Publications HAL du labo/EPI AME;M2E de la collection UMR5240

2025

titre
Bilayer-Forming Lipids Enhance Archaeal Monolayer Membrane Stability
auteur
Margot Saracco, Philippe Schaeffer, Maxime Tourte, Sonja-Verena Albers, Yoann Louis, Judith Peters, Bruno Demé, Stephane Fontanay, Philippe M Oger
article
International Journal of Molecular Sciences, 2025, 26 (7), pp.3045. ⟨10.3390/ijms26073045⟩
DOI
DOI : 10.3390/ijms26073045
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2024

titre
New insights into thermostable iron-containing/activated alcohol dehydrogenases from hyperthermophiles
auteur
Yushan Lin, Youcheng Yin, Phil M. Oger, Yong Gong, Xiaojian Zhou, Yanchao Bai, Likui Zhang
article
International Journal of Biological Macromolecules, 2024, 275, pp.133707. ⟨10.1016/j.ijbiomac.2024.133707⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.ijbiomac.2024.133707
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titre
Insights in extreme microbiology
auteur
Andreas Teske, Phil M. Oger
article
Frontiers in Microbiology, 2024, 15, pp.1473691. ⟨10.3389/fmicb.2024.1473691⟩
DOI
DOI : 10.3389/fmicb.2024.1473691
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https://hal.science/hal-04677878/file/2024%20Teske%20et%20Oger%20Front%20Microbiol.pdf BibTex
titre
Microbial diversity and secondary metabolism potential in relation to dark alterations in Paleolithic Lascaux Cave
auteur
Zélia Bontemps, Danis Abrouk, Sita Venier, Pierre Vergne, Serge Michalet, Gilles Comte, Yvan Moënne-Loccoz, Mylène Hugoni
article
npj Biofilms and Microbiomes, 2024, 10 (1), pp.121. ⟨10.1038/s41522-024-00589-3⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41522-024-00589-3
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https://hal.science/hal-04802455/file/s41522-024-00589-3.pdf BibTex
titre
Lineage-dependent partitioning of activities in chemoclines defines Woesearchaeota ecotypes in an extreme aquatic ecosystem
auteur
Lilian A Cloarec, Thomas Bacchetta, Maxime Bruto, Christophe Leboulanger, Vincent Grossi, Céline Brochier-Armanet, Jean-Pierre Flandrois, Adrian Zurmely, Cécile Bernard, Marc Troussellier, Hélène Agogué, Magali Ader, Christine Oger-Desfeux, Philippe M Oger, Adrien Vigneron, Mylène Hugoni
article
Microbiome, 2024, 12 (1), pp.249. ⟨10.1186/s40168-024-01956-0⟩
DOI
DOI : 10.1186/s40168-024-01956-0
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https://hal.science/hal-04811121/file/2024_Cloarec_Microbiome.pdf BibTex
titre
Biochemical characterization and mutational analysis of the NurA protein from the hyperthermophilic euryarchaeon Thermococcus barophilus Ch5
auteur
Guangyu Ma, Tan Lin, Peng Cao, Phil M. Oger, Kunming Dong, Li Miao, Likui Zhang
article
Research in Microbiology, 2024, pp.104189. ⟨10.1016/j.resmic.2024.104189⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.resmic.2024.104189
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https://hal.science/hal-04480971/file/Revised%20Manuscript.pdf BibTex
titre
Impact of Isotopic Exchange on Hydrated Protein Dynamics Revealed by Polarized Neutron Scattering
auteur
Agathe Nidriche, Martine Moulin, Phil M. Oger, J. Ross Stewart, Lucile Mangin-Thro, Wolfgang Schmidt, Gerald Kneller, Judith Peters
article
PRX Life, 2024, 2 (1), pp.013005. ⟨10.1103/prxlife.2.013005⟩
DOI
DOI : 10.1103/prxlife.2.013005
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https://hal.science/hal-04481004/file/2024%20Nidriche%20PRX%20Life.pdf BibTex
titre
Contributions of DNA Sequencing Technologies to the Integrative Monitoring of Karstic Caves
auteur
Zélia Bontemps, Yvan Moënne-Loccoz, Mylène Hugoni
article
Applied Sciences, 2024, 14 (20), pp.9438. ⟨10.3390/app14209438⟩
DOI
DOI : 10.3390/app14209438
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titre
Transcriptomic insights into the dominance of two phototrophs throughout the water column of a tropical hypersaline-alkaline crater lake (Dziani Dzaha, Mayotte)
auteur
Sébastien Duperron, Sébastien Halary, Jean-Pierre Bouly, Théotime Roussel, Mylène Hugoni, Maxime Bruto, Phil M. Oger, Charlotte Duval, Anthony C. Woo, Didier Jézéquel, Magali Ader, Christophe Leboulanger, Hélène Agogué, Vincent Grossi, Marc Troussellier, Cécile Bernard
article
Frontiers in Microbiology, 2024, 15, pp.1368523. ⟨10.3389/fmicb.2024.1368523⟩
DOI
DOI : 10.3389/fmicb.2024.1368523
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https://hal.inrae.fr/hal-04582518/file/2024_Duperron_Front_Microbiol.pdf BibTex
titre
Haloarchaea as Promising Chassis to Green Chemistry
auteur
Emma Bonnaud, Phil M. Oger, Avigaël Ohayon, Yoann Louis
article
Microorganisms, 2024, 12 (8), pp.1738. ⟨10.3390/microorganisms12081738⟩
DOI
DOI : 10.3390/microorganisms12081738
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https://hal.science/hal-04677423/file/2024%20Bonnaud%20Microorganisms.pdf BibTex
titre
Stochastic and deterministic assembly processes of microbial communities in relation to natural attenuation of black stains in Lascaux Cave
auteur
Zélia Bontemps, Yvan Moënne-Loccoz, Mylène Hugoni
article
mSystems, 2024, 9 (2), ⟨10.1128/msystems.01233-23⟩
DOI
DOI : 10.1128/msystems.01233-23
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https://hal.inrae.fr/hal-04523218/file/2024_Bontemps_mSystems.pdf BibTex
titre
Seismic events as potential drivers of the microbial community structure and evolution in a paleo-ocean analog
auteur
Adrien Vigneron, Lilian Cloarec, Hélène Agogué, Cécile Bernard, Sébastien Duperron, Christophe Leboulanger, Claire Carré, Patrice Got, Cécile Roques, Marc Troussellier, Didier Jézéquel, Alexis Groleau, Magali Ader, Phil M. Oger, Mylène Hugoni
article
Communications Earth & Environment, 2024, 5 (1), pp.504. ⟨10.1038/s43247-024-01615-0⟩
DOI
DOI : 10.1038/s43247-024-01615-0
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2023

titre
Effects of Crowding and Cosolutes on Biomolecular Function at Extreme Environmental Conditions
auteur
Judith Peters, Rosario Oliva, Antonino Caliò, Phil M. Oger, Roland Winter
article
Chemical Reviews, 2023, 123 (23), pp.13441-13488. ⟨10.1021/acs.chemrev.3c00432⟩
DOI
DOI : 10.1021/acs.chemrev.3c00432
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https://hal.science/hal-04296968/file/Review_final_revision_II.pdf BibTex
titre
Biochemical and mutational studies of an endonuclease V from the hyperthermophilic crenarchaeon Sulfolobus islandicus REY15A
auteur
Youcheng Yin, Jingru Shi, Likui Zhang, Qing Liu, Yong Gong, Phil M. Oger, Xipeng Liu
article
World Journal of Microbiology and Biotechnology, 2023, 39 (4), pp.90. ⟨10.1007/s11274-023-03526-2⟩
DOI
DOI : 10.1007/s11274-023-03526-2
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titre
Bradyrhizobium commune sp. nov., isolated from nodules of a wide range of native legumes across the Australian continent
auteur
Bénédicte Lafay, Elina Coquery, Phil M. Oger
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2023, 73 (7), pp.005971. ⟨10.1099/ijsem.0.005971⟩
DOI
DOI : 10.1099/ijsem.0.005971
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https://hal.science/hal-04191550/file/ijsem005971_ms.pdf BibTex
titre
Phytoplanktonic species in the haloalkaline Lake Dziani Dzaha select their archaeal microbiome
auteur
Maxime Bruto, Phil M. Oger, Patrice Got, Cécile Bernard, Delphine Melayah, Lilian Cloarec, Charlotte Duval, Arthur Escalas, Sébastien Duperron, Ludivine Guigard, Christophe Leboulanger, Magali Ader, Gerard Sarazin, Didier Jézéquel, Hélène Agogué, Marc Troussellier, Mylène Hugoni
article
Molecular Ecology, 2023, 32 (24), pp.6824-6838. ⟨10.1111/mec.17179⟩
DOI
DOI : 10.1111/mec.17179
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https://hal.science/hal-04277813/file/Bruto%20et%20al_revised_revision2_HAL.pdf BibTex
titre
Incorporation and localisation of alkanes in a protomembrane model
auteur
Loreto Misuraca, Josephine Loricco, Phil M. Oger, Judith Peters, Bruno Demé
article
Biochimica et Biophysica Acta:Biomembranes, 2023, 1865 (3), pp.184119. ⟨10.1016/j.bbamem.2023.184119⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.bbamem.2023.184119
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https://hal.science/hal-04297309/file/Paper4_version4.pdf BibTex
titre
Biochemical characterization and mutational studies of endonuclease Q from the hyperthermophilic euryarchaeon Thermococcus gammatolerans
auteur
Mai Wu, Guangyu Ma, Yushan Lin, Phil M. Oger, Peng Cao, Likui Zhang
article
DNA Repair, 2023, 126, pp.103490. ⟨10.1016/j.dnarep.2023.103490⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.dnarep.2023.103490
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https://hal.science/hal-04297134/file/2023%20Wu%20DNA%20Rep%20EndoQ%20Tgammatolerans.pdf BibTex
titre
Dark-zone alterations expand throughout Paleolithic Lascaux Cave despite spatial heterogeneity of the cave microbiome
auteur
Zélia Bontemps, Claire Prigent-Combaret, Alice Guillmot, Mylène Hugoni, Yvan Moënne-Loccoz
article
Environmental Microbiome, 2023, 18 (1), pp.31. ⟨10.1186/s40793-023-00488-8⟩
DOI
DOI : 10.1186/s40793-023-00488-8
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titre
Microscale dynamics of dark zone alterations in anthropized karstic cave shows abrupt microbial community switch
auteur
Zélia Bontemps, Mylène Hugoni, Yvan Moënne-Loccoz
article
Science of the Total Environment, 2023, 862, pp.160824. ⟨10.1016/j.scitotenv.2022.160824⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.scitotenv.2022.160824
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titre
The membrane regulator squalane increases membrane rigidity under high hydrostatic pressure in archaeal membrane mimics
auteur
Josephine Loricco, Ingo Hoffmann, Antonino Caliò, Judith Peters
article
Soft Matter, 2023, 19 (33), pp.6280-6286. ⟨10.1039/d3sm00352c⟩
DOI
DOI : 10.1039/d3sm00352c
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titre
Thermostable DNA ligases from hyperthermophiles in biotechnology
auteur
Jingru Shi, Phil M. Oger, Peng Cao, Likui Zhang
article
Frontiers in Microbiology, 2023, 14, ⟨10.3389/fmicb.2023.1198784⟩
DOI
DOI : 10.3389/fmicb.2023.1198784
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https://hal.science/hal-04297154/file/2023%20Shi%20Front%20Microbiol%20DNA%20ligases%20review.pdf BibTex
titre
Molecular Rearrangements in Protomembrane Models Probed by Laurdan Fluorescence
auteur
Loreto Misuraca, Roland Winter, Bruno Demé, Phil M. Oger, Judith Peters
article
Membranes, 2023, 13 (4), pp.386. ⟨10.3390/membranes13040386⟩
DOI
DOI : 10.3390/membranes13040386
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https://hal.science/hal-04297292/file/2023%20Misuraca%20Membranes-13-00386.pdf BibTex
titre
The non-ribosomal peptide synthetase-independent siderophore (NIS) rhizobactin produced by Caballeronia mineralivorans PML1(12) confers the ability to weather minerals
auteur
Cintia Blanco Nouche, Cédric Paris, Tiphaine Dhalleine, Phil M. Oger, Marie-Pierre Turpault, Stéphane Uroz
article
Applied and Environmental Microbiology, 2023, 89 (10), pp.0045323. ⟨10.1128/aem.00453-23⟩
DOI
DOI : 10.1128/aem.00453-23
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https://hal.science/hal-04297012/file/AEM00453-23R1-Merged_PDF.pdf BibTex

2022

titre
Alkanes as Membrane Regulators of the Response of Early Membranes to Extreme Temperatures
auteur
Loreto Misuraca, Antonino Caliò, Josephine Loricco, Ingo Hoffmann, Roland Winter, Bruno Demé, Judith Peters, Phil M. Oger
article
Life, 2022, 12 (3), pp.445. ⟨10.3390/life12030445⟩
DOI
DOI : 10.3390/life12030445
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https://hal.science/hal-03930744/file/2022%20Misuraca%20Life-12-00445-v2.pdf BibTex
titre
Biochemical characterization and mutational analysis of a novel flap endonuclease 1 from Thermococcus barophilus Ch5
auteur
Tan Lin, Likui Zhang, Donghao Jiang, Leilei Wu, Kaige Chen, Li Li, Cuili Jin, Zheng Li, Phil M. Oger
article
International Journal of Biochemistry and Cell Biology, 2022, 143, pp.106154. ⟨10.1016/j.biocel.2021.106154⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.biocel.2021.106154
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https://hal.science/hal-03722823/file/PO_Revised%20Manuscript%203%20%281%29.pdf BibTex
titre
Synthesis of phospholipids under plausible prebiotic conditions and analogies with phospholipid biochemistry or origin of life studies
auteur
Michele Fiore, Carolina Chieffo, Augustin Lopez, Dimitri Fayolle, Johal Ruiz, Laurent Soulère, Phil M. Oger, Emiliano Altamura, Florence Popowycz, René Buchet
article
Astrobiology, In press, ⟨10.1089/ast.2021.0059⟩
DOI
DOI : 10.1089/ast.2021.0059
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https://hal.science/hal-03591985/file/AST-2021-0059-Fiore.pdf BibTex
titre
Unravelling the Adaptation Mechanisms to High Pressure in Proteins
auteur
Antonino Caliò, Cécile Dubois, Stéphane Fontanay, Michael Marek Koza, François Hoh, Christian Roumestand, Phil M. Oger, Judith Peters
article
International Journal of Molecular Sciences, 2022, Feature Papers in Molecular Biophysics, 23 (15), pp.8469. ⟨10.3390/ijms23158469⟩
DOI
DOI : 10.3390/ijms23158469
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https://hal.science/hal-03744880/file/2022%20Calio%20ijms%20PMI.pdf BibTex
titre
The Exploration of the Thermococcus barophilus Lipidome Reveals the Widest Variety of Phosphoglycolipids in Thermococcales
auteur
Maxime Tourte, Sarah Coffinet, Lars Wörmer, Julius S Lipp, Kai-Uwe Hinrichs, Phil M. Oger
article
Frontiers in Microbiology, 2022, 13, pp.869479. ⟨10.3389/fmicb.2022.869479⟩
DOI
DOI : 10.3389/fmicb.2022.869479
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https://hal.science/hal-03722871/file/2022%20Tourte%20Front%20Microbiol%2013-869479.pdf BibTex
titre
High temperature molecular motions within a model protomembrane architecture
auteur
Loreto Misuraca, Tatsuhito Matsuo, Aline Cisse, Josephine Loricco, Antonino Caliò, Jean-Marc Zanotti, Bruno Demé, Phil M. Oger, Judith Peters
article
Physical Chemistry Chemical Physics, 2022, 24, pp.15083-15090. ⟨10.1039/D2CP01205G⟩
DOI
DOI : 10.1039/D2CP01205G
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https://hal.science/hal-03722910/file/Misuraca_Soft%20matter_AC_JP-PO2_TM_JMZ_BD.pdf BibTex
titre
Influence of aphotic haloclines and euxinia on organic biomarkers and microbial communities in a thalassohaline and alkaline volcanic crater lake
auteur
David Sala, Vincent Grossi, Hélène Agogué, Christophe Leboulanger, Didier Jézéquel, Gérard Sarazin, Ingrid Antheaume, Cécile Bernard, Magali Ader, Mylène Hugoni
article
Geobiology, 2022, 20 (2), pp.292-309. ⟨10.1111/gbi.12477⟩
DOI
DOI : 10.1111/gbi.12477
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https://hal.science/hal-03404766/file/Sala_2021_Geobiology_HAL.pdf BibTex
titre
Chemical Composition, Antibacterial Activity using Micro-broth Dilution Method and Antioxidant Activity of Essential Oil and Water Extract from Aerial Part of Tunisian Thymus algeriensis Boiss. & Reut.
auteur
Amal Ghorbel, Jawhar Fakhfakh, Vincent Brieudes, Maria Halabalaki, Stéphane Fontanay, Raphaël Duval, Khaled Mliki, Sami Sayadi, Noureddine Allouche
article
Journal of Essential Oil Bearing Plants, 2022, 24 (6), pp.1349-1364. ⟨10.1080/0972060X.2021.2021112⟩
DOI
DOI : 10.1080/0972060X.2021.2021112
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BibTex
titre
Biochemical characterization and mutational analysis of a mismatch glycosylase from the hyperthermophilic euryarchaeon Thermococcus barophilus Ch5
auteur
Lei Wang, Tan Lin, Phil M. Oger, Yong Gong, Likui Zhang
article
DNA Repair, 2022, 114, pp.103321. ⟨10.1016/j.dnarep.2022.103321⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.dnarep.2022.103321
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BibTex
titre
Genomic and transcriptomic characterization of the Collimonas quorum sensing genes and regulon
auteur
Stephane Uroz, Océane Geisler, Laure Fauchery, Raphaël Lami, Alice M.S. Rodrigues, Emmanuelle Morin, Johan Leveau, Phil M. Oger
article
FEMS Microbiology Ecology, 2022, 98 (11), ⟨10.1093/femsec/fiac100⟩
DOI
DOI : 10.1093/femsec/fiac100
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https://hal.science/hal-03915632/file/2022%20Uroz%20fiac100.pdf BibTex
titre
The mineral weathering ability of Collimonas pratensis PMB3(1) involves a Malleobactin-mediated iron acquisition system
auteur
Laura Picard, Cédric Paris, Tiphaine Dhalleine, Emmanuelle Morin, Phil M. Oger, Marie-Pierre M.-P. Turpault, Stéphane Uroz
article
Environmental Microbiology, 2022, 24 (2), pp. 784-802. ⟨10.1111/1462-2920.15508⟩
DOI
DOI : 10.1111/1462-2920.15508
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https://hal.science/hal-03194986/file/PICARD_draft_sidero_LP_V12SU_PO.pdf BibTex
titre
Membrane adaptation in the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus furiosus relies upon a novel strategy involving glycerol monoalkyl glycerol tetraether lipids
auteur
Maxime Tourte, Philippe Schaeffer, Vincent Grossi, Phil M. Oger
article
Environmental Microbiology, 2022, 24 (4), pp.2029-2046. ⟨10.1111/1462-2920.15923⟩
DOI
DOI : 10.1111/1462-2920.15923
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https://hal.science/hal-03845187/file/Tourte_pfu_adaptation_main.pdf BibTex

2021

titre
Straightforward Synthesis of Chiral Terpenoid Building Blocks by Ru-Catalyzed Enantioselective Hydrogenation
auteur
Johal Ruiz, Phil M. Oger, Laurent Soulère, Florence Popowycz
article
Journal of Organic Chemistry, 2021, ⟨10.1021/acs.joc.1c00677⟩
DOI
DOI : 10.1021/acs.joc.1c00677
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BibTex
titre
The Piezo-Hyperthermophilic Archaeon Thermococcus piezophilus Regulates Its Energy Efficiency System to Cope With Large Hydrostatic Pressure Variations
auteur
Yann Moalic, Jordan Hartunians, Cécile Dalmasso, Damien Courtine, Myriam Georges, Phil M. Oger, Zongze Shao, Mohamed Jebbar, Karine Alain
article
Frontiers in Microbiology, 2021, 12, pp.730231. ⟨10.3389/fmicb.2021.730231⟩
DOI
DOI : 10.3389/fmicb.2021.730231
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https://hal.science/hal-03413270/file/Moalic_2021_Tpiezophilus_transcriptome.pdf BibTex
titre
Complete genome of Bradyrhizobium sp. strain BDV5419, representative of Australian genospecies L
auteur
Christine Oger-Desfeux, Jerome Briolay, Phil M. Oger, Bénédicte Lafay
article
Microbiology Resource Announcements, 2021, 10 (8), pp.e00042-21. ⟨10.1128/MRA.00042-21⟩
DOI
DOI : 10.1128/MRA.00042-21
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https://hal.science/hal-03138171/file/2021%20Oger-Desfeux%20MRA-e00042-21.pdf BibTex
titre
Alkanes increase the stability of early life membrane models under extreme pressure and temperature conditions
auteur
Loreto Misuraca, Bruno Demé, Phil M. Oger, Judith Peters
article
Communications Chemistry, 2021, ⟨10.1038/s42004-021-00467-5⟩
DOI
DOI : 10.1038/s42004-021-00467-5
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https://hal.science/hal-03154757/file/2021%20Misuraca%20Comms%20Chem_.pdf BibTex
titre
Identification of a novel bifunctional uracil DNA glycosylase from Thermococcus barophilus Ch5
auteur
Likui Zhang, Donghao Jiang, Qi Gan, Haoqiang Shi, Li Miao, Yong Gong, Phil M. Oger
article
Applied Microbiology and Biotechnology, In press, ⟨10.1007/s00253-021-11422-8⟩
DOI
DOI : 10.1007/s00253-021-11422-8
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https://hal.science/hal-03280471/file/2021%20Zhang%20AMB.pdf BibTex
titre
Reappraisal of archaeal C20-C25 diether lipid (extended archaeol) origin and use as a biomarker of hypersalinity
auteur
Flore Vandier, Maxime Tourte, Cara Doumbe-Kingue, Julien Plancq, Philippe Schaeffer, Phil M. Oger, Vincent Grossi
article
Organic Geochemistry, 2021, 159, pp.104276. ⟨10.1016/j.orggeochem.2021.104276⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.orggeochem.2021.104276
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https://hal.science/hal-03289860/file/Vandier%20et%20al%202021_OG_104276_uncorrected%20proof%20%281%29.pdf BibTex
titre
Characterization of a novel type III alcohol dehydrogenase from Thermococcus barophilus Ch5
auteur
Likui Zhang, Donghao Jiang, Yuting Li, Leilei Wu, Qing Liu, Kunming Dong, Phil M. Oger
article
International Journal of Biological Macromolecules, 2021
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https://hal.science/hal-03090883/file/IJBIOMAC-D-20-05915_R3%20-%20HAL.pdf BibTex
titre
Biochemical characterization and mutational studies of a novel 3-methlyadenine DNA glycosylase II from the hyperthermophilic Thermococcus gammatolerans
auteur
Donghao Jiang, Likui Zhang, Kunming Dong, Yong Gong, Phil M. Oger
article
DNA Repair, 2021
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https://hal.science/hal-03035060/file/DNAREP-D-20-00162_R1%20-%20HAL.pdf BibTex
titre
Acid Hydrolysis for the Extraction of Archaeal Core Lipids and HPLC-MS Analysis
auteur
Maxime Tourte, Philippe Schaeffer, Vincent Grossi, Phil M. Oger
article
Bio-protocol , 2021, 11 (16), ⟨10.21769/bioprotoc.4118⟩
DOI
DOI : 10.21769/bioprotoc.4118
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https://hal.science/hal-03379753/file/2021%20Tourte%20Bio-protocol%204118.pdf BibTex
titre
Identification of a novel type of glucose dehydrogenase involved in the mineral weathering ability of Collimonas pratensis strain PMB3(1)
auteur
Laura Picard, Marie-Pierre M.-P. Turpault, Phil M. Oger, Stephane Uroz
article
FEMS Microbiology Ecology, 2021, 97 (1), pp.fiaa232. ⟨10.1093/femsec/fiaa232⟩
DOI
DOI : 10.1093/femsec/fiaa232
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https://hal.science/hal-03000681/file/Picard%20et%20HAL.pdf BibTex
titre
Characterisation of a synthetic Archeal membrane reveals a possible new adaptation route to extreme conditions
auteur
Marta Salvador-Castell, Maksym Golub, Nelli Erwin, Bruno Demé, Nicholas J Brooks, Roland Winter, Judith Peters, Phil M. Oger
article
Communications Biology, 2021, 4, ⟨10.1038/s42003-021-02178-y⟩
DOI
DOI : 10.1038/s42003-021-02178-y
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https://hal.science/hal-03272003/file/2021%20Salvador-Castell%20Nat%20Comms%20Biols42003-021-02178-y.pdf BibTex
titre
Non-Polar Lipids as Regulators of Membrane Properties in Archaeal Lipid Bilayer Mimics
auteur
Marta Salvador-Castell, Nicholas J Brooks, Roland Winter, Judith Peters, Phil M. Oger
article
International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (11), ⟨10.3390/ijms22116087⟩
DOI
DOI : 10.3390/ijms22116087
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https://hal.science/hal-03272006/file/2021%20Salvador-Castell%20IJMS%20ijms-22-06087-v2.pdf BibTex

2020

titre
Novel intact polar and core lipid compositions in the Pyrococcus model species, P. furiosus and P. yayanosii, reveal the largest lipid diversity amongst Thermococcales
auteur
Maxime Tourte, Vanessa Kuentz, Philippe Schaeffer, Vincent Grossi, Anaïs Cario, Phil M. Oger
article
Biomolecules, 2020, 10 (6), pp.830. ⟨10.3390/biom10060830⟩
DOI
DOI : 10.3390/biom10060830
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https://hal.science/hal-02861881/file/biomolecules-10-00830-v2.pdf BibTex
titre
Induction of non-lamellar phases in archaeal lipids at high temperature and high hydrostatic pressure by apolar polyisoprenoids
auteur
Marta Salvador-Castell, Nicholas Brooks, Judith Peters, Phil M. Oger
article
Biochimica et Biophysica Acta:Biomembranes, 2020, 1862 (2), pp.183130. ⟨10.1016/j.bbamem.2019.183130⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.bbamem.2019.183130
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https://hal.science/hal-02364592/file/SAXS_bba%20biomembranes.pdf BibTex
titre
Dual transcriptomics and proteomics analyses of the early stage of interaction between Caballeronia mineralivorans PML1(12) and mineral
auteur
Stephane Uroz, Laura Picard, Marie-Pierre M.-P. Turpault, Lucas Auer, J. Armengaud, Phil M. Oger
article
Environmental Microbiology, In press, 22 (9), pp.3838-3862. ⟨10.1111/1462-2920.15159⟩
DOI
DOI : 10.1111/1462-2920.15159
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https://hal.science/hal-02902180/file/Uroz_EM_draft_revised_PO.pdf BibTex
titre
Characterization of a Family IV uracil DNA glycosylase from the hyperthermophilic euryarchaeon Thermococcus barophilus Ch5
auteur
Qi Gan, Mengfan He, Haoqiang Shi, Phil M. Oger, Zhihui Yang, Liping Ran, Likui Zhang
article
International Journal of Biological Macromolecules, 2020, 146, pp.475-481. ⟨10.1016/j.ijbiomac.2019.12.202⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.ijbiomac.2019.12.202
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https://hal.science/hal-02441935/file/2019%20Gan%20IJMB%20Uracil%20DNA%20glycosylase.pdf BibTex
titre
An alternative pathway for repair of deaminated bases in DNA triggered by archaeal NucS endonuclease
auteur
Likui Zhang, Haoqiang Shi, Qi Gan, Yuxiao Wang, Mai Wu, Zhihui Yang, Phil M. Oger, Jianting Zheng
article
DNA Repair, 2020, pp.102734. ⟨10.1016/j.dnarep.2019.102734⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.dnarep.2019.102734
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https://hal.science/hal-02334467/file/DNAREP_2019_121_Revision%202_V0_R2.pdf BibTex
titre
Characterization and application of a family B DNA polymerase from the hyperthermophilic and radioresistant euryarchaeon Thermococcus gammatolerans
auteur
Likui Zhang, Donghao Jiang, Haoqiang Shi, Mai Wu, Qi Gan, Zhihui Yang, Phil M. Oger
article
International Journal of Biological Macromolecules, 2020, 156, pp.217-224. ⟨10.1016/j.ijbiomac.2020.03.204⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.ijbiomac.2020.03.204
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https://hal.science/hal-02526997/file/IJBIOMAC_2019_9798_Revision%201_V0_R1.pdf BibTex
titre
Structural Characterization of an Archaeal Lipid Bilayer as a Function of Hydration and Temperature
auteur
Marta Salvador-Castell, Bruno Demé, Phil M. Oger, Judith Peters
article
International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21 (5), pp.1816. ⟨10.3390/ijms21051816⟩
DOI
DOI : 10.3390/ijms21051816
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https://hal.science/hal-02508365/file/2020%20Salvador-Castell%20IJMS%20-21-01816.pdf BibTex
titre
Lipid phase separation induced by the apolar polyisoprenoid squalane demonstrates its role in membrane domain formation in archaeal membranes
auteur
Marta Salvador-Castell, Bruno Demé, Phil M. Oger, Judith Peters
article
Langmuir, 2020, 36 (26), pp.7375-7382. ⟨10.1021/acs.langmuir.0c00901⟩
DOI
DOI : 10.1021/acs.langmuir.0c00901
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https://hal.science/hal-02862864/file/acs.langmuir.0c00901.pdf BibTex
titre
Apolar Polyisoprenoids Located in the Midplane of the Bilayer Regulate the Response of an Archaeal-Like Membrane to High Temperature and Pressure
auteur
Josephine Loricco, Marta Salvador-Castell, Bruno Demé, Judith Peters, Phil M. Oger
article
Frontiers in Chemistry, 2020, 8, pp.594039. ⟨10.3389/fchem.2020.594039⟩
DOI
DOI : 10.3389/fchem.2020.594039
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https://hal.science/hal-03000614/file/2020%20LoRicco%20Front%20Chem-08-594039.pdf BibTex
titre
High-Temperature Behavior of Early Life Membrane Models
auteur
Loreto Misuraca, Antonino Caliò, Isabelle Grillo, Axelle Grélard, Phil M. Oger, Judith Peters, Bruno Demé
article
Langmuir, 2020, 36 (45), pp.13516-13526. ⟨10.1021/acs.langmuir.0c02258⟩
DOI
DOI : 10.1021/acs.langmuir.0c02258
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https://hal.science/hal-02988681/file/2020%20Misuraca%20Langmuir.pdf BibTex
titre
New Insights Into DNA Repair Revealed by NucS Endonucleases From Hyperthermophilic Archaea
auteur
Likui Zhang, Donghao Jiang, Mai Wu, Zhihui Yang, Phil M. Oger
article
Frontiers in Microbiology, 2020, 11, ⟨10.3389/fmicb.2020.01263⟩
DOI
DOI : 10.3389/fmicb.2020.01263
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https://hal.science/hal-02887791/file/2020%20Zhang%20Front%20Microbiol_%20NucS%20in%20DNA%20repair.pdf BibTex
titre
Functionalized Membrane Domains: An Ancestral Feature of Archaea?
auteur
Maxime Tourte, Philippe Schaeffer, Vincent Grossi, Phil M. Oger
article
Frontiers in Microbiology, 2020, 11, pp.526. ⟨10.3389/fmicb.2020.00526⟩
DOI
DOI : 10.3389/fmicb.2020.00526
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https://hal.science/hal-02553764/file/2020%20Tourte%20Front%20Microbiol.pdf BibTex

2019

titre
Protomembranes at the origin of life
auteur
Loreto Misuraca, Bruno Demé, Judith Peters, Phil M. Oger, Phil M. Oger
article
European Biophysics Journal, 2019
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titre
Biochemical characterization of a thermostable DNA ligase from the hyperthermophilic euryarchaeon Thermococcus barophilus Ch5
auteur
Haoqiang Shi, Yanchao Huang, Qi Gan, Mianwen Rui, Hongxun Chen, Chuandeng Tu, Zhihui Yang, Likui Zhang, Phil M. Oger
article
Applied Microbiology and Biotechnology, 2019, ⟨10.1007/s00253-019-09736-9⟩
DOI
DOI : 10.1007/s00253-019-09736-9
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https://hal.science/hal-02091415/file/Revised%20MS%20Likui_PO.docx.pdf BibTex
titre
Plant Symbionts Are Engineers of the Plant-Associated Microbiome
auteur
Stéphane Uroz, Pierre-Emmanuel Courty, Phil M. Oger
article
Trends in Plant Science, 2019, 24 (10), pp.905-916. ⟨10.1016/j.tplants.2019.06.008⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.tplants.2019.06.008
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https://hal.science/hal-02334474/file/Uroz_TIP_domino%20effect_accepte.pdf BibTex
titre
In Search for the Membrane Regulators of Archaea
auteur
Marta Salvador-Castell, Maxime Tourte, Phil M. Oger
article
International Journal of Molecular Sciences, 2019, 20 (18), pp.4434. ⟨10.3390/ijms20184434⟩
DOI
DOI : 10.3390/ijms20184434
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https://hal.science/hal-02283370/file/2019%20Salvador%20Castell%20IJMS-20-04434.pdf BibTex
titre
The first study on the impact of osmolytes in whole cells of high temperature-adapted microorganisms
auteur
Marta Salvador-Castell, Maksym Golub, Nicolas Martinez, Jacques Ollivier, Judith Peters, Phil M. Oger
article
Soft Matter, 2019, 15 (41), pp.8381-8391. ⟨10.1039/c9sm01196j⟩
DOI
DOI : 10.1039/c9sm01196j
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https://hal.science/hal-02318499/file/Salvador_Soft%20matter_%20revised%20%281%29.pdf BibTex
titre
Biochemical characterization and mutational studies of the thermostable uracil DNA glycosylase from the hyperthermophilic euryarchaeon Thermococcus barophilus Ch5
auteur
Haoqiang Shi, Qi Gan, Donghao Jiang, Yuqi Wu, Youcheng Yin, Haiyue Hou, Hongxun Chen, Li Miao, Zhihui Yang, Phil M. Oger, Likui Zhang
article
International Journal of Biological Macromolecules, 2019, ⟨10.1016/j.ijbiomac.2019.05.073⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.ijbiomac.2019.05.073
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https://hal.science/hal-02130096/file/Shi%20Biochemical%20characterization%20and%20mutational%20studies%20of%20the%20thermostable%20uracil%20DNA%20glycosylase%20from%20the%20hyperthermophilic%20euryarchaeon%20Thermococcus%20barophilus%20Ch5_submitted.pdf BibTex
titre
Corrigendum to “Caballeronia mineralivorans sp. nov., isolated from oak-Scleroderma citrinum mycorrhizosphere” [Syst. Appl. Microbiol. 40 (2017) 345–351]
auteur
S. Uroz, Phil M. Oger
article
Systematic and Applied Microbiology, 2019, 42 (3), pp.423-424. ⟨10.1016/j.syapm.2019.03.001⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.syapm.2019.03.001
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BibTex
titre
Biochemical characterization and mutational studies of the 8-oxoguanine DNA glycosylase from the hyperthermophilic and radioresistant archaeon Thermococcus gammatolerans
auteur
Likui Zhang, Yuting Li, Haoqiang Shi, Dai Zhang, Zhihui Yang, Phil M. Oger, Jianting Zheng
article
Applied Microbiology and Biotechnology, 2019, ⟨10.1007/s00253-019-10031-w⟩
DOI
DOI : 10.1007/s00253-019-10031-w
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https://hal.science/hal-02283293/file/Revised%20TgAGOG.pdf BibTex
titre
Monitoring of abiotic degradation of photocrosslinked silicone acrylate coatings: the fate of the photoinitiator
auteur
Salma Ouali, Patrick Germain, Rémy Gourdon, Valérie Desjardin, Yoann Louis
article
Environmental Science and Pollution Research, 2019, 26 (15), pp.15324-15332. ⟨10.1007/s11356-019-04937-1⟩
DOI
DOI : 10.1007/s11356-019-04937-1
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https://hal.science/hal-02086576/file/ouali%202019.pdf BibTex
titre
Dual 0.02% chlorhexidine digluconate - 0.1% disodium EDTA loaded thermosensitive ocular gel for Acanthamoeba keratitis treatment
auteur
A. Cucina, S. Filali, A. Risler, C. Febvay, D. Salmon, C. Pivot, Michel Pélandakis, F. Pirot
article
International Journal of Pharmaceutics, 2019, 556, pp.330-337. ⟨10.1016/j.ijpharm.2018.12.016⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.ijpharm.2018.12.016
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2018

titre
Complete Genome Sequences of 11 Type Species from the Thermococcus Genus of Hyperthermophilic and Piezophilic Archaea
auteur
Phil M. Oger
article
Genome Announcements, 2018, 6 (8)
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https://hal.science/hal-02001367/file/GA_Oger_11Thermoc%20%281%29.pdf BibTex
titre
Leaching and Biodegradation of Darocur 1173 used as a Photo-Initiator in the Production of Photocrosslinked Silicone Acrylates
auteur
Salma Ouali, Yoann Louis, Patrick Germain, Rémy Gourdon, Valérie Desjardin
article
Journal of Polymers and the Environment, 2018, 26 (1), pp.244-253. ⟨10.1007/s10924-017-0939-z⟩
DOI
DOI : 10.1007/s10924-017-0939-z
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BibTex
titre
The Effect of Crowding on Protein Stability, Rigidity, and High Pressure Sensitivity in Whole Cells
auteur
M. Golub, N. Martinez, G. Michoud, J. Ollivier, M. Jebbar, Phil M. Oger, J. Peters
article
Langmuir, 2018, 34 (35), pp.10419-10425. ⟨10.1021/acs.langmuir.8b01240⟩
DOI
DOI : 10.1021/acs.langmuir.8b01240
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2017

titre
Complete Genome Sequence of the Hyperthermophilic Piezophilic Archaeon Pyrococcus kukulkanii NCB100 Isolated from the Rebecca's Roost Hydrothermal Vent in the Guaymas Basin
auteur
Phil M. Oger, N. Callac, C. Oger-Desfeux, S. Hughes, B. Gillet, M. Jebbar, A. Godfroy
article
Genome Announcements, 2017, 5 (7), ⟨10.1128/genomeA.01667-16⟩
DOI
DOI : 10.1128/genomeA.01667-16
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titre
700 MPa sample stick for studying liquid samples or solid-gas reactions down to 1.8 K and up to 550 K
auteur
Eddy Lelièvre-Berna, Bruno Demé, Julien Gonthier, Jean-Paul Gonzales, James Maurice, Yohan Memphis, Claude Payre, Philippe M. Oger, Judith Peters, Sébastien Vial
article
Journal of Neutron Research, 2017, 19 (1-2), pp.77-84. ⟨10.3233/JNR-170044⟩
DOI
DOI : 10.3233/JNR-170044
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titre
Epsilonproteobacteria dominate bacterial diversity at a natural tar seep
auteur
F. Lormieres, Phil M. Oger
article
Comptes Rendus Biologies, 2017, 340 (4), pp.238-243. ⟨10.1016/j.crvi.2016.10.001⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.crvi.2016.10.001
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titre
Caballeronia mineralivorans sp. nov., isolated from oak-Scleroderma citrinum mycorrhizosphere.
auteur
Stéphane Uroz, Phil M. Oger
article
Systematic and Applied Microbiology, 2017, 40 (6), pp.345-351. ⟨10.1016/j.syapm.2017.05.005⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.syapm.2017.05.005
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2016

titre
Erratum for Dalmasso et al., Complete Genome Sequence of the Hyperthermophilic and Piezophilic Archaeon Thermococcus piezophilus CDGST, Able To Grow under Extreme Hydrostatic Pressures
auteur
C. Dalmasso, Phil M. Oger, D. Courtine, M. Georges, K. Takai, L. Maignien, K. Alain
article
Genome Announcements, 2016, 4 (5)
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titre
Complete Genome Sequence of the Hyperthermophilic and Piezophilic Archaeon Thermococcus barophilus Ch5, Capable of Growth at the Expense of Hydrogenogenesis from Carbon Monoxide and Formate
auteur
Phil M. Oger, T. G. Sokolova, D. A. Kozhevnikova, E. A. Taranov, P. Vannier, H. S. Lee, K. K. Kwon, S. G. Kang, J. H. Lee, E. A. Bonch-Osmolovskaya, A. V. Lebedinsky
article
Genome Announcements, 2016, 4 (1), ⟨10.1128/genomeA.01534-15⟩
DOI
DOI : 10.1128/genomeA.01534-15
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https://hal.science/hal-02001341/file/main.pdf BibTex
titre
Pyrococcus kukulkanii sp. nov., a hyperthermophilic, piezophilic archaeon isolated from a deep-sea hydrothermal vent
auteur
N. Callac, Phil M. Oger, F. Lesongeur, J. E. Rattray, P. Vannier, G. Michoud, M. Beauverger, N. Gayet, O. Rouxel, M. Jebbar, A. Godfroy
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 66 (8), pp.3142-9. ⟨10.1099/ijsem.0.001160⟩
DOI
DOI : 10.1099/ijsem.0.001160
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BibTex
titre
Random mutagenesis of the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus furiosus using in vitro mariner transposition and natural transformation
auteur
Natalia Guschinskaya, Romain Brunel, Maxime Tourte, Gina L. Lipscomb, Michael W. W. Adams, Phil M. Oger, Xavier Charpentier
article
Scientific Reports, 2016, 6, pp.36711. ⟨10.1038/srep36711⟩
DOI
DOI : 10.1038/srep36711
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https://hal.science/hal-01917847/file/srep36711.pdf BibTex
titre
Molecular chaperone accumulation as a function of stress evidences adaptation to high hydrostatic pressure in the piezophilic archaeon Thermococcus barophilus
auteur
A. Cario, M. Jebbar, A. Thiel, N. Kervarec, Phil M. Oger
article
Scientific Reports, 2016, 6, pp.29483. ⟨10.1038/srep29483⟩
DOI
DOI : 10.1038/srep29483
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https://hal.science/hal-02001331/file/srep29483.pdf BibTex