2025
- titre
- Exploring the genomic basis underlying the diversity of host-endosymbiont interactions in Sitophilus spp. weevils
- auteur
- J Uxue Mendez Leyva, Agnès Vallier, Benjamin Gillet, Sandrine Hughes, Carole Vincent-Monégat, Severine Balmand, Florence Hommais, Brenda Oppert, Abdelaziz Heddi, Anna Zaidman-Rémy, Rita Rebollo, Nicolas Parisot
- article
- ALPHY - AIEM, Feb 2025, Lyon, France
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-
2024
- titre
- Emergence of Supercoiling-Mediated Regulatory Networks through Bacterial Chromosome Organization
- auteur
- Théotime Grohens, Sam Meyer, Guillaume Beslon
- article
- 2024
- DOI
- DOI : 10.1101/2022.09.23.509185
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-
- titre
- Fis family members synergistically control the virulence of Legionella pneumophila
- auteur
- Claire Andréa, Julie Bresson, Christophe Ginévra, Anne Vianney, Nathalie Bailo, Annelise Chapalain, Laetitia Attaiech, Kévin Picq, Caroline Ranquet, William Nasser, Patricia Doublet, Elisabeth Kay
- article
- 2024
- DOI
- DOI : 10.1101/2024.09.25.615009
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-
- titre
- Description of a new genus of the Pectobacteriaceae family isolated from water in coastal brackish wetlands of the French Camargue region, Prodigiosinella gen. nov., including the new species Prodigiosinella aquatilis sp. nov
- auteur
- Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat, Jean-Pierre Flandrois, Jérôme Briolay, Sylvie Reverchon, Céline Brochier-Armanet
- article
- Systematic and Applied Microbiology, 2024, 47 (2-3), pp.126497. ⟨10.1016/j.syapm.2024.126497⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.syapm.2024.126497
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-
- titre
- Diversity and diversification of Pectobacteriaceae, a family of phytopathogenic bacteria with a global importance
- auteur
- Céline Brochier, Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat, Jean-Pierre Flandrois, Sylvie Reverchon, Jérôme Briolay
- article
- Cahiers Scientifiques de la Fondation Pierre Vérots, 2024, 10, pp.19-29
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-
- titre
- DNA as a Double-Coding Device for Information Conversion and Organization of a Self-Referential Unity
- auteur
- Georgi Muskhelishvili, William Nasser, Sylvie Reverchon, Andrew Travers
- article
- DNA, 2024, 4 (4), pp.473-493. ⟨10.3390/dna4040032⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/dna4040032
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-
- titre
- Hrr25 is a new kinase involved in glucose signaling in yeasts
- auteur
- Myriam Djebbi, Marion Dubarry, Sam Meyer, Alexandre Soulard, Marc Lemaire
- article
- 19th Congress of the SFM 'Bienvenue chez les Microbes', Oct 2024, Lille (FR), France
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-
- titre
- Quantitative spatial analysis of bacterial transcriptome and chromosome structural data with GRATIOSA: application to twin-supercoiled domain distribution
- auteur
- Maïwenn Pineau, Raphaël Forquet, Sylvie Reverchon, William Nasser, Florence Hommais, Sam Meyer
- article
- 2024
- DOI
- DOI : 10.1101/2023.12.22.573166
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-
- titre
- The power duo: how the interplay between nucleoid-associated proteins and small non-coding RNAs orchestrates the cellular regulatory symphony
- auteur
- Sara Moutacharrif, Feth El Zahar Haichar, Sam Meyer, Cecile Ribot, Sylvie Reverchon, William Nasser, Florence Hommais
- article
- 2024
- DOI
- DOI : 10.22541/au.173264246.60014744/v1
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-
2023
- titre
- Comparison of the signal transduction efficiency in the Vfm quorum sensing system of the genus Dickeya according to the polymorphism of the vfm genes
- auteur
- Sarah Yammine, Malo Boulanger, Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat, Sylvie Reverchon, Stéphane Cociancich, Monique Royer
- article
- 12th International Congress of Plant Pathology, Aug 2023, Lyon, France
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-
- titre
- Comparison of the signal transduction efficiency in the Vfm quorum sensing system of the genus Dickeya according to the polymorphism of the vfm genes
- auteur
- Sarah Yammine, Malo Boulanger, Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat, Sylvie Reverchon, Stéphane Cociancich, Monique Royer
- article
- 16èmes Rencontres Plantes-Bactéries, Mar 2023, Aussois, France
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-
- titre
- From physical structure to biological function: modeling a few transcriptional regulatory principles in bacteria
- auteur
- Sam Meyer
- article
- Bacteriology. Institut National des Sciences Appliquées de Lyon, 2023
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-
- titre
- Specificity and polymorphism of the Vfm quorum sensing system of the plant pathogenic bacteria of the genus Dickeya
- auteur
- Monique Royer, Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat, Erwan Gueguen, Paul Le Guen, Sylvie Reverchon, Stéphane Cociancich
- article
- 16èmes Rencontres Plantes-Bactéries, Mar 2023, Aussois, France
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-
- titre
- Global regulation of bacterial transcription by DNA supercoiling
- auteur
- Maïwenn Pineau
- article
- Sciences du Vivant [q-bio]. INSA de Lyon, 2023. Français. ⟨NNT : 2023ISAL0091⟩
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-
- titre
- Interaction networks of Escherichia coli replication proteins under different bacterial growth conditions
- auteur
- Joanna Morcinek-Orłowska, Beata Walter, Raphaël Forquet, Dominik Cysewski, Maxime Carlier, Michał Mozolewski, Sam Meyer, Monika Glinkowska
- article
- Scientific Data , 2023, 10, ⟨10.1038/s41597-023-02710-1⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/s41597-023-02710-1
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-
2022
- titre
- Editorial: Roles of Regulatory RNAs in Bacterial Pathogens
- auteur
- Florence Hommais, Olga Soutourina
- article
- Roles of Regulatory RNAs in Bacterial Pathogens, 2022, ⟨10.3389/fmicb.2022.915005⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2022.915005
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-
- titre
- Relationship between the Chromosome Structural Dynamics and Gene Expression-A Chicken and Egg Dilemma?
- auteur
- Diana Le Berre, Georgi Muskhelishvili, William Nasser, Sylvie Reverchon
- article
- Microorganisms, 2022, 10 (5), pp.846. ⟨10.3390/microorganisms10050846⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms10050846
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-
- titre
- A Genome-Wide Evolutionary Simulation of the Transcription-Supercoiling Coupling
- auteur
- Théotime Grohens, Sam Meyer, Guillaume Beslon
- article
- Artificial Life, 2022, CogNet, 28 (4), pp.440-457. ⟨10.1162/artl_a_00373⟩
- DOI
- DOI : 10.1162/artl_a_00373
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-
- titre
- Implications of carbon catabolite repression for plant–microbe interactions
- auteur
- Théophile Franzino, Hasna Boubakri, Tomislav Cernava, Danis Abrouk, Wafa Achouak, Sylvie Reverchon, William Nasser, Feth El Zahar Haichar
- article
- Plant Communications, 2022, 3, pp.100272. ⟨10.1016/j.xplc.2021.100272⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.xplc.2021.100272
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-
- titre
- A Genome-Wide Evolutionary Simulation of the Transcription-Supercoiling Coupling: extended version
- auteur
- Théotime Grohens, Sam Meyer, Guillaume Beslon
- article
- 2022
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-
- titre
- What is a supercoiling-sensitive gene? Insights from topoisomerase I inhibition in the Gram-negative bacterium Dickeya dadantii
- auteur
- Maïwenn Pineau, Shiny Martis Badiadka, Raphaël Forquet, Jessica Baude, Camille Villard, Lucie Grand, Florence Popowycz, Laurent Soulère, Florence Hommais, William Nasser, Sylvie Reverchon, Sam Meyer
- article
- Nucleic Acids Research, 2022, 50 (16), pp.9149-9161. ⟨10.1093/nar/gkac679⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/nar/gkac679
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-
- titre
- Mapping the Complex Transcriptional Landscape of the Phytopathogenic Bacterium Dickeya dadantii
- auteur
- Raphaël Forquet, Xuejiao Jiang, William Nasser, Florence Hommais, Sylvie Reverchon, Sam Meyer
- article
- mBio, 2022, 13, ⟨10.1128/mbio.00524-22⟩
- DOI
- DOI : 10.1128/mbio.00524-22
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-
- titre
- Carbon catabolite repression in pectin digestion by the phytopathogen Dickeya dadantii
- auteur
- Shiny Martis Badiadka, Michel Droux, William Nasser, Sylvie Reverchon, Sam Meyer
- article
- Journal of Biological Chemistry, 2022, 298 (1), pp.101446. ⟨10.1016/j.jbc.2021.101446⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.jbc.2021.101446
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-
- titre
- Quantitative contribution of the spacer length in the supercoiling-sensitivity of bacterial promoters
- auteur
- Raphaël Forquet, William Nasser, Sylvie Reverchon, Sam Meyer
- article
- Nucleic Acids Research, 2022, 50 (13), pp.7287-7297. ⟨10.1093/nar/gkac579⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/nar/gkac579
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-
- titre
- Specificity and genetic polymorphism in the Vfm quorum sensing system of plant pathogenic bacteria of the genus Dickeya
- auteur
- Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat, Monique Royer, Erwan Gueguen, Paul Le Guen, Roderich Süssmuth, Sylvie Reverchon, Stéphane Cociancich
- article
- Environmental Microbiology, 2022, 24 (3), pp.1467-1483. ⟨10.1111/1462-2920.15889⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.15889
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-
2021
- titre
- Pattern and causes of the establishment of the invasive bacterial potato pathogen Dickeya solani and of the maintenance of the resident pathogen D. dianthicola
- auteur
- Pauline Blin, Kévin Robic, Slimane Khayi, Jérémy Cigna, Euphrasie Munier-Lépinay, Pauline Dewaegeneire, Angélique Laurent, Yan Jaszczyszyn, Kar‐wai Hong, Kok-Gan Chan, Amélie Beury, Sylvie Reverchon, Tatiana E Giraud, Valerie Hélias, Denis Faure
- article
- Molecular Ecology, 2021, 30 (2), pp.608-624. ⟨10.1111/mec.15751⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/mec.15751
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-
- titre
- Agrobacterium fabrum C58 involved nitrate reductase NapA and antisense RNA NorR to denitrify
- auteur
- Solène Lecomte, Xavier Nesme, Théophile Franzino, Camille Villard, Mariane Pivard, Ludovic Vial, Jeanne Doré, Florence Hommais, Feth El Zahar Haichar
- article
- FEMS Microbiology Ecology, 2021, 97 (1), ⟨10.1093/femsec/fiaa233⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/femsec/fiaa233
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-
- titre
- Editorial: Novel Insights Into the Response of the Plant Microbiome to Abiotic Factors
- auteur
- Feth El Zahar Haichar, Tomislav Cernava, Jia Liu, Collin Timm
- article
- Frontiers in Plant Science, 12, 2021, ⟨10.3389/fpls.2021.607874⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fpls.2021.607874
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-
- titre
- Design and comparative characterization of RecA variants
- auteur
- Elsa del Val, William Nasser, Hafid Abaibou, Sylvie Reverchon
- article
- Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-00589-9⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/s41598-021-00589-9
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-
- titre
- Quorum Sensing Regulation in Phytopathogenic Bacteria
- auteur
- Julie Baltenneck, Sylvie Reverchon, Florence Hommais
- article
- Microorganisms, 2021, 9 (2), pp.239. ⟨10.3390/microorganisms9020239⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms9020239
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-
- titre
- RNA Chaperones Hfq and ProQ Play a Key Role in the Virulence of the Plant Pathogenic Bacterium Dickeya dadantii
- auteur
- Simon Leonard, Camille Villard, William Nasser, Sylvie Reverchon, Florence Hommais
- article
- Frontiers in Microbiology, 2021, 12, pp.687484. ⟨10.3389/fmicb.2021.687484⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2021.687484
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-
- titre
- Role of the Discriminator Sequence in the Supercoiling Sensitivity of Bacterial Promoters
- auteur
- Raphaël Forquet, Maïwenn Pineau, William Nasser, Sylvie Reverchon, Sam Meyer
- article
- mSystems, 2021, ⟨10.1128/mSystems.00978-21⟩
- DOI
- DOI : 10.1128/mSystems.00978-21
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-
- titre
- DNA sequence-directed cooperation between nucleoid-associated proteins
- auteur
- Aleksandre Japaridze, Wayne Yang, Cees Dekker, William Nasser, Georgi Muskhelishvili
- article
- iScience, 2021, 24 (5), pp.102408. ⟨10.1016/j.isci.2021.102408⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.isci.2021.102408
- Accès au bibtex
-
- titre
- A Genome-Wide Evolutionary Simulation of the Transcription-Supercoiling Coupling
- auteur
- Théotime Grohens, Sam Meyer, Guillaume Beslon
- article
- ALIFE 2021 - Conference on Artificial Life, Jul 2021, Prague, Czech Republic
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Separation and quantification of 2-Keto-3-deoxy-gluconate (KDG) a major metabolite in pectin and alginate degradation pathways
- auteur
- Shiny Martis Badiadka, Michel Droux, Florelle Deboudard, William Nasser, Sam Meyer, Sylvie Reverchon
- article
- Analytical Biochemistry, 2021, 619, pp.114061. ⟨10.1016/j.ab.2020.114061⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ab.2020.114061
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-
- titre
- Modelling transcriptional regulation by DNA supercoiling in bacteria
- auteur
- Raphaël Forquet
- article
- Molecular biology. Université de Lyon, 2021. English. ⟨NNT : 2021LYSEI102⟩
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-
2020
- titre
- TwisTranscripT: stochastic simulation of the transcription-supercoiling coupling
- auteur
- Bilal El Houdaigui, Sam Meyer
- article
- Bioinformatics, 2020, 36 (12), pp.3899-3901. ⟨10.1093/bioinformatics/btaa221⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/bioinformatics/btaa221
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-
- titre
- Does Biological Denitrification Inhibition (BDI) in the Field Induce an Increase in Plant Growth and Nutrition in Apium graveolens L. Grown for a Long Period?
- auteur
- William Galland, Florence Piola, Céline Mathieu, Lyna Bouladra, Laurent Simon, Feth El Zahar Haichar
- article
- Microorganisms, 2020, 8 (8), pp.1-13. ⟨10.3390/microorganisms8081204⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms8081204
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-
- titre
- Plasmid‐chromosome crosstalks
- auteur
- Ludovic Vial, Florence Hommais
- article
- Environmental Microbiology, 2020, 22 (2), pp.540-556. ⟨10.1111/1462-2920.14880⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.14880
- Accès au bibtex
-
- titre
- Dickeya poaceiphila sp. nov., a plant-pathogenic bacterium isolated from sugar cane (Saccharum officinarum)
- auteur
- Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat, Celine Brochier-Armanet, Jean-Pierre Flandrois, Sylvie Reverchon
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2020, 70 (8), pp.4508-4514. ⟨10.1099/ijsem.0.004306⟩
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.004306
- Accès au bibtex
-
- titre
- Development of a luminescence-based biosensor reporter strain for quantitative detection of the Vfm quorum sensing signal molecule of Dickeya dadantii 3937
- auteur
- Claire Troillard, Florelle Deboudard, Florie Lo Ying Ping, Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat, Sylvie Reverchon, Monique Royer, Stéphane Cociancich
- article
- 14èmes Rencontres Plantes-Bactéries, Jan 2020, Aussois, France
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-
- titre
- The nucleoid-associated protein IHF acts as a ‘transcriptional domainin’ protein coordinating the bacterial virulence traits with global transcription
- auteur
- Sylvie Reverchon, Sam Meyer, Raphaël Forquet, Florence Hommais, Georgi Muskhelishvili, William Nasser
- article
- Nucleic Acids Research, 2020, ⟨10.1093/nar/gkaa1227⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/nar/gkaa1227
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2019
- titre
- Coherent Domains of Transcription Coordinate Gene Expression During Bacterial Growth and Adaptation
- auteur
- Georgi Muskhelishvili, Raphaël Forquet, Sylvie Reverchon, Sam Meyer, William Nasser
- article
- Microorganisms, 2019, 7 (12), pp.694. ⟨10.3390/microorganisms7120694⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms7120694
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Bacterial genome architecture shapes global transcriptional regulation by DNA supercoiling
- auteur
- Bilal El houdaigui, Raphaël Forquet, Thomas Hindré, Dominique Schneider, William Nasser, Sylvie Reverchon, Sam Meyer
- article
- Nucleic Acids Research, 2019, 47 (11), pp.5648-5657. ⟨10.1093/nar/gkz300⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/nar/gkz300
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- DNA Supercoiling: an Ancestral Regulator of Gene Expression in Pathogenic Bacteria?
- auteur
- Shiny Martis Badiadka, Raphaël Forquet, Sylvie Reverchon, William Nasser, Sam Meyer
- article
- Computational and Structural Biotechnology Journal, 2019, 17, pp.1047-1055. ⟨10.1016/j.csbj.2019.07.013⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.csbj.2019.07.013
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A novel plasmid‐transcribed regulatory sRNA, QfsR, controls chromosomal polycistronic gene expression in Agrobacterium fabrum
- auteur
- Benjamin Diel, Magali Dequivre, Florence Wisniewski-Dyé, Ludovic Vial, Florence Hommais
- article
- Environmental Microbiology, 2019, 21 (8), pp.3063-3075. ⟨10.1111/1462-2920.14704⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.14704
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-
- titre
- APERO: a genome-wide approach for identifying bacterial small RNAs from RNA-Seq data
- auteur
- Simon Leonard, Sam Meyer, Stéphan Lacour, William Nasser, Florence Hommais, Sylvie Reverchon
- article
- Nucleic Acids Research, 2019, 47 (15), pp.1-12. ⟨10.1093/nar/gkz485⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/nar/gkz485
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-
- titre
- Acetic acid bacteria (AAB) involved in cocoa fermentation from Ivory Coast: species diversity and performance in acetic acid production
- auteur
- Souleymane Soumahoro, Honoré Ouattara, Michel Droux, William Nasser, Sébastien Niamke, Sylvie Reverchon
- article
- Journal of Food Science and Technology, 2019, 57, pp.1904-1916. ⟨10.1007/s13197-019-04226-2⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s13197-019-04226-2
- Accès au bibtex
-
- titre
- The phytopathogenic nature of Dickeya aquatica 174/2 and the dynamic early evolution of Dickeya pathogenicity
- auteur
- Alexandre Duprey, Najwa Taïb, Simon Leonard, Tiffany Garin, Jean-Pierre Flandrois, William Nasser, Céline Brochier-Armanet, Sylvie Reverchon
- article
- Environmental Microbiology, 2019, 21 (8), pp.2809-2835. ⟨10.1111/1462-2920.14627⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.14627
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- RecA and DNA recombination: a review of molecular mechanisms
- auteur
- Elsa del Val, William Nasser, Hafid Abaibou, Sylvie Reverchon
- article
- Biochemical Society Transactions, 2019, ⟨10.1042/BST20190558⟩
- DOI
- DOI : 10.1042/BST20190558
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modeling the bioconversion of polysaccharides in a continuous reactor: A case study of the production of oligo-galacturonates by Dickeya dadantii
- auteur
- Jacques-Alexandre Sepulchre, Sylvie Reverchon, Jean-Luc Gouzé, William Nasser
- article
- Journal of Biological Chemistry, 2019, 294 (5), pp.1753-1762. ⟨10.1074/jbc.RA118.004615⟩
- DOI
- DOI : 10.1074/jbc.RA118.004615
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2018
- titre
- ThreaDNA: predicting DNA mechanics’ contribution to sequence selectivity of proteins along whole genomes
- auteur
- Jasmin Cevost, Cédric Vaillant, Sam Meyer
- article
- Bioinformatics, 2018, 34 (4), pp.609-616. ⟨10.1093/bioinformatics/btx634⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/bioinformatics/btx634
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Chromosomal organization of transcription: in a nutshell
- auteur
- Sam Meyer, Sylvie Reverchon, William Nasser, Georgi Muskhelishvili
- article
- Current Genetics, 2018, 64 (3), pp.555-565
- Accès au bibtex
-
2017
- titre
- Regulation of the synthesis of pulp degrading enzymes in Bacillus isolated from cocoa fermentation
- auteur
- H. G. Ouattara, Sylvie Reverchon, S. L. Niamke, William Nasser
- article
- Food Microbiology, 2017, 63, pp.255-262
- Accès au bibtex
-
- titre
- New nucleic acid testing devices to diagnose infectious diseases in resource-limited settings
- auteur
- P. Maffert, Sylvie Reverchon, William Nasser, C. Rozand, H. Abaibou
- article
- European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2017, 36 (10), pp.1717-1731
- Accès au bibtex
-
- titre
- 2-Substituted Aniline as a Simple Scaffold for LuxR-Regulated QS Modulation
- auteur
- S. Li, Julien Wawrzyniak, Y. Queneau, L. Soulère
- article
- Molecules, 2017, 22 (12), pp.E2090. ⟨10.3390/molecules22122090⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/molecules22122090
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Plant-phytopathogen interactions: bacterial responses to environmental and plant stimuli
- auteur
- Simon Leonard, Florence Hommais, William Nasser, Sylvie Reverchon
- article
- Environmental Microbiology, 2017, 19 (5), pp.1689 - 1716. ⟨10.1111/1462-2920.13611⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.13611
- Accès au bibtex
-
- titre
- Erratum to: Multiple controls affect arsenite oxidase gene expression in Herminiimonas arsenicoxydans
- auteur
- S. Koechler, J. Cleiss-Arnold, C. Proux, O. Sismeiro, M. A. Dillies, F. Goulhen-Chollet, Florence Hommais, D. Lièvremont, F. Arsène-Ploetze, J. Y. Coppe, P. N. Bertin
- article
- BMC Microbiology, 2017, 17 (1), pp.74. ⟨10.1186/s12866-017-0976-8⟩
- DOI
- DOI : 10.1186/s12866-017-0976-8
- Accès au bibtex
-
- titre
- Lactic acid bacteria involved in cocoa beans fermentation from Ivory Coast: Species diversity and citrate lyase production
- auteur
- Hadja Ouattara, Honoré Ouattara, Michel Droux, Sylvie Reverchon, William Nasser, Sébastien Niamke
- article
- International Journal of Food Microbiology, 2017, 256, pp.11-19. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2017.05.008⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijfoodmicro.2017.05.008
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-
2016
- titre
- Erratum to: Temperature-induced variation in gene expression burst size in metazoan cells
- auteur
- O. Arnaud, Sam Meyer, E. Vallin, G. Beslon, O. Gandrillon
- article
- BMC Molecular Biology, 2016, 17, pp.2
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-
- titre
- Effect of a static magnetic field on Escherichia coli adhesion and orientation
- auteur
- Lotfi Mhamdi, Nejib Mhamdi, Naceur Mhamdi, Philippe Lejeune, Nicole Jaffrezic-Renault, Noël Burais, Riccardo Scorretti, Jiry Pokorny, Laurence Ponsonnet
- article
- Canadian Journal of Microbiology, 2016, 62 (11), pp.944-952. ⟨10.1139/cjm-2015-0839⟩
- DOI
- DOI : 10.1139/cjm-2015-0839
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- titre
- Transcriptional start site turnover in the evolution of bacterial paralogous genes - the pelE-pelD virulence genes in Dickeya
- auteur
- Alexandre Duprey, William Nasser, Simon Leonard, Céline Brochier-Armanet, Sylvie Reverchon
- article
- FEBS Journal, 2016, 283 (22), pp.4192-4207
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-
- titre
- Regulation of pel genes, major virulence factors in the plant pathogen bacterium Dickeya dadantii, is mediated by cooperative binding of the nucleoid-associated protein H-NS
- auteur
- O. Zghidi-Abouzid, E. Herault, S. Rimsky, Sylvie Reverchon, William Nasser, M. Buckle
- article
- Research in Microbiology, 2016, 167 (4), pp.247-253
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-
- titre
- From multiple pathogenicity islands to a unique organized pathogenicity archipelago
- auteur
- C. Bouyioukos, Sylvie Reverchon, F. Kepes
- article
- Scientific Reports, 2016, 6, pp.27978. ⟨10.1038/srep27978⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/srep27978
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-
- titre
- Global transcriptional response of Dickeya dadantii to environmental stimuli relevant to the plant infection
- auteur
- X. Jiang, O. Zghidi-Abouzid, C. Oger-Desfeux, F. Hommais, N. Greliche, G. Muskhelishvili, William Nasser, Sylvie Reverchon
- article
- Environmental Microbiology, 2016, 18 (11), pp.3651-3672
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-
- titre
- Coordinated Regulation of Species-Specific Hydroxycinnamic Acid Degradation and Siderophore Biosynthesis Pathways in Agrobacterium fabrum
- auteur
- Jessica Baude, Ludovic Vial, Camille Villard, Tony Campillo, Céline Lavire, Xavier Nesme, Florence Hommais
- article
- Applied and Environmental Microbiology, 2016, 82 (12), pp.3515-3524. ⟨10.1128/aem.00419-16⟩
- DOI
- DOI : 10.1128/aem.00419-16
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-
- titre
- Temporal control of Dickeya dadantii main virulence gene expression by growth phase-dependent alteration of regulatory nucleoprotein complexes
- auteur
- A. Duprey, G. Muskhelishvili, Sylvie Reverchon, William Nasser
- article
- Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms , 2016, 1859 (11), pp.1470-1480
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-
- titre
- Virulence Program of a Bacterial Plant Pathogen: The Dickeya Model
- auteur
- Sylvie Reverchon, Georgi Muskhelishvili, William Nasser
- article
- Progress in molecular biology and translational medicine, pp.51-92, 2016
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-
2015
- titre
- Identification of Novel Components Influencing Colonization Factor Antigen I Expression in Enterotoxigenic Escherichia coli
- auteur
- S. Haines, S. Gautheron, William Nasser, G. Renauld-Mongenie
- article
- PLoS ONE, 2015, 10 (10), pp.e0141469. ⟨10.1371/journal.pone.0141469⟩
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0141469
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-
- titre
- Temperature-induced variation in gene expression burst size in metazoan cells
- auteur
- Ophélie Arnaud, Sam Meyer, Elodie Vallin, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon
- article
- BMC Molecular Biology, 2015, 16 (20), ⟨10.1186/s12867-015-0048-2⟩
- DOI
- DOI : 10.1186/s12867-015-0048-2
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-
- titre
- Upstream binding of idling RNA polymerase modulates transcription initiation from a nearby promoter
- auteur
- V. Gerganova, S. Maurer, L. Stoliar, A. Japaridze, G. Dietler, William Nasser, T. Kutateladze, A. Travers, G. Muskhelishvili
- article
- Journal of Biological Chemistry, 2015, 290 (13), pp.8095-8109. ⟨10.1074/jbc.M114.628131⟩
- DOI
- DOI : 10.1074/jbc.M114.628131
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-
- titre
- Small RNA deep-sequencing analyses reveal a new regulator of virulence in Agrobacterium fabrum C58
- auteur
- Magali Dequivre, Benjamin Diel, Camille Villard, Odile Sismeiro, Maxime Durot, Jean-Yves Coppée, Xavier Nesme, Ludovic Vial, Florence Hommais
- article
- Molecular Plant-Microbe Interactions, 2015, 28 (5), pp.580-589. ⟨10.1094/MPMI-12-14-0380-FI⟩
- DOI
- DOI : 10.1094/MPMI-12-14-0380-FI
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-
- titre
- Chromosomal "stress-response" domains govern the spatiotemporal expression of the bacterial virulence program
- auteur
- Xuejiao Jiang, P. Sobetzko, William Nasser, Sylvie Reverchon, G. Muskhelishvili
- article
- mBio, 2015, 6 (3), pp.e00353-15. ⟨10.1128/mBio.00353-15⟩
- DOI
- DOI : 10.1128/mBio.00353-15
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-
- titre
- IscR Regulates Synthesis of Colonization Factor Antigen I Fimbriae in Response to Iron Starvation in Enterotoxigenic Escherichia coli
- auteur
- S. Haines, N. Arnaud-Barbe, D. Poncet, Sylvie Reverchon, J. Wawrzyniak, William Nasser, G. Renauld-Mongenie
- article
- Journal of Bacteriology, 2015, 197 (18), pp.2896-2907. ⟨10.1128/JB.00214-15⟩
- DOI
- DOI : 10.1128/JB.00214-15
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-
- titre
- Inferring coarse-grain histone-DNA interaction potentials from high-resolution structures of the nucleosome
- auteur
- Sam Meyer, R. Everaers
- article
- Journal of Physics: Condensed Matter, 2015, 27 (6), pp.064101. ⟨10.1088/0953-8984/27/6/064101⟩
- DOI
- DOI : 10.1088/0953-8984/27/6/064101
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-
- titre
- DNA Physical Properties and Nucleosome Positions Are Major Determinants of HIV-1 Integrase Selectivity
- auteur
- Monica Naughtin, Zofia Haftek-Terreau, Johan Xavier, Sam Meyer, Maud Silvain, Yan Jaszczyszyn, Nicolas Lévy, Vincent Miele, Mohamed Salah Benleulmi, Marc Ruff, Vincent Parissi, Cédric Vaillant, Marc Lavigne
- article
- PLoS ONE, 2015, 10, pp.e0129427. ⟨10.1371/journal.pone.0129427⟩
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0129427
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-
2014
- titre
- Role of the LysR-type transcriptional regulator PecT and DNA supercoiling in the thermoregulation of pel genes, the major virulence factors in Dickeya dadantii
- auteur
- Elodie Hérault, Sylvie Reverchon, William Nasser
- article
- Environmental Microbiology, 2014, 16 (3), pp.734-45
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-
- titre
- Torsion-Mediated Interaction between Adjacent Genes
- auteur
- Sam Meyer, Guillaume Beslon
- article
- PLoS Computational Biology, 2014, 10 (9), pp.e1003785. ⟨10.1371/journal.pcbi.1003785⟩
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pcbi.1003785
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-
- titre
- Bacterial virulence and Fis: adapting regulatory networks to the host environment
- auteur
- A. Duprey, Sylvie Reverchon, William Nasser
- article
- Trends in Microbiology, 2014, 22 (2), pp.92-9
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-
2013
- titre
- Dickeya ecology, environment sensing and regulation of virulence programme
- auteur
- Sylvie Reverchon, William Nasser
- article
- Environ Microbiol Rep, 2013, 5 (5), pp.622-36
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-
- titre
- Vfm a new quorum sensing system controls the virulence of Dickeya dadantii.
- auteur
- William Nasser, Corinne Dorel, Julien Wawrzyniak, Frédérique van Gijsegem, Marie-Christine Groleau, Eric Déziel, Sylvie Reverchon
- article
- Environmental Microbiology, 2013, 15 (3), pp.865-80. ⟨10.1111/1462-2920.12049⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.12049
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-
2012
- titre
- Structural basis for selective GABA binding in bacterial pathogens
- auteur
- S. Planamente, S. Mondy, Florence Hommais, A. Vigouroux, S. Morera, D. Faure
- article
- Mol Microbiol, 2012, 86 (5), pp.1085-99
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-
- titre
- The nucleoid-associated protein Fis directly modulates the synthesis of cellulose, an essential component of pellicle-biofilms in the phytopathogenic bacterium Dickeya dadantii.
- auteur
- Claire Prigent-Combaret, Ouafa Zghidi-Abouzid, Géraldine Effantin, Philippe Lejeune, Sylvie Reverchon, William Nasser
- article
- Molecular Microbiology, 2012, 86 (1), pp.172-86
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-
- titre
- Quorum sensing signaling molecules produced by reference and emerging soft-rot bacteria (Dickeya and Pectobacterium spp.).
- auteur
- Alexandre Crépin, Corinne Barbey, Amélie Beury-Cirou, Valérie Hélias, Laure Taupin, Sylvie Reverchon, William Nasser, Denis Faure, Alain Dufour, Nicole Orange, Marc Feuilloley, Karin Heurlier, Jean-François Burini, Xavier Latour
- article
- PLoS ONE, 2012, 7 (4), pp.e35176. ⟨10.1371/journal.pone.0035176⟩
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0035176
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-
- titre
- The Role of Secretion Systems and Small Molecules in Soft-Rot Enterobacteriaceae Pathogenicity
- auteur
- Amy Charkowski, Carlos Blanco, Guy Condemine, Dominique Expert, Thierry Franza, Christopher Hayes, Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat, Emilia Lopez Solanilla, David Low, Lucy Moleleki, Minna Pirhonen, Andrew Pitman, Nicole Perna, Sylvie Reverchon, Pablo Rodriguez Palenzuela, Michael San Francisco, Ian Toth, Shinji Tsuyumu, Jacquie van Der Waals, Jan van Der Wolf, Frederique van Gijsegem, Ching-Hong Yang, Iris Yedidia
- article
- Annual Review of Phytopathology, 2012, 50, pp.425 - 449. ⟨10.1146/annurev-phyto-081211-173013⟩
- DOI
- DOI : 10.1146/annurev-phyto-081211-173013
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-
- titre
- The nucleoid-associated proteins H-NS and FIS modulate the DNA supercoiling response of the pel genes, the major virulence factors in the plant pathogen bacterium Dickeya dadantii
- auteur
- Zghidi-Abouzid Ouafa, Sylvie Reverchon, Thomas Lautier, Georgi Muskhelishvili, William Nasser
- article
- Nucleic Acids Research, 2012, 40 (10), pp.4306-4319. ⟨10.1093/nar/gks014⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/nar/gks014
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-
2011
- titre
- PecS is an important player in the regulatory network governing the coordinated expression of virulence genes during the interaction between [i]Dickeya dadantii[/i] 3937 and plants
- auteur
- Nadia Mhedbi-Hajri, Pierrette Malfatti, Jacques Pedron, Stephane Gaubert, Sylvie Reverchon, Frederique van Gijsegem
- article
- Environmental Microbiology, 2011, 13 (11), pp.2901 - 2914. ⟨10.1111/j.1462-2920.2011.02566.x⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/j.1462-2920.2011.02566.x
- Accès au bibtex
-
- titre
- LuxR dependent quorum sensing inhibition by N,N'-disubstituted imidazolium salts.
- auteur
- Mohamad Sabbah, Laurent Soulère, Sylvie Reverchon, Y. Queneau, Alain Doutheau
- article
- Bioorganic and Medicinal Chemistry, 2011, 19 (16), pp.4868-75. ⟨10.1016/j.bmc.2011.06.075⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.bmc.2011.06.075
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-
- titre
- lpxC and yafS are the Most Suitable Internal Controls to Normalize Real Time RT-qPCR Expression in the Phytopathogenic Bacteria Dickeya dadantii
- auteur
- Florence Hommais, Ouafa Zghidi-Abouzid, Christine Oger-Desfeux, Emilie Pineau, Frederique van Gijsegem, William Nasser, Sylvie Reverchon
- article
- PLoS ONE, 2011, 6 (5), ⟨10.1371/journal.pone.0020269⟩
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0020269
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Electrochemical monitoring of Chlorhexidine Digluconate effect on polyelectrolyte immobilized bacteria and kinetic cell adhesion
- auteur
- Nabil Borghol, Laurence Mora, N. Sakly, Philippe Lejeune, Thierry Jouenne, Nicole Jaffrezic-Renault, A. Othmane
- article
- Journal of Biotechnology, 2011, 151 (1), pp.114-121. ⟨10.1016/j.jbiotec.2010.11.014⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.jbiotec.2010.11.014
- Accès au bibtex
-
- titre
- Molecular identification and pectate lyase production by Bacillus strains involved in cocoa fermentation
- auteur
- H. G. Ouattara, Sylvie Reverchon, S. L. Niamke, William Nasser
- article
- Food Microbiology, 2011, 28 (1), pp.1-8
- Accès au bibtex
-
- titre
- Genome sequence of the plant-pathogenic bacterium Dickeya dadantii 3937.
- auteur
- Jeremy D. Glasner, Ching-Hong Yang, Sylvie Reverchon, Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat, Guy Condemine, Jean-Pierre Bohin, Frédérique van Gijsegem, Shihui Yang, Thierry Franza, Dominique Expert, Guy Plunkett, Michael J. San Francisco, Amy O. Charkowski, Béatrice Py, Kenneth Bell, Lise Rauscher, Pablo Rodriguez-Palenzuela, Ariane Toussaint, Maria C. Holeva, Sheng Yang He, Vanessa Douet, Martine Boccara, Carlos Blanco, Ian Toth, Bradley D. Anderson, Bryan S. Biehl, Bob Mau, Sarah M. Flynn, Frédéric Barras, Magdalen Lindeberg, Paul R. J. Birch, Shinji Tsuyumu, Xiangyang Shi, Michael Hibbing, Mee-Ngan Yap, Mathilde Carpentier, Elie Dassa, Masahiro Umehara, Jihyun F. Kim, Michael Rusch, Pritin Soni, George F. Mayhew, Derrick E. Fouts, Steven R. Gill, Frederick R. Blattner, Noel T. Keen, Nicole T. Perna
- article
- Journal of Bacteriology, 2011, 193 (8), pp.2076-7. ⟨10.1128/JB.01513-10⟩
- DOI
- DOI : 10.1128/JB.01513-10
- Accès au bibtex
-
2010
- titre
- Systematic targeted mutagenesis of the MarR/SlyA family members of Dickeya dadantii 3937 reveals a role for MfbR in the modulation of virulence gene expression in response to acidic pH
- auteur
- Sylvie Reverchon, Frederique F. van Gijsegem, Géraldine Effantin, Ouafa Zghidi-Abouzid, William Nasser
- article
- Molecular Microbiology, 2010, 78 (4), pp.1018-1037. ⟨10.1111/j.1365-2958.2010.07388.x⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/j.1365-2958.2010.07388.x
- Accès au bibtex
-
- titre
- Has the final countdown to wildlife extinction in Northern Central African Republic begun?
- auteur
- Philippe Bouché, Pierre-Cyril Renaud, Philippe Lejeune, Cédric Vermeulen, Jean-Marc Froment, Alfred Bangara, Okclefort Fiongai, Antoine Abdoulaye, Raymond Abakar, Mike Fay
- article
- African Journal of Ecology, 2010, 48 (4), pp.994-1003. ⟨10.1111/j.1365-2028.2009.01202.x⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/j.1365-2028.2009.01202.x
- Accès au bibtex
-
- titre
- Toward a quantitative modeling of the synthesis of the pectate lyases, essential virulence factors in Dickeya dadantii
- auteur
- W. D. Kepseu, J. A. Sepulchre, Sylvie Reverchon, William Nasser
- article
- Journal of Biological Chemistry, 2010, 285 (37), pp.28565-76. ⟨10.1074/jbc.M110.114710⟩
- DOI
- DOI : 10.1074/jbc.M110.114710
- Accès au bibtex
-
- titre
- Biochemical properties of pectate lyases produced by three different Bacillus strains isolated from fermenting cocoa beans and characterization of their cloned genes
- auteur
- H. G. Ouattara, Sylvie Reverchon, S. L. Niamke, William Nasser
- article
- Applied and Environmental Microbiology, 2010, 76 (15), pp.5214-20. ⟨10.1128/AEM.00705-10⟩
- DOI
- DOI : 10.1128/AEM.00705-10
- Accès au bibtex
-
2008
- titre
- The crystal structure of pectate lyase peli from soft rot pathogen Erwinia chrysanthemi in complex with its substrate
- auteur
- Christophe Crezé, Sandra Castang, Emmanuel Derivery, Richard Haser, Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat, Vladimir Shevchik, Patrice Gouet
- article
- Journal of Biological Chemistry, 2008, 283 (26), pp.18260-18268. ⟨10.1074/jbc.M709931200⟩
- DOI
- DOI : 10.1074/jbc.M709931200
- Accès au texte intégral et bibtex
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2007
- titre
- The DNA nucleoid-associated protein Fis co-ordinates the expression of the main virulence genes in the phytopathogenic bacterium Erwinia chrysanthemi
- auteur
- Thomas Lautier, William Nasser
- article
- Molecular Microbiology, 2007, 66 (6), pp.071119190133007-???. ⟨10.1111/j.1365-2958.2007.06012.x⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/j.1365-2958.2007.06012.x
- Accès au bibtex
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1998
- titre
- Characterization of the Erwinia chrysanthemi expI-expR locus directing the synthesis of two N-acyl-homoserine lactone signal molecules
- auteur
- William Nasser, Marie-Louise Bouillant, G. Salmond, Sylvie Reverchon
- article
- Molecular Microbiology, 1998, 29 (6), pp.1391-405. ⟨10.1046/j.1365-2958.1998.01022.x⟩
- DOI
- DOI : 10.1046/j.1365-2958.1998.01022.x
- Accès au bibtex
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