Publications HAL du labo/EPI FungiPath;GFCP de la collection UMR5240

2022

titre
Snf1 Kinase Differentially Regulates Botrytis cinerea Pathogenicity according to the Plant Host
auteur
Szabina Lengyel, Christine Rascle, Nathalie Poussereau, Christophe Bruel, Luca Sella, Mathias M. Choquer, Francesco Favaron
article
Microorganisms, 2022, 10 (2), pp.444. ⟨10.3390/microorganisms10020444⟩
DOI
DOI : 10.3390/microorganisms10020444
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03586344/file/microorganisms-10-00444-v2.pdf BibTex
titre
Evidencing New Roles for the Glycosyl-Transferase Cps1 in the Phytopathogenic Fungus Botrytis cinerea
auteur
Matthieu Blandenet, Isabelle R Gonçalves, Christine Rascle, Jean-William Dupuy, François-Xavier Gillet, Nathalie Poussereau, Mathias Choquer, Christophe Bruel
article
Journal of Fungi, 2022, 8 (9), pp.899. ⟨10.3390/jof8090899⟩
DOI
DOI : 10.3390/jof8090899
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03797089/file/jof-08-00899-v3-3.pdf BibTex
titre
The Candida glabrata glycogen branching enzyme structure reveals unique features of branching enzymes of the Saccharomycetaceae phylum
auteur
Léa Conchou, Juliette Martin, Isabelle R. Gonçalves, Frédéric Galisson, Sébastien Violot, Florence Guillière, Nushin Aghajari, Lionel Ballut
article
Glycobiology, 2022, ⟨10.1093/glycob/cwab110⟩
DOI
DOI : 10.1093/glycob/cwab110
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titre
Are Methionine Sulfoxide-Containing Proteins Related to Seed Longevity? A Case Study of Arabidopsis thaliana Dry Mature Seeds Using Cyanogen Bromide Attack and Two-Dimensional-Diagonal Electrophoresis
auteur
Ewa Marzena Kalemba, Benoît Valot, Dominique Job, Christophe Bailly, Patrice Meimoun
article
Plants, 2022, 11 (4), pp.569. ⟨10.3390/plants11040569⟩
DOI
DOI : 10.3390/plants11040569
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titre
Tertiary and Quaternary Structure Organization in GMP Synthetases: Implications for Catalysis
auteur
Lionel Ballut, Sébastien Violot, Frédéric Galisson, Isabelle R. Gonçalves, Juliette Martin, Santosh Shivakumaraswamy, Loïc Carrique, Hemalatha Balaram, Nushin Aghajari
article
Biomolecules, 2022, 12 (7), pp.871. ⟨10.3390/biom12070871⟩
DOI
DOI : 10.3390/biom12070871
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03708048/file/Ballut%20et%20al.%20-%202022%20-%20Tertiary%20and%20Quaternary%20Structure%20Organization%20in%20.pdf BibTex

2021

titre
Structure–function analysis of pectate lyase Pel3 reveals essential facets of protein recognition by the bacterial type 2 secretion system.
auteur
Camille Pineau, Natalia Guschinskaya, Isabelle R. Gonçalves, Florence Ruaudel, Xavier Robert, Patrice Gouet, Lionel Ballut, Vladimir Shevchik
article
Journal of Biological Chemistry, 2021, pp.100305. ⟨10.1016/j.jbc.2021.100305⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.jbc.2021.100305
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03143879/file/JBC2021_Pineau%20et%20al.pdf BibTex
titre
Identification and characterization of a new soybean promoter induced by Phakopsora pachyrhizi, the causal agent of Asian soybean rust
auteur
L. Cabre, S. Peyrard, C. Sirven, L. Gilles, B. Pelissier, S. Ducerf, N. Poussereau
article
BMC Biotechnology, 2021, 21, pp.27. ⟨10.1186/s12896-021-00684-9⟩
DOI
DOI : 10.1186/s12896-021-00684-9
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titre
The infection cushion of Botrytis cinerea : a fungal ‘weapon’ of plant‐biomass destruction
auteur
Mathias M. Choquer, Christine Rascle, Isabelle R. Gonçalves, Amélie de Vallée, Cécile Ribot, Elise Loisel, Pavlé Smilevski, Jordan Ferria, Mahamadi Savadogo, Eytham Souibgui, Marie‐josèphe Gagey, Jean‐william Dupuy, Jeffrey Rollins, Riccardo Marcato, Camille Noûs, Christophe Bruel, Nathalie Poussereau
article
Environmental Microbiology, 2021, 23, pp.2293-2314. ⟨10.1111/1462-2920.15416⟩
DOI
DOI : 10.1111/1462-2920.15416
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03153197/file/Choquer2021_HALversion.pdf BibTex
titre
Clathrin Is Important for Virulence Factors Delivery in the Necrotrophic Fungus Botrytis cinerea
auteur
Eytham Souibgui, Christophe Bruel, Mathias M. Choquer, Amélie de Vallée, Cindy Dieryckx, Jean William Dupuy, Marie-Pascale Latorse, Christine Rascle, Nathalie Poussereau
article
Frontiers in Plant Science, 2021, 12, pp.668937. ⟨10.3389/fpls.2021.668937⟩
DOI
DOI : 10.3389/fpls.2021.668937
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titre
ScreenSeed as a novel high throughput seed germination phenotyping method
auteur
Nicolas Merieux, Pierre Cordier, Marie-Hélène Wagner, Sylvie Ducournau, Sophie Aligon, Dominique Job, Philippe Grappin, Edwin Grappin
article
Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-020-79115-2⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41598-020-79115-2
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2020

titre
Systems-Based Approaches to Unravel Networks and Individual Elements Involved in Apple Superficial Scald
auteur
Evangelos Karagiannis, Georgia Tanou, Federico Scossa, Martina Samiotaki, Michail Michailidis, Maria Manioudaki, François Laurens, Dominique Job, Alisdair Fernie, Mathilde Orsel, Athanassios Molassiotis
article
Frontiers in Plant Science, 2020, 11, ⟨10.3389/fpls.2020.00008⟩
DOI
DOI : 10.3389/fpls.2020.00008
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titre
The Multiple Facets of Plant–Fungal Interactions Revealed Through Plant and Fungal Secretomics
auteur
Delphine Vincent, Maryam Rafiqi, Dominique Job
article
Frontiers in Plant Science, 2020, 10, pp.1626. ⟨10.3389/fpls.2019.01626⟩
DOI
DOI : 10.3389/fpls.2019.01626
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titre
Plant nitrogen supply affects the Botrytis cinerea infection process and modulates known and novel virulence factors
auteur
Marie‐christine Soulie, Shamsuddin Mia Koka, Kévin Floch, Baptiste Vancostenoble, Deborah Barbe, Antoine Daviere, Ludivine Soubigou‐taconnat, Veronique Brunaud, Nathalie Poussereau, Elise Loisel, Amelie Devallee, Dominique Expert, Mathilde Fagard
article
Molecular Plant Pathology, 2020, 21, pp.1436-1450. ⟨10.1111/mpp.12984⟩
DOI
DOI : 10.1111/mpp.12984
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2019

titre
A Similar Secretome Disturbance as a Hallmark of Non-pathogenic Botrytis cinerea ATMT-Mutants?
auteur
Amélie de Vallée, Pascal Bally, Christophe Bruel, Lucie Chandat, Mathias Choquer, Cindy Dieryckx, Jean William Dupuy, Sophie Kaiser, Marie-Pascale Latorse, Elise Loisel, Géraldine Mey, Guillaume Morgant, Christine Rascle, Julia Schumacher, Adeline Simon, Eytham Souibgui, Muriel M. Viaud, François Villalba, Nathalie Poussereau
article
Frontiers in Microbiology, 2019, 10 (2829), 13 p. ⟨10.3389/fmicb.2019.02829⟩
DOI
DOI : 10.3389/fmicb.2019.02829
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titre
Amborella – Bearing witness to the past ?
auteur
Valerie Poncet, Philippe Birnbaum, Valérie Burtet-Sarramegna, Alexandre de Kochko, Bruno Fogliani, Gildas Gateble, Sandrine Isnard, Tanguy Jaffré, Dominique Job, François F. Munoz, Jérôme Munzinger, C.P. Scutt, Rémi Tournebize, Santiago Trueba, Yohan Pillon
article
Annual Plant Reviews Online, 2019, 3, pp.1 - 41. ⟨10.1002/9781119312994.apr0689⟩
DOI
DOI : 10.1002/9781119312994.apr0689
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titre
A secreted metal-binding protein protects necrotrophic phytopathogens from reactive oxygen species
auteur
Lulu Liu, Virginie Gueguen-Chaignon, Isabelle R. Gonçalves, Christine C. Rascle, Martine Rigault, Alia Dellagi, Elise Loisel, Nathalie Poussereau, Agnès Rodrigue, Laurent Terradot, Guy Condemine
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), pp.4853. ⟨10.1038/s41467-019-12826-x⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41467-019-12826-x
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02336631/file/A%20secreted%20metal-binding%20protein%20protects%20necrotrophic%20phytopathogens%20from%20reactive%20oxygen%20species_2019.pdf BibTex

2018

titre
Patterns of protein carbonylation during Medicago truncatula seed maturation
auteur
Pascale Satour, Chvan Youssef, Benoit Ly Vu, Béatrice Teulat, Emilie Chatelain, Claudette Job, Dominique Job, Françoise Montrichard
article
Plant, Cell and Environment, 2018, 41 (9), pp.2183-2194. ⟨10.1111/pce.13194⟩
DOI
DOI : 10.1111/pce.13194
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titre
The pH regulator PacC: a host-dependent virulence factor in Botrytis cinerea
auteur
Christine Rascle, Cindy Dieryckx, Jean William Dupuy, Laetitia Muszkieta, Eytham Souibgui, Michel Droux, Christophe Bruel, Vincent Girard, Nathalie Poussereau
article
Environmental Microbiology Reports, 2018, 10 (5), pp.555-568. ⟨10.1111/1758-2229.12663⟩
DOI
DOI : 10.1111/1758-2229.12663
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2017

titre
Comprehensive proteome profiling in Aedes albopictus to decipher Wolbachia-arbovirus interference phenomenon
auteur
Yoann Saucereau, Claire Valiente Moro, Cindy Dieryckx, Jean-William Dupuy, Florence-Hélène Tran, Vincent Girard, Patrick Potier, Patrick Mavingui
article
BMC Genomics, 2017, 18 (1), pp.635. ⟨10.1186/s12864-017-3985-y⟩
DOI
DOI : 10.1186/s12864-017-3985-y
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https://hal.univ-reunion.fr/hal-01589764/file/Saucerau%20et%20al%202017%20BMC%20Genomics%20%28proteomics%29.pdf BibTex

2016

titre
How Can Secretomics Help Unravel the Secrets of Plant-Microbe Interactions?
auteur
Delphine Vincent, Kim M. Plummer, Peter S. Solomon, Marc-Henri Lebrun, Dominique Job, Maryam Rafiqi
article
Frontiers in Plant Science, 2016, open access, 1 p. ⟨10.3389/fpls.2016.01777⟩
DOI
DOI : 10.3389/fpls.2016.01777
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01604807/file/fpls-07-01777_1.pdf BibTex
titre
Genome-wide analyses of chitin synthases identify horizontal gene transfers towards bacteria and allow a robust and unifying classification into fungi
auteur
Isabelle R. Gonçalves, Sophie Brouillet, Marie-Christine Soulié, Simonetta Gribaldo, Catherine Sirven, Noémie Charron, Martine Boccara, Mathias Choquer
article
BMC Evolutionary Biology, 2016, 16, pp.252. ⟨10.1186/s12862-016-0815-9⟩
DOI
DOI : 10.1186/s12862-016-0815-9
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01425978/file/genome.pdf BibTex

2015

titre
Comparative genomics, proteomics and transcriptomics give new insight into the exoproteome of the basidiomycete Hebeloma cylindrosporum and its involvement in ectomycorrhizal symbiosis
auteur
Jeanne Dore, Marie Perraud, Cindy Dieryckx, Annegret Kohler, Emmanuelle Morin, Bernard Henrissat, Erika Lindquist, Sabine D. Zimmermann, Vincent Girard, Alan Kuo, Igor V Grigoriev, Francis Martin, Roland Marmeisse, Gilles Gay
article
New Phytologist, 2015, 208 (4), pp.1169-1187. ⟨10.1111/nph.13546⟩
DOI
DOI : 10.1111/nph.13546
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BibTex
titre
Methionine Biosynthesis is Essential for Infection in the Rice Blast Fungus Magnaporthe oryzae
auteur
Marie Emmanuelle Saint-Macary, Crystel Barbisan, Marie Josèphe Gagey, Océane Frelin, Roland R. Beffa, Marc Henri Lebrun, Michel Droux
article
PLoS ONE, 2015, 10 (4), pp.e0111108. ⟨10.1371/journal.pone.0111108⟩
DOI
DOI : 10.1371/journal.pone.0111108
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02320054/file/MET6.pdf BibTex
titre
Beyond plant defense: insights on the potential of salicylic and methylsalicylic acid to contain growth of the phytopathogen Botrytis cinerea
auteur
C. Dieryckx, V. Gaudin, J. W. Dupuy, M. Bonneu, V. Girard, D. Job
article
Frontiers in Plant Science, 2015, 6, pp.859. ⟨10.3389/fpls.2015.00859⟩
DOI
DOI : 10.3389/fpls.2015.00859
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2014

titre
The Basis for Evolution of DNA-Binding Specificity of the Aft1 Transcription Factor in Yeasts.
auteur
Isabelle R Gonçalves, Natalia Conde E Silva, Cesar La Torre Garay, Emmanuel Lesuisse, Jean Michel Camadro, Pierre Louis Blaiseau
article
Genetics, Genetics Society of America, 2014, 196 (1), pp.149-160. ⟨10.1534/genetics.113.157693⟩
DOI
DOI : 10.1534/genetics.113.157693
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titre
Investigating the Role of Dicer 2 (dcr2) in Gene Silencing and the Regulation of Mycoviruses in Botrytis cinerea.
auteur
Seuseu J. Tauatia, Michael N. Pearson, Mathias Choquer, Gary D. Fostera, Andy M. Bailey
article
Microbiology, 2014, 83 (1-2), pp.140-148
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titre
Fungal model systems and the elucidation of pathogenicity determinants
auteur
Elena Perez-Nadales, Maria Filomena Almeida Nogueira, Clara Baldin, Sonia Castanheira, Mennat El Ghalid, Elisabeth Grund, Klaus Lengeler, Elisabetta E. Marchegiani, Pankaj Vinod Mehrotra, Marino Moretti, Vikram Naik, Miriam Oses-Ruiz, Therese Oskarsson, Katja Schaefer, Lisa Wasserstrom, Axel A. Brakhage, Neil A. R. Gow, Regine Kahmann, Marc-Henri M.-H. Lebrun, Jose Perez-Martin, Antonio Di Pietro, Nicholas J. Talbot, Valerie Toquin, Andrea Walther, Jurgen Wendland
article
Fungal Genetics and Biology, 2014, 70, pp.42 - 67. ⟨10.1016/j.fgb.2014.06.011⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.fgb.2014.06.011
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2013

titre
The Amborella Genome and the Evolution of Flowering Plants
auteur
Victor A. Albert, W. Bradley Barbazuk, Claude W. Depamphilis, Joshua P. Der, James Leebens-Mack, Hong Ma, Jeffrey D. Palmer, Steve Rounsley, David Sankoff, Stephan C. Schuster, Douglas E. Soltis, Pamela S. Soltis, Susan R. Wessler, Rod A. Wing, Jetty S. S. Ammiraju, Srikar Chamala, Andre S. Chanderbali, Ronald Determann, Paula Ralph, Jason Talag, Lynn Tomsho, Brandon Walts, Stefan Wanke, Tien-Hao Chang, Tianying Lan, Siwaret Arikit, Michael J. Axtell, Saravanaraj Ayyampalayam, James M. Burnette, Emanuele de Paoli, James C. Estill, Nina P. Farrell, Alex Harkess, Yuannian Jiao, Kun Liu, Wenbin Mei, Blake C. Meyers, Saima Shahid, Eric Wafula, Jixian Zhai, Xiaoyu Zhang, Lorenzo Carretero-Paulet, Eric Lyons, Haibao Tang, Chunfang Zheng, Naomi S. Altman, Feng Chen, Jian-Qun Chen, Vincent Chiang, Bruno Fogliani, Chunce Guo, Jesper Harholt, Claudette Job, Dominique Job, Sangtae Kim, Hongzhi Kong, Guanglin Li, Lin Li, Jie Liu, Jongsun Park, Xinshuai Qi, Loïc Rajjou, Valérie Burtet-Sarramegna, Ron Sederoff, Ying-Hsuan Sun, Peter Ulvskov, Matthieu Villegente, Jia-Yu Xue, Ting-Feng Yeh, Xianxian Yu, Juan J. Acosta, Riva A. Bruenn, Alexandre de Kochko, Luis R. Herrera-Estrella, Enrique Ibarra-Laclette, Matias Kirst, Solon P. Pissis, Valerie Poncet
article
Science, 2013, 342 (6165), pp.1-10. ⟨10.1126/science.1241089⟩
DOI
DOI : 10.1126/science.1241089
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titre
Pseudomonas putida KT2440 response to nickel or cobalt induced stress by quantitative proteomics
auteur
P. Ray, V. Girard, M. Gault, C. Job, M. Bonneu, M.-A. Mandrand-Berthelot, S.S. Singh, D. Job, Agnès Rodrigue
article
Metallomics, 2013, 5 (1), pp.68-79. ⟨10.1039/c2mt20147j⟩
DOI
DOI : 10.1039/c2mt20147j
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titre
Adaptation to pH and role of PacC in the rice blast fungus Magnaporthe oryzae
auteur
P. Landraud, S. Chuzeville, G. Billon-Grande, N. Poussereau, C. Bruel
article
PLoS ONE, 2013, 8 (7), pp.e69236. ⟨10.1371/journal.pone.0069236⟩
DOI
DOI : 10.1371/journal.pone.0069236
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2012

titre
Genetic erosion in wild populations makes resistance to a pathogen more costly
auteur
Émilien Luquet, Trenton W. J. Garner, Jean-Paul Léna, Christophe Bruel, Pierre Joly, Thierry Lengagne, Odile Grolet, Sandrine Plénet
article
Evolution - International Journal of Organic Evolution, Wiley, 2012, 66 (6), pp.1942-1952. ⟨10.1111/j.1558-5646.2012.01570.x⟩
DOI
DOI : 10.1111/j.1558-5646.2012.01570.x
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titre
Proteomic analysis of proteins secreted by Botrytis cinerea in response to heavy metal toxicity
auteur
Semcheddine Cherrad, Vincent Girard, Cindy Dieryckx, Isabelle R. Gonçalves, Jean-William Dupuy, Marc Bonneu, Christine C. Rascle, Claudette C. Job, Dominique Job, Sébastien Vacher, Nathalie Poussereau
article
Metallomics, 2012, 4 (8), pp.835-46. ⟨10.1039/c2mt20041d⟩
DOI
DOI : 10.1039/c2mt20041d
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titre
Seed germination and vigor
auteur
Loïc Rajjou, Manuel M. Duval, Karine K. Gallardo-Guerrero, Julie J. Catusse, Julia J. Bally, Claudette C. Job, Dominique D. Job
article
Annual Review of Plant Biology, 2012, 63, pp.507-533. ⟨10.1146/annurev-arplant-042811-105550⟩
DOI
DOI : 10.1146/annurev-arplant-042811-105550
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01000608/file/Rajjou2012.pdf BibTex
titre
pH modulation differs during sunflower cotyledon colonization by the two closely related necrotrophic fungi Botrytis cinerea and Sclerotinia sclerotiorum
auteur
Geneviève Billon-Grand, Christine Rascle, Michel Droux, Jeffrey Rollins, Nathalie Poussereau
article
Molecular Plant Pathology, 2012, 13 (6), pp.568-578. ⟨10.1111/j.1364-3703.2011.00772.x⟩
DOI
DOI : 10.1111/j.1364-3703.2011.00772.x
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2011

titre
LongSAGE gene-expression profiling of Botrytis cinerea germination suppressed by resveratrol, the major grapevine phytoalexin
auteur
C. Zheng, M. Choquer, B. Zhang, H. Ge, S. Hu, H. Ma, Si Chen
article
Fungal Biol, 2011, 115 (9), pp.815-32
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titre
Genomic Analysis of the Necrotrophic Fungal Pathogens Sclerotinia sclerotiorum and Botrytis cinerea
auteur
Joelle J. Amselem, Christina A. Cuomo, Jan A. L. van Kan, Muriel M. Viaud, Ernesto P. Benito, Arnaud Couloux, Pedro M Coutinho, Ronald P. de Vries, Paul S. Dyer, Sabine, Helma Fillinger-David, Elisabeth Fournier, Lilian Gout, Matthias Hahn, Linda Kohn, Nicolas Lapalu, Kim M. Plummer, Jean-Marc Pradier, Emmanuel Quevillon, Amir Sharon, Adeline Simon, Arjen ten Have, Bettina Tudzynski, Paul Tudzynski, Patrick Wincker, Marion Andrew, Véronique Anthouard, Ross E. Beever, Rolland Beffa, Isabelle Benoit, Ourdia Bouzid, Baptiste Brault, Zehua Chen, Mathias Choquer, Jerome Collemare, Pascale Cotton, Etienne Danchin, Corinne da Silva, Angelique Gautier, Corinne Giraud-Delville, Tatiana Giraud, Celedonio Gonzalez, Sandrine Grossetete, Ulrich Gueldener, Bernard Henrissat, Barbara J. Howlett, Chinnappa Kodira, Matthias Kretschmer, Anne Lappartient, Michaela Leroch, Caroline Levis, Evan Mauceli, Cécile Neuvéglise, Birgitt Oeser, Matthew Pearson, Julie Poulain, Nathalie Poussereau, Hadi Quesneville, Christine Rascle, Julia Schumacher, Béatrice Segurens, Adrienne Sexton, Evelyn Silva, Catherine Sirven, Darren M. Soanes, Nicholas J. Talbot, Matt Templeton, Chandri Yandava, Oded Yarden, Qiandong Zeng, Jeffrey A. Rollins, Marc-Henri Lebrun, Marty Dickman
article
PLoS Genetics, 2011, 7 (8), ⟨10.1371/journal.pgen.1002230⟩
DOI
DOI : 10.1371/journal.pgen.1002230
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01190236/file/journal.pgen.1002230.PDF BibTex
titre
Reboot the system thanks to protein post-translational modifications and proteome diversity: How quiescent seeds restart their metabolism to prepare seedling establishment
auteur
Erwann E. Arc, Marc M. Galland, Gwendal Cueff Cueff, Béatrice B. Godin-Pérénnez, Imen Lounifi Lounifi, Dominique D. Job, Loïc Rajjou
article
Proteomics, 2011, 11 (9), pp.1606-1618. ⟨10.1002/pmic.201000641⟩
DOI
DOI : 10.1002/pmic.201000641
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2010

titre
Novel insights into mannitol metabolism in the fungal plant pathogen Botrytis cinerea
auteur
Thierry Dulermo, Christine Rascle, Geneviève Billon-Grand, Elisabeth Gout, Richard Bligny, Pascale Cotton
article
Biochemical Journal, Portland Press, 2010, 427 (2), pp.323-332. ⟨10.1042/BJ20091813⟩
DOI
DOI : 10.1042/BJ20091813
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00479283/file/PEER_stage2_10.1042%252FBJ20091813.pdf BibTex

2008

titre
Improved gene targeting in Magnaporthe grisea by inactivation of MgKU80 required for non-homologous end joining
auteur
François Villalba, Jérôme Collemare, Patricia Landraud, Karine Lambou, Viviane Brozek, Bénédicte Cirer, Damien Morin, Christophe Bruel, Roland R. Beffa, Marc-Henri Lebrun
article
Fungal Genetics and Biology, 2008, 45 (1), pp.68-75. ⟨10.1016/j.fgb.2007.06.006⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.fgb.2007.06.006
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