2024
Journal articles
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- titre
- Predominant heterotrophic diazotrophic bacteria are involved in Sargassum proliferation in the great Atlantic Sargassum Belt
- auteur
- M Léger-Pigout, E Navarro, F Menard, S Ruitton, F Le Loc’h, S Guasco, J-M Munaron, D Thibault, T Changeux, S Connan, V Stiger-Pouvreau, T Thibaut, V Michotey
- article
- The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2024, ⟨10.1093/ismejo/wrad026⟩
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- titre
- Linking Zetaproteobacterial diversity and substratum type in iron-rich microbial mats from the Lucky Strike hydrothermal field (EMSO-Azores observatory)
- auteur
- Aina Astorch-Cardona, Giliane P Odin, Valérie Chavagnac, Alain Dolla, Hélène Gaussier, Céline Rommevaux
- article
- Applied and Environmental Microbiology, 2024, ⟨10.1128/aem.02041-23⟩
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- titre
- Algal‐ and soil‐derived dissolved organic matter shapes bacteria‐phytoplankton interactions in a high‐altitude lake
- auteur
- Flavia Dory, Laurent Cavalli, Evelyne Franquet, France van Wambeke, Benjamin Misson, Stéphane Mounier, Christian Martino, Benjamin Oursel, Thierry Tatoni, Céline Bertrand
- article
- Freshwater Biology, In press, ⟨10.1111/fwb.14225⟩
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- titre
- What happens to biomass burning-emitted particles in the ocean? A laboratory experimental approach based on their tracers
- auteur
- Juan Miguel González-Sánchez, Christos Panagiotopoulos, Candice Antich, Laure Papillon, Nicole Garcia, France van Wambeke, Benjamin Misson
- article
- Science of the Total Environment, 2024, 907, pp.167770. ⟨10.1016/j.scitotenv.2023.167770⟩
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- titre
- A novel method to sample individual marine snow particles for downstream molecular analyses
- auteur
- Chloé M.J. Baumas, Fatima‐ezzahra Ababou, Marc Garel, Mina Bizic, Danny Ionescu, Arthur Puzenat, Frederic A.C. Le Moigne, Hans-Peter Grossart, Christian Tamburini
- article
- Limnology and Oceanography: Methods, 2024, 22, pp.34-46. ⟨10.1002/lom3.10590⟩
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2023
Journal articles
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- titre
- Assessing the diversity of plankton-associated prokaryotes along a size-fraction gradient: A methodological evaluation
- auteur
- Léa Cabrol, Mélanie Delleuze, Arthur Szylit, Guillaume Schwob, Marianne Quemeneur, Benjamin Misson
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2023, 197, pp.115688. ⟨10.1016/j.marpolbul.2023.115688⟩
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- titre
- Multi-objective Optimization of Thermophilic Biohydrogen Production
- auteur
- Khadija Blaiech,, Juan Acosta-Pavas, Davidsond, Sylvain, Lamia Ben Gaïda, Gannoun, Hanna, Pierre-Pol Liebgott, César Arturo Aceves-Lara
- article
- Chemical Engineering Transactions, 2023, 105, pp.31-36
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- titre
- Assessing the bioavailability of black carbon-derived dissolved organic matter for marine heterotrophic prokaryotes
- auteur
- Pauline Martinot, Catherine Guigue, Sandrine Chifflet, Philippe Cuny, Aude Barani, Morgane Didry, Clara Dignan, Léa Guyomarc'h, Nathalie Pradel, Olivier Pringault, France van Wambeke, Cam Tu Vu, Xavier Mari, Marc Tedetti
- article
- Science of the Total Environment, 2023, 901, pp.165802. ⟨10.1016/j.scitotenv.2023.165802⟩
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- titre
- An Effect-Based Method to Evaluate Spatio-Temporal Variations of Coastal Marine DOM Properties
- auteur
- Clara Dignan, Véronique Lenoble, Olivier Pringault, Benjamin Misson
- article
- Journal of Marine Science and Engineering, 2023, 11 (10), pp.1841. ⟨10.3390/jmse11101841⟩
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- titre
- Biological mechanisms underlying priming of vascular plant material in the presence of diatoms
- auteur
- Patricia Bonin, Aurélie Portas, Julie Hardy, Sophie Guasco, Ts Bianchi, Nd Ward, Jf Rontani
- article
- Aquatic Microbial Ecology, 2023, 89, pp.99-117. ⟨10.3354/ame01999⟩
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- titre
- Metabolic challenges and key players in serpentinite-hosted microbial ecosystems
- auteur
- Rabja Maria Popall, Anne Postec, Aurélien Lecoeuvre, Marianne Quéméneur, Gaël Erauso
- article
- Frontiers in Microbiology, 2023, 14, ⟨10.3389/fmicb.2023.1197823⟩
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- titre
- Microbial taxa related to natural hydrogen and methane emissions in serpentinite-hosted hyperalkaline springs of New Caledonia
- auteur
- Marianne Quéméneur, Nan Mei, Christophe Monnin, Anne Postec, Sophie Guasco, Julie Jeanpert, Pierre Maurizot, Bernard Pelletier, Gaël Erauso
- article
- Frontiers in Microbiology, 2023, 14, ⟨10.3389/fmicb.2023.1196516⟩
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- titre
- Cellular Damage of Bacteria Attached to Senescent Phytoplankton Cells as a Result of the Transfer of Photochemically Produced Singlet Oxygen: A Review
- auteur
- Jean-François Rontani, Patricia Bonin
- article
- Microorganisms, 2023, 11 (6), pp.1565. ⟨10.3390/microorganisms11061565⟩
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- titre
- Prokaryotic Responses to Estuarine Coalescence Contribute to Planktonic Community Assembly in a Mediterranean Nutrient-Rich Estuary
- auteur
- Elisabeth Navarro, Chiara Santinelli, Simona Retelletti Brogi, Gaël Durrieu, Olivier Radakovitch, Cédric Garnier, Benjamin Misson
- article
- Journal of Marine Science and Engineering, 2023, 11 (5), pp.933. ⟨10.3390/jmse11050933⟩
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- titre
- Contamination of planktonic food webs in the Mediterranean Sea: Setting the frame for the MERITE-HIPPOCAMPE oceanographic cruise (spring 2019)
- auteur
- Marc Tedetti, Jacek Tronczynski, François Carlotti, Marc Pagano, Sana Ben Ismail, Cherif Sammari, Malika Bel Hassen, Karine Desboeufs, Charlotte Poindron, Amel Bellaaj Zouari, Moufida Abdennadher, Sirine Amri, Daniela Bănaru, Lotfi Ben Abdallah, Nagib Bhairy, Ismail Boudriga, Aude Bourin, Christophe Brach-Papa, Nicolas Briant, Léa Cabrol, Cristele Chevalier, Sandrine Chifflet, Lassaad Chouba, Sylvain Coudray, Mohamed Nejib Daly Yahia, Thibault de Garidel-Thoron, Aurélie Dufour, Jean-Claude Dutay, Boris Espinasse, Pamela Fierro-González, Michel Fornier, Nicole Garcia, Stéphanie Jacquet, Catherine Guigue, Franck Giner, Loic Guilloux, Asma Hamza, Lars-Eric Heimbürger-Boavida, Joel Knoery, Rim Lajnef, Nouha Makhlouf Belkahia, Deny Malengros, Pauline Martinot, Anthony Bosse, Jean-Charles Mazur, Marouan Meddeb, Benjamin Misson, Olivier Pringault, Marianne Quemeneur, Olivier Radakovitch, Patrick Raimbault, Christophe Ravel, Javier Angel Tesán-Onrubia, Vincent Rossi, Bastien Thomas, Chaimaa Rwawi, Asma Sakka Hlaili, Melilotus Thyssen, Noureddine Zaaboub
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2023, 189, pp.114765. ⟨10.1016/j.marpolbul.2023.114765⟩
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- titre
- Bacterial diversity of an acid mine drainage beside the Xichú River (Mexico) accessed by culture-dependent and culture-independent approaches
- auteur
- Elcia Margareth Souza Brito, Remy Guyoneaud, César Augusto Caretta, Manon Joseph, Marisol Goñi-Urriza, Bernard Ollivier, Agnès Hirschler-Réa
- article
- Extremophiles, 2023, 27 (1), pp.5. ⟨10.1007/s00792-023-01291-6⟩
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- titre
- Adaptation Strategies to High Hydrostatic Pressures in Pseudothermotoga species Revealed by Transcriptional Analyses
- auteur
- Romain Fenouil, Nathalie Pradel, Hassiba Belahbib, Marie Roumagnac, Manon Bartoli, Wajdi Ben Hania, Yann Denis, Marc Garel, C. Tamburini, Bernard Ollivier, Zarath Summers, Fabrice Armougom, Alain Dolla
- article
- Microorganisms, 2023, 11 (3), pp.773. ⟨10.3390/microorganisms11030773⟩
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- titre
- Aminithiophilus ramosus gen. nov., sp. nov., a sulphur-reducing bacterium isolated from a pyrite-forming enrichment culture, and taxonomic revision of the family Synergistaceae
- auteur
- Nathalie Pradel, Marie-Laure Fardeau, Boyke Bunk, Cathrin Spröer, Christian Boedeker, Jacqueline Wolf, Meina Neumann-Schaal, Michael Pester, Stefan Spring
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2023, 73 (2), ⟨10.1099/ijsem.0.005691⟩
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- titre
- Prokaryotic Diversity and Dynamics during Dinoflagellate Bloom Decays in Coastal Tunisian Waters
- auteur
- Rim Lajnef, Marianne Quéméneur, Moufida Abdennadher, Lamia Dammak Walha, Asma Hamza, Malika Belhassen, Amel Bellaaj Zouari
- article
- Diversity, 2023, 15 (2), pp.273. ⟨10.3390/d15020273⟩
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- titre
- Thermospira aquatica gen. nov., sp. nov., a novel thermophilic spirochete isolated from a Tunisian hot spring, and description of the novel family Thermospiraceae
- auteur
- Zouhaier Ben Ali Gam, Abdoulaye Thioye, Jean-Luc Cayol, Anne Postec, Manon Bartoli-Joseph, Céline Vandecasteele, Gaël Erauso, Marc Labat
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2023, 73 (1), ⟨10.1099/ijsem.0.005690⟩
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- titre
- Planktonic shift with dissolved organic matter properties: a functional perspective for sentinel lakes
- auteur
- Flavia Dory, Laurent Cavalli, Evelyne Franquet, Stéphane Mounier, Patrick Höhener, Benjamin Misson, Mathieu Martin, Quentin Arnault, Thierry Tatoni, Céline Bertrand
- article
- Journal of Ecology, 2023, 111 (1), pp.45-61. ⟨10.1111/1365-2745.14013⟩
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- titre
- Karenia selliformis bloom dynamics and growth rate estimation in the Sfax harbour (Tunisia), by using automated flow cytometry equipped with image in flow, during autumn 2019
- auteur
- Ismail Boudriga, Moufida Abdennadher, Yosra Khammeri, Mabrouka Mahfoudi, Marianne Quéméneur, Asma Hamza, Nader Bel Haj Hmida, Amel Bellaaj Zouari, Malika Bel Hassen
- article
- Harmful Algae, 2023, 121, pp.102366. ⟨10.1016/j.hal.2022.102366⟩
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- titre
- Phage-Host Prediction Using a Computational Tool Coupled with 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing
- auteur
- Harilanto Felana Andrianjakarivony, Yvan Bettarel, Fabrice Armougom, Christelle Desnues
- article
- Viruses, 2023, 15 (1), pp.76. ⟨10.3390/v15010076⟩
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- titre
- Marinitoga aeolica sp. nov., a novel thermophilic anaerobic heterotroph isolated from a shallow hydrothermal field of Panarea Island in the Aeolian archipelago, Italy
- auteur
- Anne Postec, Grégoire Galès, Anne-Hélène Prime, Manon Bartoli, Roy E Price, Céline Vandecasteele, Gaël Erauso
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2023, 73 (11), pp.006186. ⟨10.1099/ijsem.0.006186⟩
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- titre
- Reconstructing the ocean's mesopelagic zone carbon budget: sensitivity and estimation of parameters associated with prokaryotic remineralization
- auteur
- Chloé Baumas, Robin Fuchs, Marc Garel, Jean-Christophe Poggiale, Laurent Memery, Frédéric A. C. Le Moigne, Christian Tamburini
- article
- Biogeosciences, 2023, 20 (19), pp.4165-4182. ⟨10.5194/BG-20-4165-2023⟩
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- titre
- Singlet oxygen‐induced alteration of bacteria associated with phytodetritus: Effect of irradiance
- auteur
- Christopher Burot, Patricia Bonin, Gwénola Simon, Laurie Casalot, Jean‐françois Rontani
- article
- Journal of Phycology, 2023, 59 (5), pp.980-988. ⟨10.1111/jpy.13376⟩
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-
Reports
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- titre
- Prospective océan-atmosphère 2023-2028
- auteur
- Jean-Francois Doussin, Thibault de Garidel-Thoron, P. Lherminier, S. Bony, Sébastien Payan, Cyrille Flamant, Xavier Capet, P. Chazette, C. Delon, Fleur Couvreux, G. Durand, E. Freney, Kathy S. Law, R. Morrow, E. Sanchez-Gomez, J. Riédi, N. Savoye Riédi, F. d'Ortenzio, F. Lohou, Paola Formenti, G. Forêt, G. Uzu, J. F. Léon, Samuel Morin, Philippe Bousquet, M. Cirtog, Virginie Marécal, J. Savarino, Gaelle Dufour, Thibaut Wagener, Stephane Sauvage, Eric Villenave, Joël E Savarino, Christian Tamburini, Fabrizio d'Ortenzio, Urania Christaki
- article
- Institut National des Sciences de l'Univers. 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
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- titre
- Des microalgues produisent des eaux colorées dangereuses pour la santé
- auteur
- Isabelle C. Biegala, Louise Rigaud, Manoella Sibat, Thierry Jauffrais, Jean Lorquin, Nina Brunet, Vincent Dumontet, Muriel Hagen, Tepoerau Mai, Rachelle Lanceleur
- article
- CRESICA. 2023
- Accès au bibtex
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Preprints, Working Papers, ...
- titre
- kmindex and ORA: indexing and real-time user-friendly queries in terabyte-sized complex genomic datasets
- auteur
- Téo Lemane, Nolan Lezzoche, Julien Lecubin, Eric Pelletier, Magali Lescot, Rayan Chikhi, Pierre Peterlongo
- article
- 2023
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- titre
- Equatorial to Polar genomic variability of the microalgae Bathycoccus prasinos
- auteur
- Jade Leconte, Youri Timsit, Tom O Delmont, Magali Lescot, Gwenael Piganeau, Patrick Wincker, Olivier Jaillon
- article
- 2023
- Accès au bibtex
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- titre
- Singlet oxygen-induced alteration of bacteria associated with phytodetritus: effect of bacterial pigments
- auteur
- Gwénola Simon, Laurie Casalot, Corinne Valette, Christopher Burot, Jean-François Rontani, Patricia Bonin
- article
- 2023
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- titre
- “Quasigenus” amongPhycodnaviridae: A diversity of chlorophyte-infecting viruses in response to a dense algal culture in a high-rate algal pond
- auteur
- Emily E Chase, Thomas M Pitot, Sonia Monteil-Bouchard, Christelle Desnues, Guillaume Blanc
- article
- 2023
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2022
Journal articles
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- titre
- Isotopic compositions of copper and zinc in plankton from the Mediterranean Sea (MERITE-HIPPOCAMPE campaign): Tracing trophic transfer and geogenic inputs
- auteur
- Sandrine Chifflet, Nicolas Briant, Rémi Freydier, Daniel Araùjo, Marianne Quéméneur, Hana Zouch, Amel Bellaaj-Zouari, François Carlotti, Marc Tedetti
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2022, 185 (Part A), pp.114315. ⟨10.1016/j.marpolbul.2022.114315⟩
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- titre
- Effective degradation of organophosphate ester flame retardants and plasticizers in coastal sediments under high urban pressure
- auteur
- Javier Castro-Jimenez, Philippe Cuny, Cécile Militon, Lea Sylvi, F Royer, L Papillon, Richard Sempere
- article
- Scientific Reports, 2022, ⟨10.1038/s41598-022-24685-6⟩
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- titre
- Screening for Hyperthermophilic Electrotrophs for the Microbial Electrosynthesis of Organic Compounds
- auteur
- Rabja Maria Popall, Alenica Heussner, Sven Kerzenmacher, Pierre-Pol Liebgott, Guillaume Pillot
- article
- Microorganisms, 2022, 10 (11), pp.2249. ⟨10.3390/microorganisms10112249⟩
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- titre
- A RUpture‐Based detection method for the Active mesopeLagIc Zone (RUBALIZ): A crucial step toward rigorous carbon budget assessments
- auteur
- Robin Fuchs, Chloé M J Baumas, Marc Garel, David Nerini, Frédéric a C Le Moigne, Christian Tamburini
- article
- Limnology and Oceanography: Methods, 2022, ⟨10.1002/lom3.10520⟩
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- titre
- Methanobacterium alkalithermotolerans sp. nov., a novel alkaliphilic and hydrogen-utilizing methanogen isolated from an alkaline geothermal spring (La Crouen, New Caledonia)
- auteur
- Nan Mei, Anne Postec, Manon Bartoli, Céline Vandecasteele, Laura Wils, Lisa Gil, Christophe Monnin, Bernard Pelletier, Gael Erauso, Marianne Quéméneur
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2022, 72 (10), ⟨10.1099/ijsem.0.005554⟩
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- titre
- Comparative Metagenomics Highlight a Widespread Pathway Involved in Catabolism of Phosphonates in Marine and Terrestrial Serpentinizing Ecosystems
- auteur
- Eléonore Frouin, Aurélien Lecoeuvre, Fabrice Armougom, Matthew Schrenk, Gaël Erauso
- article
- mSystems, 2022, 7 (4), ⟨10.1128/msystems.00328-22⟩
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- titre
- Genomic evidence for global ocean plankton biogeography shaped by large-scale current systems
- auteur
- Daniel Richter, Romain Watteaux, Thomas Vannier, Jade Leconte, Paul Frémont, Gabriel Reygondeau, Nicolas Maillet, Nicolas Henry, Gaëtan Benoit, Antonio Fernandez-Guerra, Samir Suweis, Romain Narci, Cédric Berney, Damien Eveillard, Frédérick Gavory, Lionel Guidi, Karine Labadie, Eric Mahieu, Julie Poulain, Sarah Romac, Simon Roux, Céline Dimier, Stefanie Kandels, Marc Picheral, Sarah Searson, Stéphane Pesant, Jean-Marc Aury, Jennifer Brum, Claire Lemaitre, Eric Pelletier, Peer Bork, Shinichi Sunagawa, Lee Karp-Boss, Chris Bowler, Matthew Sullivan, Eric Karsenti, Mahendra Mariadassou, Ian Probert, Pierre Peterlongo, Patrick Wincker, Colomban de Vargas, Maurizio Ribera d'Alcalà, Daniele Iudicone, Olivier Jaillon, Tom O. Delmont
- article
- eLife, 2022, 11, pp.e78129. ⟨10.7554/eLife.78129⟩
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- titre
- Temporal trends of two iconic Mediterranean gorgonians (Paramuricea clavata and Eunicella cavolini) in the climate change context
- auteur
- L. Iborra, M. Leduc, L. Fullgrabe, P. Cuny, S. Gobert
- article
- Journal of Sea Research (JSR), 2022, 186, pp.102241. ⟨10.1016/j.seares.2022.102241⟩
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- titre
- Complete Genome Sequence of Tepidibacter sp. Strain 8C15b, Isolated from Bank Sediments of Haiphong Bay, Vietnam
- auteur
- Stéphanie Fouteau, Vuong Bui Van, Zoé Rouy, Mélanie Beraud, Corinne Cruaud, Jean-Luc Cayol, Sandrine Chifflet, Thuoc Chu Van, Thu Pham The, David Vallenet, Pedro Oliveira, Xavier Mari, Nathalie Pradel
- article
- Microbiology Resource Announcements, 2022, 11 (7), ⟨10.1128/mra.00132-22⟩
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- titre
- Integrated viral elements suggest the dual lifestyle of Tetraselmis spp. Polinton-like viruses
- auteur
- Emily Chase, Christelle Desnues, Guillaume Blanc
- article
- Virus Evolution, 2022, 8 (2), ⟨10.1093/ve/veac068⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
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- titre
- Cd transfers during marine sediment resuspension over short and long-term period: Associated risk for coastal water quality
- auteur
- Nicolas Layglon, Véronique Lenoble, Longo Louis, Sébastien d'Onofrio, Stéphane Mounier, Jean-Ulrich Mullot, Davide Sartori, Dario Omanović, Cédric Garnier, Benjamin Misson
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2022, 180, pp.113771. ⟨10.1016/j.marpolbul.2022.113771⟩
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- titre
- The Ocean Gene Atlas v2.0: online exploration of the biogeography and phylogeny of plankton genes
- auteur
- Caroline Vernette, Julien Lecubin, Pablo Sánchez, (team) Tara Oceans Coordinators, Shinichi Sunagawa, Tom O. Delmont, Silvia G Acinas, Eric Pelletier, Pascal Hingamp, Magali Lescot
- article
- Nucleic Acids Research, 2022, 11, ⟨10.1093/nar/gkac420⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
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- titre
- Seasonal composition and activity of the intertidal macrobenthic community of Caleta Valdés (Patagonia, Argentina) applying in situ and ex situ experimental protocols
- auteur
- Agustina Ferrando, Julieta Sturla Lompré, Emilia Gonzalez, Marcos Franco, Marta Commendatore, Marina Nievas, Cécile Militon, Georges Stora, José Luis Esteves, Philippe Cuny, Franck Gilbert
- article
- Regional Studies in Marine Science, 2022, 53, pp.102444. ⟨10.1016/j.rsma.2022.102444⟩
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- titre
- Living on an ever-changing coast: French Guiana populations facing coastal mobility
- auteur
- Marianne Palisse, Gérard Collomb, Dennis Lamaison, Valérie Morel, Philippe Cuny, Morgane Jolivet, Jean-Jacques Marquisar, Bettie Laplanche, Antoine Gardel
- article
- GeoJournal, 2022, ⟨10.1007/s10708-022-10694-5⟩
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- titre
- Dry-Wet Cycles Affect Nitrous Oxide Emissions Across Aquatic-Terrestrial Interfaces: A Mesocosms Study
- auteur
- Renata Pinto, Gabriele Weigelhofer, Matthias Pucher, Rebecca Clare Hood-Nowotny, Patricia Bonin, António Guerreiro Brito, Thomas Hein
- article
- Frontiers in Soil Science, 2022, 2, ⟨10.3389/fsoil.2022.849210⟩
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- titre
- Genome sequence and Carbohydrate Active Enzymes (CAZymes) repertoire of the thermophilic Caldicoprobacter algeriensis TH7C1T
- auteur
- Rihab Ameri, José Luis García, Amel Bouanane Derenfed, Nathalie Pradel, Sawssan Neifar, Sonia Mhiri, Monia Mezghanni, Nadia Zaraî Jaouadi, Jorge Barriuso, Samir Bejar
- article
- Microbial Cell Factories, 2022, 21 (1), pp.91. ⟨10.1186/s12934-022-01818-0⟩
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- titre
- Diversity of Giant Viruses Infecting Vermamoeba vermiformis
- auteur
- Khalil Geballa-Koukoulas, Bernard La Scola, Guillaume Blanc, Julien Andreani
- article
- Frontiers in Microbiology, 2022, 13, ⟨10.3389/fmicb.2022.808499⟩
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- titre
- Mangrove microbiota along the urban-to-rural gradient of the Cayenne estuary (French Guiana, South America): Drivers and potential bioindicators
- auteur
- Maud Fiard, Philippe Cuny, Léa Sylvi, Cédric Hubas, Ronan Jézéquel, Dominique Lamy, Romain Walcker, Amonda El Houssainy, Lars-Eric Heimbürger-Boavida, Tony Robinet, Isabelle Bihannic, Franck Gilbert, Emma Michaud, Guillaume Dirberg, Cécile Militon
- article
- Science of the Total Environment, 2022, 807, pp.150667. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.150667⟩
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- titre
- Surface Characteristics Together With Environmental Conditions Shape Marine Biofilm Dynamics in Coastal NW Mediterranean Locations
- auteur
- Jean-François Briand, Thomas Pollet, Benjamin Misson, Cédric Garnier, Marlene Lejars, Marine Maintenay, Raphaëlle Barry-Martinet, Aurélie Portas, Jean-François Ghiglione, Christine Bressy
- article
- Frontiers in Marine Science, 2022, 8, ⟨10.3389/fmars.2021.746383⟩
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- titre
- The role of coupled DNRA-Anammox during nitrate removal in a highly saline lake
- auteur
- N. Valiente, F. Jirsa, T. Hein, W. Wanek, J. Prommer, P. Bonin, J.J. Gómez-Alday
- article
- Science of the Total Environment, 2022, 806, pp.150726. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.150726⟩
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- titre
- Biodiversity, climate change, and adaptation in the Mediterranean
- auteur
- D. Aurelle, Séverine Thomas, Cécile H. Albert, Marc Bally, Alberte Bondeau, Charles-François Boudouresque, Abigail E. Cahill, François Carlotti, Anne Chenuil, Wolfgang Cramer, Hendrik Davi, Aurélien De Jode, Alexander Ereskovsky, Anne Marie Farnet da Silva, Catherine Fernandez, Thierry Gauquelin, Pascal Mirleau, Anne-Christine Monnet, Bernard Prévosto, Vincent Rossi, Stéphane Sartoretto, France van Wambeke, Bruno Fady
- article
- Ecosphere, 2022, 13 (4), pp.2-23. ⟨10.1002/ecs2.3915⟩
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-
-
- titre
- Summer dynamics drive the microbial response to carbon and nutrient additions in a high‐altitude lake
- auteur
- Flavia Dory, Laurent Cavalli, Evelyne Franquet, Magalie Claeys-Bruno, Benjamin Misson, Thierry Tatoni, Céline Bertrand
- article
- Limnology and Oceanography, 2022, 67 (5), pp.1142-1156. ⟨10.1002/lno.12062⟩
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-
Conference papers
- titre
- Holobiont diversity in heterogeneous and anthropized marine environments
- auteur
- D. Aurelle, Christelle Desnues, Stephane Sartoretto, Emma Rozis, Sonia Bouchard, Dorian Guillemain, Laurine Moirand, Sandrine Chenesseau, Pierre Pontarotti, Alessandra Accornero, Jean-Christophe Poggiale, Lamya Chaoui, M. Hichem Kara, Nur Eda Topçu, Sarah Samadi, Marc Bally
- article
- Ecology and Evolution: New perspectives and societal challenges, SFE² GfÖ EEF Joint meeting, International Conference on Ecological Sciences, Nov 2022, Metz, France
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2021
Journal articles
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- titre
- Use of Stress Signals of Their Attached Bacteria to Monitor Sympagic Algae Preservation in Canadian Arctic Sediments
- auteur
- Rémi Amiraux, Patricia Bonin, Burot Christopher, Jean-Francois Rontani
- article
- Microorganisms, 2021, 9 (12), pp.2626. ⟨10.3390/microorganisms9122626⟩
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- titre
- Macroscale patterns of oceanic zooplankton composition and size structure
- auteur
- Manoela Brandão, Fabio Benedetti, Séverine Martini, Yawouvi Dodji Soviadan, Jean-Olivier Irisson, Jean-Baptiste Romagnan, Amanda Elineau, Corinne Desnos, Laëtitia Jalabert, Andrea Freire, Marc Picheral, Nicolas Henry, Silvia Acinas, Marcel Babin, Peer Bork, Emmanuel Boss, Chris Bowler, Guy Cochrane, Colomban de Vargas, Gabriel Gorsky, Lionel Guidi, Nigel Grimsley, Pascal Hingamp, Daniele Iudicone, Olivier Jaillon, Stefanie Kandels, Lee Karp-Boss, Eric Karsenti, Fabrice Not, Hiroyuki Ogata, Nicole Poulton, Stephane Pesant, Jeroen Raes, Christian Sardet, Sabrina Speich, Matthew Sullivan, Shinichi Sunagawa, Patrick Wincker, Lars Stemmann, Fabien Lombard
- article
- Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-94615-5⟩
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- titre
- Hydrothermal plumes as hotspots for deep-ocean heterotrophic microbial biomass production
- auteur
- Cécile Cathalot, Erwan Roussel, Antoine Perhirin, Vanessa Creff, Jean-Pierre Donval, Vivien Guyader, Guillaume Roullet, Jonathan Gula, Christian Tamburini, Marc Garel, Anne Godfroy, Pierre-Marie Sarradin
- article
- Nature Communications, 2021, 12 (1), ⟨10.1038/s41467-021-26877-6⟩
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- titre
- Evolution of Thermophilic Microbial Communities from a Deep-Sea Hydrothermal Chimney under Electrolithoautotrophic Conditions with Nitrate
- auteur
- Guillaume Pillot, Oulfat Amin Ali, Sylvain Davidson, Laetitia Shintu, Yannick Combet-Blanc, Anne Godfroy, Patricia Bonin, Pierre-Pol Liebgott
- article
- Microorganisms, 2021, 9 (12), pp.2475. ⟨10.3390/microorganisms9122475⟩
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- titre
- Integration of spatio-temporal variations of surface metabolomes and epibacterial communities highlights the importance of copper stress as a major factor shaping host-microbiota interactions within a Mediterranean seaweed holobiont
- auteur
- Benoît Paix, Nicolas Layglon, Christophe Le Poupon, Sébastien D’onofrio, Benjamin Misson, Cédric Garnier, Gérald Culioli, Jean-François Briand
- article
- Microbiome, 2021, 9 (1), ⟨10.1186/s40168-021-01124-8⟩
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- titre
- Identification of enriched hyperthermophilic microbial communities from a deep-sea hydrothermal vent chimney under electrolithoautotrophic culture conditions
- auteur
- Guillaume Pillot, Oulfat Amin Ali, Sylvain Davidson, Laetitia Shintu, Anne Godfroy, Yannick Combet-Blanc, Patricia Bonin, Pierre-Pol Liebgott
- article
- Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-94135-2⟩
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- titre
- Deep ocean metagenomes provide insight into the metabolic architecture of bathypelagic microbial communities
- auteur
- Silvia Acinas, Pablo Sánchez, Guillem Salazar, Francisco Cornejo-Castillo, Marta Sebastián, Ramiro Logares, Marta Royo-Llonch, Lucas Paoli, Shinichi Sunagawa, Pascal Hingamp, Hiroyuki Ogata, Gipsi Lima-Mendez, Simon Roux, José González, Jesús Arrieta, Intikhab Alam, Allan Kamau, Chris Bowler, Jeroen Raes, Stéphane Pesant, Peer Bork, Susana Agustí, Takashi Gojobori, Dolors Vaqué, Matthew Sullivan, Carlos Pedrós-Alió, Ramon Massana, Carlos Duarte, Josep Gasol
- article
- Communications Biology, 2021, 4 (1), ⟨10.1038/s42003-021-02112-2⟩
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- titre
- Towards the Idea of Molecular Brains
- auteur
- Y. Timsit, Grégoire Sergeant-Perthuis
- article
- International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (21), pp.11868. ⟨10.3390/ijms222111868⟩
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- titre
- Bioluminescence and Photoreception in Unicellular Organisms: Light-Signalling in a Bio-Communication Perspective
- auteur
- Youri Timsit, Magali Lescot, Martha Valiadi, Fabrice Not
- article
- International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (21), pp.11311. ⟨10.3390/ijms222111311⟩
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- titre
- Similar Methanogenic Shift but Divergent Syntrophic Partners in Anaerobic Digesters Exposed to Direct versus Successive Ammonium Additions
- auteur
- Julie Hardy, Patricia Bonin, Adele Lazuka, Estelle Gonidec, Sophie Guasco, Corinne Valette, Sébastien Lacroix, Léa Cabrol
- article
- Microbiology Spectrum, 2021, 9 (2), ⟨10.1128/Spectrum.00805-21⟩
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- titre
- Pacmanvirus S19, the Second Pacmanvirus Isolated from Sewage Waters in Oran, Algeria
- auteur
- Guillaume Blanc, Khalil Geballa-Koukoulas, Souhila Abdi, Bernard La Scola, Julien Andreani
- article
- Microbiology Resource Announcements, 2021, 10 (42), ⟨10.1128/MRA.00693-21⟩
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- titre
- Increasing Hydrostatic Pressure Impacts the Prokaryotic Diversity during Emiliania huxleyi Aggregates Degradation
- auteur
- Christian Tamburini, Marc Garel, Aude Barani, Dominique Boeuf, Patricia Bonin, Nagib Bhairy, Sophie Guasco, Stéphanie Jacquet, Frédéric A.C. Le Moigne, Christos Panagiotopoulos, Virginie Riou, Sandrine Veloso, Chiara Santinelli, Fabrice Armougom
- article
- Water, 2021, 13 (19), pp.2616. ⟨10.3390/w13192616⟩
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- titre
- Synergistic effects of temperature and light affect the relationship between Taonia atomaria and its epibacterial community: a controlled conditions study
- auteur
- Benoit Paix, Philippe Potin, Gaëtan Schires, Christophe Le Poupon, B. Misson, Catherine Leblanc, Gérald Culioli, Jean‐françois Briand
- article
- Environmental Microbiology, 2021, 23 (11), pp.6777-6797. ⟨10.1111/1462-2920.15758⟩
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- titre
- Benthic oxygen dynamics and implication for the maintenance of chronic hypoxia and ecosystem degradation in the Berre lagoon (France)
- auteur
- Sylvain Rigaud, Bruno Deflandre, Christian Grenz, Florian Cesbron, Lara Pozzato, Baptiste Voltz, Antoine Grémare, Alicia Romero-Ramirez, Pascal Mirleau, Samuel Meulé, Vincent Faure, Nicolas Mayot, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Ludovic Pascal, Marie-Ange Cordier, Bastien Lamarque, Márcio Tenório, Olivier Radakovitch
- article
- Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2021, 258, pp.107437. ⟨10.1016/j.ecss.2021.107437⟩
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- titre
- Sediment reworking by the burrowing polychaete Hediste diversicolor modulated by environmental and biological factors across the temperate North Atlantic. A tribute to Gaston Desrosiers
- auteur
- Franck Gilbert, Erik Kristensen, Robert Aller, Gary Banta, Philippe Archambault, Rénald Belley, Luca Bellucci, Lois Calder, Philippe Cuny, Xavier de Montaudouin, Susanne Eriksson, Stefan Forster, Patrick Gillet, Jasmin Godbold, Ronnie Glud, Jonas Gunnarsson, Stefan Hulth, Stina Lindqvist, Anthony Maire, Emma Michaud, Karl Norling, Judith Renz, Martin Solan, Michael Townsend, Nils Volkenborn, Stephen Widdicombe, Georges Stora
- article
- Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 2021, 541, pp.151588. ⟨10.1016/j.jembe.2021.151588⟩
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- titre
- Rapid Spread of the Invasive Brown Alga Rugulopteryx okamurae in a National Park in Provence (France, Mediterranean Sea)
- auteur
- Sandrine Ruitton, Aurelie Blanfuné, Charles F. Boudouresque, Dorian Guillemain, Valerie Michotey, Sylvain Roblet, Delphine Thibault, Thierry Thibaut, Marc Verlaque
- article
- Water, 2021, 13 (16), pp.2306. ⟨10.3390/w13162306⟩
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- titre
- Organic additive release from plastic to seawater is lower under deep-sea conditions
- auteur
- Vincent Fauvelle, Marc Garel, Christian Tamburini, D. Nerini, Javier Castro-Jiménez, Natascha Schmidt, Andrea Paluselli, Armand Fahs, Laure Papillon, Andy M Booth, Richard Sempere
- article
- Nature Communications, 2021, 12 (1), ⟨10.1038/s41467-021-24738-w⟩
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- titre
- Procaryotic Diversity and Hydrogenotrophic Methanogenesis in an Alkaline Spring (La Crouen, New Caledonia)
- auteur
- Marianne Quéméneur, Nan Mei, Christophe Monnin, Anne Postec, Laura Wils, Manon Bartoli, Sophie Guasco, Bernard Pelletier, Gael Erauso
- article
- Microorganisms, 2021, 9 (7), pp.1360. ⟨10.3390/microorganisms9071360⟩
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- titre
- Forensic genetic identification of sharks involved in human attacks
- auteur
- Nicolas Oury, Sébastien Jaquemet, Gwenola Simon, Laurie Casalot, Géry Vangrevelynghe, Fanch Landron, Hélène Magalon
- article
- Forensic Science International: Genetics , 2021, pp.102558. ⟨10.1016/j.fsigen.2021.102558⟩
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- titre
- Microbial consortia in an ice‐covered high‐altitude lake impacted by additions of dissolved organic carbon and nutrients
- auteur
- Flavia Dory, Laurent Cavalli, Evelyne Franquet, B. Misson, Thierry Tatoni, Céline Bertrand, Magalie Claeys-Bruno
- article
- Freshwater Biology, 2021, 66 (8), pp.1648-1662. ⟨10.1111/fwb.13781⟩
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- titre
- A global metagenomic map of urban microbiomes and antimicrobial resistance
- auteur
- David Danko, Daniela Bezdan, Evan Afshin, Sofia Ahsanuddin, Chandrima Bhattacharya, Daniel Butler, Kern Rei Chng, Daisy Donnellan, Jochen Hecht, Katelyn Jackson, Katerina Kuchin, Mikhail Karasikov, Abigail Lyons, Lauren Mak, Dmitry Meleshko, Harun Mustafa, Beth Mutai, Russell Neches, Amanda Ng, Olga Nikolayeva, Tatyana Nikolayeva, Eileen Png, Krista Ryon, Jorge Sanchez, Heba Shaaban, Maria Sierra, Dominique Thomas, Ben Young, Omar Abudayyeh, Josue Alicea, Malay Bhattacharyya, Ran Blekhman, Eduardo Castro-Nallar, Ana Cañas, Aspassia Chatziefthimiou, Robert Crawford, Francesca de Filippis, Youping Deng, Christelle Desnues, Emmanuel Dias-Neto, Marius Dybwad, Eran Elhaik, Danilo Ercolini, Alina Frolova, Dennis Gankin, Jonathan Gootenberg, Alexandra Graf, David Green, Iman Hajirasouliha, Jaden J.A. Hastings, Mark Hernandez, Gregorio Iraola, Soojin Jang, Andre Kahles, Frank Kelly, Kaymisha Knights, Nikos Kyrpides, Paweł Łabaj, Patrick K.H. Lee, Marcus H.Y. Leung, Per Ljungdahl, Gabriella Mason-Buck, Ken Mcgrath, Cem Meydan, Emmanuel Mongodin, Milton Ozorio Moraes, Niranjan Nagarajan, Marina Nieto-Caballero, Houtan Noushmehr, Manuela Oliveira, Stephan Ossowski, Olayinka Osuolale, Orhan Özcan, David Paez-Espino, Nicolás Rascovan, Hugues Richard, Gunnar Rätsch, Lynn Schriml, Torsten Semmler, Osman Sezerman, Leming Shi, Tieliu Shi, Rania Siam, Le Huu Song, Haruo Suzuki, Denise Syndercombe Court, Scott Tighe, Xinzhao Tong, Klas Udekwu, Juan Ugalde, Brandon Valentine, Dimitar Vassilev, Elena Vayndorf, Thirumalaisamy Velavan, Jun Wu, María Zambrano, Jifeng Zhu, Sibo Zhu, Christopher Mason, Gabriela Albuquerque, Alex Alexiev, Kalyn Ali, Lucia Alvarado-Arnez, Sarh Aly, Jennifer Amachee, Maria Amorim, Majelia Ampadu, Muhammad Al-Fath Amran, Nala An, Watson Andrew, Harilanto Andrianjakarivony, Michael Angelov, Verónica Antelo, Catharine Aquino, Álvaro Aranguren, Luiza Araujo, Hitler Francois Vasquez Arevalo, Jenny Arevalo, Carme Arnan, Lucia Elena Alvarado Arnez, Fernanda Arredondo, Matthew Arthur, Freddy Asenjo, Thomas Saw Aung, Juliette Auvinet, Nuria Aventin, Sadaf Ayaz, Silva Baburyan, Abd-Manaaf Bakere, Katrin Bakhl, Thais Bartelli, Erdenetsetseg Batdelger, François Baudon, Kevin Becher, Carla Bello, Médine Benchouaia, Hannah Benisty, Anne-Sophie Benoiston, Joseph Benson, Diego Benítez, Juliana Bernardes, Denis Bertrand, Silvia Beurmann, Tristan Bitard-Feildel, Lucie Bittner, Christina Black, Guillaume Blanc, Brittany Blyther, Toni Bode, Julia Boeri, Bazartseren Boldgiv, Kevin Bolzli, Alexia Bordigoni, Ciro Borrelli, Sonia Bouchard, Jean-Pierre Bouly, Alicia Boyd, Gabriela Branco, Alessandra Breschi, Björn Brindefalk, Christian Brion, Alan Briones, Paulina Buczansla, Catherine Burke, Aszia Burrell, Alina Butova, Irvind Buttar, Jalia Bynoe, Sven Bönigk, Kari Bøifot, Hiram Caballero, Xiao Wen Cai, Dayana Calderon, Angela Cantillo, Miguel Carbajo, Alessandra Carbone, Anais Cardenas, Katerine Carrillo, Laurie Casalot, Sofia Castro, Ana Castro, Astred Castro, Ana Valeria B. Castro, Simone Cawthorne, Jonathan Cedillo, Salama Chaker, Jasna Chalangal, Allison Chan, Anastasia Chasapi, Starr Chatziefthimiou, Sreya Ray Chaudhuri, Akash Keluth Chavan, Francisco Chavez, Gregory Chem, Xiaoqing Chen, Michelle Chen, Jenn-Wei Chen, Ariel Chernomoretz, Allaeddine Chettouh, Daisy Cheung, Diana Chicas, Shirley Chiu, Hira Choudhry, Carl Chrispin, Kianna Ciaramella, Erika Cifuentes, Jake Cohen, David Coil, Sylvie Collin, Colleen Conger, Romain Conte, Flavia Corsi, Cecilia Cossio, Ana Costa, Delisia Cuebas, Bruno D’alessandro, Katherine Dahlhausen, Aaron Darling, Pujita Das, Lucinda Davenport, Laurent David, Natalie Davidson, Gargi Dayama, Stéphane Delmas, Chris Deng, Chloé Dequeker, Alexandre Desert, Monika Devi, Felipe Dezem, Clara Dias, Timothy Ryan Donahoe, Sonia Dorado, Lashonda Dorsey, Valeriia Dotsenko, Steven Du, Alexandra Dutan, Naya Eady, Jonathan Eisen, Miar Elaskandrany, Lennard Epping, Juan Escalera-Antezana, Cassie Ettinger, Iqra Faiz, Luice Fan, Nadine Farhat, Emile Faure, Fazlina Fauzi, Charlie Feigin, Skye Felice, Laís Pereira Ferreira, Gabriel Figueroa, Aubin Fleiss, Denisse Flores, Jhovana Velasco Flores, Marcos A.S. Fonseca, Jonathan Foox, Juan Carlos Forero, Aaishah Francis, Kelly French, Pablo Fresia, Jacob Friedman, Jaime Fuentes, Josephine Galipon, Mathilde Garcia, Laura Garcia, Catalina García, Annie Geiger, Samuel Gerner, Sonia Ghose, Dao Phuong Giang, Matías Giménez, Donato Giovannelli, Dedan Githae, Spyridon Gkotzis, Liliana Godoy, Samantha Goldman, Gaston Gonnet, Juana Gonzalez, Andrea Gonzalez, Camila Gonzalez-Poblete, Andrew Gray, Tranette Gregory, Charlotte Greselle, Sophie Guasco, Juan Guerra, Nika Gurianova, Wolfgang Haehr, Sebastien Halary, Felix Hartkopf, Arya Hawkins-Zafarnia, Nur Hazlin Hazrin-Chong, Eric Helfrich, Eva Hell, Tamera Henry, Samuel Hernandez, Pilar Lopez Hernandez, David Hess-Homeier, Lauren Hittle, Nghiem Xuan Hoan, Aliaksei Holik, Chiaki Homma, Irene Hoxie, Michael Huber, Elizabeth Humphries, Stephanie Hyland, Andrea Hässig, Roland Häusler, Nathalie Hüsser, Robert Petit, Badamnyambuu Iderzorig, Mizuki Igarashi, Shaikh Iqbal, Shino Ishikawa, Sakura Ishizuka, Sharah Islam, Riham Islam, Kohei Ito, Sota Ito, Takayuki Ito, Tomislav Ivankovic, Tomoki Iwashiro, Sarah Jackson, Joann Jacobs, Marisano James, Marianne Jaubert, Marie-Laure Jerier, Esmeralda Jiminez, Ayantu Jinfessa, Ymke de Jong, Hyun Woo Joo, Guilllaume Jospin, Takema Kajita, Affifah Saadah Ahmad Kassim, Nao Kato, Amrit Kaur, Inderjit Kaur, Fernanda de Souza Gomes Kehdy, Vedbar Khadka, Shaira Khan, Mahshid Khavari, Michelle Ki, Gina Kim, Hyung Jun Kim, Sangwan Kim, Ryan King, Giuseppe Kolomonaco, Ellen Koag, Nadezhda Kobko-Litskevitch, Maryna Korshevniuk, Michael Kozhar, Jonas Krebs, Nanami Kubota, Andrii Kuklin, Sheelta Kumar, Rachel Kwong, Lawrence Kwong, Ingrid Lafontaine, Juliana Lago, Tsoi Ying Lai, Elodie Laine, Manolo Laiola, Olha Lakhneko, Isha Lamba, Gerardo de Lamotte, Romain Lannes, Eleonora de Lazzari, Madeline Leahy, Hyunjung Lee, Yunmi Lee, Lucy Lee, Vincent Lemaire, Emily Leong, Dagmara Lewandowska, Chenhao Li, Weijun Liang, Moses Lin, Priscilla Lisboa, Anna Litskevitch, Eric Minwei Liu, Tracy Liu, Mayra Arauco Livia, Yui Him Lo, Sonia Losim, Manon Loubens, Jennifer Lu, Olexandr Lykhenko, Simona Lysakova, Salah Mahmoud, Sara Abdul Majid, Natalka Makogon, Denisse Maldonado, Krizzy Mallari, Tathiane Malta, Maliha Mamun, Dimitri Manoir, German Marchandon, Natalia Marciniak, Sonia Marinovic, Brunna Marques, Nicole Mathews, Yuri Matsuzaki, Vincent Matthys, Madelyn May, Elias Mccomb, Annabelle Meagher, Adiell Melamed, Wayne Menary, Katterinne Mendez, Ambar Mendez, Irène Mauricette Mendy, Irene Meng, Ajay Menon, Mark Menor, Roy Meoded, Nancy Merino, Karishma Miah, Mathilde Mignotte, Tanja Miketic, Wilson Miranda, Athena Mitsios, Ryusei Miura, Kunihiko Miyake, Maria Moccia, Natasha Mohan, Mohammed Mohsin, Karobi Moitra, Mauricio Moldes, Laura Molina, Jennifer Molinet, Orgil-Erdene Molomjamts, Eftar Moniruzzaman, Sookwon Moon, Isabelle de Oliveira Moraes, Mario Moreno, Maritza Mosella, Josef Moser, Christopher Mozsary, Amanda Muehlbauer, Oasima Muner, Muntaha Munia, Naimah Munim, Maureen Muscat, Tatjana Mustac, Cristina Muñoz, Francesca Nadalin, Areeg Naeem, Dorottya Nagy-Szakal, Mayuko Nakagawa, Ashanti Narce, Masaki Nasu, Irene González Navarrete, Hiba Naveed, Bryan Nazario, Narasimha Rao Nedunuri, Thomas Neff, Aida Nesimi, Wan Chiew Ng, Synti Ng, Gloria Nguyen, Elsy Ngwa, Agier Nicolas, Pierre Nicolas, Abdollahi Nika, Hosna Noorzi, Avigdor Nosrati, Diana Nunes, Kathryn O’brien, Niamh O’hara, Gabriella Oken, Rantimi Olawoyin, Javier Quilez Oliete, Kiara Olmeda, Tolulope Oluwadare, Itunu Oluwadare, Nils Ordioni, Jenessa Orpilla, Jacqueline Orrego, Melissa Ortega, Princess Osma, Israel Osuolale, Oluwatosin Osuolale, Mitsuki Ota, Francesco Oteri, Yuya Oto, Rachid Ounit, Christos Ouzounis, Subhamitra Pakrashi, Rachel Paras, Coral Pardo-Este, Young-Ja Park, Paulina Pastuszek, Suraj Patel, Jananan Pathmanathan, Andrea Patrignani, Manuel Perez, Ante Peros, Sabrina Persaud, Anisia Peters, Adam Phillips, Lisbeth Pineda, Melissa Pizzi, Alma Plaku, Alketa Plaku, Brianna Pompa-Hogan, María Gabriela Portilla, Leonardo Posada, Max Priestman, Bharath Prithiviraj, Sambhawa Priya, Phanthira Pugdeethosal, Catherine Pugh, Benjamin Pulatov, Angelika Pupiec, Kyrylo Pyrshev, Tao Qing, Saher Rahiel, Savlatjon Rahmatulloev, Kannan Rajendran, Aneisa Ramcharan, Adan Ramirez-Rojas, Shahryar Rana, Prashanthi Ratnanandan, Timothy Read, Hubert Rehrauer, Renee Richer, Alexis Rivera, Michelle Rivera, Alessandro Robertiello, Courtney Robinson, Paula Rodríguez, Nayra Aguilar Rojas, Paul Roldán, Anyelic Rosario, Sandra Roth, Maria Ruiz, Stephen Eduard Boja Ruiz, Kaitlan Russell, Mariia Rybak, Thais Sabedot, Mahfuza Sabina, Ikuto Saito, Yoshitaka Saito, Gustavo Adolfo Malca Salas, Cecilia Salazar, Kaung Myat San, Khaliun Sanchir, Ryan Sankar, Paulo Thiago de Souza Santos, Zulena Saravi, Kai Sasaki, Yuma Sato, Masaki Sato, Seisuke Sato, Ryo Sato, Kaisei Sato, Nowshin Sayara, Steffen Schaaf, Oli Schacher, Anna-Lena Schinke, Ralph Schlapbach, Christian Schori, Jason Schriml, Felipe Segato, Felipe Sepulveda, Marianna Serpa, Paola de Sessions, Juan Severyn, Maheen Shakil, Sarah Shalaby, Aliyah Shari, Hyenah Shim, Hikaru Shirahata, Yuh Shiwa, Ophélie da Silva, Jordana Silva, Gwenola Simon, Shaleni Singh, Kasia Sluzek, Rebecca Smith, Eunice So, Núria Andreu Somavilla, Yuya Sonohara, Nuno Rufino de Sousa, Camila Souza, Jason Sperry, Nicolas Sprinsky, Stefan Stark, Antonietta La Storia, Kiyoshi Suganuma, Hamood Suliman, Jill Sullivan, Arif Asyraf Md Supie, Chisato Suzuki, Sora Takagi, Fumie Takahara, Naoya Takahashi, Kou Takahashi, Tomoki Takeda, Isabella Takenaka, Soma Tanaka, Anyi Tang, Yuk Man Tang, Emilio Tarcitano, Andrea Tassinari, Mahdi Taye, Alexis Terrero, Eunice Thambiraja, Antonin Thiébaut, Sade Thomas, Andrew Thomas, Yuto Togashi, Takumi Togashi, Anna Tomaselli, Masaru Tomita, Itsuki Tomita, Oliver Toth, Nora Toussaint, Jennifer Tran, Catalina Truong, Stefan Tsonev, Kazutoshi Tsuda, Takafumi Tsurumaki, Michelle Tuz, Yelyzaveta Tymoshenko, Carmen Urgiles, Mariko Usui, Sophie Vacant, Laura Vann, Fabienne Velter, Valeria Ventorino, Patricia Vera-Wolf, Riccardo Vicedomini, Michael Suarez-Villamil, Sierra Vincent, Renee Vivancos-Koopman, Andrew Wan, Cindy Wang, Tomoro Warashina, Ayuki Watanabe, Samuel Weekes, Johannes Werner, David Westfall, Lothar Wieler, Michelle Williams, Silver Wolf, Brian Wong, Yan Ling Wong, Tyler Wong, Rasheena Wright, Tina Wunderlin, Ryota Yamanaka, Jingcheng Yang, Hirokazu Yano, George Yeh, Olena Yemets, Tetiana Yeskova, Shusei Yoshikawa, Laraib Zafar, Yang Zhang, Shu Zhang, Amy Zhang, Yuanting Zheng, Stas Zubenko, Natasha Abdullah, Marcos Abraao, Adel Ait-Hamlat, Muhammad Afaq, Faisal Al-Quaddoomi, Ireen Alam
- article
- Cell, 2021, 184 (13), pp.3376-3393.e17. ⟨10.1016/j.cell.2021.05.002⟩
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- titre
- The chemistry of hyperalkaline springs in serpentinizing environments: 1. the composition of free gases in New Caledonia compared to other springs worldwide
- auteur
- Christophe Monnin, Marianne Quemeneur, Roy Price, Julie Jeanpert, Pierre Maurizot, Cédric Boulart, Jean-Pierre Donval, Bernard Pelletier
- article
- Journal of Geophysical Research: Biogeosciences, In press, 9 (126), pp.e2021JG006243. ⟨10.1029/2021JG006243⟩
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- titre
- Alkalicella caledoniensis gen. nov., sp. nov., a novel alkaliphilic anaerobic bacterium isolated from ‘La Crouen’ alkaline thermal spring, New Caledonia
- auteur
- Marianne Quéméneur, Gaël Erauso, Manon Bartoli, Céline Vandecasteele, Laura Wils, Lisa Gil, Christophe Monnin, Bernard Pelletier, Anne Postec
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2021, 71 (5), pp.004810. ⟨10.1099/ijsem.0.004810⟩
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- titre
- Viability and stress state of bacteria associated with primary production or zooplankton-derived suspended particulate matter in summer along a transect in Baffin Bay (Arctic Ocean)
- auteur
- Christopher Burot, Rémi Amiraux, Patricia Bonin, Sophie Guasco, Marcel Babin, Fabien Joux, Dominique Marie, Laure Vilgrain, Hermann Heipieper, Jean-Francois Rontani
- article
- Science of the Total Environment, 2021, 770, pp.145252. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.145252⟩
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- titre
- Metal-containing PAS/GAF domains in bacterial sensors
- auteur
- Romain Pardoux, Alain Dolla, Corinne Aubert
- article
- Coordination Chemistry Reviews, 2021, 442, pp.214000. ⟨10.1016/j.ccr.2021.214000⟩
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- titre
- Contrasting degradation rates of natural dissolved organic carbon by deep-sea prokaryotes under stratified water masses and deep-water convection conditions in the NW Mediterranean Sea
- auteur
- Marc Garel, Christos Panagiotopoulos, Mehdi Boutrif, Daniel Repeta, Richard Sempere, Chiara Santinelli, Bruno Charrière, David Nerini, Jean-Christophe Poggiale, Christian Tamburini
- article
- Marine Chemistry, 2021, 231, pp.103932. ⟨10.1016/j.marchem.2021.103932⟩
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- titre
- Limited influence of marine sediment lyophilization on prokaryotic community structure assessed via amplicon sequencing: an example from environmentally contrasted sediment layers in Toulon harbor (France)
- auteur
- Benjamin Misson, Cédric Garnier, Alexandre J Poulain
- article
- PeerJ, 2021, 9, pp.e11075. ⟨10.7717/peerj.11075⟩
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- titre
- Elutriate preparation affects embryo development test with Paracentrotus lividus: An in-depth study on the differences between two protocols and three different sediment/water mixing times
- auteur
- Davide Sartori, Simona Macchia, Nicolas Layglon, Sébastien d'Onofrio, Benjamin Misson, Maria Elena Piccione, Rosa Maria Bertolotto, Alice Scuderi, Fabiano Pilato, Silvia Giuliani, David Pellegrini, Andrea Gaion
- article
- Ecotoxicology and Environmental Safety, 2021, ⟨10.1016/j.ecoenv.2021.112010⟩
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- titre
- First Assessment of the Benthic Meiofauna Sensitivity to Low Human-Impacted Mangroves in French Guiana
- auteur
- Claire Michelet, Daniela Zeppilli, Cédric Hubas, Elisa Baldrighi, Philippe Cuny, Guillaume Dirberg, Cécile Militon, Romain Walcker, Dominique Lamy, Ronan Jézéquel, Justine Receveur, Gilbert Franck, Amonda El Houssainy, Aurélie Dufour, Lars-Eric Heimbürger-Boavida, Isabelle Bihannic, Lea Sylvi, Baptiste Vivier, Emma Michaud
- article
- Forests, 2021, 12 (3), pp.338. ⟨10.3390/f12030338⟩
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- titre
- Ecosystem maturity modulates greenhouse gases fluxes from artificial lakes
- auteur
- Fanny Colas, Jean-Marc Baudoin, Patricia Bonin, Léa Cabrol, Martin Daufresne, Rémy Lassus, Julien Cucherousset
- article
- Science of the Total Environment, 2021, 760, pp.144046. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.144046⟩
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- titre
- OrpR is a σ 54 ‐dependent activator using an iron‐sulfur cluster for redox sensing in Desulfovibrio vulgaris Hildenborough
- auteur
- Anouchka Fiévet, Meriem Merrouch, Gaël Brasseur, Danaé Eve, Emanuele Biondi, Odile Valette, Sofia Pauleta, Alain Dolla, Zorah Dermoun, Bénédicte Burlat, Corinne Aubert
- article
- Molecular Microbiology, 2021, 116 (1), ⟨10.1111/mmi.14705⟩
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- titre
- DOM Biological Lability in an Estuarine System in Two Contrasting Periods
- auteur
- Simona Retelletti Brogi, Raffaella Casotti, Benjamin Misson, Cecilia Balestra, Margherita Gonnelli, Stefano Vestri, Chiara Santinelli
- article
- Journal of Marine Science and Engineering, 2021, ⟨10.3390/jmse9020172⟩
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- titre
- The Kaumoebavirus LCC10 Genome Reveals a Unique Gene Strand Bias among “Extended Asfarviridae”
- auteur
- Khalil Geballa-Koukoulas, Julien Andreani, Bernard La Scola, Guillaume Blanc
- article
- Viruses, 2021, 13 (2), pp.148. ⟨10.3390/v13020148⟩
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- titre
- Mesopelagic microbial carbon production correlates with diversity across different marine particle fractions
- auteur
- Chloé Baumas, Frédéric Le Moigne, Marc Garel, Nagib Bhairy, Sophie Guasco, Virginie Riou, Fabrice Armougom, Hans-Peter Grossart, Christian Tamburini
- article
- The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2021, ⟨10.1038/s41396-020-00880-z⟩
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- titre
- The Ocean Barcode Atlas: a web service to explore the biodiversity and biogeography of marine organisms.
- auteur
- Caroline Vernette, Nicolas Henry, Julien Lecubin, Colomban de Vargas, Pascal Hingamp, Magali Lescot
- article
- Molecular Ecology Resources, 2021, ⟨10.1111/1755-0998.13322⟩
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- titre
- Phylogenomic fingerprinting of tempo and functions of horizontal gene transfer within ochrophytes
- auteur
- Richard G Dorrell, Adrien Villain, Benoît Perez-Lamarque, Guillemette Audren de Kerdrel, Giselle Mccallum, Andrew K Watson, Ouardia Ait-Mohamed, Adriana Alberti, Erwann Corre, Kyle R Frischkorn, Juan J Pierella Karlusich, Eric Pelletier, Hélène Morlon, Chris Bowler, Guillaume Blanc
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2021, 118 (4), ⟨10.1073/pnas.2009974118/-/DCSupplemental⟩
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-
- titre
- Phylogenomic fingerprinting of tempo and functions of horizontal gene transfer within ochrophytes
- auteur
- Richard Dorrell, Adrien Villain, Benoît Perez-Lamarque, Guillemette Audren de Kerdrel, Giselle Mccallum, Andrew Watson, Ouardia Ait-Mohamed, Adriana Alberti, Erwann Corre, Kyle Frischkorn, Juan Pierella Karlusich, Eric Pelletier, Hélène Morlon, Chris Bowler, Guillaume Blanc
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2021, 118 (4), ⟨10.1073/pnas.2009974118⟩
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- titre
- Efficiency of benthic diatom-associated bacteria in the removal of benzo(a)pyrene and fluoranthene
- auteur
- Oumayma Kahla, Sondes Melliti Ben Garali, Fatma Karray, Manel Ben Abdallah, Najwa Kallel, Najla Mhiri, Hatem Zaghden, Badreddine Barhoumi, Olivier Pringault, Marianne Quemeneur, Marc Tedetti, Sami Sayadi, Asma Sakka Hlaili
- article
- Science of the Total Environment, 2021, 751, pp.141399. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.141399⟩
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- titre
- Metal resistance genes enrichment in marine biofilm communities selected by biocide-containing surfaces in temperate and tropical coastal environments
- auteur
- Elisa C.P. Catao, Nicolas Gallois, Fabienne Fay, Benjamin Misson, Jean-François Briand
- article
- Environmental Pollution, 2021, 268, pp.115835. ⟨10.1016/j.envpol.2020.115835⟩
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- titre
- Glutamate optimizes enzymatic activity under high hydrostatic pressure in Desulfovibrio species: effects on the ubiquitous thioredoxin system
- auteur
- Hélène Gaussier, M. Nouailler, Edouard Champaud, Edwige Garcin, Sebban -Kreuzer, Olivier Bornet, Marc Garel, Christian Tamburini, Laetitia Pieulle, Alain Dolla, Nathalie Pradel
- article
- Extremophiles, 2021, 25, pp.385-392. ⟨10.1007/s00792-021-01236-x⟩
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- titre
- RadA, a MSCRAMM Adhesin of the Dominant Symbiote Ruminococcus gnavus E1, Binds Human Immunoglobulins and Intestinal Mucins
- auteur
- Marc Maresca, Radia Alatou, Ange Pujol, Cendrine Nicoletti, Josette Perrier, Thierry Giardina, Gwenola Simon, Vincent Méjean, Michel Fons
- article
- Biomolecules, 2021, 11 (11), pp.1613. ⟨10.3390/biom11111613⟩
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- titre
- Trace Metal Contamination Impacts Predicted Functions More Than Structure of Marine Prokaryotic Biofilm Communities in an Anthropized Coastal Area
- auteur
- Clément Coclet, Cédric Garnier, Sébastien d'Onofrio, Gaël Durrieu, Emilie Pasero, Christophe Le Poupon, Dario Omanović, Jean-Ulrich Mullot, Benjamin Misson, Jean-François Briand
- article
- Frontiers in Microbiology, 2021, 12, pp.589948. ⟨10.3389/fmicb.2021.589948⟩
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- titre
- Rapid Spread of the Invasive Brown Alga Rugulopteryx okamurae in a National Park in Provence (France, Mediterranean Sea)
- auteur
- Sandrine Ruitton, A. Blanfuné, Charles F. Boudouresque, Dorian Guillemain, Valerie Michotey, Sylvain Roblet, Delphine Thibault, Thierry Thibaut, Marc Verlaque
- article
- Water, 2021, 13 (16), pp.2306. ⟨10.3390/w13162306⟩
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- titre
- Evolution of ribosomal protein network architectures
- auteur
- Y. Timsit, Grégoire Sergeant-Perthuis, Daniel Bennequin
- article
- Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-020-80194-4⟩
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- titre
- On the barium–oxygen consumption relationship in the Mediterranean Sea: implications for mesopelagic marine snow remineralization
- auteur
- Stéphanie Jacquet, Dominique Lefèvre, Christian Tamburini, Marc Garel, Frédéric A.C. Le Moigne, Nagib Bhairy, Sophie Guasco
- article
- Biogeosciences, 2021, 18 (6), pp.2205-2212. ⟨10.5194/bg-18-2205-2021⟩
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- titre
- A high rate algal pond hosting a dynamic community of RNA viruses
- auteur
- Emily E Chase, Sonia Monteil-Bouchard, Angélique Gobet, Felana H Andrianjakarivony, Christelle Desnues, Guillaume Blanc
- article
- Viruses, 2021, 13 (11), pp.2163. ⟨10.3390/v13112163⟩
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-
- titre
- Bacterial diversity and lipid biomarkers in sea ice and sinking particulate organic material during the melt season in the Canadian Arctic
- auteur
- Rémi Amiraux, Jean-Francois Rontani, Fabrice Armougom, Eléonore Frouin, Marcel Babin, Lise Artigue, Patricia Bonin
- article
- Elementa: Science of the Anthropocene, 2021, 9 (1), ⟨10.1525/elementa.2019.040⟩
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-
- titre
- Alkaliphilus serpentinus sp. nov. and Alkaliphilus pronyensis sp. nov., two novel anaerobic alkaliphilic species isolated from the serpentinite-hosted Prony Bay Hydrothermal Field (New Caledonia)
- auteur
- Anne Postec, Marianne Quemeneur, Aurélien Lecoeuvre, Nicolas Chabert, Manon Joseph, Gaël Erauso
- article
- Systematic and Applied Microbiology, 2021, 44 (2), pp.126175. ⟨10.1016/j.syapm.2020.126175⟩
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-
-
- titre
- Negligible microbial heterotrophic quantitative contribution onto trace metals remobilization during marine sediment resuspension - insights from a Mediterranean urbanized bay
- auteur
- Nicolas Layglon, B. Misson, Nicolas Gallois, Sébastien d'Onofrio, V Lenoble, Stéphane Mounier, Dario Omanović, Cédric Garnier
- article
- Marine Chemistry, In press, ⟨10.1016/j.marchem.2021.103981⟩
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-
- titre
- Spatial patterns of ectoenzymatic kinetics in relation to biogeochemical properties in the Mediterranean Sea and the concentration of the fluorogenic substrate used
- auteur
- France van Wambeke, Elvira Pulido-Villena, Philippe Catala, Julie Dinasquet, Kahina Djaoudi, Anja Engel, Marc Garel, Sophie Guasco, Barbara Marie, Sandra Nunige, Vincent Taillandier, Birthe Zäncker, Christian Tamburini
- article
- Biogeosciences, 2021, 18 (7), pp.2301-2323. ⟨10.5194/bg-18-2301-2021⟩
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-
Conference papers
-
- titre
- NEW INSIGHTS INTO MICROBIAL WAX ESTER BIOSYNTHESIS, NATURAL OCCURRENCE AND ADAPTIVE ROLE
- auteur
- Vincent Grossi, Ingrid Antheaume, Daniel Ariztegui, Guillaume Borrel, Cristiana Cravo-Laureau, Philippe Cuny, Mylène Hugoni, Cécile Militon, David Sala, Lea Sylvi, Camille Thomas
- article
- 30th International Meeting on Organic Geochemistry (IMOG), Sep 2021, Montpellier (on line due to pandemic situation), France
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-
- titre
- The REINFORCE Project: Inviting Citizen Scientists to analyse KM3NeT data
- auteur
- Rémy Le Breton, Vincent Bertin, Paschal Coyle, Gwenhaël de Wasseige, Hervé Glotin, Carlo Guidi, Feifei Huang, Séverine Martini, Antoine Kouchner, Christian Tamburini, Veronique van Elewyck
- article
- 37th International Cosmic Ray Conference, Jul 2021, Berlin, Germany. pp.1392, ⟨10.22323/1.395.1392⟩
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-
Book sections
- titre
- Serpentinicella
- auteur
- Marianne Quemeneur, Nan Mei, Anne Postec, Gaël Erauso
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, 1, Wiley, 2021, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01817⟩
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Thriving of hyperthermophilic microbial communities from a deep-sea sulfidic hydrothermal chimney under electrolithoautotrophic conditions with nitrate as electron acceptor
- auteur
- G. Pillot, S. Davidson, L. Shintu, L. Tanet, Y. Combet-Blanc, A. Godfroy, Patricia Bonin, Pierre-Pol Liebgott
- article
- 2021
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-
2020
Journal articles
-
- titre
- Responses to the Hydrostatic Pressure of Surface and Subsurface Strains of Pseudothermotoga elfii Revealing the Piezophilic Nature of the Strain Originating From an Oil-Producing Well
- auteur
- Marie Roumagnac, Nathalie Pradel, Manon Bartoli, Marc Garel, Aaron Jones, Fabrice Armougom, Romain Fenouil, Christian Tamburini, Bernard Ollivier, Zarath Summers, Alain Dolla
- article
- Frontiers in Microbiology, 2020, 11, ⟨10.3389/fmicb.2020.588771⟩
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-
-
- titre
- Prokaryotic Diversity and Distribution Along Physical and Nutrient Gradients in the Tunisian Coastal Waters (South Mediterranean Sea)
- auteur
- Marianne Quemeneur, Malika Bel Hassen, Fabrice Armougom, Yosra Khammeri, Rim Lajnef, Amel Bellaaj-Zouari
- article
- Frontiers in Microbiology, 2020, 11, ⟨10.3389/fmicb.2020.593540⟩
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-
-
- titre
- In situ observations and modelling revealed environmental factors favouring occurrence of Vibrio in microbiome of the pelagic Sargassum responsible for strandings
- auteur
- Valerie Michotey, Aurelie Blanfuné, Cristele Chevalier, Marc Garel, Frédéric Diaz, Léo Berline, Louis Le Grand, Fabrice Armougom, Sophie Guasco, Sandrine Ruitton, T. Changeux, Bruno Belloni, Jean Blanchot, Frédéric Ménard, Thierry Thibaut
- article
- Science of the Total Environment, 2020, 748, pp.141216. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.141216⟩
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-
-
- titre
- Stress factors resulting from the Arctic vernal sea-ice melt
- auteur
- Rémi Amiraux, Christopher Burot, Patricia Bonin, Guillaume Massé, Sophie Guasco, Marcel Babin, Frederic Vaultier, Jean-Francois Rontani
- article
- Elementa: Science of the Anthropocene, 2020, 8 (1), ⟨10.1525/elementa.076⟩
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-
-
- titre
- A novel Thermotoga strain TFO isolated from a Californian petroleum reservoir phylogenetically related to Thermotoga petrophila and T. naphthophila, two thermophilic anaerobic isolates from a Japanese reservoir: Taxonomic and genomic considerations
- auteur
- Zara M Summers, Hassiba Belahbib, Nathalie Pradel, Manon Bartoli, Pooja Mishra, Christian Tamburini, Alain Dolla, Bernard Ollivier, Fabrice Armougom
- article
- Systematic and Applied Microbiology, 2020, 43 (6), pp.126132. ⟨10.1016/j.syapm.2020.126132⟩
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-
-
- titre
- Long-read only assembly of Drechmeria coniospora genomes reveals widespread chromosome plasticity and illustrates the limitations of current nanopore methods
- auteur
- Damien Courtine, Jan Provaznik, Jerome Reboul, Guillaume Blanc, Vladimir Benes, Jonathan J Ewbank
- article
- GigaScience, 2020, 9 (9), pp.1 - 11. ⟨10.1093/gigascience/giaa099⟩
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-
-
- titre
- Meta-omics Provides Insights into the Impact of Hydrocarbon Contamination on Microbial Mat Functioning
- auteur
- Johanne Aubé, Pavel Senin, Patricia Bonin, Olivier Pringault, Céline Jeziorski, Olivier Bouchez, Christophe C. Klopp, Remy Guyoneaud, Marisol Goñi
- article
- Microbial ecology, 2020, 80 (2), pp.286-295. ⟨10.1007/s00248-020-01493-x⟩
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-
-
- titre
- Impact of cigarette butts on microbial diversity and dissolved trace metals in coastal marine sediment
- auteur
- Marianne Quemeneur, Sandrine Chifflet, Fourat Akrout, Amel Bellaaj-Zouari, Malika Belhassen
- article
- Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2020, 240, pp.106785. ⟨10.1016/j.ecss.2020.106785⟩
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-
-
- titre
- Long-term monitoring emphasizes impacts of the dredging on dissolved Cu and Pb contamination along with ultraplankton distribution and structure in Toulon Bay (NW Mediterranean Sea, France)
- auteur
- N. Layglon, Benjamin Misson, Gaël Durieu, Clément Coclet, Sébastien d'Onofrio, Duc Huy Dang, David François, Jean-Ulrich Mullot, Stéphane Mounier, Véronique Lenoble, Dario Omanović, Cédric Garnier
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2020, 156, pp.111196. ⟨10.1016/j.marpolbul.2020.111196⟩
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-
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- titre
- Impacts of copper and lead exposure on prokaryotic communities from contaminated contrasted coastal seawaters: the influence of previous metal exposure
- auteur
- Clément Coclet, Cédric Garnier, Gaël Durrieu, Sébastien d'Onofrio, Nicolas Layglon, Jean-François Briand, Benjamin Misson
- article
- FEMS Microbiology Ecology, 2020, 96 (6), ⟨10.1093/femsec/fiaa048⟩
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-
-
- titre
- Diversity and evolution of bacterial bioluminescence genes in the global ocean
- auteur
- Thomas Vannier, Pascal Hingamp, Floriane Turrel, Lisa Tanet, Magali Lescot, Y. Timsit
- article
- NAR Genomics and Bioinformatics, 2020, 2 (2), ⟨10.1093/nargab/lqaa018⟩
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-
-
- titre
- Archaea, specific genetic traits, and development of improved bacterial live biotherapeutic products: another face of next-generation probiotics
- auteur
- Khaled Fadhlaoui, Marie-Edith Arnal, Matthieu Martineau, Paméla Camponova, Bernard Ollivier, Paul O’toole, Jean-François Brugere
- article
- Applied Microbiology and Biotechnology, 2020, 104 (11), pp.4705-4716. ⟨10.1007/s00253-020-10599-8⟩
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-
-
- titre
- Dissolved organic matter controls of arsenic bioavailability to bacteria
- auteur
- Martin Pothier, Véronique Lenoble, Cédric Garnier, Benjamin Misson, Charlotte Rentmeister, Alexandre Poulain
- article
- Science of the Total Environment, 2020, 716, pp.137118. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.137118⟩
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-
-
- titre
- A Multi-Omics Analysis Suggests Links Between the Differentiated Surface Metabolome and Epiphytic Microbiota Along the Thallus of a Mediterranean Seaweed Holobiont
- auteur
- Benoît Paix, Nathan Carriot, Raphaëlle Barry-Martinet, Stephane Greff, Benjamin Misson, Jean-François Briand, Gérald Culioli
- article
- Frontiers in Microbiology, 2020, 11, pp.494. ⟨10.3389/fmicb.2020.00494⟩
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-
-
- titre
- Oil spill response in mangroves: why a specific ecosystem-based management is required? The case of French Guiana – a mini-review
- auteur
- Philippe Cuny, Ronan Jezequel, Emma Michaud, Léa Sylvi, Franck Gilbert, Maud Fiard, C. Chevalier, Valérie Morel, Cécile Militon
- article
- Vie et Milieu / Life & Environment, 2020, 70 (3-4), pp.69-76
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-
-
- titre
- Oxygen and light determine the pathways of nitrate reduction in a highly saline lake
- auteur
- Nicolás Valiente, Franz Jirsa, Thomas Hein, Wolfgang Wanek, Patricia Bonin, Juan José Gómez-Alday
- article
- Biogeosciences, 2020, ⟨10.5194/bg-2020-20⟩
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-
-
- titre
- Production of Current by Syntrophy Between Exoelectrogenic and Fermentative Hyperthermophilic Microorganisms in Heterotrophic Biofilm from a Deep-Sea Hydrothermal Chimney
- auteur
- Guillaume Pillot, Sylvain Davidson, Richard Auria, Yannick Combet-Blanc, Anne Godfroy, Pierre-Pol Liebgott
- article
- Microbial ecology, 2020, 79 (1), pp.38-49. ⟨10.1007/s00248-019-01381-z⟩
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-
-
- titre
- Stress factors resulting from the Arctic vernal sea-ice melt: Impact on the viability of bacterial communities associated with sympagic algae
- auteur
- Rémi Amiraux, Christopher Burot, Patricia Bonin, Guillaume Massé, Sophie Guasco, Marcel Babin, Frederic Vaultier, Jean-Francois Rontani
- article
- Elementa: Science of the Anthropocene, In press, 8, ⟨10.1525/elementa.076⟩
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-
- titre
- Have decades of abiotic studies in sediments been misinterpreted?
- auteur
- N. Layglon, Benjamin Misson, Stéphane Mounier, Véronique Lenoble, Dario Omanović, Cédric Garnier
- article
- Science of the Total Environment, 2020, 707, pp.135949. ⟨10.1016/j.scitotenv.2019.135949⟩
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-
- titre
- Desulfobotulus mexicanus sp. nov., a novel sulfate-reducing bacterium isolated from the sediment of an alkaline crater lake in Mexico
- auteur
- Maria Fernanda Pérez-Bernal, Elcia Margareth Souza Brito, Manon Bartoli, Johanne Aubé, Bernard Ollivier, Remy Guyoneaud, Agnès Hirschler-Réa
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2020, 70 (5), pp.3219-3225. ⟨10.1099/ijsem.0.004159⟩
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-
-
- titre
- Towards the development of ecosystem-based indicators of mangroves functioning state in the context of the EU water framework directive
- auteur
- Guillaume Dirberg, Geneviève Barnaud, Olivier Brivois, Pierre Caessteker, Marie-Christine Cormier-Salem, Philippe Cuny, Maud Fiard, François Fromard, Franck Gilbert, Sandrine Grouard, Daniel Guiral, Cédric Hubas, Daniel Imbert, Dominique Lamy, Tarik Meziane, Emma Michaud, Claire Michelet, Cécile Militon, Alain Pibot, Christophe Proisy, Tony Robinet, Thomas Stieglitz, Léa Sylvi, F Taureau, Hélène Udo, Romain Walcker, Daniela Zeppilli, Olivier Monnier
- article
- Vie et Milieu / Life & Environment, 2020, 70 (3-4), pp.303-310
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-
- titre
- Anaerohalosphaera lusitana gen. nov., sp. nov., and Limihaloglobus sulfuriphilus gen. nov., sp. nov., isolated from solar saltern sediments, and proposal of Anaerohalosphaeraceae fam. nov. within the order Sedimentisphaerales
- auteur
- Nathalie Pradel, Marie-Laure Fardeau, Brian Tindall, Stefan Spring
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, In press, ⟨10.1099/ijsem.0.003919⟩
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-
-
- titre
- Reviews and syntheses: Bacterial bioluminescence – ecology and impact in the biological carbon pump
- auteur
- Lisa Tanet, Severine Martini, Laurie Casalot, Christian Tamburini
- article
- Biogeosciences, 2020, 17 (14), pp.3757-3778. ⟨10.5194/bg-17-3757-2020⟩
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-
-
- titre
- Iron corrosion induced by the hyperthermophilic sulfate-reducing archaeon Archaeoglobus fulgidus at 70°C
- auteur
- Oulfat Amin Ali, Emmanuel Aragon, Armand Fahs, Sylvain Davidson, Bernard Ollivier, Agnès Hirschler-Réa
- article
- International Biodeterioration and Biodegradation, 2020, 154, pp.105056. ⟨10.1016/j.ibiod.2020.105056⟩
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-
-
- titre
- Comparative Genomics Unveils Regionalized Evolution of the Faustovirus Genomes
- auteur
- Khalil Geballa-Koukoulas, Hadjer Boudjemaa, Julien Andreani, Bernard Scola, Guillaume Blanc
- article
- Viruses, 2020, 12 (5), pp.577. ⟨10.3390/v12050577⟩
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-
Conference papers
- titre
- Oil Spill response in mangroves: why a specific Ecosystem-based Management is required?
- auteur
- Philippe Cuny, Ronan Jézéquel, Emma Michaud, Lea Sylvi, Cécile Militon
- article
- International Workshop on Ecosystem-based Management, Feb 2020, Marseille, France
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-
Book sections
- titre
- Un risque littoral avéré non représenté : la pollution par les hydrocarbures pétroliers
- auteur
- Cristele Chevalier, Philippe Cuny, Valérie Morel
- article
- Atlas critique de la Guyane, , pp.302-303, 2020, 978-2-271-13213-0
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-
Preprints, Working Papers, ...
-
- titre
- Electrotrophy as potential primary metabolism for colonization of conductive surfaces in deep-sea hydrothermal chimneys
- auteur
- Guillaume Pillot, Sylvain Davidson, Laetitia Shintu, Oulfat Amin, Anne Godfroy, Yannick Combet-Blanc, Patricia Bonin, Pierre-Pol Liebgott
- article
- 2020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- On the barium-oxygen consumption relationship in the Mediterranean Sea: implications for mesopelagic marine snow remineralisation
- auteur
- Stéphanie Jacquet, Dominique Lefèvre, Christian Tamburini, Marc Garel, Frédéric A.C. Le Moigne, Nagib Bhairy, Marie Roumagnac, Sophie Guasco
- article
- 2020
- Accès au bibtex
-
- titre
- Particulate biogenic barium tracer of mesopelagic carbon remineralization in the Mediterranean Sea (PEACETIME project)
- auteur
- Stéphanie Jacquet, Christian Tamburini, Marc Garel, Aurélie Dufour, France van Wambeke, Frédéric A.C. Le Moigne, Nagib Bhairy, Sophie Guasco
- article
- 2020
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-
2019
Journal articles
-
- titre
- The lichen symbiosis re-viewed through the genomes of Cladonia grayi and its algal partner Asterochloris glomerata
- auteur
- Daniele Armaleo, Olaf Müller, François Lutzoni, Guillaume Blanc, Helge B Bode, Frank R Collart, Francesco Dal Grande, Fred Dietrich, Igor V Grigoriev, Suzanne Joneson, Alan Kuo, Peter Gorm Larsen, John M Logsdon, David López, Francis Martin, Susan P May, Tami R Mcdonald, Sabeeha S Merchant, Vivian Miao, Emmanuelle Morin, Ryoko Oono, Matteo Pellegrini, Nimrod Rubinstein, Maria Virginia Sanchez-Puerta, Elizabeth Savelkoul, Imke Schmitt, Jason C Slot, Darren Soanes, Péter Szövényi, Nicholas J Talbot, Claire Veneault-Fourrey, Basil B Xavier
- article
- BMC Genomics, 2019, 20 (1), pp.605. ⟨10.1186/s12864-019-5629-x⟩
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-
-
- titre
- Microbial abundance, activity and population genomic profiling with mOTUs2
- auteur
- Alessio Milanese, Daniel Mende, Lucas Paoli, Guillem Salazar, Hans-Joachim Ruscheweyh, Miguelangel Cuenca, Pascal Hingamp, Renato Alves, Paul Costea, Luis Pedro Coelho, Thomas Schmidt, Alexandre Almeida, Alex Mitchell, Robert Finn, Jaime Huerta-Cepas, Peer Bork, Georg Zeller, Shinichi Sunagawa
- article
- Nature Communications, 2019, 10 (1), ⟨10.1038/s41467-019-08844-4⟩
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-
-
- titre
- Metabolomic and proteomic changes induced by growth inhibitory concentrations of copper in the biofilm-forming marine bacterium Pseudoalteromonas lipolytica
- auteur
- Laurie Favre, Annick Ortalo-Magné, Lionel Kerloch, Carole Pichereaux, Benjamin Misson, Jean-François Briand, Cédric Garnier, Gérald Culioli
- article
- Metallomics, 2019, 11 (11), pp.1887-1899. ⟨10.1039/C9MT00184K⟩
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-
- titre
- Gene Expression Changes and Community Turnover Differentially Shape the Global Ocean Metatranscriptome
- auteur
- Guillem Salazar, Lucas Paoli, Adriana A. Alberti, Jaime Huerta-Cepas, Hans-Joachim Ruscheweyh, Miguelangel Cuenca, Christopher Field, Luis Pedro Coelho, Corinne Cruaud, Stefan Engelen, Ann Gregory, Karine Labadie, Claudie Marec, Eric Pelletier, Marta Royo-Llonch, Simon Roux, Pablo Sánchez, Hideya Uehara, Ahmed Zayed, Georg Zeller, Margaux Carmichael, Céline Dimier, Joannie Ferland, Stefanie Kandels, Marc Picheral, Sergey Pisarev, Julie Poulain, Silvia Acinas, Marcel Babin, Peer Bork, Emmanuel Boss, Chris Bowler, Guy Cochrane, Colomban de Vargas, Michael Follows, Gabriel Gorsky, Nigel Grimsley, Lionel Guidi, Pascal Hingamp, Daniele Iudicone, Olivier Jaillon, Stefanie Kandels-Lewis, Lee Karp-Boss, Eric Karsenti, Fabrice Not, Hiroyuki Ogata, Stephane Pesant, Nicole Poulton, Jeroen Raes, Christian Sardet, Sabrina Speich, Lars Stemmann, Matthew Sullivan, Shinichi Sunagawa, Patrick Wincker
- article
- Cell, 2019, 179 (5), pp.1068-1083.e21. ⟨10.1016/j.cell.2019.10.014⟩
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-
- titre
- Direct and indirect impact of the bacterial strain Pseudomonas aeruginosa on the dissolution of synthetic Fe(III)- and Fe(II)-bearing basaltic glasses
- auteur
- Anne Perez, Stéphanie Rossano, Nicolas Trcera, Aurélie Verney-Carron, Céline Rommevaux, Chloé Fourdrin, Ana Carolina Agnello, David Huguenot, François Guyot
- article
- Chemical Geology, 2019, 523, pp.9-18. ⟨10.1016/j.chemgeo.2019.05.033⟩
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- titre
- Shear Stress as a Major Driver of Marine Biofilm Communities in the NW Mediterranean Sea
- auteur
- Elisa C P Catão, Thomas Pollet, Benjamin Misson, Cédric Garnier, Jean-François Ghiglione, Raphaëlle Barry-Martinet, Marine Maintenay, Christine Bressy, Jean-François Briand
- article
- Frontiers in Microbiology, 2019, ⟨10.3389/fmicb.2019.01768⟩
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- titre
- Effects of catchment area and nutrient deposition regime on phytoplankton functionality in alpine lakes
- auteur
- Coralie Jacquemin, Céline Bertrand, Evelyne Franquet, Stéphane Mounier, Benjamin Misson, Benjamin Oursel, Laurent Cavalli
- article
- Science of the Total Environment, 2019, 674, pp.114-127. ⟨10.1016/j.scitotenv.2019.04.117⟩
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- titre
- Nervous-Like Circuits in the Ribosome Facts, Hypotheses and Perspectives
- auteur
- Y. Timsit, Daniel Bennequin
- article
- International Journal of Molecular Sciences, 2019, ⟨10.3390/ijms20122911⟩
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- titre
- Prokaryote Communities at Active Chimney and In-Situ Colonization Devices after a Magmatic Degassing Event (37°N MAR, EMSO-Azores Deep-Sea Observatory)
- auteur
- Céline Rommevaux, Pauline A Henri, Jefferson Degboe, Valérie Chavagnac, Françoise A Lesongeur, Anne A Godfroy, Cédric Boulart, Christine Destrigneville, Alain Castillo
- article
- Geochemistry, Geophysics, Geosystems, 2019, ⟨10.1029/2018GC008107⟩
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- titre
- New High-Tech Flexible Networks for the Monitoring of Deep-Sea Ecosystems
- auteur
- Jacopo Aguzzi, Damianos Chatzievangelou, Simone Marini, Emanuela Fanelli, Roberto Danovaro, Sascha Flögel, Nadine Lebris, Francis Juanes, Fabio de Leo, Joaquin del Rio, Laurenz Thomsen, Corrado Costa, Giorgio Riccobene, Christian Tamburini, Dominique Lefèvre, Carl Gojak, Pierre-Marie Poulain, Paolo Favali, Annalisa Griffa, Autun Purser, Danelle Cline, Duane Edgington, Joan Navarro, Sergio Stefanni, Steve D’hondt, Imants Priede, Rodney Rountree, Joan Company
- article
- Environmental Science and Technology, 2019, 53 (12), pp.6616-6631. ⟨10.1021/acs.est.9b00409⟩
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- titre
- Seasonal and plant-part isotopic and biochemical variation in Posidonia oceanica
- auteur
- Pierre Cresson, Charles-François Boudouresque, Sandrine Ruitton, Laurie Casalot, Marc Verlaque, Mireille Harmelin-Vivien
- article
- Mediterranean Marine Science, 2019, 20 (2), pp.357. ⟨10.12681/mms.18660⟩
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- titre
- Dissecting the membrane lipid binding properties and lipase activity of Mycobacterium tuberculosis LipY domains
- auteur
- Pierre Santucci, Nabil Smichi, Sadia Diomandé, Isabelle Poncin, Vanessa Point, Hélène Gaussier, Jean-François Cavalier, Laurent Kremer, Stéphane Canaan
- article
- FEBS Journal, 2019, ⟨10.1111/febs.14864⟩
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- titre
- Impact of sterilization methods on dissolved trace metals concentrations in complex natural samples: optimization of UV irradiation
- auteur
- Sandrine Chifflet, Marianne Quemeneur, Aude Barani, Bernard Angeletti, Morgane Didry, Gérald Grégori, Nathalie Pradel
- article
- MethodsX, 2019, 6, pp.1133-1146. ⟨10.1016/j.mex.2019.04.020⟩
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- titre
- Community‐Level Responses to Iron Availability in Open Ocean Plankton Ecosystems
- auteur
- Luigi Caputi, Quentin Carradec, Damien Eveillard, Amos Kirilovsky, Eric Pelletier, Juan Pierella Karlusich, Fabio Rocha Jimenez Vieira, Emilie Villar, Samuel Chaffron, Shruti Malviya, Eleonora Scalco, Silvia G Acinas, Adriana A. Alberti, Jean Marc Aury, Anne-Sophie Benoiston, Alexis Bertrand, Tristan Biard, Lucie Bittner, Martine Boccara, Jennifer R. Brum, Christophe Brunet, Greta Busseni, Anna Carratalà, Hervé Claustre, Luis Pedro Coelho, Sébastien Colin, Salvatore d'Aniello, Corinne da Silva, Marianna del Core, Hugo Doré, Stéphane Gasparini, Florian Kokoszka, Jean-Louis Jamet, Christophe D Lejeusne, Cyrille Lepoivre, Magali Lescot, Gipsi Lima-Mendez, Fabien Lombard, Julius Lukeš, Nicolas Maillet, Mohammed-Amin Madoui, Elodie Martinez, Maria Grazia Mazzocchi, Mario B Néou, Javier Paz-Yepes, Julie Poulain, Simon Ramondenc, Jean-Baptiste Romagnan, Simon Roux, Daniela Salvagio Manta, Remo Sanges, Sabrina Speich, Mario Sprovieri, Shinichi Sunagawa, Vincent Taillandier, Atsuko Tanaka, Leila Tirichine, Camille Trottier, Julia Uitz, Alaguraj Veluchamy, Jana Veselá, Flora Vincent, Sheree Yau, Stefanie Kandels-Lewis, Sarah Searson, Céline Dimier, Marc Picheral, Peer Bork, Emmanuel Boss, Colomban de Vargas, Michael Follows, Nigel Grimsley, Lionel Guidi, Pascal Hingamp, Eric Karsenti, Paolo Sordino, Lars Stemmann, Matthew B. Sullivan, Alessandro Tagliabue, Adriana Zingone, Laurence Garczarek, Fabrizio d'Ortenzio, Pierre Testor, Fabrice Not, Maurizio Ribera d'Alcalà, Patrick Wincker, Gabriel Gorsky, Olivier Jaillon, Lee Karp-Boss, Uros Krzic, Hiroyuki Ogata, Stéphane Pesant, Jeroen Raes, Emmanuel G Reynaud, Christian Sardet, Mike Sieracki, Didier Velayoudon, Jean Weissenbach, Chris Bowler, Daniele Iudicone
- article
- Global Biogeochemical Cycles, 2019, 33 (3), pp.391-419. ⟨10.1029/2018GB006022⟩
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- titre
- Bacterial Bioluminescence: Light Emission in Photobacterium phosphoreum Is Not Under Quorum-Sensing Control
- auteur
- Lisa Tanet, Christian Tamburini, Chloé Baumas, Marc Garel, Gwenola Simon, Laurie Casalot
- article
- Frontiers in Microbiology, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.00365⟩
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- titre
- Changes in Bacterioplankton Communities Resulting From Direct and Indirect Interactions With Trace Metal Gradients in an Urbanized Marine Coastal Area
- auteur
- Clément Coclet, Cédric Garnier, Gaël Durrieu, Dario Omanović, Sébastien d'Onofrio, Christophe Le Poupon, Jean-Ulrich Mullot, Jean-François Briand, Benjamin Misson
- article
- Frontiers in Microbiology, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.00257⟩
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- titre
- The bacterial MrpORP is a novel Mrp/NBP35 protein involved in iron-sulfur biogenesis
- auteur
- Romain Pardoux, Anouchka Fiévet, Cíntia Carreira, Céline Brochier-Armanet, Odile Valette, Zorah Dermoun, Beatrice Py, Alain Dolla, Sofia Pauleta, Corinne Aubert
- article
- Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.360-373. ⟨10.1038/s41598-018-37021-8⟩
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- titre
- Growth of an anaerobic sulfate-reducing bacterium sustained by oxygen respiratory energy conservation after O 2 -driven experimental evolution
- auteur
- Marine Schoeffler, Anne-Laure Gaudin, Fanny Ramel, Odile Valette, Yann Denis, Wagdi Ben Hania, Agnès Hirschler-Réa, Alain Dolla
- article
- Environmental Microbiology, 2019, ⟨10.1111/1462-2920.14466⟩
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- titre
- Genus Paludifilum
- auteur
- Marie-Laure Fardeau, Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2019, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01628⟩
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-
- titre
- Minimum Information about an Uncultivated Virus Genome (MIUViG)
- auteur
- Simon Roux, Evelien M. Adriaenssens, Bas E. Dutilh, Eugene V. Koonin, Andrew M. Kropinski, Mart Krupovic, Jens H. Kuhn, Rob Lavigne, J. Rodney Brister, Arvind Varsani, Clara Amid, Ramy K. Aziz, Seth R. Bordenstein, Peer Bork, Mya Breitbart, Guy R. Cochrane, Rebecca A. Daly, Christelle Desnues, Melissa B. Duhaime, Joanne B. Emerson, François Enault, Jed A. Fuhrman, Pascal Hingamp, Philip Hugenholtz, Bonnie L. Hurwitz, Natalia N. Ivanova, Jessica M. Labonté, Kyung-Bum Lee, Rex R. Malmstrom, Manuel Martinez-Garcia, Ilene Karsch Mizrachi, Hiroyuki Ogata, David Páez-Espino, Marie-Agnès Petit, Catherine Putonti, Thomas Rattei, Alejandro Reyes, Francisco Rodriguez-Valera, Karyna Rosario, Lynn Schriml, Frederik Schulz, Grieg F. Steward, Matthew B. Sullivan, Shinichi Sunagawa, Curtis A. Suttle, Ben Temperton, Susannah G. Tringe, Rebecca Vega Thurber, Nicole S. Webster, Katrine L. Whiteson, Steven W. Wilhelm, K. Eric Wommack, Tanja Woyke, Kelly C. Wrighton, Pelin Yilmaz, Takashi Yoshida, Mark J. Young, Natalya Yutin, Lisa Zeigler Allen, Nikos C. Kyrpides, Emiley A. Eloe-Fadrosh
- article
- Nature Biotechnology, 2019, 37 (1), pp.29-37. ⟨10.1038/nbt.4306⟩
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- titre
- Modicisalibacter
- auteur
- Ben-Ali-Gam Zouhair, Laurie Casalot, Marc Labat
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2019, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01717⟩
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- titre
- Dynamics of trace metals in a shallow coastal ecosystem : insights from the Gulf of Gabès (southern Mediterranean Sea)
- auteur
- Sandrine Chifflet, Marc Tedetti, Hana Zouch, Rania Fourati, Hatem Zaghden, Boubaker Elleuch, Marianne Quemeneur, Fatma Karray, Sami Sayadi
- article
- Aims Environmental Science, 2019, 6 (4), pp.277-297. ⟨10.3934/environsci.2019.4.277⟩
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- titre
- Evidence of high N2 fixation rates in the temperate northeast Atlantic
- auteur
- Debany Fonseca-Batista, Xuefeng Li, Virginie Riou, Valerie Michotey, Florian Deman, François Fripiat, Sophie Guasco, Natacha Brion, Nolwenn Lemaitre, Manon Tonnard, Morgane Gallinari, Hélène Planquette, Frédéric Planchon, Géraldine Sarthou, Marc Elskens, Julie Laroche, Lei Chou, Frank Dehairs
- article
- Biogeosciences, 2019, 16 (5), pp.999-1017. ⟨10.5194/bg-16-999-2019⟩
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- titre
- Methanocalculus
- auteur
- Marie-Laure Fardeau, Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2019, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00512.pub2⟩
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- titre
- Hydrostatic Pressure Helps to Cultivate an Original Anaerobic Bacterium From the Atlantis Massif Subseafloor (IODP Expedition 357): Petrocella atlantisensis gen. nov. sp. nov.
- auteur
- Marianne Quéméneur, Gaël Erauso, Eléonore E Frouin, Emna Zeghal, Céline Vandecasteele, Bernard Ollivier, Christian Tamburini, Marc Garel, Bénédicte Ménez, Anne Postec
- article
- Frontiers in Microbiology, 2019, 10, pp.1497. ⟨10.3389/fmicb.2019.01497⟩
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- titre
- Microbial and chemical investigation of 2000 m deep Triassic rock (Meuse/Haute Marne, France)
- auteur
- Vanessa Leblanc, Jennifer Hellal, Marie Laure Fardeau, Saber Khelaifia, Claire Sergeant, Françis Garrido, Bernard Ollivier, Catherine Joulian
- article
- Geosciences, 2019, 9 (1), pp.3. ⟨10.3390/geosciences9010003⟩
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-
- titre
- Fonticella
- auteur
- Marie Laure Fardeau, Anne Postec, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2019, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01633⟩
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-
- titre
- Anaerosalibacter
- auteur
- Marie Laure Fardeau, Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2019, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01397⟩
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-
- titre
- Towards Integrating Evolution, Metabolism, and Climate Change Studies of Marine Ecosystems
- auteur
- Federico Baltar, Barbara Bayer, Nina Bednarsek, Stacy Deppeler, Ruben Escribano, Carolina Gonzalez, Roberta Hansman, Rajani Kanta Mishra, Mary Ann Moran, Daniel Repeta, Carol Robinson, Eva Sintes, Christian Tamburini, Luis Valentin, Gerhard Herndl
- article
- Trends in Ecology & Evolution, 2019, 34 (11), pp.1022-1033. ⟨10.1016/J.TREE.2019.07.003⟩
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-
-
- titre
- Pressure-Retaining Sampler and High-Pressure Systems to Study Deep-Sea Microbes Under in situ Conditions
- auteur
- Marc Garel, Patricia Bonin, Severine Martini, Sophie Guasco, Marie Roumagnac, Nagib Bhairy, Fabrice Armougom, Christian Tamburini
- article
- Frontiers in Microbiology, 2019, 10, pp.453. ⟨10.3389/fmicb.2019.00453⟩
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-
- titre
- Enhancement of biotic degradation of terrestrial particulate organic matter in an estuarine salinity gradient: Interactive effects of organic matter pools and changes of bacterial communities.
- auteur
- Patricia Bonin, Anne-Hélène Prime, Mairie-Aimée Galeron, Sophie Guasco, Jean-Francois Rontani
- article
- Aquatic Microbial Ecology, 2019, 83, pp.147 - 159. ⟨10.3354/ame01908⟩
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-
- titre
- Crassaminicella
- auteur
- Gregoire Gales, Anne Postec, Jean Luc Cayol
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2019, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01636⟩
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Conference papers
- titre
- Ecological gradients as an evolutionary opportunity for Mediterranean biodiversity
- auteur
- Bruno Fady, Marc Bally, Alberte Bondeau, Francois Carlotti, Anne Chenuil, Wolfgang Cramer, Jean-Pierre Féral, Thierry Gauquelin, Anne-Christine Monnet, Séverine Thomas, France van Wambeke, D. Aurelle
- article
- OTMED Final Conference - What kind of environmental transition for the mediterranean region?, Oct 2019, Marseille, France
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-
Book sections
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- titre
- Eau et Santé
- auteur
- Isabelle C. Biegala, Yann Barguil, Chollet Stéphane, Bétrancourt Jérôme, Saume, Karine
- article
- Au Fil de l'eau CRESICA, 2019
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-
-
- titre
- Prendre les cyanobactéries sur le fait
- auteur
- Isabelle C. Biegala
- article
- Sabrié, Marie-Lise (dir.), Mourier, Thomas (dir.), Lavagne, Corinne (dir.). Science et développement durable : 75 ans de recherche au Sud, IRD, pp.115, 2019
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-
Books
- titre
- Science et développement durable : 75 ans de recherche au Sud
- auteur
- Isabelle Guérin, François Roubaud, Christophe Z. Guilmoto, Mireille Razafindrakoto, Marc Pilon, Isabelle Léglise, Pierre-Yves Le Meur, Fatoumata Ouattara, Christian Seignobos, Pierre Chauveau, Eric Léonard, Dominique Guillaud, Alain Froment, Nelly Robin, Michel Agier, Sophie Bava, Annabel Desgrées Du Loû, Flore Gubert, Eric Delaporte, Gonzague Jourdain, Alexandre Dumont, Serge S. Trèche, Jacques Berger, Pierre Traissac, Valérie Delaunay, Vincent Robert, Frédéric Darriet, Cheikh Sokhna, Michel Cot, Martine Peeters, Eric M. Leroy, Alice Desclaux, Marc Hougard, Didier Paugy, Michel Boussinesq, Philippe Solano, Dorothée Missé, Louis-Clément Gouagna, Jean Lemesre, Anne-Laure Bañuls, Christophe E. Menkès, Morgan Mangeas, Benjamin Sultan, Thomas Condom, Marie Gosset, Serge Janicot, Jean Nocquet, Luc Le Pennec, Sébastien Hardy, Philippe Charvis, Yann Hello, Emmanuel Bonnet, Emilie Strady, David E Point, Bernard Ollivier, Isabelle C. Biegala, Christian Feller, Christian Valentin, Eric Giraud, Eric Blanchart, Pierre Montoroi, Philippe Cecchi, Jean Albergel, Jean-Michel Vouillamoz, Vincent Simonneaux, Gil Boulet, Thierry Ruf, Geneviève Michon, Jean-Baptiste Boutrais, Laure Emperaire, Robin Duponnois, Philippe Boulanger, Eugénie Hébrard, Valerie Verdier, Boris Szurek, Bruno Le Ru, Paul-André Calatayud, Olivier O. Dangles, Frédérique Aberlenc, Sevastianos Roussos, Gauthier G. Dobigny, Marc Legendre, Daniel Gaertner, Pierre Chavance, Pascal Bach, Arnaud Bertrand, Jérôme Vialard, Jacques Merle, Bruno Voituriez, Bernard Bourlès, Pierrick Penven, Gil Mahe, Thierry Lebel, Luc Descroix, Pierre Chevallier, Stéphane Calmant, Bruno Turcq, Adrien Favreau, Jean-Louis Rajot, Raphaël Pelissier, Philippe Cury, Riccardo Rodolfo-Metalpa, Hervé De Tricornot, Frédéric Simard, Jean-François Etard, Bernard Taverne, Florence Fournet, Alexis Drogoul, Marc Souris, Monique Simier, Marie Bonnin, Alain Ghesquière, Serge Hamon, Yves Vigouroux, Sophie Gonzalez, Jean-François Molino, Geneviève Bourdy, Christian Moretti, Pierre Ottino Garanger, Francisco Valdez, Benoît Antheaume, Nicolas Gratiot, Philippe Lavigne Delville, Yves Goudineau, Marie-Lise Sabrié, Thomas Mourier, Lavagne, Corinne, Viviane Thivent
- article
- IRD, pp.224, 2019, 978-2-7099-2737-6
- Accès au bibtex
-
2018
Journal articles
-
- titre
- Effect of acidic industrial efluent release on microbial diversity and trace metal dynamics during resuspension of coastal sediment
- auteur
- Hana Zouch, Léa Cabrol, Marc Tedetti, Sandrine Chifflet, Fatma Karray, Hatem Zaghden, Sami Sayadi, Marianne Quemeneur
- article
- Frontiers in Microbiology, 2018, 9, ⟨10.3389/fmicb.2018.03103⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Pleomorphochaeta naphthae sp. nov., a new anaerobic fermentative bacterium isolated from an oil field
- auteur
- Boussad Arroua, Régis Grimaud, Agnès Hirschler-Réa, Patrick Bouriat, Michel Magot, Laurent Urios, Anthony Ranchou-Peyruse
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2018, 68 (12), pp.3747-3753. ⟨10.1099/ijsem.0.003048⟩
- Accès au bibtex
-
-
- titre
- Single-cell genomics of multiple uncultured stramenopiles reveals underestimated functional diversity across oceans
- auteur
- Yoann Seeleuthner, Samuel Mondy, Vincent Lombard, Quentin Carradec, Eric Pelletier, Marc Wessner, Jade Leconte, Jean-François Mangot, Julie Poulain, Karine Labadie, Ramiro Logares, Shinichi Sunagawa, Véronique de Berardinis, Marcel Salanoubat, Céline Dimier, Stefanie Kandels-Lewis, Marc Picheral, Sarah Searson, Stéphane Pesant, Nicole Poulton, Ramunas Stepanauskas, Peer Bork, Chris Bowler, Pascal Hingamp, Matthew B. Sullivan, Daniele Iudicone, Ramon Massana, Jean-Marc Aury, Bernard Henrissat, Eric Karsenti, Olivier Jaillon, Mike Sieracki, Colomban de Vargas, Patrick Wincker, Silvia G. Acinas, Emmanuel Boss, Michael Follows, Gabriel Gorsky, Nigel Grimsley, Lee Karp-Boss, Uros Krzic, Fabrice Not, Jeroen Raes, Emmanuel G. Reynaud, Christian Sardet, Sabrina Speich, Lars Stemmann, Jean Weissenbach, Didier Velayoudon
- article
- Nature Communications, 2018, 9, pp.310. ⟨10.1038/s41467-017-02235-3⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-
- titre
- A global ocean atlas of eukaryotic genes
- auteur
- Quentin Carradec, Eric Pelletier, Corinne da Silva, Adriana A. Alberti, Yoann Seeleuthner, Romain Blanc-Mathieu, Gipsi Lima-Mendez, Fabio Rocha, Leila Tirichine, Karine Labadie, Amos Kirilovsky, Alexis Bertrand, Stefan Engelen, Mohammed-Amin Madoui, Raphaël Méheust, Julie Poulain, Sarah Romac, Daniel Richter, Genki Yoshikawa, Céline Dimier, Stefanie Kandels-Lewis, Marc Picheral, Sarah Searson, Olivier Jaillon, Jean-Marc Aury, Eric Karsenti, Matthew Sullivan, Shinichi Sunagawa, Peer Bork, Fabrice Not, Pascal Hingamp, Jeroen J. Raes, Lionel Guidi, Hiroyuki Ogata, Colomban de Vargas, Daniele Iudicone, Chris Bowler, Patrick Wincker, Jean Weissenbach
- article
- Nature Communications, 2018, 9 (1), pp.373. ⟨10.1038/s41467-017-02342-1⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-
- titre
- Magmatism, serpentinization and life: Insights through drilling the Atlantis Massif (IODP Expedition 357)
- auteur
- Gretchen Früh-Green, Beth Orcutt, Stéphane Rouméjon, Marvin Lilley, Yuki Morono, Carol Cotterill, Sophie Green, Javier Escartin, Barbara John, Andrew Mccaig, Mathilde Cannat, Bénédicte Ménez, Esther Schwarzenbach, Morgan Williams, Morgan Morgan, Susan Lang, Matthew Schrenk, William Brazelton, Norikatsu Akizawa, Chiara Boschi, Kristina G Dunkel, Marianne Quemeneur, Scott Whattam, Lisa Mayhew, Michelle Harris, Gaye Bayrakci, Jan-Hinrich Behrmann, Emilio Herrero-Bervera, Kirsten Hesse, Hai-Quan Liu, Amila Sandaruwan Ratnayake, Katrina Twing, Dominique Weis, Rui Zhao, Laura Bilenker
- article
- Lithos, 2018, 323, pp.137-155. ⟨10.1016/j.lithos.2018.09.012⟩
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-
- titre
- Sporosalibacterium
- auteur
- Marie Laure Fardeau, Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2018, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01447⟩
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-
-
- titre
- Bacterial diversity obtained by culturable approaches in the gut of Glossina pallidipes population from a non sleeping sickness focus in Tanzania: preliminary results
- auteur
- Imna Malele, Hamis Nyingilili, Eugen Lyaruu, Marc Tauzin, Bernard Ollivier, Jean-Luc Cayol, Marie-Laure Fardeau, Anne Geiger
- article
- BMC Microbiology, 2018, 18 (S1), pp.811-823. ⟨10.1186/s12866-018-1288-3⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-
- titre
- Towards a congruent reclassification and nomenclature of the thermophilic species of the genus Pseudothermotoga within the order Thermotogales
- auteur
- Hassiba Belahbib, Zarath Summers, Marie-Laure Fardeau, Manon Joseph, Christian Tamburini, Alain Dolla, Bernard Ollivier, Fabrice Armougom
- article
- Systematic and Applied Microbiology, 2018, 41 (6), pp.555-563. ⟨10.1016/J.SYAPM.2018.04.007⟩
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-
-
- titre
- Fate of petroleum hydrocarbons in bioturbated pristine sediments from Caleta Valdés (Patagonia Argentina): An ex situ bioassay
- auteur
- Julieta Sturla Lompré, Marina Nievas, Marcos Franco, Vincent Grossi, Agustina Ferrando, Cécile Militon, Franck Gilbert, Philippe Cuny, Georges Stora, Marcela Sepúlveda, José Luis Esteves, Marta Commendatore
- article
- Ecotoxicology and Environmental Safety, 2018, 162, pp.673-682. ⟨10.1016/j.ecoenv.2018.06.069⟩
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-
-
- titre
- Degenerate PCR Primers to Reveal the Diversity of Giant Viruses in Coastal Waters
- auteur
- Yanze Li, Pascal Hingamp, Hiroyasu Watai, Hisashi Endo, Takashi Yoshida, Hiroyuki Ogata
- article
- Viruses, 2018, 10 (9), pp.496. ⟨10.3390/v10090496⟩
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-
- titre
- Abundance and diversity of prokaryotes in ephemeral hypersaline lake Chott El Jerid using Illumina Miseq sequencing, DGGE and qPCR assays
- auteur
- Manel Ben Abdallah, Fatma Karray, Najwa Kallel, Fabrice Armougom, Najla Mhiri, Marianne Quemeneur, Jean-Luc Cayol, Gaël Erauso, Sami Sayadi
- article
- Extremophiles, 2018, 22 (5), pp.811-823. ⟨10.1007/s00792-018-1040-9⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Exploring the microbiome of the “star” freshwater diatom Asterionella formosa in a laboratory context
- auteur
- Kojadinovic-Sirinelli Mila, Villain Adrien, Puppo Carine, Fon Sing Sophie, Prioretti Laura, Hubert Pierre, Gérald Grégori, Zhang Yizhi, Sassi Jean-François, Jean-Michel Claverie, Guillaume Blanc, Brigitte Gontero
- article
- Environmental Microbiology, 2018, 20 (10), pp.3601-3615. ⟨10.1111/1462-2920.14337⟩
- Accès au bibtex
-
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- titre
- The nature of electron acceptor (MnIV/NO3) triggers differential expression of genes associated with stress and ammonium limitation responses in Shewanella algae C6G3
- auteur
- Axel Aigle, Patricia Bonin, Nicolas Fernandez -Nunez, Béatrice B. Loriod, Sophie Guasco, Aurélie Bergon, Fabrice Armougom, Chantal Iobbi-Nivol, Jean Imbert, Valerie Michotey
- article
- FEMS Microbiology Letters, In press, ⟨10.1093/femsle/fny068⟩
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- titre
- Specific enrichment of hyperthermophilic electroactive Archaea from deep-sea hydrothermal vent on electrically conductive support
- auteur
- Guillaume Pillot, Eléonore E Frouin, Emilie Pasero, Anne Godfroy, Yannick Combet-Blanc, Sylvain Davidson, Pierre-Pol Liebgott
- article
- Bioresource Technology, 2018, 259, pp.304-311. ⟨10.1016/j.biortech.2018.03.053⟩
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- titre
- Prokaryotic community successions and interactions in marine biofilms: the key role of Flavobacteriia
- auteur
- Thomas Pollet, Lyria Berdjeb, Cédric Garnier, Gaël Durrieu, Christophe Le Poupon, Benjamin Misson, Jean-François Briand
- article
- FEMS Microbiology Ecology, 2018, 94 (6), ⟨10.1093/femsec/fiy083⟩
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- titre
- Salinity shifts in marine sediment: Importance of number of fluctuation rather than their intensities on bacterial denitrifying community
- auteur
- Imen Zaghmouri, Valerie Michotey, Fabrice Armougom, Sophie Guasco, Patricia Bonin
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2018, 130, pp.76 - 83. ⟨10.1016/j.marpolbul.2018.03.020⟩
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- titre
- Trace metal contamination as a toxic and structuring factor impacting ultraphytoplankton communities in a multicontaminated Mediterranean coastal area
- auteur
- Clément Coclet, Cédric Garnier, Floriane Delpy, Dominique Jamet, Gaël Durrieu, Christophe Le Poupon, Marie Mayer, Benjamin Misson
- article
- Progress in Oceanography, 2018, 163, pp.196 - 213. ⟨10.1016/j.pocean.2017.06.006⟩
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- titre
- Biodegradation of Emiliania huxleyi aggregates by a natural Mediterranean prokaryotic community under increasing hydrostatic pressure
- auteur
- Virginie Riou, Julien Para, Marc Garel, Catherine Guigue, Badr Al Ali, Chiara Santinelli, Dominique Lefèvre, Jean-Pierre Gattuso, Madeleine Goutx, Stephanie Jacquet, Frédéric A.C. Le Moigne, K. Tachikawa, Christian Tamburini
- article
- Progress in Oceanography, 2018, 163, pp.271-281. ⟨10.1016/j.pocean.2017.01.005⟩
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- titre
- Characterization of Desulfovibrio salinus sp. nov., a slightly halophilic sulfate-reducing bacterium isolated from a saline lake in Tunisia
- auteur
- Zouhaier Ben Ali Gam, Abdoulaye Thioye, Jean-Luc Cayol, Manon Bartoli, Guy Fauque, Marc Labat
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2018, 68 (3), pp.715-720. ⟨10.1099/ijsem.0.002567⟩
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- titre
- IR spectroscopy analysis of pancreatic lipase-related protein 2 interaction with phospholipids: 2. Discriminative recognition of various micellar systems and characterization of PLRP2-DPPC-bile salt complexes
- auteur
- Eduardo Mateos-Diaz, Priscila Sutto-Ortiz, Moulay Sahaka, Deborah Byrne, Hélène Gaussier, Frédéric Carrière
- article
- Chemistry and Physics of Lipids, 2018, 211, pp.66-76. ⟨10.1016/j.chemphyslip.2017.11.012⟩
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- titre
- IR spectroscopy analysis of pancreatic lipase-related protein 2 interaction with phospholipids: 1. Discriminative recognition of mixed micelles versus liposomes
- auteur
- Eduardo Mateos-Diaz, Jean-Claude Bakala N’goma, Deborah Byrne, Sylvie Robert, Frédéric Carrière, Hélène Gaussier
- article
- Chemistry and Physics of Lipids, 2018, 211, pp.52-65. ⟨10.1016/j.chemphyslip.2017.02.005⟩
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- titre
- Diversity of rare and abundant prokaryotic phylotypes in the Prony hydrothermal field and comparison with other serpentinite-hosted ecosystems
- auteur
- Eléonore E Frouin, Méline Bes, Bernard Ollivier, Marianne Quéméneur, Anne Postec, Didier Debroas, Fabrice Armougom, Gaël Erauso
- article
- Frontiers in Microbiology, 2018, 9, ⟨10.3389/fmicb.2018.00102⟩
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- titre
- The Physcomitrella patens chromosome-scale assembly reveals moss genome structure and evolution
- auteur
- Daniel Lang, Kristian Ullrich, Florent Murat, Jörg Fuchs, Jerry Jenkins, Fabian Haas, Carl Li, Guillaume Blanc, Heidrun H. Gundlach, Michiel van Bel, Rabea Meyberg, Cristina Vives, Jordi Morata, Aikaterini Symeonidi, Manuel Hiss, Wellington Muchero, Lee Kamisugi, Omar A. Saleh, Eva Decker, Nico van Gessel, Jane Grimwood, Richard Hayes, Sean Graham, Lee Gunter, Daniel Mcdaniel, Sebastian N.W. Hoernstein, Anders Larsson, Fay-Wei Li, Pierre-François Perroud, Jeremy Phillips, Priya Ranjan, Daniel Rokshar, Carl Rothfels, Lucas Schneider, Shengqiang Shu, Dennis Stevenson, Fritz Thümmler, Michael Tillich, Juan Villarreal Aguilar, Thomas Widiez, Gane Ka-Shu Wong, Ann Wymore, Yong Zhang, Andreas Zimmer, Ralph Quatrano, Klaus F.X. Mayer, David Goodstein, Josep Casacuberta, Klaas Vandepoele, Ralf Reski, Andrew Cuming, Gerald Tuskan, Florian Maumus, Jérôme Salse, Jeremy Schmutz, Stefan Rensing
- article
- Plant Journal, 2018, 93 (3), pp.515 - 533. ⟨10.1111/tpj.13801⟩
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- titre
- A simple gas pressure manometer for measuring hydrogen production by hydrogenogenic cultures in serum bottles
- auteur
- Hana Gannoun, Lamia Ben Gaida, Rafika Saidi, Baligh Miladi, Moktar Hamdi, Hassib Bouallagui, Pierre-Pol Liebgott, Richard Auria
- article
- Process Biochemistry, 2018, 65, pp.157-163. ⟨10.1016/j.procbio.2017.10.011⟩
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- titre
- Locality and diel cycling of viral production revealed by a 24 h time course cross-omics analysis in a coastal region of Japan
- auteur
- Takashi Yoshida, Yosuke Nishimura, Hiroyasu Watai, Nana Haruki, Daichi Morimoto, Hiroto Kaneko, Takashi Honda, Keigo Yamamoto, Pascal Hingamp, Yoshihiko Sako, Susumu Goto, Hiroyuki Ogata
- article
- The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2018, ⟨10.1038/s41396-018-0052-x⟩
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- titre
- Biohydrogen production from hyperthermophilic anaerobic digestion of fruit and vegetable wastes in seawater: Simplification of the culture medium of Thermotoga maritima
- auteur
- Rafika Saidi, Pierre-Pol Liebgott, Hana Gannoun, Lamia Ben Gaïda, Baligh Miladi, Moktar Hamdi, Hassib Bouallagui, Richard Auria
- article
- Waste Management, 2018, 71, pp.474 - 484. ⟨10.1016/j.wasman.2017.09.042⟩
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- titre
- Obligate sugar oxidation in Mesotoga spp., phylum Thermotogae , in the presence of either elemental sulfur or hydrogenotrophic sulfate-reducers as electron acceptor
- auteur
- Khaled Fadhlaoui, Wagdi Ben Hania, Fabrice Armougom, Manon Joseph, Marie-Laure Fardeau, Gaël Erauso, Gael Brasseur, Corinne Aubert, Moktar Hamdi, Céline Brochier-Armanet, Alain Dolla, Bernard Ollivier
- article
- Environmental Microbiology, 2018, 20 (1), pp.281-292. ⟨10.1111/1462-2920.13995⟩
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- titre
- Functional characterization and FTIR-based 3D modeling of full length and truncated forms of Scorpio maurus venom phospholipase A 2
- auteur
- Najeh Krayem, Goetz Parsiegla, Hélène Gaussier, Hanen Louati, Raida Jallouli, Pascal Mansuelle, Frédéric Carrière, Youssef Gargouri
- article
- Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects, 2018, 1862 (5), pp.1247-1261. ⟨10.1016/j.bbagen.2018.02.004⟩
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- titre
- Archaea: Microbial Candidates in Next-generation Probiotics Development
- auteur
- Jean-François Brugère, Wajdi Ben Hania, Marie-Edith Arnal, Céline Ribière, Nathalie Ballet, Pascal Vandeckerkove, Bernard Ollivier, Paul O’toole
- article
- Journal of Clinical Gastroenterology, 2018, 52, pp.S71-S73. ⟨10.1097/MCG.0000000000001043⟩
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- titre
- Enhancement of fermentative hydrogen production by Thermotoga maritima through hyperthermophilic anaerobic co-digestion of fruit-vegetable and fish wastes
- auteur
- Rafika Saidi, Pierre-Pol Liebgott, Moktar Hamdi, Richard Auria, Hassib Bouallagui
- article
- International Journal of Hydrogen Energy, 2018, 43 (52), pp.23168-23177. ⟨10.1016/j.ijhydene.2018.10.208⟩
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- titre
- Taxon Richness of “Megaviridae” Exceeds those of Bacteria and Archaea in the Ocean
- auteur
- Tomoko Mihara, Hitoshi Koyano, Pascal Hingamp, Nigel Grimsley, Susumu Goto, Hiroyuki Ogata
- article
- Microbes and environments / JSME, 2018, 33 (2), pp.162-171. ⟨10.1264/jsme2.me17203⟩
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- titre
- The Ocean Gene Atlas: exploring the biogeography of plankton genes online
- auteur
- Emilie Villar, Thomas Vannier, Caroline Vernette, Magali Lescot, Miguelangel Cuenca, Aurélien Alexandre, Paul Bachelerie, Thomas Rosnet, Eric Pelletier, Shinichi Sunagawa, Pascal Hingamp
- article
- Nucleic Acids Research, 2018, 46 (W1), pp.gky376. ⟨10.1093/nar/gky376⟩
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Conference papers
- titre
- Role of microorganisms in marine mercury cycling: current knowledge and future directions
- auteur
- Andrea Garcia Bravo, Claudia Cosio, Léa Cabrol, Benjamin Misson, Cynthia Gilmour, Marisol Goñi, Remy Guyoneaud, Marianne Quemeneur, Lars-Eric Heimbürger-Boavida, Silvia G Acinas, Alexandre J. Poulain
- article
- MISTRALS Contamination & Pollution workshop, Nov 2018, Marseille, France
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- titre
- Climate change and the evolutionary challenge of Mediterranean biodiversity
- auteur
- Bruno Fady, Marc Bally, Alberte Bondeau, Francois Carlotti, Anne Chenuil, Wolfgang Cramer, J.P. Féral, Thierry Gauquelin, Anne-Christine Monnet, Séverine Thomas, France van Wambeke, D. Aurelle
- article
- ESEB 2018 Evolution conference Montpellier, Aug 2018, Montpellier, France. ⟨10.13140/RG.2.2.35257.62565⟩
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Book sections
- titre
- Importance of Prokaryotes in the Functioning and Evolution of the Present and Past Geosphere and Biosphere
- auteur
- Bernard Ollivier, Nina Zeyen, Grégoire Galès, Keyron Hickman-Lewis, Frédéric Gaboyer, Karim Benzerara, Frances Westall
- article
- Prokaryotes and Evolution, Springer International Publishing, pp.57-129, 2018, 978-3-319-99782-7. ⟨10.1007/978-3-319-99784-1_3⟩
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- titre
- Evolutionary success of prokaryotes
- auteur
- J.C. Bertrand, P. Bonin, Bernard Ollivier, K. Alain, A. Godfroy, Nathalie Pradel, P. Normand
- article
- Bertrand, J.C. (ed.); Normand, P. (ed.); Ollivier, Bernard (ed.); Sime-Ngando, T. (ed.). Prokaryotes and evolution, Springer, pp.131-240, 2018, 978-3-319-99782-7. ⟨10.1007/978-3-319-99784-1_4⟩
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- titre
- The evolution of living beings started with prokaryotes and in interaction with prokaryotes
- auteur
- T. Sime-Ngando, J.C. Bertrand, Didier Bogusz, J.F. Brugère, Claudine Franche, Marie-Laure Fardeau, Emilie Froussart, Anne Geiger, Maria Soledad Goñi Urriza, Bernard Ollivier, P. O'Toole
- article
- Bertrand, J.C. (ed.); Normand, P. (ed.); Ollivier, Bernard (ed.); Sime-Ngando (ed.). Prokaryotes and evolution, Springer, p. 241-338, 2018, 978-3-319-99782-7
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-
-
- titre
- Recherche à long terme, outils et formations pour structurer la recherche
- auteur
- Suzie Beaurune, Veronique Berteaux-Lecellier, Isabelle C. Biegala
- article
- Livre blanc de la recherche en appui au développement de la province des îles Loyauté, , 2018
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-
- titre
- Gestion de l'environnement
- auteur
- Abdelghani Moulay, Veronique Berteaux-Lecellier, Isabelle C. Biegala, Philippe Birnbaum, Fabrice Colin
- article
- Livre blanc de la recherche, en appui au développement de la province des îles Loyauté : synthèses issues du séminaire « Quelles recherches pour le développement en province des îles Loyauté ? » organisé à Lifou (11 au 13 octobre 2017), 2018
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-
- titre
- Prokaryote/eukaryote dichotomy and bacteria/archaea/eukarya domains : two inseparable concepts
- auteur
- Jean-Claude Bertrand, Pierre Caumette, P. Normand, Bernard Ollivier, T. Sime-Ngando
- article
- Bertrand, J.C. (ed.); Normand, P. (ed.); Ollivier, Bernard (ed.); Sime-Ngando, T. (ed.). Prokaryotes and evolution, Springer, p. 1-21, 2018, 978-3-319-99782-7. ⟨10.1007/978-3-319-99784-1_1⟩
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Books
- titre
- Prokaryotes and evolution
- auteur
- J.C. Bertrand, P. Normand, Bernard Ollivier, T. Sime Ngando
- article
- Springer, 396 p., 2018, 978-3-319-99782-7. ⟨10.1007/978-3-319-99784-1⟩
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-
Poster communications
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- titre
- Climate change and the evolutionary challenge of Mediterranean biodiversity
- auteur
- Bruno Fady, Alberte Bondeau, Marc Bally, Wolfgang Cramer, Thierry Gauquelin, Jean-Pierre Féral, Anne-Christine Monnet, Séverine Thomas, France van Wambeke, Anne Chenuil, Didier Aurelle
- article
- 2. Joint Congress on Evolutionary Biology (EVOLUTION 2018), Aug 2018, Montpellier, France. 2018
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2017
Journal articles
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- titre
- Genome Sequence of Piezophilic Bacterium Desulfovibrio profundus Strain 500-1, Isolated from a Deep Sediment Layer in the Japan Sea
- auteur
- Stéphanie Fouteau, Thomas Guerin, Ghislaine Magdelenat, Marie Roumagnac, Manon Bartoli, Bernard Ollivier, Alain Dolla, Valérie Barbe, Nathalie Pradel
- article
- Genome Announcements, 2017, 5 (44), ⟨10.1128/genomeA.01181-17⟩
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- titre
- Desulfovibrio senegalensis sp. nov., a mesophilic sulfate reducer isolated from marine sediment
- auteur
- Abdoulaye Thioye, Zouhaier Ben Ali Gam, Malick Mbengue, Jean-Luc Cayol, Manon Bartoli, Coumba Touré-Kane, Marc Labat
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2017, 67 (9), pp.3162 - 3166. ⟨10.1099/ijsem.0.001997⟩
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- titre
- Microbial Diversity in Sulfate-Reducing Marine Sediment Enrichment Cultures Associated with Anaerobic Biotransformation of Coastal Stockpiled Phosphogypsum (Sfax, Tunisia)
- auteur
- Hana Zouch, Fatma Karray, Fabrice Armougom, Sandrine Chifflet, Agnès Hirschler-Réa, Hanen Kharrat, Lotfi Kamoun, Wajdi Ben Hania, Bernard Ollivier, Sami Sayadi, Marianne Quéméneur
- article
- Frontiers in Microbiology, 2017, 8, pp.1583 ⟨10.3389/fmicb.2017.01583⟩
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- titre
- Viral to metazoan marine plankton nucleotide sequences from the Tara Oceans expedition
- auteur
- Adriana A. Alberti, Julie Poulain, Stefan Engelen, Karine Labadie, Sarah Romac, Isabel Ferrera, Guillaume Albini, Jean-Marc Aury, Caroline Belser, Alexis Bertrand, Corinne Cruaud, Corinne da Silva, Carole Dossat, Frédérick F. Gavory, Shahinaz Gas, Guy Guy, Maud Haquelle, E'Krame Jacoby, Olivier Jaillon, Arnaud Lemainque, Eric Pelletier, Gaëlle Samson, Mark Wessner, Pascal Bazire, Odette Beluche, Laurie Bertrand, Marielle Besnard-Gonnet, Isabelle Bordelais, Magali Boutard, Maria Dubois, Corinne Dumont, Evelyne Ettedgui, Patricia Fernandez, Espérance Garcia, Nathalie Aiach, Thomas Guerin, Chadia Hamon, Élodie Brun, Sandrine Lebled, Patricia Lenoble, Claudine Louesse, Eric Mahieu, Barbara Mairey, Nathalie Martins, Catherine Megret, Claire Milani, Jacqueline Muanga, Céline Orvain, Emilie Payen, Peggy Perroud, Emmanuel Petit, Dominique Robert, Murielle Ronsin, Benoit Vacherie, Silvia G. Acinas, Marta Royo-Llonch, Francisco Cornejo-Castillo, Ramiro Logares, Beatriz Fernández-Gómez, Chris Bowler, Guy Cochrane, Clara Amid, Petra Ten Hoopen, Colomban de Vargas, Nigel Grimsley, Elodie Desgranges, Stefanie Kandels-Lewis, Hiroyuki Ogata, Nicole Poulton, Michael E. Sieracki, Ramunas Stepanauskas, Matthew Sullivan, Jennifer Brum, Melissa Duhaime, Bonnie Poulos, Bonnie Hurwitz, Peer Bork, Emmanuel Boss, Michael Follows, Gabriel Gorsky, Pascal Hingamp, Daniele Iudicone, Lee Karp-Boss, Eric Karsenti, Fabrice Not, Stéphane Pesant, Jeroen Raes, Christian Sardet, Sabrina Speich, Lars Stemmann, Shinichi Sunagawa, Patrick Wincker
- article
- Scientific Data , 2017, 4, ⟨10.1038/sdata.2017.93⟩
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- titre
- Monitoring photo-oxidative and salinity-induced bacterial stress in the Canadian Arctic using specific lipid tracers
- auteur
- Remi Amiraux, Simon Belt, Frederic Vaultier, Virginie Galindo, Michel Gosselin, Patricia Bonin, Jean-Francois Rontani
- article
- Marine Chemistry, 2017, 194, pp.89-99. ⟨10.1016/j.marchem.2017.05.006⟩
- Accès au bibtex
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- titre
- Rapid Characterization of Microcystin-Producing Cyanobacteria in Freshwater Lakes by TSA-FISH (Tyramid Signal Amplification-Fluorescent In Situ Hybridization)
- auteur
- Luc Brient, Nihel Ben Gamra, Marine Periot, Marie Roumagnac, Perrine Zeller, Myriam Bormans, Annick Mejean, Olivier Ploux, Isabelle C. Biegala
- article
- Frontiers in Environmental Science, 2017, 5, pp.43. ⟨10.3389/fenvs.2017.00043⟩
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- titre
- Regional and local environmental conditions do not shape the response to warming of a marine habitat-forming species
- auteur
- Carolina Crisci, J. -B. Ledoux, K. Mokhtar-Jamai, Marc Bally, N. Bensoussan, D. Aurelle, E. Cebrian, R. Coma, Jean-Pierre Féral, Marie La Riviere, C. Linares, P. Lopez-Sendino, C. Marschal, M. Ribes, N. Teixido, Frederic Zuberer, J. Garrabou
- article
- Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.5069. ⟨10.1038/s41598-017-05220-4⟩
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- titre
- Comparative Genomics of Chrysochromulina Ericina Virus and Other Microalga-Infecting Large DNA Viruses Highlights Their Intricate Evolutionary Relationship with the Established Mimiviridae Family
- auteur
- Lucie Gallot-Lavallée, Guillaume Blanc, Jean-Michel Claverie
- article
- Journal of Virology, 2017, 91 (14), pp.230 - 247. ⟨10.1128/JVI.00230-17⟩
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- titre
- Transfer of Pseudomonas pictorum Gray and Thornton 1928 to genus Stenotrophomonas as Stenotrophomonas pictorum comb. nov., and emended description of the genus Stenotrophomonas
- auteur
- Aboubakar Sidiki Ouattara, Jean Le Mer, Manon Joseph, Hervé Macarie
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2017, 67 (6), pp.1894 - 1900. ⟨10.1099/ijsem.0.001880⟩
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- titre
- Specificity Re-evaluation of Oligonucleotide Probes for the Detection of Marine Picoplankton by Tyramide Signal Amplification-Fluorescent In Situ Hybridization
- auteur
- Virginie Riou, Marine Periot, Isabelle C. Biegala
- article
- Frontiers in Microbiology, 2017, 8, pp.854 ⟨10.3389/fmicb.2017.00854⟩
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- titre
- Characterization of recombinant Trypanosoma brucei gambiense Translationally Controlled Tumor Protein (r Tbg TCTP) and its interaction with Glossina midgut bacteria
- auteur
- Géraldine Bossard, Manon Bartoli, Marie-Laure Fardeau, Philippe P. Holzmuller, Bernard Ollivier, Anne Geiger
- article
- Gut microbes, 2017, 8 (5), pp.413 - 427. ⟨10.1080/19490976.2017.1331833⟩
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- titre
- Desulfobulbus aggregans sp. nov., a Novel Sulfate Reducing Bacterium Isolated from Marine Sediment from the Gulf of Gabes
- auteur
- Hanen Kharrat, Fatma Karray, Manon Bartoli, Wajdi Ben Hania, Najla Mhiri, Marie-Laure Fardeau, Feten Bennour, Lotfi Kamoun, Didier Alazard, Sami Sayadi
- article
- Current Microbiology, 2017, 74 (4), pp.449 - 454. ⟨10.1007/s00284-017-1211-4⟩
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- titre
- Physiological and transcriptional approaches reveal connection between nitrogen and manganese cycles in Shewanella algae C6G3
- auteur
- Axel Aigle, Patricia Bonin, Chantal Iobbi-Nivol, Vincent Méjean, Valerie Michotey
- article
- Scientific Reports, 2017, Scientific Reports 7, 7, ⟨10.1038/srep44725⟩
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- titre
- Environmental Viral Genomes Shed New Light on Virus-Host Interactions in the Ocean
- auteur
- Yosuke Nishimura, Hiroyasu Watai, Takashi Honda, Tomoko Mihara, Kimiho Omae, Simon Roux, Romain Blanc-Mathieu, Keigo Yamamoto, Pascal Hingamp, Yoshihiko Sako, Matthew Sullivan, Susumu Goto, Hiroyuki Ogata, Takashi Yoshida
- article
- MSphere, 2017, 2 (2), ⟨10.1128/mSphere.00359-16⟩
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- titre
- Characterization of the first cultured representative of a Bacteroidetes clade specialized on the scavenging of cyanobacteria
- auteur
- Wajdi Ben Hania, Manon Bartoli, Boyke Bunk, Cathrin Sproer, Hans-Peter Klenk, Marie-Laure Fardeau, Stefan Spring
- article
- Environmental Microbiology, 2017, 19 (3), pp.1134 - 1148. ⟨10.1111/1462-2920.13639⟩
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- titre
- Complete mitochondrial genome sequence of the freshwater diatom Asterionella formosa
- auteur
- Adrien Villain, Mila Kojadinovic, Carine Puppo, Laura Prioretti, Pierre Hubert, Gérald Grégori, Alain Roulet, Céline Roques, Jean-Michel Claverie, Brigitte Gontero, Guillaume Blanc, Yizhi Zhang
- article
- Mitochondrial DNA Part B Resources, 2017, 2 (1), pp.97 - 98. ⟨10.1080/23802359.2017.1285210⟩
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- titre
- Inhibitory effects of sodium azide on microbial growth in experimental resuspension of marine sediment
- auteur
- Léa Cabrol, Marianne Quemeneur, Benjamin Misson
- article
- Journal of Microbiological Methods, 2017, 133, pp.62 - 65. ⟨10.1016/j.mimet.2016.12.021⟩
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- titre
- Mineralizing Filamentous Bacteria from the Prony Bay Hydrothermal Field Give New Insights into the Functioning of Serpentinization-Based Subseafloor Ecosystems
- auteur
- Céline E Pisapia, Emmanuelle E Gérard, Martine Gérard, Léna Lecourt, Susan Q. Lang, Bernard E Pelletier, Claude Payri, Christophe Monnin, Linda Guentas, Anne Postec, Marianne Q Quéméneur, Gaël Erauso, Bénédicte Ménez
- article
- Frontiers in Microbiology, 2017, 8, pp.57. ⟨10.3389/fmicb.2017.00057⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
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- titre
- Stacked search for time shifted high energy neutrinos from gamma ray bursts with the Antares neutrino telescope
- auteur
- S. Adrián-Martínez, A. Albert, M. Andre, M. Anghinolfi, G. Anton, M. Ardid, J. Aubert, B. Baret, J. Barrios-Marti, S. Basa, V. Bertin, S. Biagi, R. Bormuth, C. Bouwhuis, R. Bruijn, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, J. Carr, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, I. Dekeyser, A. Deschamps, G. de Bonis, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, D. Drouhin, A. Dumas, T. Eberl, D. Elsässer, A. Enzenhöfer, K. Fehn, I. Felis, P. Fermani, F. Folger, A. Fusco, S. Galatà, P. Gay, S. Geisselsöder, K. Geyer, V. Giordano, A. Gleixner, R. Gracia-Ruiz, K. Graf, S. Hallmann, H. van Haren, J. Heijboer, Y. Hello, J. Hernández-Rey, J. Hössl, J. Hofestädt, C. Hugon, C. James, M. de Jong, M. Kadler, O. Kalekin, U. Katz, D. Kiessling, P. Kooijman, A. Kouchner, M. Kreter, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, Dominique Lefèvre, E. Leonora, S. Loucatos, M. Marcelin, A. Margiotta, A. Marinelli, J. Martínez-Mora, A. Mathieu, T. Michael, P. Migliozzi, A. Moussa, C. Müller, E. Nezri, E. Păvălaş, C. Pellegrino, C. Perrina, P. Piattelli, V. Popa, T. Pradier, C. Racca, G. Riccobene, R. Richter, K. Roensch, M. Saldaña, D. Samtleben, A. Sanchez-Losa, M. Sanguineti, P. Sapienza, J. Schmid, J. Schnabel, F. Schüssler, T. Seitz, C. Sieger, M. Spurio, J. Steijger, Th. Stolarczyk, M. Taiuti, Christian Tamburini, A. Trovato, M. Tselengidou, C. Tönnis, B. Vallage, C. Vallee, V. van Elewyck, E. Visser, D. Vivolo, S. Wagner, J. Wilms, J. Zornoza, J. Zúñiga
- article
- European Physical Journal C: Particles and Fields, 2017, C77 (1), pp.20. ⟨10.1140/epjc/s10052-016-4496-8⟩
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-
-
- titre
- A Glimpse of Nucleo-Cytoplasmic Large DNA Virus Biodiversity through the Eukaryotic Genomics Window
- auteur
- Lucie Gallot-Lavallée, Guillaume Blanc
- article
- Viruses, 2017, 9 (1), ⟨10.3390/v9010017⟩
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-
-
- titre
- Objection to the proposition of the new genus Abyssivirga
- auteur
- Anne Postec, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2017, 67 (1), pp.174. ⟨10.1099/ijsem.0.001601⟩
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-
- titre
- Defluviitalea
- auteur
- Marie Laure Fardeau, Anne Postec, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2017, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01386⟩
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-
-
- titre
- Defluviitaleaceae
- auteur
- Marie-Laure Fardeau, Anne Postec, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2017, ⟨10.1002/9781118960608.fbm00280⟩
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-
- titre
- Desulfonatronum parangueonense sp. nov., a sulfate-reducing bacterium isolated from sediment of an alkaline crater lake
- auteur
- M.F. Pérez Bernal, Elcia Margareth Souza Brito, Manon Bartoli, Johanne Aubé, Marie-Laure Fardeau, G.C. Rodriguez, B. Ollivier, Remy Guyoneaud, Agnès Hirschler-Réa
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2017, 67 (12), pp.4999-5005. ⟨10.1099/ijsem.0.002399⟩
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-
-
- titre
- Deep sediment resuspension and thick nepheloid layer generation by open-ocean convection
- auteur
- Xavier Durrieu de Madron, S. Ramondenc, L. Berline, Loïc Houpert, Anthony Bosse, S. Martini, L. Guidi, Pascal Conan, C. Curtil, N. Delsaut, S. Kunesch, J.F. Ghiglione, Patrick Marsaleix, M. Pujo-Pay, T. Séverin, Pierre Testor, Christian Tamburini
- article
- J.Geophys.Res.Oceans, 2017, 122 (3), pp.2291-2318. ⟨10.1002/2016jc012062⟩
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-
Conference papers
- titre
- Assessment of oil weathering and impact in mangrove ecosystem: PRISME Experiment.
- auteur
- Ronan Jézéquel, Karine Duboscq, Léa Sylvi, Emma Michaud, Lise Millera Ferriz, Enora Roic, Robert Duran, Cristiana Cravo-Laureau, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Franck Gilbert, Marc Tedetti, Cécile Militon, Philippe Cuny
- article
- International Oil Spill Conference Proceedings 2017, May 2017, Long Beach, United States. pp.634-656, ⟨10.7901/2169-3358-2017.1.634⟩
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-
Book sections
- titre
- Protocols for Subtidal and Deep-Sea Benthic Oil Spill Simulations
- auteur
- Philippe Cuny, Vincent Grossi, Cécile Militon, Christian Tamburini, Georges Stora, Franck Gilbert
- article
- McGenity, Terry J., Timmis, Kenneth N., Nogales Fernández, Balbina. Hydrocarbon and Lipid Microbiology Protocols. Meso- and Microcosms, , pp.91-102, 2017, 978-3-662-53108-2
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-
Other publications
-
- titre
- Specificity re-evaluation of oligonucleotidic probes for the detection of marine picoplankton by Tyramide Signal Amplification-Fluorescent in situ Hybridization
- auteur
- Riou Virginie, Périot Marine, Isabelle C Biegala
- article
- 2017
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-
2016
Journal articles
- titre
- Hydrogen production by the hyperthermophilic bacterium Thermotoga maritima Part II: modeling and experimental approaches for hydrogen production
- auteur
- Richard Auria, Céline Boileau, Sylvain Davidson, Laurence Casalot, Pierre Christen, Pierre-Pol Liebgott, Yannick Combet-Blanc
- article
- Biotechnology for Biofuels, 2016, 9 (1), pp.268. ⟨10.1186/s13068-016-0681-0⟩
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-
-
- titre
- Impact of an intense water column mixing (0-1500 m) on prokaryotic diversity and activities during an open-ocean convection event in the NW Mediterranean Sea
- auteur
- Tatiana Severin, Caroline Sauret, Mehdi Boutrif, Thomas Duhaut, Fayçal Kessouri, Louise Oriol, Jocelyne Caparros, Mireille Pujo-Pay, Xavier Durrieu de Madron, Marc Garel, Christian Tamburini, Pascal Conan, Jean-François Ghiglione
- article
- Environmental Microbiology, 2016, 18 (12), pp.4378 - 4390. ⟨10.1111/1462-2920.13324⟩
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-
-
- titre
- Hydrogen production by the hyperthermophilic bacterium Thermotoga maritima part I: effects of sulfured nutriments, with thiosulfate as model, on hydrogen production and growth
- auteur
- Celine Boileau, Richard Auria, Sylvain Davidson, Laurence Casalot, Pierre Christen, Pierre-Pol Liebgott, Yannick Combet-Blanc
- article
- Biotechnology for Biofuels, 2016, 9, ⟨10.1186/s13068-016-0678-8⟩
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-
- titre
- The chimeric nature of the genomes of marine magnetotactic coccoid-ovoid bacteria defines a novel group of Proteobacteria.
- auteur
- Boyang Ji, Sheng-Da Zhang, Wei-Jia Zhang, Zoe Rouy, François Alberto, Claire-Lise Santini, Sophie Mangenot, Séverine Gagnot, Nadège Philippe, Nathalie Pradel, Lichen Zhang, Sébastien Tempel, Ying Li, Claudine Médigue, Bernard Henrissat, Pedro M Coutinho, Valérie Barbe, Emmanuel Talla, Long-Fei Wu
- article
- Environmental Microbiology, 2016, pp.doi: 10.1111/1462-2920.13637. ⟨10.1111/1462-2920.13637⟩
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-
- titre
- Desulfotomaculum aquiferis sp nov and Desulfotomaculum profundi sp nov., isolated from a deep natural gas storage aquifer
- auteur
- Sabrina Berlendis, Magali Ranchou-Peyruse, Marie-Laure Fardeau, Jean-Francois Lascourreges, Manon Joseph, Bernard Ollivier, Thomas Auello, David Dequidt, Michel Magot, Anthony Ranchou-Peyruse
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 66 (11), pp.4329-4338. ⟨10.1099/ijsem.0.001352⟩
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-
- titre
- Serpentinicella alkaliphila gen. nov., sp. nov., a novel alkaliphilic anaerobic bacterium isolated from the serpentinite-hosted Prony hydrothermal field, New Caledonia.
- auteur
- Nan Mei, Anne Postec, Gaël Erauso, Manon Bartoli, Bernard Pelletier, Claude Payri, Bernard Ollivier, Marianne Quemeneur
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 66 (11), pp.4464-4470. ⟨10.1099/ijsem.0.001375⟩
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-
- titre
- Balneicella halophila gen. nov., sp nov., an anaerobic bacterium, isolated from a thermal spring and description of Balneicellaceae fam. nov.
- auteur
- Khaled Fadhlaoui, Wajdi Ben Hania, Anne Postec, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 66 (11), pp.4692-4696. ⟨10.1099/ijsem.0.001412⟩
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-
- titre
- Fluorescence insitu hybridization of Microcystis strains producing microcystin using specific mRNA probes
- auteur
- P. Zeller, A. Mejean, Isabelle C. Biegala, V. Contremoulins, O. Ploux
- article
- Letters in Applied Microbiology, 2016, 63 (5), pp.376-383. ⟨10.1111/lam.12634⟩
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-
- titre
- The impact of long-term hydrocarbon exposure on the structure, activity, and biogeochemical functioning of microbial mats
- auteur
- Johanne Aubé, Pavel Senin, Olivier Pringault, Patricia Bonin, Bruno Deflandre, Olivier Bouchez, Noëlle Bru, Edurne Biritxinaga-Etchart, Christophe C. Klopp, Remy Guyoneaud, Marisol Goñi
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2016, 111 (1-2), pp.115-125. ⟨10.1016/j.marpolbul.2016.07.023⟩
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-
- titre
- Bacteria as part of bioluminescence emission at the deep ANTARES station (North-Western Mediterranean Sea) during a one-year survey
- auteur
- Severine Martini, Valerie Michotey, Laurie Casalot, Patricia Bonin, Sophie Guasco, Marc Garel, Christian Tamburini
- article
- Deep Sea Research, 2016, 116, pp.33-40. ⟨10.1016/j.dsr.2016.07.014⟩
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-
- titre
- Localization of endobacteria in the gastrodermis of a Mediterranean gorgonian coral, Paramuricea clavata, using fluorescence in situ hybridization
- auteur
- Marie La Rivière, Marc Garel, Marc Bally
- article
- Marine Biology, 2016, 163, ⟨10.1007/s00227-016-2975-y⟩
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-
- titre
- Denitrification activity in mangrove sediments varies with associated vegetation
- auteur
- Sheryl Oliveira Fernandes, Pinky Dutta, Maria-Judith Gonsalves, Patricia Bonin, P. A. Lokabharathi
- article
- Ecological Engineering, 2016, 95, pp.671-681. ⟨10.1016/j.ecoleng.2016.06.102⟩
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-
- titre
- Metatranscriptomes of oil-contaminated marine coastal sediment affected by oil addition and/or by the bioturbating activity of the marine polychaete Hediste diversicolor: Who are the microbial players?
- auteur
- Cécile Militon, Alexandre Atkinson, Valerie Michotey, Celine Jeziorski, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran, Patricia Bonin, Philippe Cuny
- article
- Marine Genomics, 2016, 29, pp.55-59. ⟨10.1016/j.margen.2016.06.006⟩
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-
- titre
- Coupling of bacterial nitrification with denitrification and anammox supports N removal in intertidal sediments (Arcachon Bay, France)
- auteur
- Sheryl Fernandes, Cedric Javanaud, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Pierre Anschutz, Patricia Bonin
- article
- Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2016, 179, pp.39-50. ⟨10.1016/j.ecss.2015.10.009⟩
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-
-
- titre
- Neuron-Like Networks Between Ribosomal Proteins Within the Ribosome
- auteur
- Olivier Poirot, Y. Timsit
- article
- Scientific Reports, 2016, 6 (1), ⟨10.1038/srep26485⟩
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-
- titre
- Deciphering the adaptation strategies of Desulfovibrio piezophilus to hydrostatic pressure through metabolic and transcriptional analyses.
- auteur
- Amira Amrani, Jacques van Helden, Aurélie Bergon, Aicha Aouane, Wajdi Ben Hania, Christian Tamburini, Béatrice Loriod, Jean Imbert, Bernard Ollivier, Nathalie Pradel, Alain Dolla
- article
- Environmental Microbiology Reports, 2016, 8 (4), pp.520-6. ⟨10.1111/1758-2229.12427⟩
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-
- titre
- Genomic and physiological analysis reveals versatile metabolic capacity of deep-sea Photobacterium phosphoreum ANT-2200.
- auteur
- Sheng-Da Zhang, Claire-Lise Santini, Wei-Jia Zhang, Valérie Barbe, Sophie Mangenot, Charlotte Guyomar, Marc Garel, Hai-Tao Chen, Xue-Gong Li, Qun-Jian Yin, Yuan Zhao, J. Armengaud, Jean-Charles Gaillard, Severine Martini, Nathalie Pradel, Claude Vidaud, François Alberto, Claudine Médigue, Christian Tamburini, Long-Fei Wu
- article
- Extremophiles life under extreme conditions, 2016, 20 (3), pp.301-10. ⟨10.1007/s00792-016-0822-1⟩
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-
- titre
- Novel serine keratinase from Caldicoprobacter algeriensis exhibiting outstanding hide dehairing abilities.
- auteur
- Khelifa Bouacem, Amel Bouanane-Darenfed, Nadia Zaraî Jaouadi, Manon Bartoli, Hocine Hacene, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau, Samir Bejar, Bassem Jaouadi
- article
- International Journal of Biological Macromolecules, 2016, 86, pp.321-8. ⟨10.1016/j.ijbiomac.2016.01.074⟩
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-
- titre
- Novel species and expanded distribution of ellipsoidal multicellular magnetotactic prokaryotes
- auteur
- Yi-Ran Chen, Wen-Yan Zhang, Ke Zhou, Hong-Miao Pan, Hai-Jian Du, Cong Xu, Jian-Hong Xu, Nathalie Pradel, Claire-Lise Santini, Jin-Hua Li, Hui Huang, Yong-Xin Pan, Tian Xiao, Long-Fei Wu
- article
- Environmental Microbiology Reports, 2016, 8 (2), pp.218--226. ⟨10.1111/1758-2229.12371⟩
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-
- titre
- Oil removal and effects of spilled oil on active microbial communities in close to salt-saturation brines.
- auteur
- Yannick Corsellis, Marc M Krasovec, Lea Sylvi, Philippe Cuny, Cécile Militon
- article
- Extremophiles, 2016, pp.26955981. ⟨10.1007/s00792-016-0818-x⟩
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-
-
- titre
- Preservation of ancestral Cretaceous microflora recovered from a hypersaline oil reservoir
- auteur
- Gregoire Gales, Nicolas Tsesmetzis, Isabel Neria, Didier Alazard, Stéphanie Coulon, Bart P. Lomans, Dominique Morin, Bernard Ollivier, Jean Borgomano, Catherine Joulian
- article
- Scientific Reports, 2016, 6, ⟨10.1038/srep22960⟩
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-
- titre
- Reclassification of Anaerobaculum mobile, Anaerobaculum thermoterrenum, Anaerobaculum hydrogeniformans as Acetomicrobium mobile comb. nov., Acetomicrobium thermoterrenum comb. nov and Acetomicrobium hydrogeniformans comb. nov., respectively, and emendation of the genus Acetomicrobium
- auteur
- Wajdi Ben Hania, Amel Bouanane-Darenfed, Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 66, pp.1506-1509. ⟨10.1099/ijsem.0.000910⟩
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-
- titre
- Analysis of a population of magnetotactic bacteria of the Gulf of Gabes, Tunisia
- auteur
- Nathalie Pradel, Jean-Luc Cayol, Marie-Laure Fardeau, Fatma Karray, Sami Sayadi, Didier Alazard, Bernard Ollivier
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2016, 23 (5), pp.4046-4053. ⟨10.1007/s11356-015-4314-0⟩
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-
- titre
- Prokaryotic diversity in a Tunisian hypersaline lake, Chott El Jerid
- auteur
- Manel Ben Abdallah, Fatma Karray, Najla Mhiri, Nan Mei, Marianne Quemeneur, Jean-Luc Cayol, Gaël Erauso, Jean-Luc Tholozan, Didier Alazard, Sami Sayadi
- article
- Extremophiles, 2016, 20 (2), pp.125-138. ⟨10.1007/s00792-015-0805-7⟩
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-
- titre
- Mobilisporobacter senegalensis gen. nov., sp nov., an anaerobic bacterium isolated from tropical shea cake
- auteur
- Malick Mbengue, Abdoulaye Thioye, Marc Labat, Laurie Casalot, Manon Bartoli, Abdoulaye Samb, Zouhaier Ben Ali Gam
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 66, pp.1383-1388. ⟨10.1099/ijsem.0.000889⟩
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-
-
- titre
- Plankton networks driving carbon export in the oligotrophic ocean
- auteur
- Lionel Guidi, Samuel Chaffron, Lucie Bittner, Damien Eveillard, Abdelhalim Larhlimi, Simon Roux, Youssef Darzi, Stéphane Audic, L. Berline, Jennifer R. Brum, Luis Pedro Coelho, Julio Cesar Ignacio Espinoza, Shruti Malviya, Shinichi Sunagawa, Céline Dimier, Stefanie Kandels-Lewis, Marc Picheral, Julie Poulain, Sarah Searson, Lars Stemmann, Fabrice Not, Pascal Hingamp, Sabrina Speich, Mick Follows, Lee Karp-Boss, Emmanuel Boss, Hiroyuki Ogata, Stephane Pesant, Jean Weissenbach, Patrick Wincker, Silvia G. Acinas, Peer Bork, Daniele Iudicone, Matthew B. Sullivan, Jeroen Raes, Eric Karsenti, Chris Bowler, Gabriel Gorsky
- article
- Nature, 2016, 532, pp.465-470. ⟨10.1038/nature16942⟩
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-
- titre
- Optical and X-ray early follow-up of ANTARES neutrino alerts
- auteur
- S. Adrián-Martínez, M. Ageron, A. Albert, Imen Al Samarai, M. André, G. Anton, M. Ardid, J. -J. Aubert, B. Baret, J. Barrios-Marti, S. Basa, V. Bertin, S. Biagi, C. Bogazzi, R. Bormuth, M. Bou-Cabo, M. C. Bouwhuis, R. Bruijnk, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, J. Carr, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, I. Dekeyser, Anne Deschamps, G. de Bonis, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, D. Drouhin, Alexis Dumas, T. Eberl, D. Elsasser, A. Enzenhöfer, K. Fehn, I. Feis, P. Fermani, F. Folger, L. A. Fusco, S. Galatà, P. Gay, S. Geisselsoder, K. Geyer, V. Giordano, A. Gleixner, R. Gracia-Ruiz, K. Graf, H. Van Haren, A. J. Heijboer, Y. Hello, J. J. Hernandez-Rey, A. Herrero, J. Hossl, J. Hofestadt, C. Hugon, C. W. James, M. de Jong, M. Kadler, O. Kalekin, U. Katz, D. Kiessling, P. Kooijman, A. Kouchner, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, G. Lambard, D. Lattuada, Dominique Lefèvre, E. Leonora, S. Loucatos, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J. A. Martinez-Mora, S. Martini, A. Mathieu, T. Michael, P. Piattelli, P. Migliozzi, A. Moussa, C. Mueller, M. Neff, E. Nezri, G. E. Pavalas, C. Pellegrino, C. Perrina, V. Popa, T. Pradier, C. Racca, G. Riccobene, R. Richter, K. Roensch, A. Rostovtsev, M. Saldana, D. F. E. Samtleben, M. Sanguinetiz, P. Sapienza, J. Schmid, J. Schnabel, S. Schulte, F. Schüssler, T. Seitz, C. Sieger, M. Spurio, J. J. M. Steijger, Th. Stolarczyk, A. Sanchez-Losa, M. Taiuti, Christian Tamburini, A. Trovato, M. Tselengidou, C. Tonnis, D. Turpin, B. Vallage, Corentin Vallée, V. van Elewyck, M. Vecchi, E. Visser, D. Vivolo, S. Wagner, J. Wilms, J. D. Zornoza, J. Zúñiga, A. Klotz, M. Boer, A. Le van Suu, C. Akerlof, W. Zheng, P. Evans, N. Gehrels, J. Kennea, J. P. Osborne, D. M. Coward, Antares Collaboration
- article
- Journal of Cosmology and Astroparticle Physics, 2016, 02 (2), pp.062. ⟨10.1088/1475-7516/2016/02/062⟩
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-
- titre
- Magnetotactic bacteria population in a pristine French Atlantic lagoon.
- auteur
- Nathalie Pradel, Maxime Fuduche, Bernard Ollivier
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2016, 23 (1), pp.691-7. ⟨10.1007/s11356-015-5322-9⟩
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-
- titre
- Thermanaeromonas burensis sp nov., a thermophilic anaerobe isolated from a subterranean clay environment
- auteur
- Zouhaier Ben Ali Gam, Sylvie Daumas, Laurie Casalot, Manon Bartoli, Sophia Necib, Yannick Linard, Marc Labatt
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 66, pp.445-449. ⟨10.1099/ijsem.0.000739⟩
- Accès au bibtex
-
-
- titre
- Metagenomic and PCR-Based Diversity Surveys of [FeFe]-Hydrogenases Combined with Isolation of Alkaliphilic Hydrogen-Producing Bacteria from the Serpentinite-Hosted Prony Hydrothermal Field, New Caledonia
- auteur
- Nan Mei, Anne R Postec, Christophe Monnin, Bernard R Pelletier, Claude Payri, Bénédicte R Ménez, Eléonore E Frouin, Bernard Ollivier, Gaël Erauso, Marianne Quéméneur
- article
- Frontiers in Microbiology, 2016, 7, pp.1301. ⟨10.3389/fmicb.2016.01301⟩
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-
-
- titre
- Genomic Insights into a new Citrobacter koseri strain revealed gene exchanges with the virulence-associated Yersinia pestis pPCP1 plasmid
- auteur
- Fabrice Armougom, Idir Bitam, Olivier Croce, Vicky Merhej, Lina Barassi, Ti-Thien Nguyen, Bernard La Scola, Didier Raoult
- article
- Frontiers in Microbiology, 2016, 7, pp.340. ⟨10.3389/fmicb.2016.00340⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Desulfotomaculum aquiferis sp. nov. and Desulfotomaculum profundi sp. nov., isolated from a deep natural gas storage aquifer
- auteur
- Sabrina Berlendis, Magali Ranchou-Peyruse, Marie-Laure Fardeau, Jean-François Lascourrèges, Manon Joseph, Bernard Ollivier, Thomas Aüllo, David Dequidt, Michel Magot, Anthony Ranchou-Peyruse
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 66, pp.4329 - 4338. ⟨10.1099/ijsem.0.001352⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bacterial community structure and functional arrA gene diversity associated with arsenic reduction and release in an industrially contaminated soil
- auteur
- Marianne Quéméneur, Françis Garrido, Patrick Billard, Dominique Breeze, Corinne Leyval, Michel Jauzein, Catherine Joulian
- article
- Geomicrobiology Journal, 2016, 33 (10), pp.839-849. ⟨10.1080/01490451.2015.1118167⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Molecular microbiology methods for environmental diagnosis
- auteur
- Théodore Bouchez, A. L. Blieux, Samuel S. Dequiedt, Isabelle Domaizon, Alexis Dufresne, Stephanie Ferreira, Jean-Jacques Godon, Jennifer Hellal, Catherine Joulian, Achim Quaiser, Fabrice Martin-Laurent, A. Mauffret, Jean-Michel Monier, P. Peyret, P. Schmitt-Koplin, Olivier Sibourg, E. d'Oiron, Antonio Bispo, I. Deportes, C. Grand, Philippe Cuny, Pierre-Alain Maron, Lionel Ranjard
- article
- Environmental Chemistry Letters, 2016, 14 (4), pp.423--441. ⟨10.1007/s10311-016-0581-3⟩
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-
-
- titre
- Importance of N2-Fixation on the Productivity at the North-Western Azores Current/Front System, and the Abundance of Diazotrophic Unicellular Cyanobacteria
- auteur
- Virginie Riou, Debany Fonseca-Batista, Arnout Roukaerts, Isabelle C. Biegala, Shree Ram Prakya, Clara Magalhães Loureiro, Mariana Santos, Angel Muniz-Piniella, Mara Schmiing, Marc Elskens, Natacha Brion, M. Ana Martins, Frank Dehairs
- article
- PLoS ONE, 2016, 11 (3), pp.015082. ⟨10.1371/journal.pone.0150827⟩
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-
Conference papers
- titre
- Fate and Impact of Oil in Mangrove Ecosystem PRISME Experiment
- auteur
- Ronan Jézéquel, Karine Duboscq, Lea Sylvi, Emma Michaud, Lise Millera Ferriz, Robert Duran, Cristiana Cravo-Laureau, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Gilbert Franck, Marc Tedetti, Cécile Militon, Philippe Cuny
- article
- AMOP Technical Seminar, Environment and Climate Change Canada, Ottawa, ON, 2016., Jun 2016, Halifax, Canada
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- titre
- Microbiology of shallow subsurface aquifer and carbonate rocks studied by culture-dependent and culture-independent methods. Preliminary results on an underground laboratory, the LSBB, Rustrel, France
- auteur
- Gregoire Gales, Gaël Erauso, Jean-Luc Cayol, David Navarro, Daniel Boyer, Gilles Micolau
- article
- 6. International Conference on Inter-Disciplinary Underground Science and Technology (-DUST), Jun 2016, Avignon, France. pp.5, ⟨10.1051/e3sconf/20161205002⟩
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- titre
- Life in deep subsurface
- auteur
- Gregoire Gales, Gaël Erauso
- article
- I-DUST 2016 - INTER-DISCIPLINARY UNDERGROUND SCIENCE & TECHNOLOGY, 2016, Unknown, Unknown Region. ⟨10.1051/e3sconf/20161205001⟩
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Poster communications
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- titre
- Contribution of Chlorophyta and non-chlorophyta to the picoeukaryotic community in the Gulf of Gabès (Eastern Mediterranean Sea)
- auteur
- Amel Bellaaj, Mariem Borchani, Ismail Sabeur Hamza, Isabelle C. Biegala, Malika Bel
- article
- EMBL-16, Jan 2016, Heidelberg, Germany
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-
2015
Journal articles
- titre
- Evidence for host specificity among dominant bacterial symbionts in temperate gorgonian corals
- auteur
- Marie La Riviere, Joaquim Garrabou, Marc Bally
- article
- Coral Reefs, 2015, 34 (4), pp.1087. ⟨10.1007/s00338-015-1334-7⟩
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-
- titre
- Draft genome sequence of Mesotoga strain PhosAC3, a mesophilic member of the bacterial order Thermotogales, isolated from a digestor treating phosphogypsum in Tunisia
- auteur
- Wajdi Ben Hania, Khaled Fadhlaoui, Céline Brochier-Armanet, Cécile Persillon, Anne Postec, Moktar Hamdi, Alain Dolla, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau, Jean Le Mer, Gaël Erauso
- article
- Standards in Genomic Sciences, 2015, 10 (1), pp.12. ⟨10.1186/1944-3277-10-12⟩
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-
- titre
- Evidence for host specificity among dominant bacterial symbionts in temperate gorgonian corals
- auteur
- Marie La Rivière, Joaquim Garrabou, Marc Bally
- article
- Coral Reefs, 2015, 34 (4), pp.1087-1098. ⟨10.1007/s00338-015-1334-7⟩
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-
-
- titre
- Oil spill effects on macrofaunal communities and bioturbation of pristine marine sediments (Caleta Valdés, Patagonia, Argentina): experimental evidence of low resistance capacities of benthic systems without history of pollution
- auteur
- Agustina Ferrando, Emilia Gonzalez, Marcos Franco, Marta Commendatore, Marina Nievas, Cécile Militon, Georges Stora, Franck Gilbert, José Luis Esteves, Philippe Cuny
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, vol. 22 (n° 20), pp. 15294-15306. ⟨10.1007/s11356-015-4167-6⟩
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- titre
- Microbial ecology of hydrocarbon-polluted coastal sediments.
- auteur
- Robert Duran, Philippe Cuny, Patricia Bonin, Cristiana Cravo-Laureau
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15195 - 15199. ⟨10.1007/s11356-015-5373-y⟩
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- titre
- Crassaminicella profunda gen. nov., sp. nov., an anaerobic marine bacterium isolated from deep-sea sediments
- auteur
- Marie-Laure Fardeau, Raja Lakhal, Bernard Ollivier, Anne Godfroy, Anne R Postec, Jean-Luc Cayol, Grégoire Galès, Nathalie Pradel
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2015, 65 (9), pp.3097-3102. ⟨10.1099/ijsem.0.000386⟩
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-
- titre
- Dynamic of bacterial communities attached to lightened phytodetritus
- auteur
- Morgan Petit, Patricia Bonin, Remi Amiraux, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Joshua Armitano, Cécile Jourlin-Castelli, Frederic Vaultier, Vincent Méjean, Jean-Francois Rontani
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (18), pp.13681-92. ⟨10.1007/s11356-015-4209-0⟩
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-
-
- titre
- Environmental microbiology as a mosaic of explored ecosystems and issues
- auteur
- Denis Faure, Patricia Bonin, Robert Duran, Pierre Amato, Florence Arsene-Ploetze, Jean-Christophe Auguet, Bernard Legrand, Philippe N. Bertin, Yvan Bettarel, Aurélie Bigot-Clivot, Nicolas Blot, Manuel Blouin, Myriam Bormans, Marc Bouvy, O Bruneel, Aurélie Cébron, Urania Christaki, Ivan Couée, Cristiana Cravo-Laureau, Michael Danger, Julien de Lorgeril, Yves Desdevises, Yves Dessaux, D Destoumieux-Garzón, Élodie Duprat, Gaël Erauso, Feth El Zahar Haichar, Éric Fouilland, Andre-Jean Francez, Nathalie Fromin, Alain Geffard, Jean-François Ghiglione, Arnaud Huguet, Vincent Grossi, Katell Guizien, Ludwig Jardillier, Pascal Jouquet, Fabien Joux, Aurore Kaisermann, Oliver Kaltz, Jean-Christophe Lata, Antoine Lecerf, Corinne Leyval, Patricia Luis, Estelle Masseret, Audrey Niboyet, Philippe Normand, Frédéric Plewniak, Franck Poly, Soizic Prado, Achim Quaiser, Pascal Ratet, Agnès Richaume, Jean-Luc Rolland, Jean-Luc Rols, Jf Rontani, Francesca Rossi, Sophie Sablé, P Sivadon, Philippe Soudant, Christian Tamburini, Aline Tribollet, Claire Valiente Moro, France van Wambeke, Philippe Vandenkoornhuyse, Stéphane Vuilleumier, Philippe Vandenkoornhuyse
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (18), pp.13577-13598. ⟨10.1007/s11356-015-5164-5⟩
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-
-
- titre
- Microbial diversity in a submarine carbonate edifice from the serpentinizing hydrothermal system of the Prony Bay (New Caledonia) over a 6-year period
- auteur
- Anne Postec, Marianne Quéméneur, Méline Bes, Nan Mei, Fatma Ben Aissa-Fennira, Claude Payri, Bernard Pelletier, Christophe Monnin, Linda Guentas-Dombrowsky, Bernard Ollivier, Emmanuelle Gérard, Céline Pisapia, Martine Gérard, Bénédicte Ménez, Gaël Erauso
- article
- Frontiers in Microbiology, 2015, 6, pp.857. ⟨10.3389/fmicb.2015.00857⟩
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-
-
- titre
- Draft-genome sequence of Shewanella algae strain C6G3
- auteur
- Axel Aigle, Valerie Michotey, Patricia Bonin
- article
- Standards in Genomic Sciences, 2015, 43 (10), pp.10.1186/s40793-015-0022-0. ⟨10.1186/s40793-015-0022-0⟩
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-
- titre
- Ecological significance of Synergistetes in the biological treatment of tuna cooking wastewater by an anaerobic sequencing batch reactor.
- auteur
- Cécile Militon, Olfa Hamdi, Valerie Michotey, Marie-Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Hassib Bouallagui, Moktar Hamdi, Patricia Bonin
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, pp.2015 Jul 22. ⟨10.1007/s11356-015-4973-x⟩
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- titre
- Use of dispersant in mudflat oil-contaminated sediment: behavior and effects of dispersed oil on micro- and macrobenthos.
- auteur
- Philippe Cuny, Franck Gilbert, Cécile Militon, Georges Stora, Patricia Bonin, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Karine Duboscq, Christine Cagnon, Ronan Jézéquel, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15370-15376. ⟨10.1007/s11356-015-4800-4⟩
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-
- titre
- Acetoanaerobium pronyense sp. nov., an anaerobic alkaliphilic bacterium isolated from the Prony alkaline Hydrothermal Field in New Caledonia.
- auteur
- Meline Bes, Mériem Merrouch, Manon Bartoli, Marianne Quemeneur, Claude Payri, Bernard Pelletier, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau, Gaël Erauso, Anne Postec
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2015, pp.10.1099/ijs.0.000307. ⟨10.1099/ijs.0.000307⟩
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- titre
- Draft genome sequence of Mesotoga strain PhosAC3, a mesophilic member of the bacterial order Thermotogales, isolated from a digestor treating phosphogypsum in Tunisia
- auteur
- Wajdi Ben Hania, Khaled Fadhlaoui, Céline Brochier-Armanet, Cecile Persillon, Anne Postec, Moktar Hamdi, Alain Dolla, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau, Jean Le Mer, Gaël Erauso
- article
- Standards in Genomic Sciences, 2015, 10, ⟨10.1186/1944-3277-10-12⟩
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-
- titre
- Caldanaerobacter
- auteur
- Marie-Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Jean-Luc Cayol
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00745⟩
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-
- titre
- Halothermothrix
- auteur
- Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier, Jean-Louis Garcia
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00735⟩
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-
- titre
- Thermodesulfobacterium
- auteur
- Claude Hatchikian, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01267⟩
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-
- titre
- Aminobacterium
- auteur
- Sandra Baena, Jean-Louis Garcia, Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01253⟩
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-
- titre
- Mahella
- auteur
- M Bonillas-Salinas, Bernard Ollivier, Bkc Patel, Jean-Luc Cayol
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00758⟩
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-
- titre
- Aminomonas
- auteur
- Sandra Baena, Jean-Louis Garcia, Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01251⟩
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-
- titre
- Thermohalobacter
- auteur
- Jean-Luc Cayol, Jean-Louis Garcia, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00624⟩
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-
- titre
- Effect of physical sediments reworking on hydrocarbon degradation and bacterial community structure in marine coastal sediments.
- auteur
- Robert Duran, Patricia Bonin, Ronan Jezequel, Karine Dubosc, Claire Gassie, Fanny Terrisse, Justine Abella, Christine Cagnon, Cécile Militon, Valerie Michotey, Franck Gilbert, Philippe Cuny, Cristiana Cravo-Laureau
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15248-15259. ⟨10.1007/s11356-015-4373-2⟩
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-
- titre
- Growth of the Obligate Anaerobe Desulfovibrio vulgaris Hildenborough under Continuous Low Oxygen Concentration Sparging: Impact of the Membrane-Bound Oxygen Reductases
- auteur
- Fanny Ramel, Gael Brasseur, Laetitia Pieulle, Odile Valette, Agnès Hirschler-Réa, Marie Laure Fardeau, Alain Dolla
- article
- PLoS ONE, 2015, 10, pp.e0123455. ⟨10.1371/journal.pone.0123455⟩
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-
- titre
- Anaerobic nitrification-denitrification mediated by Mn-oxides in meso-tidal sediments: Implications for N-2 and N2O production
- auteur
- Sheryl Fernandes, Cedric Javanaud, Axel Aigle, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Jonathan Deborde, Bruno Deflandre, Pierre Anschutz, Patricia Bonin
- article
- Journal of Marine Systems, 2015, 144, pp.1-8. ⟨10.1016/j.jmarsys.2014.11.011⟩
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-
- titre
- Diversity of magnetotactic bacteria from a French pristine Mediterranean area.
- auteur
- Maxime Fuduche, Anne Postec, Sylvain Davidson, Jean-Paul Chauvin, Grégoire Galès, Agnès Hirschler-Réa, Bernard Ollivier, Long-Fei Wu, Nathalie Pradel
- article
- Current Microbiology, 2015, 70 (4), pp.499-505. ⟨10.1007/s00284-014-0745-y⟩
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-
- titre
- Aminobacterium thunnarium sp. nov., a mesophilic, amino acid-degrading bacterium isolated from an anaerobic sludge digester, pertaining to the phylum Synergistetes.
- auteur
- Olfa Hamdi, Wajdi Ben Hania, Anne Postec, Hassib Bouallagui, Moktar Hamdi, Patricia Bonin, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2015, 65 (Pt 2), pp.609-14. ⟨10.1099/ijs.0.068965-0⟩
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-
- titre
- Endolithic microbial communities in carbonate precipitates from serpentinite-hosted hyperalkaline springs of the Voltri Massif (Ligurian Alps, Northern Italy).
- auteur
- Marianne Quemeneur, Alexandra Palvadeau, Anne Postec, Christophe Monnin, Valérie Chavagnac, Bernard Ollivier, Gaël Erauso
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, pp.10.1007/s11356-015-4113-7. ⟨10.1007/s11356-015-4113-7⟩
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-
-
- titre
- Substrates specialization in lipid compounds and hydrocarbons of Marinobacter genus.
- auteur
- Patricia Bonin, Christophe Vieira, Régis Grimaud, Cécile Militon, Philippe Cuny, Oscar Lima, Sophie Guasco, Corina P D Brussaard, Valerie Michotey
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15347-15359. ⟨10.1007/s11356-014-4009-y⟩
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-
- titre
- Characterization of Alkaliphilus hydrothermalis sp. nov., a novel alkaliphilic anaerobic bacterium, isolated from a carbonaceous chimney of the Prony hydrothermal field, New Caledonia,
- auteur
- F. Ben Aissa, Anne Postec, Gaël Erauso, C. Payri, B. Pelletier, M. Hamdi, M-Laure Fardeau, B. Ollivier
- article
- Extremophiles, 2015, 19 (1), pp.183-188. ⟨10.1007/s00792-014-0697-y⟩
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-
- titre
- Crystallographic studies of [NiFe]-hydrogenase mutants: towards consensus structures for the elusive unready oxidized states.
- auteur
- Anne Volbeda, Lydie Martin, Elodie Barbier, Oscar Gutiérrez-Sanz, Antonio L de Lacey, Pierre-Pol Liebgott, Sébastien Dementin, Marc Rousset, Juan-Carlos Fontecilla-Camps
- article
- Journal of Biological Inorganic Chemistry, 2015, 20 (1), pp.11-22. ⟨10.1007/s00775-014-1203-9⟩
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-
-
- titre
- Complete genome sequence of a new member of the Marseilleviridae recovered from the Brackish submarine spring in the Cassis Port-Miou Calanque, France
- auteur
- Gabriel Doutre, Bruno Arfib, Pierre Rochette, Jean-Michel Claverie, Patricia Bonin, Chantal Abergel
- article
- Genome Announcements, 2015, 3 (6), pp.e01148--15. ⟨10.1128/genomeA.01148-15⟩
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-
- titre
- Thermodesulfobacteria class. nov.
- auteur
- Claude Hatchikian, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, ⟨10.1002/9781118960608.cbm00049⟩
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-
- titre
- Sporanaerobacter
- auteur
- Hernandez-Eugenio G, Marie Laure Fardeau, Jean-Louis Garcia, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00720⟩
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-
- titre
- Sporobacter
- auteur
- Isabelle Grech-Mora, Marie Laure Fardeau, Jean-Louis Garcia, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00679⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Garciella
- auteur
- Miranda-Tello E., Marie Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Didier Alazard
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00630⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Thermodesulfobacteriales ord. nov.
- auteur
- Claude Hatchikian, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, ⟨10.1002/9781118960608.obm00113⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Thermodesulfobacteriaceae fam. nov.
- auteur
- Claude Hatchikian, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, ⟨10.1002/9781118960608.fbm00251⟩
- Accès au bibtex
-
-
- titre
- Functional response of an adapted subtidal macrobenthic community to an oil spill: macrobenthic structure and bioturbation activity over time throughout an 18-month field experiment
- auteur
- Franck Gilbert, Georges Stora, Philippe Cuny
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15285-15293. ⟨10.1007/s11356-014-3906-4⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-
- titre
- Dynamics of bacterial assemblages and removal of polycyclic aromatic hydrocarbons in oil-contaminated coastal marine sediments subjected to contrasted oxygen regimes
- auteur
- Cécile Militon, Ronan Jezequel, Franck Gilbert, Yannick Corsellis, Léa Sylvi, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran, Philippe Cuny
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15260-15272. ⟨10.1007/s11356-015-4510-y⟩
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-
Book sections
- titre
- Contributions of Descriptive and Functional Genomics to Microbial Ecology
- auteur
- Philippe Bertin, Valerie Michotey, Philippe Normand
- article
- Jean-Claude Bertrand; Pierre Caumette; Philippe Lebaron; Robert Matheron; Philippe Normand; Télesphore Sime-Ngando. Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications, Springer Netherlands, pp.831-846, 2015, ⟨10.1007/978-94-017-9118-2_18⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Biogeochemical Cycles
- auteur
- Jean-Claude Bertrand, Patricia Bonin, Pierre Caumette, Jean-Pierre Gattuso, Gérald Grégori, Remy Guyoneaud, Xavier Le Roux, Robert Matheron, Franck Poly
- article
- Jean-Claude Bertrand; Pierre Caumette; Philippe Lebaron; Robert Matheron; Philippe Normand; Télesphore Sime-Ngando. Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications, Springer Netherlands, pp.511-617, 2015, 978-94-017-9118-2. ⟨10.1007/978-94-017-9118-2_14⟩
- Accès au bibtex
-
-
- titre
- A l'origine du vivant
- auteur
- Isabelle C. Biegala
- article
- Les écosystèmes marins dans la régulation du climat, , 2015
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Antares Neutrino telescope and Deap Sea Observatory,
- auteur
- V. Bertin, J. Brunner, J. Carr, P. Coyle, C. Curtil, J. Destelle, A. Deschamps, S. Escoffier, K. Graf, C. Gojak, J. Hössl, R. Lahmann, Dominique Lefèvre, C. Lévèque, Christian Tamburini, P. Schuller, H. van Haren
- article
- Seafloor Observatories - A New Vision of the Earth from the Abyss, 12, Springer Berlin Heidelberg, pp.369-414, 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Mudflat Benthic Spill Simulations
- auteur
- Cristiana Cravo-Laureau, Ronan Jézéquel, Franck Gilbert, Philippe Cuny, Robert Duran
- article
- McGenity, Terry J., Timmis, Kenneth N., Fernandez, Balbina Nogales. Hydrocarbon and Lipid Microbiology Protocols. Meso- and Microcosms, Springer Protocols Handbooks, pp.79-89, 2015, 978-3-662-45179-3. ⟨10.1007/8623_2015_52⟩
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-
2014
Journal articles
- titre
- Fermentative hydrogen production by a new alkaliphilic Clostridium sp (strain PROH2) isolated from a shallow submarine hydrothermal chimney in Prony Bay, New Caledonia
- auteur
- Nan Mei, Nesrine Zergane, Anne Postec, Gaël Erauso, Angelique Oilier, Claude Payri, Bernard Pelletier, Marie-Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Marianne Quemeneur
- article
- International Journal of Hydrogen Energy, 2014, 39 (34), pp.19465-19473. ⟨10.1016/j.ijhydene.2014.09.111⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Constraining the neutrino emission of gravitationally lensed Flat-Spectrum Radio Quasars with ANTARES data
- auteur
- S. Adrián-Martínez, A. Albert, M. Andre, G. Anton, M. Ardid, J. J. Aubert, B. Baret, J. Barrios-Marti, S. Basa, V. Bertin, S. Biagii, C. Bogazzi, R. Bormuth, M. Bou-Cabo, M. C. Bouwhuis, R. Bruijn, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, J. Carr, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, L. Core, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, G. de Rosa, I. Dekeyser, A. Deschamps, G. de Bonis, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, Q. Dorosti, D. Drouhin, A. Dumas, T. Eberl, D. Elsaesser, A. Enzenhoefer, S. Escoffier, K. Fehn, I. Fells, P. Fermani, F. Folger, L. A. Fusco, S. Galata, P. Gay, S. Geisselsoeder, K. Geyer, V. Giordano, A. Gleixner, J. P. Gomez-Gonzalez, K. Graf, G. Guillard, H. Van Haren, A. J. Heijboer, Y. Hello, J. J. Hernandez-Rey, B. Herold, A. Herrero, J. Hoessl, J. Hofestaedt, C. Hugon, C. W. James, M. De Jong, M. Kadler, O. Kalekin, A. Kappes, U. Katz, D. Kiessling, P. Kooijman, A. Kouchner, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, E. Lambard, G. Lambard, Dominique Lefèvre, E. Leonora, H. Loehner, S. Loucatos, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J. A. Martinez-Mora, S. Martini, A. Mathieu, T. Michael, P. Migliozzi, C. Mueller, M. Neff, E. Nezri, D. Palioselitis, G. E. Pavalas, C. Perrina, V. Popa, T. Pradier, C. Racca, G. Riccobene, R. Richter, K. Roensch, A. Rostovtsev, M. Saldana, D. F. E. Samtleben, A. Sanchez-Losa, M. Sanguineti, J. Schmid, J. Schnabel, S. Schulte, F. Schuessler, T. Seitz, C. Sieger, A. Spies, M. Spurioi, J. J. M. Steijger, Th. Stolarczyk, M. Taiuti, Christian Tamburini, Y. Tayalati, A. Trovato, M. Tselengidou, C. Toennis, B. Vallage, Corentin Vallée, V. van Elewyck, E. Visser, D. Vivolo, S. Wagner, J. Wilms, E. Wolf, K. Yatkin, H. Yepes, J. D. Zornoza, J. Zúñiga, E. E. Falco, Antares Collaboration
- article
- JOURNAL OF COSMOLOGY AND ASTROPARTICLE PHYSICS, 2014, 11, ⟨10.1088/1475-7516/2014/11/017⟩
- Accès au bibtex
-
-
- titre
- Do furanic and phenolic compounds of lignocellulosic and algae biomass hydrolyzate inhibit anaerobic mixed cultures? A comprehensive review
- auteur
- F. Monlau, C. Sambusiti, Abdellatif Barakat, Marianne Quemeneur, Eric Trably, Jean-Philippe Steyer, Hélène Carrère
- article
- Biotechnology Advances, 2014, 32 (5), pp.934 - 951. ⟨10.1016/j.biotechadv.2014.04.007⟩
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-
-
- titre
- Relation between deep bioluminescence and oceanographic variables: A statistical analysis using time–frequency decompositions
- auteur
- S. Martini, David Nerini, Christian Tamburini
- article
- Progress in Oceanography, 2014, 127, pp.117-128. ⟨10.1016/j.pocean.2014.07.003⟩
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- titre
- Anaerobic oxidation of long-chain n-alkanes by the hyperthermophilic sulfate-reducing archaeon, Archaeoglobus fulgidus.
- auteur
- Nadia Khelifi, Oulfat Amin Ali, Philippe Roche, Vincent Grossi, Céline Brochier-Armanet, Odile Valette, Bernard Ollivier, Alain Dolla, Agnès Hirschler-Réa
- article
- The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2014, pp.18. ⟨10.1038/ismej.2014.58⟩
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- titre
- Vallitalea pronyensis sp. nov., isolated from a marine alkaline hydrothermal chimney
- auteur
- F. Ben Aissa, Anne Postec, Gaël Erauso, C. Payri, B. Pelletier, M. Hamdi, B. Ollivier, M.-L. Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2014, 64 (Pt 4), pp.1160 - 1165. ⟨10.1099/ijs.0.055756-0⟩
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- titre
- Desulfatiferula berrensis sp. nov., a n-alkene-degrading sulfate-reducing bacterium isolated from estuarine sediments.
- auteur
- Florence Hakil, Oulfat Amin, Agnès Hirschler-Réa, Damien Mollex, Vincent Grossi, Robert Duran, Robert Matheron, Cristiana Cravo-Laureau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2014, 64 (Pt 2), pp.540-4. ⟨10.1099/ijs.0.057174-0⟩
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- titre
- Comparative genomic analysis provides insights into the evolution and niche adaptation of marine Magnetospira sp. QH-2 strain
- auteur
- Boyang Ji, Sheng-Da Zhang, Pascal Arnoux, Zoe Rouy, François Alberto, Nadège Philippe, Dorothée Murat, Wei-Jia Zhang, Jean-Baptiste Rioux, Nicolas Ginet, Monique Sabaty, Sophie Mangenot, Nathalie Pradel, Jiesheng Tian, Jing Yang, Lichen Zhang, Wenyan Zhang, Hongmiao Pan, Bernard Henrissat, Pedro M Coutinho, Ying Li, Tian Xiao, Claudine Médigue, Valérie Barbe, David Pignol, Emmanuel Talla, Long-Fei Wu
- article
- Environmental Microbiology, 2014, 16 (2), pp.525-544. ⟨10.1111/1462-2920.12180⟩
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- titre
- Mannitol metabolism in brown algae involves a new phosphatase family.
- auteur
- Agnès Groisillier, Zhanru Shao, Gurvan Michel, Sophie Goulitquer, Patricia Bonin, Stefan Krahulec, Bernd Nidetzky, Delin Duan, Catherine Boyen, Thierry Tonon
- article
- Journal of Experimental Botany, 2014, 65 (2), pp.559-70. ⟨10.1093/jxb/ert405⟩
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- titre
- Bacterial diversity in relatively pristine and anthropogenically-influenced mangrove ecosystems (Goa, India).
- auteur
- Sheryl Fernandes, David L Kirchman, Valerie Michotey, Patricia Bonin, P A Lokabharathi
- article
- Brazilian Journal of Microbiology, 2014, 45 (4), pp.1161-71. ⟨10.1590/S1517-83822014000400006⟩
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- titre
- Reconciliation of the carbon budget in the ocean’s twilight zone
- auteur
- Sarah L. C. Giering, Richard Sanders, Richard S. Lampitt, Thomas R. Anderson, Christian Tamburini, Mehdi Boutrif, Mikhail V. Zubkov, Chris M. Marsay, Stephanie A. Henson, Kevin Saw, Kathryn Cook, Daniel J. Mayor
- article
- Nature, 2014, 507 (7493), pp.480-483. ⟨10.1038/nature13123⟩
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- titre
- Transcriptomics Reveal Several Gene Expression Patterns in the Piezophile Desulfovibrio hydrothermalis in Response to Hydrostatic Pressure
- auteur
- Amira Amrani, Aurélie Bergon, Hélène Holota, Christian Tamburini, Marc Garel, Bernard Ollivier, Jean Imbert, Alain Dolla, Nathalie Pradel
- article
- PLoS ONE, 2014, 9 (9), pp.e106831. ⟨10.1371/journal.pone.0106831⟩
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-
- titre
- A search for time dependent neutrino emission from microquasars with the ANTARES telescope
- auteur
- S. Adrián-Martínez, A. Albert, M. André, M. Anghinolfi, G. Anton, M. Ardid, T. Astraatmadja, J.-J. Aubert, B. Baret, J. Barrios, S. Basa, V. Bertin, S. Biagi, C. Bigongiari, C. Bogazzi, B. Bouhou, M. C. Bouwhuis, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, C. Cârloganu, J. Carr, S. Cecchini, P. Charvis, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, L. Core, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, G. de Rosa, I. Dekeyser, Anne Deschamps, G. de Bonis, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, Q. Dorosti, D. Drouhin, A. Dumas, T. Eberl, D. Elsässer, U. Emanuele, A. Enzenhöfer, J.-P. Ernenwein, S. Escoffier, K. Fehn, I. Felis, P. Fermani, F. Folger, L.A. Fusco, S. Galatà, Pascal Gay, S. Geisselsöder, K. Geyer, V. Giordano, A. Gleixner, J. P. Gómez-González, K. Graf, G. Guillard, H. van Haren, A. J. Heijboer, Y. Hello, J.J. Hernández-Rey, B. Herold, J. Hössl, J. Hofestädt, C. W. James, M. de Jong, M. Kadler, O. Kalekin, A. Kappes, U. Katz, P. Kooijman, A. Kouchner, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, E. Lambard, G. Lambard, G. Larosa, D. Lattuada, Dominique Lefèvre, E. Leonora, H. Loehner, S. Loucatos, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J. A. Martínez-Mora, S. Martini, A. Mathieu, T. Michael, P. Migliozzi, T. Montaruli, C. Müller, M. Neff, E. Nezri, D. Palioselitis, G. E. Păvălaş, C. Perrina, P. Piattelli, V. Popa, T. Pradier, C. Racca, G. Riccobene, R. Richter, C. Rivière, A. Robert, K. Roensch, A. Rostovtsev, M. Salda\na, D. F. E. Samtleben, A. Sánchez-Losa, M. Sanguineti, P. Sapienza, J. Schmid, J. Schnabel, S. Schulte, F. Schüssler, T. Seitz, C. Sieger, A. Spies, M. Spurio, J.J. M. Steijger, T. Stolarczyk, M. Taiuti, Christian Tamburini, Y. Tayalati, A. Trovato, B. Vallage, Corentin Vallée, V. van Elewyck, P. Vernin, Eelco Visser, D. Vivolo, S. Wagner, J. Wilms, E. de Wolf, K. Yatkin, H. Yepes, J. D. Zornoza, J. Zúñiga
- article
- Journal of High Energy Astrophysics, 2014, 3-4, pp.9-17. ⟨10.1016/j.jheap.2014.06.002⟩
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-
- titre
- Spatial distribution of microbial communities in the shallow submarine alkaline hydrothermal field of the Prony Bay, New Caledonia
- auteur
- Marianne Quéméneur, Méline Bes, Anne Postec, Nan Mei, Jérôme Hamelin, Christophe Monnin, Valérie Chavagnac, Claude Payri, Bernard Pelletier, Linda Guentas-Dombrowsky, Martine Gérard, Céline Pisapia, Emmanuelle Gérard, Bénédicte Ménez, Bernard Ollivier, Gaël Erauso
- article
- Environmental Microbiology Reports, 2014, 6 (2014), pp.665-674. ⟨10.1111/1758-2229.12184⟩
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-
- titre
- Fluid chemistry of the low temperature hyperalkaline hydrothermal system of Prony Bay (New Caledonia)
- auteur
- C. Monnin, V. Chavagnac, C. Boulart, B. Menez, M. Gerard, E. Gerard, C. Pisapia, Marianne Quemeneur, Gaël Erauso, Anne Postec, L. Guentas-Dombrowski, C. Payri, B. Pelletier
- article
- Biogeosciences, 2014, 11 (20), pp.5687-5706. ⟨10.5194/bg-11-5687-2014⟩
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Conference papers
- titre
- Production d’hydrogène dans les systèmes hydrothermaux hyperalcalins des ophiolites (Oman, Ligurie, Nouvelle Calédonie)
- auteur
- C. Monnin, V. Chavagnac, C. Boulart, G. Ceuleneer, Guilhem Hoareau, B. Ménez, E. Gérard, M. Gérard, M. Quéméneur, Gaël Erauso, Anne Postec, L. Guentas-Dombrowski, C. Payri, B. Pelletier
- article
- 24ème Réunion des Sciences de la Terre : RST 2014, Pau, France, Oct 2014, 2014, Unknown, Unknown Region
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-
Book sections
- titre
- Methods for Studying Microorganisms in the Environment
- auteur
- Fabien Joux, Jean Claude Bertrand, Rutger de Wit, Vincent Grossi, Laurent Intertaglia, Philippe Lebaron, Valerie Michotey, Philippe Normand, Pierre P. Peyret, Patrick Raimbault, Christian Tamburini, Laurent Urios
- article
- Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications, Springer Netherlands, pp.757-829, 2014, 978-94-017-9117-5. ⟨10.1007/978-94-017-9118-2_17⟩
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-
- titre
- Petroleum: from formation to microbiology.
- auteur
- Bernard Ollivier, Jean Borgomano, Philippe Oger
- article
- Microbial life in the deep biosphere, De Gruyter, pp.161 -185, 2014
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-
- titre
- Members of the order Thermotogales: from microbiology to hydrogen production.
- auteur
- Martina Cappelletti, Davide Zannoni, Anne Postec, Bernard Ollivier
- article
- Davide Zannoni, Roberto De Philippis. Microbial BioEnergy: Hydrogen Production, Springer, pp.197-224, 2014, Advances in Photosynthesis and Respiration, 978-94-017-8553-2. ⟨10.1007/978-94-017-8554-9_9⟩
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-
Poster communications
-
- titre
- Dynamique de l’holobionte corallien et plasticité transcriptomique : variabilité interspécifique, interpopulationnelle et interindividuelle
- auteur
- Kelly Brener, Jeremie Vidal-Dupiol, Mehdi Adjeroud, Pascal Romans, Julien Loubet, Rémi Pillot, D. Aurelle, Marine Pratlong, Anne Haguenauer, Pierre Pontaroti, Pascal Mirleau, Marc Bally, Eve Toulza, Guillaume Mitta
- article
- Journée de doctoriales Aragoyennes, Apr 2014, Banyuls sur Mer, France
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-
Reports
- titre
- Atelier de réflexion prospective MERMED : adaptation aux changements globaux en mer Méditerranée : rapport final
- auteur
- B. Hubert, M. Broin, F. Boulier, V. Chagué, T. Changeux, D. Lacroix, Christian Chaboud, Philippe Charvis, Philippe Cury, Florence Galletti, François Guilhaumon, François Le Loc'h, Christophe Leboulanger, Bernard Moizo, Bernard Ollivier, Olivier Pringault
- article
- [Rapport de recherche] Agropolis International. 2014, 156 p
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-
2013
Journal articles
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- titre
- Biochemical, Transcriptional and Translational Evidences of the Phenol-meta-Degradation Pathway by the Hyperthermophilic Sulfolobus solfataricus 98/2
- auteur
- Alexia Comte, Pierre Christen, Sylvain Davidson, Matthieu Pophillat, Jean Lorquin, Richard Auria, Gwenola Simon, Laurie Casalot
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (12), pp.e82397. ⟨10.1371/journal.pone.0082397⟩
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-
- titre
- Denitrification activity is closely linked to the total ambient Fe concentration in mangrove sediments of Goa, India
- auteur
- S Fernandes, M Gonsalves, Valerie Michotey, Patricia Bonin, P Lokabharathi
- article
- Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2013, 131, pp.64-74. ⟨10.1016/j.ecss.2013.08.008⟩
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-
- titre
- Mesotoga infera sp. nov., a mesophilic member of the order Thermotogales, isolated from an underground gas storage aquifer.
- auteur
- Wajdi Ben Hania, Anne Postec, Thomas Aüllo, Anthony Ranchou-Peyruse, Gaël Erauso, Céline Brochier-Armanet, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Stéphanie Saint-Laurent, Michel Magot, Marie-Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, 63 (Pt 8), pp.3003-8. ⟨10.1099/ijs.0.047993-0⟩
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-
- titre
- Vallitalea guaymasensis gen. nov., sp. nov., isolated from marine sediment.
- auteur
- Raja Lakhal, Nathalie Pradel, Anne Postec, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Anne Godfroy, Marie-Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, 63 (Pt 8), pp.3019-23. ⟨10.1099/ijs.0.045708-0⟩
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-
- titre
- Isolation of Thermovenabulum gondwanense from a French hot spring and emended description of the species
- auteur
- Nathalie Pradel, Manon Bartoli, Alain Bernadac, Gregory Gimenez, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
- article
- Antonie van Leeuwenhoek, 2013, 104 (2), pp.271-279. ⟨10.1007/s10482-013-9947-8⟩
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-
- titre
- Measurement of the atmospheric $\nu_\mu$ energy spectrum from 100 GeV to 200 TeV with the ANTARES telescope
- auteur
- S. Adrián-Martínez, A. Albert, Imen Al Samarai, M. André, M. Anghinolfi, G. Anton, S. Anvar, M. Ardid, T. Astraatmadja, J-J. Aubert, B. Baret, J. Barrios-Martí, S. Basa, V. Bertin, S. Biagi, C. Bigongiari, C. Bogazzi, B. Bouhou, M. C. Bouwhuis, R. Bruijn, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, C. Carloganu, J. Carr, S. Cecchini, Z. Charif, Ph. Charvis, T. Chiarusi, M. Circella, F. Classen, L. Core, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, C. Curtil, I. Dekeyser, Anne Deschamps, G. de Bonis, M. P. Decowski, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, Q. Dorosti, D. Drouhin, A. Dumas, T. Eberl, U. Emanuele, A. Enzenhöfer, J.-P. Ernenwein, S. Escoffier, K. Fehn, P. Fermani, V. Flaminio, F. Folger, U. Fritsch, L. A. Fusco, S. Galatà, Pascal Gay, S. Geisselsöder, K. Geyer, G. Giacomelli, V. Giordano, A. Gleixner, J. P. Gómez-González, K. Graf, G. Guillard, H. van Haren, A. J. Heijboer, Y. Hello, J. J. Hernández-Rey, B. Herold, J. Hössl, C. W. James, M. de Jong, M. Kadler, O. Kalekin, A. Kappes, U. Katz, P. Kooijman, A. Kouchner, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, E. Lambard, G. Lambard, G. Larosa, D. Lattuada, Dominique Lefèvre, E. Leonora, D. Lo Presti, H. Loehner, S. Loucatos, F. Louis, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J. A. Martínez-Mora, S. Martini, T. Michael, T. Montaruli, M. Morganti, H. Motz, C. Mueller, M. Neff, E. Nezri, D. Palioselitis, G. E. Pavalas, C. Perrina, P. Piattelli, V. Popa, T. Pradier, C. Racca, R. Richter, C. Rivière, A. Robert, K. Roensch, A. Rostovtsev, D. F. E. Samtleben, M. Sanguineti, P. Sapienza, J. Schmid, J. Schnabel, S. Schulte, F. Schüssler, T. Seitz, R. Shanidze, C. Sieger, F. Simeone, A. Spies, M. Spurio, J. J. M. Steijger, Th. Stolarczyk, A. Sánchez-Losa, M. Taiuti, Christian Tamburini, Y. Tayalati, A. Trovato, B. Vallage, Corentin Vallée, V. van Elewyck, P. Vernin, Eelco Visser, S. Wagner, J. Wilms, E. de Wolf, K. Yatkin, H. Yepes, J.D. Zornoza, J. Zúñiga
- article
- European Physical Journal C: Particles and Fields, 2013, 73, pp.2606. ⟨10.1140/epjc/s10052-013-2606-4⟩
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-
- titre
- Evidence for surfactant production by the haloarchaeon Haloferax sp. MSNC14 in hydrocarbon-containing media
- auteur
- Ikram Djeridi, Cécile Militon, Vincent Grossi, Philippe Cuny
- article
- Extremophiles, 2013, 17 (4), pp.669-675. ⟨10.1007/s00792-013-0550-8⟩
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-
- titre
- Genome of Phaeocystis globosa virus PgV-16T highlights the common ancestry of the largest known DNA viruses infecting eukaryotes
- auteur
- S. Santini, J. Bartoli, O. Poirot, Magali Lescot, C. Abergel, Valérie Barbe, K. Wommack, A. Noordeloos, C. Brussaard, J.-M. Claverie
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2013, 110 (26), pp.10800-10805. ⟨10.1073/pnas.1303251110⟩
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-
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- titre
- Effects of Hydrostatic Pressure on Growth and Luminescence of a Moderately-Piezophilic Luminous Bacteria Photobacterium phosphoreum ANT-2200
- auteur
- Severine Martini, Badr Al Ali, Marc Garel, David Nerini, Vincent Grossi, Muriel Pacton, Laurence Casalot, Philippe Cuny, Christian Tamburini
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (6), pp.e66580. ⟨10.1371/journal.pone.0066580⟩
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-
- titre
- Desulfotomaculum peckii sp. nov., a moderately thermophilic member of the genus Desulfotomaculum, isolated from an upflow anaerobic filter treating abattoir wastewaters.
- auteur
- Linda Jabari, Hana Gannoun, Jean Luc Cayol, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Guy Fauque, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, 63 (Pt 6), pp.2082-7. ⟨10.1099/ijs.0.043893-0⟩
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-
-
- titre
- Prokaryotic responses to hydrostatic pressure in the ocean - a review
- auteur
- Christian Tamburini, Mehdi Boutrif, Marc Garel, Rita Colwell, Jody W. Deming
- article
- Environmental Microbiology, 2013, 15 (5), pp.1262-1274. ⟨10.1111/1462-2920.12084⟩
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-
- titre
- Trends in salinity and inorganic nitrogen compounds in the Berre lagoon (1994-2011) bacterial activities and nitrogen budgets
- auteur
- Imen Zaghmouri, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Patrick Raimbault, Nicole Garcia, Guillaume Bernard, Patricia Bonin
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2013, 67, pp.55-65. ⟨10.1016/j.marpolbul.2012.11.046⟩
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-
- titre
- Characterization of Vallitalea guaymasensis gen. nov., sp. nov., a novel marine bacterium, isolated from sediments of Guaymas basin
- auteur
- R Lakhal, Nathalie Pradel, Anne Postec, M Hamdi, Bernard Ollivier, Anne Godfroy, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, pp.doi:10.1099/ijs.0.045708-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Desulfosporosinus burensis sp. nov., a spore-forming, mesophilic, sulfate-reducing bacterium isolated from a deep clay environment.
- auteur
- Bruno Mayeux, Marie Laure Fardeau, Manon Bartoli, Laurie Casalot, Agnes Vinsot, Marc Labat
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, 63 (Pt 2), pp.593-8. ⟨10.1099/ijs.0.035238-0⟩
- Accès au bibtex
-
-
- titre
- Genome Sequence of the Sulfate-Reducing Bacterium Desulfotomaculum hydrothermale Lam5(T).
- auteur
- Oulfat Amin, Marie-Laure Fardeau, Odile Valette, Agnès Hirschler-Réa, Valérie Barbe, Claudine Médigue, Benoit Vacherie, Bernard Ollivier, Philippe N Bertin, Alain Dolla
- article
- Genome Announcements , 2013, 1 (1), epub ahead of print. ⟨10.1128/genomeA.00114-12⟩
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-
-
- titre
- Complete Genome Sequence of the Piezophilic, Mesophilic, Sulfate-Reducing Bacterium Desulfovibrio hydrothermalis AM13(T.).
- auteur
- Boyang Ji, Gregory Gimenez, Valérie Barbe, Benoit Vacherie, Zoé Rouy, Amira Amrani, Marie-Laure Fardeau, Philippe Bertin, Didier Alazard, Sabine Leroy, Emmanuel Talla, Bernard Ollivier, Alain Dolla, Nathalie Pradel
- article
- Genome Announc, 2013, 1 (1), epub ahead of print. ⟨10.1128/genomeA.00226-12⟩
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-
-
- titre
- Deep-Sea Bioluminescence Blooms after Dense Water Formation at the Ocean Surface
- auteur
- Christian Tamburini, Miquel Canals, Xavier Durrieu de Madron, Loïc Houpert, Dominique Lefèvre, Séverine Martini, Fabrizio d'Ortenzio, Anne Robert, Pierre Testor, Juan Antonio Aguilar, Imen Al Samarai, Arnaud Albert, Michel André, Marco Anghinolfi, Gisela Anton, Shebli Anvar, Miguel Ardid, Ana Carolina Assis Jesus, Tri L. Astraatmadja, Jean-Jacques Aubert, Bruny Baret, Stéphane Basa, Vincent Bertin, Simone Biagi, Armando Bigi, Ciro Bigongiari, Claudio Bogazzi, Manuel Bou-Cabo, Boutayeb Bouhou, Mieke C. Bouwhuis, Jurgen Brunner, José Busto, Francisco Camarena, Antonio Capone, Christina Cârloganu, Giada Carminati, John Carr, Stefano Cecchini, Ziad Charif, Philippe Charvis, Tommaso Chiarusi, Marco Circella, Rosa Coniglione, Heide Costantini, Paschal Coyle, Christian Curtil, Patrick Decowski, Ivan Dekeyser, Anne Deschamps, Corinne Donzaud, Damien Dornic, Hasankiadeh Q. Dorosti, Doriane Drouhin, Thomas Eberl, Umberto Emanuele, Jean-Pierre Ernenwein, Stéphanie Escoffier, Paolo Fermani, Marcelino Ferri, Vincenzo Flaminio, Florian Folger, Ulf Fritsch, Jean-Luc Fuda, Salvatore Galatà, Pascal Gay, Giorgio Giacomelli, Valentina Giordano, Juan-Pablo Gómez-González, Kay Graf, Goulven Guillard, Garadeb Halladjian, Gregory Hallewell, Hans van Haren, Joris Hartman, Aart J. Heijboer, Yann Hello, Juan Jose Hernández-Rey, Bjoern Herold, Jurgen Hössl, Ching-Cheng Hsu, Marteen de Jong, Matthias Kadler, Oleg Kalekin, Alexander Kappes, Uli Katz, Oksana Kavatsyuk, Paul Kooijman, Claudio Kopper, Antoine Kouchner, Ingo Kreykenbohm, Vladimir Kulikovskiy, Robert Lahmann, Patrick Lamare, Giuseppina Larosa, Dario Lattuada, Gordon Lim, Domenico Lo Presti, Herbert Loehner, Sotiris Loucatos, Salvatore Mangano, Michel Marcelin, Annarita Margiotta, Juan Antonio Martinez-Mora, Athina Meli, Teresa Montaruli, Luciano Moscoso, Holger Motz, Max Neff, Emma Nuel Nezri, Dimitris Palioselitis, Gabriela E. Păvălaş, Kevin Payet, Patrice Payre, Jelena Petrovic, Paolo Piattelli, Nicolas Picot-Clemente, Vlad Popa, Thierry Pradier, Eleonora Presani, Chantal Racca, Corey Reed, Giorgio Riccobene, Carsten Richardt, Roland Richter, Colas Rivière, Kathrin Roensch, Andrei Rostovtsev, Joaquin Ruiz-Rivas, Marius Rujoiu, Valerio G. Russo, Francisco Salesa, Augustin Sánchez-Losa, Piera Sapienza, Friederike Schöck, Jean-Pierre Schuller, Fabian Schussler, Rezo Shanidze, Francesco Simeone, Andreas Spies, Maurizio Spurio, Jos J. M. Steijger, Thierry Stolarczyk, Mauro G. F. Taiuti, Simona Toscano, Bertrand Vallage, Véronique van Elewyck, Giulia Vannoni, Manuela Vecchi, Pascal Vernin, Guus Wijnker, Jorn Wilms, Els de Wolf, Harold Yepes, Dmitry Zaborov, Juan de Dios Zornoza, Juan Zúñiga
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (7), pp.e67523. ⟨10.1371/JOURNAL.PONE.0067523⟩
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-
-
- titre
- The First Genomic and Proteomic Characterization of a Deep-Sea Sulfate Reducer: Insights into the Piezophilic Lifestyle of Desulfovibrio piezophilus
- auteur
- Nathalie Pradel, Boyang Ji, G Gimenez, E Talla, P Lenoble, Marc Garel, Christian Tamburini, Patrick Fourquet, Régine Lebrun, Philippe Bertin, Yann Denis, Matthieu Pophillat, Valérie Barbe, Bernard Ollivier, Alain Dolla
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (1), pp.e55130. ⟨10.1371/journal.pone.0055130⟩
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-
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- titre
- DNA Self-Assembly: From Chirality to Evolution
- auteur
- Y. Timsit
- article
- International Journal of Molecular Sciences, 2013, 14 (4), pp.8252-8270. ⟨10.3390/ijms14048252⟩
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-
-
- titre
- Long-term monitoring programme of the hydrological variability in the Mediterranean Sea: a first overview of the HYDROCHANGES network
- auteur
- K. Schroeder, C. Millot, L. Bengara, S. Ben Ismail, M. Bensi, M. Borghini, G. Budillon, V. Cardin, L. Coppola, C. Curtil, A. Drago, B. El Moumni, J. Font, Jean-Luc Fuda, J. García-Lafuente, G. Gasparini, H. Kontoyiannis, Dominique Lefevre, P. Puig, Patrick Raimbault, G. Rougier, J. Salat, C. Sammari, J. Sánchez Garrido, A. Sanchez-Roman, S. Sparnocchia, Christian Tamburini, I. Taupier-Letage, A. Theocharis, M. Vargas-Yáñez, A. Vetrano
- article
- Ocean Science, 2013, 9 (2), pp.301-324. ⟨10.5194/os-9-301-2013⟩
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-
- titre
- Transient Shifts in Bacterial Communities Associated with the Temperate Gorgonian Paramuricea clavata in the Northwestern Mediterranean Sea
- auteur
- Marie La Rivière, Marie Roumagnac, Joaquim Garrabou, M. Bally
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (2), pp.e57385. ⟨10.1371/journal.pone.0057385⟩
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-
- titre
- Anaerobic bacterial degradation of pristenes and phytenes in marine sediments does not lead to pristane and phytane during early diagenesis
- auteur
- Jean-Francois Rontani, Patricia Bonin, Sophie Guasco, Frederic Vaultier, John K. Volkman
- article
- Organic Geochemistry, 2013, 58, pp.43-55
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-
-
- titre
- Impact of oil on bacterial community structure in bioturbated sediments
- auteur
- Magali Stauffert, Cristiana Cravo-Laureau, Ronan Jezequel, Sandra Barantal, Philippe Cuny, Franck Gilbert, Christine Cagnon, Cécile Militon, David Amouroux, Fatima Mahdaoui, Brice Bouyssière, Georges Stora, François-Xavier Merlin, Robert Duran
- article
- PLoS ONE, 2013, vol. 8, pp. 1-15. ⟨10.1371/journal.pone.0065347⟩
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-
-
- titre
- Insights into dynamics of mobile genetic elements in hyperthermophilic environments from five new thermococcus plasmids.
- auteur
- Mart Krupovic, Mathieu Gonnet, Wajdi Ben Hania, Patrick Forterre, Gaël Erauso
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (1), pp.e49044. ⟨10.1371/journal.pone.0049044⟩
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-
Conference papers
- titre
- INTRIGUING DIVERSITY AMONG DIAZOTROPHIC PICOPLANKTON ALONG A MEDITERRANEAN TRANSECT: A DOMINANCE OF RHIZOBIA
- auteur
- Morgane Le Moal, Hélène Collin, Isabelle C. Biegala
- article
- ASLO-13, Feb 2013, New Orleans, United States
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-
Other publications
- titre
- Des Microoganismes très convoités
- auteur
- Bernard Ollivier
- article
- 2013, pp.n°70
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-
Poster communications
- titre
- Distribution spatiale des communautés microbiennes du système hydrothermal alcalin de la baie de Prony, Nouvelle Calédonie
- auteur
- Marianne Quemeneur, Méline Bes, Anne Postec, Nan Mei, Jérôme Hamelin, Claude Payri, Bernard Pelletier, Bernard Ollivier, Gaël Erauso
- article
- VI. Colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne (AFEM) "Microbiologie Environnementale : du Gène à l’Ecosystème", Oct 2013, Parent, France. 2013
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-
Reports
- titre
- Evaluation and Selection of the MEUST Submarine Site
- auteur
- V. Bertin, M. Billault, P. Coyle, C. Curtil, S. Deguero, J.-J. Destelle, D. Dornic, F. Gallo, S. Henry, P. Keller, P. Lamare, Dominique Lefèvre, F. Léon, S. Martini, Christian Tamburini, Corentin Vallée
- article
- 2013, pp.1-15
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-
- titre
- Technical Design Report of the MEUST Infrastructure
- auteur
- M. Ageron, K. Bernardet, V. Bertin, S. Beurthey, M. Billault, J. Brunner, L. Caillat, A. Cosquer, P. Coyle, J.J. Destelle, D. Dornic, C. Gojak, Z. Hafidi, S. Henry, P. Keller, P. Lamare, Dominique Lefèvre, Y. Lenault, K. Mahiouz, J. Royon, M. Solazzo, Christian Tamburini, D. Tézier, S. Théraube, Corentin Vallée
- article
- 2013
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-
2012
Journal articles
- titre
- Methanogenic octadecene degradation by syntrophic enrichment culture from brackish sediments
- auteur
- Agnès Hirschler-Réa, Cristiana Cravo-Laureau, Laurie Casalot, Robert Matheron
- article
- Current Microbiology, 2012, 65 (5), pp.561-7. ⟨10.1007/s00284-012-0195-3⟩
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-
- titre
- Analysis of Structure-Function Relationships in the Colibactin-Maturating Enzyme ClbP.
- auteur
- A Cougnoux, L Gibold, F Robin, D Dubois, Nathalie Pradel, A Darfeuille-Michaud, G Dalmasso, J Delmas, R Bonnet
- article
- Journal of Molecular Biology, 2012, 424 (3-4), in press. ⟨10.1016/j.jmb.2012.09.017⟩
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-
- titre
- Spatio-temporal diversity of free-living and particle-attached prokaryotes in the tropical lagoon of Ahe atoll (Tuamotu Archipelago) and its surrounding oceanic waters
- auteur
- Valerie Michotey, Sophie Guasco, Dominique Boeuf, Nicola Morezzi, Brice Durieu, Loïc Charpy, Patricia Bonin
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2012, 65 (10), pp.525-537. ⟨10.1016/j.marpolbul.2012.01.009⟩
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-
-
- titre
- DNA-Directed Base Pair Opening
- auteur
- Y. Timsit
- article
- Molecules, 2012, 17 (10), pp.11947-11964. ⟨10.3390/molecules171011947⟩
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-
- titre
- Macellibacteroides fermentans gen. nov., sp. nov., a member of the family Porphyromonadaceae isolated from an upflow anaerobic filter treating abattoir wastewaters.
- auteur
- L Jabari, H Gannoun, Jean Luc Cayol, A Hedi, M Sakamoto, E Falsen, M Ohkuma, M Hamdi, Guy Fauque, Bernard Ollivier, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 62 (Pt 10), pp.2522-7. ⟨10.1099/ijs.0.032508-0⟩
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-
- titre
- Isolation and characterization of Fonticella tunisiensis gen nov., sp. nov., a novel bacterium isolated from a Tunisian hot spring.
- auteur
- Belkis Fraj, Wajdi Ben Hania, Anne Postec, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, pp.10.1099/ijs.0.041947-0. ⟨10.1099/ijs.0.041947-0⟩
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-
- titre
- Methanomassiliicoccus luminyensis gen. nov., sp. nov., a methanogenic archaeon isolated from human faeces.
- auteur
- B Dribi, Marie Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Didier Raoult, Michel Drancourt
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 62 (Pt 8), pp.1902-7. ⟨10.1099/ijs.0.033712-0⟩
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-
- titre
- Halanaerobacter jeridensis sp. nov., isolated from a hypersaline lake.
- auteur
- M Mezghani, Didier Alazard, F Karray, Jean Luc Cayol, Manon Bartoli, Anne Postec, Marie Laure Fardeau, Jean-Luc Tholozan, S Sayadi
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 62 (Pt 8), pp.1970-3. ⟨10.1099/ijs.0.036301-0⟩
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-
-
- titre
- Effect of enzyme addition on fermentative hydrogen production from wheat straw
- auteur
- Marianne Quéméneur, Marine Bittel, Eric Trably, Claire Dumas, Laurent Fourage, Gilles Ravot, Jean-Philippe Steyer, Hélène Carrère
- article
- International Journal of Hydrogen Energy, 2012, 37 (14), pp.10639 - 10647. ⟨10.1016/j.ijhydene.2012.04.083⟩
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-
- titre
- Defluviitoga tunisiensis gen. nov., sp. nov., a thermophilic bacterium isolated from a mesothermic and anaerobic whey digester.
- auteur
- Wajdi Ben Hania, Ramzi Ghodbane, Anne Postec, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 62 (Pt 6), pp.1377-82. ⟨10.1099/ijs.0.033720-0⟩
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-
- titre
- Fusibacter tunisiensis sp. nov., isolated from an anaerobic reactor used to treat olive-mill wastewater.
- auteur
- Wajdi Ben Hania, Belkis Fraj, Anne Postec, Khaled Fadhlaoui, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 62 (Pt 6), pp.1365-8. ⟨10.1099/ijs.0.034603-0⟩
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-
- titre
- Understanding and tuning the catalytic bias of hydrogenase.
- auteur
- Abbas Abou Hamdan, Sébastien Dementin, Pierre-Pol Liebgott, Oscar Gutierrez-Sanz, Pierre Richaud, Antonio de Lacey, Marc Rousset, Patrick Bertrand, Laurent Cournac, Christophe Léger
- article
- Journal of the American Chemical Society, 2012, 134 (20), pp.8368-71. ⟨10.1021/ja301802r⟩
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-
- titre
- Characterization of Defluviitalea saccharophila gen. nov., sp. nov., a thermophilic bacterium isolated from an upflow anaerobic filter treating abattoir wastewaters, and proposal of Defluviitaleaceae fam. nov.
- auteur
- Linda Jabari, Hana Gannoun, Jean Luc Cayol, Moktar Hamdi, Guy Fauque, Bernard Ollivier, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 62 (Pt 3), pp.550-5. ⟨10.1099/ijs.0.030700-0⟩
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-
-
- titre
- Inhibition of fermentative hydrogen production by lignocellulose-derived compounds in mixed cultures
- auteur
- Marianne Quéméneur, Jérôme Hamelin, Abdellatif Barakat, Jean-Philippe Steyer, Hélène Carrère, Eric Trably
- article
- International Journal of Hydrogen Energy, 2012, 37 (4), pp.3150 - 3159. ⟨10.1016/j.ijhydene.2011.11.033⟩
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-
- titre
- How to analyse bioluminescence time series from in situ observatories? Example from high frequency records and real time data at the ANTARES site
- auteur
- Severine Martini, David Nerini, Christian Tamburini
- article
- Luminescence, 2012, 27 (2), pp.139-140
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-
- titre
- Kinetics of aerobic phenol biodegradation by the acidophilic and hyperthermophilic archaeon Sulfolobus solfataricus 98/2
- auteur
- Pierre Christen, Armando Vega, Laurie Casalot, Gwenola Simon, Richard Auria
- article
- Biochemical Engineering Journal, 2012, 62, pp.56-61. ⟨10.1016/j.bej.2011.12.012⟩
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-
-
- titre
- Mimicking floodplain reconnection and disconnection using 15N mesocosm incubations
- auteur
- N. Welti, E. Bondar-Kunze, M. Mair, Patricia Bonin, W. Wanek, Gilles Pinay, T. Hein
- article
- Biogeosciences, 2012, 9 (11), pp.4263-4278. ⟨10.5194/bg-9-4263-2012⟩
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-
- titre
- Magnetotactic Bacteria in Microcosms Originating from the French Mediterranean Coast Subjected to Oil Industry Activities
- auteur
- Anne Postec, Nicolas Tapia, Alain Bernadac, Manon Bartoli, Sylvain Davidson, Long-Fei Wu, Bernard Ollivier, Nathalie Pradel
- article
- Microbial ecology, 2012, 63, pp.1-11. ⟨10.1007/s00248-011-9910-z⟩
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-
-
- titre
- DNA-DNA Recognition: From Tight Contact to Fatal Attraction
- auteur
- Y. Timsit
- article
- InTech, 2012
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-
- titre
- Desulfosoma profundi sp nov., a thermophilic sulfate-reducing bacterium isolated from a deep terrestrial geothermal spring in France
- auteur
- Patrick Gregoire, Marie Laure Fardeau, Sophie Guasco, Joel Lagiere, Jean Cambar, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Bernard Ollivier
- article
- Antonie van Leeuwenhoek, 2012, 101, pp.595-602. ⟨10.1007/s10482-011-9675-x⟩
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-
-
- titre
- Tungsten-enhanced growth of Methanosphaera stadtmanae
- auteur
- Bédis Dridi, Saber Khelaifia, Marie Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Michel Drancourt
- article
- BMC Research Notes, 2012, 5, pp.238. ⟨10.1186/1756-0500-5-238⟩
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-
-
- titre
- Nitrogen-limited mangrove ecosystems conserve N through dissimilatory nitrate reduction to ammonium
- auteur
- Sheryl Fernandes, Patricia Bonin, Valerie Michotey, Nicole Garcia, P. A. Lokabharathi
- article
- Scientific Reports, 2012, 2, pp.419. ⟨10.1038/srep00419⟩
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-
- titre
- Denitrification prevails over anammox in tropical mangrove sediments (Goa, India)
- auteur
- Sheryl Fernandes, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Patricia Bonin, P. A. Loka Bharathi
- article
- Marine Environmental Research, 2012, 74, pp.9-19. ⟨10.1016/j.marenvres.2011.11.008⟩
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-
Conference papers
- titre
- Effects of pressure, temperature and salinity on metabolic activity of anaerobic strains
- auteur
- Vanessa Barsotti, Sébastien Dupraz, Catherine Joulian, Fabienne Battaglia-Brunet, Claire Sergeant, Bernard Ollivier, Françis Garrido
- article
- 7th International Conference on High Pressure Bioscience and Biotechnology (HPBB2012), Oct 2012, Kyoto, Japan
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-
- titre
- Identification des liens entre communautés associées au cycle de l'azote par méthode d'enrichissement isotopique: Application aux zones d'interfaces aérobie/anaérobie des sédiments marins
- auteur
- Valerie Michotey
- article
- Identification des liens entre communautés associées au cycle de l'azote par méthode d'enrichissemen, Oct 2012, Clermont Ferrand, France
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-
- titre
- Diversity of gorgonian-associated bacterial communities in Northwestern Mediterranean Sea
- auteur
- Marie La Riviere, Marie Roumagnac, Joaquim Garrabou, M. Bally
- article
- The 14th International Symposium on Microbial Ecology (ISME), Aug 2012, Copenhague, Denmark
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-
- titre
- How to analyse bioluminescence time series from in situ observatories ? Example from high frequency records and real time data at the ANTARES site.
- auteur
- Severine Martini, Christian Tamburini, David Nerini
- article
- International symposium on bioluminescence and chemiluminescence (17th), May 2012, Guelph, Canada
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-
Book sections
- titre
- Les conditions de vie extrêmes sur la planète et exobiologie
- auteur
- Jean Luc Cayol, Bernard Ollivier, Didier Alazard, Ricardo Amils, Anne Godfroy, Florence Piette, Daniel Prieur
- article
- Ecologie microbienne, Presses Universitaires de Pau et des Pays de l'Adour, pp.363-408, 2012
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-
Other publications
- titre
- Bactéries de l'extrême.
- auteur
- Bernard Ollivier, Patrick Gregoire
- article
- 2012, pp.63
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-
- titre
- Les micro-rois du pétrole
- auteur
- Bernard Ollivier
- article
- 2012
- Accès au bibtex
-
Patents
- titre
- Culture et detection d'une Archaea méthanogène.
- auteur
- B Dridi, Marie Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Didier Raoult, Michel Drancourt
- article
- France, N° de brevet: N° H52 888 cas 8 PCT/MD. MIO:12-093. 2012
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-
2011
Journal articles
- titre
- Local sensing of global DNA topology: from crossover geometry to type II topoisomerase processivity
- auteur
- Y. Timsit
- article
- Nucleic Acids Research, 2011, 39 (20), pp.8665-8676
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-
- titre
- Cytosine, the double helix and DNA self-assembly
- auteur
- Y. Timsit, Peter Varnai
- article
- Journal of Molecular Recognition, 2011, 24 (2), pp.137-138
- Accès au bibtex
-
-
- titre
- Functional versus phylogenetic fingerprint analyses for monitoring hydrogen-producing bacterial populations in dark fermentation cultures
- auteur
- Marianne Quéméneur, Jérôme Hamelin, Eric Latrille, Jean-Philippe Steyer, Eric Trably
- article
- International Journal of Hydrogen Energy, 2011, 36 (6), pp.3870 - 3879. ⟨10.1016/j.ijhydene.2010.12.100⟩
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-
- titre
- Isolation and characterization of Thermanaerothrix daxensis gen. nov., sp nov., a thermophilic anaerobic bacterium pertaining to the phylum "Chloroflexi", isolated from a deep hot aquifer in the Aquitaine Basin
- auteur
- Patrick Gregoire, Marie Laure Fardeau, Manon Bartoli, Sophie Guasco, Francette Hamaide, Sandra Biasutti, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Bernard Ollivier
- article
- Systematic and Applied Microbiology, 2011, 34, pp.494-497. ⟨10.1016/j.syapm.2011.02.004⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- The chemical-in-mu well: a high-throughput technique for identifying solutes eliciting a chemotactic response in motile bacteria
- auteur
- Joshua Armitano, Claudine Baraquet, Valerie Michotey, Vincent Mejean, Cecile Jourlin-Castelli
- article
- Research in Microbiology, 2011, 162, pp.934-938. ⟨10.1016/j.resmic.2011.03.001⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Anaerobic ammonium oxidation mediated by Mn-oxides: from sediment to strain level
- auteur
- Cedric Javanaud, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Nicole Garcia, Pierre Anschutz, Mathieu Canton, Patricia Bonin
- article
- Research in Microbiology, 2011, 162, pp.848-857. ⟨10.1016/j.resmic.2011.01.011⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Acoustic and optical variations during rapid downward motion episodes in the deep north-western Mediterranean Sea
- auteur
- H. van Haren, I. Taupier-Letage, J.A. Aguilar, A. Albert, G. Anton, S. Anvar, M. Ardid, A.C. Assis Jesus, T. Astraatmadja, J.-J. Aubert, R. Auer, B. Baret, S. Basa, M. Bazzotti, V. Bertin, S. Biagi, C. Bigongiari, M. Bou-Cabo, M.C. Bouwhuis, A. Brown, J. Brunner, J. Busto, F. Camarena, A. Capone, G. Carminati, J. Carr, D. Castel, E. Castorina, V. Cavasinni, S. Cecchini, Ph. Charvis, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, H. Costantini, N. Cottini, P. Coyle, C. Curtil, G. de Bonis, M.P. Decowski, I. Dekeyser, Anne Deschamps, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, D. Drouhin, T. Eberl, U. Emanuele, J.-P. Ernenwein, S. Escoffier, F. Fehr, V. Flaminio, K. Fratini, U. Fritsch, J.-L. Fuda, G. Giacomelli, J.P. Gómez-González, K. Graf, G. Guillard, G. Halladjian, G. Hallewell, A.J. Heijboer, Y. Hello, J.J. Hernández-Rey, J. Hössl, M. de Jong, N. Kalantar-Nayestanaki, O. Kalekin, A. Kappes, U. Katz, P. Kooijman, C. Kopper, A. Kouchner, W. Kretschmer, R. Lahmann, P. Lamare, G. Lambard, G. Larosa, H. Laschinsky, Dominique Lefèvre, G. Lelaizant, G. Lim, D. Lo Presti, H. Loehner, S. Loucatos, F. Lucarelli, K. Lyons, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J.A. Martinez-Mora, G. Maurin, A. Mazure, M. Melissas, T. Montaruli, M. Morganti, L. Moscoso, H. Motz, C. Naumann, M. Neff, R. Ostasch, G. Palioselitis, G.E. Păvălaş, P. Payre, J. Petrovic, P. Piattelli, N. Picot-Clemente, C. Picq, R. Pillet, V. Popa, T. Pradier, E. Presani, C. Racca, A. Radu, C. Reed, G. Riccobene, C. Richardt, M. Rujoiu, G.V. Russo, F. Salesa, F. Schoeck, J.-P. Schuller, R. Shanidze, F. Simeone, M. Spurio, J.J.M. Steijger, Th. Stolarczyk, Christian Tamburini, L. Tasca, S. Toscano, B. Vallage, V. van Elewyck, M. Vecchi, P. Vernin, G. Wijnker, E. de Wolf, H. Yepes, D. Zaborov, J.D. Zornoza, J. Zúñiga, M. Anghinolfi
- article
- Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers, 2011, 58, pp.875-884. ⟨10.1016/j.dsr.2011.06.006⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Caldilinea tarbellica sp nov., a filamentous, thermophilic, anaerobic bacterium isolated from a deep hot aquifer in the Aquitaine Basin
- auteur
- Patrick Gregoire, Malek Bohli, Jean Luc Cayol, Manon Bartoli, Sophie Guasco, Karine Dubourg, Jean Cambar, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Marie Laure Fardeau, Bernard Ollivier
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2011, 61 (Part6), pp.1436-1441. ⟨10.1099/ijs.0.025676-0⟩
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-
Conference papers
- titre
- Quantification des activités du cycle de l'azote dans des sédiments soumis à des apports d'eau douce: impact sur l'état d'eutrophisation de l'écosystème
- auteur
- Imen Zaghmouri, Patricia Bonin, Valerie Michotey
- article
- Lagun'R, Mar 2011, Aix en Provence, France. pp.178-182
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- Apports de la génomique descriptive et fonctionnelle en écologie microbienne. Chapitre 18
- auteur
- Philippe Bertin, Valerie Michotey, Philippe Normand
- article
- Ecologie Microbienne : Microbiologie des milieux naturels et anthropisés, Presses Universitaires de Pau et des Pays de l'Adour, 1004 p., 2011, 2-35311-022-3 9782353110223
- Accès au bibtex
-
- titre
- Hydrocarbon degradation in coastal muddy areas and anoxic ecosystems (DHYVA project): Role of bacterial mechanisms and bioturbation effects on the biodisponibility of organic pollutants
- auteur
- Magalie Stauffert, Lionel Huang, Isabelle Vitte, Ronan Jézéquel, Cristiana Cravo-Laureau, Georges Stora, Christophe Pécheyran, Christine Cagnon, Franck Gilbert, Marisol Goñi, François-Xavier Merlin, David Amouroux, Philippe Cuny, Robert Duran
- article
- Ceccaldi, H.-J., Dekeyser, I., Girault, M., Stora, G. Global Change: Mankind-Marine Environment Interactions, Springer, pp.393-395, 2011, ISBN 978-90-481-8630-3
- Accès au bibtex
-
- titre
- Méthodes d'études des micro-organismes dans l'environnement. Chapitre 17
- auteur
- Fabien Joux, Jean-Claude Bertrand, Rutger de Wit, Vincent Grossi, Laurent Intertaglia, Philippe Lebaron, Valerie Michotey, Philippe Normand, Pierre Peyret, Patrick Raimbault, Christian Tamburini, Laurent Urios
- article
- Ecologie Microbienne : Microbiologie des milieux naturels et anthropisés, Presses Universitaires de Pau et des Pays de l'Adour, 1004 p., 2011, 2-35311-022-3 9782353110223
- Accès au bibtex
-
- titre
- Les cycles géochimiques. Chapitre 14
- auteur
- Jean-Claude Bertrand, Patricia Bonin, Pierre Caumette, Jean-Pierre Gattuso, Gérald Grégori, Remy Guyoneaud, Xavier Le Roux, Robert Matheron, Franck Poly
- article
- Ecologie Microbienne : Microbiologie des milieux naturels et anthropisés, Presses Universitaires de Pau et des Pays de l'Adour, 1004 p., 2011, 2-35311-022-3 9782353110223
- Accès au bibtex
-
2010
Journal articles
-
- titre
- Development and application of a functional CE-SSCP fingerprinting method based on [Fe–Fe]-hydrogenase genes for monitoring hydrogen-producing Clostridium in mixed cultures
- auteur
- Marianne Quéméneur, Jérôme Hamelin, Eric Latrille, Jean-Philippe Steyer, Eric Trably
- article
- International Journal of Hydrogen Energy, 2010, 35 (24), pp.13158 - 13167. ⟨10.1016/j.ijhydene.2010.07.076⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Differential stability of DNA crossovers in solution mediated by divalent cations
- auteur
- Péter Várnai, Y. Timsit
- article
- Nucleic Acids Research, 2010, 38 (12), pp.4163-4172
- Accès au bibtex
-
- titre
- Fatty acids as biomarkers to indicate main carbon sources of four major invertebrate families in a large River (the Allier, France)
- auteur
- Aurélie Descroix, Alexandre Bec, Gilles Bourdier, Denis Sargos, Jeremy Sauvanet, Benjamin Misson, Christian Desvilettes
- article
- Fundamental and Applied Limnology, 2010, 177 (1), pp.39 - 55. ⟨10.1127/1863-9135/2010/0177-0039⟩
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-
- titre
- Mesopelagic zone ecology and biogeochemistry - a synthesis
- auteur
- Carol Robinson, Deborah K. Steinberg, Thomas R. Anderson, Javier Aristegui, Craig A. Carlson, Jessica R. Frost, Jean-Francois Ghiglione, Santiago Hernandez-Leon, George A. Jackson, Rolf Koppelmann, Bernard Queguiner, Olivier Ragueneau, Fereidoun Rassoulzadegan, Bruce H. Robison, Christian Tamburini, Tsuneo Tanaka, Karen F. Wishner, Jing Zhang
- article
- Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography, 2010, 57, pp.1504-1518. ⟨10.1016/j.dsr2.2010.02.018⟩
- Accès au bibtex
-
-
- titre
- Effect of Oxygen and Redox Potential on Glucose Fermentation in Thermotoga maritima under Controlled Physicochemical Conditions
- auteur
- Raja Lakhal, Richard Auria, Sylvain Davidson, Bernard Ollivier, Alain Dolla, Moktar Hamdi, Yannick Combet-Blanc
- article
- International Journal of Microbiology, 2010, 2010, pp.1 - 10 / 896510. ⟨10.1155/2010/896510⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-
- titre
- Response of an archaeal community from anoxic coastal marine sediments to experimental petroleum contamination
- auteur
- Gilles Miralles, Monique Acquaviva, Jean Claude Bertrand, Philippe Cuny
- article
- Aquatic Microbial Ecology, 2010, 59, pp.25-31. ⟨10.3354/ame01379⟩
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-
2009
Journal articles
- titre
- Hydroxytyrosol from tyrosol using hydroxyphenylacetic acid-induced bacterial cultures and evidence of the role of 4-HPA 3-hydroxylase
- auteur
- Pierre-Pol Liebgott, Agnès Amouric, Alexia Comte, Jean Tholozan, Jean Lorquin
- article
- Research in Microbiology, 2009, 160 (10), pp.757 - 766. ⟨10.1016/j.resmic.2009.09.015⟩
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-
- titre
- Effect of O 2 concentrations on Sulfolobus solfataricus P2
- auteur
- Gwenola Simon, Jasper Walther, Nathalie Zabeti, Yannick Combet-Blanc, Richard Auria, John van Der Oost, Laurence Casalot
- article
- FEMS Microbiology Letters, 2009, 299 (2), pp.255 - 260. ⟨10.1111/j.1574-6968.2009.01759.x⟩
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-
- titre
- Nitrogen fixation in the western equatorial Pacific: Rates, diazotrophic cyanobacterial size class distribution, and biogeochemical significance
- auteur
- Sophie Bonnet, Isabelle C. Biegala, Pierre Dutrieux, Lia Slemons, Douglas Capone
- article
- Global Biogeochemical Cycles, 2009, 23 (3), pp.n/a - n/a. ⟨10.1029/2008GB003439⟩
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-
- titre
- The Role of Disordered Ribosomal Protein Extensions in the Early Steps of Eubacterial 50 S Ribosomal Subunit Assembly
- auteur
- Y. Timsit, Zahir Acosta, Frédéric Allemand, Claude Chiaruttini, Mathias Springer
- article
- International Journal of Molecular Sciences, 2009, 10 (3), pp.817-834. ⟨10.3390/ijms10030817⟩
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-
- titre
- Mass mortality in Northwestern Mediterranean rocky benthic communities: effects of the 2003 heat wave
- auteur
- J. Garrabou, R. Coma, N. Bensoussan, M. Bally, P. Chevaldonne, M. Cigliano, D. Diaz, Jean Georges Harmelin, M. C. Gambi, D. K. Kersting, Jean-Baptiste Ledoux, C. Lejeusne, C. Linares, C. Marschal, T. Perez, M. Ribes, J. C. Romano, E. Serrano, N. Teixido, O. Torrents, M. Zabala, Frederic Zuberer, C. Cerrano
- article
- Global Change Biology, 2009, 15, pp.1090-1103. ⟨10.1111/j.1365-2486.2008.01823.x⟩
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Conference papers
- titre
- SI-OC Interactions during degradation of the diatom Skeletonema marinoï
- auteur
- Brivaëla Moriceau, Madeleine Goutx, Cindy Lee, A. Robert Armstrong, Catherine Guigue, Christian Tamburini, Marie Duflos, Olivier Ragueneau
- article
- ASLO, 2009, Nice, France
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-
Poster communications
- titre
- Particle flux : control and processes affecting POM degradation
- auteur
- Madeleine Goutx, Brivaëla Moriceau, Catherine Guigue, Marc Garel, Christian Tamburini, Cindy Lee
- article
- ASLO Meeting, 2009, Nice, France
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2008
Journal articles
-
- titre
- Insights into the Musa genome: Syntenic relationships to rice and between Musa species
- auteur
- Magali Lescot, Pietro Piffanelli, Ana Ciampi, Manuel Ruiz, Guillaume Blanc, Jim Leebens-Mack, Felipe da Silva, Candice Mr Santos, Angélique d'Hont, Olivier Garsmeur, Alberto Vilarinhos, Hiroyuki Kanamori, Takashi Matsumoto, Catherine Ronning, Foo Cheung, Brian Haas, Ryan Althoff, Tammy Arbogast, Erin Hine, Georgios Pappas, Takuji Sasaki, Manoel Souza, Robert Ng Miller, Jean-Christophe Glaszmann, Christopher Town
- article
- BMC Genomics, 2008, 9 (1), ⟨10.1186/1471-2164-9-58⟩
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-
- titre
- The Genome of Borrelia recurrentis, the Agent of Deadly Louse-Borne Relapsing Fever, Is a Degraded Subset of Tick-Borne Borrelia duttonii
- auteur
- Magali Lescot, Stephane Audic, Catherine Robert, Thi Tien Nguyen, Guillaume Blanc, Sally Cutler, Patrick Wincker, Arnaud Couloux, Jean-Michel Claverie, Didier Raoult, Michel Drancourt
- article
- PLoS Genetics, 2008, 4 (9), pp.e1000185. ⟨10.1371/journal.pgen.1000185⟩
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-
- titre
- Metabolism of n-alkanes and n-alkenes by anaerobic bacteria: A summary
- auteur
- Vincent Grossi, Cristiana Cravo-Laureau, Remy Guyoneaud, Anthony Ranchou-Peyruse, Agnès Hirschler-Réa
- article
- Organic Geochemistry, 2008, 39 (8), pp.1197 - 1203. ⟨10.1016/j.orggeochem.2008.02.010⟩
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-
- titre
- A Single Banana Streak Virus Integration Event in the Banana Genome as the Origin of Infectious Endogenous Pararetrovirus
- auteur
- Philippe Gayral, Juan-Carlos Noa-Carrazana, Magali Lescot, Fabrice Lheureux, Benham Lockhart, Takashi Matsumoto, Pietro Piffanelli, Marie-Line Iskra-Caruana
- article
- Journal of Virology, 2008, 82 (13), pp.6697-6710. ⟨10.1128/JVI.00212-08⟩
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-
2007
Journal articles
- titre
- Bioconversion of tyrosol into hydroxytyrosol and 3,4-dihydroxyphenylacetic acid under hypersaline conditions by the new Halomonas sp. strain HTB24
- auteur
- Pierre-Pol Liebgott, Marc Labat, Laurence Casalot, Agnã¨s Amouric, Jean Lorquin
- article
- FEMS Microbiology Letters, 2007, 276 (1), pp.26 - 33. ⟨10.1111/j.1574-6968.2007.00896.x⟩
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-
- titre
- The 1.3 A resolution structure of the RNA tridecamer r(GCGUUUGAAACGC): Metal ion binding correlates with base unstacking and groove contraction
- auteur
- Y. Timsit, Sophie Bombard
- article
- RNA, 2007, 13 (12), pp.2098-2107
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-
Book sections
- titre
- Impact of the deep biosphere on CO2 storage performance
- auteur
- Bénédicte Ménez, Sébastien Dupraz, Emmanuelle Gérard, François Guyot, Céline Rommevaux, Maximilien Libert, Fabian Delorme, Christian Michel, Fabienne Battaglia-Brunet, Bruno Garcia, Denis Blanchet, Alain-Yves Huc, F. Haeseler, Phil M. Oger, Gilles Dromart, Bernard Ollivier, Michel Magot
- article
- Geotechnologien Science Reports, 9, pp.150-163, 2007, French-German Symposium on Geological storage of CO2
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-
2006
Journal articles
- titre
- Coexistence of two protein folding states in the crystal structure of ribosomal protein L20
- auteur
- Y. Timsit, Frédéric Allemand, Claude Chiaruttini, Mathias Springer
- article
- EMBO Reports, 2006, 7 (10), pp.1013-1018. ⟨10.1038/sj.embor.7400803⟩
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-
-
- titre
- Seasonal dynamics of bacterioplankton community structure at a coastal station in the western English Channel
- auteur
- I Mary, D G Cummings, P H Burkill, S D Archer, M V Zubkov, Isabelle C. Biegala
- article
- Aquatic Microbial Ecology, 2006, 42, pp.119-126. ⟨10.3354/ame042119⟩
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-
Poster communications
- titre
- Si-C interactions during degradation of the diatom Skeletonema costatum
- auteur
- Brivaëla Moriceau, Madeleine Goutx, Catherine Guigue, Cindy Lee, Marie Duflos, A. Robert Armstrong, Christian Tamburini, Bruno Charrìère
- article
- AGU conference, 2006, San Francisco, United States
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-
2005
Journal articles
- titre
- Molecular, Biochemical, and Physiological Approaches for Understanding the Ecology of Denitrification
- auteur
- Christelle Goréguès, Valerie Michotey, Patricia Bonin
- article
- Microbial ecology, 2005, 49 (2), pp.198-208
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-
-
- titre
- Hybridisation of picoeukaryotes by eubacterial probes is widespread in the marine environment
- auteur
- Isabelle C. Biegala, M Cuttle, M Mary, M. Zubkov
- article
- Aquatic Microbial Ecology, 2005, 41, pp.293 - 297. ⟨10.3354/ame041293⟩
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-
Patents
- titre
- Use of bacterium strains for the preparation of metallic biocatalysts, in particular for the preparation of palladium biocatalysts
- auteur
- Marc Rousset, Laurence Casalot, Pascale de Philip, A. Belaich, L. E. Macaskie, I. Mykheenko
- article
- France, Patent n° : 05 290 387.9. 2005
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-
2004
Journal articles
- titre
- Isolation of hydrocarbonoclastic denitrifying bacteria from berre microbial mats
- auteur
- Christelle Goréguès, Valerie Michotey, Patricia Bonin
- article
- Ophelia, 2004, 58 (3), pp.263-270
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-
- titre
- Annotation of a 95-kb Populus deltoides genomic sequence reveals a disease resistance gene cluster and novel class I and class II transposable elements
- auteur
- Magali Lescot, S. Rombauts, J. Zhang, S. Aubourg, C. Mathé, S. Jansson, P. Rouzé, W. Boerjan
- article
- TAG Theoretical and Applied Genetics, 2004, 109 (1), pp.10-22. ⟨10.1007/s00122-004-1621-0⟩
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-
2003
Journal articles
- titre
- Quantitative assessment of picoeukaryotes in the natural environment by using taxon-specific oligonucleotide probes in association with tyramide signal amplification-fluorescence in situ hybridization and flow cytometry.
- auteur
- Isabelle C. Biegala, Fabrice Not, Daniel Vaulot, Nathalie Simon
- article
- Applied and Environmental Microbiology, 2003
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-
- titre
- Glucose Fermentation by Propionibacterium microaerophilum : Effect of pH on Metabolism and Bioenergetic
- auteur
- Marina Koussémon, Yannick Combet-Blanc, Bernard Ollivier
- article
- Current Microbiology, 2003, 46 (2), pp.141 - 145. ⟨10.1007/s00284-002-3839-x⟩
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-
2002
Journal articles
- titre
- Aerobic and anaerobic metabolism of squalene by a denitrifying bacterium isolated from marine sediment
- auteur
- Abdelkrim Mouzdahir, Jean-Francois Rontani, Valerie Michotey, Patricia Bonin
- article
- Archives of Microbiology, 2002, 178 (4), pp.279-287. ⟨10.1007/s00203-002-0457-8⟩
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-
-
- titre
- Inducibility by pathogen attack and developmental regulation of the rice Ltp1 gene
- auteur
- Emmanuel Guiderdoni, Maria José Cordero, Florence Vignols, José Manuel Garcia-Garrido, Magali Lescot, Didier Tharreau, Donaldo Meynard, Nicole Ferrière, Jean-Loup Notteghem, Michel Delseny
- article
- Plant Molecular Biology, 2002, 49 (6), pp.679-695. ⟨10.1023/a:1015595100145⟩
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-
- titre
- Effect of auxin, cytokinin, and sucrose on cell cycle gene expression in Arabidopsis thaliana cell suspension cultures
- auteur
- Caroline Richard, Magali Lescot, Dirk Inzé, Lieven de Veylder
- article
- Plant Cell, Tissue and Organ Culture, 2002, 69 (2), pp.167-176. ⟨10.1023/a:1015241709145⟩
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-
-
- titre
- A Gibbs Sampling Method to Detect Overrepresented Motifs in the Upstream Regions of Coexpressed Genes
- auteur
- Gert Thijs, Kathleen Marchal, Magali Lescot, Stephane Rombauts, Bart de Moor, Pierre Rouzé, Yves Moreau
- article
- Journal of Computational Biology, 2002, 9 (2), pp.447-464. ⟨10.1089/10665270252935566⟩
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-
-
- titre
- PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences
- auteur
- Magali Lescot, Patrice Dehais, G. Thijs, K. Marchal, Y. Moreau, Y. van de Peer, P. Rouzé, S. Rombauts
- article
- Nucleic Acids Research, 2002, 30 (1), pp.325-327. ⟨10.1093/nar/30.1.325⟩
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-
- titre
- Characterization of three spiral-shaped purple nonsulfur bacteria isolated from coastal lagoon sediments, saline sulfur springs, and microbial mats: Emended description of the genus Roseospira and description of Roseospira marina sp. nov., Roseospira navarrensis sp. nov., and Roseospira thiosulfatophila sp. nov.
- auteur
- Remy Guyoneaud, S. Mouné, C. Eatock, V. Bothorel, Agnès Hirschler-Réa, J. Willison, Robert Duran, W. Liesack, R. Herbert, R. Matheron, Pierre Caumette
- article
- Archives of Microbiology, 2002, 178 (5), pp.315-324. ⟨10.1007/s00203-002-0454-y⟩
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-
- titre
- One-year seasonal survey of the chlorophyll photodegradation process in the northwestern Mediterranean Sea
- auteur
- Philippe Cuny, Jc Marty, J Chiaverini, I Vescovali, D Raphel, Jf Rontani
- article
- Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography, 2002, 49 (11), pp.1987-2005. ⟨10.1016/S0967-0645(02)00023-1⟩
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-
2001
Journal articles
- titre
- A higher-order background model improves the detection of promoter regulatory elements by Gibbs sampling
- auteur
- G. Thijs, Magali Lescot, K. Marchal, S. Rombauts, B. de Moor, P. Rouze, Y. Moreau
- article
- Bioinformatics, 2001, 17 (12), pp.1113-1122. ⟨10.1093/bioinformatics/17.12.1113⟩
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-
- titre
- Convergent Evolution of MutS and Topoisomerase II for Clamping DNA crossovers and stacked Holliday junctions
- auteur
- Y. Timsit
- article
- Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 2001, 19 (2), pp.215-218. ⟨10.1080/07391102.2001.10506733⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Propionibacterium microaerophilum sp. nov., a microaerophilic bacterium isolated from olive mill wastewater
- auteur
- Yannick Combet-Blanc, Pierre Thomas, Bernard Ollivier, Marina Koussémon, Jean-Luc Cayol, Jean-Louis Garcia, Bharat Patel
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2001, 51 (4), pp.1373 - 1382. ⟨10.1099/00207713-51-4-1373⟩
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-
- titre
- Hydration and structural alterations of A-DNA. Implications for the accuracy of DNA replication.
- auteur
- C Mayer, Y. Timsit
- article
- Cellular and Molecular Biology, 2001, 47 (5), pp.815-22
- Accès au bibtex
-
2000
Journal articles
- titre
- DNA Structure and Polymerase Fidelity: A New Role for A-DNA
- auteur
- Y. Timsit
- article
- Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 2000, 17 (sup1), pp.169-176. ⟨10.1080/07391102.2000.10506617⟩
- Accès au bibtex
-
1999
Journal articles
- titre
- DNA structure and polymerase fidelity 1 1Edited by T. Richmond
- auteur
- Y. Timsit
- article
- Journal of Molecular Biology, 1999, 293 (4), pp.835-853. ⟨10.1006/jmbi.1999.3199⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- ATCase activity, RNA:DNA ratio, gonad development stage, and egg production in the female copepod Calanus helgolandicus
- auteur
- Isabelle C. Biegala, R. Harris, J. Bergeron
- article
- Marine Biology, 1999, 135 (1), pp.1 - 10. ⟨10.1007/s002270050595⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Left-handed DNA Crossovers. Implications for DNA-DNA Recognition and Structural Alterations
- auteur
- Y. Timsit, Michal Shatzky-Schwartz, Zippora Shakked
- article
- Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 1999, 16 (4), pp.775-785. ⟨10.1080/07391102.1999.10508292⟩
- Accès au bibtex
-
1998
Journal articles
- titre
- Symmetry and chirality in topoisomerase II-DNA crossover recognition 1 1Edited by T. Richmond
- auteur
- B Timsit, Bertrand Duplantier, J Jannink, Jean-Louis Sikorav, Y. Timsit, Gérard Jannink
- article
- Journal of Molecular Biology, 1998, 284 (5), pp.1289-1299. ⟨10.1006/jmbi.1998.2281⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- DNA crossovers and type II DNA topoisomerases: a thermodynamical study 1 1Edited by T. Richmond
- auteur
- Y Sikorav, Bertrand Duplantier, Gérard Jannink, Y. Timsit, Jean-Louis Sikorav
- article
- Journal of Molecular Biology, 1998, 284 (5), pp.1279-1287. ⟨10.1006/jmbi.1998.2280⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Hydration and recognition of methylated CpG steps in DNA
- auteur
- C. Mayer-Jung, D. Moras, Y. Timsit
- article
- EMBO Journal, 1998, 17 (9), pp.2709-2718. ⟨10.1093/emboj/17.9.2709⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bacterial flora in the gut of Helix aspersa (Gastropoda Pulmonata): evidence for a permanent population with a dominant homolactic intestinal bacterium, Enterococcus casseliflavus
- auteur
- Maryvonne Charrier, Yannick Combet-Blanc, Bernard Ollivier
- article
- Canadian Journal of Microbiology, 1998, 44 (1), pp.20 - 27. ⟨10.1139/w97-120⟩
- Accès au bibtex
-
1997
Journal articles
- titre
- Effect of cytosine methylation on DNA-DNA recognition at CpG steps
- auteur
- Claudine Mayer-Jung, Dino Moras, Y. Timsit
- article
- Journal of Molecular Biology, 1997, 270 (3), pp.328-335. ⟨10.1006/jmbi.1997.1137⟩
- Accès au bibtex
-
1996
Journal articles
- titre
- Cruciform structures and functions.
- auteur
- Y. Timsit, D. Moras
- article
- Quarterly Reviews of Biophysics, 1996, 29 (4), pp.279-307
- Accès au bibtex
-
1995
Journal articles
- titre
- Self-fitting and Self-modifying Properties of theB-DNA Molecule
- auteur
- Y. Timsit, Dino Moras
- article
- Journal of Molecular Biology, 1995, 251 (5), pp.629-647. ⟨10.1006/jmbi.1995.0461⟩
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- DNA self-fitting
- auteur
- Y. Timsit
- article
- Proceeding of the eleventh conversation, state university of New York, Albany, eds R. Sarma and M. Sarma, Adenine press., 1995
- Accès au bibtex
-
1994
Journal articles
- titre
- DNA self-fitting: the double helix directs the geometry of its supramolecular assembly.
- auteur
- Y. Timsit, D. Moras
- article
- EMBO Journal, 1994, 13 (12), pp.2737-46
- Accès au bibtex
-
1992
Journal articles
- titre
- Crystallization of DNA.
- auteur
- Y. Timsit, D. Moras
- article
- Methods in Enzymology, 1992, 211, pp.409-29
- Accès au bibtex
-
1991
Journal articles
- titre
- Base-pairing shift in the major groove of (CA)n tracts by B-DNA crystal structures
- auteur
- Y. Timsit, Eric Vilbois, Dino Moras
- article
- Nature, 1991, 354 (6349), pp.167-170. ⟨10.1038/354167a0⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Groove-backbone interaction in B-DNA. Implication for DNA condensation and recombination.
- auteur
- Y. Timsit, D. Moras
- article
- Journal of Molecular Biology, 1991, 221 (3), pp.919-40
- Accès au bibtex
-
1989
Journal articles
- titre
- Unusual helical packing in crystals of DNA bearing a mutation hot spot
- auteur
- R Timsit, Eric Westhof, Robert P Fuchs, Dino Moras, Y. Timsit
- article
- Nature, 1989, 341 (6241), pp.459-462. ⟨10.1038/341459a0⟩
- Accès au bibtex
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