Publications HAL

2022

Journal articles

titre
WoT Search Engine based on Multi Agent System: A Conceptual Framework
auteur
Mili Seif Eddine, Vincent Rodin
article
International Journal of Interactive Mobile Technologies (iJIM), 2022, 16 (05), pp.49-61. ⟨10.3991/ijim.v16i05.27901⟩
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titre
Smart and Dynamic Indoor Evacuation System (SDIES)
auteur
Khadidja Bouchenga, Bouabdellah Kechar, Vincent Rodin
article
International Journal of Distributed Artificial Intelligence, 2022, 14 (1), pp.1-23. ⟨10.4018/IJDAI.304896⟩
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titre
An Hybrid Model for Rectal Tumour Response Prediction during Radiotherapy
auteur
Sena Apeke, Laurent Gaubert, Nicolas Boussion, Dimitris Visvikis, Olivier Saut, Thierry Colin, Philippe Lambin, Vincent Rodin, Pascal Redou
article
Open Journal of Biophysics, 2022, 12 (04), pp.245-264. ⟨10.4236/ojbiphy.2022.124012⟩
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Poster communications

titre
Increasing the autonomy of an underwater ROV
auteur
Marko Vukšić, Tonko Kovacevic, Barbara Džaja, Predrag Đukić, Slaven Šitić, Hai Nam Tran, Vincent Rodin, Laurent Lemarchand, Valérie-Anne Nicolas, Alain Plantec, Stéphane Rubini, Frank Singhoff
article
Sea Tech Week, Sep 2022, Brest, France
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https://hal.univ-brest.fr/hal-03778490/file/vuksic22.pdf BibTex

2021

Conference papers

titre
Evaluation and Optimization of Underwater Image Restoration Algorithms
auteur
Alan Le Boudec, Artur Mkrtchyan, Barbara Džaja, Vincent Rodin, Hai Nam Tran
article
International Conference on Smart and Sustainable Technologies (SpliTech), Sep 2021, Split, Croatia
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https://hal.science/hal-03406203/file/1.Evaluation_and_Optimization_of_Underwater_Image_Restoration_Algorithms.pdf BibTex
titre
Interpretable Machine Learning for Meteorological Data
auteur
Ngoan Thanh Trieu, Bernard Pottier, Vincent Rodin, Hiep Xuan Huynh
article
ICMLSC '21: 2021 The 5th International Conference on Machine Learning and Soft Computing, Jan 2021, Sanya, China. pp.11-17, ⟨10.1145/3453800.3453803⟩
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2020

Conference papers

titre
An Interruptible Task Allocation Model : Application to a Honey Bee Colony Simulation
auteur
Thomas Alves, Jérémy Rivière, Cédric Alaux, Yves Le Conte, Frank Singhoff, Thierry Duval, Vincent Rodin
article
PAAMS 2020: 18th International Conference on Practical Applications of Agents and Multi-Agent Systems, Oct 2020, L'aquila, Italy. pp.3-15, ⟨10.1007/978-3-030-49778-1_1⟩
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titre
Modèle d'Interruption pour la Répartition des Tâches : Application à une simulation de colonie d'abeilles
auteur
Thomas Alves, Jérémy Rivière, Cédric Alaux, Yves Le Conte, Frank Singhoff, Thierry Duval, Vincent Rodin
article
Rencontres des Jeunes Chercheur·ses en Intelligence Artificielle (RJCIA 2020 @ PFIA), Jun 2020, Angers, France
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https://hal.science/hal-03211869/file/Alves_RJCIA_Soumission16.pdf BibTex

2019

Conference papers

titre
Multiscale Geographic Exploration, Observation, Simulation, and Representation
auteur
My Thu Thao Truong, Samar Syed Yazdani, Bernard Pottier, Vincent Rodin, Xuan Hiep Huynh
article
13th International Conference - Mathematics, Actuarial, Computer Science & Statistics (MACS 13), IEEE XPlore, Dec 2019, Karachi, Pakistan. ⟨10.1109/MACS48846.2019.9024777⟩
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titre
Immersive and interactive visualisation of a virtual honey bee colony
auteur
Thomas Alves, Jérémy Rivière, Vincent Rodin, Thierry Duval
article
EuroVR 2019: International Conference on Virtual Reality and Mixed Reality, Oct 2019, Tallinn, Estonia. ⟨10.1007/978-3-030-31908-3_23⟩
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https://hal.science/hal-02297300/file/conference_041818_auteurs.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
Multi-Scale Modeling and Oxygen Impact on Tumor Temporal Evolution: Application on Rectal Cancer During Radiotherapy
auteur
Sena Apeke, Laurent Gaubert, Nicolas Boussion, Philippe Lambin, Dimitris Visvikis, Vincent Rodin, Pascal Redou
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2018, 37 (4), pp.871-880. ⟨10.1109/TMI.2017.2771379⟩
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Conference papers

titre
Recrutement et auto-organisation : Vers un modèle multi-agent complet d’une colonie d’abeilles
auteur
Jérémy Rivière, Cédric Alaux, Yves Le Conte, Yves Layec, André Lozac'H, Vincent Rodin, Frank Singhoff
article
26èmes Journées Francophones sur les Systèmes Multi-Agents (JFSMA'2018), Oct 2018, Métabief, France
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https://hal.science/hal-01898549/file/Recrutement%20et%20auto-organisation%20-%20Vers%20un%20mod%C3%A8le%20multi-agent%20complet%20d%27une%20colonie%20d%27abeilles.pdf BibTex
titre
Toward a Complete Agent-Based Model of a Honeybee Colony
auteur
Jérémy Rivière, Cédric Alaux, Yves Le Conte, Yves Layec, André Lozac'H, Vincent Rodin, Frank Singhoff
article
Highlights of Practical Applications of Agents, Multi-Agent Systems, and Complexity: The PAAMS Collection, Jun 2018, Toledo, Spain. ⟨10.1007/978-3-319-94779-2_42⟩
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https://hal.science/hal-01826153/file/Toward%20a%20Complete%20Agent-Based%20Model%20of%20a%20Honeybee%20Colony.pdf BibTex

Book sections

titre
Toward a Complete Agent-Based Model of a Honeybee Colony
auteur
Jeremy Riviere, Cédric Alaux, Yves Le Conte, Yves Layec, André Lozac’h, Vincent Rodin, Frank Singhoff
article
Highlights of Practical Applications of Agents, Multi-Agent Systems, and Complexity: The PAAMS Collection : International Workshops of PAAMS 2018, Toledo, Spain, June 20–22, 2018, Proceedings, 887 (Chapter 42), Springer International Publishing Ag, 552 p. - XXIII, 2018, Communications in Computer and Information Science, 978-3-319-94778-5. ⟨10.1007/978-3-319-94779-2_42⟩
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2017

Book sections

titre
Modelling and Simulating Complex Systems in Biology: introducing NetBioDyn
auteur
Pascal Ballet, Jérémy Rivière, Alain Pothet, Michaël Théron, Karine Pichavant, Frank Abautret, Alexandra Fronville, Vincent Rodin
article
Multi-Agent-Based Simulations Applied to Biological and Environmental Systems, IGI Global, 2017, 978-1-5225-1756-6. ⟨10.4018/978-1-5225-1756-6.ch006⟩
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https://hal.science/hal-01407520/file/Chapter6_Windows.pdf BibTex

2016

Poster communications

titre
NetBioDyn, a smart Agent-Based software to intuitively model and simulate complex biological systems
auteur
Jérémy Rivière, Pascal Ballet, Vincent Rodin
article
Conference on Complex Systems (CCS), Sep 2016, Amsterdam, Netherlands. , 2016
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https://hal.science/hal-01407523/file/Poster.pdf BibTex

2015

Conference papers

titre
3D individual based model for simultaneous growth and interaction of L. Monocytogenes and lactic acid bacteria
auteur
Gireg Desmeulles, Fabrice Harrouet, Dominique Thuault, Véronique Huchet, Pascal Redou, Laurent Gaubert, Guillaume Longelin Péron, Pascal Ballet, Vincent Rodin
article
9th International Conference on Predictive Modelling in Food (ICPMF9), Sep 2015, Rio de Janeiro, Brazil. pp.11-12
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https://hal.science/hal-01339095/file/ICPMF9.pdf BibTex

Poster communications

titre
Simulation of Multicellular Systems
auteur
Pascal Ballet, Alexandra Fronville, Anne Jeannin-Girardon, Jérémy Rivière, Vincent Rodin, Abdoulaye Sarr
article
EURASC 2015, Oct 2015, Brest, France. , 2015
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2014

Conference papers

titre
Morphogenesis Model for Systematic Simulation of Forms’ Co-evolution with Constraints: Application to Mitosis
auteur
Abdoulaye Sarr, Alexandra Fronville, Vincent Rodin
article
Third International Conference, TPNC 2014, Dec 2014, Granada, Spain. ⟨10.1007/978-3-319-13749-0_20⟩
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titre
Evolutions viables de formes par application de mécanismes cellulaires.
auteur
Abdoulaye Sarr, Alexandra Fronville, Laurent Lemarchand, Pascal Ballet, Vincent Rodin
article
34ème séminaire de la société francophone de biologie théorique (SFBT), May 2014, SFBT, France
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Book sections

titre
French Flag Tracking by Morphogenetic Simulation Under Developmental Constraints
auteur
Abdoulaye Sarr, Alexandra Fronville, Pascal Ballet, Vincent Rodin
article
Springer International Publishing. Lecture Notes in Computer Science, , pp 90-106, 2014, Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics, 978-3-319-09041-2. ⟨10.1007/978-3-319-09042-9_7⟩
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2013

Journal articles

titre
A Software Architecture for Multi-Cellular System Simulations on Graphics Processing Units
auteur
Anne Jeannin-Girardon, Pascal Ballet, Vincent Rodin
article
Acta Biotheoretica, 2013, 61 (3), pp.317-327. ⟨10.1007/s10441-013-9187-3⟩
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Conference papers

titre
An Efficient Biomechanical Cell Model to Simulate Large Multi-cellular Tissue Morphogenesis: Application to Cell Sorting Simulation on GPU
auteur
Anne Jeannin-Girardon, Pascal Ballet, Vincent Rodin
article
TPNC 2013, 2nd International Conference on the Theory and Practice of Natural Computing, Dec 2013, Cáceres, Spain. pp.96-107, ⟨10.1007/978-3-642-45008-2_8⟩
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BibTex
titre
In silico study of mechanical stresses at the cellular level during tissue development.
auteur
Anne Jeannin-Girardon, Pascal Ballet, Vincent Rodin
article
BIBE 2013, 13th IEEE International Conference on BioInformatics and BioEngineering, Nov 2013, Chania, Greece. pp.1-4, ⟨10.1109/BIBE.2013.6701641⟩
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BibTex
titre
French Flag Tracking by Morphogenetic Simulation Under Developmental Constraints - Short version
auteur
Abdoulaye Sarr, Alexandra Fronville, Pascal Ballet, Vincent Rodin
article
CIBB 2013, 10th International Meeting on Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics, Jun 2013, Nice, France
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BibTex

Book sections

titre
Une approche multi-agent pour la simulation en biologie cellulaire.
auteur
Pascal Ballet, Alain Pothet, Gradimir Misevic, Anne Jeannin-Girardon, Alexandra Fronville, Vincent Rodin
article
Matériologiques. Le vivant discret et continu, Editions Matériologiques, pp.155-194, 2013, Sciences & Philosophie, 978-2-919694-23-5
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2012

Conference papers

titre
Mutational analysis-inspired algorithms for cells self-organization towards a dynamic under viability constraints
auteur
Alexandra Fronville, Abdoulaye Sarr, Pascal Ballet, Vincent Rodin
article
Self-Adaptive and Self-Organizing Systems (SASO), 2012 IEEE Sixth International Conference on, Sep 2012, Lyon, France. pp.181--186, ⟨10.1109/SASO.2012.15⟩
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https://hal.science/hal-00781080/file/bare_conf.pdf BibTex
titre
Usage de la simulation et de l'analyse morphologique pour l'étude de la dynamique cellulaire.
auteur
Alexandra Fronville, Abdoulaye Sarr, Pascal Ballet, Vincent Rodin
article
32ème séminaire de la société francophone de biologie théorique (SFBT), Jun 2012, St Flour, France
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BibTex

2011

Journal articles

titre
An efficient algorithm based on weak synchronization for distributed in virtuo biological experiments
auteur
Vincent Rodin, Gireg Desmeulles, Pascal Ballet, Pascal Redou, Christophe Le Gal
article
Multiagent and Grid Systems - An International Journal of Cloud Computing , 2011, 7 (4-5), pp.159-182. ⟨10.3233/MGS-2011-0173⟩
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https://hal.univ-brest.fr/hal-00668699/file/V_Rodin_MAGS2011.pdf BibTex

2010

Journal articles

titre
Multilayer cell proliferation with an adaptation of cellular Potts model
auteur
S. Tripodi, Pascal Ballet, Vincent Rodin
article
Journal of Biological Physics and Chemistry, 2010, 10 (1), pp.33-38
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BibTex
titre
Absolute Stability of Chaotic Asynchronous Multi-Interactions Schemes for Solving ODE
auteur
Pascal Redou, Laurent Gaubert, Gireg Desmeulles, Pierre-Antione Béal, Christophe Le Gal, Vincent Rodin
article
Computer Modeling in Engineering and Sciences, 2010, 70 (1), pp.11-40
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https://hal.science/hal-00823479/file/CMES201011261788_11081.pdf BibTex
titre
Absolute Stability of Chaotic Asynchronous Multi-Interactions Schemes for Solving ODE
auteur
Pascal Redou, Laurent Gaubert, Gireg Desmeulles, Vincent Rodin, Pierre-Antoine Béal, Christophe Le Gal
article
Computer Modeling in Engineering and Sciences, 2010, 70 (1), pp.11-40
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https://hal.science/hal-00861381/file/v1.pdf BibTex
titre
Absolute Stability of Chaotic Asynchronous Multi-Interactions Schemes for Solving ODE
auteur
Pascal Redou, L. Gaubert, Gireg Desmeulles, P.-A. Béal, Christophe Le Gal, Vincent Rodin
article
Computer Modeling in Engineering and Sciences, 2010, 70 (1), pp. 11-40. ⟨10.3970/cmes.2010.070.011⟩
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BibTex

Conference papers

titre
Self-organization of a virtual multicellular organism by adding a shape model in the Cellular Potts Model.
auteur
S. Tripodi, Pascal Ballet, Vincent Rodin
article
Twelfth International Conference on the Synthesis and Simulation of Living Systems - ALIFE XII ., Aug 2010, Odense-Denmark., Denmark. pp.249-256
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BibTex
titre
A new PBTK modelling method based on multi interaction paradigm
auteur
Gireg Desmeulles, Vincent Ferec, Pascal Redou, Vincent Rodin, Alain-Claude Roudot
article
FOODSIM'2010, Jun 2010, Braganca, Portugal. pp.154-157
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https://hal.science/hal-00932802/file/sortie.pdf BibTex
titre
A new PBTK modelling method based on multi-interaction paradigm
auteur
Gireg Desmeulles, V. Ferec, Pascal Redou, Vincent Rodin, Alain-Claude Roudot
article
FOODSIM'2010, Food Simulation Conference, Jun 2010, Braganca, Portugal. pp.154-157
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BibTex

Book sections

titre
Computational Energetic Model of Morphogenesis Based on Multi-agent Cellular Potts Model
auteur
S. Tripodi, Pascal Ballet, Vincent Rodin
article
Advances in Computational Biology, 680 (7), Springer, pp.685-692, 2010, Advances in Experimental Medicine and Biology, ⟨10.1007/978-1-4419-5913-3_76⟩
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BibTex

2009

Journal articles

titre
MorphoBlock Programming: a way to model and simulate morphogenesis of multicellular organisms.
auteur
Pascal Ballet, S. Tripodi, Vincent Rodin
article
Journal of Biological Physics and Chemistry, 2009, 9 (1), pp. 37-44
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BibTex
titre
In virtuo Experiments Based on the Multi-Interaction System Framework: the RéISCOP Meta-Model.
auteur
Gireg Desmeulles, Stéphane Bonneaud, Pascal Redou, Vincent Rodin, Jacques Tisseau
article
Computer Modeling in Engineering and Sciences, 2009, 47 (3), pp.299-330. ⟨10.3970/cmes.2009.047.299⟩
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BibTex

2007

Conference papers

titre
Formal validation of asynchronous interaction-agents algorithms for reaction-diffusion problems
auteur
Pascal Redou, Kerdélo Sébastien, Gireg Desmeulles, Jean-François Abgrall, Vincent Rodin, Jacques Tisseau
article
PADS'07, 21st International Workshop on Principles of Advanced and Distributed Simulation, Jun 2007, San Diego, United States. pp.26-34
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https://hal.science/hal-00861413/file/redou-interactionagents.pdf BibTex

2006

Journal articles

titre
The Virtual Reality applied to the biology understanding: the in virtuo experimentation
auteur
Gireg Desmeulles, Gabriel Querrec, Pascal Redou, Sébastien Kerdelo, Laurent Misery, Vincent Rodin, Jacques Tisseau
article
Expert Systems with Applications, 2006, 30 (1), pp.82-92. ⟨10.1016/j.eswa.2005.09.051⟩
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https://hal.science/hal-00932756/file/iv_esa.pdf BibTex

2005

Journal articles

titre
Reaction agent: first mathematical validation of a multi-agent system for dynamical biochemical kinetics
auteur
Pascal Redou, Sébastien Kerdelo, Christophe Le Gal, Gabriel Querrec, Vincent Rodin, Jean-François Abgrall, Jacques Tisseau
article
Lecture Notes in Computer Science, 2005, 3808, pp.156-166
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https://hal.science/hal-00875478/file/agentreaction.pdf BibTex