBS Letters, 2007, 581 (16), pp.2981-7. ⟨10.1016/j.febslet.2007.05.068⟩

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titre

Expression and purification of active human internal His6-tagged l-glutamine: d-Fructose-6P amidotransferase I

auteur

Celine Richez, Joachim Boetzel, Nicolas Floquet, Kinnera Koteshwar, Julie Stevens, Bernard Badet, Marie-Ange Badet

article

Protein Expression and Purification, 2007, 54 (1), pp.45-53. ⟨10.1016/j.pep.2007.01.015⟩

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titre

Discovery new inhibitors of bacterial glucosamine-6P synthase (GlmS) by docking simulations

auteur

Nicolas Floquet, C. Richez, P. Durand, Bernard Maigret, B. Badet, M. A. Badet

article

Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters, 2007, 17 (7), pp.1966-1970. ⟨10.1016/j.bmcl.2007.01.052⟩

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2006

Journal articles

titre

Structural and antitumor properties of the YSNSG cyclopeptide derived from Tumstatin

auteur

Jessica Thévenard, Nicolas Floquet, Laurent Ramont, Elise Prost, Jean-Marc Nuzillard, Manuel Dauchez, Hocine Yezid, Alain J.P. Alix, François-Xavier Macquart, Jean-Claude Monboisse, Sylvie Brassart-Pasco

article

Chemistry and Biology, 2006, 13, pp.1307-1315

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2004

Journal articles

titre

Elastin as a matrikine

auteur

Laurent Duca, Nicolas Floquet, Alain J.P Alix, Bernard Haye, Laurent Debelle

article

Critical Reviews in Oncology/Hematology, 2004, 49 (3), pp.235-244. ⟨10.1016/j.critrevonc.2003.09.007⟩

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2003

Book sections

titre

Structure-function relationships of elastin-derived peptides: determination of a structural motif involved in the peptides-receptor(s) interactions.

auteur

Nicolas Floquet, Laurent Duca, Stéphanie Héry-Hyunh, Gauthier Moroy, Manuel Dauchez, Laurent Debelle, Alain J.P. Alix

article

Elastin 2002, 2003

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2002

Conference papers

titre

Elastin in silico.

auteur

Alain J.P. Alix, Brigida Bochicchio, Manuel Dauchez, Laurent Debelle, Philippe Derreumaux, Nicolas Floquet, Patrick Fuchs, Stéphanie Héry-Huynh, Hervé H. Kaplan, Gauthier Moroy, Antonio Tamburro

article

Second European Symposium ELASTIN 2002, Jul 2002, Acquafredda di Maratea, Italy

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