Publications HAL du labo/EPI CRP de la collection UMR5240

2020

titre
TwisTranscripT: stochastic simulation of the transcription-supercoiling coupling
auteur
Bilal El Houdaigui, Sam Meyer
article
Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2020, 36 (12), pp.3899-3901. ⟨10.1093/bioinformatics/btaa221⟩
DOI
DOI : 10.1093/bioinformatics/btaa221
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titre
Separation and quantification of 2-Keto-3-deoxy-gluconate (KDG) a major metabolite in pectin and alginate degradation pathways
auteur
Shiny Martis B., Michel Droux, Florelle Deboudard, William Nasser, Sam Meyer, Sylvie Reverchon
article
Analytical Biochemistry, Elsevier Masson, 2020, pp.114061. ⟨10.1016/j.ab.2020.114061⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.ab.2020.114061
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titre
Plasmid‐chromosome crosstalks
auteur
Ludovic Vial, Florence Hommais
article
Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2020, 22 (2), pp.540-556. ⟨10.1111/1462-2920.14880⟩
DOI
DOI : 10.1111/1462-2920.14880
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titre
The nucleoid-associated protein IHF acts as a ‘transcriptional domainin’ protein coordinating the bacterial virulence traits with global transcription
auteur
Sylvie Reverchon, Sam Meyer, Raphaël Forquet, Florence Hommais, Georgi Muskhelishvili, William Nasser
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2020, ⟨10.1093/nar/gkaa1227⟩
DOI
DOI : 10.1093/nar/gkaa1227
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03091721/file/Reverchon-2020-NAR.pdf BibTex
titre
Pattern and causes of the establishment of the invasive bacterial potato pathogen Dickeya solani and of the maintenance of the resident pathogen D. dianthicola
auteur
Pauline Blin, Kévin Robic, Slimane Khayi, Jérémy Cigna, Euphrasie Munier, Pauline Dewaegeneire, Angélique Laurent, Yan Jaszczyszyn, Kar‐wai Hong, Kok‐gan Chan, Amélie Beury, Sylvie Reverchon, Tatiana Giraud, Valérie Hélias, Denis Faure
article
Molecular Ecology, Wiley, 2020, ⟨10.1111/mec.15751⟩
DOI
DOI : 10.1111/mec.15751
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titre
Dickeya poaceiphila sp. nov., a plant-pathogenic bacterium isolated from sugar cane (Saccharum officinarum)
auteur
Nicole Hugouvieux‐cotte‐pattat, Celine Brochier-Armanet, Jean-Pierre Flandrois, Sylvie Reverchon
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2020, 70 (8), pp.4508-4514. ⟨10.1099/ijsem.0.004306⟩
DOI
DOI : 10.1099/ijsem.0.004306
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2019

titre
Modeling the bioconversion of polysaccharides in a continuous reactor: A case study of the production of oligo-galacturonates by Dickeya dadantii
auteur
Jacques-Alexandre Sepulchre, Sylvie Reverchon, Jean-Luc Gouzé, William Nasser
article
Journal of Biological Chemistry, American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2019, 294 (5), pp.1753-1762. ⟨10.1074/jbc.RA118.004615⟩
DOI
DOI : 10.1074/jbc.RA118.004615
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https://hal.inria.fr/hal-01952846/file/Article_JBC20181105.pdf BibTex
titre
Coherent Domains of Transcription Coordinate Gene Expression During Bacterial Growth and Adaptation
auteur
Georgi Muskhelishvili, Raphaël Forquet, Sylvie Reverchon, Sam Meyer, William Nasser
article
Microorganisms, MDPI, 2019, 7 (12), pp.694. ⟨10.3390/microorganisms7120694⟩
DOI
DOI : 10.3390/microorganisms7120694
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02412664/file/Revue%20CODOS%20microorganisms-07-00694.pdf BibTex
titre
RecA and DNA recombination: a review of molecular mechanisms
auteur
Elsa del Val, William Nasser, Hafid Abaibou, Sylvie Reverchon
article
Biochemical Society Transactions, Portland Press, 2019, ⟨10.1042/BST20190558⟩
DOI
DOI : 10.1042/BST20190558
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titre
APERO: a genome-wide approach for identifying bacterial small RNAs from RNA-Seq data
auteur
Simon Leonard, Sam Meyer, Stéphan Lacour, William Nasser, Florence Hommais, Sylvie Reverchon
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2019, 47 (15), pp.1-12. ⟨10.1093/nar/gkz485⟩
DOI
DOI : 10.1093/nar/gkz485
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titre
The phytopathogenic nature of Dickeya aquatica 174/2 and the dynamic early evolution of Dickeya pathogenicity
auteur
Alexandre Duprey, Najwa Taïb, Simon Leonard, Tiffany Garin, Jean-Pierre Flandrois, William Nasser, Céline Brochier-Armanet, Sylvie Reverchon
article
Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2019, 21 (8), pp.2809-2835. ⟨10.1111/1462-2920.14627⟩
DOI
DOI : 10.1111/1462-2920.14627
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titre
Acetic acid bacteria (AAB) involved in cocoa fermentation from Ivory Coast: species diversity and performance in acetic acid production
auteur
Souleymane Soumahoro, Honoré Ouattara, Michel Droux, William Nasser, Sébastien Niamke, Sylvie Reverchon
article
Journal of Food Science and Technology, Springer Link, 2019, 57, pp.1904-1916. ⟨10.1007/s13197-019-04226-2⟩
DOI
DOI : 10.1007/s13197-019-04226-2
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titre
DNA Supercoiling: an Ancestral Regulator of Gene Expression in Pathogenic Bacteria?
auteur
Shiny Martis B., Raphaël Forquet, Sylvie Reverchon, William Nasser, Sam Meyer
article
Computational and Structural Biotechnology Journal, Elsevier, 2019, 17, pp.1047-1055. ⟨10.1016/j.csbj.2019.07.013⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.csbj.2019.07.013
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titre
A novel plasmid‐transcribed regulatory sRNA, QfsR, controls chromosomal polycistronic gene expression in Agrobacterium fabrum
auteur
Benjamin Diel, Magali Dequivre, Florence Wisniewski-Dyé, Ludovic Vial, Florence Hommais
article
Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2019, 21 (8), pp.3063-3075. ⟨10.1111/1462-2920.14704⟩
DOI
DOI : 10.1111/1462-2920.14704
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titre
Bacterial genome architecture shapes global transcriptional regulation by DNA supercoiling
auteur
Bilal El houdaigui, Raphaël Forquet, Thomas Hindré, Dominique Schneider, William Nasser, Sylvie Reverchon, Sam Meyer
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2019, 47 (11), pp.5648-5657. ⟨10.1093/nar/gkz300⟩
DOI
DOI : 10.1093/nar/gkz300
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2018

titre
ThreaDNA: predicting DNA mechanics’ contribution to sequence selectivity of proteins along whole genomes
auteur
Jasmin Cevost, Cédric Vaillant, Sam Meyer
article
Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2018, 34 (4), pp.609-616. ⟨10.1093/bioinformatics/btx634⟩
DOI
DOI : 10.1093/bioinformatics/btx634
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titre
Chromosomal organization of transcription: in a nutshell
auteur
Sam Meyer, S. Reverchon, W. Nasser, G. Muskhelishvili
article
Current Genetics, Springer Verlag, 2018, 64 (3), pp.555-565
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2017

titre
Regulation of the synthesis of pulp degrading enzymes in Bacillus isolated from cocoa fermentation
auteur
H. G. Ouattara, S. Reverchon, S. L. Niamke, W. Nasser
article
Food Microbiology, Elsevier, 2017, 63, pp.255-262
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titre
New nucleic acid testing devices to diagnose infectious diseases in resource-limited settings
auteur
P. Maffert, S. Reverchon, W. Nasser, C. Rozand, H. Abaibou
article
European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2017, 36 (10), pp.1717-1731
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titre
Erratum to: Multiple controls affect arsenite oxidase gene expression in Herminiimonas arsenicoxydans
auteur
S. Koechler, J. Cleiss-Arnold, C. Proux, O. Sismeiro, M. A. Dillies, F. Goulhen-Chollet, F. Hommais, D. Lièvremont, F. Arsène-Ploetze, J. Y. Coppe, P. N. Bertin
article
BMC Microbiology, BioMed Central, 2017, 17 (1), pp.74
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titre
2-Substituted Aniline as a Simple Scaffold for LuxR-Regulated QS Modulation
auteur
S. Li, J. Wawrzyniak, Y. Queneau, L. Soulère
article
Molecules, MDPI, 2017, 22 (12), pp.E2090. ⟨10.3390/molecules22122090⟩
DOI
DOI : 10.3390/molecules22122090
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02001353/file/LiS_WawrzyniakJ-QueneauY_EtAl_2017.pdf BibTex
titre
Plant-phytopathogen interactions: bacterial responses to environmental and plant stimuli
auteur
Simon Leonard, Florence Hommais, William Nasser, Sylvie Reverchon
article
Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2017, 19 (5), pp.1689 - 1716. ⟨10.1111/1462-2920.13611⟩
DOI
DOI : 10.1111/1462-2920.13611
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titre
Lactic acid bacteria involved in cocoa beans fermentation from Ivory Coast: Species diversity and citrate lyase production
auteur
Hadja Ouattara, Honoré Ouattara, Michel Droux, Sylvie Reverchon, William Nasser, Sébastien Niamke
article
International Journal of Food Microbiology, Elsevier, 2017, 256, pp.11-19. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2017.05.008⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.ijfoodmicro.2017.05.008
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2016

titre
Regulation of pel genes, major virulence factors in the plant pathogen bacterium Dickeya dadantii, is mediated by cooperative binding of the nucleoid-associated protein H-NS
auteur
O. Zghidi-Abouzid, E. Herault, S. Rimsky, S. Reverchon, W. Nasser, M. Buckle
article
Research in Microbiology, Elsevier, 2016, 167 (4), pp.247-253
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titre
Coordinated Regulation of Species-Specific Hydroxycinnamic Acid Degradation and Siderophore Biosynthesis Pathways in Agrobacterium fabrum
auteur
Jessica Baude, Ludovic Vial, Camille Villard, Tony Campillo, Céline Lavire, Xavier Nesme, Florence Hommais
article
Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2016, 82 (12), pp.3515-3524. ⟨10.1128/aem.00419-16⟩
DOI
DOI : 10.1128/aem.00419-16
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titre
Temporal control of Dickeya dadantii main virulence gene expression by growth phase-dependent alteration of regulatory nucleoprotein complexes
auteur
A. Duprey, G. Muskhelishvili, S. Reverchon, W. Nasser
article
Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms , Elsevier, 2016, 1859 (11), pp.1470-1480
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titre
Erratum to: Temperature-induced variation in gene expression burst size in metazoan cells
auteur
O. Arnaud, Sam Meyer, E. Vallin, G. Beslon, O. Gandrillon
article
BMC Molecular Biology, BioMed Central, 2016, 17, pp.2
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BibTex
titre
Transcriptional start site turnover in the evolution of bacterial paralogous genes - the pelE-pelD virulence genes in Dickeya
auteur
Alexandre Duprey, William Nasser, Simon Leonard, Céline Brochier-Armanet, S. Reverchon
article
FEBS Journal, Wiley, 2016, 283 (22), pp.4192-4207
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titre
From multiple pathogenicity islands to a unique organized pathogenicity archipelago
auteur
C. Bouyioukos, S. Reverchon, F. Kepes
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6, pp.27978
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BibTex
titre
Global transcriptional response of Dickeya dadantii to environmental stimuli relevant to the plant infection
auteur
X. Jiang, O. Zghidi-Abouzid, C. Oger-Desfeux, F. Hommais, N. Greliche, G. Muskhelishvili, W. Nasser, S. Reverchon
article
Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2016, 18 (11), pp.3651-3672
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BibTex
titre
Effect of a static magnetic field on Escherichia coli adhesion and orientation
auteur
Lotfi Mhamdi, Nejib Mhamdi, Naceur Mhamdi, Philippe Lejeune, Nicole Jaffrezic-Renault, Noël Burais, Riccardo Scorretti, Jiry Pokorny, Laurence Ponsonnet
article
Canadian Journal of Microbiology, NRC Research Press, 2016, 62 (11), pp.944-952. ⟨10.1139/cjm-2015-0839⟩
DOI
DOI : 10.1139/cjm-2015-0839
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2015

titre
IscR Regulates Synthesis of Colonization Factor Antigen I Fimbriae in Response to Iron Starvation in Enterotoxigenic Escherichia coli
auteur
S. Haines, N. Arnaud-Barbe, D. Poncet, S. Reverchon, J. Wawrzyniak, W. Nasser, G. Renauld-Mongenie
article
Journal of Bacteriology, American Society for Microbiology, 2015, 197 (18), pp.2896-907
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BibTex
titre
Upstream binding of idling RNA polymerase modulates transcription initiation from a nearby promoter
auteur
V. Gerganova, S. Maurer, L. Stoliar, A. Japaridze, G. Dietler, W. Nasser, T. Kutateladze, A. Travers, G. Muskhelishvili
article
Journal of Biological Chemistry, American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2015, 290 (13), pp.8095-109
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titre
Small RNA Deep-Sequencing Analyses Reveal a New Regulator of Virulence in Agrobacterium fabrum C58
auteur
M. Dequivre, B. Diel, C. Villard, O. Sismeiro, M. Durot, J. Y. Coppee, X. Nesme, L. Vial, F. Hommais
article
Mol Plant Microbe Interact, 2015, 28 (5), pp.580-9
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BibTex
titre
DNA Physical Properties and Nucleosome Positions Are Major Determinants of HIV-1 Integrase Selectivity
auteur
Monica Naughtin, Zofia Haftek-Terreau, Johan Xavier, Sam Meyer, Maud Silvain, Yan Jaszczyszyn, Nicolas Lévy, Vincent Miele, Mohamed Benleulmi, Marc Ruff, Vincent Parissi, Cédric Vaillant, Marc Lavigne
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, 10, pp.e0129427. ⟨10.1371/journal.pone.0129427⟩
DOI
DOI : 10.1371/journal.pone.0129427
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https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-01416841/file/Naughtin2015.pdf BibTex
titre
Inferring coarse-grain histone-DNA interaction potentials from high-resolution structures of the nucleosome
auteur
Sam Meyer, R. Everaers
article
Journal of Physics: Condensed Matter, IOP Publishing, 2015, 27 (6), pp.064101
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BibTex
titre
Identification of Novel Components Influencing Colonization Factor Antigen I Expression in Enterotoxigenic Escherichia coli
auteur
S. Haines, S. Gautheron, W. Nasser, G. Renauld-Mongenie
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, 10 (10), pp.e0141469
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titre
Chromosomal "stress-response" domains govern the spatiotemporal expression of the bacterial virulence program
auteur
X. Jiang, P. Sobetzko, W. Nasser, S. Reverchon, G. Muskhelishvili
article
mBio, American Society for Microbiology, 2015, 6 (3), pp.e00353-15
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BibTex
titre
Temperature-induced variation in gene expression burst size in metazoan cells
auteur
Ophélie Arnaud, Sam Meyer, Elodie Vallin, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon
article
BMC Molecular Biology, BioMed Central, 2015, 16 (20), ⟨10.1186/s12867-015-0048-2⟩
DOI
DOI : 10.1186/s12867-015-0048-2
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2014

titre
Bacterial virulence and Fis: adapting regulatory networks to the host environment
auteur
A. Duprey, S. Reverchon, W. Nasser
article
Trends in Microbiology, Elsevier, 2014, 22 (2), pp.92-9
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BibTex
titre
Role of the LysR-type transcriptional regulator PecT and DNA supercoiling in the thermoregulation of pel genes, the major virulence factors in Dickeya dadantii
auteur
E. Herault, S. Reverchon, W. Nasser
article
Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2014, 16 (3), pp.734-45
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BibTex
titre
NiCo Buster: Engineering E. coli for fast and efficient capture of cobalt and nickel
auteur
A. Duprey, V. Chansavang, F. Frémion, C. Gonthier, Y. Louis, P. Lejeune, F. Springer, V. Desjardin, Agnès Rodrigue, C. Dorel
article
Journal of Biological Engineering, BioMed Central, 2014, 8 (1), pp.19. ⟨10.1186/1754-1611-8-19⟩
DOI
DOI : 10.1186/1754-1611-8-19
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01760900/file/1754-1611-8-19.pdf BibTex
titre
Torsion-Mediated Interaction between Adjacent Genes
auteur
Sam Meyer, Guillaume Beslon
article
PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2014, 10 (9), pp.e1003785. ⟨10.1371/journal.pcbi.1003785⟩
DOI
DOI : 10.1371/journal.pcbi.1003785
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01090990/file/Meyer14.pdf BibTex
titre
Analysis of hydroxycinnamic acid degradation in Agrobacterium fabrum reveals a coenzyme A-dependent, beta-oxidative deacetylation pathway
auteur
T. Campillo, S. Renoud, I. Kerzaon, L. Vial, J. Baude, V. Gaillard, F. Bellvert, C. Chamignon, G. Comte, X. Nesme, C. Lavire, F. Hommais
article
Appl Environ Microbiol, 2014, 80 (11), pp.3341-9
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2013

titre
Dickeya ecology, environment sensing and regulation of virulence programme
auteur
S. Reverchon, W. Nasser
article
Environ Microbiol Rep, 2013, 5 (5), pp.622-36
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BibTex
titre
Vfm a new quorum sensing system controls the virulence of Dickeya dadantii.
auteur
William Nasser, Corinne Dorel, Julien Wawrzyniak, Frédérique van Gijsegem, Marie-Christine Groleau, Eric Déziel, Sylvie Reverchon
article
Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2013, 15 (3), pp.865-80. ⟨10.1111/1462-2920.12049⟩
DOI
DOI : 10.1111/1462-2920.12049
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2012

titre
The nucleoid-associated proteins H-NS and FIS modulate the DNA supercoiling response of the pel genes, the major virulence factors in the plant pathogen bacterium Dickeya dadantii
auteur
Zghidi-Abouzid Ouafa, Sylvie Reverchon, Thomas Lautier, Georgi Muskhelishvili, William Nasser
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2012, 40 (10), pp.4306-4319. ⟨10.1093/nar/gks014⟩
DOI
DOI : 10.1093/nar/gks014
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BibTex
titre
Structural basis for selective GABA binding in bacterial pathogens
auteur
S. Planamente, S. Mondy, F. Hommais, A. Vigouroux, S. Morera, D. Faure
article
Mol Microbiol, 2012, 86 (5), pp.1085-99
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BibTex
titre
The nucleoid-associated proteins H-NS and FIS modulate the DNA supercoiling response of the pel genes, the major virulence factors in the plant pathogen bacterium Dickeya dadantii
auteur
Z. A. Ouafa, S. Reverchon, T. Lautier, G. Muskhelishvili, W. Nasser
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2012, 40 (10), pp.4306-19
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BibTex
titre
The Role of Secretion Systems and Small Molecules in Soft-Rot Enterobacteriaceae Pathogenicity
auteur
Amy Charkowski, Carlos Blanco, Guy Condemine, Dominique Expert, Thierry Franza, Christopher Hayes, Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat, Emilia Lopez Solanilla, David Low, Lucy Moleleki, Minna Pirhonen, Andrew Pitman, Nicole Perna, Sylvie Reverchon, Pablo Rodriguez Palenzuela, Michael San Francisco, Ian Toth, Shinji Tsuyumu, Jacquie van der Waals, Jan van der Wolf, Frederique van Gijsegem, Ching-Hong Yang, Iris Yedidia
article
Annual Review of Phytopathology, Annual Reviews, 2012, 50, pp.425 - 449. ⟨10.1146/annurev-phyto-081211-173013⟩
DOI
DOI : 10.1146/annurev-phyto-081211-173013
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BibTex
titre
Quorum sensing signaling molecules produced by reference and emerging soft-rot bacteria (Dickeya and Pectobacterium spp.).
auteur
Alexandre Crépin, Corinne Barbey, Amélie Beury-Cirou, Valérie Hélias, Laure Taupin, Sylvie Reverchon, William Nasser, Denis Faure, Alain Dufour, Nicole Orange, Marc Feuilloley, Karin Heurlier, Jean-François Burini, Xavier Latour
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2012, 7 (4), pp.e35176. ⟨10.1371/journal.pone.0035176⟩
DOI
DOI : 10.1371/journal.pone.0035176
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00857430/file/crepin_2012_1.pdf BibTex
titre
The nucleoid-associated protein Fis directly modulates the synthesis of cellulose, an essential component of pellicle-biofilms in the phytopathogenic bacterium Dickeya dadantii.
auteur
Claire Prigent-Combaret, Ouafa Zghidi-Abouzid, Géraldine Effantin, Philippe Lejeune, Sylvie Reverchon, William Nasser
article
Molecular Microbiology, Wiley, 2012, 86 (1), pp.172-86
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BibTex

2011

titre
Molecular identification and pectate lyase production by Bacillus strains involved in cocoa fermentation
auteur
H. G. Ouattara, S. Reverchon, S. L. Niamke, W. Nasser
article
Food Microbiology, Elsevier, 2011, 28 (1), pp.1-8
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BibTex
titre
PecS is an important player in the regulatory network governing the coordinated expression of virulence genes during the interaction between [i]Dickeya dadantii[/i] 3937 and plants
auteur
Nadia Mhedbi-Hajri, Pierrette Malfatti, Jacques Pedron, Stephane Gaubert, Sylvie Reverchon, Frederique van Gijsegem
article
Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2011, 13 (11), pp.2901 - 2914. ⟨10.1111/j.1462-2920.2011.02566.x⟩
DOI
DOI : 10.1111/j.1462-2920.2011.02566.x
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BibTex
titre
Electrochemical monitoring of Chlorhexidine Digluconate effect on polyelectrolyte immobilized bacteria and kinetic cell adhesion
auteur
Nabil Borghol, Laurence Mora, N. Sakly, Philippe Lejeune, Thierry Jouenne, Nicole Jaffrezic-Renault, A. Othmane
article
Journal of Biotechnology, Elsevier, 2011, 151 (1), pp.114-121. ⟨10.1016/j.jbiotec.2010.11.014⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.jbiotec.2010.11.014
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BibTex
titre
LuxR dependent quorum sensing inhibition by N,N'-disubstituted imidazolium salts.
auteur
Mohamad Sabbah, Laurent Soulère, Sylvie Reverchon, Y. Queneau, Alain Doutheau
article
Bioorganic and Medicinal Chemistry, Elsevier, 2011, 19 (16), pp.4868-75. ⟨10.1016/j.bmc.2011.06.075⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.bmc.2011.06.075
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PecS is an important player in the regulatory network governing the coordinated expression of virulence genes during the interaction between Dickeya dadantii 3937 and plants
auteur
N. Mhedbi-Hajri, P. Malfatti, J. Pedron, S. Gaubert, S. Reverchon, F. van Gijsegem
article
Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2011, 13 (11), pp.2901-14
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lpxC and yafS are the Most Suitable Internal Controls to Normalize Real Time RT-qPCR Expression in the Phytopathogenic Bacteria Dickeya dadantii
auteur
Florence Hommais, Ouafa Zghidi-Abouzid, Christine Oger-Desfeux, Emilie Pineau, Frederique van Gijsegem, William Nasser, Sylvie Reverchon
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2011, 6 (5), ⟨10.1371/journal.pone.0020269⟩
DOI
DOI : 10.1371/journal.pone.0020269
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01190471/file/2011_Hommais_Plosone_1.pdf BibTex
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Genome sequence of the plant-pathogenic bacterium Dickeya dadantii 3937.
auteur
Jeremy D. Glasner, Ching-Hong Yang, Sylvie Reverchon, Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat, Guy Condemine, Jean-Pierre Bohin, Frédérique van Gijsegem, Shihui Yang, Thierry Franza, Dominique Expert, Guy Plunkett, Michael J. San Francisco, Amy O. Charkowski, Béatrice Py, Kenneth Bell, Lise Rauscher, Pablo Rodriguez-Palenzuela, Ariane Toussaint, Maria C. Holeva, Sheng Yang He, Vanessa Douet, Martine Boccara, Carlos Blanco, Ian Toth, Bradley D. Anderson, Bryan S. Biehl, Bob Mau, Sarah M. Flynn, Frédéric Barras, Magdalen Lindeberg, Paul R. J. Birch, Shinji Tsuyumu, Xiangyang Shi, Michael Hibbing, Mee-Ngan Yap, Mathilde Carpentier, Elie Dassa, Masahiro Umehara, Jihyun F. Kim, Michael Rusch, Pritin Soni, George F. Mayhew, Derrick E. Fouts, Steven R. Gill, Frederick R. Blattner, Noel T. Keen, Nicole T. Perna
article
Journal of Bacteriology, American Society for Microbiology, 2011, 193 (8), pp.2076-7. ⟨10.1128/JB.01513-10⟩
DOI
DOI : 10.1128/JB.01513-10
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2010

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Biochemical properties of pectate lyases produced by three different Bacillus strains isolated from fermenting cocoa beans and characterization of their cloned genes
auteur
H. G. Ouattara, S. Reverchon, S. L. Niamke, W. Nasser
article
Appl Environ Microbiol, 2010, 76 (15), pp.5214-20
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Toward a quantitative modeling of the synthesis of the pectate lyases, essential virulence factors in Dickeya dadantii
auteur
W. D. Kepseu, J. A. Sepulchre, S. Reverchon, W. Nasser
article
Journal of Biological Chemistry, American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2010, 285 (37), pp.28565-76
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Systematic targeted mutagenesis of the MarR/SlyA family members of Dickeya dadantii 3937 reveals a role for MfbR in the modulation of virulence gene expression in response to acidic pH
auteur
S. Reverchon, F. van Gijsegem, G. Effantin, O. Zghidi-Abouzid, W. Nasser
article
Mol Microbiol, 2010, 78 (4), pp.1018-37
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2007

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The DNA nucleoid-associated protein Fis co-ordinates the expression of the main virulence genes in the phytopathogenic bacterium Erwinia chrysanthemi
auteur
Thomas Lautier, William Nasser
article
Molecular Microbiology, Wiley, 2007, 66 (6), pp.071119190133007-???. ⟨10.1111/j.1365-2958.2007.06012.x⟩
DOI
DOI : 10.1111/j.1365-2958.2007.06012.x
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