Publications HAL du labo/EPI bioger

2024

Journal articles

titre
Pyricularia oryzae : Lab star and field scourge
auteur
Maël Baudin, Marie Le Naour--Vernet, Pierre Gladieux, Didier Tharreau, Marc‐henri Lebrun, Karine Lambou, Marie Leys, Elisabeth Fournier, Stella Césari, Stella Cesari, Thomas Kroj
article
Molecular Plant Pathology, 2024, 25 (4), pp.e13449. ⟨10.1111/mpp.13449⟩
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titre
Hunting for sources of durable resistance in crop cultivar evaluation data: The case of wheat yellow rust in France
auteur
Tiphaine Vidal, Rémi Perronne, Anne‐lise Boixel, Philippe Du Cheyron, Florence Dubs, Jérôme Enjalbert
article
Plant Pathology, 2024, ⟨10.1111/ppa.13905⟩
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titre
Preventing multi‐resistance: New insights for managing fungal adaptation
auteur
Agathe Ballu, Claire Ugazio, Clémentine Duplaix, Alicia Noly, Juerg Wullschleger, Stefano Torriani, Anne Dérédec, Florence Carpentier, Anne‐sophie Walker
article
Environmental Microbiology, 2024, 26 (4), pp.e16614. ⟨10.1111/1462-2920.16614⟩
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titre
Estimating the frequency of virulence against an Stb gene in Zymoseptoria tritici populations by bulk phenotyping on checkerboard microcanopies of wheat near‐isogenic lines
auteur
Frédéric Suffert, Stéphanie Le Prieur, Sandrine Gélisse, Emmie Dzialo, Cyrille Saintenac, Thierry Marcel
article
Plant Pathology, 2024, ⟨10.1111/ppa.13894⟩
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titre
Quantitative pathogenicity and host adaptation in a fungal plant pathogen revealed by whole-genome sequencing
auteur
Reda Amezrou, Aurélie Ducasse, Jérôme Compain, Nicolas Lapalu, Anais Pitarch, Laetitia Dupont, Johann Confais, Henriette Goyeau, Gert H. J. Kema, Daniel Croll, Joëlle Amselem, Andrea Sanchez-Vallet, Thierry C Marcel
article
Nature Communications, 2024, 15 (1), pp.1933. ⟨10.1038/s41467-024-46191-1⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04498577/file/s41467-024-46191-1.pdf BibTex
titre
Regulation of effector gene expression as concerted waves in Leptosphaeria maculans : a two‐player game
auteur
Colin Clairet, Elise Gay, Antoine Porquier, Françoise Blaise, Claire‐line Marais, Marie‐hélène Balesdent, Thierry Rouxel, Jessica Soyer, Isabelle Fudal
article
New Phytologist, 2024, ⟨10.1111/nph.19581⟩
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titre
The collembolan Heteromurus nitidus grazes the wheat fungal pathogen Zymoseptoria tritici on infected tissues: opportunities and limitations for bioregulation
auteur
Thomas Bourgeois, Soizic Prado, Frédéric Suffert, Sandrine Salmon
article
Pest Management Science, 2024, ⟨10.1002/ps.8026⟩
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titre
SeptoSympto: a precise image analysis of Septoria tritici blotch disease symptoms using deep learning methods on scanned images
auteur
Laura Mathieu, Maxime Reder, Ali Siah, Aurélie Ducasse, Camilla Langlands-Perry, Thierry Marcel, Jean-Benoît Morel, Cyrille Saintenac, Elsa Ballini
article
Plant Methods, 2024, 20 (1), pp.18. ⟨10.1186/s13007-024-01136-z⟩
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titre
Monitoring the phenology of plant pathogenic fungi: why and how?
auteur
Chloé Delmas, Marie-Odile Bancal, Christel Leyronas, Marie‐hélène Robin, Tiphaine Vidal, Marie Launay
article
Biological Reviews, 2024, 99, pp.1075-1084. ⟨10.1111/brv.13058⟩
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titre
The bZIP transcription factor BIP1 of the rice blast fungus is essential for infection and regulates a specific set of appressorium genes
auteur
Karine Lambou, Andrew Tag, Alexandre Lassagne, Jérôme Collemare, Pierre-Henri Clergeot, Crystel Barbisan, Philippe Perret, Didier Tharreau, Joelle Millazo, Elia Chartier, Ronald de Vries, Judith Hirsch, Jean-Benoit Morel, Roland Beffa, Thomas Kroj, Terry Thomas, Marc-Henri Lebrun
article
PLoS Pathogens, 2024, 20 (1), pp.e1011945. ⟨10.1371/journal.ppat.1011945⟩
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Conference papers

titre
Fungicides alternation and mixture lead to in vitro selection of generalist resistance mechanisms (MDR) in Zymoseptoria tritici
auteur
Elza Neau, Anaïs Lalève, Sabine Fillinger
article
32nd Fungal genetics conference, GSA, Mar 2024, Asilomar - California, France
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titre
Biosécurité des cultures et agroterrorisme : caractériser la menace pour mieux gérer le risque
auteur
Frédéric Suffert
article
Colloque AgroBioTech « Risques biotechnologiques et biovigilance », Association AgroBioTech, Feb 2024, Palaiseau (91), France. ⟨10.13140/RG.2.2.20677.42729⟩
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Book sections

titre
Grapevine defence mechanisms when challenged by pathogenic fungi and oomycetes
auteur
Marielle Adrian, Marie-France Corio-Costet, Agnès Calonnec, Stéphanie Cluzet, Benoît Poinssot, Sophie Trouvelot, Sabine Wiedemann-Merdinoglu, Muriel Viaud
article
Grapevine: From Origin to the Vineyard, Elsevier, 2024, Advances in Botanical Research, ⟨10.1016/bs.abr.2024.02.013⟩
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Poster communications

titre
Identification of major genes involved in rapeseed quantitative resistance to Leptosphaeria maculans by an innovative effectoromics approach.
auteur
Camille Rabeau, Sébastien Faure, Audren Jiquel, Isabelle Fudal
article
Journées Jean Chevaugeon, Jan 2024, Aussois, France
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titre
Systematic inactivation of fungal biosynthetic gene clusters expressed during the Colletotrichum higginsianum- Arabidopsis thaliana interaction
auteur
Axelle Deroubaix, Justine Vergne, Célia Perdrizet, Clara Centa, Richard J O'Connell, Muriel Viaud, Jean-Félix Dallery
article
14e Rencontres de Phytopathologie - Mycologie, Jan 2024, Aussois (France), France
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Preprints, Working Papers, ...

titre
Plasticity of the MFS1 promotor is not the only driver of Multidrug resistance in Zymoseptoria tritici
auteur
Simon Patry-Leclaire, Elza Neau, Anaïs Pitarch, Anne-Sophie Walker, Sabine Fillinger
article
2024
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titre
Evaluation of two indicators according to the objectives of the Sustainable Use of pesticides Directive (SUD). A French case study
auteur
Garnault Maxime, Barbu Corentin, Alexix Aulagnier, Bockstaller Christian, Kudsk Per, Labeyrie Baptiste, Fabrice Le Bellec, Richard Freddie-Jeanne, Gallien Marc, Grimonprez Benoît, Klinghammer Alfred, Landrieu Tanguy, Emilie Maugin, Ozier-Lafontaine Harry, Anne-Sophie Walker, Humbert Laura, Omnès François, Aubertot Jean-Noël
article
2024
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https://hal.science/hal-04564733/file/Reflection%20on%20indicators%20for%20NAPs_v2.docx.pdf BibTex
titre
Infection of Alfalfa Cotyledons by an Incompatible but Not a Compatible Species of Colletotrichum Induces Formation of Paramural Bodies and Secretion of EVs
auteur
Suchismita Ghosh, Kamesh Regmi, Barry Stein, Jun Chen, Richard O’connell, Roger Innes
article
2024
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titre
Preventing multiple resistance above all: new insights for managing fungal adaptation
auteur
Agathe Ballu, Claire Ugazio, Clémentine Duplaix, Alicia Noly, Juerg Wullschleger, Stefano F.F. Torriani, Anne Dérédec, Florence Carpentier, Anne-Sophie Walker
article
2024
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titre
Improved gene annotation of the fungal wheat pathogen Zymoseptoria tritici based on combined Iso-Seq and RNA-Seq evidence
auteur
Nicolas Lapalu, Lucie Lamothe, Yohann Petit, Anne Genissel, Camille Delude, Alice Feurtey, Leen Abraham, Dan Smith, Robert King, Alison Renwick, Mélanie Appertet, Justine Sucher, Andrei Steindorff, Stephen Goodwin, Gert H.J. Kema, Igor Grigoriev, James Hane, Jason Rudd, Eva Stukenbrock, Daniel Croll, Gabriel Scalliet, Marc-Henri Lebrun
article
2024
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titre
Meiotic recombination in Leptosphaeria maculans favours the rise of transgressive isolates adapted to a nonhost species, Brassica carinata
auteur
Julie Noah, Mathilde Gorse, Carole-Anne Romain, Elise Gay, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent, Jessica Soyer
article
2024
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titre
Generation of diversity in the blue cheese mold Penicillium roqueforti and identification of pleiotropic QTL for key cheese-making phenotypes
auteur
Thibault Caron, Ewen Crequer, Mélanie Le Piver, Stéphanie Le Prieur, Sammy Brunel, Alodie Snirc, Gwennina Cueff, Daniel Roueyre, Michel Place, Christophe Chassard, Adeline Simon, Ricardo Rodriguez de la Vega, Monika Coton, Emmanuel Coton, Marie Foulongne-Oriol, Antoine Branca, Tatiana Giraud
article
2024
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titre
Bioengineering a plant NLR immune receptor with a robust binding interface towards a conserved fungal pathogen effector
auteur
Rafał Zdrzałek, Yuxuan Xi, Thorsten Langner, Adam Bentham, Yohann Petit-Houdenot, Juan Carlos de la Concepcion, Adeline Harant, Motoki Shimizu, Vincent Were, Nicholas Talbot, Ryohei Terauchi, Sophien Kamoun, Mark Banfield
article
2024
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titre
Plasticity of the MFS1 promotor is not the only driver of Multidrug resistance in Zymoseptoria tritici
auteur
Simon Patry-Leclaire, Elza Neau, Anaïs Pitarch, Anne-Sophie Walker, Sabine Fillinger
article
2024
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titre
Estimating the frequency of virulence against an Stb gene in Zymoseptoria tritici populations by bulk phenotyping on checkerboard microcanopies of wheat NILs
auteur
Frédéric Suffert, Stéphanie Le Prieur, Sandrine Gélisse, Emmie Dzialo, Cyrille Saintenac, Thierry Marcel
article
2024
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2023

Journal articles

titre
Three-dimensional ultrastructure of Arabidopsis cotyledons infected with Colletotrichum higginsianum
auteur
Kamesh Regmi, Suchismita Ghosh, Benjamin Levi Koch, Ulla Neumann, Barry Stein, Richard O'Connell, Roger Innes
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, 2023, 37 (04), pp.396-406. ⟨10.1094/MPMI-05-23-0068-R⟩
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titre
Antifungal alternation can be beneficial for durability but at the cost of generalist resistance
auteur
Agathe Ballu, Philomène Despréaux, Clémentine Duplaix, Anne Dérédec, Florence Carpentier, Anne-Sophie Walker
article
Communications Biology, 2023, 6 (1), pp.180. ⟨10.1038/S42003-023-04550-6⟩
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titre
A thousand-genome panel retraces the global spread and adaptation of a major fungal crop pathogen
auteur
Alice Feurtey, Cécile Lorrain, Megan Mcdonald, Andrew Milgate, Peter Solomon, Rachael Warren, Guido Puccetti, Gabriel Scalliet, Stefano Torriani, Lilian Gout, Thierry Marcel, Frédéric Suffert, Julien Alassimone, Anna Lipzen, Yuko Yoshinaga, Christopher Daum, Kerrie Barry, Stephen Goodwin, Anne Genissel, Michael Seidl, Eva Stukenbrock, Marc-Henri Lebrun, Gert Kema, Bruce Mcdonald, Daniel Croll
article
Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.1059. ⟨10.1038/s41467-023-36674-y⟩
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titre
Unfolding the link between multiple ecosystem services and bundles of functional traits to design multifunctional crop variety mixtures
auteur
Florence Dubs, Jerome Enjalbert, Sebastien Barot, Emmanuelle Porcher, Vincent Allard, Claude Pope, Arnaud Gauffreteau, Audrey Niboyet, Thomas Pommier, Sébastien Saint-Jean, Tiphaine Vidal, Xavier Le Roux
article
Agronomy for Sustainable Development, 2023, 43 (6), pp.71. ⟨10.1007/s13593-023-00924-6⟩
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https://agroparistech.hal.science/hal-04276559/file/Dubs_ASD_2023.pdf BibTex
titre
Location and timing govern tripartite interactions of fungal phytopathogens and host in the stem canker species complex
auteur
Elise Gay, Noémie Jacques, Nicolas Lapalu, Corinne Cruaud, Valerie Laval, Marie-Hélène Balesdent, Thierry Rouxel
article
BMC Biology, 2023, 21 (1), pp.247. ⟨10.1186/s12915-023-01726-8⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04281614/file/s12915-023-01726-8.pdf BibTex
titre
A landscape-scale field survey demonstrates the role of wheat volunteers as a local and diversified source of leaf rust inoculum
auteur
A.-L. Boixel, H. Goyeau, J. Berder, J. Moinard, F. Suffert, S. Soubeyrand, I. Sache, T. Vidal
article
Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.20411. ⟨10.1038/s41598-023-47499-6⟩
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titre
Yeast-based heterologous production of the Colletochlorin family of fungal secondary metabolites
auteur
Aude Geistodt-Kiener, Jean Chrisologue Totozafy, Géraldine Le Goff, Justine Vergne, Kaori Sakai, Jamal Ouazzani, Grégory Mouille, Muriel Viaud, Richard O'Connell, Jean-Félix Dallery
article
Metabolic Engineering, 2023, 80, pp.216 - 231. ⟨10.1016/j.ymben.2023.10.002⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04263969/file/1-s2.0-S1096717623001428-main.pdf BibTex
titre
Whole-genome sequences of Bipolaris bicolor , Curvularia hawaiiensis , Curvularia spicifera , and Exserohilum rostratum isolated from rice in Burkina Faso, France, Mali, and Pakistan
auteur
Kouka Hilaire Kaboré, Abalo Itolou Kassankogno, Henri Adreit, Sébastien Ravel, Florian Charriat, Diariatou Diagne, Marc-Henri Lebrun, Didier Tharreau
article
Microbiology Resource Announcements, 2023, 12 (11), pp.e0013423. ⟨10.1128/MRA.00134-23⟩
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titre
Natural Products Targeting the Fungal Unfolded Protein Response as an Alternative Crop Protection Strategy
auteur
Thomas Charpentier, Guillaume Viault, Anne-Marie Le Ray, Nelly Bataillé-Simoneau, Jean-Jacques Helesbeux, Nadège Blon, Franck Bastide, Muriel Marchi, Sophie Aligon, Antoine Bruguière, Chau Phi Dinh, Zahia Benbelkacem, Jean-Felix Dallery, Philippe Simoneau, Pascal Richomme, Thomas Guillemette
article
Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2023, 71 (37), pp.13706-13716. ⟨10.1021/acs.jafc.3c03602⟩
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https://univ-angers.hal.science/hal-04208459/file/Draft-AFC.pdf BibTex
titre
Metagenomic Next-Generation Sequencing (mNGS) Data Reveal the Phyllosphere Microbiome of Wheat Plants Infected by the Fungal Pathogen Zymoseptoria tritici
auteur
Didac Barroso-Bergadà, Marie Massot, Noémie Vignolles, Julie Faivre d'Arcier, Emilie Chancerel, Erwan Guichoux, Anne-Sophie Walker, Corinne Vacher, David Bohan, Valérie Laval, Frédéric Suffert
article
Phytobiomes Journal, 2023, 7 (2), pp.281-287. ⟨10.1094/PBIOMES-02-22-0008-FI⟩
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titre
Is thermal aptitude a pivotal driver in the establishment of recent Puccinia striiformis f. sp. tritici lineages in Europe?
auteur
Kevin JG Meyer, Marc Leconte, Tiphaine Vidal, Henriette Goyeau, Frédéric Suffert
article
Journal of Plant Pathology, 2023, Scientific Reports, 13 (1), pp.20411. ⟨10.1101/2023.08.11.552914⟩
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titre
Dietary preferences of Heteromurus nitidus (Collembola) among wheat fungal communities: Implications for bioregulation of two widespread pathogens
auteur
Thomas Bourgeois, Frédéric Suffert, Gérard Dury, Gwenola Biau, Sandrine Lacoste, Jöelle Dupont, Soizic Prado, Sandrine Salmon
article
Applied Soil Ecology, 2023, 188, pp.104897. ⟨10.1016/j.apsoil.2023.104897⟩
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titre
Efficient multiple gene knockout in Colletotrichum higginsianum via CRISPR/C as9 ribonucleoprotein and URA3 ‐based marker recycling
auteur
Katsuma Yonehara, Naoyoshi Kumakura, Takayuki Motoyama, Nobuaki Ishihama, Jean‐félix Dallery, Richard O'Connell, Ken Shirasu
article
Molecular Plant Pathology, 2023, ⟨10.1111/mpp.13378⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04174238/file/Molecular%20Plant%20Pathology%20-%202023%20-%20Yonehara%20-%20Efficient%20multiple%20gene%20knockout%20in%20Colletotrichum%20higginsianum%20via%20CRISPR.pdf BibTex
titre
Complete Genome Sequences of Septoria linicola : A Resource for Studying a Damaging Flax Pathogen
auteur
Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Boris Demenou, Delphine Paumier, Marie-Pierre Guillot, Lilian Gout, Frederic Suffert, Romain Valade
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, 2023, 36 (1), pp.59-63. ⟨10.1094/MPMI-09-22-0185-A⟩
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BibTex
titre
Polymorphism of Avirulence Genes and AdaptationtoBrassicaResistance Genes Is Gene-Dependentin the Phytopathogenic FungusLeptosphaeria maculans
auteur
Angélique Gautier, Valérie Laval, Sébastien Faure, Thierry Rouxel, Marie-Hélène Balesdent
article
Phytopathology, 2023, 113 (07), pp.1222-1232. ⟨10.1094/PHYTO-12-22-0466⟩
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BibTex
titre
A secreted protease-like protein in Zymoseptoria tritici is responsible for avirulence on Stb9 resistance gene in wheat
auteur
Reda Amezrou, Colette Audéon, Jérôme Compain, Sandrine Gélisse, Aurélie Ducasse, Cyrille Saintenac, Nicolas Lapalu, Clémentine Louet, Simon Orford, Daniel Croll, Joëlle Amselem, Sabine Fillinger, Thierry Marcel
article
PLoS Pathogens, 2023, 19 (5), pp.e1011376. ⟨10.1371/journal.ppat.1011376⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04102220/file/journal.ppat.1011376.pdf BibTex
titre
Quantitative and qualitative plant-pathogen interactions call upon similar pathogenicity genes with a spectrum of effects
auteur
Camilla Langlands-Perry, Anaïs Pitarch, Nicolas Lapalu, Murielle Cuenin, Christophe Bergez, Alicia Noly, Reda Amezrou, Sandrine Gélisse, Célia Barrachina, Hugues Parrinello, Frédéric Suffert, Romain Valade, Thierry Marcel
article
Frontiers in Plant Science, 2023, 14, pp.1128546. ⟨10.3389/fpls.2023.1128546⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04125786/file/fpls-14-1128546.pdf BibTex
titre
A point mutation and large deletion at the candidate avirulence locus AvrMlp7 in the poplar rust fungus correlate with poplar RMlp7 resistance breakdown
auteur
Clémentine Louet, Méline Saubin, Axelle Andrieux, Antoine Persoons, Mathilde Gorse, Jérémy Pétrowski, Bénédicte Fabre, Stéphane de Mita, Sébastien Duplessis, Pascal Frey, Fabien Halkett
article
Molecular Ecology, 2023, 32 (10), pp.2472-2483. ⟨10.1111/mec.16294⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03510966/file/Louet%20et%20al%202023ms%20Mol%20Ecol.pdf BibTex
titre
Improving sustainable crop protection using population genetics concepts
auteur
Méline Saubin, Clémentine Louet, Lydia Bousset, Frédéric Fabre, Pascal Frey, Isabelle Fudal, Frédéric Grognard, Frédéric M. Hamelin, Ludovic Mailleret, Solenn Stoeckel, Suzanne Touzeau, Benjamin Petre, Fabien Halkett
article
Molecular Ecology, 2023, 32 (10), pp.2461-2471. ⟨10.1111/mec.16634⟩
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https://hal.science/hal-03394837/file/Note_opinion.pdf BibTex
titre
Evolution within a given virulence phenotype (pathotype) is driven by changes in aggressiveness: a case study of French wheat leaf rust populations
auteur
Cécilia Fontyn, Kevin Jg Meyer, Anne-Lise Boixel, Ghislain Delestre, Emma Piaget, Corentin Picard, Frédéric Suffert, Thierry Marcel, Henriette Goyeau
article
Peer Community Journal, 2023, 3, pp.e39. ⟨10.24072/pcjournal.264⟩
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BibTex
titre
Spatially explicit ecological modeling improves empirical characterization of plant pathogen dispersal
auteur
Petteri Karisto, Frédéric Suffert, Alexey Mikaberidze
article
Plant-Environment Interactions, 2023, 4 (2), pp.86-96. ⟨10.1002/pei3.10104⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04133666/file/Plant%20Enviro%20Interactions%20-%202023%20-%20Karisto%20-%20Spatially%20explicit%20ecological%20modeling%20improves%20empirical%20characterization%20of.pdf BibTex
titre
The Combination of Both Heat and Water Stresses May Worsen Botryosphaeria Dieback Symptoms in Grapevine
auteur
Olivier Fernandez, Christelle Lemaitre-Guillier, Aurélie Songy, Guillaume Robert-Siegwald, Marc-Henri Lebrun, Philippe Schmitt-Kopplin, Philippe Larignon, Marielle Adrian, Florence Fontaine
article
Plants, 2023, 12 (4), pp.art. 753. ⟨10.3390/plants12040753⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04041409/file/2023-65.pdf BibTex
titre
Large‐scale population survey of Leptosphaeria maculans in France highlights both on‐going breakdowns and potentially effective resistance genes in oilseed rape
auteur
Marie‐hélène Balesdent, Valérie Laval, Julie Marie Noah, Patrick Bagot, Arnaud Mousseau, Thierry Rouxel
article
Pest Management Science, 2023, ⟨10.1002/ps.7401⟩
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BibTex
titre
A highly multiplexed assay to monitor pathogenicity, fungicide resistance and gene flow in the fungal wheat pathogen Zymoseptoria tritici
auteur
Hadjer Bellah, Gwilherm Gazeau, Sandrine Gélisse, Reda Amezrou, Thierry Marcel, Daniel Croll
article
PLoS ONE, 2023, 18 (2), pp.e0281181. ⟨10.1371/journal.pone.0281181⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04008480/file/journal.pone.0281181.pdf BibTex
titre
CusProSe: a customizable protein annotation software with an application to the prediction of fungal secondary metabolism genes
auteur
Leonor Oliveira, Nicolas Chevrollier, Jean-Félix Dallery, Richard O'Connell, Marc-Henri Lebrun, Muriel Viaud, Olivier Lespinet
article
Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.1-13. ⟨10.1038/s41598-023-27813-y⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03975487/file/Leonor_Oliveira_article.pdf BibTex
titre
A new set of international Leptosphaeria maculans isolates as a resource for elucidation of the basis and evolution of blackleg disease on Brassica napus
auteur
Angela van de Wouw, Jack Scanlan, Hawlader Al-Mamun, Marie‐hélène Balesdent, Lydia Bousset, Lenka Burketová, Luis del Rio Mendoza, W. Fernando, Coreen Franke, Barbara Howlett, Yong‐ju Huang, E. Eirian Jones, Birger Koopmann, Suhaizan Lob, Ali Mirabadi, Bridgit Nugent, Gary Peng, Franco Rossi, Huibrecht Schreuder, Annie Tabone, Gert van Coller, Jacqueline Batley, Alexander Idnurm
article
Plant Pathology, In press, ⟨10.1111/ppa.13801⟩
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titre
Facilitation of symplastic effector protein mobility by paired effectors is conserved in different classes of fungal pathogens
auteur
Nacera Talbi, Mila Blekemolen, Slavica Janevska, Daniel Zendler, Herman van Tilbeurgh, Isabelle Fudal, Frank Takken
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, 2023, 37 (3), 304-314 p. ⟨10.1094/MPMI-07-23-0103-FI⟩
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BibTex
titre
Unravelling the web of dark interactions: Explainable inference of the diversity of microbial interactions
auteur
Didac Barroso-Bergada, Alireza Tamaddoni-Nezhad, Dany Varghese, Corinne Vacher, Nika Galic, Valérie Laval, Frédéric Suffert, David Bohan
article
Advances in Ecological Research, 2023, Advances in Ecological Research, 68, pp.155-183. ⟨10.1016/bs.aecr.2023.09.005⟩
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BibTex
titre
The neighbouring genes AvrLm10A and AvrLm10B are part of a large multigene family of cooperating effector genes conserved in Dothideomycetes and Sordariomycetes
auteur
Nacera Talbi, Like Fokkens, Corinne Audran, Yohann Petit-Houdenot, Cécile Pouzet, Françoise Blaise, Elise Gay, Thierry Rouxel, Marie‐hélène Balesdent, Martijn Rep, Isabelle Fudal
article
Molecular Plant Pathology, In press, ⟨10.1111/MPP.13338⟩
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BibTex
titre
Nucleosome patterns in four plant pathogenic fungi with contrasted genome structures
auteur
Colin Clairet, Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Jessica Soyer, Muriel Viaud, Enric Zehraoui, Berengère Dalmais, Isabelle Fudal, Nadia Ponts
article
Peer Community Journal, 2023, 3, pp.e13. ⟨10.24072/pcjournal.227⟩
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titre
Optimiser la durabilité des résistances en riziculture
auteur
Elisabeth Fournier, Mourad Hannachi, Jingjing Liao, Sajid S. Ali, Sébastien Ravel
article
Phytoma , 2023, 764, pp.35-38
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titre
Polymorphism of avirulence genes and adaptation to Brassica resistance genes is gene-dependent in the phytopathogenic fungus Leptosphaeria maculans
auteur
Angélique Gautier, Valérie Laval, Sébastien Faure, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent
article
Phytopathology, In press, ⟨10.1094/PHYTO-12-22-0466-R⟩
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Scientific blog post

titre
Effecteurs : subterfuge et manipulation
auteur
Jean-Félix Dallery
article
2023
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https://hal.inrae.fr/hal-04425345/file/Effecteurs%20subterfuge%20et%20manipulation%20INRAE.pdf BibTex

Conference papers

titre
Comment utiliser nos connaissances sur les effecteurs d'avirulence des champignons phytopathogènes pour améliorer la gestion des résistances des plantes
auteur
Isabelle Fudal
article
Plant Alliance-animation maladies, Plant Alliance, Nov 2023, Paris, France
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https://hal.inrae.fr/hal-04565525/file/Resume%20Plant%20Alliance%20Fudal.pdf BibTex
titre
Decoding plant pathogen strategies: exploring effector structural insights for enhanced plant resistance
auteur
Clémentine Louet, Inès Li de la Sierra-Gallay, Herman van Tilbeurgh, Isabelle Fudal
article
Fungal Genetics Ile de France Symposium, Nov 2023, Paris, France
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https://hal.inrae.fr/hal-04565530/file/2023_LOUET_Abstract-FunGenet.pdf BibTex
titre
Understanding the genetic basis of adaptative response in a fungal pathogen
auteur
Anne Genissel
article
Empiricism & Theory in Ecology and Evolution, GDR Empiricism & Theory in Ecology and Evolution, Nov 2023, Gif-sur Yvette, France
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titre
Phytopathogenic Fungi as a Source of Natural Compounds Acting on Plants & Microbes.
auteur
Muriel Viaud
article
Saclay Plant' Innov' 2023 : Métabolites spécialisés : perspectives d’innovations pour une production agricole durable et la valorisation des plantes, SPS & METABIODIVEX, Nov 2023, Versailles, France
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titre
Regulation of effector gene expression as concerted waves in Leptosphaeria maculans: a two-players game involving a chromatin remodeler and a specific transcription factor
auteur
Colin Clairet, Elise J Gay, Antoine Porquier, Françoise Blaise, Claire‐line Marais, Thierry Rouxel, Marie‐hélène Balesdent, Jessica L. Soyer, Isabelle Fudal
article
International Congress of Plant Pathology, Aug 2023, Lyon, France
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https://hal.inrae.fr/hal-04565512/file/2023%20ICPP%20abstract%20Fudal%20Isabelle_epigenetics_final.pdf BibTex
titre
Variable effects of a wheat cultivar mixture on Septoria tritici blotch: investigating key factors involved in mixture effect variation between European sites
auteur
Tiphaine Vidal, Maxime Duvivier, Sylvain Gaubrie, Thies Heick, Pierre Hellin, Steven Kildea, Frédéric Suffert
article
12th International Congress of Plant Pathology, Aug 2023, Lyon, France
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titre
Structural and functional characterization of effector proteins to propose knowledge-driven plant resistance management
auteur
Clémentine Louet, Nacera Talbi, Inès Li de la Sierra-Gallay, Thierry Rouxel, Marie‐hélène Balesdent, Herman van Tilbeurgh, Isabelle Fudal
article
International Congress of Plant Pathology, Aug 2023, Lyon, France
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https://hal.inrae.fr/hal-04565517/file/2023_LOUET_Abstract-ICPP.pdf BibTex
titre
Towards a better characterization of heat stress recurrence: a case study in oilseed rape
auteur
Sophie Brunel-Muguet, Lethicia Magno Massuia de Almeida, Jérémy Delamare, Lorane Le Franc, Benoît Bernay, Julien Pontin, Jessica L. Soyer
article
International Society for Seed Science, Jul 2023, Paris, France
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https://hal.science/hal-04232194/file/Poster_ISSS%20july%202023_Brunel-Muguet.pdf BibTex
titre
The "Hiden" effectors of a polyphagous plant pathogenic fungus : Specialized metabolites and small RNAs
auteur
Muriel Viaud
article
Institut Jean-Pierrre Bourgin, INRAE, May 2023, Versailles, France
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titre
Large scale screen of potential MDR isolates in contemporary Zymoseptoria tritici populations reveals genotypic and phenotypic diversity suggesting multiple molecular mechanisms involved in MDR field strains
auteur
Simon Patry-Leclaire, Elsa Neau, Anne-Sophie Walker, Sabine Fillinger
article
20th Reinhardsbrunn symposium on modern fungicides and anti-fungal compounds, DpG, Apr 2023, Friedrichroda, Germany
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titre
Assessment of resistance risk to the Qol fungicide metyltetraprole
auteur
L. Mosser, C. Serot, B. Meunier, Anne-Sophie Walker
article
20th International Reinhardsbrunn symposium on modern fungicides and antifungal compounds, Apr 2023, Frierichroda, Germany
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titre
Antagonistic pleiotropic effects reduce adaptation in a major wheat pathogen
auteur
R. Amezrou, Gwilherm Gazeau, Nicolas Lapalu, L. Meyer, Frédéric Suffert, Sabine Fillinger, Anne-Sophie Walker, Thierry C. Marcel
article
20th International Reinhardsbrunn symposium on modern fungicides and antifungal compounds, Apr 2023, Frierichroda, Germany
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titre
Limiting resistance by alternating of mixing fungicides? Resistance status trumps both management strategies.
auteur
Agathe Ballu, Claire Ugazio, Clémentine Duplaix, Alicia Noly, J. Wüllschleger, S. Torriani, A Deredec, Florence F. Carpentier, Anne-Sophie Walker
article
20th Internatianal Reinhardsbrurnn symposium on modern fungicides and antifungal compounds, Apr 2023, Frierichroda, Germany
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titre
Antagonistic pleiotropic effects reduce adaptation in a Major wheat pathogen
auteur
Reda Amezrou, Gwilherm Gazeau, Nicolas Lapalu, L. Meyer, Frédéric Suffert, Sabine Fillinger, Anne-Sophie Walker, Thierry C. Marcel
article
20th Reinhardsbrunn symposium on modern fungicides and andi-fungal compounds, DpG, Apr 2023, Friedrichroda, Germany
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titre
Towards a better characterization of heat stress recurrence: a case study in oilseed rape
auteur
Sophie Brunel-Muguet, Lethicia Magno, Jérémy Delamare, Lorane Lefranc, Benoît Bernay, Julien Pontin, Jessica L. Soyer
article
EPICATCH Workshop "Epigenetics of temperature and light responses in plants", Mar 2023, Tel Aviv, Israel
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titre
Does a Brassica napus resistance gene to Leptosphaeria maculans influence the mycobiota structure? A 2-year case study
auteur
Mathilde Gorse, Valérie Laval, Angélique Gautier, Noémie Jacques, Lydie Kerdraon, Marie-Hélène Balesdent
article
16TH EUROPEAN CONFERENCE ON FUNGAL GENETIC, Susanne Zeilinger-Migsich; Hubertus Haas, Mar 2023, Innsbruck, Austria. pp.687-688
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titre
Screen of potential multi-drug resistant Zymoseptoria tritici field isolates reveals genotypic and phenotypic diversity suggesting multiple mechanisms involved in MDR
auteur
Elza Neau, Simon Patry-Leclaire, Clémentine Duplaix, Anne-Sophie Walker, Sabine Fillinger
article
16 TH EUROPEAN CONFERENCE ON FUNGAL GENETICS, Susanne Zeilinger-Migsich; Hubertus Haas, Mar 2023, Innsbruck,, Austria
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titre
Regulation of effector-gene expression as concerted waves in Leptosphaeria maculans: a twoplayers game
auteur
Colin Clairet, Elise J Gay, Antoine Porquier, Thierry Rouxel, Marie-Hélène Balesdent, Isabelle Fudal, Jessica L. Soyer
article
16th European Conference on Fungal Genetics, Mar 2023, Innsbruck, Austria
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https://hal.science/hal-04231683/file/Soyer_Poster_ECFG_2023.pdf BibTex
titre
Adaptation of Leptosphaeria maculans to a nonhost species which genes are involved?
auteur
Julie Noah, Mathilde Gorse, Lapalu Nicolas, Thierry Rouxel, Marie-Hélène Balesdent, Jessica Soyer
article
16th European Conference on Fungal Genetics, Susanne Zeilinger-Migsich; Hubertus Haas, Mar 2023, Innsbruck,, Austria. pp.376
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titre
Large scale screen of contemporary Zymoseptoria tritici populations suggests multiple molecular mechanisms involved in MDR field strains
auteur
Elsa Neau, Simon Patry-Leclaire, Clémentine Duplaix, Anaïs Lalève, Anne-Sophie Walker, Sabine Fillinger
article
European conference in fungal genetics, ECFG, Mar 2023, Innsbruck, Austria
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titre
Of the fungal wheat pathogen Zymoseptoria tritici using ISO-SEQ and RNA-SEQ DATA
auteur
Marc-Henri Lebrun, Nicolas Lapalu, Lucie Lamothe, Yohann Petit, Scalliet Gabriel
article
16TH EUROPEAN CONFERENCE ON FUNGAL GENETICS, Susanne Zeilinger-Migsich; Hubertus Haas, Mar 2023, Innsbruck, Austria. pp.625
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titre
Insertional mutagenesis using the TC1-Mariner transposon impala in the wheat fungal pathogen Zymoseptoria tritici
auteur
Marc-Henri Lebrun, Yohann Petit, Anais Pitarch, Camille Delude, Gabriel Scalliet
article
16 TH EUROPEAN CONFERENCE ON FUNGAL GENETICS, Susanne Zeilinger-Migsich; Hubertus Haas, Mar 2023, Innsbruck, Austria. pp.511
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titre
Chromatin-immunoprocipitation reveals the PNPF2 transcriptional network controlling effector-mediated virulence in a fungal pathogen of wheat
auteur
Kar-Chun Tan, Evan John, Singh Karam, Richard Oliver, Jessica Soyer, Jordi Muria-Gonzalez, Daniel Soo, Jacques Silke, Carl Mousley
article
16 TH EUROPEAN CONFERENCE ON FUNGAL GENETICS, Susanne Zeilinger-Migsich; Hubertus Haas, Mar 2023, Innsbruck,, Austria. pp.486
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titre
Maladies foliaires du colza : résultats du projet Atipical (financement CASDAR) : Actualisation et pérennisation des connaissances et des ressources biologiques et moléculaires –
auteur
Valerie Laval, Marie-Hélène Balesdent, Annette Penaud, Blandine Bamme, Julien Carpezat, Lydia Bousset, Patrick Bagot
article
29ième Carrefour de la sélection du Colza, Promosol, Jan 2023, Bruz (FR), France
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Book sections

titre
Méthodes, leviers et stratégies de lutte
auteur
M.-F. Corio-Costet, Didier Andrivon, Jean-Noel Aubertot, Marc Bardin, Marie-Noëlle Brisset, Agnes Calonnec, Marc Dufrêne, Séverin Hatt, Christophe Le May, Pierre Leroux, Didier Merdinoglu, Philippe C. Nicot, Philippe Reignault, Patrice Rey, Yvan Sache, Ali Siah, Laurent Thibault, Florence Val, Anne-Sophie Walker
article
Reignault, Philippe; Sache, Ivan; Choquer, Mathias; Corio-Costet, Marie-France; Dellagi, Alia; Suffert, frédéric. Phytopathologie, 2e édition, DeBoeck Supérieur, pp.245-319, 2023, Collection noire, 9782807302884
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titre
Epigenetic regulation of fungal genes involved in plant colonization
auteur
Jessica L. Soyer, Isabelle Fudal
article
The Mycota, Plant Relationships / Fungal – plant interactions., 5, springer, pp.255-281, 2023, ⟨10.1007/978-3-031-16503-0⟩
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https://hal.science/hal-04432844/file/Soyer_Fudal_review_epigenetic_regulation_fungi_BioRXIV.pdf BibTex

Lectures

titre
Génétique des populations: initiation à la pensée évolutionniste
auteur
Anne Genissel
article
Licence. Population Genetics, France. 2023, pp.15
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https://hal.inrae.fr/hal-04451832/file/ueLSBI617-Genissel-2023-chapitre1.pdf BibTex

Other publications

titre
Ontology mapping for wheat trait information management
auteur
Claire Nédellec, Sophie Aubin, Clara Sauvion, Sonia Bravo, Jacques Le Gouis, Thierry C. Marcel, Cyril Pommier, Robert Bossy, Michael Alaux
article
Séminaire résidentiel INRAE Semantic Linked Data, 2023
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Books

titre
Protéger les cultures par la diversité végétale
auteur
Anaïs Tibi, Vincent Martinet, Aude Vialatte, Audrey Alignier, Valérie Angeon, David Bohan, Douadia Bougherara, Stéphane Cordeau, Pierre Courtois, Jean-Philippe Deguine, Jérôme Enjalbert, Frederic Fabre, Hélène Fréville, Benoît Grimonprez, Nicolas Gross, Mourad Hannachi, Marie Launay, Stéphane Lemarié, Gilles Martel, Mireille Navarrete, Manuel Plantegenest, Virginie Ravigné, Adrien Rusch, Frédéric Suffert, Sophie Thoyer
article
éditions Quae, 132p., 2023, Matière à débattre et décider, 978-2-7592-3732-6. ⟨10.35690/978-2-7592-3733-3⟩
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titre
Phytopathologie
auteur
Philippe Reignault, Ivan Sache, Mathias Choquer, Marie-France Corio-Costet, Frédéric Suffert
article
Société française de phytopathologie. Bona SpA, 356 p., 2023, 978-2-8073-0288-4
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BibTex
titre
Phytopathologie
auteur
Philippe Reignault, Ivan Sache, Mathias M. Choquer, M.-F. Corio-Costet, Alia Dellagi, Frédéric Suffert
article
De Boeck Supérieur, pp.384, 2023, 978-2807302884
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Poster communications

titre
Effect of CYP51 gene expression levels and haplotype diversity on resistance phenotypes of field isolates of cercospora beticola
auteur
Séverine Fontaine, Laetitia Caddoux, Romain Del Negro,, Lucile Blouquy, Anne-Sophie Walker, Benoît Barrès
article
12th International Congress of Plant Pathology, Aug 2023, LYON, France. Poster
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https://anses.hal.science/anses-04417378/file/Anses%20Lyon2623.pdf BibTex
titre
Identification and characterization of a large multigene family of cooperating effector genes facilitating cell-to-cell mobility conserved in Dothideomycetes and Sordariomycetes
auteur
Nacera Talbi, Mila Blekemolen, Like Fokkens, Corinne Audran, Yohann Petit-Houdenot, Cécile Pouzet, Françoise Blaise, Elise J Gay, Thierry Rouxel, Marie‐hélène Balesdent, Martijn Rep, Frank Takken, Isabelle Fudal
article
International Congress of Plant Pathology, Aug 2023, Lyon, France
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https://hal.inrae.fr/hal-04565521/file/2023%20ICPP%20Fudal_final.pdf BibTex
titre
Ten year of PstS10: a perspective on recent evolutions of French populations of Puccinia striiformis f.sp. tritici (cause of wheat yellow rust)
auteur
Tiphaine Vidal, Leconte Marc, Laurent Gérard, Claude de Vallavieille-Pope, Philippe Du Cheyron
article
12th International Congress of Plant Pathology, Aug 2023, Lyon, France
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BibTex
titre
IDENTIFICATION AND CHARACTERIZATION OF A LARGE MULTIGENE FAMILY OF COOPERATING EFFECTOR GENES FACILITATING CELL-TO-CELL MOBILITY CONSERVED IN DOTHIDEOMYCETES AND SORDARIOMYCETES
auteur
Nacera Talbi, Blekemolen Mila, Like Fokkens, Corinne Audran, Yohann Petit-Houdenot, Cécile Pouzet, Francoise Blaise, Thierry Rouxel, Marie‐hélène Balesdent, Frank L. W. Takken, Martijn Rep, Isabelle Fudal
article
ICPP2023, Aug 2023, lyon, France
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BibTex
titre
Exploitation of the Leptosphaeria maculans late effector repertoire for diversification of resistances to blackleg in Brassica napus
auteur
Audren Jiquel, Julie Gervais, Aude Geistodt-Kiener, Régine Delourme, Pierre George, Justine Mas, Armand Wagner, Adrien Fior, Sébastien Faure, Thierry Rouxel, Marie-Hélène Balesdent
article
16th European Conference on Fungal Genetics, Mar 2023, Innsbruck, Austria. , CS1.1.58, pp.402
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BibTex
titre
Studying sexual reproduction in Leptosphaeria maculans, the causal agent of blackleg disease of rapeseed
auteur
Tinh-Suong Nguyen, Marie-Hélène Balesdent
article
16th European Conference on Fungal Genetics, Mar 2023, Innsbruck,, Austria. , CS2.2.14, pp.577
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BibTex

Reports

titre
Protéger les cultures en augmentant la diversité végétale des espaces agricoles. Rapport scientifique de l’Expertise scientifique collective
auteur
Aude Vialatte, Vincent Martinet, Anaïs Tibi, Audrey Alignier, Valérie Angeon, Laurent Bedoussac, David Bohan, Douadia Bougherara, A. Carpentier, Bastien Castagneyrol, Stéphane Cordeau, Pierre Courtois, Jean-Philippe Deguine, Marianne Doelher, Jérôme Enjalbert, Frédéric Fabre, Fabienne Femenia, Hélène Fréville, Frederic Goulet, Regis Grateau, Benoît Grimonprez, Nicolas Gross, Mourad Hannachi, Philippe Jeanneret, Pierre Labarthe, Marie Launay, Virginie Lelievre, Stéphane Lemarié, Gilles Martel, Abel Louis Masson, Mireille Navarrete, Manuel Plantegenest, Virginie Ravigné, Adrien Rusch, Frédéric Suffert, Abdoulaye Tapsoba, Sophie S. Thoyer
article
INRAE. 2023, 954 p
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https://hal.inrae.fr/hal-04127709/file/ESCo-INRAE-RegulNat_Rapport-VF%20%28V4%29.pdf BibTex

Theses

titre
Study of the role of fungal secondary metabolites in plant-pathogen interactions
auteur
Aude Geistodt-Kiener
article
Life Sciences [q-bio]. Université Paris Saclay, 2023. English. ⟨NNT : ⟩
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BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Can higher aggressiveness effectively compensate for a virulence deficiency in plant pathogen? A case study of Puccinia triticina’s fitness evolution in a diversified varietal landscape
auteur
Cécilia Fontyn, Kevin Jg Meyer, Anne-Lise Boixel, Corentin Picard, Adrien Destanque, Thierry Marcel, Frédéric Suffert, Henriette Goyeau
article
2023
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BibTex
titre
Development of a tool combining multiplex PCR and high-throughput sequencing to study the polymorphism of eight Leptosphaeria maculans avirulence genes and its application to field surveys in France
auteur
Angélique Gautier, Valérie Laval, Marie-Hélène Balesdent
article
2023
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BibTex
titre
Chromatin-immunoprecipitation reveals the PnPf2 transcriptional network controlling effector-mediated virulence in a fungal pathogen of wheat
auteur
Evan John, Karam B Singh, Richard P Oliver, Jessica L Soyer, Jordi Muria-Gonzalez, Daniel Soo, Silke Jacques, Kar-Chun Tan
article
2023
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https://hal.science/hal-04231656/file/John_2022_BioRXiv.pdf BibTex
titre
Breeding and management of major resistance genes to stem canker/blackleg in Brassica crops
auteur
Paula Vasquez-Teuber, Thierry Rouxel, Annaliese S Mason, Jessica L Soyer
article
2023
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https://hal.science/hal-04231645/file/Vasquez-Teuber_ResearchSquare_2023.pdf BibTex
titre
Identifying fungal leaf spots on oilseed rape: could pictures help?
auteur
Lydia Bousset, Magali Ermel, B. Bammé, A. Penaud, J. Carpezat, Mh. Balesdent, Marcellino Palerme, V. Laval, Nicolas Parisey
article
2023
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BibTex
titre
Regulation of effector gene expression as concerted waves in Leptosphaeria maculans : a two-players game
auteur
C. Clairet, E.J. Gay, A. Porquier, F. Blaise, C.L. Marais, M.-H. Balesdent, T. Rouxel, J.L. Soyer, Isabelle Fudal
article
2023
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2022

Journal articles

titre
Tandem metalloenzymes gate plant cell entry by pathogenic fungi
auteur
Bastien Bissaro, Sayo Kodama, Takumi Nishiuchi, Anna Maria Díaz-Rovira, Hayat Hage, David Ribeaucourt, Mireille Haon, Sacha Grisel, A. Jalila Simaan, Fred Beisson, Stephanie Forget, Harry Brumer, Marie-Noëlle Rosso, Victor Guallar, Richard O'Connell, Mickaël Lafond, Yasuyuki Kubo, Jean‐guy Berrin
article
Science Advances , 2022, 8 (51), ⟨10.1126/sciadv.ade9982⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03918339/file/Article%20Content.pdf BibTex
titre
Botrytis cinerea strains infecting grapevine and tomato display contrasted repertoires of accessory chromosomes, transposons and small RNAs
auteur
Adeline Simon, Alex Mercier, Pierre P. Gladieux, Benoît Poinssot, Anne-Sophie Walker, Muriel Viaud
article
Peer Community Journal, 2022, 2, pp.e83. ⟨10.24072/pcjournal.211⟩
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https://hal.science/hal-03910388/file/Simon%20et%20al.%2C%202022%20PCJ.pdf BibTex
titre
Diversity of thermal aptitude of Middle Eastern and Mediterranean Puccinia striiformis f. sp. tritici isolates from different altitude zones
auteur
Rola El Amil, Jacqui Anne Shykoff, Tiphaine Vidal, Anne‐lise Boixel, Marc Leconte, Mogens Hovmøller, Kumarse Nazari, Claude de Vallavieille-Pope
article
Plant Pathology, 2022, 71 (8), pp.1674-1687. ⟨10.1111/ppa.13613⟩
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https://hal.science/hal-03745977/file/PlantPathology-2022-ElAmil-DiversityofthermalaptitudeofMiddleEasternandMediterraneanPucciniastriiformisf.pdf BibTex
titre
Structural and biosynthetic studies of botrycinereic acid, a new cryptic metabolite from the fungus Botrytis cinerea
auteur
Ana Pinto, Javier Barúa, Marilia Almeida, Muriel Viaud, David Zorrilla, Isidro Collado, Antonio Macías-Sánchez, Rosa Durán-Patrón
article
Bioorganic Chemistry, 2022, 127, pp.105979. ⟨10.1016/j.bioorg.2022.105979⟩
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BibTex
titre
Multiple scenarios for sexual crosses in the fungal pathogen Zymoseptoria tritici on wheat residues: potential consequences for virulence gene transmission
auteur
Carolina Orellana-Torrejon, Tiphaine Vidal, Gwilherm Gazeau, Anne-Lise Boixel, Sandrine Gélisse, Jérôme Lageyre, Sébastien Saint-Jean, Frédéric Suffert
article
Fungal Genetics and Biology, In press, pp.103744. ⟨10.1016/j.fgb.2022.103744⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03818769/file/2022.02.24.481803v1.full.pdf BibTex
titre
Stem rust on barberry species in Europe: Host specificities and genetic diversity
auteur
Julian Rodriguez-Algaba, Mogens S Hovmøller, Philipp Schulz, Jens G Hansen, Juan Antonio Lezáun, Jessica Joaquim, Biagio Randazzo, Paweł Czembor, Liga Zemeca, Svetlana Slikova, Alena Hanzalová, Sarah Holdgate, Sarah Wilderspin, Fabio Mascher, Frédéric Suffert, Marc Leconte, Kerstin Flath, Annemarie F Justesen
article
Frontiers in Genetics, 2022, 13, ⟨10.3389/fgene.2022.988031⟩
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https://hal.science/hal-04297352/file/fgene-13-988031%202022.pdf BibTex
titre
20-years of Leptosphaeria maculans population survey in France suggest pyramiding Rlm3 and Rlm7 in rapeseed is a risky resistance management strategy
auteur
Marie-Helene Balesdent, Angélique Gautier, Clémence Plissonneau, Loïc Le Meur, Alizée Loiseau, Martine Leflon, Julien Carpezat, Xavier Pinochet, Thierry Rouxel
article
Phytopathology, 2022, 112 (10), pp.2126-2137. ⟨10.1094/PHYTO-04-22-0108-R⟩
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BibTex
titre
Biocontrol and Growth Promotion Potential of Combined Application of Trichoderma simmonsii and Aspergillus westerdijkiae Against Apple Tree Dieback Disease
auteur
Yosra Ben M'Henni, Ibtissem Ben Salem, Mounira Souli, Slim Tounsi, Danièle Debieu, Sabine Fillinger, Naima Boughalleb-M'Hamdi
article
PhytoFrontiers, 2022, 2 (3), pp.268-279. ⟨10.1094/PHYTOFR-01-22-0005-R⟩
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BibTex
titre
“Late” effectors from Leptosphaeria maculans as tools for identifying novel sources of resistance in Brassica napus
auteur
Audren Jiquel, Elise Gay, Justine Mas, Pierre George, Armand Wagner, Adrien Fior, Sébastien Faure, Marie‐hélène Balesdent, Thierry Rouxel
article
Plant Direct, 2022, 6 (8), pp.e435. ⟨10.1002/pld3.435⟩
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BibTex
titre
Genome-Wide Transcriptomic Analysis of the Effects of Infection with the Hemibiotrophic Fungus Colletotrichum lindemuthianum on Common Bean
auteur
Juan Alvarez-Diaz, Richard Laugé, Etienne Delannoy, Stéphanie Huguet, Christine Paysant-Le Roux, Ariane Gratias, Valérie Geffroy
article
Plants, 2022, 11 (15), pp.1995. ⟨10.3390/plants11151995⟩
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BibTex
titre
LC-MS/MS-Based Fungicide Accumulation Assay to Demonstrate Efflux Activity in the Wheat Pathogen Zymoseptoria tritici
auteur
Guillaume Fouché, Dominique Rosati, Catherine Venet, Hervé Josserand, Marie-Pascale Latorse, Danièle Debieu, Sabine Fillinger
article
Microorganisms, 2022, 10 (8), pp.1494. ⟨10.3390/microorganisms10081494⟩
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BibTex
titre
Daily fluctuations in leaf temperature modulate the development of a foliar pathogen
auteur
Frédéric Bernard, Michaël Chelle, Alain Fortineau, Ons Riahi El Kamel, Sylvain Pincebourde, Ivan Sache, Frédéric Suffert
article
Agricultural and Forest Meteorology, 2022, 322, pp.109031. ⟨10.1016/j.agrformet.2022.109031⟩
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BibTex
titre
A new family of structurally conserved fungal effectors displays epistatic interactions with plant resistance proteins
auteur
Noureddine Lazar, Carl Mesarich, Yohann Petit-Houdenot, Nacera Talbi, Ines Li de La Sierra-Gallay, Emilie Zélie, Karine Blondeau, Jérome Gracy, Bénédicte Ollivier, Françoise Blaise, Thierry Rouxel, Marie-Hélène Balesdent, Alexander Idnurm, Herman van Tilbeurgh, Isabellle Fudal
article
PLoS Pathogens, 2022, 18 (7), pp.e1010664. ⟨10.1371/journal.ppat.1010664⟩
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https://hal.science/hal-03324327/file/journal.ppat.1010664.pdf BibTex
titre
Blocked at the Stomatal Gate, a Key Step of Wheat Stb16q-Mediated Resistance to Zymoseptoria tritici
auteur
Mélissa Battache, Marc-Henri Lebrun, Kaori Sakai, Olivier Soudière, Florence Cambon, Thierry Langin, Cyrille Saintenac
article
Frontiers in Plant Science, 2022, 13, ⟨10.3389/fpls.2022.921074⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03727443/file/2022_Battache_fpls-13-921074%20%281%29.pdf BibTex
titre
Wheat Stem Rust Back in Europe: Diversity, Prevalence and Impact on Host Resistance
auteur
Mehran Patpour, Mogens Hovmøller, Julian Rodriguez-Algaba, Biagio Randazzo, Dolors Villegas, Vladimir Shamanin, Anna Berlin, Kerstin Flath, Pawel Czembor, Alena Hanzalova, Svetlana Sliková, Ekaterina Skolotneva, Yue Jin, Les Szabo, Kevin Meyer, Romain Valade, Tine Thach, Jens Hansen, Annemarie Justesen
article
Frontiers in Plant Science, 2022, 13, ⟨10.3389/fpls.2022.882440⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03713008/file/fpls-13-882440.pdf BibTex
titre
Metagenomic next⁃generation sequencing (mNGS) data reveals the phyllosphere microbiome of wheat plants infected by the fungal pathogen Zymoseptoria tritici
auteur
Didac Barroso-Bergadà, Marie Massot, Noémie Vignolles, Julie Faivre d'Arcier, Emilie Chancerel, Erwan Guichoux, Anne-Sophie Walker, Corinne Vacher, David Bohan, Valérie Laval, Frédéric Suffert
article
Phytobiomes Journal, 2022, 7 (2), pp.281-287. ⟨10.1094/PBIOMES-02-22-0008-FI⟩
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https://hal.science/hal-03689876/file/2023-307.pdf BibTex
titre
The development of extracellular vesicle markers for the fungal phytopathogen Colletotrichum higginsianum
auteur
Brian Rutter, Thi‐thu‐huyen Chu, Jean-Félix Dallery, Kamil Zajt, Richard O'Connell, Roger Innes
article
Journal of Extracellular Vesicles, 2022, 11 (5), ⟨10.1002/jev2.12216⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03664789/file/J%20of%20Extracellular%20Vesicle%20-%202022%20-%20Rutter%20-%20The%20development%20of%20extracellular%20vesicle%20markers%20for%20the%20fungal%20phytopathogen.pdf BibTex
titre
La Russie et la Chine instrumentalisent-elles la réglementation phytosanitaire à des fins géopolitiques ?
auteur
Frédéric Suffert
article
The Conversation France, 2022
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titre
Contribution of the life‐history traits of a plant pathogen to the development of field epidemics
auteur
Gustavo Azzimonti, Julien Papaïx, Christian Lannou, Henriette Goyeau
article
Plant Pathology, 2022, ⟨10.1111/ppa.13567⟩
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titre
Two independent approaches converge to the cloning of a new Leptosphaeria maculans avirulence effector gene, AvrLmS‐Lep2
auteur
Ting Xiang Neik, Kaveh Ghanbarnia, Bénédicte Ollivier, Armin Scheben, Anita Severn‐ellis, Nicholas Larkan, Parham Haddadi, Dilantha Fernando, Thierry Rouxel, Jacqueline Batley, Hossein Borhan, Marie‐hélène Balesdent
article
Molecular Plant Pathology, 2022, ⟨10.1111/mpp.13194⟩
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titre
Diversity of Neofusicoccum parvum for the Production of the Phytotoxic Metabolites (-)-Terremutin and (R)-Mellein
auteur
Patricia Trotel-Aziz, Guillaume Robert-Siegwald, Olivier Fernandez, Catarina Leal, Sandra Villaume, Jean-François Guise, Eliane Abou-Mansour, Marc-Henri Lebrun, Florence Fontaine
article
Journal of Fungi, 2022, 8 (3), pp.319. ⟨10.3390/jof8030319⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03630614/file/jof-08-00319-v2.pdf BibTex
titre
Plant SYP12 syntaxins mediate an evolutionarily conserved general immunity to filamentous pathogens
auteur
Hector Rubiato, Mengqi Liu, Richard O'Connell, Mads Nielsen
article
eLife, 2022, 11 (e73487), ⟨10.7554/eLife.73487⟩
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titre
SEPTODUR - Contribution à la durabilité de la lutte génétique et chimique contre la Septoriose du blé dur par la caractérisation des populations du complexe d’espèces responsable de cette maladie.
auteur
Romain Valade, Thomas Caparroy, Oriane Beaudouin, Cindy Vitry, Marie Massot, Julie Toussaint, Matthieu Killmayer, Michel Bonnefoy, Michaël Cochard, Philippe Lonnet, Thierry Lefèvre, Jean-Paul Legoff, Franck Lacoudre, Céline Duque, Carine André, Gwilherm Gazeau, Clémentine Duplaix, Anne-Sophie Walker, Valerie Laval, Thierry Marcel, Johann Confais, Lilian Gout
article
Innovations Agronomiques, 2022, 84, pp.44-58. ⟨10.15454/ncj0-em61⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03576072/file/2021_Valade_Innovations%20Agronomiques%2084.pdf BibTex
titre
Differential tolerance of Zymoseptoria tritici to altered optimal moisture conditions during the early stages of wheat infection
auteur
Anne-Lise Boixel, Sandrine Gélisse, Thierry Marcel, Frédéric Suffert
article
Journal of Plant Pathology, 2022, ⟨10.1007/s42161-021-01025-7⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03545031/file/867572.full.pdf BibTex
titre
Patterns of thermal adaptation in a globally distributed plant pathogen: Local diversity and plasticity reveal two‐tier dynamics
auteur
Anne-Lise Boixel, Michaël Chelle, Frédéric Suffert
article
Ecology and Evolution, 2022, 12 (1), ⟨10.1002/ece3.8515⟩
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BibTex
titre
Resistance of the Wheat Cultivar ‘Renan’ to Septoria Leaf Blotch Explained by a Combination of Strain Specific and Strain Non-Specific QTL Mapped on an Ultra-Dense Genetic Map
auteur
Camilla Langlands-Perry, Murielle Cuenin, Christophe Bergez, Safa Ben Krima, Sandrine Gélisse, Pierre Sourdille, Romain Valade, Thierry Marcel
article
Genes, 2022, 13 (1), pp.1-28. ⟨10.3390/genes13010100⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03542618/file/2022_Langlands-Perry_genes-13-00100-v3.pdf BibTex
titre
Success and failure of invasive races of plant pathogens: The case of Puccinia striiformis f. sp. tritici in France
auteur
Tiphaine Vidal, Anne‐lise Boixel, Essia Maghrebi, Rémi Perronne, Philippe Cheyron, Jérôme Enjalbert, Marc Leconte, Claude Vallavieille‐pope
article
Plant Pathology, 2022, 2022 (71), pp.1525-1536. ⟨10.1111/ppa.13581⟩
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titre
Is virulence phenotype evolution driven exclusively by Lr gene deployment in French Puccinia triticina populations?
auteur
Cécilia Fontin, Anne-Catherine Zippert, Ghislain Delestre, Thierry C. Marcel, Frédéric Suffert, Henriette Goyeau
article
Plant Pathology, In press, 71 (7), pp.1511-1524. ⟨10.1101/2022.03.16.484559⟩
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titre
Genetic diversity and structure of Bipolaris oryzae and Exserohilum rostratum populations causing brown spot of rice in Burkina Faso based on genotyping-by-sequencing
auteur
Kouka Hilaire Kaboré, Abalo Itolou Kassankogno, Henri Adreit, Joëlle Milazzo, Sonia Guillou, Laurence Blondin, Laurie Chopin, Sébastien Ravel, Florian Charriat, Mariam Barro, Charlottte Tollenaere, Marc-Henri Lebrun, Didier Tharreau
article
Frontiers in Plant Science, 2022, 13, pp.1022348. ⟨10.3389/fpls.2022.1022348⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03947255/file/Kabore-FiPS-2022-CC-BY.pdf BibTex
titre
The impact of wheat cultivar mixtures on virulence dynamics in Zymoseptoria tritici populations persists after interseason sexual reproduction
auteur
Carolina Orellana-Torrejon, Tiphaine Vidal, Sébastien Saint-Jean, Frédéric Suffert
article
Plant Pathology, 2022, 71 (7), pp.1537-1549. ⟨10.1111/ppa.13577⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03700333/file/2022.01.24.477584v1.full.pdf BibTex
titre
How large and diverse are field populations of fungal plant pathogens? The case of Zymoseptoria tritici
auteur
Bruce Mcdonald, Frederic Suffert, Alessio Bernasconi, Alexey Mikaberidze
article
Evolutionary Applications, In press, ⟨10.1111/eva.13434⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03741343/file/EvolutionaryApplications-2022-McDonald-HowlargeanddiversearefieldpopulationsoffungalplantpathogensThe.pdf BibTex
titre
Annual dynamics of Zymoseptoria tritici populations in wheat cultivar mixtures: A compromise between the efficacy and durability of a recently broken-down resistance gene?
auteur
Carolina Orellana-Torrejon, Tiphaine Vidal, Anne-Lise Boixel, Sandrine Gélisse, Sébastien Saint-Jean, Frédéric Suffert
article
Plant Pathology, 2022, 71 (2), pp.289-303. ⟨10.1111/ppa.13458⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03357908/file/2021.04.23.441180v2.full.pdf BibTex
titre
First Report of Rice Brown Spot Caused by Exserohilum rostratum in Mali
auteur
Kouka Hilaire Kaboré, Diariatou Diagne, Joelle Milazzo, Henri Adreit, Marc-Henri Lebrun, Didier Tharreau
article
Plant Disease, 2022, 106 (6), pp.1747. ⟨10.1094/PDIS-03-21-0662-PDN⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03438996/file/PHIM_2021_ADREIT_DISEASE_NOTE_Domaine_Public_first_report_of_rice_brown_spot_caused_by_exserohilum_rostratum.pdf BibTex
titre
Whole-Genome Sequences of Two Kazachstania barnettii Strains Isolated from Anthropic Environments
auteur
Hugo Devillers, Véronique Sarilar, Cécile Grondin, Lieven Sterck, Diego Segond, Noémie Jacques, Delphine Sicard, Serge Casaregola, Colin R. Tinsley
article
Genome Biology and Evolution, 2022, 14 (2), pp.evac007. ⟨10.1093/gbe/evac007⟩
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https://agroparistech.hal.science/hal-03664873/file/Devillers2022.pdf BibTex

Conference papers

titre
Impact du statut de la résistance et efficacité des stratégies de gestion chez le champignon phytopathogène Zymoseptoria tritici : apport de l’évolution expérimentale
auteur
A Ballu, A. Dérédec, A. Wüllschleger, S. Torriani, Carpentier F., A.S. Walker
article
CIMA - Conférence internationale sur les maladies des plantes, Végéphyl, Dec 2022, Orléans, France
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titre
Heterologous expression of a Colletotrichum higginsianum secondary metabolite biosynthetic gene cluster in yeast
auteur
Aude Geistodt‐kiener, Richard O'Connell, Muriel Viaud, Jean-Félix Dallery
article
3rd Fungal genetics Ile-de-France Symposium, Institut Pasteur, Institut Pasteur, Nov 2022, Issy-les-Moulineaux, France
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titre
Deciphering molecular functions and cellular processes targeted by structural families of effectors from Leptosphaeria maculans using experimental and computational approaches
auteur
Clémentine Louet, Nacera Talbi, Claire-Line Marais, Bénédicte Ollivier, Francoise Blaise, Thierry Rouxel, Marie‐hélène Balesdent, Isabelle Fudal
article
Colloque du réseau MoDIP, Oct 2022, Lauret, France
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https://hal.science/hal-04433048/file/2022_LOUET_Abstract-MoDip.pdf BibTex
titre
The neighbouring genes AvrLm10A and AvrLm10B are part of a large multigene family of cooperating effector genes conserved in Dothideomycetes and Sordariomycetes
auteur
Nacera Talbi, Like Fokkens, Corinne Audran, Yohann Petit-Houdenot, Cécile Pouzet, Francoise Blaise, Elise Gay, Angélique Gautier, Thierry Rouxel, Marie‐hélène Balesdent, Martijn Rep, Isabelle Fudal
article
Colloque du réseau MoDIP, Oct 2022, Lauret, France
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titre
On the way to identifying the role of fungal metabolites in plant-pathogen interactions
auteur
A. Geistodt-Kiener, Richard O'Connell, Muriel Viaud, Jean-Félix Dallery
article
JJC2022 - 13ème Rencontres de phytopathologie & mycologie, JJC2022, Sep 2022, Aussois, France
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BibTex
titre
Skill and style to maximise heterogeneity in selection to fungicide adaptation. Resistance status does matter. An experimental evolution study of a plant pathogen.
auteur
Agathe Ballu, A Deredec, J. Wüllschleger, S. Torriani, Florence Carpentier, Anne-Sophie Walker
article
13ème Journées Jean Chevaugeon, Sep 2022, Aussois, France
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titre
Une mutation ponctuelle et une large délétion au locus candidat d’avirulence AvrMlp7 chez la rouille du peuplier sont corrélés avec le contournement de la résistance RMlp7 exprimée par le peuplier
auteur
Clémentine Louet, Méline Saubin, Axelle Andrieux, Antoine Persoons, Mathilde Gorse, Jérémy Petrowski, Bénédicte Fabre, Stéphane De Mita, Sébastien Duplessis, Pascal Frey, Fabien Halkett
article
Journées Jean Chevaugeon, 13èmes Rencontres de Phytopathologie - Mycologie, Sep 2022, Aussois, France
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BibTex
titre
Adaptation of a plant pathogen to fungicides : from population dynamics to the prediction and management of resistance. The case of Zymoseeptoria tritici.
auteur
Anne-Sophie Walker
article
SMBE Satellite Meeting, *, Sep 2022, Kiel (Allemagne), Germany
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titre
Success and failure of invasive races of plant pathogens: the case of Puccinia striiformis f.sp. tritici in France
auteur
Tiphaine Vidal, Anne-Lise Boixel, Essia Maghrebi, Philippe Du Cheyron, Jérôme Enjalbert, Marc Leconte, Claude de Vallavieille-Pope
article
16th International Cereal Rusts and Powdery Mildews Conference 2022, Sep 2022, Cambridge, United Kingdom
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BibTex
titre
Analysis of histone modifications in thermo-primed rapeseed plants by spectrometry and ChIP
auteur
Lorane Le Franc, Benoît Bernay, Jessica L. Soyer, Sophie Brunel-Muguet
article
Cost Action 19125 Epicatch, Jul 2022, Crete, Greece
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BibTex
titre
On the way to identifying the role of fungal metabolites in plant-pathogen interactionss
auteur
A. Geistodt-Kiener
article
Summer school METABIODIVEX "Chemistry of natural product and biology', Jun 2022, Aussois, France
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BibTex
titre
Evidence of multiple fungicide resistance in French populations of Cercospora beticola: from population status to resistance mechanism
auteur
Lucile Blouquy, F. Maupas, C. Royer, I. Pandini, B. Barrès, Anne-Sophie Walker
article
78th International institute of SugaR Beet (IIRB) congress, IRRB, Jun 2022, Mons, Belgium
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titre
Diversity and host specialization in Botrytis species
auteur
Anne-Sophie Walker
article
1st joint Botrytis Sclerotinia symposium, *, Jun 2022, Avignon, France
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BibTex
titre
A new family of structurally conserved fungal effectors displays epistatic interactions with plant resistance proteins
auteur
Isabelle Fudal
article
CAnFunNet Fungal Biology Conference, May 2022, Virtual Event (Canada), France
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BibTex
titre
Characterization of epistatic interactions within a family of structurally conserved fungal effectors and of their broad-spectrum recognition by a plant resistance protein
auteur
Nacera Talbi, Noureddine Lazar, Carl H. Mesarich, Simine Pakzad, Yohann Petit-Houdenot, Inès Li de la Sierra-Gallay, Emilie Zélie, Karine Blondeau, Jérôme Gracy, Bénédicte Ollivier, Francoise Blaise, Thierry Rouxel, Marie‐hélène Balesdent, Alexander Idnurm, Herman van Tilbeurgh, Isabelle Fudal
article
integrated control of oilseed crops meeting, May 2022, Virtual conference, France
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https://hal.science/hal-04433092/file/ICW_abstract_Talbi_final.pdf BibTex
titre
Resistance status does matter to maximise heterogeneity in selection for fungicide adaptation : an experimental evolution study of a plant pathogen
auteur
Agathe Ballu, C. Ugazio, Clémentine Duplaix, J. Wüllschleger, S. Torriani, Anne Dérédec, Florence Carpentier, Anne-Sophie Walker
article
International symposium on cereal leaf blights, May 2022, Gammarth (virtual), Tunisia
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BibTex
titre
Antagonistic pleiotropic effecs reduce adaptation in a major wheat pathogen
auteur
R. Amezrou, Gwilherm Gazeau, Nicolas Lapalu, Frédéric Suffert, Sabine Fillinger, Anne-Sophie Walker, Thierry C. Marcel
article
International symposium on cereal leaf blights, May 2022, Gammarth, Tunisia
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BibTex
titre
Investigating the role of WAKL7 in sensing PME17 activity.
auteur
Aline Voxeur, Wang Ying, Thierry Desprez, Julien Sechet, Laurent Gutierrez, Fabien Senechal, Jerome Pelloux, Richard O'Connell, Samantha Vernhettes
article
Hormone/Cell wall symposium, Stephanie Robert, Mar 2022, Umea, Suède, Sweden
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BibTex
titre
Screen of potential multi-drug resistant Zymoseptoria tritici field isolates reveals genotypic and phenotypic diversity, suggesting multiples mechanisms involves in MDR
auteur
Elsa Neau, Simon Patry-Leclaire, Clémentine Duplaix, Anne-Sophie Walker, Sabine Fillinger
article
ECFG16 - 16th European conference on fungal genetics, ECFG, Mar 2022, Innsbruck, Austria
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BibTex
titre
Regulation of effector gene expression as concerted waves in Leptosphaeria maculans: a two-players game
auteur
Colin Clairet, Elise J Gay, Antoine Porquier, Francoise Blaise, Claire-Line Marais, Thierry Rouxel, Marie‐hélène Balesdent, Jessica L. Soyer, Isabelle Fudal
article
Journées Jean Chevaugeon, Jan 2022, Aussois, France
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Special issue

titre
Editorial: Antifungal Resistance: From Molecular to Global Issues
auteur
Daisuke Hagiwara, Sabine Fillinger, Dominique Sanglard
article
Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 12, pp.867398, 2022, ⟨10.3389/fcimb.2022.867398⟩
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Poster communications

titre
Fungal small RNAs: are they involved into host specialization?
auteur
Antoine Porquier, Adeline Simon, Anne-Sophie Walker, Benoit Poinssot, Muriel Viaud
article
JJC2022 - 13ème Rencontres de phytopathologie & mycologie, Sep 2022, Aussois, France
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BibTex
titre
Dissection of the machinery shaping dynamic chromatin structure in Leptosphaeria maculans
auteur
Antoine Porquier, Colin Clairet, Rim Brick-Chaouche, Moussa Benhamed, David Latrasse, Cécile Raynaud, Jérôme Chapuis, Francoise Blaise, Isabelle Fudal, Jessica L. Soyer
article
Journées Jean Chevaugeon, Sep 2022, Aussois, France
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https://hal.science/hal-04231733/file/Abstract_Porquier_Aussois_2022_final.pdf BibTex
titre
Recent sudden drops in ratings for cultivar resistance to stripe rust: testing different hypotheses to explain a case study
auteur
Tiphaine Vidal, Anne-Lise Boixel, Philippe Du Cheyron, Marc Leconte
article
16th International Cereal Rusts and Powdery Mildews Conference 2022, Sep 2022, Cambridge, United Kingdom
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BibTex
titre
Which potential of service plants for ‘multi-pest’ regulation in agroecosystems? An integrative conceptual framework highlighting complementarities in mechanisms and traits
auteur
Delphine Moreau, Elsa Ballini, Caroline Djian‐caporalino, Marie Chave, Stéphane Cordeau, Anne Violette Lavoir, Frédéric Suffert, Anne Marie Cortesero
article
XVII. Congress of the European Society for Agronomy, Aug 2022, Potsdam, Germany
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BibTex
titre
A new blackleg/phoma stem canker resistance gene in Black Mustard and progress towards introgression into rapeseed
auteur
Paula Vasquez-Teuber, J L Soyer, Marie‐hélène Balesdent, T Rouxel, R Gaebelein, Annaliese S Mason
article
GPZ Conference, Mar 2022, Düsselforf, Germany
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https://hal.science/hal-04232276/file/Poster%20%20GPZ2022_Vasquez_Teuber.pdf BibTex

Reports

titre
Protéger les cultures en augmentant la diversité végétale des espaces agricoles. Synthèse de l’expertise scientifique collective
auteur
Anaïs Tibi, Vincent Martinet, Aude Vialatte, Audrey Alignier, Valérie Angeon, David Bohan, Douadia Bougherara, Stéphane Cordeau, Pierre Courtois, Jean-Philippe Deguine, Jérôme Enjalbert, Frédéric Fabre, Hélène Fréville, Regis Grateau, Benoît Grimonprez, Nicolas Gross, Mourad Hannachi, Marie Launay, Virginie Lelievre, Stéphane Lemarié, Gilles Martel, Mireille Navarrete, Manuel Plantegenest, Virginie Ravigné, Adrien Rusch, Frédéric Suffert, Sophie S. Thoyer
article
INRAE. 2022, 86 p
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https://hal.inrae.fr/hal-03852213/file/RegulNat-synth%C3%A8se_12-12-23_V3.pdf BibTex

Theses

titre
Incidence des résistances Rlm11 et RlmS du colza sur le microbiote fongique associé à Leptosphaeria maculans et sur la sélection des allèles d'avirulence au cours du cycle infectieux
auteur
Mathilde Gorse
article
Sciences de l'environnement. Université Paris Saclay, 2022. Français. ⟨NNT : ⟩
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BibTex
titre
L’agressivité est-elle une composante significative de l’adaptation au paysage variétal cultivé, des populations de Puccinia triticina, agent de la rouille brune du blé ?
auteur
Cécilia Fontyn
article
Phytopathologie et phytopharmacie. AgroParisTech, 2022. Français. ⟨NNT : 2022AGPT0012⟩
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https://pastel.hal.science/tel-04151499/file/104015_FONTYN_2022_archivage.pdf BibTex
titre
Comprendre l'implication de familles d'effecteurs du champignon phytopathogène Leptosphaeria maculans dans l'infection du colza
auteur
Nacera Talbi
article
Biologie végétale. Université Paris-Saclay, 2022. Français. ⟨NNT : 2022UPASB041⟩
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https://theses.hal.science/tel-04224310/file/101889_TALBI_2022_archivage.pdf BibTex
titre
La question du « quantitatif ou qualitatif » dans les interactions plantes-pathogènes pourrait-elle être un faux dilemme ? L’étude de cas blé-Zymoseptoria tritici
auteur
Camilla Langlands-Perry
article
Sciences de l'environnement. Université Paris Saclay (COMUE), 2022. Français. ⟨NNT : ⟩
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BibTex
titre
Quantitatif versus qualitatif dans le cadre des interactions plante-pathogène, est-ce un faux dilemme ? Le cas de l'interaction blé-Zymoseptoria tritici
auteur
Camilla Langlands-Perry
article
Plants genetics. Université Paris-Saclay, 2022. English. ⟨NNT : 2022UPASB030⟩
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https://theses.hal.science/tel-04507702/file/107631_LANGLANDS-PERRY_2022_archivage.pdf BibTex
titre
Helminthosporiose du riz en Afrique de l'Ouest : identification des espèces responsables et diversité génétique de Bipolaris oryzae et Exserohilum rostratum
auteur
Kouka Hilaire Kabore
article
Génétique des populations [q-bio.PE]. Université Paris-Saclay, 2022. Français. ⟨NNT : 2022UPASB035⟩
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https://theses.hal.science/tel-03722955/file/108084_KABORE_2022_archivage.pdf BibTex
titre
Helminthosporiose du riz en Afrique de l'Ouest : identification des espèces responsables et diversité génétique de Bipolaris oryzae et Exserohilum rostrat‹iiri
auteur
Kaboré Kouba
article
Sciences du Vivant [q-bio]. Paris-Saclay, 2022. Français. ⟨NNT : ⟩
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BibTex
titre
Impact d’associations variétales de blé tendre sur la dynamique annuelle d’adaptation d’une population de Zymoseptoria tritici à un gène de résistance qualitative récemment contourné
auteur
Carolina Orellana Torrejon
article
Agronomie. Université Paris-Saclay, 2022. Français. ⟨NNT : 2022UPASB031⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://pastel.hal.science/tel-03708743/file/104685_ORELLANA_TORREJON_2022_archivage.pdf BibTex

2021

Journal articles

titre
Spatio‐temporal distribution of DMI and SDHI fungicide resistance of Zymoseptoria tritici throughout Europe based on frequencies of key target‐site alterations
auteur
Pierre Hellin, Maxime Duvivier, Thies Heick, Bart Fraaije, Charlotte Bataille, Aurélie Clinckemaillie, Anne Legrève, Lise Jørgensen, Björn Andersson, Berit Samils, Bernd Rodemann, Gunilla Berg, Fiona Hutton, Maxime Garnault, Moussa El Jarroudi, Gilles Couleaud, Steven Kildea
article
Pest Management Science, 2021, 77 (12), pp.5576-5588. ⟨10.1002/ps.6601⟩
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BibTex
titre
A single amino acid polymorphism in a conserved effector of the multihost blast fungus pathogen expands host-target binding spectrum
auteur
Adam Bentham, Yohann Petit-Houdenot, Joe Win, Izumi Chuma, Ryohei Terauchi, Mark Banfield, Sophien Kamoun, Thorsten Langner
article
PLoS Pathogens, 2021, 17 (11), pp.e1009957. ⟨10.1371/journal.ppat.1009957⟩
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BibTex
titre
Are Efficient-Dose Mixtures a Solution to Reduce Fungicide Load and Delay Evolution of Resistance? An Experimental Evolutionary Approach
auteur
Agathe Ballu, Anne Deredec, Anne-Sophie Walker, Florence Carpentier
article
Microorganisms, 2021, 9 (11), pp.2324. ⟨10.3390/microorganisms9112324⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03470506/file/microorganisms-09-02324-v2.pdf BibTex
titre
Spatiotemporal Changes in Varietal Resistance to Wheat Yellow Rust in France Reveal an Increase in Field Resistance Level During the Period 1985–2018
auteur
Rémi Perronne, Florence Dubs, Claude de Vallavieille-Pope, Marc Leconte, Philippe Du Cheyron, Valérie Cadot, Tiphaine Vidal, Jérôme Enjalbert
article
Phytopathology, 2021, 111 (9), pp.1602-1612. ⟨10.1094/PHYTO-05-20-0187-R⟩
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titre
Directed evolution predicts cytochrome b G37V target site modification as probable adaptive mechanism towards the QiI fungicide fenpicoxamid in Zymoseptoria tritici
auteur
Guillaume Fouché, Thomas Michel, Anaïs Lalève, Nick Wang, David Young, Brigitte Meunier, Danièle Debieu, Sabine Fillinger, Anne‐sophie Walker
article
Environmental Microbiology, 2021, 24 (03), pp.1117-1132. ⟨10.1111/1462-2920.15760⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03357067/file/accepted.pdf BibTex
titre
Assessing the Cultivability of Bacteria and Fungi from Arable Crop Residues Using Metabarcoding Data as a Reference
auteur
Valerie Laval, Lydie Kerdraon, Matthieu Barret, Anne-Lise Liabot, Coralie Marais, Benjamin Boudier, Marie-Hélène Balesdent, Marion Fischer-Le Saux, Frédéric Suffert
article
Diversity, 2021, 13 (9), pp.404. ⟨10.3390/d13090404⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03368843/file/diversity-13-00404-v3.pdf BibTex
titre
A new avirulence gene of Leptosphaeria maculans , AvrLm14 , identifies a resistance source in American broccoli ( Brassica oleracea ) genotypes
auteur
Alexandre A. Degrave, Marine Wagner, Pierre George, Laurent Coudard, Xavier Pinochet, Magali Ermel, Elise Gay, Isabelle Fudal, Onesimo Moreno‐rico, Thierry Rouxel, Marie‐hélène Balesdent
article
Molecular Plant Pathology, 2021, 22 (12), pp.1599-1612. ⟨10.1111/mpp.13131⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03344127/file/mpp.13131%281%29.pdf BibTex
titre
The Colletotrichum higginsianum secreted effector protein ChEC91 induces plant cell death
auteur
Hiroyuki Takahara, Sho Yamaguchi, Natsuki Omura, Shota Nakajima, Kasumi Otoku, Satomi Tanaka, Kenji Ogura, Jochen Kleemann, Richard O'Connell
article
Journal of General Plant Pathology, 2021
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titre
Models of plant resistance deployment
auteur
Loup Rimbaud, Frédéric Fabre, Julien Papaïx, Benoît Moury, Christian Lannou, Luke Barrett, Peter Thrall
article
Annual Review of Phytopathology, 2021, 59, pp.125-152. ⟨10.1146/annurev-phyto-020620-122134⟩
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https://hal.science/hal-03220213/file/%28postprint%29Review_ModelsRdeploy_vf_withFigs.pdf BibTex
titre
“Phytopathological strolls” in the dual context of COVID‐19 lockdown and IYPH2020: Transforming constraints into an opportunity for public education about plant pathogens
auteur
Frédéric Suffert, Muriel Suffert
article
Plant Pathology, 2021, ⟨10.1111/ppa.13430⟩
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titre
Genome-wide mapping of histone modifications during axenic growth in two species of Leptosphaeria maculans showing contrasting genomic organization
auteur
Jessica Soyer, Colin Clairet, Elise Gay, Nicolas Lapalu, Thierry Rouxel, Eva Stukenbrock, Isabelle Fudal
article
Chromosome Research, 2021, 29 (2), pp.219-236. ⟨10.1007/s10577-021-09658-1⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03266749/file/s10577-021-09658-1.pdf BibTex
titre
New specific quantitative real‐time PCR assays shed light on the epidemiology of two species of the Leptosphaeria maculans – Leptosphaeria biglobosa species complex
auteur
Noémie Jacques, Marie‐hélène Balesdent, Thierry Rouxel, Valerie Laval
article
Plant Pathology, 2021, 70 (3), pp.643-654. ⟨10.1111/ppa.13323⟩
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titre
Large-scale transcriptomics to dissect 2 years of the life of a fungal phytopathogen interacting with its host plant
auteur
Elise J Gay, Jessica L Soyer, Nicolas Lapalu, Juliette Linglin, Isabelle Fudal, Corinne da Silva, Patrick Wincker, Jean-Marc Aury, Corinne Cruaud, Anne Levrel, Jocelyne Lemoine, Régine Delourme, Thierry Rouxel, Marie-Hélène Balesdent
article
BMC Biology, 2021, 19 (1), pp.e041118. ⟨10.1186/s12915-021-00989-3⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03190704/file/Gay-2021-Large-scale%20transcriptomics%20to%20dissect.pdf BibTex
titre
Impairment of botrydial production in Botrytis cinerea allows the isolation of undescribed polyketides and reveals new insights into the botcinins biosynthetic pathway
auteur
Javier Moraga, Inmaculada Izquierdo-Bueno Reina, Cristina Pinedo, Rosario Hernández-Galán, Muriel Viaud, Isidro Collado
article
Phytochemistry, 2021, 183, pp.112627. ⟨10.1016/j.phytochem.2020.112627⟩
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titre
Morphological characterization and genetic diversity analysis of Tunisian durum wheat (Triticum turgidum var. durum) accessions
auteur
Maroua Ouaja, Bochra Bahri, Lamia Aouini, Sahbi Ferjaoui, Maher Medini, Thierry Marcel, Sonia Hamza
article
BMC Genomic Data, 2021, 22 (1), ⟨10.1186/s12863-021-00958-3⟩
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titre
A gene‐for‐gene interaction involving a ‘late’ effector contributes to quantitative resistance to the stem canker disease in Brassica napus
auteur
Audren Jiquel, Julie Gervais, Aude Geistodt‐kiener, Régine Delourme, Elise Gay, Bénédicte Ollivier, Isabelle Fudal, Sébastien Faure, Marie‐hélène Balesdent, Thierry Rouxel
article
New Phytologist, 2021, 231 (4), pp.1510-1524. ⟨10.1111/nph.17292⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03155959/file/Jiquel%20et%20al%20-%202021%20-%20A%20gene-for-gene%20interaction%20involving%20a%20%E2%80%98late%E2%80%99%20effector%20contributes%20to.pdf BibTex
titre
Responses of the necrotrophic fungus Alternaria brassisicola to the indolic phytoalexin brassinin
auteur
Guillaume Quang N’guyen, Roxane Raulo, Antoine Porquier, Beatrice Iacomi, Sandra Pelletier, Jean-Pierre Renou, Nelly Bataillé-Simoneau, Claire C. Campion, Bruno Hamon, Anthony Kwasiborski, Justine Colou, Abdelilah Benamar, Piétrick Hudhomme, David Macherel, Philippe Simoneau, Thomas Guillemette
article
Frontiers in Plant Science, 2021, 11, pp.611643. ⟨10.3389/fpls.2020.611643⟩
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https://univ-angers.hal.science/hal-04012225/file/fpls-11-611643.pdf BibTex
titre
Impacts of Sodium Arsenite on Wood Microbiota of Esca-Diseased Grapevines
auteur
Emilie E. Bruez, Philippe Larignon, Christophe C. Bertsch, Guillaume Robert-Siegwald, Marc Henri M. H. Lebrun, Patrice Rey, Fontaine Florence
article
Journal of Fungi, 2021, 7 (7), pp.498. ⟨10.3390/jof7070498⟩
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https://hal.univ-reims.fr/hal-03268364/file/jof-07-00498-v2.pdf BibTex
titre
Monitoring systems for resistance to plant protection products across the world: Between redundancy and complementarity
auteur
R4p Network, Benoit Barrès, Marie-France Corio-Costet, Daniele Debieu, Christophe Délye, Sabine Fillinger, Bertrand Gauffre, Gaëlle Le Goff, Jacques Grosman, Mourad Hannachi, Pauline de Jerphanion, Lise Nistrup Jorgensen, Christophe Plantamp, Myriam Siegwart, Anne-Sophie Walker
article
Pest Management Science, 2021, 77 (6), pp.2697-2709. ⟨10.1002/ps.6275⟩
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titre
Population genomics reveals molecular determinants of specialization to tomato in the polyphagous fungal pathogen Botrytis cinerea in France
auteur
Alex Mercier, Adeline Simon, Nicolas Lapalu, Tatiana E Giraud, Marc Bardin, Anne-Sophie Walker, Muriel Viaud, Pierre Gladieux
article
Phytopathology, 2021, 111, pp.2355-2366. ⟨10.1094/PHYTO-07-20-0302-FI⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03197705/file/Mercier%20BioRxiv.pdf BibTex
titre
Promoting crop pest control by plant diversification in agricultural landscapes: A conceptual framework for analysing feedback loops between agro-ecological and socio-economic effects
auteur
A. Vialatte, Anaïs Tibi, Valérie Angeon, Laurent Bedoussac, Frédéric Fabre, David Bohan, Douadia Bougherara, A. Carpentier, Bastien Castagneyrol, Stéphane Cordeau, Pierre Courtois, Jean-Philippe Deguine, Jerome J. Enjalbert, Fabienne Femenia, Hélène Fréville, Frederic Goulet, Regis Grateau, Benoît Grimonprez, Stephane Lemarié, Nicolas Gross, Mourad Hannachi, Philippe Jeanneret, Laure Kühfuss, Pierre P. Labarthe, Marie Launay, Marianne Lefebvre, Virginie Lelievre, Gilles Martel, Abel Louis Masson, Mireille Navarrete, Manuel Plantegenest, Virginie Ravigné, Adrien Rusch, Frederic Suffert, Abdoulaye Tapsoba, Olivier Therond, Sophie S. Thoyer, Vincent Martinet
article
Advances in Ecological Research, 2021, Advances in Ecological Research,, 65, pp.133-165. ⟨10.1016/bs.aecr.2021.10.004⟩
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titre
The quasi-universality of nestedness in the structure of quantitative plant-parasite interactions
auteur
Benoît Moury, Jean-Marc Audergon, Sylvie Baudracco-Arnas, Safa Ben Krima, François Bertrand, Nathalie Boissot, Mireille Buisson, Valérie Caffier, Melissa Cantet, Sylvia Chanéac, Carole Constant, François Delmotte, Catherine Dogimont, Juliette Doumayrou, Frédéric Fabre, Sylvain Fournet, Valérie Grimault, Thierry Jaunet, Isabelle Justafré, Véronique Lefebvre, Denis Losdat, Thierry Marcel, Josselin Montarry, Cindy E. Morris, Mariem Omrani, Manon Paineau, Sophie Perrot, Marie-Laure Pilet-Nayel, Youna Ruellan
article
Peer Community Journal, 2021, 1, pp.e44. ⟨10.24072/pcjournal.51⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03461843/file/2021_Moury_PeerCommunityJournal.pdf BibTex
titre
Ustilago maydis effector Jsi1 interacts with Topless corepressor, hijacking plant jasmonate/ethylene signaling
auteur
Martin Darino, Khong‐sam Chia, Joana Marques, David Aleksza, Luz Mayela Soto‐jiménez, Indira Saado, Simon Uhse, Michael Borg, Ruben Betz, Janos Bindics, Krzysztof Zienkiewicz, Ivo Feussner, Yohann Petit‐Houdenot, Armin Djamei
article
New Phytologist, In press
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titre
Identification of Copper-Containing Oxidoreductases in the Secretomes of Three Colletotrichum Species with a Focus on Copper Radical Oxidases for the Biocatalytic Production of Fatty Aldehydes
auteur
David Ribeaucourt, Safwan Saker, David Navarro, Bastien Bissaro, Elodie Drula, Lydie Oliveira Correia, Mireille Haon, Sacha Grisel, Nicolas Lapalu, Bernard Henrissat, Richard O'Connell, Fanny Lambert, Mickaël Lafond, Jean-Guy Berrin
article
Applied and Environmental Microbiology, 2021, 87 (24), pp.e01526-21. ⟨10.1128/AEM.01526-21⟩
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https://hal.science/hal-03619439/file/Ribeaucourt%20et%20al.%2C%20AEM%202021.pdf BibTex

Conference papers

titre
Une structure emboîtée universelle pour les interactions quantitatives entre les plantes et leurs parasites ?
auteur
Benoît Moury, Jean-Marc Audergon, Sylvie Baudracco-Arnas, Safa Ben Krima, François Bertrand, Nathalie Boissot, Mireille Buisson, Valérie Caffier, Melissa Cantet, Sylvia Chanéac, Carole Constant, Francois F. Delmotte, Catherine Dogimont, Juliette Doumayrou, Frédéric Fabre, Sylvain Fournet, Valérie Grimault, Thierry Jaunet, Isabelle Justafré, Véronique Lefebvre, Denis Losdat, Thierry C. Marcel, Josselin Montarry, Cindy E. Morris, Mariem Omrani, Manon Paineau, Sophie Perrot, Marie-Laure Pilet-Nayel, Youna Ruellan
article
Réunion annuelle du réseau E3GP3, Dec 2021, Visioconférence, France
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https://hal.inrae.fr/hal-03553078/file/Moury_HAL_INRAE.pdf BibTex
titre
Identification of the determinants involved in the adaptation of Leptosphaeria maculans to different Brassica species
auteur
Julie Noah, Mathilde Gorse, Nicolas Lapalu, Thierry Rouxel, Marie-Hélène Balesdent, Jessica L Soyer
article
Fungal Genetics IDF Symposium, Nov 2021, Paris, France
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titre
AvrLm10A/AvrLm10B a part of a multigene family of cooperating effectors largely conserved in Dothideomycetes and Sordariomycetes
auteur
Nacera Talbi, Yohann Petit-Houdenot, Claire-Line Marais, Bénédicte Ollivier, Francoise Blaise, Thierry Rouxel, Marie‐hélène Balesdent, Isabelle Fudal
article
Fungal Genetics Symposium IDF, Nov 2021, Paris, France
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https://hal.science/hal-04433125/file/Talbi%20et%20al-Fungal%20Genetics%20Ile-de-France%20Symposium%20-2022%20.pdf BibTex
titre
Investigating the involvment of the chromatin state and transcription factors in the control of effector gene expression in Leptosphaeria maculans.
auteur
Colin Clairet, Bénédicte Ollivier, Elise J Gay, Alexander Idnurm, Jessica L. Soyer, Isabelle Fudal
article
Second Symposium Fungal Genetics IDF, Nov 2021, Paris, France
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titre
Exploring the production and composition of extracellular vesicles by the crucifer anthracnose fungus? Colletotrichum higginsianum
auteur
Richard O'Connell
article
Fifth International symposium on microbiology and biotechnology (SIMB), Universidade federal de Viçosa, Nov 2021, Viçosa, Brazil
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titre
Regulation of effector gene expression as concerted waves in Leptosphaeria maculans: a two-players game
auteur
Colin Clairet, Elise J Gay, Antoine Porquier, Francoise Blaise, Claire-Line Marais, Thierry Rouxel, Marie‐hélène Balesdent, Jessica L. Soyer, Isabelle Fudal
article
Colloque GDR3E / Reaction, Oct 2021, Montpellier, France
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titre
Comment adapter les échelles de phénologie aux champignons phytopathogènes, et pour quelles utilisations ?
auteur
Chloe E. L. Delmas, Marie-Odile Bancal, Christel Leyronas, Marie-Hélène Robin, Tiphaine Vidal, Marie Launay
article
Séminaire Phénologie de TEMPO 2021, Réseau TEMPO, Oct 2021, Fontainebleau, France
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titre
Many different recipes but one flavor: A universal nested structure of quantitative interactions between plant genotypes and their parasites, including viruses
auteur
Benoît Moury, Jean-Marc Audergon, Sylvie Baudracco-Arnas, Safa Ben Krima, François Bertrand, Nathalie Boissot, Mireille Buisson, Valérie Caffier, Melissa Cantet, Sylvia Chanéac, Carole Constant, François Delmotte, Catherine Dogimont, Juliette Doumayrou, Frédéric Fabre, Sylvain Fournet, Valérie Grimault, Thierry Jaunet, Isabelle Justafré, Véronique Lefebvre, Denis Losdat, Thierry C. Marcel, Josselin Montarry, Cindy E. Morris, Mariem Omrani, Manon Paineau, Sophie Perrot, Marie-Laure Pilet-Nayel, Youna Ruellan
article
18. Rencontres de virologie végétale (RVV 2021), INRAE; CIRAD, Sep 2021, Aussois, France
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https://hal.inrae.fr/hal-03553180/file/Moury_HAL-INRAE.pdf BibTex
titre
A small species-specific effector from Colletotrichum graminicola that targets the host nucleus and aids in virulence at the early stages of infection
auteur
F.B Cuevas-Fernandez, Baroncelli R., S.D Becerra-Zambrano, J.M Sanz-Martin, P. Garcia-Rodriguez, J. Ortiz-Alvarez, T.R Boufleur, S. Dagher, E.P Benito, Richard O'Connell, J.M Bruno-Barcena, M.R Thon, S.A Sukno
article
APS Plant health conference Online, Aug 2021, *, France
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titre
Association of two co-occurring mutations at the AvrMlp7 avirulence locus in poplar rust during the breakdown of RMlp7 resistance gene
auteur
Louet C, Méline Saubin, Axelle Andrieux, A. Persoons, Gorce M, Jérémy Pétrowski, Stéphane de Mita, Bénédicte Fabre, Pascal Frey, Sébastien Duplessis, Fabien Halkett
article
Molecular Mechanism & Structure— Zooming in on Plant Immunity, Jul 2021, e-symposia, Germany
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titre
Investigating the role of WAKL7 in sensing PME17 activity
auteur
Aline Voxeur, Ying Wang, Thierry Desprez, Julien Séchet, Laurent Gutierrez, Stéphanie Guénin, Fabien Sénéchal, Jérôme Pelloux, Richard O’connell, Samantha Vernhettes.
article
7th Plant Cell Wall Biology Congress, Jun 2021, Sapporo, Japan
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titre
On the way to identifying the role of fungal secondary metabolites in plant-pathogen interactions: Focus on a biosynthetic gene cluster of Botrytis cinerea
auteur
A. Geistodt-Kiener
article
BotrytisSclero Webinar, Jun 2021, *, France
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titre
Non-proteinaceous effectors on the battlefield:what role for fungal secondary metabolites?
auteur
Jean-Félix Dallery
article
Molecular diagogue in plant biotic interactions webinars - MoDip Network, May 2021, Montpellier, France
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Book sections

titre
Évolution de la diversité cultivée du blé tendre en France
auteur
Rémi Perronne, Tiphaine Vidal, Philippe P. Du Cheyron, Jérôme Enjalbert, Isabelle Goldringer
article
L'immunité des plantes. Pour des cultures résistantes aux maladies, Editions Quae, 2021, 9782759232338
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BibTex
titre
Les contournements de résistance : Mécanismes, dynamiques et conséquences
auteur
Henriette Goyeau, Fabien Halkett, Bruno Le Cam, Josselin Montarry, Christophe Le May
article
L'immunité des plantes. Pour des cultures résistantes aux maladies, Editions Quae, pp.135-145, 2021, 9782759232338
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BibTex
titre
L'adaptation des agents pathogènes de plantes aux systèmes cultivés : une évolution sous contraintes anthropiques
auteur
Fabien Halkett, Christian Lannou, Christophe Le May, Josselin Montarry, Julien J. Papaix, Virginie Ravigné
article
L'immunité des plantes. Pour des cultures résistantes aux maladies, Editions Quae, pp.125-134, 2021, 9782759232338
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BibTex
titre
Vers une gestion des gènes de résistances comme des biens communs
auteur
Mourad Hannachi, François Coléno, Lydia Bousset, Régine Delourme, Anne-Marie Chèvre, Marie-Hélène Balesdent, Thierry Rouxel, Xavier X. Pinochet, Martine Leflon, Cécilia Multeau, Laurence Garmendia-Auckenthaler
article
L'immunité des plantes. Pour des cultures résistantes aux maladies, Editions Quae, 2021, 9782759232338
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BibTex
titre
Diversifier les paysages cultivés : état des connaissances et perspectives de recherche
auteur
Frédéric Fabre, Florence F. Carpentier, Julien Papaïx, Anne-Lise Boixel, Karine Berthier
article
L'immunité des plantes. Pour des cultures résistantes aux maladies, Editions Quae, 2021, 9782759232338
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https://hal.inrae.fr/hal-03130984/file/QuaeImmuniteVegetale_chapitre%2017.pdf BibTex
titre
Diversifier les paysages cultivés: état des connaissances et perspectives de recherche
auteur
Frédéric Fabre, Florence Carpentier, J Papaïx, Anne-Lise Boixel, Karine Berthier
article
L'immunité des plantes. Pour des cultures résistantes aux maladies, , 392 p., 2021, 9782759232345
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BibTex
titre
Mélanger les variétés pour construire des peuplements plus résistants aux bioagresseurs
auteur
Tiphaine Vidal, Arnaud Gauffreteau, Jérôme Enjalbert, Frédéric Suffert
article
L'immunité des plantes. Pour des cultures résistantes aux maladies.Pour des cultures résistantes aux maladies, Ed. QUAE, 2021, 978-2-7592-3233-8
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titre
L'intégration des connaissances sur les résistances variétales par les acteurs de la sélection : un gage d'efficacité et de durabilité? L'exemple du phoma du colza
auteur
Thierry Rouxel, Marie-Hélène Balesdent
article
L'immunité des plantes. Pour des cultures résistantes aux maladies, Ed. QUAE, 392 p;, 2021, 978-2-7592-3233-8
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BibTex
titre
Maladies et bioagresseurs : bien les connaître pour une protection intégrée efficace
auteur
Henriette Goyeau, Romain Valade, Claude Vallavieille‐pope, Marc Leconte, Jack Massé, Michel Bonnefoy, Béatrice Orlando, Claude C. Maumené, Nathalie Robin, Jean Baptiste Thibord
article
Abécassis J; Massé J; Allaoua A. Blé dur. Synthèse des connaissances pour une filière durable, Editions Quae, 2021, Chapitre 7, 9782759233137
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titre
Effecteurs des agents phytopathogènes: à la croisée des chemins entre manipulation et induction des réactions de défense des plantes.
auteur
Thierry Rouxel, Stéphane Genin, Muriel Viaud
article
L'immunité des plantes. Pour des cultures résistantes aux maladies, Ed QUAE, 392 p., 2021, 978-2-7592-3233-8
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Other publications

titre
Dataset of a two-year field experiment on the dynamics of Zymoseptoria tritici populations in wheat cultivar mixtures
auteur
Carolina Orellana-Torrejon, Tiphaine Vidal, Anne-Lise Boixel, Sandrine Gélisse, Sébastien Saint-Jean, Frédéric Suffert
article
2021, ⟨10.15454/4MAAI0⟩
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Patents

titre
UTILISATION DE L'ACIDE 4-PHÉNYLBUTYRIQUE ET/OU DE L'ACIDE 3-PHÉNYLBUTYRIQUE ET/OU DE L'ACIDE 2-PHÉNYLBUTYRIQUE POUR LA PRÉVENTION ET LE TRAITEMENT DES MALADIES CRYPTOGAMIQUES
auteur
Jean‐luc Cacas, Damien Vasselon, Olivier Lamotte, Benoit Poinssot, Anne-Sophie Walker
article
France, N° de brevet: FR2005221. Wo2021233961 - 25/11/2021. 2021
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Poster communications

titre
Association of two co-occurring mutations at the AvrMlp7 avirulence locus in poplar rust during the breakdown of RMlp7 resistance gene
auteur
Louet Clémentine, Saubin Méline, Andrieux Axelle, Persoons Antoine, Gorse Mathilde, Pétrowski Jérémy, Mita Stéphane De, Fabre Bénédicte, Duplessis Sébastien, Frey Pascal, Halkett Fabien
article
IS-MPMI Congress eSymposium, Pathogen-Host Coevolution — Combating Resistance Breaking in Agriculture, Sep 2021, Online, United States. , 2021, 2021 IS-MPMI Congress: eSymposia Series Abstracts. ⟨10.1094/MPMI-34-9-S2.1⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04137548/file/abstract%20Poster-ISMPMI_LOUET-2021.pdf BibTex

Theses

titre
Évaluation des stratégies de gestion des résistances aux fongicides par une approche d’évolution expérimentale : le cas de Zymoseptoria tritici, agent causal de la septoriose
auteur
Agathe Ballu
article
Phytopathology and phytopharmacy. Université Paris-Saclay, 2021. English. ⟨NNT : 2021UPASB041⟩
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https://theses.hal.science/tel-03429588/file/97662_BALLU_2021_archivage.pdf BibTex
titre
Exploitation du répertoire d’effecteurs de Leptosphaeria maculans pour une diversification des sources de résistance à la nécrose du collet chez Brassica napus
auteur
Audren Jiquel
article
Biologie végétale. Université Paris-Saclay, 2021. Français. ⟨NNT : 2021UPASB032⟩
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https://theses.hal.science/tel-03718898/file/98440_JIQUEL_2021_archivage.pdf BibTex
titre
Estimation of the risks of resistance selection against QiI type fungicides in Zymoseptoria tritici
auteur
Guillaume Fouché
article
Environmental Sciences. Université Paris Saclay (COMUE), 2021. English. ⟨NNT : ⟩
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titre
Dissection transcriptomique de la biologie de Leptosphaeria maculans lors de ses interactions avec son hôte (le colza) et avec un membre du complexe d'espèces, Leptosphaeria biglobosa
auteur
Elise Gay
article
Phytopathologie et phytopharmacie. Université Paris-Saclay, 2021. Français. ⟨NNT : 2021UPASB015⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://theses.hal.science/tel-03191632/file/91388_GAY_2021_archivage.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Nucleosome patterns in four plant pathogenic fungi with contrasted genome structures
auteur
Colin Clairet, Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Jessica Soyer, Muriel Viaud, Enric Zehraoui, Berengère Dalmais, Isabelle Fudal, Nadia Ponts
article
2021
Accès au bibtex
BibTex
titre
Annual dynamics of Zymoseptoria tritici populations in wheat cultivar mixtures: a compromise between the efficiency and durability of a recently broken-down resistance gene?
auteur
Carolina Orellana-Torrejon, Tiphaine Vidal, Anne-Lise Boixel, Sandrine Gélisse, Sébastien Saint-Jean, Suffert Frédéric
article
2021
Accès au bibtex
BibTex
titre
Life story of Tunisian durum wheat landraces revealed by their genetic and phenotypic diversity
auteur
Safa Ben Krima, Amine Slim, Sandrine Gélisse, Hajer Kouki, Isabelle Nadaud, Pierre Sourdille, Amor Yahyaoui, Sarrah Ben M’barek, Frédéric Suffert, Thierry C. Marcel
article
2021
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-03303679/file/Ben%20Krima%20et%20al%202020.pdf BibTex
titre
The quasi-universality of nestedness in the structure of quantitative plant-parasite interactions
auteur
Benoît Moury, Jean-Marc Audergon, Sylvie Baudracco-Arnas, Safa Ben Krima, François Bertrand, Nathalie Boissot, Mireille Buisson, Valérie Caffier, Melissa Cantet, Sylvia Chanéac, Carole Constant, François Delmotte, Catherine Dogimont, Juliette Doumayrou, Frédéric Fabre, Sylvain Fournet, Valérie Grimault, Thierry Jaunet, Isabelle Justafré, Véronique Lefebvre, Denis Losdat, Thierry Marcel, Josselin Montarry, Cindy E. Morris, Mariem Omrani, Manon Paineau, Sophie Perrot, Marie-Laure Pilet-Nayel, Youna Ruellan
article
2021
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https://hal.inrae.fr/hal-03169796/file/2021_Moury_bioRxiv.pdf BibTex

2020

Journal articles

titre
Identification of the Sesquiterpene Cyclase Involved in the Biosynthesis of (+)-4-Epi-eremophil-9-en-11-ol Derivatives Isolated from Botrytis cinerea
auteur
Ivonne Suárez, Victoria González-Rodríguez, Muriel Viaud, Carlos Garrido, Isidro Collado
article
ACS Chemical Biology, 2020, 15 (10), pp.2775-2782. ⟨10.1021/acschembio.0c00561⟩
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titre
Impact of a resistance gene against a fungal pathogen on the plant host residue microbiome: The case of the Leptosphaeria maculans–Brassica napus pathosystem
auteur
Lydie Kerdraon, Matthieu Barret, Marie‐hélène Balesdent, Frédéric Suffert, Valérie Laval
article
Molecular Plant Pathology, 2020, 21 (12), pp.1545-1558. ⟨10.1111/mpp.12994⟩
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titre
Savitreea pentosicarens gen. nov., sp. nov., a yeast species in the family Saccharomycetaceae isolated from a grease trap
auteur
Varunya Sakpuntoon, Jirameth Angchuan, Chanita Boonmak, Pannida Khunnamwong, Noémie Jacques, Cécile Grondin, Serge Casaregola, Nantana Srisuk
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2020, 70 (11), pp.5665-5670. ⟨10.1099/ijsem.0.004457⟩
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titre
Evolution and Plasticity of the Transcriptome Under Temperature Fluctuations in the Fungal Plant Pathogen Zymoseptoria tritici
auteur
Arthur J Jallet, Arnaud Le Rouzic, Anne Genissel
article
Frontiers in Microbiology, 2020, 11, 18 p. ⟨10.3389/fmicb.2020.573829⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02983043/file/2020-Jallet-FMIB.pdf BibTex
titre
A Clone Resource of Magnaporthe oryzae Effectors That Share Sequence and Structural Similarities Across Host-Specific Lineages
auteur
Yohann Petit-Houdenot, Thorsten Langner, Adeline Harant, Joe Win, Sophien Kamoun
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, 2020, 33 (8), pp.1032-1035. ⟨10.1094/MPMI-03-20-0052-A⟩
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titre
pH effect on strain-specific transcriptomes of the take-all fungus
auteur
Kévin Gazengel, Lionel Lebreton, Nicolas Lapalu, Joëlle Amselem, Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt, Denis Tagu, Stéphanie Daval
article
PLoS ONE, 2020, 15 (7), pp.e0236429. ⟨10.1371/journal.pone.0236429⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02979591/file/e8c88bf12994ba40f40541db721f6c85.pdf BibTex
titre
Auxin biosynthesis in the phytopathogenic fungus Leptosphaeria maculans is associated with enhanced transcription of indole-3-pyruvate decarboxylase LmIPDC2 and tryptophan aminotransferase LmTAM1
auteur
Hana Leontovyčová, Lucie Trdá, Petre Ivanov Dobrev, Vladimír Šašek, Elise Gay, Marie-Helene Balesdent, Lenka Burketová
article
Research in Microbiology, 2020, 171 (5-6), pp.174-184. ⟨10.1016/j.resmic.2020.05.001⟩
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titre
Laccases 2 & 3 as biomarkers of Botrytis cinerea infection in sweet white wines
auteur
S. Ployon, A. Attina, J. Vialaret, Anne Sophie Walker, Christophe Hirtz, Cédric Saucier
article
Food Chemistry, 2020, 315, pp.126233. ⟨10.1016/j.foodchem.2020.126233⟩
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https://hal.science/hal-02505356/file/S0308814620300819.pdf BibTex
titre
Comparative quantitative proteomics of osmotic signal transduction mutants in Botrytis cinerea explain mutant phenotypes and highlight interaction with cAMP and Ca2+ signalling pathways” [J Proteomics. 2020 Feb 10; 212: 103580]
auteur
Jaafar Kilani, Marlene Davanture, Adeline Simon, Michel Zivy, Sabine Fillinger
article
Journal of Proteomics, 2020, 222, ⟨10.1016/j.jprot.2020.103733⟩
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titre
Inhibition of jasmonate-mediated plant defences by the fungal metabolite higginsianin B
auteur
Jean-Felix Dallery, Marlene Zimmer, Vivek Halder, Mohamed Suliman, Sandrine Pigné, Géraldine Le Goff, Despoina D Gianniou, Ioannis P Trougakos, Jamal Ouazzani, Debora Gasperini, Richard O'Connell
article
Journal of Experimental Botany, 2020, 71 (10), pp.2910-2921. ⟨10.1093/jxb/eraa061⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02722418/file/eraa061-1.pdf BibTex
titre
Infection cushions of Fusarium graminearum are fungal arsenals for wheat infection
auteur
Michael Mentges, Anika Glasenapp, Marike Boenisch, Sascha Malz, Bernard Henrissat, Rasmus J.N. Frandsen, Ulrich Guldener, Martin Münsterkötter, Jörg Bormann, Marc‐henri Lebrun, Wilhelm Schäfer, Ana Lilia Martinez‐rocha
article
Molecular Plant Pathology, 2020, 21 (8), pp.1070-1087. ⟨10.1111/mpp.12960⟩
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titre
Seedling and adult stage resistance to net form of net blotch (NFNB) in spring barley and stability of adult stage resistance to NFNB in Morocco
auteur
Sanjaya Gyawali, Reda Amezrou, Ramesh Pal Singh Verma, Robert Brueggeman, Sajid Rehman, Loubna Belqadi, Mustapha Arbaoui, Prabin Tamang, Murari Singh
article
Journal of Phytopathology, 2020, 168 (5), pp.254-266. ⟨10.1111/jph.12887⟩
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titre
Pathotype diversification in the invasive PstS2 clonal lineage of Puccinia striiformis f. sp. tritici causing yellow rust on durum and bread wheat in Lebanon and Syria in 2010–2011
auteur
Rola El Amil, Sajid S. Ali, Bochra Bahri, Marc Leconte, Claude Vallavieille‐pope, Kumarse Nazari
article
Plant Pathology, 2020, 69 (4), pp.618-630. ⟨10.1111/ppa.13164⟩
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titre
Fungicide sensitivity shifting of Zymoseptoria tritici in the finnish-baltic region and a novel insertion in the MFS1 promoter
auteur
Andres Mäe, Sabine Fillinger, Pille Sooväli, Thies Marten Heick
article
Frontiers in Plant Science, 2020, 11 (385), ⟨10.3389/fpls.2020.00385⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02887988/file/Mae%20Andres_2020.pdf BibTex
titre
Apoplastic effector proteins of plant-associated fungi and oomycetes
auteur
Mercedes Rocafort, Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Carl Mesarich
article
Current Opinion in Plant Biology, 2020, 56, pp.9-19. ⟨10.1016/j.pbi.2020.02.004⟩
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titre
Vers une action collective à l'échelle des paysages
auteur
Mourad Hannachi, Véronique Souchère, Samuel Buèche, Marc Dupayage,, Bastien Boquet,, J-P Pardoux,, Elsa Berthet, Anne Deredec, Alberto Tonda, P Pluquet, J.P. Leroy, Aurélie Albaut,, Jacques Blarel, Jérôme Lecuyer, Claude Gazet, Muriel Leuba, Élodie Gagliardi, Karine Leleu, Philippe Leclercq, Émilien Quilliot, Jérôme Pernel, Marc Declemy, Bruno Chauvel, Anne-Sophie Walker
article
Phytoma la Défense des Végétaux, 2020, 733
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titre
Les "mots" de la résistance
auteur
R4p Network, Benoît Barrès, Marie-France Corio-Costet, Daniele Debieu, Christophe Délye, Sabine Fillinger, Bertrand Gauffre, Mourad Hannachi, Gaëlle Le Goff, Christophe Plantamp, Myriam Siegwart, Anne-Sophie Walker
article
Phytoma la Défense des Végétaux, 2020, 733, pp.12-14
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titre
Prévenir et gérer les résistances aux produits phyto
auteur
. R4p (réseau de Réflexion Et de Recherches Sur Les Résistances Aux Pesticides), Benoît Barrès, Marie-France Corio-Costet, Danièle Debieu, Christophe Délye, Sabine Fillinger, Bertrand Gauffre, Mourad Hannachi, Jacques Grosman, Gaëlle Le Goff, Christophe Plantamp, Myriam Siegwart, Anne-Sophie Walker
article
Phytoma la Défense des Végétaux, 2020, 733, pp.15-19
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titre
Double dose efficiency of the yellow rust resistance gene Yr17 in bread wheat lines
auteur
Olivier Coriton, Joseph Jahier, Marc Leconte, Virginie Huteau, Gwenn Trotoux, Françoise Dedryver, Claude Pope de Vallavieille
article
Plant Breeding, 2020, 139 (2), pp.263-271. ⟨10.1111/pbr.12768⟩
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titre
Comparative quantitative proteomics of osmotic signal transduction mutants in Botrytis cinerea explain mutant phenotypes and highlight interaction with cAMP and Ca2+ signalling pathways
auteur
Jaafar Kilani, Marlène Davanture, Adeline Simon, Michel Zivy, Sabine Fillinger
article
Journal of Proteomics, 2020, 212 (103580), pp.103580. ⟨10.1016/j.jprot.2019.103580⟩
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https://hal.science/hal-02390794/file/Kilani_etal_postprint_vf.pdf BibTex
titre
Low Amplitude Boom-and-Bust Cycles Define the Septoria Nodorum Blotch Interaction
auteur
Huyen Phan, Darcy Jones, Kasia Rybak, Kejal Dodhia, Francisco Lopez-Ruiz, Romain Valade, Lilian Gout, Marc-Henri Lebrun, Patrick Brunner, Richard Oliver, Kar-Chun Tan
article
Frontiers in Plant Science, 2020, 10, 13 p. ⟨10.3389/fpls.2019.01785⟩
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titre
Major changes in grapevine wood microbiota are associated with the onset of esca, a devastating trunk disease
auteur
Emilie Bruez, Jessica Vallance, Angélique Gautier, Valerie Laval, Stéphane Compant, Wolfgang Maurer, Angela Sessitsch, Marc‐henri Lebrun, Patrice Rey
article
Environmental Microbiology, In press, pp.1-18. ⟨10.1111/1462-2920.15180⟩
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titre
First report of the sexual stage of the flax pathogen Mycosphaerella linicola in France and its impact on pasmo epidemiology
auteur
Delphine Paumier, Blandine Bammé, Annette Penaud, Romain Valade, Frédéric Suffert
article
Plant Pathology, In press, 9 p. ⟨10.1111/ppa.13296⟩
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titre
Botrydial confers Botrytis cinerea the ability to antagonize soil and phyllospheric bacteria
auteur
Paulina Vignatti, Maria E. Gonzalez, Edgardo C. Jofre, Hernando J. Bolivar-Anillo, Javier Moraga, Muriel Viaud, Isidro G. Collado, Fernando L. Pieckenstain
article
Fungal Biology, 2020, 124 (1), pp.54 - 64. ⟨10.1016/j.funbio.2019.11.003⟩
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titre
Cultivar mixture effects on disease and yield remain despite diversity in wheat height and earliness
auteur
Tiphaine Vidal, Sébastien Saint-Jean, Pauline Lusley, Marc M. Leconte, Safa Ben Krima, Anne-Lise Boixel, C. de Valavieille-Pope
article
Plant Pathology, 2020, 69 (6), pp.1148-1160. ⟨10.1111/ppa.13200⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02863436/file/Vidal3.pdf BibTex
titre
Identification of valuable sources of resistance to Zymoseptoria tritici in the Tunisian durum wheat landraces
auteur
Maroua Ouaja, Lamia Aouini, Bochra Bahri, Sahbi Ferjaoui, Maher Medini, Thierry Marcel, Sonia Hamza
article
European Journal of Plant Pathology, 2020, 156 (2), pp.647-661. ⟨10.1007/s10658-019-01914-9⟩
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Conference papers

titre
How to find a needle in a haystack: The evolution of virulence in the filamentaous fungus Zymoseptoria tritici against the resistance gene Stb16
auteur
Anne Genissel
article
Meeting REID Fungal Group, INRAE, Nov 2020, Virtual conference, France
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titre
A new family of structurally conserved fungal effectors displays epistatic interactions with plant resistance proteins.
auteur
Noureddine Lazar, Carl H. Mesarich, Yohann Petit-Houdenot, Nacera Talbi, Inès Li de la Sierra-Gallay, Zelie Emilie, Karine Blondeau, Jérôme Gracy, Bénédicte Ollivier, Francoise Blaise, Thierry Rouxel, Marie‐hélène Balesdent, Alexander Idnurm, Herman van Tilbeurgh, Isabelle Fudal
article
Journée du REID champignons, Nov 2020, Virtual conference, France
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titre
Influence of the genomic location of Leptosphaeria maculans effector genes on their evolution and the control of their expression
auteur
Isabelle Fudal
article
RIP 2020 meeting, Oct 2020, virtual meeting, Switzerland
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titre
Amplicon-deep sequencing using Oxford-Nanopore® technology to quantify multi-drug-resistant strains in Zymoseptoria tritici populations
auteur
T.M. Heick, Nicolas Lapalus, Sabine Fillinger
article
ECFG15 - 15th European conference on fuangal genetics, ECFG15, Feb 2020, Rome, Italy. pp.374-375
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titre
Cloning of AvrStb9, a gene of Zymoseptoria tritici conferring avirulence on wheat cultivars carrying the Stb9 resistance gene
auteur
Thierry Marcel, Colette Audéon, Jérôme Compain, Gélisse Sandrine, Aurélie Ducasse, Sophie Bouchet, Cyrille Saintenac, Nicolas Lapalu, Daniel Croll, Joëlle Amselem, Sabine Fillinger
article
ECFG15 - 15th European conference on fungal genetics, ECFG15, Feb 2020, Rome, Italy. pp.340-341
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titre
Investigating the role of a fungal oxidase-peroxidase tandem in plant pathogenicity
auteur
Bastien Bissaro, Sayo Kodama, Mireille Haon, David Ribeaucourt, Mickael Lafond, Harry Brumer, Richard O'Connell, Yasuyuki Kubo, Jean-Guy Berrin
article
European Congress on Fungal Genetics (ECFG15), Feb 2020, Rome, Italy
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https://hal.inrae.fr/hal-03099694/file/abstract%20AA5_2_ECFG_final.pdf BibTex
titre
La fusariose des épis des céréales à paille : synthèse de 10 années de recherche pour une meilleure gestion intégrée de la maladie.
auteur
Romain Valade, Béatrice Orlando, Claude Maumené, Valerie Laval, Anne-Sophie Walker, Renaud Ioos, Anne-Laure Boutigny, Valerie Cadot, Marie Foulongne-Oriol, Florence Forget, Vessela Atanasova-Penichon, Cyrille Saintenac, Ludovic Bonhomme, Thierry Langin, Frédéric Serre, Delphine Taillieu, Pierre P. Roumet
article
Phloème 2020 : biennales de l’innovation céréalière, Arvalis - Institut du Végétal, Jan 2020, Paris, France
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BibTex
titre
La fusariose des épis des céréales à paille : synthèse de 10 années de recherche pour une meilleure gestion intégrée de la maladie
auteur
Romain Valade, B. Orlando, Valérie Laval, Anne-Sophie Laval, R. Ioos, Al. Boutigny, V. Cadot, M. Foulogne-Oriol, F. Forget, V. Atanasova-Penichon, C. Saintenac, L. Bonhomme, T. Langin, F. Serre, D. Taillieu, P. Roumet, E. Gourdain
article
Phloème 2020 - Biennale de l'innovtion céréalières, Phloème, Jan 2020, Paris, France
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BibTex
titre
Fungal secondary metabolites as effectors for plant manipulation
auteur
Richard O'Connell
article
INRAE UMR 1163 - BBF, Jan 2020, Luminy, France
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BibTex
titre
Impact d’associations variétales de blé sur le développement de la septoriose et la dynamique de contournement d’un gène de résistance majeur
auteur
Carolina Orellana-Torrejon, Anne-Lise Boixel, Tiphaine Vidal, Sébastien Saint-Jean, Frédéric Suffert
article
Pholème 2020, 2020, Paris, France
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Habilitation à diriger des recherches

titre
Understanding the adaptation of phytopathogenic fungi to improve their management in the context of agroecology
auteur
Anne-Sophie Walker
article
Environmental Sciences. INRAE, 2020
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https://hal.inrae.fr/tel-04269606/file/HDR_Attestation%20de%20r%C3%A9ussite_Anne-Sophie%20WALKER_23-10-20.pdf BibTex

Poster communications

titre
Could small interfering RNA be involved in host specialization in the grey mould fungus Botrytis cinerea?
auteur
Adeline Simon, Alex Mercier, Guillaume Morgant, Pierre Gladieux, Anne-Sophie Walker, Benoit Poinssot, Muriel Viaud
article
ECFG15 European conference on fungal genetics, Feb 2020, Rome, Italy. p.310
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BibTex
titre
Avirulence proteins of Leptosphaeria maculans involved in suppressive interactions share a common structural pattern and are part of a larger family
auteur
Noureddine Lazar, Carl H. Mesarich, Yohann Petit-Houdenot, Nacera Talbi, Inès Li de la Sierra-Gallay, Zelie Emilie, Karine Blondeau, Bénédicte Ollivier, A. van De Wouw, Angélique Gautier, Balesdent Marie-Hélène, Alexander Idnurm, Herman van Tilbeurgh, Isabelle Fudal
article
European Conference of Fungal Genetics, Feb 2020, Rome, France
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https://hal.science/hal-04456400/file/2020%20ECFG%20Fudal.pdf BibTex
titre
Dynamiques spatio-temporelles de la résistance et facteurs de sélection chez le champignon pathogène Zymoseptoria tritici en France
auteur
Maxime Garnault, Clémentine Duplaix, Florence Carpentier, O. David
article
Phloème - Biennale de l'innovation céréalières, Jan 2020, Paris, France
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Reports

titre
Stratégie de lutte vis-à-vis de Xylella fastidiosa - Phase 2
auteur
Eric Verdin, Anne Sicard, Laurent Gentzbittel, Bruno Legendre, Frédéric Suffert, Gaël Thébaud, Xavier Tassus
article
[0] Saisine n° 2018-SA-0248, Anses. 2020, 58 p
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https://hal.science/hal-03321004/file/SANTVEG2018SA0248Ra-1.pdf BibTex
titre
A Taxonomy of Cyber-attacks on Computer Networks
auteur
Ali Sajid
article
[Research Report] university of bradford. 2020
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https://hal.science/hal-02561057/file/final%20-%20Cyber%20Security%20Report%20Finished%20%281%29.pdf BibTex
titre
Demande d’avis relatif à la stratégie de lutte vis-à-vis de Xylella fastidiosa Phase 2
auteur
Eric Verdin, Anne Sicard, Laurent Gentzbittel, Bruno Legendre, Frédéric Suffert, Gaël Thébaud
article
[0] Saisine n° 2018-SA-0248, Anses. 2020, 48 p
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https://hal.science/hal-02906127/file/2020_Verdin-Anses-Xylella.pdf BibTex
titre
Saisine relative à une demande d’avis sur la période de latence de Xylella fastidiosa sur le genre Citrus
auteur
Péninna Deberdt, Philippe Legrand, Charles Manceau, Xavier Nesme, Valérie Olivier, Thomas Le Bourgeois, Marie-Hélène Balesdent, Françoise Binet, Antonio Biondi, Philippe Castagnone-Sereno, Nicolas Desneux, Marie-Laure Desprez Loustau, Abraham Escobar Gutiérrez, Laurent Gentzbittel, Hervé Jactel, David Makowski, Arnaud Monty, Maria Navajas, Marie-Hélène Robin, Stéphan Steyer, François Verheggen, Thierry Wetzel, Emmanuel Gachet, Christine Tayeh
article
[0] Saisine n°2019-SA-0050, Anses. 2020, 62 p
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Theses

titre
Adaptation of phytopathogenic fungi to genetically heterogeneous host populations – case study of the durum wheat – Zymoseptoria tritici pathosystem
auteur
Safa Ben'Krima
article
Life Sciences [q-bio]. Université Paris-Saclay, 2020. English. ⟨NNT : ⟩
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titre
Gestion de la maladie de dépérissement du pommier : criblage in vitro et in planta des activités protectrices d’une collection de microorganismes contre les Pythiacées et caractérisation chimique du principal actif produit par l’isolat A. westerdijkiae A7
auteur
Yosra Ben M'Henni
article
Biologie végétale. Université Paris-Saclay, 2020. Français. ⟨NNT : 2020UPASS127⟩
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https://theses.hal.science/tel-02936517/file/69633_BEN_MHENNI_2020_archivage.pdf BibTex
titre
Environmental heterogeneity, a driver of adaptation to temperature in foliar plant pathogen populations?
auteur
Anne-Lise Boixel
article
Bioclimatologie. Université Paris-Saclay, 2020. Français. ⟨NNT : 2020UPASA010⟩
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https://pastel.hal.science/tel-03202132/file/71481_BOIXEL_2020_archivage.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Gene flow between divergent cereal‐ and grass-specific lineages of the rice blast fungus Magnaporthe oryzae
auteur
Pierre P. Gladieux, Bradford Condon, Sebastien Ravel, Darren Soanes, Joao Leodato Nunes Maciel, Antonio Nhani, Li Chen, Ryohei Terauchi, Marc-Henri Lebrun, Didier Tharreau, Thomas Mitchell, Kerry Pedley, Barbara Valent, Nicholas Talbot, Mark Farman, Elisabeth Fournier
article
2020
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BibTex
titre
Impact of a resistance gene against a fungal pathogen on the plant host residue microbiome: the case of the Leptosphaeria maculans-Brassica napus pathosystem
auteur
Lydie Kerdraon, Matthieu Barret, Marie-Hélène Balesdent, Frédéric Suffert, Valerie Laval
article
2020
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https://hal.inrae.fr/hal-02790936/file/2020_Kerdraon_bioRxiv_1.pdf BibTex

2019

Journal articles

titre
A two genes – for – one gene interaction between Leptosphaeria maculans and Brassica napus
auteur
Yohann Petit-Houdenot, Alexandre A. Degrave, Michel Meyer, Françoise Blaise, Bénédicte Ollivier, Claire-Line Marais, Alain A. Jauneau, Corinne Audran, Susana Rivas, Claire Veneault-Fourrey, Hortense Brun, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal, Marie‐hélène Balesdent
article
New Phytologist, 2019, 223 (1), pp.397-411. ⟨10.1111/nph.15762⟩
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BibTex
titre
H3K4 trimethylation by CclA regulates pathogenicity and the production of three families of terpenoid secondary metabolites in Colletotrichum higginsianum
auteur
Jean‐félix Dallery, Emilie Adelin, Géraldine Le Goff, Sandrine Pigné, Annie Auger, Jamal Ouazzani, Richard O'Connell
article
Molecular Plant Pathology, 2019, 20 (6), pp.831-842. ⟨10.1111/mpp.12795⟩
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BibTex
titre
Spatiotemporal dynamics of fungicide resistance in the wheat pathogen Zymoseptoria tritici in France
auteur
Maxime Garnault, Clémentine Duplaix, Pierre Leroux, Gilles Couleaud, Florence Carpentier, Olivier David, Anne‐sophie Walker
article
Pest Management Science, 2019, 75 (7), pp.1794-1807. ⟨10.1002/ps.5360⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04102002/file/Garnault%20et%20al%2C%202019%20archive.pdf BibTex
titre
Déjouer les résistances
auteur
Anne-Sophie Walker, Maxime Garnault
article
Perspectives Agricoles, 2019, 464, pp.*
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BibTex
titre
Microbiomes and Pathogen Survival in Crop Residues, an Ecotone Between Plant and Soil
auteur
Lydie Kerdraon, Valerie Laval, Frédéric Suffert
article
Phytobiomes Journal, 2019, 3 (4), pp.246-255. ⟨10.1094/PBIOMES-02-19-0010-RVW⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03131615/file/1903.02246.pdf BibTex
titre
Bioinformatics matters: The accuracy of plant and soil fungal community data is highly dependent on the metabarcoding pipeline
auteur
Charlie Pauvert, Marc Buée, Valerie Laval, Véronique Edel-Hermann, Laure Fauchery, Angelique Gautier, Isabelle Lesur, Jessica Vallance, Corinne Vacher
article
Fungal Ecology, 2019, 41, pp.23 - 33. ⟨10.1016/j.funeco.2019.03.005⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02627344/file/S1754504818302800.pdf BibTex
titre
The polyphagous plant pathogenic fungus Botrytis cinerea encompasses host-specialized and generalist populations
auteur
Alex Mercier, Florence Carpentier, Clémentine Duplaix, Annie Auger, Jean-Marc Pradier, Muriel Viaud, Pierre Gladieux, Anne-Sophie Walker
article
Environmental Microbiology, 2019, 21 (12), pp.4808-4821. ⟨10.1111/1462-2920.14829⟩
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BibTex
titre
Destabilization of chromosome structure by histone H3 lysine 27 methylation
auteur
Mareike Moeller, Klaas Schotanus, Jessica Soyer, Janine Haueisen, Kathrin Happ, Maja Stralucke, Petra Happel, Kristina M. Smith, Lanelle R. Connolly, Michael Freitag, Eva H. Stukenbrock
article
PLoS Genetics, 2019, 15 (4), ⟨10.1371/journal.pgen.1008093⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02617678/file/2019_Moeller_Plos%20Genetic.pdf_1.pdf BibTex
titre
Overall stability in the genetic structure of a Zymoseptoria tritici population from epidemic to interepidemic stages at a small spatial scale
auteur
David Morais, Clémentine Duplaix, I. Sache, Valerie Laval, Frederic Suffert, Anne-Sophie Walker
article
European Journal of Plant Pathology, 2019, 154 (2), pp.423 - 436. ⟨10.1007/s10658-018-01666-y⟩
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titre
Phenotyping Thermal Responses of Yeasts and Yeast-like Microorganisms at the Individual and Population Levels: Proof-of-Concept, Development and Application of an Experimental Framework to a Plant Pathogen
auteur
Anne-Lise Boixel, Ghislain Delestre, Jean Legeay, Michaël Chelle, Frederic Suffert
article
Microbial ecology, 2019, 78 (1), pp.42-56. ⟨10.1007/s00248-018-1253-6⟩
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https://hal.science/hal-02159596/file/2019%20-%20Boixel-post-print-Microbial%20Ecology.pdf BibTex
titre
Diversity of genes for resistance to stripe rust in wheat elite lines, commercial varieties and landraces from Lebanon and Syria
auteur
Rola El Amil, Claude Pope de Vallavieille, Marc Leconte, Kumarse Nazari
article
Phytopathologia Mediterranea, 2019, 58 (3), pp.607 - 627. ⟨10.13128/Phyto-10982⟩
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titre
Pyricularia graminis-tritici is not the correct species name for the wheat blast fungus: response to Ceresini et al. (MPP 20:2)
auteur
Barbara Valent, Mark Farman, Yukio Tosa, Dominik Begerow, Elisabeth Fournier, Pierre Gladieux, M. Tofazzal Islam, Sophien Kamoun, Martin Kemler, Linda M. Kohn, Marc-Henri Lebrun, Jason E. Stajich, Nicholas J. Talbot, Ryohei Terauchi, Didier Tharreau, Ning Zhang
article
Molecular Plant Pathology, 2019, 20 (2), pp.173-179. ⟨10.1111/mpp.12778⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02622189/file/Publis19-bgpi-002_valent_pyricularia_1.pdf BibTex
titre
Large biodiversity of yeasts in French Guiana and the description of Suhomyces coccinellae f.a. sp. nov. and Suhomyces faveliae f.a. sp. nov.
auteur
Noémie Vignolles, Serge Casaregola
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2019, 69 (6), pp.1634 - 1649. ⟨10.1099/ijsem.0.003369⟩
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titre
Differential dynamics of microbial community networks help identify microorganisms interacting with residue-borne pathogens: the case of Zymoseptoria tritici in wheat;
auteur
Lydie Kerdraon, Matthieu Barret, Valerie Laval, Frédéric Suffert
article
Microbiome, 2019, 7 (1), pp.125 et suiv. ⟨10.1101/587667⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02624822/file/2019_Kerdraon_Microbiome_1.pdf BibTex
titre
Nonproteinaceous effectors: the terra incognita of plant-fungal interactions.
auteur
Jérôme Collemare, Richard O'Connell, Marc-Henri Lebrun
article
New Phytologist, 2019, 223 (2), pp.590-596. ⟨10.1111/nph.15785⟩
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titre
First report of Alternaria leaf spot caused by Alternaria alternata (Fries.) Kiessler on Sonchus oleraceus L. and Convolvulus arvensis L. in Algeria
auteur
Nesma Abdessemed, Ali Kerroum, Youssef Anis Bahet, Nacera Talbi, Nadjia Zermane
article
Journal of Phytopathology, 2019, 167 (6), pp.321 - 325. ⟨10.1111/jph.12800⟩
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titre
Multilocus Genotypes of the Wheat Leaf Rust Fungus Puccinia triticina in Worldwide Regions Indicate Past and Current Long-Distance Migration
auteur
J. A. Kolmer, M. E. Ordonez, S. German, A. Morgounov, Z. Pretorius, B. Visser, Henriette Goyeau, Y. Anikster, M. Acevedo
article
Phytopathology, 2019, 109 (8), pp.1453 - 1463. ⟨10.1094/PHYTO-10-18-0411-R⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02627408/file/2019%20-%20Kolmer%20JA%20-%20Phytopathology_1.pdf BibTex
titre
Botcinic acid biosynthesis in Botrytis cinerea relies on a subtelomeric gene cluster surrounded by relics of transposons and is regulated by the Zn(2)Cys(6) transcription factor BcBoa13
auteur
Antoine Porquier, Javier Moraga, Guillaume Morgant, Berengere Dalmais, Adeline Simon, Hind Sghyer, Isidro G. Collado, Muriel Viaud
article
Current Genetics, 2019, 65 (4), pp.965 - 980. ⟨10.1007/s00294-019-00952-4⟩
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titre
Sexual Reproduction in the Fungal Foliar Pathogen Zymoseptoria tritici Is Driven by Antagonistic Density Dependence Mechanisms
auteur
Frederic Suffert, Ghislain Delestre, Sandrine Gélisse
article
Microbial ecology, 2019, 77 (1), pp.110 - 123. ⟨10.1007/s00248-018-1211-3⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02618787/file/290072.full.pdf BibTex
titre
Crop Residues in Wheat-Oilseed Rape Rotation System: a Pivotal, Shifting Platform for Microbial Meetings
auteur
Lydie Kerdraon, Marie-Helene Balesdent, Matthieu Barret, Valerie Laval, Frederic Suffert
article
Microbial ecology, 2019, 77 (4), pp.931 - 945. ⟨10.1007/s00248-019-01340-8⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02620072/file/456178.full.pdf BibTex
titre
A Similar Secretome Disturbance as a Hallmark of Non-pathogenic Botrytis cinerea ATMT-Mutants?
auteur
Amélie de Vallée, Pascal Bally, Christophe Bruel, Lucie Chandat, Mathias Choquer, Cindy Dieryckx, Jean William Dupuy, Sophie Kaiser, Marie-Pascale Latorse, Elise Loisel, Géraldine Mey, Guillaume Morgant, Christine Rascle, Julia Schumacher, Adeline Simon, Eytham Souibgui, Muriel Viaud, François Villalba, Nathalie Poussereau
article
Frontiers in Microbiology, 2019, 10, pp.2829. ⟨10.3389/fmicb.2019.02829⟩
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https://hal.science/hal-02401466/file/fmicb-10-02829.pdf BibTex
titre
Metabarcoding targeting the EF1 alpha region to assess Fusarium diversity on cereals
auteur
Anne-Laure Boutigny, Angelique Gautier, Ryan Basler, Florian Dauthieux, Stephen Leite, Romain Valade, Jaime Aguayo, Renaud Ioos, Valerie Laval
article
PLoS ONE, 2019, 14 (1), ⟨10.1371/journal.pone.0207988⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02625914/file/plos%20one%20V.Laval%202019_1.pdf BibTex
titre
Populations de phoma du colza : état des lieux des résistances
auteur
Marie-Helene Balesdent, Laurent Coudard, Mickaël Pourcelot, Martine Leflon, Régine Delourme, Sébastien Faure, Thierry Rouxel
article
Phytoma , 2019, 724, pp.30-34
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titre
Population structure of the faba bean blight pathogen Ascochyta fabae (teleomorph, Didymella fabae) in Tunisia
auteur
Noura Omri Ben Youssef, Lydie Kerdraon, Lucie Mieuzet, Imen Halila, Noura Jammezi, Ahlem Mbazia, Mohamed Kharrat, Christophe Le May
article
Phytopathologia Mediterranea, 2019, 58 (1), pp.81 - 94. ⟨10.13128/Phytopathol_Mediterr-23562⟩
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titre
Broad‐specificity GH131 β‐glucanases are a hallmark of Fungi and Oomycetes that colonise plants
auteur
Georgios Anasontzis, Marc-Henri Lebrun, Mireille Haon, Charlotte Champion, Annegret Kohler, Nicolas Lenfant, Francis Martin, Richard O'Connell, Robert Riley, Igor V. Grigoriev, Bernard Henrissat, Jean-Guy Berrin, Marie-Noelle Rosso
article
Environmental Microbiology, 2019, ⟨10.1111/1462-2920.14596⟩
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https://hal.science/hal-02111203/file/Anasontzis_et_al-Environmental%20Microbiology-2019_1.pdf BibTex
titre
Deleting a Chromatin Remodeling Gene Increases the Diversity of Secondary Metabolites Produced by Colletotrichum higginsianum
auteur
Jean-Felix Dallery, Géraldine Le Goff, Emilie Adelin, Bogdan Iorga, Sandrine Pigné, Richard O'Connell, Jamal Ouazzani
article
Journal of Natural Products, 2019, 82 (4), pp.813-822. ⟨10.1021/acs.jnatprod.8b00796⟩
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Conference papers

titre
La problématique gestion des résistances aux herbicides (et fongicides) : entre tragédie des communs et tragédie des anti-communs
auteur
Mourad Hannachi, Véronique Souchère, Anne Deredec, Ruth Antoine, Tong Han, Emma Taddei, Elsa Berthet, Alberto Tonta, Christophe Délye, Anne-Sophie Walker
article
24. conference du COLUMA - journées internationales sur la lutte contre les mauvaises herbes, Dec 2019, Orléans, France. 10p
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titre
Fungal secondary metabolites as effectors for plant manipulation’
auteur
Richard O'Connell
article
Bayer Crop Science, Bayer Crop Science, Nov 2019, Lyon, France
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titre
Each fungus has its own repertoire of secondary metabolites : Wheat are their role in the lifestyle of the grey mould fungus Botrytis cinerea?
auteur
Muriel Viaud
article
NARO, Oct 2019, Tsubaka, Japan
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titre
Fungal secondary metabolites as effectors for plant manipulation
auteur
Richard O'Connell
article
Whetzel-Westcott-Dimock Lecture, School of integrative Plant Science, Cornell University, Oct 2019, Ithaca, United States
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titre
Unlocking biosynthetic gene clusters : towards discovering the activities and plant targets of fungal secondary metabolites
auteur
Jean-Félix Dallery
article
1st Fungal genetics in Ile-de-France Symposium, Oct 2019, Paris Auditorium du Grand Palais, France
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titre
Genome-wide histone map of the blackleg fungus Leptosphaeria maculans
auteur
Jessica Soyer, Colin Clairet, Elise Gay, Francoise Blaise, Eva H. Stukenbrock, Isabelle Fudal
article
Symposium of the REACTION Network, Oct 2019, Lyon, France
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titre
Two avirulence genes of Leptosphaeria maculans, displaying suppressive interactions, share a common structural pattern and are part of a larger effector family
auteur
Noureddine Lazar, Yohann Petit-Houdenot, Nacera Talbi, Inès Li de la Sierra-Gallay, Zelie Emilie, Karine Blondeau, Angela van de Wouw, Bénédicte Ollivier, Carl H. Mesarich, Alexander Idnurm, Herman van Tilbeurgh, Isabelle Fudal
article
Effectome meeting, Oct 2019, Lauret, France
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https://hal.science/hal-04456391/file/Fudal%20Effectome.pdf BibTex
titre
Towards discovering the activities and plant targets of fungal secondary metabolites
auteur
Jean-Félix Dallery
article
European Fungal Secondary Metabolites Symposium, Sep 2019, Hannover, Germany
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titre
An interdisciplinary approach to increase wheat within-field diversity and promote agro-ecosystem services
auteur
Jérôme Enjalbert, Vincent Allard, Christophe Ambroise, Bruno Andrieu, S. Barot, Laure Bentze, E. Blanc, J. Borg, A Cantarel, François Coléno, Claude Pope de Vallavieille, Dominique Descoureaux, Damien Dezette, Florence Dubs, M. Feret, Emma Forst, Aline Fugeray-Scarbel, Nathalie Galic, Arnaud Gauffreteau, J.D. Gilet, Isabelle Goldringer, C. Goussault, Mourad Hannachi, Philippe Hinsinger, G Houivet, Mylène Hugoni, Marie-Hélène Jeuffroy, Christian Kerbiriou, Pierre Labarthe, J.C. Lata, Xavier Leroux, Christophe Lecarpentier, Marc Leconte, Laurent Lejars, B. Lemain, Stéphane Lemarié, F. Leny, I. Le Viol, Pauline Lusley, Tristan Mary-Huard, Emilie Mirlicourtois, Christophe Montagnier, Audrey Niboyet, B. Omon, Rémi Perronne, S. Piaud, Sophie Pin, C. Cervek, S. Jouanne, Sébastien Piaud, F. Poly, Thomas Pommier, Emmanuelle Porcher, Sébastien Saint-Jean, S. Salmon, Didier Tropée, Alan Vergnes, Gaëlle van Frank, T. Vidal
article
European Conference on Crop Diversification, Sep 2019, Budapest, Hungary
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titre
Non-target-site resistance mechanisms againts agricultural fungicides, the tip of the iceberg?
auteur
Sabine Fillinger
article
Resistance 2019, Rothamsted Research, Sep 2019, Harpenden, United Kingdom
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titre
Assesing the risk of resistance towards SDHIs in France
auteur
Anne-Sophie Walker
article
Plant health 2019, American society of phytopathology, American society of phytopathology, Aug 2019, Cleveland, United States
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BibTex
titre
Assessing the risk of resistance towards SDHI fungicides in France
auteur
Anne-Sophie Walker, Gwilherm Gazeau, Gilles Couleaud
article
American-Phytopathological-Society (APS) Plant Health Annual Meeting, Aug 2019, Cleveland, United States. pp.1
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BibTex
titre
Colletotrichum metabolite higginsianin B suppresses plant jasmonate signalling by blocking proteasome-mediated degradation of JAZ proteins
auteur
Richard O'Connell, Jean-Félix Dallery, Jamal Ouazzani Chahdi, Debora Gasperini, Vivek Halder, Mohamed Suliman, Ioannis Trougakos
article
18. Congress IS-MPMI 2019, Jul 2019, Glasgow, United Kingdom
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titre
Effect of water and heat stresses on the physiology of Ugni blanc infected by Neofusicoccum parvum
auteur
Aurélie Songy, Philippe Larignon, Christelle Guillier, Jean-Francois Guise, Olivier Yobrégat, Catia Pinto, Vincenzo Mondello, Cindy Coppin, Guillaume Robert, Isabelle Lebrun, Philippe Schmitt-Koplin, Christophe Clément, Marielle Adrian, Florence Fontaine
article
11. International workshop on grapevine trunk diseases (IWGTD), University of British Columbia (UBC). CAN., Jul 2019, Penticton, Canada
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titre
Repertoire of secondary metabolites from a plant pathogenic fungus
auteur
Muriel Viaud
article
Specialized metabolites: from analysis to engineering, Jul 2019, Gif sur Yvette, France
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titre
Genome-wide histone map of the blackleg fungus Leptosphaeria maculans
auteur
Jessica Soyer, Colin Clairet, Elise Gay, Francoise Blaise, Eva H. Stukenbrock, Isabelle Fudal
article
15th International Rapeseed Congress, Jun 2019, Berlin, Germany
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titre
Mechanism of multidrug resistance and risk assessment towards fungicides in Zymoseptoria tritici
auteur
Anne-Sophie Walker, Gwilherm Gazeau
article
International symposium on cereal leaf blights, ISCLB19, May 2019, Dublin, Ireland
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titre
unterstanding the impact of alternation on resistance evolution by the main of experimental evolution the case of Zymoseptoria tritici the causal gent of septoria leaf blotch
auteur
Agathe Ballu, Anne-Sophie Walker, Florence Carpentier, S. Torriani, A Deredec
article
International symposium on cereal leaf blights, ISCLB19, May 2019, Dublin, Ireland
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BibTex
titre
Assessing the risk of resistance selection towards Qil fungicides in Zymoseptoria tritici
auteur
Guillaume Fouche, Anne-Sophie Walker, Sabine, Helma S. H. Fillinger-David, Brigitte Meunier, David Young
article
International symposium on cereal leaf blights, May 2019, Dublin, Ireland. p.65
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titre
Hectic Life on Wheat Leaves: Dynamics of Phenotypic Selection within Zymoseptoria tritici Populations Facing Microclimatic Heterogeneities
auteur
Anne-Lise Boixel, Michaël Chelle, Frédéric Suffert
article
International Symposium on Cereal Leaf Blights, May 2019, Dublin, Ireland
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titre
Cloning of AvrStb9, a gene of Zymoseptoria tritici conferring avirulence on wheat cultivars carrying the Stb9 resistance gene
auteur
Thierry Marcel, Colette Audeon, Compain Jérôme, Sandrine Gélisse, Aurélie Ducasse, Sophie Bouchet, Cyrille Saintenac, Nicolas Lapalus, Daniel Croll, Joëlle Amselem, Sabine Fillinger
article
International Symposium on Cereal Leaf Blights (ISCLB) 2019, ISCLB, May 2019, Dublin, Germany. p.31
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titre
Recombinase Polymerase Amplification combines with Lateral Flow Strip for detection of Biothreats agents
auteur
Sylvie Ruat, Hélène Batina, Audrey Rouaix, Hervé Volland, Fabienne Gas
article
CBRN-E, May 2019, NANTES, France
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titre
Understanding the impact of alternation on resistance evolution by the mean of experimental evolution : the case of Zymoseptoria tritici, the causal agent of septoria leaf blotch
auteur
Agathe Ballu, Florence Carpentier, F. Torriani, Anne-Sophie Walker
article
19th International Reinhardsbrunn symposium. Modern fungicides and antifungal compounds IX, DPG Spectrum phytomedizin, Apr 2019, Friedrichroda, Germany
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titre
Mechanism of multidrug resistance and risk assessment towards fungicides in Zymoseptoria tritici
auteur
Anne-Sophie Walker, G. Gazeau
article
19th International Reinhardsbrunn symposium. Modern fungicides and antifungal compounds, DPG Spectrum phytomedizin, Apr 2019, Friedrichroda, Germany
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titre
Proposal for a simple and unified classification of pesticides
auteur
B. Barrès, M.F. Corio-Costet, D Debieu, C Délye, S Fillinger, J. Grosman, A. Micoud, M. Siegwart, A.S. Walker
article
Proceedings of the 19th international Reinhardsbrunn symposium, DPG Spectrum phytomedizin, Apr 2019, Friedrichroda, Germany
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titre
Assessing the risk of resistance selection towards quinone inside inhibitor dungicides (QiLs) in Zymoseptoria tritici
auteur
G. Fouché, Danielle Debieu, D. Young, B. Meunier, Anne-Sophie Walker, Sabine Fillinger
article
19th International Reinhardsbrunn symposium. Modern fungicides and antifungal compounds IX, DPG Spectrum phytomedizin, Apr 2019, Friedrichroda, Germany
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titre
Secondary metabolites of fungal pathogens as effectors of plant manipulation
auteur
Richard O'Connell
article
Paris-Saclay Microbes Day, University Paris-Saclay, Mar 2019, Gif sur yvette, France
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titre
[WEAB] Sélection Assistée par les Effecteurs fongiques de Résistances aux champignons pathogènes chez le blé
auteur
Marc Henri Lebrun, Elsa Ballini, Guylaine Besnier- Hebert, Ludovic L. Bonhomme, Ruth Bryant, Florence Cambon, James Cockram, Jean-Michel Delhaye, Aurélie Ducasse, Rowena Downie, Laure Duchalais, Sylvie Dutriez, Benoit Foucault, Pascal Giraudeau, Lilian Gout, Bruno Grezezs-Besse, Delphine Hourcade, Gert Kema, Thomas Kroj, Stephane Lafarge, Thierry T. Langin, Valerie Laurent, J.B. Morel, Richard Olivier, Jan Panek, Cyrille C. Saintenac, Charles Snijders, Kar-Chun Tan, Romain Valade
article
7. Rencontre scientifiques du FSOV, FSOV, Mar 2019, Paris, France. 104 p
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titre
Multi drug resistance in the wheat pathogen Zymoseptoria tritici - a question of repeated elements?
auteur
S Omrane, Colette Audéon, C. Ignace, Clémentine Duplaix, L. Aouini, G. Kema, Anne-Sophie Walker, Sabine Fillinger
article
30th Fungal Genetics Conference, Fungal Genetics Conference, Mar 2019, Asilomar, United States
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titre
Research monitoring and resistance management in France
auteur
Anne-Sophie Walker
article
Annual meeting of the Phytopathological society of Japan, Phytopathological society of Japan, Mar 2019, Tokio, Japan
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titre
Functional analysis of AvrLm10a and AvrLm10b two neighbor effector genes from L. maculans displaying a "two genes for one gene" interaction with the resistance gene Rlm10 from Brassica nigra.
auteur
Yohann Petit, Michel Meyer, Francoise Blaise, Benedicte Ollivier, Claire-Line Marais, Alain Jauneau, Corinne Audran, Susana Rivas, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent, Isabelle Fudal
article
30th fungal genetics conference, Mar 2019, Asilomar, United States
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titre
Colletotrichum metabolite higginsianin B suppresses plant jasmonate signaling by blocking proteasome-mediated degradation of JAZ proteins
auteur
J. F. Dallery, V. Halder, G. Le Goff, D. D. Gianniou, I. P. Trougakos, J. Ouazzani, D. Gasperini, Richard O'Connell
article
18th Congress of, 2019, ST PAUL, France. pp.2
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Other publications

titre
Comparative proteomics of osmotic signal transduction mutants in Botrytis cinerea explain loss of pathogenicity phenotypes and highlight interaction with cAMP and Ca2+ signalling pathways
auteur
Jaafar Kilani, Marlène Davanture, Michel Zivy, Sabine, Helma S. H. Fillinger-David
article
2019, ⟨10.15454/1.5506737620833718E12⟩
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Poster communications

titre
Seasonal shifts and spatial variability of thermal adaptation in populations of Zymoseptoria tritici sampled over the Euro-Mediterranean region
auteur
Anne-Lise Boixel, Michaël Chelle, Frédéric Suffert
article
International Symposium on Cereal Leaf Blights, May 2019, Dublin, Ireland. 2019
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titre
Population structure and host specialization in Botrytis cinerea
auteur
Alex Mercier, Marguerite Cuel, Jean-Marc Pradier, Adeline Simon, Muriel Viaud, Anne-Sophie Walker, Pierre Gladieux
article
30. Fungal Genetics Conference, Mar 2019, Asilomar, United States. , 2019
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titre
Investigating the involvement of the chromatin state in the control of gene expression in Leptospharia maculans
auteur
Colin Clairet, Jessica L. Soyer, Elise Gay, Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Francoise Blaise, Eva H Stukenbrock, Isabelle Fudal
article
Fungal Genetics Conference, Mar 2019, Asiomar, United States
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https://hal.science/hal-04456403/file/Poster%20Asilomar%20Colin.pdf BibTex
titre
Adaptive evolution at a pathogen effector-host target binding interface is associated with host specificity.
auteur
A. R. Bentham, Yohann Petit, S. Kamoun, M. J. Banfield, T. Langner
article
18th Congress of, 2019, ST PAUL, France. AMER PHYTOPATHOLOGICAL SOC, Molecular Plant-Microbe Interactions, 32 (10), pp.1, 2019, Host-Microbe Co-evolution
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titre
Combined approaches to identify the incidence of Zymoseptoria tritici on microbial community in the wheat residues ecosystem.
auteur
Lydie Kerdraon, Marie-Helene Balesdent, Matthieu Barret, Frederic Suffert, Valerie Laval
article
18th Congress of, 2019, ST PAUL, United States. AMER PHYTOPATHOLOGICAL SOC, Molecular Plant-Microbe Interactions, 32 (10), pp.2, 2019, Microbiome and Phytobiome
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BibTex
titre
Searching for resistance genes against Leptosphaeria maculans late effectors, involved in systemic colonization of Brassica napus.
auteur
Audren Jiquel, Julie Gervais, Isabelle Fudal, Anais Pitarch, S. Fauré, Marie-Helene Balesdent, Thierry Rouxel
article
18th Congress of, 2019, ST PAUL, United States. AMER PHYTOPATHOLOGICAL SOC, Molecular Plant-Microbe Interactions, 32 (10), pp.1, 2019, POSTERS: Molecular recognition in Plant Immunity - Even
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Reports

titre
Maladie du huanglongbing
auteur
Pierre Silvie, Gilles Cellier, Laurent Gentzbittel, Pierre Martin, Maria Milagros - Lopez, Philippe Ryckewaert, Nicolas Sauvion, Philippe Reignault, Marie-Hélène Balesdent, Philippe Castagnone-Sereno, Bruno Chauvel, Nicolas Desneux, Marie-Laure Desprez Loustau, Abraham Escobar Gutiérrez, Hervé Jactel, Thomas Le Bourgeois, Xavier Nesme, Stéphan Steyer, Frédéric Suffert, Valérie Verdier, François Verheggen, Thierry Wetzel
article
[0] Anses. 2019, 278 p
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BibTex
titre
Résistance de la variété Platanor contre Ceratocystis platani
auteur
Laurent Gentzbittel, Ivan Sache, Didier Tharreau, Thomas Le Bourgeois, Marie-Hélène Balesdent, Françoise Binet, Antonio Biondi, Philippe Castagnone-Sereno, Christophe Clement, Péninna Deberdt, Nicolas Desneux, Marie-Laure Desprez Loustau, Abraham Escobar Gutiérrez, Hervé Jactel, David Makowski, Arnaud Monty, Maria Navajas Navarro, Xavier Nesme, Stéphan Steyer, François Verheggen, Thierry Wetzel
article
[0] Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail. 2019, 62 p
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BibTex
titre
Avis de l’Anses relatif aux connaissances nécessaires à la gestion du risque des écorces sensibles au nématode du pin
auteur
Philippe Castagnone-Sereno, Marie-Hélène Balesdent, Bernard Boutte, Thomas Le Bourgeois, Jean-Marc Henin, Hervé Jactel, Corinne Sarniguet, Françoise Binet, Antonio Biondi, Peninna Deberdt, Nicolas Desneux, Marie-Laure Desprez Loustau, Abraham Escobar Gutiérrez, Laurent Gentzbittel, David Makowski, Arnaud Monty, Maria Navajas, Xavier Nesme, Stéphan Steyer, Eric Verdin, François Verheggen, Thierry Wetzel, Xavier Tassus
article
[0] Saisine n°2018-SA-0103, Anses. 2019, 31 p
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BibTex

Theses

titre
Étude de l'évolution des résistances aux fongicides chez Zymoseptoria tritici, agent de la septoriose du blé, et quantification multi-échelle de ses déterminants
auteur
Maxime Garnault
article
Sciences du Vivant [q-bio]. Université Paris-Saclay, 2019. Français. ⟨NNT : 2019SACLA030⟩
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BibTex
titre
Déterminants génomiques de la spécialisation à l’hôte chez le champignon phytopathogène polyphage Botrytis cinerea
auteur
Alex Mercier
article
Phytopathologie et phytopharmacie. Université Paris Saclay (COmUE), 2019. Français. ⟨NNT : 2019SACLS442⟩
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https://theses.hal.science/tel-02910356/file/83618_MERCIER_2019_archivage.pdf BibTex
titre
Contrôle chromatinien et transcriptionnel de l'expression des gènes codant des effecteurs chez Leptosphaeria maculans, champignon pathogène du colza
auteur
Colin Clairet
article
Phytopathologie et phytopharmacie. Université Paris Saclay (COmUE), 2019. Français. ⟨NNT : 2019SACLS433⟩
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https://theses.hal.science/tel-03024735/file/80017_CLAIRET_2019_archivage.pdf BibTex
titre
Effet de la sélection fluctuante sur le pathogène du blé Zymoseptoria tritici par une approche d'évolution expérimentale
auteur
Arthur Jallet
article
Génétique des populations [q-bio.PE]. Université Paris Saclay (COmUE), 2019. Français. ⟨NNT : 2019SACLS349⟩
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https://theses.hal.science/tel-02598929/file/79722_JALLET_2019_archivage.pdf BibTex
titre
Microbial diversity and pathogen-microbiome interactions in crop residues : the case of Zymoseptoria tritici and Leptosphaeria maculans in a wheat-oilseed rape system
auteur
Lydie Kerdraon
article
Agricultural sciences. Université Paris Saclay (COmUE), 2019. English. ⟨NNT : 2019SACLA011⟩
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https://pastel.hal.science/tel-03537777/file/72634_KERDRAON_2019_archivage.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Inhibition of jasmonate-mediated plant defences by the fungal metabolite higginsianin B
auteur
Jean-Félix Dallery, Marlene Zimmer, Vivek Halder, Mohamed Suliman, Sandrine Pigné, Géraldine Le Goff, Despoina D. Gianniou, Ioannis P. Trougakos, Jamal Ouazzani, Debora Gasperini, Richard O'Connell
article
2019
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titre
The polyphagous plant pathogenic fungus Botrytis cinerea encompasses host-specialized and generalist populations
auteur
Alex Mercier, Florence Carpentier, Clémentine Duplaix, Annie Auger, Jean-Marc Pradier, Muriel Viaud, Pierre P. Gladieux, Anne-Sophie Walker
article
2019
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https://hal.inrae.fr/hal-02944047/file/2019_mercier_bioRxiv.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
One gene-one name: the AvrLmJ1 avirulence gene of Leptosphaeria maculans is AvrLm5
auteur
Clémence Plissonneau, Thierry Rouxel, Anne-Marie Chèvre, Angela P. van de Wouw, Marie-Helene Balesdent
article
Molecular Plant Pathology, 2018, 19 (4), pp.1012 - 1016. ⟨10.1111/mpp.12574⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02621401/file/Plissonneau%20-%202018%20-%20Molecular%20Plant%20Pathology_1.htm BibTex
titre
Contrasting plant height can improve the control of rain-borne diseases in wheat cultivar mixture: modelling splash dispersal in 3-D canopies
auteur
Tiphaine Vidal, Christophe Gigot, Claude de Vallavielle-Pope, Laurent Huber, Sébastien Saint-Jean
article
Annals of Botany, 2018, 121 (7), pp.1299-1308. ⟨10.1093/aob/mcy024⟩
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titre
IPSIM-Web, An Online Resource for Promoting Qualitative Aggregative Hierarchical Network Models to Predict Plant Disease Risk: Application to Brown Rust on Wheat
auteur
Marie-Hélène Robin, Marie-Odile Bancal, Vincent Cellier, Marc Délos, Irène Felix, Marie Launay, Adèle Magnard, Axel Olivier, Corinne Robert, Bernard Rolland, Ivan Sache, Jean-Noel Aubertot
article
Plant Disease, 2018, 102 (3), pp.488-499. ⟨10.1094/PDIS-12-16-1816-SR⟩
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titre
Comment prévenir et gérer la résistance aux fongicides? La résistance de certaines maladies aux fongicides exige une utilisation raisonnée des traitements avec la mise en oeuvre de stratégies adaptées.
auteur
Anne-Sophie Walker
article
Phytoma , 2018, 719 Décembre, pp.28-33
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titre
Subcellular Localization Screening of Colletotrichum higginsianum Effector Candidates Identifies Fungal Proteins Targeted to Plant Peroxisomes, Golgi Bodies, and Microtubules
auteur
Guillaume Robin, Jochen Kleemann, Ulla Neumann, Lisa Cabre, Jean-Felix Dallery, Nicolas Lapalu, Richard O'Connell
article
Frontiers in Plant Science, 2018, 9, ⟨10.3389/fpls.2018.00562⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02622767/file/2018_Robin_Frontiers%20in%20Plant%20Science_1.pdf BibTex
titre
A fungal avirulence factor encoded in a highly plastic genomic region triggers partial resistance to septoria tritici blotch
auteur
Lukas Meile, Daniel Croll, Patrick C. Brunner, Clémence Plissonneau, Fanny E. Hartmann, Bruce A. Mcdonald, Andrea Sanchez-Vallet
article
New Phytologist, 2018, 219 (3), pp.1048 - 1061. ⟨10.1111/nph.15180⟩
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https://hal.science/hal-02420450/file/2018_Meile_New%20Phytol.pdf BibTex
titre
Nature's genetic screens: using genome-wide association studies for effector discovery
auteur
Andrea Sanchez-Vallet, Fanny E. Hartmann, Thierry Marcel, Daniel Croll
article
Molecular Plant Pathology, 2018, 19 (1), pp.3 - 6. ⟨10.1111/mpp.12592⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02627217/file/Marcel%20T%20MPP%202018_1.html BibTex
titre
Pangenome analyses of the wheat pathogen Zymoseptoria tritici reveal the structural basis of a highly plastic eukaryotic genome
auteur
Clémence Plissonneau, Fanny E. Hartmann, Daniel Croll
article
BMC Biology, 2018, 16, ⟨10.1186/s12915-017-0457-4⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02624479/file/2018_Plissoneau_BMC%20Biology_1.pdf BibTex
titre
To B or not to B: a tale of unorthodox chromosomes
auteur
Marie-Helene Balesdent, Thierry Rouxel, Ralph A Dean, Jessica L Soyer
article
Current Opinion in Microbiology, 2018, 46, pp.50-57. ⟨10.1016/j.mib.2018.01.012⟩
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BibTex
titre
Low pathotype diversity in a recombinant Puccinia striiformis population through convergent selection at the eastern Himalayan centre of diversity (Nepal)
auteur
Sajid Ali, S. Sharma, Marc Leconte, S. J. A. Shah, E. Duveiller, Jerome Enjalbert, Claude de Vallavielle-Pope
article
Plant Pathology, 2018, 67 (4), pp.810 - 820. ⟨10.1111/ppa.12796⟩
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BibTex
titre
Biosynthesis of abscisic acid in fungi: identification of a sesquiterpene cyclase as the key enzyme in Botrytis cinerea
auteur
Inmaculada Izquierdo-Bueno, Victoria E. Gonzalez-Rodriguez, Adeline Simon, Berengere Dalmais, Jean-Marc Pradier, Pascal Le Pecheur, Alex Mercier, Anne-Sophie Walker, Carlos Garrido, Isidro Gonzalez Collado, Muriel Viaud
article
Environmental Microbiology, 2018, 20 (7), pp.2469 - 2482. ⟨10.1111/1462-2920.14258⟩
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BibTex
titre
The genome biology of effector gene evolution in filamentous plant pathogens
auteur
Andrea Sanchez-Vallet, Simone Fouche, Isabelle Fudal, Fanny E. Hartmann, Jessica L Soyer, Aurélien Tellier, Daniel Croll
article
Annual Review of Phytopathology, 2018, 56, ⟨10.1146/annurev-phyto-080516-035303⟩
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BibTex
titre
Self-limiting population genetic control with sex-linked genome editors
auteur
Austin Burt, A Deredec
article
Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2018, 285 (1883), ⟨10.1098/rspb.2018.0776⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02628704/file/burt-deredec-2018-self-limiting-population-genetic-control-with-sex-linked-genome-editors.pdf BibTex
titre
Effector Biology in Fungal Pathogens of Nonmodel Crop Plants
auteur
Isabelle Fudal, Marie-Helene Balesdent, Thierry Rouxel
article
Trends in Plant Science, 2018, 23 (9), pp.753 - +. ⟨10.1016/j.tplants.2018.07.002⟩
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BibTex
titre
Thermal generalist behaviour of invasive Puccinia striiformis f. sp. tritici strains under current and future climate conditions
auteur
Claude Pope de Vallavieille, B. Bahri, Marc Leconte, Olivier Zurfluh, Yosra Belaid, Essia Maghrebi, Frederic Huard, Laurent Huber, Marie Launay, Marie-Odile Bancal
article
Plant Pathology, 2018, 67 (6), pp.1307-1320. ⟨10.1111/ppa.12840⟩
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https://hal.science/hal-01811439/file/Vallavieille-Pope_et_al-2018-Plant_Pathology.pdf BibTex
titre
Host-Microbe Interactions: Fungi Vol 46
auteur
Ralph A. Dean, Thierry Rouxel
article
Current Opinion in Microbiology, 2018, 46, pp.III - V. ⟨10.1016/j.mib.2018.11.009⟩
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BibTex
titre
Reverse modelling to estimate yield losses caused by crop diseases
auteur
Laetitia Willocquet, Irène Félix, Claude Pope de Vallavieille, Serge Savary
article
Plant Pathology, 2018, 67 (8), pp.1669-1679. ⟨10.1111/ppa.12873⟩
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BibTex
titre
De novo assembly and annotation of three Leptosphaeria genomes using Oxford Nanopore MinION sequencing
auteur
Fabien Dutreux, Corinne da Silva, Léo d'Agata, Arnaud Couloux, Elise Gay, Benjamin Istace, Nicolas Lapalu, Arnaud Lemainque, Juliette Linglin, Benjamin Noel, Patrick Wincker, Corinne Cruaud, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent, Jean-Marc Aury
article
Scientific Data , 2018, 5 (180235), 11 p. ⟨10.1038/sdata.2018.235⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02621276/file/2018_Dutreux_Scientific%20Data_1.pdf BibTex
titre
Meiosis Leads to Pervasive Copy-Number Variation and Distorted Inheritance of Accessory Chromosomes of the Wheat Pathogen Zymoseptoria tritici
auteur
Simone Fouche, Clémence Plissonneau, Bruce A. Mcdonald, Daniel Croll
article
Genome Biology and Evolution, 2018, 10 (6), pp.1416 - 1429. ⟨10.1093/gbe/evy100⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02625192/file/2018_Fouche_Genome%20Biology%20and%20Evolution_1.pdf BibTex
titre
RMT Vegdiag, axe 2 : Accompagner l’innovation
auteur
Jean-Claude Streito, V. Grimault, T. Baldwin, F. Poliakoff, Pascal Gentit, A. Chabert, Valerie Laval
article
Phytoma la Défense des Végétaux, 2018, juin-juillet 2018, pp.16-21
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BibTex
titre
Une classification unifiée des produits de protection des plantes
auteur
. R4p (réseau de Réflexion Et de Recherches Sur Les Résistances Aux Pesticides), Benoît Barres, Marie-France Corio-Costet, Danièle D. Debieu, Christophe Délye, Sabine Fillinger, Jacques Grosman, Gaëlle Le Goff, Christophe Plantamp, Myriam Siegwart, Anne-Sophie Walker
article
Phytoma la Défense des Végétaux, 2018, 716, pp.42-46
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BibTex
titre
Strain effect on extracellular laccase activities from Botrytis cinerea
auteur
Natalia Quijada Morin, François Garcia, Karen Lambert, Anne-Sophie Walker, Laurent Tiers, Muriel Viaud, Francois Xavier Sauvage, Christophe Hirtz, Cédric Saucier
article
Australian Journal of Grape and Wine Research, 2018, 24 (2), pp.241-251. ⟨10.1111/ajgw.12322⟩
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BibTex
titre
Transposable element insertions shape gene regulation and melanin production in a fungal pathogen of wheat
auteur
Parvathy Krishnan, Lukas Meile, Clémence Plissonneau, Xin Ma, Fanny E. Hartmann, Daniel Croll, Bruce A. Mcdonald, Andrea Sanchez-Vallet
article
BMC Biology, 2018, 16, ⟨10.1186/s12915-018-0543-2⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02625472/file/2018_Plissonneau_BMC%20Biology_1.pdf BibTex
titre
Some reasons why the latent period should not always be considered constant over the course of a plant disease epidemic
auteur
Frederic Suffert, R. N. Thompson
article
Plant Pathology, 2018, 67 (9), pp.1831 - 1840. ⟨10.1111/ppa.12894⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02621026/file/148619.full.pdf BibTex
titre
Genome wide analysis of the transition to pathogenic lifestyles in Magnaporthales fungi
auteur
Ning Zhang, Guohong Cai, Dana C. Price, Jo Anne Crouch, Pierre Gladieux, Bradley Hillman, Chang Hyun Khang, Marc-Henri Lebrun, Yong-Hwan Lee, Jing Luo, Huan Qiu, Daniel Veltri, Jennifer H. Wisecaver, Jie Zhu, Debashish Bhattacharya
article
Scientific Reports, 2018, 8, pp.1-13. ⟨10.1038/s41598-018-24301-6⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02621575/file/Publis18-bgpi-008_genome_zhang_1.pdf BibTex
titre
Epidemiological trade-off between intra- and interannual scales in the evolution of aggressiveness in a local plant pathogen population
auteur
Frederic Suffert, Henriette Goyeau, Ivan Sache, Florence Carpentier, Sandrine Gélisse, David Morais, Ghislain Delestre
article
Evolutionary Applications, 2018, 11 (5), pp.768 - 780. ⟨10.1111/eva.12588⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02628208/file/Suffert_et_al-2018-Evolutionary_Applications_1.pdf BibTex
titre
Inferring pathogen dynamics from temporal count data: the emergence of Xylella fastidiosa in France is probably not recent
auteur
Samuel Soubeyrand, Pauline de Jerphanion, Olivier Martin, Mathilde Saussac, Charles Manceau, Pascal Hendrikx, Christian Lannou
article
New Phytologist, 2018, 219 (2), pp.824 - 836. ⟨10.1111/nph.15177⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02626590/file/new%20phytologist%202018%20Lannou_1.pdf BibTex
titre
Gene Flow between Divergent Cereal- and Grass-Specific Lineages of the Rice Blast Fungus Magnaporthe oryzae
auteur
Pierre Gladieux, Bradford Condon, Sébastien Ravel, Darren Soanes, Joao Leodato Nunes Maciel, Antonio Nhani, Li Chen, Ryohei Terauchi, Marc-Henri Lebrun, Didier Tharreau, Thomas Mitchell, Kerry F. Pedley, Barbara Valent, Nicholas J. Talbot, Mark Farman, Elisabeth Fournier
article
mBio, 2018, 9 (1), ⟨10.1128/mBio.01219-17⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02625604/file/Publis18-bgpi-006_gladieux_gene_1.pdf BibTex

Conference papers

titre
Comment prévenir et gérer la résistance aux fongicides?
auteur
Anne-Sophie Walker
article
12e Conférence Internationale sur les Maladies des Plantes, Végéphyl, Dec 2018, Tours, France
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BibTex
titre
Prévenir la sélection de la résistance MDR chez Zymoseptoria tritici
auteur
G Couleaud, C Maumené, J.Y. Maufras, Walker Anne-Sophie
article
12e Conférence Internationale sur les Maladies des Plantes, Végéphyl, Dec 2018, Tour, France
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titre
État des lieux de la résistance de Sclerotinia sclerotiorum aux SDHI et de sa gestion en culture de colza
auteur
A Penaud, B. Barres, F. Remuson, F. Duroueix, A.S. Walker
article
12e Conférence Internationale sur les Maladies des Plantes, Végéphyl, Dec 2018, Tours, France
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BibTex
titre
Dynamiques spatio-temporelles de la résistance aux fongicides chez Zymoseptoria tritici en France : contrastes et évolutions
auteur
Maxime Garnault, Clémentine Duplaix, Pierre Leroux, G Couleaud, Carpentier Florence, David O., Walker Anne-Sophie
article
12e Conférence Internationale sur les Maladies des Plantes, Végéphyl, Dec 2018, Tours, France
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titre
Influence of landscape structure and cropping system on microbial diversity and microbial interactions in vineyards
auteur
Corinne Vacher, Charlie Pauvert, Thomas Fort, Marc Buée, Valerie Laval, Véronique Edel-Hermann, Laure Fauchery, Angelique Gautier, Isabelle Lesur Kupin, Laurent Deliere, Jessica Vallance
article
Séminaire Pôle de Protection des Plantes (CIRAD 3P), Nov 2018, St-Pierre de la Réunion, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02787591/file/CIRAD_Seminar_CVacher_1.pdf BibTex
titre
Mécanisme de la résistance multidrogues (MDR) et prévention du risque de résistance aux antiseptoriose chez Zymoseptoria tritici
auteur
G Gazeau, Walker Anne-Sophie
article
12e Conférence Internationale sur les Maladies des Plantes, Végéphyl, Nov 2018, Tours, France
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BibTex
titre
Role of extracellular vesicles in plant-microbe interactions
auteur
Richard O'Connell
article
ERA-CAPS Grantholder Workshop, Nov 2018, Bonn, Germany
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BibTex
titre
Deciphering the involvement of an effector family from the plant pathogenic fungus Leptosphaeria maculans in oilseed rape infection
auteur
Nacera Talbi, Yohann Petit, Claire-Line Marais, Benedicte Ollivier, Francoise Blaise, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent, Isabelle Fudal
article
11. Effectome meeting, Nov 2018, Lauret, France
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BibTex
titre
Functional analysis of AvrLm10a and AvrLm10b two neighbor effector genes from L. maculans displaying a "two genes for one gene" interaction with the resistance gene Rlm10 from Brassica nigra
auteur
Yohann Petit, Alexandre A. Degrave, Michel Meyer, Francoise Blaise, Benedicte Ollivier, Claire-Line Marais, Alain Jauneau, Corinne Audran, Susana Rivas, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent, Isabelle Fudal
article
11. Effectome meeting, Nov 2018, lauret, France
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BibTex
titre
Principaux effets de l’arsénite de sodium sur la physiologie de la vigne
auteur
Julie Vallet, Guillaume Robert-Siegwald, Christelle Guillier, Marielle Adrian, Sophie Trouvelot, Lucile Jacquens, Aurélie Songy, Christophe Clément, Philippe Larignon, Marc-Henri Lebrun, Florence Fontaine
article
Journées Nationales des Maladies du bois de la vigne, Institut Français de la Vigne et du Vin (IFV). FRA., Oct 2018, Dijon, France
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titre
Mechanisms behind population responses to variable thermal environments: experiments and model-based analyses of the role of intraspecific phenotypic variation ?
auteur
Anne-Lise Boixel, Erik I Svensson, Frédéric Suffert, Michaël Chelle
article
International Conference on Ecological Sciences, session Population and Community Ecology, Oct 2018, Rennes, France
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BibTex
titre
Fungal secondary metabolites as small molecule effectors
auteur
Richard O'Connell
article
LRSV, Oct 2018, Castanet-Tolosan, France
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BibTex
titre
Multi-drug resistance in the wheat pathogen Zymoseptoria tritici - a question of repeated elements?
auteur
Selim Omrane, Colette Audéon, A. Ignace, Clémentine Duplaix, L. Aouini, G. Kema, Anne-Sophie Walker, Sabine Fillinger
article
Congrès de la SFM (Société Française de Microbiologie), Oct 2018, Paris, France
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titre
Each fungus has its own repertoire of secondary metabolites : Wheat are their role in the lifestyle of the grey mould fungus Botrytis cinerea?
auteur
Muriel Viaud
article
Zhejiang University, Sep 2018, Hangzhou, China
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titre
Zymoseptoria tritici histone modifications distinguish core and accessory chromosomes and play an important role in genome stability
auteur
Jessica L Soyer, M Moeller, Klaas Schotanus, Michael Freitag, Eva H. Stukenbrock
article
ICPP 2018, Jul 2018, Boston, United States
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BibTex
titre
Zymoseptoria tritici histone modifications distinguish core and accessory chromosomes and play an important role in genome stability
auteur
M Moeller, Klaas Schotanus, Jessica L Soyer, M. Freitag, Eva H Stukenbrock
article
International Congress of Plant Pathology (ICPP), Jul 2018, Boston, United States
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BibTex
titre
Reverse modeling enables estimating yield losses caused by individual and multiple disease injuries
auteur
Laetitia Willocquet, I. Félix, Claude Pope de Vallavieille, Serge Savary
article
International Congress of Plant Pathology (ICPP), Jul 2018, Boston, United States. pp.1
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BibTex
titre
Analysis of the determinants of adaptation of Leptosphaeria maculans ‘brassicae’ to a new host species
auteur
Jessica L Soyer, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent
article
21th Crucifer Genetics Conference, Jul 2018, Saint-Malo, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02787615/file/abstract_Soyer_Brassica_2018_1 BibTex
titre
Investigating the involvement of histone modifications in the control of effector gene expression in Leptospharia maculans, the fungus causing stem canker of oilseed rape
auteur
Jessica L Soyer, Isabelle Fudal, Colin Clairet, Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Francoise Blaise, Eva H. Stukenbrock
article
21th Crucifer Genetics Conference, Jul 2018, saint-Malo, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02786161/file/abstract_Brassica_2018_Fudal_1 BibTex
titre
Exocellular laccases from three Botrytis cinerea strains. The difference in their activities is not related to their catalytic protein part.
auteur
N. Quijada-Morin, Garcia F., K. Lambert, Anne-Sophie Walker, Muriel Viaud, F.X Sauvage, C. Hirtz, C. Saucier
article
Macrowine 2018, May 2018, Zaragoza, Spain
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BibTex
titre
The role of histone-methyltransferases KMT1 and KMT6 in chromatin organization and gene regulation in the wheat pathogen Zymoseptoria tritici
auteur
Jessica L Soyer, Mareike Moeller, Michael Freitag, Klaas Schotanus, Eva H. Stukenbrock
article
ECFG14, Feb 2018, Haifa, Israel
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BibTex
titre
Population structure and host specialization in Botrytis cinerea
auteur
Alex Mercier, Adeline Simon, Clémentine Duplaix, Marguerite Cuel, Jean-Marc Pradier, Muriel Viaud, Pierre Gladieux, Anne-Sophie Walker
article
Journées Jean Chevauchon JJC2018 - 12èmes Rencontres de Phytopathologie & Mycologie,, Jan 2018, Aussois, France. p.19
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https://hal.inrae.fr/hal-02785894/file/GG08%20A%20MERCIER%20P%2019_1.pdf BibTex
titre
The pace of aggressiveness evolution and host adaptation in a plant pathogen population
auteur
Frederic Suffert, Henriette Goyeau, Ivan Sache, Florence Carpentier, Sandrine Gélisse, David Morais
article
Journées Jean Chevauchon JJC2018 - 12èmes Rencontres de Phytopathologie & Mycologie,, Jan 2018, Aussois, France. p.34
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02791218/file/EP08%20Suffert%20P%2034_1.pdf BibTex
titre
Analyse de l'interaction entre les membres d'un complexe d'espèces pathogènes du colza (Leptosphaeria maculans et L.biglobosa) par une approche transcriptomique
auteur
Elise Gay, Marie-Helene Balesdent, Thierry Rouxel, Nicolas Lapalu, Juliette Linglin, Fabien Dutreux, Jean-Philippe Vernadet
article
Journées Jean Chevauchon JJC2018 - 12èmes Rencontres de Phytopathologie & Mycologie,, Jan 2018, Aussois, France. p.40
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https://hal.inrae.fr/hal-02790241/file/EC04%20Gay%20P40_1.pdf BibTex
titre
Identification et analyse fonctionnelle des effecteurs tardifs impliqués dans la colonisation systémique du colza par Leptosphaeria maculans
auteur
Julie Gervais, Elise Gay, Fabien Dutreux, Isabelle Fudal, Juliette Linglin, Benedicte Ollivier, Jean-Marc Aury, Marie-Helene Balesdent, Thierry Rouxel
article
Journées Jean Chevauchon JJC2018 - 12èmes Rencontres de Phytopathologie & Mycologie,, Jan 2018, Aussois, France. p.50
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02786060/file/IM06%20Gervais%20p50_1.pdf BibTex
titre
Functional analysis of AvrLm10a and AvrLm10b two neighbor effector genes from L.maculans displaying a "two genes for one gene" interaction with the resistance gene Rlm10 from Brassica nigra.
auteur
Yohann Petit, Alexandre A. Degrave, Michel Meyer, Francoise Blaise, Benedicte Ollivier, Claire-Line Marais, Alain Jauneau, Corinne Audran, Susana Rivas, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent, Isabelle Fudal
article
Journées Jean Chevauchon JJC2018 - 12èmes Rencontres de Phytopathologie & Mycologie,, Jan 2018, Aussois, France. p.54
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02791188/file/IM10%20PETIT%20Y%20P%2054_1.pdf BibTex
titre
Contrasted spatiotemporal dynamics of resistance and its drivers in the pathogenic fungus Zymoseptoria tritici in France revealed by statistical analysis.
auteur
Maxime Garnault, G. Couleaud, Pierre P. Leroux, Clémentine Duplaix, Olivier David, Florence Carpentier, Anne-Sophie Walker
article
Journées Jean Chevauchon JJC2018 - 12èmes Rencontres de Phytopathologie & Mycologie,, Jan 2018, Aussois, France. p.30
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02791573/file/EP04%20AS%20Walker%20P%2030_1.pdf BibTex
titre
Investigating the involvement of the chromatin state in the control of effector gene expression in Leptosphaeria maculans
auteur
Colin Clairet, Jessica L. Soyer, Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Francoise Blaise, Julie Gervais, Eva H. Stukenbrock, Isabelle Fudal
article
Journées Jean Chevauchon JJC2018 - 12èmes Rencontres de Phytopathologie & Mycologie,, Jan 2018, Aussois, France. p.14
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https://hal.inrae.fr/hal-02785896/file/GG03%20Clairet%20P%2014_1.pdf BibTex
titre
Pathway-specific regulation of the botcinic acid biosynthetic gene cluster in the grey mould fungus Botrytis cinerea
auteur
Antoine Porquier, Berengere Dalmais, Guillaume Morgant, Javier Moraga, Adeline Simon, Hind Sghyer, Jean-Marc Pradier, Isidro Gonzalez Collado, Muriel Viaud
article
14th european conference on fungal genetics, 2018, Haifa, Israel
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Book sections

titre
La méthylation de l’ADN
auteur
Isabelle Fudal, Nadia Ponts
article
Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3
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titre
Méthode de détermination du positionnement des nucléosomes : MAINE
auteur
Isabelle Fudal, Nadia Ponts
article
Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3
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titre
Techniques d’identification de régions génomiques accessibles à des régulateurs : FAIRE et ATAC
auteur
Isabelle Fudal, Nadia Ponts
article
Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3
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titre
Immunoprécipitation de la chromatine
auteur
Isabelle Fudal, Nadia Ponts
article
Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3
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titre
Structure de la chromatine
auteur
Isabelle Fudal, Nadia Ponts
article
Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3
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Other publications

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An experimental design to test the effect of wheat variety mixtures on biodiversity and ecosystem services
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Florence Dubs, X. Le Roux, Vincent Allard, B. Andrieu, S. Barot, A. Cantarel, C. De Vallavielle-Pope, A. Gauffreteau, I. Goldringer, C. Montagnier, T. Pommier, E. Porcher, Sébastien Saint-Jean, J. Borg, S. Bourdet-Massein, D. Carmignac, A. Duclouet, E. Forst, N. Galic, L. Gerard, M. Hugoni, A. Hure, A. Larue, J-C. Lata, C. Lecarpentier, M. Leconte, E. Le Saux, I. Le Viol, P. L'Hote, P. Lusley, M. Mouchet, Audrey Niboyet, Rémi Perronne, E. Pichot, S. Pin, S. Salmon, D. Tropée, A. Vergnes, Tiphaine Vidal, J. Enjalbert
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2018
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Poster communications

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Its all fun guys: a comparison of bioinformatic pipelines for metabarcoding plant and soil fungal communities
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International Phytobiomes Conference 2018, Dec 2018, Montpellier, France. 2018
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https://hal.science/hal-01938707/file/Pauvert_Phytobiomes18_Poster_1.pdf BibTex
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Exploit biodiversity in viticultural systems to reduce pest damage and pesticide use, and increase ecosystems services provision: the BIOVINE Project
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International Congress on Grapevine and Wine Sciences, Nov 2018, Logrono, Spain. , 2018
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Control of Zymoseptoria tritici a splash dispersed pathogen by the mean of wheat cultivars mixture; experimental and modelling biophysical approaches
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Sébastien Saint-Jean, Tiphaine Vidal, Christophe Gigot, Laurent Huber, Claude Pope de Vallavieille
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ICPP 2018, Jul 2018, Boston, United States. APS Press, Phytopathology, 108 (10S), 2018, Phytopathology. ⟨10.1094/PHYTO-108-10-S1.1⟩
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INRA's flagship program to foster development of solutions for sustainable management of crop health
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Christian Lannou, Sylvie Colleu, Cindy E. Morris
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ICPP 2018, Jul 2018, Boston, United States. APS Press, Phytopathology, 108 (10S), pp.S1.193, 2018, Phytopathology. ⟨10.1094/PHYTO-108-10-S1.1⟩
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Deciphering the molecular and genetic bases of grape tolerance to trunk diseases
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Jean-Pierre Peros, Luc Bidel, Amandine Launay, Gilles Berger, Yves Bertrand, Gwenaelle Comont, Anne Clément, Jean-Luc Verdeil, Cécile Marchal, Cédric Moisy, Loic Lecunff, Marc-Henri Lebrun, Marie-France Corio-Costet
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12. International conference on grapevine breeding and genetics, Jul 2018, Bordeaux, France. 2018
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Root growth and development under heat and water stresses: a comparative study determining independent and combined effects in four grain legume species
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Marion Prudent, Virginie Bourion, Cherif Diatta, Déborah Leborgne, Sylvie Girodet, Chantal Martin, Damien Ollivier, Vincent Durey, Christophe Salon
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ISRR-10 (International Society of Root Research). Exposing the Hidden Half. Root Research at the Forefront of Science International Symposium, Jul 2018, Jérusalem, Israel. , 2018
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The role of plant cell wall deposition and metabolism in the plant-pathogen arms race (FT)
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Ying Wang, Hermanus Höfte, Richard O'Connell, Samantha Vernhettes
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International SPS Conference 2018, Jul 2018, Gif-sur-Yvette, France. , pp.79, 2018
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Evolution of populations of Leptosphaeria maculans, a fungal pathogen of oilseed rape, under resistance selection pressure: insights from two decades of surveys in France
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Marie-Helene Balesdent, Clémence Plissonneau, Florence Carpentier, Laurent Coudard, Suzanne Touzeau, Martine Leflon, Magali Ermel, Régine Delourme, Loïc Le Meur, Thierry Rouxel
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21. Crucifer Genetics Conference - Brassica 2018, Jul 2018, Saint-Malo, France. , 2018
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Characterization of eremophilenols from Botrytis cinerea and its biosynthetic relation with the sesquiterpene cyclases 3 and 4
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Ir Suarez-Caceres, C. Garrido, Jm Cantoral, Muriel Viaud, Ig Collado
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Euroindoameriican nadural product meeting, May 2018, Madrid, Spain
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Transcriptome evolution of a fungal plant pathogen using an experimental evolution approach
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Arthur J Jallet, Anne Genissel
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2018 Population, Evolutionary and Quantitative Genetics Conference, May 2018, Madison (US-WI), United States
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Insights into chromosome structure, transposable elements and secondary metabolite gene clusters from the complete genome sequence of Colletotrichum higginsianum
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Jean-Félix Dallery, Nicolas Lapalu, M.R. Thon, Richard O'Connell
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ECFG14 European conference on fungal genetics, Feb 2018, Haifa, Israel
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Impala-based transposon mutagenesis in influenced by chromatin modifications in the fungal plant pathogen Zymoseptoria tritici
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Anais Pitarch, Camille Delude, Gabriel Scalliet, Marc Henri Lebrun
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Journées Jean Chevauchon JJC2018 - 12èmes Rencontres de Phytopathologie & Mycologie,, Jan 2018, Aussois, France. , p.62, 2018
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titre
Assessing the risk of resistance selection towards Qil fungicides in Zymoseptoria tritici
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Guillaume Fouche, Anne-Sophie Walker, Sabine, Helma S. H. Fillinger-David, Brigitte Meunier, David Young
article
Journées Jean Chevauchon JJC2018 - 12èmes Rencontres de Phytopathologie & Mycologie,, Jan 2018, Aussois, France. , p.65, 2018
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Reports

titre
Saisine relative aux stratégies de lutte contre le charançon rouge du palmier
auteur
Frédéric Suffert, Abraham Escobar Gutiérrez, Laurence Ollivier, Didier Rochat, Pierre Silvie, Philippe Reignault, Marie-Hélène Balesdent, Philippe Castagnone-Sereno, Bruno Chauvel, Nicolas Desneux, Marie-Laure Desprez Loustau, Laurent Gentzbittel, Hervé Jactel, Thomas Le Bourgeois, Xavier Nesme, Stéphan Steyer, Valérie Verdier, François Verheggen, Thierry Wetzel, Françoise Binet, Antonio Biondi, Christophe Clément, Péninna Deberdt, Charles Manceau
article
[0] Saisine n° 2017-SA-0137, Anses. 2018, 85 p
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titre
Analyse de risque phytosanitaire portant sur la berce du Caucase
auteur
Arnaud Albert, Guillaume Fried, Thomas Le Bourgeois, Marie-Hélène Balesdent, Françoise Binet, Antonio Biondi, Philippe Castagnone-Sereno, Christophe Clement, Péninna Deberdt, Nicolas Desneux, Marie-Laure Desprez Loustau, Abraham Escobar Gutiérrez, Laurent Gentzbittel, Hervé Jactel, David Makowski, Arnaud Monty, Maria Navajas Navarro, Xavier Nesme, Stéphan Steyer, François Verheggen, Thierry Wetzel
article
[0] Anses. 2018, 64 p
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titre
Risque phytosanitaire (ARP) portant sur Fusarium oxysporum f. sp. cubense (agent pathogène responsable de la maladie de Panama) pour les départements d'Outre-mer
auteur
Marie-Hélène Balesdent, Yolande Chilin Charles, David Makowski, Christian Steinberg, Pierre Silvie, Philippe Castagnone-Sereno, Bruno Chauvel, Nicolas Desneux, Marie-Laure Desprez Loustau, Abraham Escobar Gutiérrez, Laurent Gentzbittel, Hervé Jactel, Thomas Le Bourgeois, Xavier Nesme, Stéphan Steyer, Frédéric Suffert, François Verheggen, Thierry Wetzel
article
[0] Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail. 2018, 100 p
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titre
Réalisation d'une analyse de risques relative au houblon du Japon et élaboration de recommandations de gestion
auteur
Arnaud Monty, Arnaud Albert, Guillaume Fried, Pierre Silvie, Marie-Hélène Balesdent, Philippe Castagnone-Sereno, Bruno Chauvel, Nicolas Desneux, Marie-Laure Desprez Loustau, Abraham Escobar Gutiérrez, Laurent Gentzbittel, Hervé Jactel, Thomas Le Bourgeois, Xavier Nesme, Stéphan Steyer, Frédéric Suffert, François Verheggen, Thierry Wetzel
article
[0] Anses. 2018, 46 p
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titre
Risques et bénéfices relatifs des alternatives aux produits phytopharmaceutiques comportant des néonicotinoïdes
auteur
Hervé Jactel, Romain Bonafos, Robert Delorme, Eric Thybaud, Denis Thiery, Philippe Reignault, Marie-Hélène Balesdent, Philippe Castagnone-Sereno, Bruno Chauvel, Nicolas Desneux, Marie-Laure Desprez Loustau, Abraham Escobar Gutiérrez, Laurent Gentzbittel, Thomas Le Bourgeois, Xavier Nesme, Pierre Silvie, Stéphan Steyer, Frédéric Suffert, Valérie Verdier, François Verheggen, Thierry Wetzel
article
[0] Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail. 2018, 548 p
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BibTex
titre
Espèces hôtes dans le cadre de la lutte contre Phytophthora ramorum
auteur
Marie-Laure Desprez Loustau, Cécile Robin, Renaud Ioos, Benoit Marçais, Marco Pautasso, Thomas Le Bourgeois, Marie-Hélène Balesdent, Françoise Binet, Antonio Biondi, Philippe Castagnone-Sereno, Christophe Clement, Péninna Deberdt, Nicolas Desneux, Abraham Escobar Gutiérrez, Laurent Gentzbittel, Hervé Jactel, David Makowski, Arnaud Monty, Maria Navajas Navarro, Xavier Nesme, Stéphan Steyer, François Verheggen, Thierry Wetzel
article
[0] Anses. 2018, 112 p
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Theses

titre
Décryptage des cascades de signalisation liées au stress par phosphoprotéomique et génétique fonctionnelle chez Botrytis cinerea
auteur
Jaafar Kilani
article
Biologie moléculaire. Université Paris Saclay (COmUE), 2018. Français. ⟨NNT : 2018SACLS050⟩
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https://theses.hal.science/tel-01865827/file/73163_KILANI_2018_archivage.pdf BibTex

2017

Journal articles

titre
Cultivar architecture modulates spore dispersal by rain splash: A new perspective to reduce disease progression in cultivar mixtures
auteur
Tiphaine Vidal, Pauline Lusley, Marc Leconte, Claude de Vallavieille-Pope, Laurent Huber, Sébastien Saint-Jean
article
PLoS ONE, 2017, 12 (11), pp.e0187788. ⟨10.1371/journal.pone.0187788⟩
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https://agroparistech.hal.science/hal-01635938/file/Vidal2017b.pdf BibTex
titre
Reduction of fungal disease spread in cultivar mixtures: Impact of canopy architecture on rain-splash dispersal and on crop microclimate
auteur
Tiphaine Vidal, Anne-Lise Boixel, Brigitte Durand, Claude de Vallavieille-Pope, Laurent Huber, Sébastien Saint-Jean
article
Agricultural and Forest Meteorology, 2017, 246, pp.154 - 161. ⟨10.1016/j.agrformet.2017.06.014⟩
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titre
A White Paper on Global Wheat Health Based on Scenario Development and Analysis
auteur
Serge Savary, A. Djurle, J. Yuen, A. Ficke, V. Rossi, P. Esker, C. Fernandes, E. M. del Ponte, J. Kumar, L. Madden, P. Paul, N. Mcroberts, P. K. Singh, L. Huber, C. de Vallavielle-Pope, Sébastien Saint-Jean, L. Willocquet
article
Phytopathology, 2017, 107 (10), pp.1109-1122. ⟨10.1094/PHYTO-01-17-0027-FI⟩
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titre
Complex Interactions between Fungal Avirulence Genes and Their Corresponding Plant Resistance Genes and Consequences for Disease Resistance Management
auteur
Yohann Petit, Isabelle Fudal
article
Frontiers in Plant Science, 2017, 8, ⟨10.3389/fpls.2017.01072⟩
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https://hal.science/hal-01602583/file/fpls-08-01072.pdf BibTex
titre
Plasticity of the MFS1 Promoter Leads to Multidrug Resistance in the Wheat Pathogen Zymoseptoria tritici
auteur
Selim Omrane, Colette Audeon, Amandine Ignace, Clémentine Duplaix, Lamia Aouini, Gert Kema, Anne-Sophie Walker, Sabine, Helma S. H. Fillinger-David
article
MSphere, 2017, 2 (5), ⟨10.1128/mSphere.00393-17⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02627374/file/Omrane%20Msphere%202017_1.pdf BibTex
titre
A framework to characterize the commercial life cycle of crop varieties: Application to the case study of the influence of yellow rust epidemics on French bread wheat varieties
auteur
Rémi Perronne, Solene Diguet, Claude Pope de Vallavieille, Marc Leconte, Jerome Enjalbert
article
Field Crops Research, 2017, 209, pp.159 - 167. ⟨10.1016/j.fcr.2017.05.008⟩
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BibTex
titre
A small secreted protein in Zymoseptoria tritici is responsible for avirulence on wheat cultivars carrying the Stb6 resistance gene
auteur
Ziming Zhong, Thierry Marcel, Fanny E. Hartmann, Xin Ma, Clémence Plissonneau, Marcello Zala, Aurélie Ducasse, Johann Confais, Romain Compain, Nicolas Lapalu, Joëlle Amselem, Bruce A. Mcdonald, Daniel Croll, Javier Palma-Guerrero
article
New Phytologist, 2017, 214 (2), pp.619 - 631. ⟨10.1111/nph.14434⟩
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BibTex
titre
Adaptive diversification in heterogeneous environments
auteur
Olivier David, Christian Lannou, Herve Monod, Julien Papaix, Djidi Traore
article
Theoretical Population Biology, 2017, 114, pp.1-9. ⟨10.1016/j.tpb.2016.11.003⟩
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https://hal.science/hal-01508877/file/20180801dynadapt_HAL.pdf BibTex
titre
The powdery mildew-resistant Arabidopsis mlo2 mlo6 mlo12 triple mutant displays altered infection phenotypes with diverse types of phytopathogens
auteur
Johanna Acevedo-Garcia, Katrin Gruner, Anja Reinstaedler, Ariane Kemen, Eric Kemen, Lingxue Cao, Frank L. W. Takken, Marco U. Reitz, Patrick Schafer, Richard O'Connell, Stefan Kusch, Hannah Kuhn, Ralph Panstruga
article
Scientific Reports, 2017, 7, ⟨10.1038/s41598-017-07188-7⟩
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BibTex
titre
Draft genome sequence of diplodia seriata F98.1, a fungal species involved in grapevine trunk diseases
auteur
Guillaume Robert, Julie Vallet, Eliane Abou-Mansour, Jiabao Xu, Patrice Rey, Christophe Bertsch, Cecilia Rego, Philippe Larignon, Florence Fontaine, Marc-Henri Lebrun
article
Genome Announcements, 2017, 5 (14), pp.1-2. ⟨10.1128/genomeA.00061-17⟩
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BibTex
titre
High-resolution mapping of genes involved in plant stage-specific partial resistance of barley to leaf rust
auteur
F. K. S. Yeo, R. Bouchon, R. Kuijken, A. Loriaux, C. Boyd, R. E. Niks, Thierry Marcel
article
Molecular Breeding, 2017, 37 (4), ⟨10.1007/s11032-017-0624-x⟩
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https://hal.science/hal-01605912/file/MOL%20BRED%202017%20MARCEL%20T_1.pdf BibTex
titre
Spatio-temporal dynamics on a plot scale of cocoa black pod rot caused by Phytophthora megakarya in Cameroon
auteur
Michel Ndoumbe Nkeng, Mousseni Ives Bruno Efombagn, Lucien Bidzanga Nomo, Ivan Sache, Christian Cilas
article
European Journal of Plant Pathology, 2017, 147 (3), pp.579-590. ⟨10.1007/s10658-016-1027-2⟩
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https://agroparistech.hal.science/hal-01495104/file/Ndoumbeetal%20CJP2_v4Fin%20CJPP_Sache.pdf BibTex
titre
Regulation of conidiation in Botrytis cinerea involves the light-responsive transcriptional regulators BcLTF3 and BcREG1
auteur
Beate Brandhoff, Adeline Simon, Anne Dornieden, Julia Schumacher
article
Current Genetics, 2017, 63 (5), pp.931 - 949. ⟨10.1007/s00294-017-0692-9⟩
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BibTex
titre
Testing differences between pathogen compositions with small samples and sparse data
auteur
Samuel Soubeyrand, Vincent Garetta, Caroline Monteil, Frédéric Suffert, Henriette Goyeau, Julie Berder, Jacques Moinard, Elisabeth Fournier, Didier Tharreau, Cindy E. Morris, Ivan Sache
article
Phytopathology, 2017, 107 (10), pp.1199-1208. ⟨10.1094/PHYTO-02-17-0070-FI⟩
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BibTex
titre
Impact of biotic and abiotic factors on the expression of fungal effector-encoding genes in axenic growth conditions
auteur
Michel Meyer, Ahmed Salim Bourras, Julie Gervais, Karine Labadie, Corinne Cruaud, Marie-Helene Balesdent, Thierry Rouxel
article
Fungal Genetics and Biology, 2017, 99, pp.1 - 12. ⟨10.1016/j.fgb.2016.12.008⟩
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https://hal.science/hal-01608210/file/Fungal%20Genet%20Biol%202017%20Meyer_1.pdf BibTex
titre
Un outil moléculaire basé sur le séquençage haut débit pour caractériser les Fusarium sur céréales
auteur
Anne-Laure Boutigny, Angelique Gautier, Ryan Basler, Florian Dauthieux, Stephen Leite, Romain Valade, Jaime Aguayo, Renaud Ioos, Valerie Laval
article
Innovations Agronomiques, 2017, 59, pp.55-61. ⟨10.15454/1.513785287764323E12⟩
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https://hal.science/hal-01675815/file/2017_Boutigny_Innovations%20Agronomiques.pdf BibTex
titre
Utiliser les principes éco-évolutifs pour définir des stratégies de gestion territoriale des résistances variétales
auteur
Julien Papaix, Christian Lannou
article
Sélectionneur Français, 2017, in press
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BibTex
titre
Fungal adaptation to contemporary fungicide applications: the case of Botrytis cinerea populations from Champagne vineyards (France)
auteur
Anne-Sophie Walker, Virginie Ravigné, Adrien Rieux, S. Ali, Florence Carpentier, Elisabeth Fournier
article
Molecular Ecology, 2017, 26 (7), pp.1919-1935. ⟨10.1111/mec.14072⟩
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https://hal.science/hal-01608285/file/Publis17-bgpi-010_walker_fungal_1.pdf BibTex
titre
Gapless genome assembly of Colletotrichum higginsianum reveals chromosome structure and association of transposable elements with secondary metabolite gene clusters
auteur
Jean-Felix Dallery, Nicolas Lapalu, Antonios Zampounis, Sandrine Pigné, Isabelle Luyten, Joelle Amselem, Alexander H. J. Wittenberg, Shiguo Zhou, Marisa V. de Queiroz, Guillaume Robin, Annie Auger, Matthieu Hainaut, Bernard Henrissat, Ki-Tae Kim, Yong-Hwan Lee, Olivier Lespinet, David C. Schwartz, Michael R. Thon, Richard O'Connell
article
BMC Genomics, 2017, 18, ⟨10.1186/s12864-017-4083-x⟩
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https://hal.science/hal-01608503/file/BMC%20Dallery%202017_1.pdf BibTex
titre
Association Genetics in Plant Pathogens: Minding the Gap between the Natural Variation and the Molecular Function
auteur
Anne Genissel, Johann Confais, Marc-Henri Lebrun, Lilian Gout
article
Frontiers in Plant Science, 2017, 8, ⟨10.3389/fpls.2017.01301⟩
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https://hal.science/hal-01607896/file/Frontiers%20Genissel%202017_1.pdf BibTex
titre
Unusual evolutionary mechanisms to escape effector-triggered immunity in the fungal phytopathogen Leptosphaeria maculans
auteur
C. Plissonneau, Francoise Blaise, Benedicte Ollivier, M. Leflon, J. Carpezat, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent
article
Molecular Ecology, 2017, 26 (7), pp.2183 - 2198. ⟨10.1111/mec.14046⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02619658/file/Plissonneau%20MOL%20ECOL%202017_1.html BibTex
titre
Life, death and rebirth of avirulence effectors in a fungal pathogen of Brassica crops, Leptosphaeria maculans
auteur
Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent
article
New Phytologist, 2017, 214 (2), pp.526 - 532. ⟨10.1111/nph.14411⟩
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BibTex
titre
Using Population and Comparative Genomics to Understand the Genetic Basis of Effector-Driven Fungal Pathogen Evolution
auteur
Clémence Plissonneau, Juliana Benevenuto, Norfarhan Mohd-Assaad, Simone Fouche, Fanny E. Hartmann, Daniel Croll
article
Frontiers in Plant Science, 2017, 8, pp.1-15. ⟨10.3389/fpls.2017.00119⟩
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BibTex
titre
The formation of sesquiterpenoid presilphiperfolane and cameroonane metabolites in the Bcbot4 null mutant of Botrytis cinerea
auteur
Gabriel Franco dos Santos, Javier Moraga, Jacqueline A. Takahashi, Muriel Viaud, James R. Hanson, Rosario Hernandez Galan, Isidro G. Collado
article
Organic & Biomolecular Chemistry, 2017, 15 (25), pp.5357 - 5363. ⟨10.1039/c7ob01088e⟩
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https://hal.science/hal-01602630/file/c7ob01088e.pdf%3B BibTex
titre
Different waves of effector genes with contrasted genomic location are expressed by Leptosphaeria maculans during cotyledon and stem colonization of oilseed rape
auteur
Julie Gervais, Clémence Plissonneau, Juliette Linglin, Michel Meyer, Karine Labadie, Corinne Cruaud, Isabelle Fudal, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent
article
Molecular Plant Pathology, 2017, 18 (8), pp.1113 - 1126. ⟨10.1111/mpp.12464⟩
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https://hal.science/hal-01608614/file/MPP%20Gervais%202017_1.html BibTex
titre
Achieving Durable Resistance Against Plant Diseases: Scenario Analyses with a National-Scale Spatially Explicit Model for a Wind-Dispersed Plant Pathogen
auteur
Marjolein Elisabeth Lof, Claude Pope de Vallavieille, Wopke van Der Werf
article
Phytopathology, 2017, 107 (5), pp.580 - 589. ⟨10.1094/PHYTO-05-16-0207-R⟩
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BibTex
titre
Un master européen pour la protection des plantes. Le programme Erasmus + Plant Health, proposé par quatre pays européens dont la France, réunit des étudiants du monde entier. Les inscriptions sont ouvertes!
auteur
Serge Kreiter, Elena Kazakou, R. Bonafos, Manuel Plantegenest, Lilian Gout
article
Phytoma , 2017, 706, pp.48-51
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BibTex
titre
New insights into plant-microbe interactions through advances in fungal genetics
auteur
Cécile Lorrain, Julie Gervais, Yohann Petit, Jonathan M. Plett
article
New Phytologist, 2017, 216 (3), pp.647-650. ⟨10.1111/nph.14825⟩
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Conference papers

titre
Regulation of the biosynthesis of phytotoxic secondary metabolites in the grey mould fungus Botrytis cinerea
auteur
Antoine Porquier, Berengere Dalmais, Adeline Simon, Javier Moraga, Jean-Marc Pradier, Pascal Le Pecheur, Isidro Collado, Muriel Viaud
article
9. Congrès National de la Société Française de Microbiologie, Oct 2017, Paris, France
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titre
Improving Septoria tritici blotch resistance (STB) in Wheat by Genome Wide Association Studies
auteur
G. Hébert, Stéphane Lafarge, Gaetan Touzy, Cyrille Saintenac, Thierry Marcel, Sébastien Praud, - The Breedwheat Consortium, Jacques Le Gouis
article
Deciphering plant-microbe interactions for sustainable crop production, Sep 2017, Banyuls-sur-Mer, France
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titre
Chromatin-based control of plant-fungi interactions
auteur
Isabelle Fudal
article
40th New Phytologist Symposium, Sep 2017, Vienne, Austria
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https://hal.inrae.fr/hal-02786093/file/2017%20Fudal%20Vienna%20INV_1.pdf https://hal.inrae.fr/hal-02786093/file/2017%20Fudal%20Vienna%20INV_2.docx BibTex
titre
Fungal appressoria: platforms for delivering small molecule effectors
auteur
Jean-Felix Dallery, E. Adelin, Jamal Ouazzani, Richard O'Connell
article
FEMS 7th Congress of European Microbiologists, Jul 2017, Valence, Spain
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titre
Unusual evolutionary mechanisms to escape Effector-Triggered-Immunity in the fungal phytopathogen Leptosphaeria maculans
auteur
Clémence Plissonneau, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent
article
29. Fungal genetics conference Asilomar 17, Mar 2017, Pacific Grove CA, United States. pp.258
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titre
Comparative proteomics and phosphoproteomics to decipher signal transduction in Botrytis cinerea.
auteur
Jaafar Kilani, Marlène Davanture, Michel Zivy, Sabine Fillinger
article
29. Fungal genetics conference Asilomar 17, Mar 2017, Pacific Grove CA, United States. p.212
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https://hal.science/hal-01604794/file/Abstract%20Book%202017%208x10_1.pdf BibTex
titre
Light-induced gene expression in Botrytis cinerea involves GATA-transcription factors and the stress-activated MAP kinase module.
auteur
Julia Schumacher, Kim C. Cohrs, Adeline Simon, Jaafar Kilani, Muriel Viaud, Sabine Fillinger
article
29. Fungal genetics conference Asilomar 17, Mar 2017, Pacific Grove CA, United States. p.196
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titre
A first glimpse into the genetic architecture of pathogenicity of Zymoseptoria tritici on bread wheat
auteur
Thierry Marcel, Aurélie Ducasse, Jérome Compain, Nicolas Lapalu, Z Chang Zhong Chen, Fanny E. Hartmann, Johann Confais, Henriette Goyeau, J. Palma-Guerrero, G.H.J. Kema, Joëlle Amselem, Daniel Croll
article
29. Fungal genetics conference Asilomar 17, Mar 2017, Pacific Grove, CA, United States. p.246
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titre
Leptosphaeria maculans effectors involved in the oilseed rape systemic colonization.
auteur
Julie Gervais, Clémence Plissonneau, Juliette Linglin, Michel Meyer, K Labadie, Corinne Cruaud, Benedicte Ollivier, Isabelle Fudal, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent
article
29. Fungal genetics conference Asilomar 17, Mar 2017, Pacific Grove CA, United States. p.234
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titre
A small secreted protein in Zymoseptoria tritici is responsible for avirulence on wheat cultivars carrying the Stb6 resistance gene
auteur
Ziming Zhong, Thierry Marcel, Clemence Plissonneau, Bruce A. Mcdonald, Daniel Croll, J. Palma-Guerrero
article
29. Fungal genetics conference Asilomar 17, Mar 2017, Pacific Grove CA, United States. p.246
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titre
Influence of histone modifications on effector gene expression in the plant pathogenic fungus Leptosphaeria maculans.
auteur
Jessica Soyer, Colin Clairet, Julie Gervais, Marie-Helene Balesdent, Lanelle R Connolly, Michael Freitag, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal
article
29. Fungal genetics conference Asilomar 17, Mar 2017, Pacific GROVE CA, United States. p.55
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titre
Improved genome sequence of Diplodia seriata, a tool for comparative genomics of Diplodia species.
auteur
Guillaume Robert, J. Vallet, E. Abou-Mansour, J. Xu, Patrice Rey, C. Bertsch, Cecília Rego, P. Larignon, F. Fontaine, Marc-Henri Lebrun
article
29. Fungal genetics conference Asilomar 17, Mar 2017, Asilomar, United States. p.159
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titre
Biotic and abiotic factors influence the expression of effectors in Leptosphaeria maculans during axenic growth.
auteur
Michel Meyer, Salim Bourras, Julie Gervais, Isabelle Fudal, Marie-Helene Balesdent, Thierry Rouxel
article
29. Fungal genetics conference Asilomar 17, Mar 2017, Pacific Grove CA, United States. p.228
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titre
The phosducin-like protein PhnA of Botrytis cinerea is involved in fungal development and pathogenicity.
auteur
Jaafar Kilani, Monica Miazzi, Colette Audeon, Sabine Fillinger
article
29. Fungal genetics conference Asilomar 17, Mar 2017, Asilomar, United States. p.142
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titre
Structural and functional characterization of Leptosphaeria maculans effectors: the example of AvrLm4-7.
auteur
Yohann Petit, Francoise Blaise, Clémence Plissonneau, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent, Karine Blondeau, Lazar Noureddine, Inès Gallay, Théo Le Moigne, Herman van Tilbeurgh, Isabelle Fudal
article
29. Fungal genetics conference Asilomar 17, Mar 2017, Pacific Grove CA, United States. pp.P;231
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titre
Transcriptomics and experimental proof that compound appressoria are arsenals of Fusarium graminearum
auteur
M. Mentges, Anika Glasenapp, Marike J. Boenisch, A.-L. Martínez Rocha, M. Münsterkötter, U. Güldener, Bernard Henrissat, Marc-Henri Lebrun, Jorg Bormann, W. Schaefer
article
29. Fungal genetics conference Asilomar 17, Mar 2017, Pacific Grove CA, United States. p.238
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titre
Organisateurs du congrès
auteur
Benoit Barrès, Daniele Debieu, Christophe Délye, Sabine Fillinger, Jacques Grosman, Annie Micoud, Myriam Siegwart, Anne-Sophie Walker
article
Journées d’Échanges sur les Résistances aux Produits de Protection des Plantes 2017, Réseau de Réflexion et de Recherche sur les Résistances aux Pesticides (R4P). FRA., Mar 2017, Bordeaux, France. 49 p
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titre
Prévenir et réduire les risques de sélection de résistances : de la théorie à la pratique, des pistes pour améliorer la durabilité des PPP
auteur
Christophe Délye, Myriam Siegwart, Anne-Sophie Walker
article
Journées d’Échanges sur les Résistances aux produits de protection des plantes 2017, Réseau de Réflexion et de Recherche sur les Résistances aux Pesticides (R4P). FRA., Mar 2017, Bordeaux, France. 49 p
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titre
Généralités sur la Résistance aux Produits de Protection des Plantes (PPP)
auteur
Anne-Sophie Walker, Christophe Délye
article
Journées d’Échanges sur les Résistances aux produits de protection des plantes 2017, Réseau de Réflexion et de Recherche sur les Résistances aux Pesticides (R4P). FRA., Mar 2017, Bordeaux, France. 49 p
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titre
Utiliser les principes éco-évolutifs pour définir des stratégies de gestion territoriale des résistances variétales
auteur
Julien Papaix, Christian Lannou
article
Journée scientifique ASF : "Durabilité des résistances aux maladies et amélioration des plantes, Feb 2017, Versailles, France
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titre
Microbial metacommunity: a METABAR coding approach
auteur
Marc Buée, Matthieu Barret, Maria Bernard, Didier Debroas, Isabelle Domaizon, Laure Fauchery, Claude Husson, Valerie Laval, Géraldine Pascal, Charlie Pauvert, Christophe Mougel, Thomas Pommier, Dirk Redecker, Aymé Spor, Sébastien Terrat, Véronique Edel-Hermann, Corinne Vacher
article
2017 Scientific MEM days: Journées scientifiques MEM (Métaomiques et écosystèmes microbiens), Jan 2017, Paris, France
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Book sections

titre
Integrating crop bioterrorism hazards into pest risk assessment tools
auteur
J.D. Mumford, A.W. Leach, J. Holt, Frederic Suffert, Ivan Sache, Bénédicte Moignot, Alexander Hamilton
article
Practical tools for plant and food biosecurity, , 384 p., 2017, Plant Pathology in the 21st Century, ⟨10.1007/978-3-319-46897-6⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02787698/file/CHAP%206%20SUFFERT_1.pdf BibTex
titre
Integrating crop bioterrorism hazards into pest risk assessment tools
auteur
J.D. Mumford, A.W. Leach, J. Holt, Frederic Suffert, Ivan Sache, Bénédicte Moignot, Alexander Hamilton
article
Practical tools for plant and food biosecurity, , 384 p., 2017, Plant Pathology in the 21st Century
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https://hal.inrae.fr/hal-02928125/file/CHAP%206%20SUFFERT_1.pdf BibTex
titre
Decreases in Crop Production by Non-native Weeds, Pests, and Pathogens
auteur
Guillaume Fried, Bruno Chauvel, Philippe Reynaud, Ivan Sache
article
Invading Nature-Springer Series in Invasion Ecology, 12, SPRINGER INTERNATIONAL PUBLISHING AG, pp.19, 2017, Invading Nature, 978-3-319-45121-3; 978-3-319-45119-0. ⟨10.1007/978-3-319-45121-3_6⟩
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titre
Mining plant genomic and genetic data using the GnpIS information system
auteur
Anne-Francoise Adam-Blondon, Michael Alaux, Sophie Durand, Thomas Letellier, Guillaume Merceron, Nacer Mohellibi, Cyril Pommier, Delphine Steinbach, Françoise Alfama-Depauw, Joëlle Amselem, Dorothée Charruaud, Nathalie Choisne, Raphaël-Gauthier Flores, Claire Guerche, Véronique Jamilloux, Erik Kimmel, Nicolas Lapalu, Mikaël Loaec, Célia Michotey, Hadi Quesneville
article
Aalt D.J van Dijk. Plant Genomics Databases. Methods and Protocols, 1533, Springer, 2017, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-6658-5. ⟨10.1007/978-1-4939-6658-5_5⟩
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https://hal.science/hal-03206731/file/GnpIS_MIPMB_original.pdf BibTex

Lectures

titre
Santé des plantes : de l’observation au diagnostic
auteur
Pierre Abad, Laure Vidal Beaudet, Dominique Blancard, Anne-Gaelle Cabelguen, Sylvain Charpentier, Noëlle Dorion, Joël Fruneau, Mary Fruneau, Bruno Jaloux, Michel Javoy, Jérôme Jullien, Serge Kreiter, Cyril Kruczkowski, Eliane Lebret, Hervé Lecoq, Olivier Leprince, Marie-Hélène Avelange-Macherel, Elizabeth Rat-Morris, Philippe Reignault, Ivan Sache, Hannah Surmely, Nicolas Toutain, Eric Verdin
article
Doctorat. France. 2017
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https://hal.inrae.fr/hal-02791747/file/2017_Abad_MOOC%20%281%29.pdf BibTex

Poster communications

titre
Investigating the involvement of the chromatin state in the control of effector gene expression in Leptospharia maculans
auteur
Colin Clairet, Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Francoise Blaise, Julie Gervais, Jessica L. Soyer, Isabelle Fudal
article
40th New Phytologist Symposium, Sep 2017, Vienne, Austria. 2017
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https://hal.inrae.fr/hal-02786095/file/Poster%20Clairet%20et%20al%20Vienna%202017_1.pdf https://hal.inrae.fr/hal-02786095/file/Poster%20Clairet%20et%20al%20Vienna%202017_2.doc BibTex
titre
Status of resistance towards SDHIs in French populations of Sclerotinia sclerotiorum and characterization of resistant strains
auteur
Anne-Sophie Walker, Christiane Auclair, F. Rémuson, A. Micoud, J. Carpezat, M. Leflon, A. Penaud
article
16th International Sclerotinia Workshop, Aug 2017, Uberlandia, Brazil.
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titre
Population structure and host specialization in Botrytis cinerea
auteur
Anne-Sophie Walker, Alex Mercier, Marguerite Cuel, Jean-Marc Pradier, Adeline Simon, Muriel Viaud, Pierre Gladieux
article
10. French Society for Plant Pathology (SFP), May 2017, Dunkerque, Malo-les-Bains, France. , 236 p., 2017, Deepen Knowledge in Plant Pathology for Innovative Agro-Ecology : Book of Abstracts
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https://hal.science/hal-01603401/file/Publis17-bgpi-048_walker_population_1.pdf BibTex
titre
Population structure and host specialization in Botrytis cinerea
auteur
Anne-Sophie Walker, A. Mercier, M. Cuel, Jean Marc Pradier, Adeline Simon, Muriel Viaud, P. Gladieux
article
10th French society for plant pathology conference, May 2017, Dunkerque, France.
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titre
Le levier variétal pour lutter contre les bioagresseurs du blé tendre
auteur
P. Du Cheyron, Valérie Cadot, Henriette Goyeau, Claude Pope de Vallavieille
article
Congrès AFPP, Mar 2017, Lille, France. 2017
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titre
In planta localisation of Leptosphaeria maculans effectors and identification of their plant targets.
auteur
Claire-Line Marais, Yohann Petit, Francoise Blaise, Benedicte Ollivier, Julie Gervais, - Le Moigne, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent, Inès Gallay, K Blondeau, Noureddine Lazar, Herman van Tilbeurgh, Isabelle Fudal
article
29. Fungal genetics conference Asilomar 17, Mar 2017, Pacific Grove CA, United States. , p.232, 2017
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titre
Relative influence of cropping systems, injury profiles and institutional determinants on the spatio-temporal structure of bread wheat diversity in France
auteur
Rémi Perronne, David Makowski, Céline Schott, Mourad Hannachi, Robin Goffaux, Pierre Montalent, Jean-Noel Aubertot, Vincent Cellier, Stephane Lemarié, Aline Fugeray-Scarbel, Claude Pope de Vallavieille, Marc Leconte, Jerome Enjalbert, Isabelle Goldringer
article
4. Young Natural History scientists Meeting, Feb 2017, Paris, France. , 169 p., 2017, YNHM : Young Natural History scientists Meeting
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titre
What were the relative influences of cropping systems, injury profiles and institutional determinants on the spatio-temporal structure of bread wheat varietal and genetic diversity in France ?
auteur
Rémi Perronne, David Makowski, Céline Schott, Mourad Hannachi, Robin Goffaux, Pierre Montalent, Jean-Noel Aubertot, Vincent Cellier, Stephane Lemarié, Aline Fugeray-Scarbel, Claude Pope de Vallavieille, Marc Leconte, Jerome Enjalbert, Marie Stetzler, Solene Diguet, Nicolas Poulain, Isabelle Goldringer
article
38. Réunion Annuelle du Groupe d'Etude de Biologie et Génétique des Populations, 2017, Saclay, France. , 1 p., 2017
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titre
Relative influence of agricultural systems, pathogen pressures and soci-economic drivers on spatio-temporal changes of cultivated bread wheat varietal and genetic diversity over recent decades in France
auteur
Rémi Perronne, David Makowski, Céline Schott, Mourad Hannachi, Robin Goffaux, Pierre Montalent, Jean-Noel Aubertot, Vincent Cellier, Stephane Lemarié, Aline Fugeray-Scarbel, Claude Pope de Vallavieille, Marc Leconte, Jerome Enjalbert, Marie Stetzler, Solène Diguet, Nicolas Poulain, Isabelle Goldringer
article
EUCARPIA Genetic Resources 2017 - Crop diversification in a changing world : Mobilizing the green gold of plant genetic resources, 2017, Montpellier, France. , 1 p., 2017
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https://hal.inrae.fr/hal-02790829/file/2017_PERRONNE_SCHOTT_determinants_of_wheat_cultivated_diversity_Eucarpia_01_05_2017_vf_1.pdf BibTex

Reports

titre
Demande d’avis relatif à la réalisation d’une analyse de risques relative à l’ambroisie trifide (Ambrosia trifida L.) et pour l’élaboration de recommandation de gestion
auteur
Thomas Le Bourgeois, Bruno Chauvel, Guillaume Fried, Arnaud Monty, Jean-Pierre Rossi, Philippe Reignault, Marie‐hélène Balesdent, Philippe Castagnone-Sereno, Nicolas Desneux, Marie-Laure Desprez Loustau, Abraham J. Escobar-Gutierrez, Laurent Gentzbittel, Hervé Jactel, Xavier Nesme, Pierre Silvie, Stéphan Steyer, Frédéric Suffert, Valerie Verdier, Francois Verheggen, Thierry Wetzel, Xavier Tassus, Marie Aigueperse
article
[0] Saisine n° 2016-SA-0090, Anses. 2017, pp.108
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https://hal.inrae.fr/hal-03191543/file/SANTVEG2016SA0090Ra.pdf BibTex

Theses

titre
Comprendre l’implication des effecteurs fongiques dans l’infection d’une plante hôte : caractérisation fonctionnelle d’effecteurs de Leptosphaeria maculans, un champignon pathogène du colza
auteur
Yohann Petit
article
Phytopathologie et phytopharmacie. Université Paris Saclay (COmUE), 2017. Français. ⟨NNT : 2017SACLS549⟩
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https://theses.hal.science/tel-01709853/file/75099_PETIT_2017_archivage.pdf BibTex
titre
Identification et analyse fonctionnelle des effecteurs tardifs impliqués dans la colonisation systémique du colza par Leptosphaeria maculans
auteur
Julie Gervais
article
Phytopathologie et phytopharmacie. Université Paris Saclay (COmUE), 2017. Français. ⟨NNT : 2017SACLS346⟩
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https://theses.hal.science/tel-01900126/file/71891_GERVAIS_2017_diffusion.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
Isolation of fungi from dead arthropods and identification of a new mosquito natural pathogen
auteur
Sana Jaber, Alex Mercier, Khouzama Knio, Sylvain Brun, Zakaria Kambris
article
Parasites & Vectors, 2016, 9 (1), ⟨10.1186/s13071-016-1763-3⟩
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BibTex
titre
Erratum: Survival trade-offs in plant roots during colonization by closely related beneficial and pathogenic fungi
auteur
Stéphane Hacquard, Barbara Kracher, Kei Hiruma, Philipp C. Münch, Ruben Garrido-Oter, Michael R. Thon, Aaron Weimann, Ulrike Damm, Jean-Félix Dallery, Matthieu Hainaut, Bernard Henrissat, Olivier Lespinet, Soledad Sacristán, Emiel Ver Loren van Themaat, Eric Kemen, Alice C. Mchardy, Paul Schulze-Lefert, Richard O'Connell
article
Nature Communications, 2016, 7, ⟨10.1038/ncomms13072⟩
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BibTex
titre
The N-end rule pathway regulates pathogen responses in plants
auteur
Rémi de Marchi, Maud Sorel, Brian Mooney, Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Kevin Goslin, Kamila Kwaśniewska, Patrick Ryan, Marina Pfalz, Juergen Kroymann, Stephan Pollmann, Angela Feechan, Frank Wellmer, Susana Rivas, Emmanuelle Graciet
article
Scientific Reports, 2016, 6 (1), ⟨10.1038/srep26020⟩
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https://hal.science/hal-02104524/file/2016_Marchi_Scientific%20Reports_1 BibTex
titre
cloncase : Estimation of sex frequency and effective population size by clonemate resampling in partially clonal organisms
auteur
Sajid S. Ali, Samuel Soubeyrand, Pierre Gladieux, Tatiana Giraud, Marc Leconte, Angelique Gautier, Wanquan Chen, Claude de Vallavieille-Pope, Jerome Enjalbert
article
Molecular Ecology Resources, 2016, 16 (4), pp.845-861. ⟨10.1111/1755-0998.12511⟩
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BibTex
titre
Breakdown of Rlm3 resistance in the Brassica napus-Leptosphaeria maculans pathosystem in western Canada
auteur
Xuehua Zhang, Gary Peng, H. Randy Kutcher, Marie-Helene Balesdent, Régine Delourme, W. G. Dilantha Fernando
article
European Journal of Plant Pathology, 2016, 145 (3), pp.659 - 674. ⟨10.1007/s10658-015-0819-0⟩
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BibTex
titre
Diversity of Fusarium species isolated from UK forage maize and the population structure of F. graminearum from maize and wheat
auteur
Ryan Basler
article
PeerJ, 2016, eCollection 2016, 4 (e2143), 18 p. ⟨10.7717/peerj.2143⟩
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https://hal.science/hal-01524531/file/peerj-2143.pdf BibTex
titre
Survival trade-offs in plant roots during colonization by closely related beneficial and pathogenic fungi
auteur
Stéphane Hacquard, Barbara Kracher, Kei Hiruma, Philipp C. Münch, Ruben Garrido-Oter, Michael R. Thon, Aaron Weimann, Ulrike Damm, Jean-Félix Dallery, Matthieu Hainaut, Bernard Henrissat, Olivier Lespinet, Soledad Sacristán, Emiel Ver Loren van Themaat, Eric Kemen, Alice C. Mchardy, Paul Schulze-Lefert, Richard O'Connell
article
Nature Communications, 2016, 7, pp.1-12. ⟨10.1038/ncomms11362⟩
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https://hal.science/hal-01412501/file/HKHMO.pdf BibTex
titre
Études du CEA sur les gainages avancés de combustible nucléaire pour un combustible REL avec une tolérance aux accidents améliorée, en APRP et au-delà
auteur
J.-C. Brachet, C. Lorrette, A. Michaux, C. Sauder, I. Idarraga-Trujillo, M. Le Saux, M. Le Flem, F. Schuster, A. Billard, E. Monsifrot, E. Torres, F. Rebillat, J. Bischoff, A. Ambard
article
Revue Générale Nucléaire, 2016, 1, pp.14-20. ⟨10.1051/rgn/20151014⟩
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BibTex
titre
Proposal for a unified nomenclature for target-site mutations associated with resistance to fungicides
auteur
Wesley Mair, Francisco Lopez-Ruiz, Gerd Stammler, William Clark, Fiona Burnett, Derek Hollomon, Hideo Ishii, Tarlochan S Thind, James Km Brown, Bart Fraaije, Hans Cools, Michael Shaw, Sabine Fillinger, Anne-Sophie Walker, Emilia Mellado, Guido Schnabel, Andreas Mehl, Richard P Oliver
article
Pest Management Science, 2016, 72 (8), pp.1449-1459. ⟨10.1002/ps.4301⟩
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https://hal.science/hal-01588038/file/Mair_et_al-2016-Pest_Management_Science_%7B8CAFE091-B5FF-48E2-BE62-B8CD6E6EFD3E%7D.pdf BibTex
titre
A complete toolset for the study of Ustilago bromivora and Brachypodium sp as a fungal-temperate grass pathosystem
auteur
Franziska Rabe, Jason Bosch, Alexandra Stirnberg, Tilo Guse, Lisa Bauer, Denise Seitner, Fernando A. Rabanal, Angelika Czedik-Eysenberg, Simon Uhse, Janos Bindics, Bianca Genenncher, Fernando Navarrete, Ronny Kellner, Heinz Ekker, Jochen Kumlehn, John P. Vogel, Sean P. Gordon, Thierry Marcel, Martin Muensterkoetters, Mathias C. Walter, Christian M. K. Sieber, Gertrud Mannhaupt, Ulrich Gueldener, Regine Kahmann, Armin Djamei
article
eLife, 2016, 5 (novembre), pp.e20522. ⟨10.7554/eLife.20522⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02634403/file/T.%20MARCEL%20e20522-download_1.pdf BibTex
titre
Special issue on clubroot and blackleg diseases of brassicas - Foreword
auteur
Elke Diederichsen, Geoffrey R. Dixon, Ann-Charlotte Wallenhammar, Dilantha Fernando, Marie-Helene Balesdent
article
European Journal of Plant Pathology, 2016, 145 (3), pp.515 - 516. ⟨10.1007/s10658-016-0963-1⟩
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BibTex
titre
Leptosphaeria maculans effector AvrLm4-7 affects SA- and ET-signalling and H2O2 accumulation in Brassica napus
auteur
Miroslava Nováková, Lucie Trdá, Hana Krutinová, Thomas Mongin, Olga Valentová, Marie-Helene Balesdent, Thierry Rouxel, Lenka Burketová
article
Molecular Plant Pathology, 2016, 17 (6), pp.818-831. ⟨10.1111/mpp.12332⟩
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BibTex
titre
Fashionably late partners have more fruitful encounters: Impact of the timing of co-infection and pathogenicity on sexual reproduction in Zymoseptoria tritici
auteur
Frédéric Suffert, Ghislain Delestre, Florence Carpentier, Gwilherm Gazeau, Anne-Sophie Walker, Sandrine Gélisse, Clémentine Duplaix
article
Fungal Genetics and Biology, 2016, 92, pp.40 - 49. ⟨10.1016/j.fgb.2016.05.004⟩
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BibTex
titre
The botrydial biosynthetic gene cluster of Botrytis cinerea displays a bipartite genomic structure and is positively regulated by the putative Zn(II)(2)Cys(6) transcription factor BcBot6
auteur
Antoine Porquier, Guillaume Morgant, Javier Moraga, Berengere Dalmais, Isabelle Luyten, Adeline Simon, Jean-Marc Pradier, Joëlle Amselem, Isidro Gonzalez Collado, Muriel Viaud
article
Fungal Genetics and Biology, 2016, 96 (Nov 2016), pp.33-46. ⟨10.1016/j.fgb.2016.10.003⟩
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https://hal.science/hal-01532622/file/2016-The%2520botrydial%2520biosynthetic%2520gene%2520cluster%2520of%2520Botrytis%2520cinerea%2520displays%2520a%2520bipartite%2520genomic%2520structure%2520and%2520is%2520positively%2520regulated%2520by%2520the%2520putative%2520Zn%2528II%25292Cys6transcription%2520f.pdf BibTex
titre
Light governs asexual differentiation in the grey mould fungusBotrytis cinereavia the putative transcription factor BcLTF2
auteur
Kim C. Cohrs, Adeline Simon, Muriel Viaud, Julia Schumacher
article
Environmental Microbiology, 2016, ⟨10.1111/1462-2920.13431⟩
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BibTex
titre
Emergence of wheat blast in Bangladesh was caused by a South American lineage of Magnaporthe oryzae
auteur
M. Tofazzal Islam, Daniel Croll, Pierre Gladieux, Darren M. Soanes, Antoine Persoons, Pallab Bhattacharjee, M. Shaid Hossain, Dipali Rani Gupta, Md Mahbubur Rahman, M. Golam Mahboob, Nicolas Cook, Moin U. Salam, Musrat Zahan Surovy, Vanessa Bueno Sancho, Jao Leotado Nunes Maciel, Antonio Nhani, Vanina Lilian Castroagudin, Juliana T. D. Reges, Paulo Cezar Ceresini, Sébastien Ravel, Ronny Kellner, Elisabeth E. Fournier, Didier Tharreau, Marc-Henri Lebrun, Bruce A. Mcdonald, Timothy Stitt, Daniel Swan, Nicholas J. Talbot, Diane G. O. Saunders, Joe Win, Sophien Kamoun
article
BMC Biology, 2016, 14, pp.1-11. ⟨10.1186/s12915-016-0309-7⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02638254/file/Publis16-bgpi-068_islam_emergence_1.pdf BibTex
titre
Mapping Averaged Pairwise Information (MAPI): a new exploratory tool to uncover spatial structure.
auteur
Sylvain S. Piry, Marie Pierre Chapuis, Bertrand Gauffre, Julien J. Papaix, Astrid Cruaud, Karine Berthier
article
Methods in Ecology and Evolution, 2016, 7 (12), pp.1463-1475. ⟨10.1111/2041-210X.12616⟩
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https://hal.science/hal-01506806/file/2016_Piry_Methods%20Ecol%20Evol_postprint_2.pdf BibTex
titre
Root Endophyte Colletotrichum tofieldiae Confers Plant Fitness Benefits that Are Phosphate Status Dependent
auteur
Kei Hiruma, Nina Gerlach, Soledad Sacristán, Ryohei Thomas Nakano, Stéphane Hacquard, Barbara Kracher, Ulla Neumann, Diana Ramirez, Marcel Bucher, Richard O'Connell, Paul Schulze-Lefert
article
Cell, 2016, 165 (2), pp.464 - 474. ⟨10.1016/j.cell.2016.02.028⟩
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titre
Haplotype divergence and multiple candidate genes at Rphq2, a partial resistance QTL of barley to Puccinia hordei
auteur
F K S Yeo, Y Wang, T Vozabova, Cécile C. Huneau, Philippe Leroy, B Chalhoub, X Q Qi, R E Niks, Thierry Marcel
article
TAG Theoretical and Applied Genetics, 2016, 129 (2), pp.289-304. ⟨10.1007/s00122-015-2627-5⟩
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titre
Genome sequence and annotation of Colletotrichum higginsianum, a causal agent of Crucifer Anthracnose Disease
auteur
Antonios Zampounis, Sandrine Pigné, Jean-Felix Dallery, Alexander H. J. Wittenberg, Shiguo Zhou, David C. Schwartz, Michael R. Thon, Richard O'Connell
article
Genome Announcements, 2016, 4 (4), pp.e00821-16. ⟨10.1128/genomeA.00821-16⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02635906/file/Zampounis%20et%20al%202016%20Genome%20Announcements_1.pdf BibTex
titre
Trends and challenges in pesticide resistance detection
auteur
. R4p (reflection And Research On Resistance To Pesticides), Benoît Barres, Marie-France Corio-Costet, Danièle D. Debieu, Christophe Délye, Sabine Fillinger-David, Jacques Grosman, Annie Micoud, Myriam Siegwart, Anne-Sophie Walker
article
Trends in Plant Science, 2016, 21 (10), pp.834-853. ⟨10.1016/j.tplants.2016.06.006⟩
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BibTex
titre
How Can Secretomics Help Unravel the Secrets of Plant-Microbe Interactions?
auteur
Delphine Vincent, Kim M. Plummer, Peter S. Solomon, Marc-Henri Lebrun, Dominique Job, Maryam Rafiqi
article
Frontiers in Plant Science, 2016, open access, 1 p. ⟨10.3389/fpls.2016.01777⟩
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https://hal.science/hal-01604807/file/fpls-07-01777_1.pdf BibTex
titre
Genetic and molecular basis of botrydial biosynthesis. Connecting cytochrome P450-encoding genes to biosynthetic intermediates.
auteur
Javier Moraga, Berengere Dalmais, Inmaculada Izquierdo-Bueno, Josefina Aleu, James R. Hanson, Rosario Hernández-Galán, Muriel Viaud, Isidro G. Collado
article
ACS Chemical Biology, 2016, 11 (10), pp.2838-2846. ⟨10.1021/acschembio.6b00581⟩
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https://hal.science/hal-01531674/file/moraga-et-al-2016-genetic-and-molecular-basis-of-botrydial-biosynthesis-connecting-cytochrome-p450-encoding-genes-to.pdf BibTex
titre
Identification of yeasts isolated from raffia wine (Raphia hookeri) produced in Cote d'Ivoire and genotyping of Saccharomyces cerevisiae strains by PCR inter-delta
auteur
Charles Y. Tra Bi, Florent K. N'Guessan, Clementine A. Kouakou, Noémie Vignolles, Serge Casaregola, Marcellin K. Djè
article
World Journal of Microbiology and Biotechnology, 2016, 32 (8), pp.125-134. ⟨10.1007/s11274-016-2095-3⟩
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BibTex
titre
Rouille jaune sur blé tendre. Les résistances dépendent aussi du stade.
auteur
P. Du Cheyron, Claude de Vallavieille-Pope, Marc Leconte
article
Perspectives Agricoles, 2016, 434, pp.8-11
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BibTex
titre
Combining selective pressures to enhance the durability of disease resistance genes
auteur
Denis Bourguet, François Delmotte, Pierre Franck, Thomas Guillemaud, Xavier Reboud, Corinne Vacher, Anne Sophie A. S. Walker
article
Frontiers in Plant Science, 2016, 7, pp.1-8. ⟨10.3389/fpls.2016.01916⟩
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https://hal.science/hal-01533924/file/fpls-07-01916_1.pdf BibTex
titre
Generic names in Magnaporthales
auteur
Ning Zhang, Jing Luo, Amy Y. Rossman, Takayuki Aoki, Izumi Chuma, Pedro W. Crous, Ralph Dean, Ronald P. de Vries, Nicole Donofrio, Kevin D. Hyde, Marc-Henri Lebrun, Nicholas J. Talbot, Didier Tharreau, Yukio Tosa, Barbara Valent, Zonghua Wang, Jin-Rong Xu
article
IMA Fungus, 2016, 7 (1), pp.155-159. ⟨10.5598/imafungus.2016.07.01.09⟩
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https://hal.science/hal-01608608/file/ima-7-1-155_1.pdf BibTex
titre
Partitioning the contributions of alternative malaria vector species
auteur
Anne Deredec, Samantha M. O'Loughlin, Tin-Yu J. Hui, Austin Burt
article
Malaria Journal, 2016, 15 (60), 7 p. ⟨10.1186/s12936-016-1107-y⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02631953/file/2016%20Deredec%20Malaria%20Journal_1.pdf BibTex
titre
Replacement of the European wheat yellow rust population by new races from the centre of diversity in the near-Himalayan region
auteur
M. S. Hovmoller, S. Walter, R. A. Bayles, A. Hubbard, K. Flath, N. Sommerfeldt, Marc M. Leconte, P. Czembor, J. Rodriguez-Algaba, T. Thach, J. G. Hansen, P. Lassen, A. F. Justesen, S. Ali, Claude de Vallavieille-Pope
article
Plant Pathology, 2016, 65 (3), pp.402 - 411. ⟨10.1111/ppa.12433⟩
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titre
Is the onset of septoria tritici blotch epidemics related to the local pool of ascospores?
auteur
D. Morais, I. Sache, F. Suffert, Valerie Laval
article
Plant Pathology, 2016, 65 (2), pp.250 - 260. ⟨10.1111/ppa.12408⟩
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titre
Wheat yellow rust dynamics in Tunisia since 2013 and resistance genes in durum wheat
auteur
Bochra Amina Bahri, Marc Leconte, Hamza Rebai, Claude Pope de Vallavieille
article
Phytopathology, 2016, 106 (12), pp.84-84
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titre
Inferring the origin of primary inoculum of Zymoseptoria tritici from differential adaptation of resident and immigrant populations to wheat cultivars
auteur
David Morais, Sandrine Gelisse, Valerie Laval, Ivan Sache, Frederic Suffert
article
European Journal of Plant Pathology, 2016, 145 (2), pp.393 - 404. ⟨10.1007/s10658-015-0853-y⟩
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titre
A game of hide and seek between avirulence genes AvrLm4‐7 and AvrLm3 in Leptosphaeria maculans
auteur
Clémence Plissonneau, Guillaume Daverdin, Bénédicte Ollivier, Françoise Blaise, Alexandre A. Degrave, Isabelle Fudal, Thierry Rouxel, Marie-Hélène Balesdent
article
New Phytologist, 2016, 209 (4), pp.1613-1624. ⟨10.1111/nph.13736⟩
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https://univ-angers.hal.science/hal-02516669/file/nph.13736%20%281%29.pdf BibTex
titre
Estimating the incidence of Septoria leaf blotch in wheat crops from in-season field measurements
auteur
Lucie Michel, François Brun, François Piraux, David Makowski
article
European Journal of Plant Pathology, 2016, 146 (1), pp.17. ⟨10.1007/s10658-016-0887-9⟩
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BibTex
titre
Phenylpyrroles: 30 years, two molecules and (nearly) no resistance
auteur
Jaafar Kilani, Sabine Fillinger
article
Frontiers in Microbiology, 2016, 7, pp.1-10. ⟨10.3389/fmicb.2016.02014⟩
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https://hal.science/hal-01602833/file/2016_Kilani_Frontiers%20in%20Microbiology_1.pdf BibTex
titre
A European Database of Fusarium graminearum and F-culmorum Trichothecene Genotypes
auteur
Matias Pasquali, Marco Beyer, Antonio Logrieco, Kris Audenaert, Virgilio Balmas, Ryan Basler, Anne-Laure Boutigny, Jana Chrpova, Elzbieta Czembor, Tatiana Gagkaeva, Maria Gonzalez-Jaen, Ingerd S. Hofgaard, Nagehan D. Koycu, Lucien Hoffmann, Jelena Levic, Patricia Marin, Thomas Miedaner, Quirico Migheli, Antonio Moretti, Marina E. H. Mueller, Francoise Munaut, Paivi Parikka, Marine Pallez-Barthel, Jonathan Piec, Jonathan Scauflaire, Barbara Scherm, Slavica Stankovic, Ulf Thrane, Silvio Uhlig, Adriaan Vanheule, Tapani Yli-Mattila, Susanne Vogelgsang
article
Frontiers in Microbiology, 2016, 7, 11 p. ⟨10.3389/fmicb.2016.00406⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02637292/file/Pasqueli%20FRONTIERS%202016_1.pdf https://hal.inrae.fr/hal-02637292/file/Pasqueli%20FRONTIERS%202016_2.txt BibTex
titre
Phytophthora nicotianae diseases worldwide: new knowledge of a long-recognised pathogen
auteur
Franck Panabières, Gul Shad Ali, Mohamed Bechir Alagui, Ronaldo J. D. Dalio, Neil C. Gudmestad, Marie-Line Kuhn, Sanjoy Guha Roy, Leonardo Schena, Antonios Zampounis
article
Phytopathologia Mediterranea, 2016, 55 (1), pp.20 - 40. ⟨10.14601/Phytopathol_Mediterr-16423⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02639974/file/2016_Panabieres_Phytopathologia%20Mediterranea_1.pdf BibTex
titre
Concevoir des associations variétales de blé pour réduire la progression épidémique de la septoriose : approche théorique et expérimentations au champ
auteur
Claude C. Pope de Vallavieille, Sébastien Saint-Jean, Christophe Gigot, Laurent Huber, M. Leconte, C Maumené, Philippe Du Cheyron, Gilles Couleaud, B. Kerhornou
article
Innovations Agronomiques, 2016, 50, pp.157-170. ⟨10.15454/1.4721162285051362E12⟩
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https://hal.science/hal-01564560/file/2016_de%20Vallavieille%20Pope_innovations%20Agronomiques_%7B768D3A4E-E9D6-4717-955F-2AF837BE2DB9%7D.pdf BibTex
titre
Lutte contre les fusarioses des épis de blés : quantification des espèces du complexe fusarien, facteurs de risque et méthodes de lutte
auteur
Emmanuelle Gourdain, Hélène Batina, Philippe Du Cheyron, Arnaud Fourrey, Sandrine Gelisse, Guénolé Grignon, Valerie Laval, Claude Maumené, Benoît Méléard, Romain Valade
article
Innovations Agronomiques, 2016, 49, pp.133-145. ⟨10.15454/1.4622769356130952E12⟩
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https://hal.science/hal-01652932/file/2016_Gourdain_Innovations%20Agronomiques.pdf BibTex
titre
The Evolution of Orphan Regions in Genomes of a Fungal Pathogen of Wheat
auteur
Clémence Plissonneau, Alessandra Sturchler, Daniel Croll
article
mBio, 2016, 7 (5), ⟨10.1128/mBio.01231-16⟩
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https://hal.science/hal-01606849/file/mBio-2016-Plissonneau-_1.pdf BibTex
titre
A novel Zn(2)Cys(6) transcription factor BcGaaR regulates D-galacturonic acid utilization in Botrytis cinerea
auteur
Lisha Zhang, Ronnie J. M. Lubbers, Adeline Simon, Joost H. M. Stassen, Pablo R. Vargas Ribera, Muriel Viaud, Jan A. L. van Kan
article
Molecular Microbiology, 2016, 100 (2), pp.247 - 262. ⟨10.1111/mmi.13314⟩
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BibTex
titre
Molecular markers for tracking the origin and worldwide distribution of invasive strains of Puccinia striiformis
auteur
Stephanie Walter, Sajid Ali, Eric Kemen, Kumarse Nazari, Bochra A. Bahri, Jérôme Enjalbert, Jens G. Hansen, James K. M. Brown, Thomas Sicheritz-Ponten, Jonathan Jones, Claude de Vallavieille-Pope, Mogens S. Hovmoller, Annemarie F. Justesen
article
Ecology and Evolution, 2016, 6 (9), pp.2790 - 2804. ⟨10.1002/ece3.2069⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02637526/file/Walter_et_al-2016-Ecology_and_Evolution_1.pdf BibTex
titre
Special issue on clubroot and blackleg diseases of brassicas - foreword
auteur
Elke Diederichsen, Geoffrey R. Dixon, Ann-Charlotte Wallenhammar, Dilantha Fernando, Marie-Helene Balesdent
article
European Journal of Plant Pathology, 2016, 146 (2), pp.449 - 449. ⟨10.1007/s10658-016-1004-9⟩
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BibTex
titre
A novel L-arabinose-responsive regulator discovered in the rice-blast fungus Pyricularia oryzae (Magnaporthe oryzae)
auteur
Sylvia Klaubauf, Miaomiao Zhou, Marc-Henri Lebrun, Ronald P. de Vries, Evy Battaglia
article
FEBS Letters, 2016, 590 (4), pp.550 - 558. ⟨10.1002/1873-3468.12070⟩
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BibTex
titre
Worldwide population structure of the wheat rust fungus Puccinia striiformis in the past
auteur
T. Thach, S. Ali, C. de Vallavieille-Pope, A. F. Justesen, M. S. Hovmoller
article
Fungal Genetics and Biology, 2016, 87, pp.1 - 8. ⟨10.1016/j.fgb.2015.12.014⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02632544/file/POPE%202016%20Fungal%20genetics_1 BibTex
titre
Colletotrichum higginsianum extracellular LysM proteins play dual roles in appressorial function and suppression of chitin-triggered plant immunity.
auteur
Hiroyuki Takahara, Stéphane Hacquard, Anja Kombrink, H Bleddyn Hughes, Vivek Halder, Guillaume Robin, Kei Hiruma, Ulla Neumann, Tomonori Shinya, Erich Kombrink, Naoto Shibuya, Bart P H J Thomma, Richard O'Connell
article
New Phytologist, 2016, 211 (4), pp.1323-37. ⟨10.1111/nph.13994⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02639587/file/Takahara%20et%20al%202016%20New%20Phytologist_1.pdf BibTex
titre
Chemically Induced Cryptic Sesquiterpenoids and Expression of Sesquiterpene Cyclases in Botrytis cinerea Revealed New Sporogenic (+)-4-Epieremophil-9-en-11-ols
auteur
Cristina Pinedo, Javier Moraga, Javier Barua, Victoria E. Gonzalez-Rodriguez, Josefina Aleu, Rosa Duran-Patron, Antonio J. Macias-Sanchez, James R. Hanson, Muriel Viaud, Rosario Hernández-Galán, Carlos Garrido, Isidro G. Collado
article
ACS Chemical Biology, 2016, 11 (5), pp.1391 - 1400. ⟨10.1021/acschembio.5b00931⟩
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Conference papers

titre
Exemple de « vieilles » lignées asexuées chez les rouilles
auteur
Ronan Becheler, Henriette Goyeau, Solenn Stoeckel, Fabien Halkett
article
Réunion 2016 du groupe "champignons phytopathogènes", Nov 2016, Paris, France
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titre
Transcriptional and chromatin-based control of effector gene expression in the plant pathogenic fungus Leptosphaeria maculans
auteur
Jessica L. Soyer, Colin Clairet, Jonathan J. Grandaubert, Marie-Helene Balesdent, Lanelle R Connolly, Michael Freitag, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal
article
Effectome meeting 2016, Nov 2016, Lauret, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02795171/file/Fudal%20effectome%202%202016_1.pdf https://hal.inrae.fr/hal-02795171/file/Fudal%20effectome%202%202016_2.doc BibTex
titre
Investigating the involvement of the heterochromatic-associated histone modification, H3K27me3, in the control of effector gene expression in Leptospharia maculans
auteur
Colin Clairet, Jessica L. Soyer, Francoise Blaise, Julie Gervais, Isabelle Fudal
article
Effectome meeting 2016, Nov 2016, Lauret, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02795172/file/Clairet%20et%20al%20Effectome%202016_1.pdf https://hal.inrae.fr/hal-02795172/file/Clairet%20et%20al%20Effectome%202016_2.doc BibTex
titre
In planta localisation of Leptosphaeria maculans effectors and identification of their plant targets
auteur
Claire-Line Marais, Yohann Petit, Francoise Blaise, Benedicte Ollivier, Julie Gervais, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent, Karine Blondeau, Noureddine Lazar, Herman van Tilbeurgh, Isabelle Fudal
article
Effectome meeting 2016, Nov 2016, Lauret, France
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titre
Taking advantage of architectural diversity to improve control of splash dispersed disease in cultivar mixtures : a modelling study based on field experimentation
auteur
Tiphaine Vidal, Anne-Lise Boixel, Christophe Gigot, Claude Pope de Vallavieille, Laurent Huber, Sébastien Saint-Jean
article
FSPMA2016, International Conference on Functional-Structural Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications, IEEE, FSPMA 2016., Nov 2016, Qingdao, China
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titre
Quantification of the architectural effects of wheat canopies on the interception of splash dispersed spores
auteur
Sébastien Saint-Jean, Tiphaine Vidal, Christophe Gigot, Pauline Lusley, Guillaume Girardin, Corinne Robert, Laurent Huber, Claude Pope de Vallavieille
article
FSPMA2016, International Conference on Functional-Structural Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications, IEEE, FSPMA 2016., Nov 2016, Qingdao, China
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BibTex
titre
Sesquiterpenes in the Botrytis cinerea life cycle. Characterising the missing link in the ABA biosynthesis
auteur
Isidro G Collado, Muriel Viaud
article
XVII International Botrytis Symposium, Oct 2016, Santa Cruz, Chile. p.58
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BibTex
titre
Sequiterpene cyclase STCS: the missing link in the biosynthesis of abscisic acid
auteur
Inmaculada Izquierdo-Bueno, Gabriel Franco dos Santos, Victoria E. Gonzalez-Rodriguez, Berengere Dalmais, Jean-Marc Pradier, Pascal Le Pecheur, Javier Moraga, Rosario Sanchez, Maria Carbu, Jesus M Cantoral, Muriel Viaud, Isidro G. Collado
article
XVII International Botrytis Symposium, Oct 2016, Santa Cruz, Chile. p.38
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BibTex
titre
Quantitative comparative phosphoproteomics to decipher signal transduction
auteur
Jaafar Kilani, Marlène Davanture, Michel Zivy, Sabine Fillinger
article
XVII International Botrytis Symposium, Oct 2016, Santa Cruz, United States. p. 46
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BibTex
titre
Looking through the eyes of Botrytis:Molecular genetics of photoperception and its consequences
auteur
Kim C. Cohrs, Adeline Simon, Muriel Viaud, Julia Schumacher
article
XVII International Botrytis Symposium, Oct 2016, Santa Cruz, Chile. p.22
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BibTex
titre
A network of light-responsive transcription factors regulates asexual differentiation n Botrytis cinerea
auteur
Kim C. Cohrs, Beate Brandhoff, Adeline Simon, Muriel Viaud, Julia Schumacher
article
XVII International Botrytis Symposium, Oct 2016, Sana Cruz, Chile. p. 32
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BibTex
titre
Fungicide resistance in Botrytis cinerea: updates on resistance mechanisms and management
auteur
Anne-Sophie Walker, Stefania Pollastro
article
XVII International Botrytis Symposium, Oct 2016, Sana Cruz, Chile. p.96
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BibTex
titre
The botrydial (BOT) and botcinic acid (BOA) biosynthetic gene clusters dispolay a bipartite genomic structure and are controlled by putatiave pathway-specific ZN(II)2CYS6 Transcription factors
auteur
Antoine Porquier, Guillaume Morgant, J. Moraga, Berengere Dalmais, Isabelle Luyten, Adeline Simon, Hind Sghyer, Jean-Marc Pradier, Pascal Le Pecheur, Joëlle Amselem, Isidro G Collado, Muriel Viaud
article
XVII International Botrytis Symposium, Oct 2016, Santa Cruz, Chile. p.49
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BibTex
titre
Pantoea eucalyptii induces systemic resistance in Arabidopsis thaliana against Botrytis cinerea by priming defense responses
auteur
Fernando M Romero, Maria Marina, Franco R. Rossi, Muriel Viaud, Fernando L. Pieckenstain
article
XVII International Botrytis Symposium, Oct 2016, Santa Cruz, Chile. p.80
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BibTex
titre
Ecotoxicological impact of an antibiotic mixture on soil nitrogen cycling microbial guilds
auteur
Olivier Crouzet, Anais Goulas, Agnès Richaume-Jolion, Thomas Pommier, Christelle Marrauld, Julie Gervais, Claire-Sophie Haudin, Sylvie Nelieu, Marjolaine Deschamps, Ghislaine Delarue, Pierre Benoit
article
First International Conference on Risk Assessment of Pharmaceuticals in the Environment (ICRAPHE), Sep 2016, Paris, France
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BibTex
titre
Increasing species richness and genetic diversity in agriculture: results of the Wheatamix project
auteur
Jerome Enjalbert, Vincent Allard, Bruno Andrieu, Sébastien Barot, Julie Borg, Amélie Cantarel, M Feret, Céline Cervek, François Coléno, Claude Pope de Vallavieille, Dominique Descoureaux, Florence Dubs, Nathalie Galic, Arnaud Gauffreteau, J.D. Gilet, Isabelle Goldringer, Mourad Hannachi, G Houivet, Sophie Pin, Marie-Helene Jeuffroy, Christian Kerbiriou, Pierre Labarthe, Jean Christophe Lata, Christophe Lecarpentier, L Lejars, B. Lemain, Stephane Lemarié, F. Leny, Xavier Le Roux, Isabelle Le Viol, Christophe Montagnier, Audrey Niboyet, Bernard Omon, Sébastien Piaud, Franck Poly, Thomas Pommier, Emmanuelle Porcher, Sébastien Saint-Jean, Sandrine Salmon, Didier Tropee, Tiphaine Vidal
article
5. International EcoSummit Congress - Ecological Sustainability: Engineering Change, Aug 2016, Montpellier, France. 40 p
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https://hal.science/hal-01799552/file/2016_WHEATAMIX_finalV_1.pdf BibTex
titre
Adaptation to fungicides in the wheat pathogen Zymoseptoria tritici: a multidisciplinary study of multi drug resistance.
auteur
Sabine Fillinger, Selim Omrane, Colette C. Audeon, Amandine Ignace, Clémentine Duplaix, Lamia Aouini, Gert Kema, Anne-Sophie Walker
article
11th national meeting of the SFBV, Jul 2016, Angers, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02796760/file/F7B6FF83-B149-4FA2-B161-7AF0EB03EF2C_1 https://hal.inrae.fr/hal-02796760/file/Abstract_2 BibTex
titre
Colletotrichum tofieldiae, a pathogenic fungus turned plant growth-promoting endophyte
auteur
Richard O'Connell
article
Seminar of the Biocentre Klein Flottbek, University of Hamburg, Jun 2016, Hamburg, Germany
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BibTex
titre
When foes become friends: a Colletotrichum endophyte that enhances plant growth
auteur
Richard O'Connell
article
SFB seminar series of Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, May 2016, Halle, Germany
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https://hal.inrae.fr/hal-02795072/file/When%20foes%20become%20friends%20Richard_1.pdf https://hal.inrae.fr/hal-02795072/file/When%20foes%20become%20friends%20Richard_2.docx BibTex
titre
Population genetic structure and host specialization in the fungal plant pathogen Zymoseptoria tritici
auteur
Lilian L. Gout, Johann J. Confais, M. Massot, Aurélie Ducasse, R. Valade
article
9.International symposium on Septoria diseases of cereals, Apr 2016, Paris, France. p.16
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02799804/file/GOUT%201_1.pdf BibTex
titre
Resolution of population structure in the wheat pathogen Zymoseptoria tritici using either 12 or 4000 microsatellite markers
auteur
Johann J. Confais, Aurélie Ducasse, Anne Genissel, Lilian Gout
article
9.International symposium on Septoria diseases of cereals, Apr 2016, Paris, France. p.68
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titre
Investigation of the mechanisms of sexual reproduction in Zymoseptoria tritici and their consequences on STB dynamics
auteur
Frédéric Suffert, David Morais, Ghislain Delestre, Sandrine Gelisse, Valerie Laval, Ivan I. Sache
article
9.International symposium on Septoria diseases of cereals, Apr 2016, Paris, France. p.28
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https://hal.inrae.fr/hal-02796581/file/SUFFERT_1.pdf BibTex
titre
Genome dynamic and accessory elements in the plant pathogenic fungus Zymoseptoria tritici
auteur
Eva H Stukenbrock, Mareike Moeller, Klaas Schotanus, Jessica L. Soyer, Michael Freitag
article
9.International symposium on Septoria diseases of cereals, Apr 2016, Paris, France. p.12
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https://hal.inrae.fr/hal-02793895/file/STUKENBROCK_1.pdf BibTex
titre
Spatio-temporal dynamics of fungicide resistance in French populations of Zymoseptoria tritici
auteur
Anne-Sophie Walker, Bertrand Oudot, Florence F. Carpentier
article
9.International symposium on Septoria diseases of cereals, Apr 2016, Paris, France. p.21
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https://hal.inrae.fr/hal-02801254/file/WALKER_1.pdf BibTex
titre
Durable strategies for fungicides use: lessons from the past and leads for improving the future Preliminary results from the FONDU project
auteur
Anne-Sophie Walker, Mourad Hannachi, Sylvie Charlot, Stephane Lemarié, Anne Deredec, Florence Carpentier, Olivier David, François Coléno, Frédérique Angevin, Marie-France Corio-Costet
article
9.International symposium on Septoria diseases of cereals, Apr 2016, Reinhardsbrunn, Germany. 141 p
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titre
Leaf blotch on durum wheat in France:characterization of the species complex responsible of the disease with a focus on Parastagonospora nodorum
auteur
Romain Valade, Thomas Caparroy, Cindy Vitry, Oriane Beaudouin, Johann J. Confais, Lilian L. Gout
article
9.International symposium on Septoria diseases of cereals, Apr 2016, Paris, France. p.31
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https://hal.inrae.fr/hal-02799258/file/CONFAIS%202_1.pdf BibTex
titre
The power of GWAS to detect natural genetic variation associated with pathogeny in Zymoseptoria tritici
auteur
Anne Genissel, Marie-Pierre Guillot, Johann J. Confais, Lilian Gout, Marc-Henri Lebrun
article
9.International symposium on Septoria diseases of cereals, Apr 2016, Paris, France. p.17
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BibTex
titre
Reduction of Septoria leaf blotch propagation in cultivar mixtures: exploring mechanisms through controlled conditions experimentation and modelling
auteur
Tiphaine Vidal, Pauline Lusley, Marc Leconte, Claude C. Pope de Vallavieille, Laurent Huber, Sébastien Saint-Jean
article
9.International symposium on Septoria diseases of cereals, Apr 2016, Paris, France. p.26
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BibTex
titre
Mixing wheat varieties with contrasted architecture to reduce Septoria tritici blotch splash-dispersed epidemics
auteur
Anne-Lise Boixel, Tiphaine Vidal, Pauline Lusley, Brigitte Durand, Marc Leconte, Claude C. Pope de Vallavieille, Laurent Huber, Sébastien Saint-Jean
article
9.International symposium on Septoria diseases of cereals, Apr 2016, Paris, France. p.74
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https://hal.science/hal-01564562/file/BOIXEL_1.pdf BibTex
titre
Microbiome diversity in crop debris and the search for micro-organisms acting on Zymoseptoria tritici and Leptosphaeria maculans primary inoculum
auteur
Lydie Kerdraon, Marie-Helene Balesdent, Matthieu Barret, Valerie Laval, Frederic Suffert
article
9.International symposium on Septoria diseases of cereals, Apr 2016, Paris, France. p.83
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https://hal.science/hal-01456000/file/KERDRAON_1.pdf BibTex
titre
Response of french Zymoseptoria tritici populations to temperature at different spatio-temporal scales
auteur
Anne-Lise Boixel, Jean Legeay, Ivan I. Sache, Michaël Chelle, Frédéric Suffert
article
9.International symposium on Septoria diseases of cereals, Apr 2016, Paris, France. p.30
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https://hal.inrae.fr/hal-02796858/file/BOIXEL%202_1.pdf BibTex
titre
Transcriptional responses to white light in Botrytis cinerea involve the GATAtranscription factors BcWCL1 and BcLTF1 and the MAP kinase BcSAK1
auteur
Julia Schumacher, Beate Brandhoff, Adeline A. Simon, Kim Christopher Cohrs, Muriel Viaud
article
ECFG13 European conference on fungal genetics, Apr 2016, PARIS-LA VILETTE, France. p.51
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https://hal.inrae.fr/hal-02795744/file/SCHUMACHER%20ECFG13%202016_1.pdf BibTex
titre
LeptoLife: deciphering the life and pathogenicity cycle of a fungal phytopathogen using metatranscriptomics
auteur
Marie-Helene Balesdent, Fabien Dutreux, Corinne Cruaud, Isabelle Fudal, Michel Meyer, Régine Delourme, Thierry Rouxel
article
ECFG13 European conference on fungal genetic, Apr 2016, PARIS - LA VILLETTE, France. p.188
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https://hal.science/hal-01462736/file/BALESDENT%20ECFG132%202016_1.pdf BibTex
titre
Colletotrichum tofieldiae: an Arabidopsis root endophyte that enhances plant growth by transferring phosphorus
auteur
Richard O'Connell
article
Colletotrichum Satellite Meeting, Apr 2016, Paris, France
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BibTex
titre
In silico analysis of the transcription factor repertoire in Leptosphaeria maculans 'brassicae' to identify putative regulators of pathogenicity
auteur
Jessica Louise Soyer, Jonathan Grandaubert, Rohan G. T. Lowe, Juliette Linglin, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal
article
ECFG13. European conference on fungal genetics, Apr 2016, PARIS LA VILLETTE, France. p.375
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https://hal.science/hal-01462737/file/SOYER%20ECFG13%202016_1.pdf BibTex
titre
Several mutations of Zymoseptoria tritici field strains lead to MFS1 overexpression and multi-drug-resistance (MDR)
auteur
Sabine Fillinger, Selim Omrane, Colette C. Audeon, Amandine Ignace, Clémentine Duplaix, Lamia Aouini, Gert Kema, Anne-Sophie Walker
article
ECFG13. European conference on fungal genetics, Apr 2016, PARIS LA VILLETTE, France. p.94
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https://hal.inrae.fr/hal-02796869/file/FILLINGER%20ECFG13%202016_1.pdf BibTex
titre
Specific regulation of Botrydial and Botcinic acid gene clusters in Botrytis cinerea
auteur
Antoine Porquier, Guillaume G. Morgant, Berengere Dalmais, Adeline A. Simon, Muriel Viaud
article
ECFG13 European conference on fungal genetic, Apr 2016, PARIS-VILLETTE, France. p.89
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https://hal.inrae.fr/hal-02797016/file/PORQUIER%20ECFG13%202016_1.pdf BibTex
titre
Transcriptional and chromatin-based control of effector gene expression in the plant pathogenic fungus Leptosphaeria maculans
auteur
Jessica L. Soyer, Mennat El Ghalid, Jonathan Grandaubert, Marie-Helene Balesdent, Lanelle R Connolly, Michael Freitag, Thierry T. Rouxel, Isabelle Fudal-Grolier Fudal
article
ECFG13. European conference on fungal genetics, Apr 2016, Paris, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02799514/file/Fudal%20ECFG%202016_suite_1.pdf BibTex
titre
Impact écotoxicologique d’un antibiotique sur les processus microbiens du cycle de l’azote, dans des sols amendés par des produits résiduaires organiques
auteur
Olivier Crouzet, Anais Goulas, Agnès Richaume, Christelle Marrauld, Julie Gervais, Claire-Sophie Haudin, Pierre Benoit, Sylvie Nazaret
article
3èmes Journées d’Écotoxicologie Microbienne, Mar 2016, Valence, France
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https://hal.science/hal-01608676/file/Recueil-r%C3%A9sum%C3%A9s-EcotoxicoMic-2016_1.pdf BibTex
titre
Wheat effector assisted breeding for resistance to fungal pathogens (WEAB)
auteur
Thierry T. Langin, Thomas T. Kroj, James Cockram, Richard Oliver, Gert Kema, Romain Valade, Sebastian Praud, Valérie Laurent, Laure Duchalais, Marc-Henri M.-H. Lebrun
article
3. Annual Conference of the COST Action Sustain (FA1208), Feb 2016, Banyuls-sur-Mer, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02743736/file/Publis16-bgpi-024_langin_wheat_1.pdf BibTex
titre
Associer des variétés de blé différant fortement par leur architecture : une piste d’amélioration de l’efficacité des associations variétales dans la réduction de la septoriose du blé ?
auteur
Tiphaine Vidal, Anne-Lise Boixel, Pauline Lusley, Marc Leconte, Claude C. Pope de Vallavieille, Laurent Huber, Sébastien Saint-Jean
article
Journées Jean Chevaugeon 2016 (JJC) - 11èmes Rencontres de Phytopathologie - Mycologie, Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2016, Aussois, France. p.32
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https://hal.science/hal-01564553/file/Recueil_JJC2016_1.pdf BibTex
titre
Influence de facteurs biotiques et abiotiques sur l’expression d’effecteurs du champignon Leptosphaeria maculans
auteur
Michel M. Meyer, Ahmed Salim A. S. Bourras, Marie-Helene Balesdent, Thierry T. Rouxel
article
Journées Jean Chevaugeon 2016 (JJC) - 11èmes Rencontres de Phytopathologie - Mycologie, Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2016, Aussois, France. p.50
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https://hal.inrae.fr/hal-02800749/file/Recueil_JJC2016_1.pdf BibTex
titre
Régulation spécifique des clusters botrydial et acide botcinique chez Botrytis cinerea
auteur
Antoine Porquier, Guillaume G. Morgant, Berengere Dalmais, Adeline A. Simon, Muriel Viaud
article
Journées Jean Chevaugeon 2016 (JJC) - 11èmes Rencontres de Phytopathologie - Mycologie, Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2016, Aussois, France. 58 p
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https://hal.inrae.fr/hal-02798983/file/Recueil_JJC2016_1.pdf BibTex
titre
Spécialisation d’hôte et structuration des populations de Zymoseptoria tritici
auteur
Johann J. Confais, A. Massot, Aurélie Ducasse, Romain Valade, Lilian Gout
article
Journées Jean Chevaugeon 2016 (JJC) - 11èmes Rencontres de Phytopathologie - Mycologie, Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2016, Aussois, France. p.15
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https://hal.inrae.fr/hal-02796908/file/Recueil_JJC2016_1.pdf BibTex
titre
Wheat effector assisted breeding for resistance to fungal pathogens (WEAB)
auteur
Marc-Henri M.-H. Lebrun, Thierry T. Langin, Thomas T. Kroj, J. Cockram, R. Oliver, G. Kema, R. Valade, S. Praud, V. Laurent, L. Duchalais, V. Lein
article
Journées Jean Chevaugeon 2016 (JJC) - 11èmes Rencontres de Phytopathologie - Mycologie, Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2016, Aussois, France. pp.49
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https://hal.inrae.fr/hal-02801728/file/Recueil_JJC2016_1.pdf BibTex
titre
Global analysis of the stress signalling pathway by phosphoproteomics reveals a new pathogenic factor in Botrytis cinerea
auteur
Jaafar Kilani, Marlène M. Davanture, Michel M. Zivy, Sabine Fillinger
article
Journées Jean Chevaugeon 2016 (JJC) - 11èmes Rencontres de Phytopathologie - Mycologie, Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2016, Aussois, France. p.45
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https://hal.inrae.fr/hal-02800126/file/Recueil_JJC2016_1.pdf BibTex
titre
A two genes – for – one gene interaction between Leptosphaeria maculans and Brassica napus
auteur
Yohann Petit, Alexandre A. Degrave, Michel Meyer, Francoise Blaise, Benedicte Ollivier, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal, Marie-Helene Balesdent
article
Journées Jean Chevaugeon 2016. 11ème Rencontres de Phytopahologie-Mycologie., Jan 2016, Aussois, France. p.44
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https://hal.science/hal-01455993/file/Recueil_JJC2016_1.pdf BibTex
titre
La fusariose de la vanille : identification, éléments d’étiologie et étude de la dynamique épidémique dans une zone de production polynésienne, en comparaison avec d’autres pathologies, selon un suivi de cohorte
auteur
T. Atuahiva, Sayuj Koyyappurath, A. Labat, Hélène Batina, Valerie Laval, Ivan I. Sache, E. Liew, Claude C. Alabouvette, Michel Grisoni, C. Dillmann, Jack Legrand, Michel Dron
article
Journée Jean Chevaugeon 2016. 11ème Rencontres de Phytopathologie-Mycologie, Jan 2016, Aussois, France. 36 p
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https://hal.inrae.fr/hal-02801576/file/Recueil_JJC2016_1.pdf BibTex
titre
Wheat leaf rust survey in France:2015 update
auteur
Henriette Goyeau
article
European rust virulence survey and research meeting, 2016, Cambridge, United Kingdom
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BibTex
titre
Structure spatio-temporelle de la diversité cultivée du blé tendre et de ses déterminants potentiels : Étude de cas en France
auteur
Rémi Perronne, David Makowski, Céline Schott, Mourad Hannachi, Robin Goffaux, Pierre Montalent, Jean-Noel Aubertot, Vincent Cellier, Stephane Lemarié, Aline Fugeray-Scarbel, Claude Pope de Vallavieille, Marc Leconte, Jerome Enjalbert, Juan Fernández-Manjarrés, Marie Stetzler, Solene Diguet, Nicolas Poulain, Isabelle Goldringer
article
Petit Pois Déridé – 37ème édition, Université de Picardie Jules Verne (UPJV). Amiens, FRA., 2016, Amiens, France. 31 p
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https://hal.inrae.fr/hal-02801578/file/2016_PERRONNE-SCHOTT_diversite_ble_colloquePetit%20Pois%20Deride_26_08_2016_1.pdf BibTex

Book sections

titre
Regulation of Secondary metabolism in the gray mold fungus Botrytis cinerea
auteur
Muriel Viaud, Antoine Porquier, Adeline A. Simon, Julia Schumacher
article
Host-Pathogen Interaction. Microbial Metabolism, Pathogenicity and Antiinfectives, 6, Wiley-VCH, 450 p., 2016, Drug Discovery in Infectious Diseases, 978-3-527-68239-3
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https://hal.inrae.fr/hal-02795159/file/VIAUD%202016%20HOST%20PATHOGEN%20INTERACTION%20OUV_1.pdf BibTex
titre
Chemical Control and Resistance Management of Botrytis Diseases
auteur
Sabine Fillinger, Anne Sophie A. S. Walker
article
Botrytis – the Fungus, the Pathogen and its Management in Agricultural Systems, Springer International Publishing, 2016, 978-3-319-23370-3. ⟨10.1007/978-3-319-23371-0_10⟩
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BibTex
titre
Secondary Metabolism in Botrytis cinerea: Combining Genomic and Metabolomic Approaches
auteur
Isidro G. Collado, Muriel Viaud
article
Botrytis – the Fungus, the Pathogen and its Management in Agricultural Systems, Springer International Publishing, 2016, 978-3-319-23370-3. ⟨10.1007/978-3-319-23371-0_15⟩
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BibTex
titre
Diversity Within and Between Species of Botrytis
auteur
Anne Sophie A. S. Walker
article
Botrytis – the Fungus, the Pathogen and its Management in Agricultural Systems, Springer International Publishing, 2016, 978-3-319-23370-3. ⟨10.1007/978-3-319-23371-0_6⟩
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titre
Botrytis, the Good, the Bad and the Ugly
auteur
Yigal Elad, Melané Vivier, Sabine Fillinger
article
Botrytis – the Fungus, the Pathogen and its Management in Agricultural Systems, Springer International Publishing, 2016, 978-3-319-23370-3. ⟨10.1007/978-3-319-23371-0⟩
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Habilitation à diriger des recherches

titre
Métabolisme secondaire chez le champignon phytopathogène nécrotrophe et polyphage Botrytis cinerea
auteur
Muriel Viaud
article
Sciences du Vivant [q-bio]. Université Paris Sud - Paris 11, 2016
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Books

titre
Botrytis – the fungus, the pathogen and its management in agricultural systems
auteur
Sabine Fillinger, Elad Yigal
article
Springer International Publishing, 486 p., 2016, 978-3-319-23370-3. ⟨10.1007/978-3-319-23371-0⟩
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Poster communications

titre
Population structure and host specialization in Botrytis cinerea
auteur
Anne-Sophie Walker, Alex Mercier, Marguerite Cuel, Jean-Marc Pradier, Adeline Simon, Muriel Viaud, Pierre Gladieux
article
17. International Botrytis Symposium, Oct 2016, Santa-Cruz, Chile. , 178 p., 2016, Abstract book : XVII International Botrytis Symposium
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titre
Different waves of effector genes with contrasted genomic location are expressed by Leptosphaeria maculans during cotyledon and stem colonization of oilseed rape
auteur
Julie Gervais, Thierry T. Rouxel, Marie-Helene Balesdent, Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Clémence Plissonneau
article
2016 IS-MPMI XVII CONGRESS, Jul 2016, Portland, Oregon, United States. 2016
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https://hal.inrae.fr/hal-02800290/file/2016_ISMPMI_Program_Book_1.pdf BibTex
titre
A two genes – for – one gene interaction between Leptosphaeria maculans and Brassica napus
auteur
Yohann Petit, Alexandre A. Degrave, Michel Meyer, Francoise Blaise, Benedicte Ollivier, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal, Marie-Helene Balesdent
article
2016 IS-MPMI XVII CONGRESS, Jul 2016, Portland, United States. 2016
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https://hal.inrae.fr/hal-02795249/file/Poster%20Petit%20Y%20MPMI%202016_1.pdf https://hal.inrae.fr/hal-02795249/file/Poster%20Petit%20Y%20MPMI%202016_2.docx BibTex
titre
Assessing the risk of recombination between MDR and specific resistance towards SDHIs in Zymoseptoria tritici
auteur
Gwilherm Gazeau, Christiane Auclair, Ghislain Delestre, Frédéric Suffert, Anne-Sophie Walker
article
18th International Reinhardsbrunn symposium on modern fungicides and antifungal compounds, Apr 2016, Friedrichroda, Germany.
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BibTex
titre
Wheat effector assisted breeding for resistance to fungal pathogens
auteur
Marc-Henri M.-H. Lebrun, Thierry T. Langin, Thomas T. Kroj, J. Cockram, R. Oliver, G. Kema, R. Valade, S. Praud, V. Laurent, L. Duchalais, V. Lein
article
9.International symposium on Septoria diseases of cereals, Apr 2016, Paris, France. p.123, 2016
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https://hal.inrae.fr/hal-02800809/file/LEBRUN%20MH_1.pdf BibTex
titre
Colletotrichum higginsianum extracellular LysM proteins play dual roles in appressorial function and suppression of chitin-triggered plant immunity
auteur
Hiroyuki Takahara, Stéphane Hacquard, Anja Kombrink, Kei Hiruma, Guillaume Robin, Vivek Halder, Bleddyn Hughes, Tomonori Shinya, Ulla Neumann, Richard O'Connell
article
ECFG13. European conference on fungal genetics, Apr 2016, Paris, France. p. 182, 2016
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https://hal.inrae.fr/hal-02796861/file/Abstract%20ChELPs_1.pdf https://hal.inrae.fr/hal-02796861/file/Abstract%20ChELPs_2.docx BibTex
titre
Biotic and abiotic factors influence the expression of effectors in Leptosphaeria maculans during axenic growth
auteur
Michel M. Meyer, Ahmed Salim A. S. Bourras, Clémence Plissonneau, Julie Gervais, Marie-Helene Balesdent, Thierry T. Rouxel
article
ECFG13. European conference on fungal genetics (2016), Apr 2016, PARIS LA VILLETTE, France. p.309, 2016
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https://hal.inrae.fr/hal-02794169/file/MEYER%20ECFG13%202016_1.pdf BibTex
titre
The role of histone-methyltransferases KMT1 and KMT6 in chromatin organization and gene regulation in Zymoseptoria tritici
auteur
Mareike Möller, Jessica L. Soyer, Klaas Schotanus, Michael Freitag, Eva H Stukenbrock
article
ECFG13. European conference on fungal genetics, Apr 2016, PARIS LA VILLETTE, France. p.118, 2016
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02801736/file/ECFG13%20-%20Abstract%20Book%20Soyer%20JL_1.pdf BibTex
titre
Different waves of effector genes with contrasted genomic location are expressed by Leptosphaeria maculans during cotyledon and stem colonization
auteur
Julie Gervais, Thierry T. Rouxel, Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Marie-Helene Balesdent
article
ECFG13. European conference on fungal genetics, Apr 2016, PARIS LA VILLETTE, France. p.155, 2016
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02796487/file/GERVAIS%20ECFG13%2020165_1.pdf BibTex
titre
Survival trade-offs in plant roots during colonization by closely related beneficial and pathogenic fungi
auteur
Stéphane Hacquard, Kei Hiruma, Barbara Kracher, Nina Gerlach, Soledad Sacristán, Ryohei Thomas Nakano, Michael R Thon, Marcel Bucher, Richard O'Connell, Paul Schulze-Lefert
article
ECFG13. European conference on fungal genetics, Apr 2016, PARIS LA VILLETTE, France. p.228, 2016
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02801397/file/O%27CONNELL%20ECFG13%202016_1.pdf BibTex
titre
Regulation of secondary metabolism in the anthracnose fungus Colletotrichum higginsianum
auteur
Jean-Felix Dallery, Emilie Adelin, Sandrine Pigné, Olivier Lespinet, Jamal Ouazzani, Erich Kombrink, Marc-Henri M.-H. Lebrun, Richard O'Connell
article
ECFG13 European conference on fungal genetic, Apr 2016, PARIS LA VILLETTE, France. p.551, 2016
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https://hal.inrae.fr/hal-02801217/file/LEBRUN%20ECFG13%202016_1.pdf BibTex
titre
Genetic and biochemistry analyses of the natural resistance of the fungicide fenhexamid in the phytopathogenic fungus Botrytis pseudocinerea
auteur
Alexis A. Billard, Saad Azeddine, Jocelyne J. Bach, Colette C. Audeon, Catherine C. Lanen, Sabine Fillinger, Danièle D. Debieu
article
ECFG13. European conference on fungal genetics, Apr 2016, PARIS LA VILLETTE, France. p.581, 2016
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https://hal.inrae.fr/hal-02797065/file/DEBIEU%20ECFG13%202016_1.pdf BibTex
titre
Unusual evolutionary mechanisms to escape Effector-Triggered-Immunity in the fungal phytopathogen Leptosphaeria maculans
auteur
Clémence Plissonneau, Bénédicte B. Ollivier, Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Thierry T. Rouxel, Marie-Helene Balesdent
article
ECFG13. European conference on fungal genetics, Apr 2016, PARIS-LA VILLETTE, France. p.490, 2016
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https://hal.inrae.fr/hal-02800552/file/PLISSONNEAU%20ECFG13%202016_1.pdf BibTex
titre
A two genes – for – one gene interaction between Leptosphaeria maculans and Brassica napus
auteur
Yohann Petit, Alexandre A. Degrave, Michel M. Meyer, Francoise F. Blaise, Bénédicte B. Ollivier, Thierry T. Rouxel, Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Marie-Helene Balesdent
article
ECFG13. European conference on fungal genetics, Apr 2016, PARIS LA VILLETTE, France. p.201, 2016
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https://hal.inrae.fr/hal-02795706/file/PETIT%20ECFG13%202016_1.pdf BibTex
titre
Resolution provided by microsatellite markers in detecting population structure of the wheat pathogen Zymoseptoria tritici
auteur
Johann J. Confais, Aurélie Ducasse, Anne Genissel, Lilian L. Gout
article
ECFG13. European conference on fungal genetics, Apr 2016, PARIS LA VILLETTE, France. p.515, 2016
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https://hal.inrae.fr/hal-02794992/file/CONFAIS%20ECFG13%202016_1.pdf BibTex
titre
Detecting molecular footprint of local adaptation in Zymoseptoria tritici
auteur
Anne Genissel, Lilian L. Gout
article
ECFG13 European conference on fungal genetics, Apr 2016, PARIS LA VILLETTE, France. p.509, 2016
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https://hal.inrae.fr/hal-02792403/file/GENISSEL%20ECFG13%202016_1.pdf BibTex
titre
Candidate effector proteins of the anthracnose pathogen Colletotrichum higginsianum target plant peroxisomes
auteur
Guillaume Robin, Richard O'Connell
article
ECFG13. European conference on fungal genetics, Apr 2016, PARIS LA VILLETTE, France. p.186, 2016
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02796040/file/ROBIN%20ECFG13%202016_1.pdf BibTex
titre
Population genetic structure and host specialization in the fungal plant pathogen Zymoseptoria tritici
auteur
Lilian L. Gout, Johann J. Confais, Marie Massot, Aurélie Ducasse, Romain Valade
article
ECFG13 European conference on fungal genetic, 2016, PARIS LA VILLETTE, France. p.275, 2016
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Theses

titre
Etude des mécanismes de régulation du métabolisme secondaire chez Botrytis cinerea.
auteur
Antoine Porquier
article
Biochimie, Biologie Moléculaire. Université Paris Saclay (COmUE), 2016. Français. ⟨NNT : 2016SACLS480⟩
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https://theses.hal.science/tel-01756394/file/75103_PORQUIER_2016_archivage.pdf BibTex

2015

Journal articles

titre
Systematic gene deletion and functional characterization of histidine kinase phosphorelay receptors (HKRs) in the human pathogenic fungus Aspergillus fumigatus
auteur
F. Chapeland-Leclerc, A. Dilmaghani, L. Ez-Zaki, S. Boisnard, B. da Silva, T. Gaslonde, F.H. Porée, G. Ruprich-Robert
article
Fungal Genetics and Biology, 2015, 84, pp.1-11. ⟨10.1016/j.fgb.2015.09.005⟩
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titre
Crystal structure of the effector AvrLm4-7 of Leptosphaeria maculans reveals insights into its translocation into plant cells and recognition by resistance proteins.
auteur
Karine Blondeau, Françoise Blaise, Marc Graille, Shiv D Kale, Juliette Linglin, Bénédicte Ollivier, Audrey Labarde, Noureddine Lazar, Guillaume Daverdin, Marie-Hélène Balesdent, Danielle H y Choi, Brett M Tyler, Thierry Rouxel, Herman van Tilbeurgh, Isabelle Fudal
article
Plant Journal, 2015, 83 (4), pp.610-24. ⟨10.1111/tpj.12913⟩
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titre
Fusarium oxysporum f. sp. radicis-vanillae is the causal agent of root and stem rot of vanilla
auteur
Sayuj Koyyappurath, T. Atuahiva, Roxane Le Guen, H. Batina, Sandrine Le Squin, N. Gautheron, V. Edel Hermann, J. Peribe, Michel Jahiel, Christian Steinberg, E. C. Y. Liew, Claude Alabouvette, Pascale Besse, Michel M. Dron, Ivan I. Sache, Valerie Laval, Michel Grisoni
article
Plant Pathology, 2015, 65 (4), pp.612--625. ⟨10.1111/ppa.12445⟩
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titre
The Top 10 oomycete pathogens in molecular plant pathology
auteur
Sophien Kamoun, Oliver Furzer, Jonathan D. G. Jones, Howard S. Judelson, Gul Shad Ali, Ronaldo J. D. Dalio, Sanjoy Guha Roy, Leonardo Schena, Antonios Zambounis, Franck Panabières, David Cahill, Michelina Ruocco, Andreia Figueiredo, Xiao-Ren Chen, Jon Hulvey, Remco Stam, Kurt Lamour, Mark Gijzen, Brett M. Tyler, Niklaus J. Grünwald, M. Shahid Mukhtar, Daniel F. A. Tomé, Mahmut Tör, Guido van den Ackerveken, John Mcdowell, Fouad Daayf, William Fry, Hannele Lindqvist-Kreuze, Harold J. G. Meijer, Benjamin Petre, Jean Ristaino, Kentaro Yoshida, Paul R. J. Birch, Francine Govers
article
Molecular Plant Pathology, 2015, 16 (4), pp.413-434. ⟨10.1111/mpp.12190⟩
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titre
THE NATURAL HISTORY OF MODEL ORGANISMS C. elegans outside the Petri dish
auteur
Lise Frezal, Marie-Anne Félix
article
eLife, 2015, 4, ⟨10.7554/eLife.05849.001⟩
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https://hal.science/hal-02332419/file/2015%20Frezal%20eLife.pdf BibTex
titre
Colletotrichum orbiculare FAM1 Encodes a Novel Woronin Body-Associated Pex22 Peroxin Required for Appressorium-Mediated Plant Infection
auteur
Yasuyuki Kubo, Naoki Fujihara, Ken Harata, Ulla Neumann, Guillaume P. Robin, Richard O'Connell
article
mBio, 2015, 6 (5), pp.1-15. ⟨10.1128/mBio.01305-15⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02629974/file/2015_Kubo_mBio_1.pdf BibTex
titre
Fungicide efflux and the MgMFS1 transporter contribute to the multidrug resistance phenotype in Zymoseptoria tritici field isolates
auteur
Selim Omrane, Hind Sghyer, Colette Audeon, Catherine C. Lanen, Clémentine Duplaix, Anne Sophie A. S. Walker, Sabine Fillinger
article
Environmental Microbiology, 2015, 17 (8), pp.2805 - 2823. ⟨10.1111/1462-2920.12781⟩
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titre
Chromatin-based control of effector gene expression in plant-associated fungi
auteur
Jessica L. Soyer, Thierry T. Rouxel, Isabelle Fudal-Grolier Fudal
article
Current Opinion in Plant Biology, 2015, 26, pp.51-56. ⟨10.1016/j.pbi.2015.05.025⟩
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titre
Crop pathogen emergence and evolution in agro-ecological landscapes
auteur
Julien Papaix, Jeremy Burdon, Jiasui Zhan, Peter H. Thrall
article
Evolutionary Applications, 2015, 8 (4), pp.385-402. ⟨10.1111/eva.12251⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02640601/file/2015_Papa%C3%AFx_Evolutionary_Applications_1.pdf BibTex
titre
Deciphering genome content and evolutionary relationships of isolates from the fungus Magnaporthe oryzae attacking different host plants
auteur
Helene Chiapello, Ludovic Mallet, Cyprien Guerin, Gabriela Aguileta, Joelle J. Amselem, Thomas Kroj, Enrique Ortega-Abboud, Marc-Henri Lebrun, Bernard Henrissat, Annie Gendrault, François Rodolphe, Didier Tharreau, Elisabeth Fournier
article
Genome Biology and Evolution, 2015, 7 (10), pp.2896-2912. ⟨10.1093/gbe/evv187⟩
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https://hal.science/hal-01222884/file/2015_Chiapello_GBE_%7B20D019B5-2493-4780-978D-E9A1135F8A9E%7D.pdf BibTex
titre
Menace sur la santé des plantes
auteur
Ivan I. Sache
article
Biofutur, 2015, 371 (34-36)
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titre
Rouille jaune du blé en France trois facteurs interagissent. Face à la pression de la rouille jaune en 2014 et la présence de la maladie, déjà, début 2015, un point sur les causes de la "flambée de 2014" est utile.
auteur
Simon Lefèvre, Marc Leconte, Claude C. Pope de Vallavieille
article
Phytoma , 2015, 683 (avril 2015)
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titre
Les inhibiteurs respiratoires du complexe III résisteront-ils tous ? Présentation des substances utilisées comme fongicides, acaricides ou médicaments et qui peuvent être en butte à la résistance de bioagresseurs. Quelles sont ces résistances, que faire face à elles ? Le point.
auteur
Pierre Leroux, Anne Sophie A. S. Walker
article
Phytoma , 2015, 684 (Mai), pp.37-44
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titre
Field pathogenomics reveals the emergence of a diverse wheat yellow rust population
auteur
Amelia Hubbard, Clare M. Lewis, Kentaro Yoshida, Ricardo H. Ramírez-González, Claude de Vallavieille-Pope, Jane Thomas, Sophien Kamoun, Rosemary Bayles, Cristobal Uauy, Diane G. O. Saunders
article
Genome Biology, 2015, 16 (23), 15 p. ⟨10.1186/s13059-015-0590-8⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02641590/file/2015%20Hubbart%20Genome%20Biology_1.html BibTex
titre
Methionine Biosynthesis is Essential for Infection in the Rice Blast Fungus Magnaporthe oryzae
auteur
Marie Emmanuelle Saint-Macary, Crystel Barbisan, Marie Josèphe Gagey, Océane Frelin, Roland R. Beffa, Marc Henri Lebrun, Michel Droux
article
PLoS ONE, 2015, 10 (4), pp.e0111108. ⟨10.1371/journal.pone.0111108⟩
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https://hal.science/hal-02320054/file/MET6.pdf BibTex
titre
Conditional gene expression and promoter replacement in Zymoseptoria tritici using fungal nitrate reductase promoters
auteur
Elisabetta Marchegiani, Yaadwinder Sidhu, Ken Haynes, Marc-Henri Lebrun
article
Fungal Genetics and Biology, 2015, 79, pp.174 - 179. ⟨10.1016/j.fgb.2015.04.021⟩
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titre
Dynamic spatial interactions between the native invader Brown-headed Cowbird and its hosts
auteur
Jean-Yves Barnagaud, Julien Papaix, Olivier Gimenez, Jens-Christian Svenning
article
Diversity and Distributions, 2015, 21 (5), pp.511-522. ⟨10.1111/ddi.12275⟩
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titre
Inflorescences vs leaves: a distinct modulation of carbon metabolism process during Botrytis infection
auteur
Parul Vatsa-Portugala, Anne-Sophie Walker, Lucile Jacquens, Christophe Clément, Essaïd Ait Barka, Nathalie Vaillant-Gaveau
article
Physiologia Plantarum, 2015, 154 (1), pp.162-177. ⟨10.1111/ppl.12287⟩
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titre
Chromatin analyses of Zymoseptoria tritici: Methods for chromatin immunoprecipitation followed by high-throughput sequencing (ChIP-seq)
auteur
Jessica Louise Soyer, Mareike Möller, Klaas Schotanus, Lanelle R Connolly, Jonathan M Galazka, Michael Freitag, Eva H Stukenbrock
article
Fungal Genetics and Biology, 2015, 79, pp.63-70. ⟨10.1016/j.fgb.2015.03.006⟩
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titre
Agrobacterium tumefaciens Gene Transfer: How a Plant Pathogen Hacks the Nuclei of Plant and Nonplant Organisms
auteur
Salim Bourras, Thierry Rouxel, Michel Meyer
article
Phytopathology, 2015, 105 (10), pp.1288 - 1301. ⟨10.1094/PHYTO-12-14-0380-RVW⟩
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titre
Playing on a pathogen’s weakness: using evolution to guide sustainable plant disease control strategies
auteur
Jiasui Zhan, Peter Thrall, Julien Papaix, Lianhui Xie, Jeremy Burdon
article
Annual Review of Phytopathology, 2015, 53, pp.19-43. ⟨10.1146/annurev-phyto-080614-120040⟩
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titre
Evolution de la rouile jaune sur blé en France en 2014-2015. La pression de la maladie a été moindre que ce que l'on craignait. Par ailleurs, la race Warrior du pathogène se révèle être... deux races.
auteur
Claude C. Pope de Vallavieille, Simon Lefèvre, Marc Leconte
article
Phytoma , 2015, 689, pp.9-10
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titre
Fusariose des épis du blé: faire évoluer la lutte fongicide. Bilan du volet "Utilisation raisonnée des fongicides et approt des biofongicides pour lutter contre la fusariose des épis de blé" du programme EcoFusa.
auteur
Hélène Batina, Vessela Atanasova-Penichon, Arnaud Fourrey, Sandrine Gelisse, Guénolé Grignon, Valerie Laval, Benoit Méléard, Romain Valade, Anne Sophie A. S. Walker, Emmanuelle Gourdain, Claude Maumené
article
Phytoma , 2015, pp.16-20
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titre
Seasonal Changes Drive Short-Term Selection for Fitness Traits in the Wheat Pathogen Zymoseptoria tritici
auteur
Frederic F. Suffert, Virginie Ravigné, Ivan I. Sache
article
Applied and Environmental Microbiology, 2015, 81 (18), pp.6367-6379. ⟨10.1128/AEM.00529-15⟩
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https://agroparistech.hal.science/hal-01584429/file/Appl.%2520Environ.%2520Microbiol.-2015-Suffert-6367-79.pdf BibTex
titre
Modelling the interactive effects of selective fishing and environmental change on Atlantic salmon demogenetics
auteur
Cyril Piou, Marc H. Taylor, Julien Papaix, Etienne Prévost
article
Journal of Applied Ecology, 2015, 52 (6), pp.1629-1637. ⟨10.1111/1365-2664.12512⟩
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titre
Analysis of the molecular dialogue between gray mold (Botrytis cinerea) and grapevine (Vitis vinifera) reveals a clear shift in defense mechanisms during berry ripening
auteur
Jani Kelloniemi, Sophie Trouvelot, Marie-Claire Héloir, Adeline A. Simon, Berengere Dalmais, Patrick Frettinger, Agnes Cimerman, Marc Fermaud, Jean Roudet, Sylvain Baulande, Christophe Bruel, Mathias Choquer, Linhdavanh Couvelard, Mathilde Duthieuw, Alberto Ferrarini, Victor Flors, Pascal P. Le Pecheur, Elise Loisel, Guillaume G. Morgant, Nathalie Poussereau, Jean-Marc J.-M. Pradier, Christine Rascle, Lucie Tdra, Benoît Poinssot, Muriel Viaud
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, 2015, 28 (11), pp.1167-1180. ⟨10.1094/MPMI-02-15-0039-R⟩
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titre
The VELVET Complex in the Gray Mold Fungus Botrytis cinerea: Impact of BcLAE1 on Differentiation, Secondary Metabolism, and Virulence
auteur
Julia Schumacher, Adeline Simon, Kim Christopher Cohrs, Stefanie Traeger, Antoine Porquier, Bérengère Dalmais, Muriel Viaud, Bettina Tudzynski
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, 2015, 28 (6), pp.659-674. ⟨10.1094/mpmi-12-14-0411-r⟩
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BibTex
titre
Unraveling the Function of the Response Regulator BcSkn7 in the Stress Signaling Network of Botrytis cinerea
auteur
Anne Viefhues, Ina Schlathoelter, Adeline A. Simon, Muriel Viaud, Paul Tudzynski
article
Eukaryotic Cell, 2015, 14 (7), pp.636 - 651. ⟨10.1128/EC.00043-15⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02636106/file/2015_Viaud_Eukaryotic%20Cell_1.pdf BibTex
titre
The APSES transcription factor LmStuA is required for sporulation, pathogenic development and effector gene expression in Leptosphaeria maculans
auteur
Jessica Louise Soyer, Audrey Hamiot, Benedicte Ollivier, Marie-Helene Balesdent, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal
article
Molecular Plant Pathology, 2015, 16 (9), pp.1000-1005. ⟨10.1111/mpp.12249⟩
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BibTex
titre
JÉR 2015 à Dijon, les résistances sur le grill
auteur
. R4p, Marie-France Corio-Costet, Danièle D. Debieu, Christophe C. Delye, Sabine, Helma Fillinger, Jacques Grosman, Annie Micoud, Myriam Siegwart, Anne Sophie A. S. Walker
article
Phytoma , 2015, 684, pp.10-12
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BibTex
titre
Evolution of the EKA family of powdery mildew avirulence-effector genes from the ORF 1 of a LINE retrotransposon
auteur
Joelle J. Amselem, Marielle Vigouroux, Simone Oberhaensli, James K M Brown, Laurence V Bindschedler, Pari Skamnioti, Thomas Wicker, Pietro D Spanu, Hadi Quesneville, Soledad Sacristán
article
BMC Genomics, 2015, 16 (1), pp.917. ⟨10.1186/s12864-015-2185-x⟩
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https://hal.science/hal-01264935/file/2015_Amselem_BMC%20Genomic_%7B349C9477-B0C0-4015-80F6-916C99F2AC70%7D.pdf BibTex
titre
Sex and parasites: genomic and transcriptomic analysis of Microbotryum lychnidis-dioicae, the biotrophic and plant-castrating anther smut fungus
auteur
Michael H Perlin, Joelle J. Amselem, Eric Fontanillas, Su San Toh, Zehua Chen, Jonathan Goldberg, Sébastien Duplessis, Bernard Henrissat, Sarah Young, Qiandong Zeng, Gabriela Aguileta, Elsa Petit, Helene Badouin, Jared Andrews, Dominique Razeeq, Toni Gabaldón, Hadi Quesneville, Tatiana Giraud, Michael E Hood, David J Schultz, Christina A Cuomo
article
BMC Genomics, 2015, 16 (461), ⟨10.1186/s12864-015-1660-8⟩
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https://hal.science/hal-01186421/file/2015_BMC%20Genomics_Perlin_%7B398BC7AB-CBD3-4ED6-B5C4-BBC99384EA11%7D.pdf BibTex
titre
Résistance du colza au phoma : où en est l'efficacité de Rlm7 ?
auteur
Marie-Helene Balesdent, Clémence Plissonneau, Laurent Coudard, Guillaume Daverdin, Loïc Le Meur, Julien Carpezat, Martine Leflon, Xavier Pinochet, Magali Ermel, Hortense Brun, Thierry Rouxel
article
Phytoma la Défense des Végétaux, 2015, Mai (684), pp.20-24
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https://hal.science/hal-01208773/file/Myl%C3%A8ne%20PHYTOMA%20V3-1_1.pdf BibTex
titre
Mapping genes in barley for resistance to Puccinia coronata from couch grass and to P-striiformis from brome, wheat and barley
auteur
Rients E. Niks, Sisay K. Alemu, Thierry C. Marcel, Skye van Heyzen
article
Euphytica, 2015, 206 (2), pp.487-499. ⟨10.1007/s10681-015-1516-y⟩
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BibTex
titre
Phoma du colza : recyclage du gène de résistance Rlm3
auteur
Clémence Plissonneau, Guillaume G. Daverdin, Laurent L. Coudard, Bénédicte B. Ollivier, Thierry T. Rouxel, Marie-Helene Balesdent
article
Phytoma , 2015, Mai (684), pp.25-28
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https://hal.inrae.fr/hal-02629773/file/PHYTOMA%20PLISSONNEAU_1.pdf BibTex
titre
Mutual Exclusion between Fungal Species of the Fusarium Head Blight Complex in a Wheat Spike
auteur
Dorothée Siou, Sandrine Gelisse, Valerie Laval, Frédéric Suffert, Christian C. Lannou
article
Applied and Environmental Microbiology, 2015, 81 (14), pp.4682-4689. ⟨10.1128/AEM.00525-15⟩
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BibTex
titre
Interactions between head blight pathogens: consequences for disease development and toxin production in wheat spikes
auteur
Dorothée Siou, Sandrine Gelisse, Valerie Laval, Sonia Elbelt, Cédric Repinçay, Marjolaine Deschamps, Frederic Suffert, Christian Lannou
article
Applied and Environmental Microbiology, 2015, 81 (3), pp.957 - 965. ⟨10.1128/AEM.02879-14⟩
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BibTex
titre
Population structure and temporal maintenance of the multihost fungal pathogen Botrytis cinerea: causes and implications for disease management.
auteur
Anne Sophie A. S. Walker, Pierre Gladieux, Véronique Decognet, Marc Fermaud, Johann J. Confais, Jean Roudet, Marc Bardin, Alexandre Bout, Philippe C. Nicot, Christine Poncet, Elisabeth E. Fournier
article
Environmental Microbiology, 2015, 17 (4), pp.1261-1274. ⟨10.1111/1462-2920.12563⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02638009/file/2015_Walker_Environ%20Microbiol_postprint_2.pdf BibTex
titre
Rapid identification of the Leptosphaeria maculans avirulence gene AvrLm2 using an intraspecific comparative genomics approach
auteur
Kaveh Ghanbarnia, Isabelle Fudal, Nicholas J. Larkan, Matthew G. Links, Marie-Helene Balesdent, Bronislava Profotova, W. G. Dilantha Fernando, Thierry Rouxel, M. Hossein Borhan
article
Molecular Plant Pathology, 2015, 16 (7), pp.699 - 709. ⟨10.1111/mpp.12228⟩
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BibTex
titre
High-Resolution Melting approaches towards plant fungal molecular diagnostics
auteur
Antonios Zambounis, Ioannis Ganopoulos, Michael Chatzidimopoulos, Athanasios Tsaftaris, Panagiotis Madesis
article
Phytoparasitica, 2015, 43 (2), pp.265 - 272. ⟨10.1007/s12600-014-0441-2⟩
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BibTex
titre
Histone modifications rather than the novel regional centromeres of Zymoseptoria tritici distinguish core and accessory chromosomes
auteur
Klaas Schotanus, Jessica L. Soyer, Lanelle R. Connolly, Jonathan Grandaubert, Petra Happel, Kristina M. Smith, Michael Freitag, Eva H. Stukenbrock
article
Epigenetics and Chromatin, 2015, 8 (41), pp.OA. ⟨10.1186/s13072-015-0033-5⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02637052/file/2015_Schotanus_Epigenetics%20and%20Chromatin_1.pdf BibTex
titre
The genera of fungi - fixing the application of the type species of generic names - g 2: allantophomopsis, latorua, macrodiplodiopsis, macrohilum, milospium, protostegia, pyricularia, robillarda, rotula, septoriella, torula, and wojnowicia
auteur
Pedro W. Crous, Lori M. Carris, Alejandra Giraldo, Johannes Z. Groenewald, David L. Hawksworth, Margarita Hernandez-Restrepo, Walter M. Jaklitsch, Marc-Henri Lebrun, Rene K. Schumacher, J. Benjamin Stielow, Elna J. van Der Linde, Julija Vilcane, Hermann Voglmayr, Alan R. Wood
article
IMA Fungus, 2015, 6 (1), pp.163-198. ⟨10.5598/imafungus.2015.06.01.11⟩
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BibTex
titre
Comparative pathogenicity of sexual and asexual spores of Zymoseptoria tritici (septoria tritici blotch) on wheat leaves.
auteur
David Morais, Valerie Laval, Ivan Sache, Frederic Suffert
article
Plant Pathology, 2015, 64 (6), pp.1429-1439. ⟨10.1111/ppa.12372⟩
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BibTex
titre
Whole genome comparative analysis of transposable elements provides new insight into mechanisms of their inactivation in fungal genomes
auteur
Joelle J. Amselem, Marc-Henri Lebrun, Hadi Quesneville
article
BMC Genomics, 2015, 16 (1), pp.141. ⟨10.1186/s12864-015-1347-1⟩
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https://hal.science/hal-01142763/file/s12864-015-1347-1_%7B33366C96-F519-435C-847C-04DE73C5B5A8%7D.pdf BibTex
titre
Evolution of dispersal in asexual populations: to be independent, clumped or grouped?
auteur
Samuel S. Soubeyrand, Ivan I. Sache, Frédéric Marie Hamelin, Etienne K. Klein
article
Evolutionary Ecology, 2015, 29 (6), pp.947-963. ⟨10.1007/s10682-015-9768-5⟩
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BibTex
titre
Fusariose des épis du blé : faire évoluer la lutte fongicide
auteur
Hélène Batina, Vessela Atanasova-Penichon, Arnaud Fourrey, Sandrine Gelisse, Guénolé Grignon, Valerie Laval, Claude Maumené, Benoît Meleard, Romain R. Valade, Anne-Sophie Walker, Emmanuelle Gourdain
article
Phytoma , 2015, 686, pp.16-20
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Conference papers

titre
Etude au champ de l'efficacité et de la pression sélective exercee par des associations fongicides sur la sensibilité des populations de Zymoseptoria tritici ces dernières années en France.
auteur
Gilles Couleaud, Anne-Sophie Walker, Claude Maumené
article
CIMA, Association Française de Protection des Plantes (AFPP). FRA., Dec 2015, Tours, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02742695/file/Performance_Septoriose_2012-2014_VF-2%5B1%5D_1.pdf BibTex
titre
Résultats du réseau d'essai de suivi des résistances du piétin-verse aux fongicides (AFPP) et dynamique des épidémies.
auteur
T. Durand, A. Micoud, F. Remuson, Anne Sophie A. S. Walker, M. Delos
article
AFPP - 11ème Conférence Internationale sur les Maladies des Plantes, Dec 2015, Tours, France. p.112
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BibTex
titre
Statut de la résistance aux SDHIS des populations françaises de Sclerotinia sclerotiorum et caractérisation des souches résistantes
auteur
Anne-Sophie Walker, Christiane Auclair, Florent Remuson, Annie Micoud, Jacques Moinard, Julien Carpezat, Martine Leflon Martine Leflon, Annette Penaud
article
CIMA, Association Française de Protection des Plantes (AFPP). FRA., Dec 2015, Tours, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02744332/file/Walker_Sclerotinia_CIMA2015_VF-2%5B1%5D_1.pdf BibTex
titre
La résistance de type MDR chez l'agent de la septoriose du blé : dernières avancées sur un mode d'action original
auteur
Selim Omrane, Colette C. Audeon, Amandine Ignace, Clémentine Duplaix, Hind Sghyer, Lamia Aouini, Gert Kema, Sabine Fillinger, Anne-Sophie Walker
article
CIMA, Association Française de Protection des Plantes (AFPP). FRA., Dec 2015, Tours, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02740700/file/Walker_MycosphaerellaMDR_CIMA2015_VF-3%5B1%5D_1.pdf BibTex
titre
Résultats du réseau d'essai de suivi des résistances du Pietin Verse aux fongicides (AFPP) et dynamique des epidémies.
auteur
T. Durand, A. Micoud, Florent Remuson, Anne-Sophie Walker, M. Delos
article
CIMA, Association Française de Protection des Plantes (AFPP). FRA., Dec 2015, Tours, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02740381/file/reseau_erosion_AFPP_pi%C3%A9tin_verse_VF%5B1%5D_1.pdf BibTex
titre
Résultats du réseau d'essai de suivi des résistances de la Septoriose aux fongicides (AFPP)
auteur
L. Warangot, T. Durand, Anne-Sophie Walker, Marc Delos
article
CIMA, Association Française de Protection des Plantes (AFPP). FRA., Dec 2015, Tours, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02743248/file/reseau_erosion_AFPP_septo_oidium_VF%5B1%5D_1.pdf BibTex
titre
Hemibiotrophic interfaces and invasion strategies of Colletotrichum fungi
auteur
Richard O'Connell
article
36th New Phytologist Symposium, Nov 2015, Munich, Germany
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titre
Regulation of appressorium-expressed pathogenicity genes in the anthracnose fungus Colletotrichum higginsianum
auteur
Richard O'Connell
article
mini-symposium “Epigenetics meets biotrophy”, Oct 2015, Aachen, Germany
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titre
A two genes – for – one gene interaction between Leptosphaeria maculans and Brassica napus
auteur
Yohann Petit, Alexandre A. Degrave, Michel Meyer, Francoise Blaise, Benedicte Ollivier, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal, Marie-Helene Balesdent
article
8th Effectome meeting, Sep 2015, Lauret, France
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https://hal.science/hal-01456013/file/a%20two%20genes_1.pdf BibTex
titre
Contemporary fungicide applications sign for selection in Botrytis cinerea populations collected in the Champagne vineyard (France)
auteur
Anne Sophie A. S. Walker, Adrien Rieux, Virginie Ravigné, Elisabeth Fournier
article
Resistance 2015, Sep 2015, Harpenden, United Kingdom. 20 p
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titre
Resistance of Ustilago nuda towards SDHIs in France: old or new story ?
auteur
Anne Sophie A. S. Walker, Christiane Auclair, Nathalie Robin, C. Maumené
article
Resistance 2015, Sep 2015, Harpenden, United Kingdom. 51 p
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titre
Multi-drug-resistance (MDR) in septoria leaf blotch
auteur
Selim Omrane, Colette Audeon, Amandine Ignace, Clémentine Duplaix, Hind Sghyer, Lamia Aouini, Gert Kema, Anne Sophie A. S. Walker, Sabine Fillinger
article
18. international Conference on Plant Protection, Aug 2015, Berlin, Germany
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https://hal.science/hal-01187021/file/Septo_MDR_1.pdf https://hal.science/hal-01187021/file/Septo_MDR_2.docx BibTex
titre
Effects of wheat varietal resistance level and rainfall characteristics on splash dispersal of Septoria tritici blotch
auteur
Tiphaine Vidal, Pauline Lusley, Christophe Gigot, Marc Leconte, F. Suffert, Claude de Vallavielle-Pope, L. Huber, Sébastien Saint-Jean
article
Annual American Phytopatholgy Society Meeting, American Phytopathological Society, Aug 2015, Passedena, California, United States. pp.S4.1-S4.160, ⟨10.1094/PHYTO-105-11-S4.1⟩
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titre
A two genes – for – one gene interaction between Leptosphaeria maculans and Brassica napus.
auteur
Yohann Petit, Alexandre A. Degrave, Michel Meyer, Francoise Blaise, Benedicte Ollivier, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal, Marie-Helene Balesdent
article
7th European Plant Science Retreat, Jul 2015, Paris, France
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https://hal.science/hal-01456012/file/a%20two%20genes_1.pdf BibTex
titre
Increasing within-field diversity to foster agro-ecosystem services and cope with climate change
auteur
Jerome Enjalbert, Xavier Le Roux, Vincent Allard, Bruno Andrieu, Sébastien Barot, Julie Borg, Dominique Descoureaux, Claude Pope de Vallavieille, Arnaud Gauffreteau, Isabelle Goldringer, Stephane Lemarié, Sébastien Saint-Jean, Emmanuelle Porcher
article
CFCC15 Our Common Future under Climate Change, Jul 2015, Paris, France
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titre
Correlation among life-history traits in plant-pathogen interaction and consequences for epidemic spread:a case study in the wheat leaf rust pathosystem.
auteur
Henriette Goyeau, Gustavo Azzimonti, Julien Papaix, Christian Lannou
article
14th International Cereal Rusts and Powdery Mildews Conference, Helsingor, Denmark, 5-8 July 2015, Jul 2015, Helsingor, Denmark
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titre
Deciphering the role of effectors during plant infection and chromatin-based control of their expression in the plant pathogenic fungus Leptosphaeria maculans
auteur
Isabelle Fudal
article
Séminaire à l'Université de Kiel, Jun 2015, Kiel, Germany
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titre
ECHAP : un projet pour identifier les possibilités de réduction de l’utilisation des fongicides en utilisant l’architecture des couverts
auteur
Corinne Robert, Christian Fournier, Mariem Abichou, Bruno Andrieu, Marie-Odile Bancal, Enrique Barriuso, Carole Bedos, Pierre Benoit, Valerie Bergheaud, Marc Bidon, Bernard Bonicelli, Camille Chambon, R. Chapuis, Eric Cotteux, J. da Costa, Brigitte Durand, Nathalie Gagnaire, Damien Gaudillat, Christophe Gigot, Guillaume Girardin, David Gouache, Josiane Jean-Jacques, Laure Mamy, Bertrand Ney, N. Paveley, Benjamin Perriot, Samuel Poidevin, Stéphanie Pointet, Valerie Pot-Genty, Christophe Pradal, C. Richard, Sébastien Saint-Jean, Jerome Salse, Carole Sinfort, J. Smith, A. ter Halle, E. van den Berg, Anne-Sophie Walker
article
45e Congrès du Groupe Français des Pesticides Devenir et impact des pesticides : verrous à lever et nouveaux enjeux, May 2015, Versailles, France. 2 p
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https://hal.science/hal-01595503/file/Book_Abstracts_GFP_2015_1.pdf BibTex
titre
Functional analysis of secondary metabolism gene clusters expressed in Colletotrichum appressoria
auteur
Jean-Felix Dallery, Antonios Zampounis, Emilie Adelin, Sandrine Pigné, Olivier Lespinet, Jamal Ouazzani, Marc-Henri Lebrun, Richard O'Connell
article
28. Fungal Genetics Conference, Mar 2015, Asilomar, United States
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titre
Get ready for infection: Transcriptional profiling reveals virulence-specific traits inside of infection cushions of Fusarium graminearum
auteur
Jorg Bormann, Marike J. Boenisch, Anika Glasenapp, Ana-Lilia Martinez Rocha, Stefan Scholten, Sebastian Piehler, Martin Münsterkötter, Ulrich Güldener, Bernard Henrissat, Marc-Henri M.-H. Lebrun, Wilhelm Schäfer
article
28. Fungal Genetics Conference, Mar 2015, Pacific Grove, CA, United States. p.25
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https://hal.inrae.fr/hal-02798807/file/Asilomar%20Fungal%20Abstract%20Book%202015_1.pdf BibTex
titre
Genetic analysis of multi-drug-resistance (MDR) in Mycosphaerella graminicola (Zymoseptoria tritici) field isolates
auteur
Selim Omrane, Colette C. Audeon, Amandine Ignace, Clémentine Duplaix, Hind Sghyer, Lamia Aouini, Gert Kema, Anne Sophie A. S. Walker, Sabine, Helma S. H. Fillinger-David
article
27th Fungal Genetics Conference - Asilomar Conference Grounds,, Mar 2015, pacific grove, United States. p.36
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https://hal.inrae.fr/hal-02796578/file/Omrane_etal_1.pdf https://hal.inrae.fr/hal-02796578/file/Omrane_etal_2.docx BibTex
titre
Epigenetic hotspots are genomic islands for putative effector-encoding genes in Zymoseptoria tritici.
auteur
Jessica Louise Soyer, Jonathan Grandaubert, Klaas Schotanus, Janine Haueisen, Eva H Stukenbrock
article
28. Fungal Genetics Conference, Mar 2015, Asilomar, United States
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BibTex
titre
Epigenetic control of effector gene expression in the plant pathogen fungus Leptosphaeria maculans
auteur
Jessica Louise Soyer, Mennat El Ghalid, Jonathan Grandaubert, Marie-Helene Balesdent, Lanelle R. Connolly, Michael Freitag, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal-Grolier
article
28. Fungal Genetics Conference, Mar 2015, Asilomar, United States
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titre
Localization of Colletotrichum higginsianum putative effector proteins in planta
auteur
Guillaume Robin, Richard O'Connell
article
28. Fungal Genetics Conference, Mar 2015, Asilomar, United States
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titre
Utilisation raisonnée des fongicides et apport des biofongicides pour lutter contre la fusariose des épis de blé
auteur
Hélène Batina, V. Atanasova-Penichon, A. Fourrey, Sandrine Gélisse, G. Grignon, Valérie Laval, C. Maumene, B. Meleard, Romain Valade, Anne-Sophie Walker, E. Gourdain
article
5ème conférence internationale sur les méthodes alternatives de protection des plantes, AFPP, Mar 2015, Lille, France
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titre
Deciphering the role of effectors during plant infection and the chromatin-based control of their expression in the plant pathogenic fungus Leptosphaeria maculans
auteur
Isabelle Fudal
article
Séminaire à l'Université de Maynooth, Feb 2015, Maynooth, Ireland
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titre
A two genes – for – one gene interaction between Leptosphaeria maculans and Brassica napus.e
auteur
Yohann Petit, Alexandre A. Degrave, Michel Meyer, Francoise Blaise, Benedicte Ollivier, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal, Marie-Helene Balesdent
article
Workshop on experimental approaches for the investigation of effector function, Feb 2015, Tel-Aviv, Israel
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https://hal.science/hal-01456011/file/a%20two%20genes_1.pdf BibTex
titre
A two genes – for – one gene interaction between Leptosphaeria maculans and Brassica napus
auteur
Yohann Petit, Alexandre A. Degrave, Michel Meyer, Francoise Blaise, Benedicte Ollivier, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal, Marie-Helene Balesdent
article
COST action SUSTAIN. Experimental approaches for the investigation of effector function, Feb 2015, Tel Aviv, Israel
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https://hal.science/hal-01456014/file/abstract%20COST%20Tel-Aviv%202015_1.pdf BibTex
titre
Généralités sur la résistance aux Produits de Protection des Plantes (PPP)
auteur
Anne Sophie A. S. Walker, Christophe Délye
article
Journées d’Échanges sur les Résistances aux produits de protection des plantes JER 2015, Feb 2015, Dijon, France, 2-3 février 2015, France. 42 p
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titre
Prévenir et réduire les risques de sélection de résistances : de la théorie à la pratique, des pistes pour améliorer la durabilité des PPP
auteur
Christophe Délye, Myriam Siegwart, Anne Sophie A. S. Walker
article
Journées d’Échanges sur les Résistances aux produits de protection des plantes JER 2015, Feb 2015, Dijon, France. 42 p
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BibTex
titre
Assessing the risk of a viral disease based on expert opinions
auteur
Gael Thébaud, Pauline de Jerphanion, A. de Keyzer, M. Letroublon, Emmanuel Jacquot
article
15. Rencontres de Virologie Végétale (RVV), Jan 2015, Aussois, France
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BibTex
titre
Validation de marqueurs liés à des gènes d’intérêt en vue de l’établissement d’une base de données pour la sélection assistée chez le blé tendre
auteur
Marion Ranoux, Claire Nédellec, Emmanuelle Cariou-Pham, Robert Bossy, Claude de Vallavieille-Pope, Marc Leconte, Dialekti Valsamou, Delphine Hourcade, Laurent Guerrero, Pierre Sourdille
article
Synthèse des Programmes de Recherche FSOV. Actes de la 4ème Rencontre Scientifique, FSOV., Jan 2015, Paris, France. 5 p
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Book sections

titre
Quantitative resistance to biotrophic filamentous plant pathogens: concepts, misconceptions, and mechanisms
auteur
Rients E. Niks, Xiaoquan Qi, Thierry Marcel
article
Annual Review of Phytopathology, 53, ANNUAL REVIEWS, 26 p., 2015, Annual Review of Phytopathology, 978-0-8243-1353-1. ⟨10.1146/annurev-phyto-080614-115928⟩
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Habilitation à diriger des recherches

titre
Vers une approche intégrée pour l'étude des gènes fongiques en interaction avec les résistances des Brassicaceae à Leptosphaeria spp.
auteur
Marie-Helene Balesdent
article
Sciences du Vivant [q-bio]. Université Paris Sud - Paris 11, 2015
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titre
Processus et mécanismes centrés sur l'inoculum : une approche fonctionnelle et expérimentale de l'épidémiologie végétale
auteur
Frédéric Suffert
article
Phytopathologie et phytopharmacie. Université Paris Sud - Paris 11, 2015
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https://hal.inrae.fr/tel-02799913/file/m%C3%A9moire%20HDR%20Suffert%20v2-1_1.pdf BibTex
titre
Processus et mécanismes centrés sur l'inoculum : une approche fonctionnelle et expérimentale de l'épidémiologie végétale
auteur
Frédéric Suffert
article
Sciences du Vivant [q-bio]. Université Paris Sud, 2015
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https://hal.science/tel-01167164/file/m%C3%A9moire%20HDR%20Suffert%20v2.pdf BibTex

Poster communications

titre
Integration of transcriptomic and proteomics approaches in characterizing short-term gravi-perception signaling networks in poplar wood.
auteur
Nicolas N. Richet, Mélanie Mauriat, Marie-Claude Lesage Descauses, Odile Rogier, Françoise F. Laurans, Stéphanie Huguet, Sandrine Balzergue, Nicolas N. Lapalu, Gilles G. Pilate, Catherine Coutand, Christophe Plomion, Jean-Charles Leplé
article
8. Plant Biomechanics International Conference PBM8, Nov 2015, Nagoya, Japan. Nagoya University, Proceedings of the Plant Biomechanics Conference, 253 p., 2015, 8th Plant Biomechanics International Conference
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https://hal.inrae.fr/hal-02744040/file/2015_Richet_8PBIC_1.pdf BibTex
titre
The StructuraLEP project: structural and functional characterization of Leptosphaeria maculans effectors and of their interactants
auteur
Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Yohann Petit, Francoise F. Blaise, Bénédicte B. Ollivier, Clémence Plissonneau, Michel M. Meyer, Julie Gervais, Thierry T. Rouxel, Marie-Helene Balesdent, Karine Blondeau, Lazar Noureddine, Inès Gallais, Herman van Tilbeurgh
article
8th Effectome meeting, Sep 2015, Lauret, France. , 2015
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https://hal.inrae.fr/hal-02800676/file/Structural%20Meyer_1.pdf BibTex
titre
Multi-drug-resistance (MDR) in septoria leaf blotch.
auteur
Selim Omrane, Colette Audeon, Amandine Ignace, Clémentine Duplaix, Hind Sghyer, Lamia Aouini, Gert Kema, Anne Sophie A. S. Walker, Sabine Fillinger
article
Resistance 2015, Sep 2015, Harpenden, United Kingdom. Pest Management Science, 67 (1), pp.44-59, 2015, Pest Management Science
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BibTex
titre
Genetic and biochemistry analyses of the natural resistance to the fungicide fenhexamid in the phytopathogenic fungus Botrytis pseudocinerea
auteur
Saad Azeddine, Alexis A. Billard, Jocelyne J. Bach, Colette C. Audeon, Catherine C. Lanen, Anne-Sophie Walker, Sabine Fillinger, Danièle D. Debieu
article
Resistance 2015, Sep 2015, Harpenden, United Kingdom. 2015
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https://hal.inrae.fr/hal-02739487/file/Abstract_Cyp684_Rothamsted_2015-1_1.pdf https://hal.inrae.fr/hal-02739487/file/Abstract_Cyp684_Rothamsted_2015-1_2.docx BibTex
titre
Status of resistance towards SDHIs in French populations of Sclerotinia sclerotiorum and characterization of resistant strains
auteur
Anne-Sophie Walker, Christiane Auclair, Florent Remuson, Annie Micoud, Julien Carpezat, Virginie Ravigné, Elisabeth E. Fournier
article
Resistance 2015, Sep 2015, Harpenden, United Kingdom. 51 p., 2015
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https://hal.inrae.fr/hal-02800129/file/Walker_botrytis%20resistance%20evolution_Rothamsted2015-1_1.pdf https://hal.inrae.fr/hal-02800129/file/Walker_botrytis%20resistance%20evolution_Rothamsted2015-1_2.docx BibTex
titre
Spécialisation d’hôte et structure des populations de Mycosphaerella graminicola, agent de la Septoriose du blé
auteur
Johann J. Confais, Lilian L. Gout, Marie Massot
article
36ème colloque « Petit pois déridé », Aug 2015, orsay, France. 2014
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https://hal.inrae.fr/hal-02798252/file/resumes_PETIT%20POIS%20DERIDES_1.pdf BibTex
titre
The GEMO project: Hitchhiking DNA in Magnaporthe oryzae
auteur
Ludovic Mallet, Cyprien Guerin Guérin, Joelle J. Amselem, Elisabeth E. Fournier, Helene H. Chiapello
article
JOBIM 2015. Meeting of working Group Medicago sativa, Jul 2015, Clermont-Ferrand, France. , 1123 p., 2015
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https://hal.inrae.fr/hal-02801084/file/Publis15-bgpi-039_mallet_hitchhiking_1.pdf BibTex
titre
ECHAP : un projet pour identifier les possibilités de réduction de l’utilisation des fongicides en utilisant l’architecture des couverts
auteur
Corinne Robert, Christian Fournier, Mariem Abichou, Bruno Andrieu, Marie-Odile Bancal, Enrique Barriuso, Carole Bedos, Pierre Benoit, Valerie Bergheaud, Marc Bidon, Bernard Bonicelli, Camille Chambon, R. Chapuis, Eric Cotteux, J. da Costa, Brigitte Durand, Nathalie Gagnaire, Damien Gaudillat, Christophe Gigot, Guillaume Girardin, David Gouache, Josiane Jean-Jacques, Laure Mamy, Bertrand Ney, N. Paveley, Benjamin Perriot, Samuel Poidevin, Stéphanie Pointet, Valerie Pot-Genty, Christophe Pradal, C. Richard, Sébastien Saint-Jean, Jerome Salse, Carole Sinfort, J. Smith, A. ter Halle, E. van den Berg, Anne Sophie A. S. Walker
article
45e Congrès du Groupe Français des Pesticides Devenir et impact des pesticides : verrous à lever et nouveaux enjeux, May 2015, Versailles, France. 145 p., 2015, Devenir et impact des pesticides : verrous à lever et nouveaux enjeux
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BibTex
titre
Occurrence of Fusarium and Microdochium species and associated mycotoxins in French Wheat
auteur
Laetitia Pinson-Gadais, Nadia Ponts, Emmanuelle Gourdain, G. Grignon, Valerie Laval, Hélène Batina, Christine Ducos, Sébastien Fromentin, Marie-Noëlle Verdal-Bonnin, Christian C. Barreau, Florence Richard-Forget, Vessela Atanasova-Penichon
article
28. Fungal Genetics Conference, Mar 2015, Asilomar, United States. 2015
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BibTex
titre
Secondary metabolism and necrotrophy in Botrytis cinerea: role of the BOA13 transcription factor
auteur
Antoine Porquier, Berengere Dalmais, Hind Sghyer, Adeline Simon, Guillaume Morgant, Pascal Le Pecheur, Muriel Viaud
article
28th Fungal genetics conference, Mar 2015, Asilomar, United States. , 2015
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BibTex
titre
Contemporary fungicide applications sign for selection in Botrytis cinerea populations collected in the Champagne vineyard
auteur
Anne-Sophie Walker, A. Rieux, V. Ravigné, Elisabeth Fournier
article
28th Fungal genetics conference, Mar 2015, Asilomar - California, United States.
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Reports

titre
Modélisation de l'interaction entre gènes pour évaluer la durabilité de résistances variétale
auteur
Romain Tching Chi Yen
article
[Stage] France. Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), FRA. 2015, 27 p
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titre
Modélisation de l’interaction entre gènes pour évaluer la durabilité de résistances variétales
auteur
Romain Tching Chi Yen
article
[Stage] INSA Lyon. 2015
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Theses

titre
Quand un gène d'avirulence en cache un autre : analyse de l'interaction entre AvrLm3 et AvrLm4-7 chez Leptosphaeria maculans
auteur
Clémence Plissonneau
article
Phytopathologie et phytopharmacie. Université Paris Saclay (COmUE), 2015. Français. ⟨NNT : 2015SACLS021⟩
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https://theses.hal.science/tel-01380376/file/70046_PLISSONNEAU_2015_diffusion.pdf BibTex
titre
Effect of host and temperature on the population structure of Puccinia striiformis f. sp. tritici, responsible of yellow rust in the Middle East
auteur
Rola El Amil
article
Phytopathology and phytopharmacy. Université Paris Sud - Paris XI, 2015. English. ⟨NNT : 2015PA112236⟩
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https://theses.hal.science/tel-01261429/file/VD2_EL_AMIL_ROLA_25092015.pdf BibTex
titre
Components of the early stages of septoria tritici blotch epidemics (Zymoseptoria tritici) : quantity, efficiency and origin of primary inoculum
auteur
David Morais
article
Agricultural sciences. AgroParisTech, 2015. English. ⟨NNT : 2015AGPT0021⟩
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https://pastel.hal.science/tel-04167889/file/42888_MORAIS_2015_archivage.pdf BibTex
titre
Les déterminants des phases épidémiques précoces de la septoriose du blé (Zymoseptoria tritici) : quantité, efficacité et origine de l'inoculum primaire
auteur
David Morais
article
Sciences du Vivant [q-bio]. AgroParisTech, 2015. Français. ⟨NNT : ⟩
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https://hal.science/tel-01142864/file/th%C3%A8se%20David%20Morais%20v150415.pdf BibTex

2014

Journal articles

titre
Pathogen population dynamics in agricultural landscapes: The Ddal modelling framework
auteur
Julien Papaïx, Katarzyna Adamczyk-Chauvat, Annie Bouvier, Kiên Kiêu, Suzanne Touzeau, Christian Lannou, Hervé Monod
article
Infection, Genetics and Evolution, 2014, 27, pp.509-520. ⟨10.1016/j.meegid.2014.01.022⟩
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BibTex
titre
Using virtual 3-D plant architecture to assess fungal pathogen splash dispersal in heterogeneous canopies: a case study with cultivar mixtures and a non-specialized disease causal agent
auteur
Christophe Gigot, Claude de Vallavieille-Pope, Laurent L. Huber, Sébastien Saint-Jean
article
Annals of Botany, 2014, 114 (4), pp.863-876. ⟨10.1093/aob/mcu098⟩
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BibTex
titre
Can epidemic control be achieved by altering landscape connectivity in agricultural systems?
auteur
Julien Papaïx, Suzanne Touzeau, Hervé Monod, Christian Lannou
article
Ecological Modelling, 2014, 284 (284), pp.35-47. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2014.04.014⟩
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BibTex
titre
Inferring the contribution of sexual reproduction, migration and off-season survival to the temporal maintenance of microbial populations: a case study on the wheat fungal pathogen Puccinia striiformis f.sp. tritici
auteur
Sajid S. Ali, Pierre P. Gladieux, Hidayatur Rahman, Saqib Muhammad, Ahmad Habib, Marc M. Leconte, Angelique A. Gautier, Annemarie Fejer Justesen, Mogens Hovmøller, Jerome J. Enjalbert, Claude C. Pope de Vallavieille
article
Molecular Ecology, 2014, 23 (3), pp.603-617. ⟨10.1111/mec.12629⟩
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BibTex
titre
The powdery mildew resistance protein RPW8.2 is carried on VAMP721/722 vesicles to the extrahaustorial membrane ofhaustorial complexes
auteur
Hyeran Kim, Richard O'Connell, Makoto Maekawa-Yoshikawa, Tomohiro Uemura, Ulla Neumann, Paul Schulze-Lefert
article
Plant Journal, 2014, 79 (5), pp.835-847
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BibTex
titre
The Colletotrichum destructivum species complex - hemibiotrophic pathogens of forage and field crops
auteur
U. Damm, Richard O'Connell, J. Z. Groenewald, P. W. Crous
article
Studies in Mycology, 2014, 79, pp.49 - 84. ⟨10.1016/j.simyco.2014.09.003⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02641019/file/2014_Damm_Studies%20in%20Mycology_1.pdf BibTex
titre
Reprogramming of plant cells by filamentous plant-colonizing microbes
auteur
Gunther Doehlemann, Natalia Requena, Patrick Schaefer, Frédéric Brunner, Richard O'Connell, Jane E. Parker
article
New Phytologist, 2014, 204 (4), pp.803 - 814. ⟨10.1111/nph.12938⟩
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BibTex
titre
Rouille jaune une race s'attaque aux céréales
auteur
P. Du Cheyron, Jean-Yves Maufras, Delphine Audigeos, Claude de Vallavieille-Pope, Marc M. Leconte
article
Perspectives Agricoles, 2014, Avril (410), pp.16-18
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BibTex
titre
Associer des variétés pour maîtriser les maladies et stabiliser la production
auteur
Tiphaine Vidal, Christophe Gigot, Makram Belhaj Fraj, Marc M. Leconte, Laurent L. Huber, Sebastien Saint-Jean, Claude de Vallavieille-Pope
article
Agronomie, Environnement & Sociétés, 2014, 4 (2), pp.103-111
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https://hal.inrae.fr/hal-02641628/file/pope%20AES-Vol4_n2_13_Vidal_et_al-2_1.pdf BibTex
titre
Phosphoproteome profiles of the phytopathogenic fungi [i]Alternaria brassicicola[/i] and [i]Botrytis cinerea[/i] during exponential growth in axenic cultures
auteur
Marlène Davanture, Jerome Dumur, Nelly Bataillé, Claire Campion, Benoit Valot, Michel Zivy, Philippe Simoneau, Sabine, Helma Fillinger-David
article
Proteomics, 2014, 14 (13-14), pp.1639-1645. ⟨10.1002/pmic.201300541⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
Effect of wheat spike infection timing on fusarium head blight development and mycotoxin accumulation
auteur
Dorothée Siou, Sandrine Gelisse, Valerie Laval, Cédric Repinçay, Robert Canalès, Frederic Suffert, Christian Lannou
article
Plant Pathology, 2014, 63 (2), pp.390-399. ⟨10.1111/ppa.12106⟩
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BibTex
titre
Les livres de journalistes politiques.
auteur
Pierre Leroux, Christian Le Bart, Roselyne Ringoot
article
Mots: les langages du politique, 2014, Les livres de journalistes politiques, 1 (104), pp.5-17
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BibTex
titre
Fitness measurement reveals contrasting costs in homologous recombinant mutants of Botrytis cinerea resistant to succinate dehydrogenase inhibitors
auteur
Anaïs Laleve, Sabine, Helma S. H. Fillinger-David, Anne Sophie A. S. Walker
article
Fungal Genetics and Biology, 2014, 67, pp.24-36. ⟨10.1016/j.fgb.2014.03.006⟩
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titre
Evolution of pathogen specialisation in a host metapopulation: joint effects of host and pathogen dispersal
auteur
Julien J. Papaix, Jeremy J. Burdon, Christian C. Lannou, Peter H. Thrall
article
PLoS Computational Biology, 2014, 10 (5), pp.e1003633. ⟨10.1371/journal.pcbi.1003633⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02636472/file/2014_Papaix_PLOS%20Computational%20Biology_1.pdf BibTex
titre
La rouille brune sous haute surveillance
auteur
Jean-Yves Maufras, P Du Cheyron, Henriette H. Goyeau
article
Perspectives Agricoles, 2014, Avril (410), pp.19-21
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titre
Diversity, specificity and impacts on field epidemics of QTLs involved in components of quantitative resistance in the wheat leaf rust pathosystem
auteur
Gustavo Azzimonti, Thierry Marcel, O. Robert, Sophie Paillard, Christian Lannou, Henriette Goyeau
article
Molecular Breeding, 2014, 34 (2), pp.549 - 567. ⟨10.1007/s11032-014-0057-8⟩
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titre
Role of ascospores and conidia in the initiation and spread of South American leaf blight in a rubber tree plantation
auteur
J. Guyot, V. Condina, F. Doaré, C. Cilas, I. Sache
article
Plant Pathology, 2014, 63 (3), pp.510 - 518. ⟨10.1111/ppa.12126⟩
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titre
Caractérisation de sources de résistance à la rouille brune chez le blé dur
auteur
Henriette H. Goyeau, Julie J. Berder, F. Lacoudre, K. Ammar, A. Loladze, L. Duchalais, E. Goudemand, N. Desmouceaux, C. Andre, P. Blanc, L. Gervais, P. Lonnet, T. Lefevre, O. Argillier, O. Robert, A. Lezie, B. Poupard, A. Ollivier
article
Innovations Agronomiques, 2014, 35, pp.143-150
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https://hal.inrae.fr/hal-02630771/file/Vol35-14-Goyeau_1.pdf BibTex
titre
Genetic diversity assessed by SSR markers and chemotyping of Fusarium culmorum causal agent of foot and root rot of wheat collected from two different fields in Tunisia
auteur
Hanene Rebib, Hanene Bouraoui, Mustapha Rouaissi, Yves Brygoo, Abdellatif Boudabbous, Med Rabeh Hajlaoui, Najla Sadfi-Zouaoui
article
European Journal of Plant Pathology, 2014, 139 (3), pp.481 - 495. ⟨10.1007/s10658-014-0405-x⟩
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titre
Site-directed mutagenesis of the P225, N230 and H272 residues of succinate dehydrogenase subunit B from Botrytis cinerea highlights different roles in enzyme activity and inhibitor binding
auteur
Anaïs Laleve, Stephanie Gamet, Anne Sophie A. S. Walker, Danièle D. Debieu, Valerie Toquin, Sabine, Helma S. H. Fillinger-David
article
Environmental Microbiology, 2014, 16 (7), pp.2253-2266. ⟨10.1111/1462-2920.12282⟩
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titre
Fungal model systems and the elucidation of pathogenicity determinants
auteur
Elena Perez-Nadales, Maria Filomena Almeida Nogueira, Clara Baldin, Sonia Castanheira, Mennat El Ghalid, Elisabeth Grund, Klaus Lengeler, Elisabetta E. Marchegiani, Pankaj Vinod Mehrotra, Marino Moretti, Vikram Naik, Miriam Oses-Ruiz, Therese Oskarsson, Katja Schaefer, Lisa Wasserstrom, Axel A. Brakhage, Neil A. R. Gow, Regine Kahmann, Marc-Henri M.-H. Lebrun, Jose Perez-Martin, Antonio Di Pietro, Nicholas J. Talbot, Valerie Toquin, Andrea Walther, Jurgen Wendland
article
Fungal Genetics and Biology, 2014, 70, pp.42 - 67. ⟨10.1016/j.fgb.2014.06.011⟩
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titre
The Transcription Factor BcLTF1 Regulates Virulence and Light Responses in the Necrotrophic Plant Pathogen Botrytis cinerea
auteur
Julia Schumacher, Adeline Simon, Kim Christopher Cohrs, Muriel Viaud, Paul Tudzynski
article
PLoS Genetics, 2014, 10 (1), pp.e1004040. ⟨10.1371/journal.pgen.1004040⟩
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https://hal.science/hal-01019558/file/Schumacher%20et%20al.%202014_1.pdf BibTex
titre
Habitat filtering by landscape and local forest composition in native and exotic New Zealand birds
auteur
Jean-Yves J.-Y. Barnagaud, Luc L. Barbaro, Julien J. Papaix, Marc Deconchat, Eckehard G E. G. Brockerhoff
article
esa Ecology, 2014, 95 (1), pp.78-87. ⟨10.1890/13-0791.1⟩
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titre
Resolving the polyphyletic nature of Pyricularia (Pyriculariaceae)
auteur
S. Klaubauf, Didier Tharreau, Elisabeth E. Fournier, J. Z. Groenewald, P. W. Crous, R. P. de Vries, Marc-Henri M.-H. Lebrun
article
Studies in Mycology, 2014, 79, pp.85-120. ⟨10.1016/j.simyco.2014.09.004⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02637974/file/Publis14-bgpi-013_1.pdf BibTex
titre
Use of high resolution melting analysis to genotype the avirulence AvrLm4-7 gene of Leptosphaeria maculans, a fungal pathogen of Brassica napus
auteur
J. Carpezat, S. Bothorel, Guillaume G. Daverdin, Marie-Helene Balesdent, M. Leflon
article
Annals of Applied Biology, 2014, 164 (3), pp.430-440,. ⟨10.1111/aab.12112⟩
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titre
Genomes and Transcriptomes of Partners in Plant-Fungal- Interactions between Canola (Brassica napus) and Two Leptosphaeria Species
auteur
Rohan G.T. Lowe, Andrew Cassin, Jonathan J. Grandaubert, Bethany L Clark, Angela P van de Wouw, Thierry T. Rouxel, Barbara J Howlett
article
PLoS ONE, 2014, 9 (7), pp.e103098. ⟨10.1371/journal.pone.0103098⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02634093/file/Rouxel%20PLOS%20ONE_1.pdf BibTex
titre
A synthetic sex ratio distortion system for the control of the human malaria mosquito
auteur
Roberto Galizi, Lindsey A. Doyle, Miriam Menichelli, Federica Bernardini, Anne Deredec, Austin Burt, Barry L. Stoddard, Nikolai Windbichler, Andrea Crisanti
article
Nature Communications, 2014, 5 (3977), ⟨10.1038/ncomms4977⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02634336/file/Nat%20comm%202014%20Deredec_1.pdf BibTex
titre
Une première à Avignon, les JÉR, journées d'échanges sur les résistances
auteur
Danièle D. Debieu, Jacques Grosman, Myriam Siegwart, Annie Micoud, Marie-France Corio-Costet, Anne Sophie A. S. Walker, Sabine, Helma Fillinger, Christophe Delye
article
Phytoma la Défense des Végétaux, 2014, 670, pp.7-9
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titre
The first set of expressed sequence tags (EST) from the medicinal mushroom Agaricus subrufescens delivers resource for gene discovery and marker development
auteur
Marie Foulongne-Oriol, Nicolas Lapalu, Cyril Férandon, Cathy Spataro, Nathalie Ferrer, Joelle J. Amselem, Jean-Michel Savoie
article
Applied Microbiology and Biotechnology, 2014, 98 (18), pp.7879-92. ⟨10.1007/s00253-014-5844-y⟩
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titre
Quantitative resistance can lead to evolutionary changes in traits not targeted by the resistance QTLs
auteur
Femke van den Berg, Christian C. Lannou, Christopher A. Gilligan, Frank van den Bosch
article
Evolutionary Applications, 2014, 7 (3), pp.370-380. ⟨10.1111/eva.12130⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02633765/file/2014_Van%20den%20Berg_Evol%20Applic_1.pdf BibTex
titre
Origin, Migration Routes and Worldwide Population Genetic Structure of the Wheat Yellow Rust Pathogen Puccinia striiformis f.sp. tritici
auteur
Sajid S. Ali, Pierre Gladieux, Marc Leconte, Angelique Gautier, A.F. Justesen, Mogens S. Hovmøller, Jerome Enjalbert, Claude C. Pope de Vallavieille
article
PLoS Pathogens, 2014, 10 (1), pp.003903. ⟨10.1371/journal.ppat.1003903⟩
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https://hal.science/hal-01019256/file/journal.ppat.1003903%20SAJID%20PLOS%20PATHOGENS_1.pdf BibTex
titre
Quantitative resistance affects the speed of frequency increase but not the diversity of the virulence alleles overcoming a major resistance gene to [i]Leptosphaeria maculans[/i] in oilseed rape
auteur
Régine Delourme, Lydia Bousset, Magali Ermel, Philippe Duffe, Anne-Laure Besnard, Bruno Marquer, Isabelle Fudal-Grolier, Juliette Linglin, Joel Chadoeuf, Hortense Brun
article
Infection, Genetics and Evolution, 2014, 27, pp.490-499. ⟨10.1016/j.meegid.2013.12.019⟩
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titre
Shifting the paradigm from pathogens to pathobiome: new concepts in the light of meta-omics
auteur
Muriel Vayssier Taussat, Emmanuel Albina, Christine Citti, Jean-Franҫois Cosson, Marie-Agnès Jacques, Marc-Henri Lebrun, Yves Le Loir, Mylène Ogliastro, Marie-Agnès Petit, Philippe Roumagnac, Thierry T. Candresse
article
Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2014, 4, pp.n/a. ⟨10.3389/fcimb.2014.00029⟩
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https://hal.science/hal-01153583/file/vayssier-taussat-2014-frontiers.pdf BibTex
titre
Rouille jaune du blé l'ex-marginale maritime prend sa revanche
auteur
Marianne Decoin, Claude de Vallavieille-Pope, Marc M. Leconte, Axel Olivier
article
Phytoma , 2014, 674, pp.42-43
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titre
A high virulence and pathotype diversity of Puccinia striiformis f.sp. tritici at its centre of diversity, the Himalayan region of Pakistan
auteur
Sajid S. Ali, Marc M. Leconte, Hidayatur Rahman, Shahab Saqib, Pierre Gladieux, Jerome J. Enjalbert, Claude de Vallavieille-Pope
article
European Journal of Plant Pathology, 2014, 140 (2), pp.275-290. ⟨10.1007/s10658-014-0461-2⟩
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titre
New races of Puccinia striiformis found in europe reveal race specificity of long-term effective adult plant resistance in wheat
auteur
Chris K. Sorensen, Mogens S. Howmoller, Marc Leconte, Françoise Dedryver-Person, Claude C. Pope de Vallavieille
article
Phytopathology, 2014, 104 (10), pp.1042-1051. ⟨10.1094/PHYTO-12-13-0337-R⟩
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https://hal.science/hal-01208727/file/PHYTOleconte_1.pdf BibTex
titre
IPM Strategies and Their Dilemmas Including an Introduction to www.eurowheat.org
auteur
L.N. Jorgensen, Ms Hovmoller, Jg Hansen, P Lassen, B Clark, R Bayles, B Rodemann, K Flath, M Jahn, T Goral, J Czembor, P Cheyron, C Maumené, Claude de Vallavieille-Pope, R Ban, Gc Nielsen, G Berg,
article
Journal of Integrative Agriculture , 2014, 13 (2), pp.265-281. ⟨10.1016/S2095-3119(13)60646-2⟩
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titre
Phosphoproteome profiles of the phytopathogenic fungi [i]Alternaria brassicicola[/i] and [i]Botrytis cinerea[/i] during exponential growth in axenic cultures
auteur
Marlène Davanture, Jerome Dumur, Nelly Bataillé, Claire Campion, Benoit Valot, Michel Zivy, Philippe Simoneau, Sabine, Helma Fillinger-David
article
Proteomics, 2014, 14 (13-14), pp.1639-1645. ⟨10.1002/pmic.201300541⟩
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https://hal.science/hal-04012727/file/Davanture_et_al_210314%20%281%29.pdf BibTex
titre
Golden SusPtrit: a genetically well transformable barley line for studies on the resistance to rust fungi
auteur
Fks Yeo, G Hensel, T Vozabova, A Martin-Sanz, Thierry T. Marcel, J Kumlehn, Re Niks
article
TAG Theoretical and Applied Genetics, 2014, 127 (2), pp.325-337. ⟨10.1007/s00122-013-2221-7⟩
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titre
Epigenetic Control of Effector Gene Expression in the Plant Pathogenic Fungus [i]Leptosphaeria maculans[/i]
auteur
Jessica Soyer, Mennat El Ghalid, Nicolas Glaser, Bénédicte Ollivier, Juliette Linglin, Jonathan Grandaubert, Marie-Helene Balesdent, Lanelle R. Connolly, Michael Freitag, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal
article
PLoS Genetics, 2014, 10 (3), 19 p. ⟨10.1371/journal.pgen.1004227⟩
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https://hal.science/hal-01019254/file/Soyer%20et%20al%20PLOS%20Genetics%202014_1.pdf BibTex
titre
Convergent evolution of morphogenetic processes in fungi
auteur
Philippe Silar, Fabienne Malagnac, Frédérique Bidard, Hervé Lalucque, Sylvain Brun, Karine Lambou, Marc-Henri Lebrun
article
Communicative and Integrative Biology, 2014, 1 (2), pp.180-181. ⟨10.4161/cib.1.2.7198⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02468137/file/cib0102_0180.pdf BibTex
titre
Transposable element-assisted evolution and adaptation to host plant within the Leptosphaeria maculans-Leptosphaeria biglobosa species complex of fungal pathogens
auteur
Jonathan J. Grandaubert, Rohan G.T. Lowe, Jessica L. Soyer, C.L. Schoch, Angela P van de Wouw, Isabelle Fudal-Grolier, Barbara Robbertse, Nicolas Lapalu, Matthew G Links, Bénédicte B. Ollivier, Juliette Linglin, Valérie Barbe, Sophie Mangenot, Cruaud Corinne, Hossein Borban, Barbara J Howlett, Marie-Helene Balesdent, Thierry T. Rouxel
article
BMC Genomics, 2014, 15 (891), pp.OA. ⟨10.1186/1471-2164-15-891⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02631920/file/bmc%20genomics%20grandaubert_1.pdf BibTex

Conference papers

titre
Génomique structurale et fonctionnelle de la résistance quantitative du colza à Leptosphaeria maculans
auteur
Régine Delourme, Berline Fopa Fomeju, Antoine Gravot, Sophie Paillard, Corine Cruaud, Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Marie-Helene Balesdent, Thierry T. Rouxel, Maria M. Manzanares-Dauleux
article
Colloque Résistance, Nov 2014, Lauret, France
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titre
WHEATAMIX Project : Increasing within-field wheat diversity to foster ecosystem services in the Parisian basin
auteur
Vincent Allard, Bruno Andrieu, Sébastien Barot, Julie Borg, Amélie Cantarel, Céline Cervek, François Coléno, Claude Pope de Vallavieille, Dominique Descoureaux, Florence Dubs, Jerome Enjalbert, M Feret, Nathalie Galic, Arnaud Gauffreteau, J.D. Gilet, Isabelle Goldringer, Mourad Hannachi, G Houivet, Sophie Pin, Marie-Helene Jeuffroy, Christian Kerbiriou, Pierre Labarthe, Jean Christophe Lata, Christophe Lecarpentier, L Lejars, B. Lemain, Stephane Lemarié, F. Leny, Xavier Le Roux, M. Le Viol, Christophe Montagnier, Audrey Niboyet, B. Omond, S. Piaud, Franck Poly, Thomas Pommier, Emmanuelle Porcher, Sébastien Saint-Jean, Sandrine Salmon, Didier Tropee, Tiphaine Vidal
article
3. International Conference on Biodiversity and the UN Millennium Development Goals,Biodiversity and Food Security – From Trade-offs to Synergies, Oct 2014, Aix en Provence, France
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titre
Interaction between the avirulence genes AvrLm3 and AvrLm7 of the phytopathogenic fungus Leptosphaeria maculans
auteur
Clémence Plissonneau, Guillaume G. Daverdin, Marie-Helene Balesdent, Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Thierry T. Rouxel
article
Effectome 2014, Oct 2014, Lauret, France
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BibTex
titre
Epigenetic hotspots as ecological niches for pathogenicity-related genes?
auteur
Jessica L. Soyer, Mareike Möller, Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Thierry T. Rouxel, Eva H. Stukenbrock
article
Effectome 2014, Oct 2014, Lauret, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02795047/file/Effectome%202014%20abstracts-1_1.pdf BibTex
titre
A two genes – for – one gene interaction between Leptosphaeria maculans and Brassica napus
auteur
Yohann Petit, Alexandre A. Degrave, Michel Meyer, Francoise Blaise, Benedicte Ollivier, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal, Marie-Helene Balesdent
article
7th Effectome meeting, Oct 2014, Lauret, France
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https://hal.science/hal-01456010/file/a%20two%20genes_1.pdf BibTex
titre
Host specialization and structure of Mycosphaerella graminicola populations
auteur
Johann J. Confais, Lilian L. Gout, Marie Massot
article
Mycosphaerella graminicola / Zymoseptoria tritici European Workshop, Sep 2014, exeter, United Kingdom
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titre
The avirulence gene AvrLm4-7 of Leptosphaeria maculans: linking crystal structure, functional and evolutionary characteristics.
auteur
Karine Blondeau, Francoise F. Blaise, Marc Graille, S.D. Kale, Juliette Linglin, Bénédicte B. Ollivier, Audrey Labarde, Noureddine Lazar, Danielle H. Y. Choi, Brett M Tyler, Thierry T. Rouxel, Herman van Tilbeurgh, Isabelle Fudal-Grolier Fudal
article
Cost Action SUSTAIN Structure-guided Investigation of Effector Function, Action and Recognition, Sep 2014, Bucarest, Romania
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titre
Spécialisation d’hôte et structure des populations de Mycosphaerella graminicola, agent de la Septoriose du blé
auteur
Johann Confais, Lilian Gout, Marie Massot
article
36ème colloque « Petit pois déridé », Aug 2014, Orsay, France
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titre
Using wheat cultivar mixtures as a control method against Septoria tritici blotch: Experimental and modeling approaches
auteur
Christophe Gigot, Sébastien Saint-Jean, Laurent Huber, Claude C. Pope de Vallavieille
article
2014 American Phytopathological Society /CPS Joint Meeting, Aug 2014, Minneapolis, Minesota, United States
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titre
WHEATAMIX Project : Increasing within-field wheat diversity to foster ecosystem services in the Parisian basin
auteur
Vincent Allard, Bruno Andrieu, Sébastien Barot, Julie Borg, Amélie Cantarel, Céline Cervek, François Coléno, Claude Pope de Vallavieille, Dominique Descoureaux, Florence Dubs, Jerome Enjalbert, M Feret, Nathalie Galic, Arnaud Gauffreteau, J.D. Gilet, Isabelle Goldringer, Mourad Hannachi, G Houivet, Sophie Pin, Marie-Helene Jeuffroy, Christian Kerbiriou, Pierre Labarthe, Jean Christophe Lata, Christophe Lecarpentier, L Lejars, B. Lemain, Stephane Lemarié, F. Leny, Xavier Le Roux, M. Le Viol, Christophe Montagnier, Audrey Niboyet, B. Omond, S. Piaud, Franck Poly, Thomas Pommier, Emmanuelle Porcher, Sébastien Saint-Jean, Sandrine Salmon, Didier Tropee, Tiphaine Vidal
article
Solibam final congress - Diversity strategies for organic and low input agricultures and their food systems, Jul 2014, Nantes, France
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titre
Key mutations in the Cylindrical Inclusion are involved in Lettuce mosaic virus adaptation to eIF4E-mediated resistance in lettuce
auteur
Sylvie S. German-Retana, Maud Sorel, Laurence Svanella-Dumas, Guillaume Acelin, Anais Pitarch, Amandine A. Bordat, Marie-Christine M.-C. Houvenaghel, Thierry T. Candresse
article
33. Annual Meeting of the American Society for Virology, Jun 2014, Fort Collins, United States
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titre
Insights into hemibiotrophy and host manipulation from the genomes and transcriptomes of Colletotrichum fungi
auteur
Richard O'Connell
article
Seminar of the Biocentre Klein Flottbek, University of Hamburg, Jun 2014, Hamburg, Germany
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titre
Implication d’un contrôle épigénétique dans l’expression des gènes codant des effecteurs chez Leptosphaeria maculans, champignon pathogène du colza
auteur
Jessica Louise Soyer, Mennat El Ghalid, Benedicte Ollivier, Juliette Linglin, Lanelle Connolly, Michael Freitag, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal
article
Colloque EpiAgro 2014, Jun 2014, Rennes, France
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titre
Functional characterization of avirulence genes in Leptosphaeria maculans: linking 3-D structure, functional characteristics and evolution
auteur
Karine Blondeau, Francoise F. Blaise, Marc Graille, Shive D. Kale, Juliette Linglin, Bénédicte B. Ollivier, Audrey Labarde, Nourredine Lazar, Guillaume G. Daverdin, Marie-Helene Balesdent, Dannielle H.Y. Choi, Brett M. Tyler, Thierry T. Rouxel, Herman van Tilbeurgh, Isabelle Fudal-Grolier Fudal
article
COST Cell Biology Workshop, Apr 2014, Toulouse, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02796393/file/Fudal%20abstract%20COST%20Toulouse%202014_1.pdf https://hal.inrae.fr/hal-02796393/file/Fudal%20abstract%20COST%20Toulouse%202014_2.doc BibTex
titre
Effector delivery by the appressoria and biotrophic hyphae of Colletotrichum
auteur
Richard O'Connell
article
COST SUSTAIN Workshop on cellular dynamics of effector action and recognition, Apr 2014, Toulouse, France
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titre
Laser microdissection and transcriptomics of infection cushion development of fusarium graminearum
auteur
Marike Boenisch, Anika Glasenapp, Jorg Bormann, Stefan Scholten, Sebastian Piehler, Martin Münsterkötter, Ulrich Güldener, Marc-Henri M.-H. Lebrun
article
12th European conference on fungal genetics, Mar 2014, Séville, Spain. p.67
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titre
Transposoable elements reshaping genomes and favoring the evolutionary and adaptive potential of fungal phytopathogens
auteur
Thierry T. Rouxel, Jonathan J. Grandaubert, Marie-Helene Balesdent
article
12th European conference on fungal genetics, Mar 2014, Séville, Spain. p.28
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BibTex
titre
Light-responsive transcription factors (LTFS) regulate differentiation CS2.8 and virulence in the gray mold fungus Botrytis cinerea
auteur
Julia Schumacher,, Kim Christopher Cohrs, Adeline A. Simon, Muriel Viaud, Paul Tudzynski
article
12. European conference on fungal genetics, Mar 2014, Séville, Spain
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titre
MGMFS1 is the major membrane transporter involved in multiple drug resistance in Mycosphaerella graminicola field isolates
auteur
Selim Omrane, Anne Sophie A. S. Walker, Hind Sghyer, Catherine C. Lanen, Lamia Aouini, Sabine, Helma S. H. Fillinger-David
article
12th European conference on fungal genetics, Mar 2014, Séville, Spain. p.306
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BibTex
titre
Epigenetic control of effector gene expression in the plant pathogenic fungus Leptosphaeria maculans
auteur
Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Jessica L. Soyer, Mennat El Ghalid, Marie-Helene Balesdent, Lanelle Connolly, Michael Freitag, Thierry T. Rouxel
article
12th European conference on fungal genetics, Mar 2014, Séville, Spain. p.65
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BibTex
titre
Implication d’un contrôle épigénétique dans l’expression des gènes codant des effecteurs chez Leptosphaeria maculans, champignon pathogène du colza
auteur
Jessica Soyer, Mennat El Ghalid, Bénédicte Ollivier, Juliette Linglin, L.R. Connolly, M. Freitag, Thierry Rouxel, Isabelle Fudal-Grolier
article
10es Rencontres de Phytopathologie-Mycologie de la Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2014, Aussois, France. p.24
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https://hal.science/hal-01189873/file/recueil_jjc%20AUSSOIS%202014_1.pdf BibTex
titre
Expression profiles of Mycosphaerella graminicola candidate effector genes
auteur
Johann J. Confais, Houda Fartoun, Lilian Gout, Marc-Henri Lebrun, Thierry Marcel
article
10es Rencontres de Phytopathologie-Mycologie de la Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2014, Aussois, France. p. 101
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https://hal.science/hal-01019611/file/recueil_jjc%20AUSSOIS%202014_1.pdf BibTex
titre
Characterization of molecular mechanisms underlying the multi-drugresistant phenotypes of Mycosphaerella graminicola field isolates
auteur
Selim Omrane, Hind Sghyer, Catherine Lanen, L. Aouini, G. Kema, Anne Sophie A. S. Walker, Sabine, Helma Fillinger-David
article
10es Rencontres de Phytopathologie-Mycologie de la Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2014, Aussois, France. p. 21
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https://hal.science/hal-01019587/file/recueil_jjc%20AUSSOIS%202014_1.pdf BibTex
titre
Functional analysis of secondary metabolism gene clusters expressed in fungal appressoria
auteur
Jean-Felix Dallery, Marc-Henri Lebrun, Richard O'Connell
article
10es Rencontres de Phytopathologie-Mycologie de la Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2014, Aussois, France. p. 75
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titre
Mycosphaerella graminicola : même les hyperactifs sexuels ont parfois besoin d'un bon entremetteur
auteur
Frederic Suffert
article
10es Rencontres de Phytopathologie-Mycologie de la Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2014, Aussois, France. p. 42
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titre
Botrytis pseudocinerea is resistant to the fungicide fenhexamid due to detoxification by the cytochrome P450 monooxygenase Cyp684
auteur
Saad Azeddine, Alexis A. Billard, Jocelyne Bach, Catherine Lanen, Anne Sophie A. S. Walker, Danièle D. Debieu, Sabine, Helma Fillinger-David
article
10es Rencontres de Phytopathologie-Mycologie de la Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2014, Aussois, France. p. 83
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titre
Modélisation du risque sanitaire en grande culture à l'échelle régionale
auteur
David D. Blanchard, Christian C. Lannou, Henriette H. Goyeau, F. F. F. Carpentier, Herve H. Monod
article
10es Rencontres de Phytopathologie-Mycologie de la Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2014, Aussois, France. p. 90
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titre
Allocation optimale de cultures dans un paysage agricole : conflits entre dynamique épidémique, durabilité de la résistance et évolution à long terme des populations pathogènes
auteur
Julien Papaix, J.J. Burdon, J. Zhan, Christian Lannou, P.H. Thrall
article
10es Rencontres de Phytopathologie-Mycologie de la Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2014, Aussois, France. p. 38
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titre
BOA13, un facteur de transcription qui régule la synthèse d'acide botcinique et d'autres fonctions impliquées dans la nécrotrophie
auteur
Antoine Porquier, Berengere Dalmais-Lenaers, Hind Sghyer, Adeline Simon, Guillaume Morgant, Pascal Le Pecheur, Muriel Viaud
article
10es Rencontres de Phytopathologie-Mycologie de la Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2014, Aussois, France. p. 50
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titre
Relations entre composantes de la résistance quantitative et résistance au champ, chez la rouille brune du blé causée par Puccinia triticina
auteur
Henriette Goyeau, Gustavo Azzimonti, Julien Papaix, Christian Lannou
article
10es Rencontres de Phytopathologie-Mycologie de la Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2014, Aussois, France. p. 44
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https://hal.science/hal-01019207/file/recueil_jjc%20AUSSOIS%202014_1.pdf BibTex
titre
Incursion of a new aggressive Puccinia striiformis f.sp. tritici race in Syria and Lebanon in 2010-2011
auteur
Rola El Amil, Marc Leconte, Sajid S. Ali, M. M. Hovmøller, A. Yahyaoui, Claude C. Pope de Vallavieille, K. Nazari
article
10es Rencontres de Phytopathologie-Mycologie de la Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2014, Aussois, France. p. 68
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titre
Analyse de l'interaction entre les gènes d'avirulence AvrLm3 et AvrLm4-7 chez Leptosphaeria maculans
auteur
Clémence Plissonneau, Marie-Helene Balesdent, Isabelle Fudal, Thierry Rouxel
article
10es Rencontres de Phytopathologie-Mycologie de la Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2014, Aussois, France. p. 52
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titre
Insights into fungal hemibiotrophy from sequencing the genomes and transcriptomes of Colletotrichum species
auteur
Richard O'Connell
article
Séminaire de l'Institut de Biologie des Plantes, Jan 2014, Orsay, France
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titre
URGI plant and fungi platform: distributed resources through GMOD tools
auteur
Joelle J. Amselem, Michael M. Alaux, Nathalie Choisne, Olivier Inizan, Nicolas Lapalu, Nacer Mohellibi, Françoise F. Alfama-Depauw, Aminah A. Keliet, Erik Kimmel, Jonathan Kreplak, Claire Guerche, Mikael Loaec, Cyril Pommier, Matthias Zytnicki, Marc-Henri M.-H. Lebrun, Delphine D. Steinbach, Hadi Quesneville
article
Plant and Animal Genome conference XXII, GMOD session, Jan 2014, San Diego (CA), United States
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https://hal.inrae.fr/hal-02796293/file/AMSELEM%20SANS%20DIEGO_1.htm BibTex
titre
Effet de l'architecture d'un couvert de blé et des caractéristiques pluviométriques sur la dispersion par éclaboussement de Mycosphaerella graminicola en conditions contrôlées
auteur
Tiphaine Vidal, C. Gigot, G. Girardin, C. de Vallavieille-Pope, Frédéric Suffert, L. Huber, Cédric Robert Robert, Sébastien Saint-Jean
article
Journées Jean Chevaugeon, Jan 2014, Aussois, France. pp.95
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Book sections

titre
Genomics of Colletotrichum
auteur
Joanne Crouch, Richard O'Connell, Pamela Gan, Ester Buiate, Maria F. Torres, Lisa Beirn, Ken Shirasu, Lisa Vaillancourt
article
Genomics of Plant-Associated Fungi: Monocot Pathogens, RA Dean, A Lichens-Park, C Kole, Springer-Verlag, 2014, 978-3-662-44053-7
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https://hal.inrae.fr/hal-02798712/file/Crouch%20CHAP%20OUV%20RICHARD_1.pdf BibTex
titre
The Genome of Botrytis cinerea, a Ubiquitous Broad Host Range Necrotroph
auteur
Matthias Hahn, Muriel Viaud, J. van Kan
article
Genomics of Plant-Associated Fungi and Oomycetes: Dicot Pathogens, Editions Springer, 2014, 978-3-662-44055-1
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titre
Evolutionary and adaptive role of transposable elements in fungal genomes
auteur
Jonathan J. Grandaubert, Marie-Helene Balesdent, Thierry T. Rouxel
article
FUNGI, 70, , pp.79-107, 2014, Advances in Botanical Research, 978-0-12-397940-7. ⟨10.1016/B978-0-12-397940-7.00003-3⟩
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Habilitation à diriger des recherches

titre
Génomique fonctionnelle des interactions plantes / champignons
auteur
Isabelle Fudal-Grolier Fudal
article
Sciences du Vivant [q-bio]. Université Paris Sud - Paris 11, 2014
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Poster communications

titre
Expression profiles of Mycosphaerella graminicola effector genes highlight a succession of different infectious strategies during wheat leaves colonization
auteur
Johann J. Confais, Houda Fartoun, Elisabetta E. Marchegiani, Lilian L. Gout, Thierry T. Marcel, Marc-Henri M.-H. Lebrun
article
The 7. Effectome meeting, Oct 2014, Lauret, France. , 2014
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titre
A two genes – for – one gene interaction between Leptosphaeria maculans and Brassica napus
auteur
Yohann Petit, Alexandre A. Degrave, Michel M. Meyer, Francoise F. Blaise, Thierry T. Rouxel, Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Marie-Helene Balesdent
article
Effectome 2014, Oct 2014, Lauret, France. , 2014
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titre
Identification and functional characterisation of late effectors involved in systemic colonization of oilseed rape by Leptosphaeria maculans
auteur
Julie Gervais, Thierry T. Rouxel, Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Marie-Helene Balesdent
article
Effectome 2014, Oct 2014, Lauret, France. 2014
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titre
Leptosphaeria maculans effector AVRLM4-7 suppresses the plant defence 377 responses in susceptible cultivar of Brassica napus
auteur
Miroslava Nováková, Olga Valentová, Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Marie-Helene Balesdent, Thierry T. Rouxel, Lenka Burketová
article
12th European conference on fungal genetics, Mar 2014, Séville, Spain. , p.258, 2014
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titre
Epigenetic control of effector gene expression in the plant pathogenic fungus Leptosphaeria maculans
auteur
Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Jessica L. Soyer, Mennat El Ghalid, Marie-Helene Balesdent, Lanelle Connolly, Michael Freitag, Thierry T. Rouxel
article
12th European conference on fungal genetics, Mar 2014, Séville, Spain. 2014
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titre
Light-responsive transcription factors (LTFS) regulate differentiation CS2.8 and virulence in the gray mold fungus Botrytis cinerea
auteur
Julia Schumacher, Kim Cohrs, Adeline A. Simon, Muriel Viaud, Paul Tudzynski
article
12th European conference on fungal genetics, Mar 2014, Séville, Spain. , p.214, 2014
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titre
The first set of expressed sequence TAGS (ESTS) in the medicinal mushroom Agaricus subrufescens provides opportunitgies to discover production pathways of bioactive compounds and develop molecular breeding
auteur
Marie Foulongne-Oriol, Nicolas Lapalu, Joelle J. Amselem, Jean-Michel Savoie
article
12th European conference on fungal genetics, Mar 2014, Séville, Spain. , p.315, 2014
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titre
Role of map kinase pathways in the pathogenicity of the wheat pathogen Mycosphaerella graminicola
auteur
Elisabetta E. Marchegiani, Julie Vallet, Marc-Henri M.-H. Lebrun
article
12th European conference on fungal genetics, Mar 2014, Séville, Spain. , p.265, 2014, 5.Pathogenic and Mutalistic Interactions
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BibTex
titre
Whole genome comparative analysis of transposable elements provide new insights on silencing mechanisms in fungal genomes
auteur
Joelle J. Amselem, Marc-Henri M.-H. Lebrun, Hadi Quesneville
article
Mobile Genetic Elements & Genome Evolution symposium, Mar 2014, Santa Fe New mexico, United States. , 2014
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BibTex
titre
Effect of pea-wheat mixture on the severity of Septoria tritici blotch
auteur
Elise Pelzer, Tiphaine Vidal, Valérian Lebon, Nesrine Tarsim, Claude C. Pope de Vallavieille, Sébastien Saint-Jean
article
10èmes Rencontres de Phytopathologie-Mycologie de la Société Française de Phytopathologie (SFP), Jan 2014, Aussois, France. 2014, des Journées Jean Chevaugeon 10èmes Rencontres de Phytopathologie-Mycologie de la Société Française de Phytopathologie (SFP)
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https://hal.science/hal-01378300/file/recueil_jjc%20AUSSOIS%202014_1.pdf BibTex

Reports

titre
Analyse de risque phytosanitaire [i]Plasmopara halstedii[/i] agent responsable de la maladie du mildiou du tournesol
auteur
Frederic Suffert, François Delmotte, Marc Delos, Valérie Grimault, Denis D. Tourvieille de Labrouhe, Patrick Vincourt, Veronique Wilson, Philippe Reignault, Sylvie Augustin, Nathalie Bréda, Philippe Castagnone-Sereno, Bruno Chauvel, Nicolas Desneux, Abraham Escobar Gutiérrez, Laurent Gentzbittel, Herve Jactel, Jean-Claude Laberche, Thomas Le Bourgeois, Guy Lemperiere, Didier Mugniery, Pierre Silvie, Stéphan Steyer, François Verheggen, Thierry Wetzel
article
[0] Anses. 2014, 107 p
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2013

Journal articles

titre
Xlr1 is involved in the transcriptional control of the pentose catabolic pathway, but not hemi-cellulolytic enzymes in Magnaporthe oryzae
auteur
Evy Battaglia, Sylvia Klaubauf, Julie J. Vallet, Cécile C. Ribot, Marc-Henri M.-H. Lebrun, Ronald de Vries
article
Fungal Genetics and Biology, 2013, 57, pp.76 - 84. ⟨10.1016/j.fgb.2013.06.005⟩
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https://hal.science/hal-01759648/file/2013-Battaglia%20E%20-%20Fungal%20Gen%20Biol.pdf BibTex
titre
Associations de blés tendres: Mélanger les variétés pour limiter les attaques de septoriose
auteur
Christophe Gigot, C. de Vallavieille-Pope, M. Leconte, Sébastien Saint-Jean
article
Perspectives Agricoles, 2013, Juin (401), pp.70-74
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https://hal.science/hal-00909149/file/Perspectives%20Agricoles%20401_1.pdf BibTex
titre
The pentose catabolic pathway of the rice-blast fungus Magnaporthe oryzae involves a novel pentose reductase restricted to few fungal species
auteur
Sylvia Klaubauf, Cecile Ribot, Delphine Melayah, Arnaud Lagorce, Marc-Henri Lebrun, Ronald P. de Vries
article
FEBS Letters, 2013, 587 (9), pp.1346 - 1352. ⟨10.1016/j.febslet.2013.03.003⟩
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titre
Chikungunya Virus-associated Long-term Arthralgia: A 36-month Prospective Longitudinal Study
auteur
Clémentine Schilte, Frédérik Staikovsky, Thérèse Couderc, Yoann Madec, Florence Carpentier, Somar Kassab, Matthew L. Albert, Marc Lecuit, Alain Michault
article
PLoS Neglected Tropical Diseases, 2013, 7 (3), pp.e2137. ⟨10.1371/journal.pntd.0002137⟩
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https://hal.science/hal-01189712/file/journal_pntd_0002137.PDF BibTex
titre
Approximate Bayesian computation with functional statistics
auteur
Samuel Soubeyrand, Florence Carpentier, François Guiton, Etienne K. Klein
article
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 2013, 12 (1), pp.17-37. ⟨10.1515/sagmb-2012-0014⟩
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https://agroparistech.hal.science/hal-01584412/file/soubeyrand2013_1.pdf BibTex
titre
Protective effects of a wheat cultivar mixture against splash-dispersed septoria tritici blotch epidemics
auteur
Christophe Gigot, Sébastien Saint-Jean, L. Huber, C. Maumené, M. Leconte, B. Kerhornou, Claude de Vallavieille-Pope
article
Plant Pathology, 2013, 62 (5), pp.1011-1019. ⟨10.1111/ppa.12012⟩
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titre
Associations de blés tendres : Mélanger les variétés pour limiter les attaques de septoriose
auteur
Christophe Gigot, Claude de Vallavieille-Pope, Marc M. Leconte, Sebastien Saint-Jean
article
Perspectives Agricoles, 2013, 401 ( juin 2013), pp.70-74
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BibTex
titre
Defining and designing plant architectural ideotypes to control epidemics?
auteur
Didier Andrivon, Carole Giorgetti, Alain Baranger, Agnes Calonnec, Philippe Cartolaro, Robert Faivre, Sébastien Guyader, Pierre-Eric Lauri, Francoise Lescourret, Luciana Parisi, Bertrand Ney, Bernard Tivoli, Ivan Sache
article
European Journal of Plant Pathology, 2013, 135 (3), pp.611-617. ⟨10.1007/s10658-012-0126-y⟩
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BibTex
titre
Microbe-Independent Entry of Oomycete RxLR Effectors and Fungal RxLR-Like Effectors Into Plant and Animal Cells Is Specific and Reproducible
auteur
Brett M. B. M. Tyler, Shiv D. S. D. Kale, Qunqing Q. Wang, Kai K. Tao, Helen R. H. R. Clark, Kelly K. Drews, Vincenzo V. Antignani, Amanda A. Rumore, Tristan T. Hayes, Jonathan Michael J. M. Plett, Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Biao B. Gu, Qinghe Q. Chen, Katharyn J. K. J. Affeldt, Erwin Berthier, Gregory J. G. J. Fischer, Daolong D. Dou, Weixing W. Shan, Nancy P. N. P. Keller, Francis Martin, Thierry T. Rouxel, Christopher B. C. B. Lawrence
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, 2013, 26 (6), pp.611 - 616. ⟨10.1094/mpmi-02-13-0051-ia⟩
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https://hal.science/hal-01001070/file/Tyler%20Molecular%20Plant-Microbe%20Interactions_1.htm BibTex
titre
The development of a foliar fungal pathogen does react to leaf temperature !
auteur
Frederic F. Bernard, Ivan I. Sache, Frederic F. Suffert, Michaël Chelle
article
New Phytologist, 2013, 198 (1), pp.232-240. ⟨10.1111/nph.12134⟩
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BibTex
titre
Maladies des céréales ;Rouille jaune du blé: une nouvelle race a dominé en 2012.
auteur
Philippe Du Cheyron, Claude C. Pope de Vallavieille, Marc Leconte
article
Yvoir.fr - Savoir et Anticiper, 2013, 3 p
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https://hal.science/hal-01053141/file/nrrj2013%20YVOIR%20ROUILLE%20JAUNE_1.pdf BibTex
titre
French vineyards provide information that opens ways for effective resistance management of Botrytis cinerea (grey mould)
auteur
Anne Sophie A. S. Walker, Annie Micoud, Florent Remuson, Jacques Grosman, Michel Gredt, Pierre Leroux
article
Pest Management Science, 2013, 69 (6), pp.667 - 678. ⟨10.1002/ps.3506⟩
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BibTex
titre
The dispensable chromosome of Leptosphaeria maculans shelters an effector gene conferring avirulence towards Brassica rapa.
auteur
Marie-Helene Balesdent, Isabelle Fudal-Grolier Fudal, Bénédicte B. Ollivier, Pascal P. Bally, Jonathan J. Grandaubert, Frederique F. Eber, Anne-Marie Chèvre, Martine M. Leflon, Thierry T. Rouxel
article
New Phytologist, 2013, 198 (3), pp.887-898. ⟨10.1111/nph.12178⟩
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https://hal.science/hal-01004245/file/Balesdent%20New%20Phytologist%20-_1.htm BibTex
titre
Quantitative plant resistance in cultivar mixtures: wheat yellow rust as a modelling case study.
auteur
Natalia Sapoukhina, Sophie Paillard, Françoise Dedryver-Person, Claude C. Pope de Vallavieille
article
New Phytologist, 2013, 200 (3), pp.888-897. ⟨10.1111/nph.12413⟩
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https://hal.science/hal-01189711/file/Sapoukhina%20-%20New%20Phytologist_1.htm BibTex
titre
Gestion de la résistance aux maladies à l’échelle des territoires cultivés
auteur
Christian Lannou, Julien Papaix, Herve Monod, Louis-Marie Raboin, Henriette Goyeau
article
Innovations Agronomiques, 2013, 29, pp.33-44
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https://hal.science/hal-01190581/file/2013_Lannou_Innovations%20Agronomiques%2029.pdf BibTex
titre
Functional interplay of DnaE polymerase, DnaG primase and DnaC helicase within a ternary complex, and primase to polymerase hand-off during lagging strand DNA replication in Bacillus subtilis
auteur
Olivier Rannou, Emmanuelle Le Chatelier, Marilynn A. Larson, Hamid Nouri, Berengere Dalmais-Lenaers, Charles Laughton, Laurent Janniere, Panos Soultanas
article
Nucleic Acids Research, 2013, 41 (10), pp.5303 - 5320. ⟨10.1093/nar/gkt207⟩
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https://hal.science/hal-01190567/file/2013_Rannou_Nucleic%20Acids%20Research_1.pdf BibTex
titre
Shared influence of pathogen and host genetics on a trade-off between latent period and spore production capacity in the wheat pathogen, Puccinia triticina
auteur
Benedicte B. Pariaud, Femke F. van den Berg, Frank F. van den Bosch, Stephen J. S. J. Powers, Oliver O. Kaltz, Christian C. Lannou
article
Evolutionary Applications, 2013, 6 (2), pp.303 - 312. ⟨10.1111/eva.12000⟩
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https://hal.science/hal-01001587/file/eva.12000.pdf BibTex
titre
Plant and animal protein intakes are differently associated with nutrient adequacy of the diet of French adults
auteur
Géraldine M. G. M. Camilleri, Eric E. Verger, Jean-François Huneau, Florence F. Carpentier, Carine C. Dubuisson, François Mariotti
article
Journal of Nutrition, 2013, 143 (9), pp.1466-1473. ⟨10.3945/jn.113.177113⟩
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BibTex
titre
Comparative genomic and transcriptomic analyses reveal the hemibiotrophic stage shift ofColletotrichum fungi
auteur
Pamela Gan, Kyoko Ikeda, Hiroki Irieda, Mari Narusaka, Richard O'Connell, Yoshihiro Narusaka, Yoshitaka Takano, Yasuyuki Kubo, Ken Shirasu
article
New Phytologist, 2013, 197 (4), pp.1236-1249. ⟨10.1111/nph.12085⟩
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BibTex
titre
The Magnaporthe oryzae effector AVR1-CO39 is translocated into rice cells independently of a fungal-derived machinery
auteur
Cécile C. Ribot, Stella S. Cesari, Imène I. Abidi, Veronique V. Chalvon-Poulier, Caroline C. Bournaud, Julie J. Vallet, Marc-Henri M.-H. Lebrun, Jean-Benoit J.-B. Morel, Thomas T. Kroj
article
Plant Journal, 2013, 74 (1), pp.1-12. ⟨10.1111/tpj.12099⟩
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BibTex
titre
From model to crop plant-pathogen interactions:cloning of the first resistance gene to Leptosphaeria maculans in Brassica napus
auteur
Thierry T. Rouxel, Marie-Helene Balesdent
article
New Phytologist, 2013, 197 (2), pp.356-358. ⟨10.1111/nph.12099⟩
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https://hal.science/hal-01000637/file/lepto%20new%20phytol%20_1.%20pdf BibTex
titre
Components of quantitative resistance to leaf rust in wheat cultivars: diversity, variability and specificity
auteur
Gustavo Azzimonti, Christian Lannou, Ivan Sache, Henriette Goyeau
article
Plant Pathology, 2013, 62 (5), pp.970 - 981. ⟨10.1111/ppa.12029⟩
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BibTex
titre
How can quantitative ecology be attractive to young scientists? Balancing computer/desk work with fieldwork
auteur
Olivier O. Gimenez, Fitsum Abadi, Jean-Yves J.-Y. Barnagaud, L. L. Blanc, Mathieu Buoro, S. S. Cubaynes, M. M. Desprez, Marlène M. Gamelon, F. F. Guilhaumon, P. P. Lagrange, B. B. Madon, L. L. Marescot, Eleni E. Papadatou, Julien J. Papaix, G. G. Péron, S. S. Servanty
article
Animal Conservation, 2013, 16 (2), pp.134-136. ⟨10.1111/j.1469-1795.2012.00597.x⟩
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BibTex
titre
Role of sterol 3-ketoreductase sensitivity in susceptibility to the fungicide fenhexamid in Botrytis cinerea and other phytopathogenic fungi
auteur
Danièle D. Debieu, Jocelyne Bach, Emeline Montesinos, Sabine, Helma Fillinger-David, Pierre Leroux
article
Pest Management Science, 2013, 69 (5), pp.642 - 651. ⟨10.1002/ps.3418⟩
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BibTex
titre
Genetic differentiation of the wheat leaf rust fungus Puccinia triticina in Europe.
auteur
J.A. J. Kolmer, A. A. Hanzalova, Henriette H. Goyeau, R. R. Bayles, A. A. Morgounov
article
Plant Pathology, 2013, 62 (1), pp.21-31. ⟨10.1111/j.1365-3059.2012.02626.x⟩
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https://hal.science/hal-01004299/file/-%20Kolmer%20-%202012%20-%20Plant%20Pathology%20-_1.htm BibTex
titre
Assessment of quantitative traits of aggressiveness in Mycosphaerella graminicola on adult wheat plants
auteur
Frederic F. Suffert, Ivan I. Sache, Christian C. Lannou
article
Plant Pathology, 2013, 62 (6), pp.1330-1341. ⟨10.1111/ppa.12050⟩
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BibTex
titre
Clonal populations of Leptosphaeria maculans contaminating cabbage in Mexico
auteur
Azita Dilmaghani, Lilian Gout, O. Moreno-Rico, J. S. Dias, Laurent Coudard, N. Castillo-Torres, Marie-Helene Balesdent, Thierry Rouxel
article
Plant Pathology, 2013, 62 (3), pp.520 - 532. ⟨10.1111/j.1365-3059.2012.02668.x⟩
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BibTex
titre
Gestion des résistances. L’importance des modalités de déploiement des substances
auteur
. Rex Consortium (resistance To Xenobiotics), Denis D. Bourguet, François F. Delmotte, Pierre Franck, Thomas Guillemaud, Xavier Reboud, Corinne C. Vacher, Anne Sophie A. S. Walker
article
Phytoma , 2013, 669, pp.10-14
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BibTex
titre
Development stage-dependent susceptibility of cocoa fruit to pod rot caused by Phytophthora megakarya.
auteur
P. Takam Soh, M. Ndoumbè-Nkeng, Ivan Sache, E.P. Ndong Nguema, H. Gwet, Joel Chadoeuf
article
European Journal of Plant Pathology, 2013, 135 (2), pp.363-370. ⟨10.1007/s10658-012-0092-4⟩
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titre
Heterogeneity of selection and the evolution of resistance
auteur
Denis D. Bourguet, François F. Delmotte, Pierre P. Franck, Thomas Guillemaud, Xavier Reboud, Corinne C. Vacher, Anne Sophie A. S. Walker
article
Trends in Ecology & Evolution, 2013, 28 (2), pp.110-118. ⟨10.1016/j.tree.2012.09.001⟩
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https://hal.science/hal-01000430/file/REX_Consortium1_1.pdf https://hal.science/hal-01000430/file/REX_Consortium2_2.pdf BibTex
titre
Screening of a Botrytis cinerea one-hybrid library reveals a Cys(2)His(2) transcription factor involved in the regulation of secondary metabolism gene clusters
auteur
Adeline A. Simon, Berengere B. Dalmais-Lenaers, Guillaume G. Morgant, Muriel Viaud
article
Fungal Genetics and Biology, 2013, 52, pp.9 - 19. ⟨10.1016/j.fgb.2013.01.006⟩
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titre
Fungicide resistance status in french populations of the wheat eyespot fungi Oculimacula acuformis and Oculimacula yallundae.
auteur
Pierre Leroux, Michel Gredt, Florent Remuson, Annie Micoud, Anne Sophie A. S. Walker
article
Pest Management Science, 2013, 69 (1), pp.15-26. ⟨10.1002/ps.3408⟩
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https://hal.science/hal-01190606/file/-%20Leroux%20-%202012%20-%20Pest%20Management%20Science%20-%20Wiley%20Online%20Library_1.htm BibTex
titre
A functional bikaverin biosynthesis gene cluster in rare strains of Botrytis cinerea is positively controlled by VELVET
auteur
Julia Schumacher, Angelique Gautier, Guillaume Morgant, Lena Studt, Paul Henri Ducrot, Pascal Le Pecheur, Saad Azeddine, Sabine, Helma Fillinger-David, Pierre Leroux, Bettina Tudzynski, Muriel Viaud
article
PLoS ONE, 2013, 8 (1), pp.e53729. ⟨10.1371/journal.pone.0053729⟩
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https://hal.science/hal-01190541/file/schumacher%20Plos%20One_1.pdf BibTex
titre
High levels of auto-infection in plant pathogens favour short latent periods: a theoretical approach
auteur
F van den Berg, Sebastien Gaucel, Christian Lannou, C.A. Gilligan
article
Evolutionary Ecology, 2013, 27 (2), pp.409-428. ⟨10.1007/s10682-012-9602-2⟩
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https://hal.science/hal-01190640/file/Van%20de%20berg%20EVOL%20ECOLO_1.pdf BibTex
titre
Impacts of plant growth and architecture on pathogen processes and their consequences for epidemic behaviour
auteur
Agnes Calonnec, Jean Baptiste Burie, Michel Langlais, Sébastien Guyader, Sébastien Saint-Jean, I. Sache, B. Tivoli
article
European Journal of Plant Pathology, 2013, 135 (3), pp.479-497. ⟨10.1007/s10658-012-0111-5⟩
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titre
Dynamics of adaptation in spatially heterogeneous metapopulations
auteur
Julien J. Papaix, Olivier David, Christian C. Lannou, Herve H. Monod
article
PLoS ONE, 2013, 8 (2), pp.1-15. ⟨10.1371/journal.pone.0054697⟩
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https://hal.science/hal-01000426/file/PapaixPLOSONE2013_1.pdf BibTex
titre
A Shared Biosynthetic Pathway for Botcinins and Botrylactones Revealed through Gene Deletions
auteur
Michelli M. Massaroli, Javier J. Moraga, Keyller K. Bastos Borges, Jacinto J. Ramirez-Fernandez, Muriel Viaud, Isidro I. Gonzalez Collado, Rosa R. Duran-Patron, Rosario R. Hernandez-Galan
article
ChemBioChem a European Journal of Chemical Biology, 2013, 14 (1), pp.132-136. ⟨10.1002/cbic.201200487⟩
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https://hal.science/hal-01001252/file/Massaroli%20VIAUD%202013_1.htm BibTex
titre
Fusariose des épis de blé. Le degré d'infection fonction de l'équilibre entre deux champignons.
auteur
Emmanuelle Gourdain, Christian Lannou
article
Perspectives Agricoles, 2013, Avril (399), pp.8-11
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https://hal.science/hal-01003328/file/Perspectives%20Agricoles%20399_1.pdf BibTex
titre
Activity of fungicides and modulators of membrane drug transporters in field strains of Botrytis cinerea displaying multidrug resistance
auteur
Pierre P. Leroux, Anne Sophie A. S. Walker
article
European Journal of Plant Pathology, 2013, 135 (4), pp.683 - 693. ⟨10.1007/s10658-012-0105-3⟩
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Conference papers

titre
Réduire les risques de sélection de résistances : de la théorie à la pratique, des pistes pour améliorer la durabilité des PPP
auteur
Christophe C. Delye, Anne Sophie A. S. Walker, Jacques Grosman
article
Journées d’Échanges sur les Résistances aux produits de protection des plantes 2013, Réseau de Réflexion et de Recherche sur les Résistances aux Pesticides (R4P). FRA., Oct 2013, Avignon, France. 45 p
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titre
Généralités sur la résistance aux Produits de Protection des Plantes (PPP)
auteur
Anne Sophie A. S. Walker, Christophe C. Delye
article
Journées d’Échanges sur les Résistances aux produits de protection des plantes 2013, Réseau de Réflexion et de Recherche sur les Résistances aux Pesticides (R4P). FRA., Oct 2013, Avignon, France. 45 p
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titre
R-SYST network : a French consortium for barcoding and species identification
auteur
Agnes Bouchez, Marc Buée, Philippe Chaumeil, Valerie Laval, Marion Le Saux, Marie-Anne Auger-Rozenberg, Alain Franc
article
Journées annuelles de la Société Française de Systématique : "Systématique et sciences participatives", Oct 2013, Paris, France. 1 p
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https://hal.science/hal-01209971/file/summary%20R-syst%20congres%20SFS%202012-2_1.pdf BibTex
titre
Insights into Colletotrichum hemibiotrophy from genome and transcriptome sequencing
auteur
Richard O'Connell, Stéphane Hacquard, Pamela Gan, Emiel Ver Loren van Themaat, Jochen Kleemann, Stefan Amyotte, Michael R Thon, Li-Jun Ma, Ken Shirasu, Lisa Vaillancourt
article
XI International Fungal Biology Conference, Sep 2013, Karlsruhe, Germany
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https://hal.inrae.fr/hal-02808987/file/OConnell%20IFB%20abstract_%7B66F6ABC0-2775-48B8-8F42-A8C712B9E388%7D_1.pdf BibTex
titre
Epidemiology and spread of Leptosphaeria species (phoma stem canker) on brassicas.
auteur
B. B. Fitt, D.J. D. Hughes, H.U. H. Stotz, B.A. B. Macdonald, Thierry T. Rouxel
article
10th International congress of plant pathology,, Aug 2013, Beijing, China. p.567
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https://hal.science/hal-01004247/file/ICPP2013%20CHINE_1.htm BibTex
titre
Quantification and interpretation of risk for security, trade, food and environment.
auteur
J.D. J. Mumford, Frederic F. Suffert, A.W. A. Leach, J. J. Holt, Ivan I. Sache, C. C. Le Fay-Souloy, M. M. Barbier, R.A. R. Hamilton
article
10th International Congress of Plant Pathology,, Aug 2013, Beijing, China. p.409
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https://hal.science/hal-01004310/file/Abstract%20of%20ICPP%202013-final_1.pdf BibTex
titre
Inferring the origin and trajectories of recent invasions of wheat yellow rust strains from worldwide population structrure
auteur
Sajid S. Ali, Jerome J. Enjalbert, Pierre P. Gladieux, Mogens Støvring M. S. Hovmøller, Claude C. Pope de Vallavieille
article
Borlaug Global Rust Initiative (BGRI) Technical Workshop, Aug 2013, New-Delhi, India
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https://hal.science/hal-01004260/file/BGRI%20Poster%202013%20Inde_1.pptx BibTex
titre
Expression patterns of candidate effector genes
auteur
Johann J. Confais
article
Mycosphaerella graminicola / Zymoseptoria tritici European Workshop, Aug 2013, Harpenden, United Kingdom
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titre
Evolution de la résistance basale à Botrytis cinerea au cours de la maturation de la baie
auteur
Benoît Poinssot, Jani-Petri Kelloniemi, Sophie Trouvelot, Marie-Claire Heloir, Lucie Trdá, Patrick Frettinger, Alberto Ferrarini, Victor Flors, Mathias Choquer, Marc Fermaud, Aline Simon, Jean-Marc Pradier, Berengere Dalmais, Muriel Viaud
article
1. Rencontre du Nouveau Réseau Vigne et Vins Septentrional (RVVS), Réseau Vigne et Vins Septentrional (RVVS). FRA., Jul 2013, Colmar, France. 116 p
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titre
Genetic and phenotypic characterization of Botrytis cinerea isolates from Chile with differet levels of strobilurin sensityvity.
auteur
Charleen C. Copier, Jaime J. Auger, Marlene M. Rosales, Anne Sophie A. S. Walker, Marcela M. Esterio
article
16th International Botrytis Symposium,, Jun 2013, Bari, Italy. p.51
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https://hal.science/hal-01001616/file/Congr%C3%A8s%20Botrytis%20Abstract%20Book%202013_1.pdf BibTex
titre
Towards a better understanding of Botrytis cinerea population genetics: how agricultural environments shaape population structure and consequences for disease management.
auteur
Anne Sophie A. S. Walker
article
16th International Botrytis Symposium,, Jun 2013, Bari, Italy
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https://hal.science/hal-01190680/file/Congr%C3%A8s%20Botrytis%20Abstract%20Book%202013_1.pdf BibTex
titre
Functional characterization of Bclae1 gene in Botrytis cinerea
auteur
José J J. J. Espino, Steffanie S. Traeger, Adeline A. Simon, Muriel Viaud, Julia J. Schumacher, Bettina B. Tudzynski
article
16th International Botrytis symposium,, Jun 2013, Bari, Italy. p.99
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https://hal.science/hal-01004236/file/Congr%C3%A8s%20Botrytis%20Abstract%20Book%202013_1.pdf BibTex
titre
The phytopathogenic fungus Botrytis pseudocinerea is resistant to the fungicide fenhexamid due to detoxification by a cytochrome P450 monooxygenase Cyp684.
auteur
Saad Azeddine, Alexis A. Billard, Jocelyne Bach, Catherine Lanen, Anne Sophie A. S. Walker, Danièle D. Debieu, Sabine, Helma Fillinger-David
article
16th International Botrytis Symposium,, Jun 2013, Bari, Italy
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https://hal.science/hal-01190844/file/Congr%C3%A8s%20Botrytis%20Abstract%20Book%202013_1.pdf BibTex
titre
Fungicide resistance in Botrytis cinerea: back and forth between field aspects and molecular mechanisms.
auteur
Anne Sophie A. S. Walker
article
16th International Botrytis Symposium,, Jun 2013, Bari, Italy. p.42
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https://hal.science/hal-01004714/file/Congr%C3%A8s%20Botrytis%20Abstract%20Book%202013_1.pdf BibTex
titre
Functional characterisation of two signal transduction genes identified by phosphoproteomics in Botrytis cinerea.
auteur
Colette Audeon, Marlène Davanture, Monica Miazzi, Michel Zivy, Sabine, Helma Fillinger-David
article
16th International Botrytis Symposium, Jun 2013, Bari, Italy. p.91
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https://hal.science/hal-01003338/file/Congr%C3%A8s%20Botrytis%20Abstract%20Book%202013_1.pdf BibTex
titre
An integrated and modular model for simulating and evaluating how canopy architecture can help reduce fungicide applications
auteur
Christian Fournier, Christophe Pradal, Mariem Abichou, Bruno Andrieu, Marie-Odile Bancal, Carole Bedos, Pierre Benoit, Camille Chambon, Romain Chapuis, Eric Cotteux, Laure Mamy, Neil Paveley, Valérie Pot, Sébastien Saint-Jean, Carole Sinfort, Claire Richard, Alexandra ter Halle, Eric van den Berg, Anne Sophie A. S. Walker, Corinne Robert
article
7th International Conference on Functional-Structural Plant Models, Jun 2013, Saariselkä, Finland. pp.345-348
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https://inria.hal.science/hal-00850818/file/FournierPradaletal2013.pdf BibTex
titre
Using 3D virtual plants to assess the control of splash dispersed diseases by wheat cultivar mixtures.
auteur
Christophe Gigot, Claude de Vallavieille-Pope, Marc M. Leconte, Claude Maumené, Laurent L. Huber, Sebastien Saint-Jean
article
7th International conference on functional-structural plant models (FSPM 2013),, Jun 2013, Saariselkâ, Finland
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https://hal.inrae.fr/hal-02746176/file/FSPM2013_Proceedings_book_format_1.pdf BibTex
titre
Deciphering plant fungal infection using comparative genomics.
auteur
Marc-Henri M.-H. Lebrun
article
5th Conference on Physiologyof Yeast and Filamentous Fungi,, Jun 2013, Montpellier, France
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https://hal.science/hal-01004307/file/Programme_PYFF5_20130516_1.pdf BibTex
titre
Using 3D virtual plants to evaluate the canopy role in the progression of a splash-dispersed crop disease: a case study based on wheat cultivar mixtures
auteur
C. Gigot, C. de Vallavieille-Pope, M. Leconte, C. Maumené, L. Huber, Sébastien Saint-Jean
article
7th International Conference on Functional-Structural Plant Models, Jun 2013, Saariselkä, Finland. pp.ISBN 978-951-651-408-9
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https://hal.science/hal-00908515/file/Gigot20136.pdf BibTex
titre
Dietary intake of plant proteins as a marker of diet quality in french adults
auteur
E. O. Verger, G. M. Camilleri, F. Huneau, F. Carpentier, C. Dubuisson, François Mariotti
article
Joint Nutrition Society, Belgian and French Nutrition Societies meeting, May 2013, Lille, France. pp.E323, ⟨10.1017/S0029665113003571⟩
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titre
Avantages évolutifs et adaptatifs de l'obésité génomique chez les champignons phytopathogènes.
auteur
Jonathan J. Grandaubert, Marie-Helene Balesdent, Thierry T. Rouxel
article
Séance du 15 Mai 2013 de la Société de Biologie "Génomique des champignons",, May 2013, Paris, France
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titre
Characterization of molecular mechanisms underlying the multi-drug-resistant phenotypes of Mycosphaerella graminicola field isolates
auteur
Selim Omrane, Anne Sophie A. S. Walker, Hind Sghyer, Catherine Lanen, Lamia Ouini, Gert Kema, Sabine, Helma Fillinger-David
article
Proceedings of the 17th International Reinhardsbrunn symposium on Modern Fungicides and Antifungal Compounds,, Apr 2013, Friedrichroda, Germany
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https://hal.science/hal-01189688/file/Scientific%20Program%2017th%20Reinhardsbrunn%202013-1_1.pdf BibTex
titre
From enzyme to fungal development or how sdhB mutations impact respiration, fungicide resistance and fitness in the grey mold agent Botrytis cinerea.
auteur
Anaïs A. Laleve, Anne Sophie A. S. Walker, Stéphanie S. Gamet, Valérie V. Toquin, Danièle D. Debieu, Sabine, Helma S. H. Fillinger-David
article
Proceedings of the 17th International Reinhardsbrunn Symposium on Modern Fungicides and Antifungal Compounds,, Apr 2013, Friedrichroda, Germany
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https://hal.science/hal-01004254/file/Scientific%20Program%2017th%20Reinhardsbrunn%202013-1_1.pdf BibTex
titre
The phytopathogenic fungus Botrytris pseudocinerea is resistant to the fungicide fenhexamid due to detoxification by a cytochrome P450.
auteur
Saad Azeddine, Alexis A. Billard, Jocelyne Bach, Catherine Lanen, Anne Sophie A. S. Walker, Sabine, Helma Fillinger-David, Danièle D. Debieu
article
Proceedings of the 17th International Reinhardsbrunn symposium on Modern Fungicides and Antifungal Compounds,, Apr 2013, Friedrichroda, Germany
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https://hal.science/hal-01189687/file/Scientific%20Program%2017th%20Reinhardsbrunn%202013-1_1.pdf BibTex
titre
Characterization of molecular mechanisms underlying the multi-drugresistant phenotypes of Mycosphaerella graminicola field isolates
auteur
Selim Omrane, Hind Sghyer, Catherine Lanen, L. Aouini, G. Kema, Anne Sophie A. S. Walker, Sabine, Helma Fillinger-David
article
17th International Reinhardsbrunn Symposium on Modern Fungicides and Antifungal Compounds, Apr 2013, Friedrichroda, Germany. p. 21
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BibTex
titre
Habitat and host-specific diffentiation in the multihost fungal pathogen Botryotinia fuckeliana and evidence for fungicide selection in populations.
auteur
Anne Sophie A. S. Walker, Elisabeth Fournier
article
17. International Reinhardsbrunn Symposium on Modern Fungicides and Antifungal Compounds,, Apr 2013, Friedrichroda, Germany
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https://hal.science/hal-01189689/file/Scientific%20Program%2017th%20Reinhardsbrunn%202013-1_1.pdf BibTex
titre
Plant and animal protein intakes are differently associated with nutrient adequacy in French adults
auteur
E.O. Verger, Géraldine M. G. M. Camilleri, Jean-François Huneau, Florence F. Carpentier, Carine C. Dubuisson, François Mariotti
article
Experimental Biology 2016 Meeting, Apr 2013, Boston, United States. Supplement 1075.2, ⟨10.1096/fj.1530-6860⟩
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titre
Pathogen evolution in agricultural landscapes: the role of the host spatial structure
auteur
Julien J. Papaix, Jeremy J. J. J. Burdon, Herve H. Monod, Christian C. Lannou, Peter H P. H. Thrall
article
Plant Industry Seminar, Apr 2013, Canberra, Australia
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BibTex
titre
Application of high-resolution melting analysis to genotype the AvrLm7 gene of Leptosphaeria maculans
auteur
J. J. Carpezat, Marie-Helene Balesdent, M. M. Leflon
article
Workshop RFSV, Mar 2013, angers, France
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https://hal.science/hal-01004246/file/Workshop%20RFSV%20Angers_1.htm BibTex
titre
Stabilité de QTL et de composantes de résistance adulte du blé tendre à la rouille jaune.
auteur
Axel Olivier, Gwenn Verplancke, Claude C. Pope de Vallavieille, Marc Leconte, Bernard Rolland, Sophie Paillard, Jean-Bruno Beaufume, Jayne Stragliati, Denis Beghin, Philippe Lonnet, Sébastien Cuvelier, Eric Margale, Patrice Senellart, Sébastien Caiveau, David Guiard, Françoise Dedryver-Person
article
FSOV 2008-2011,, Mar 2013, Paris, France
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https://hal.science/hal-01189718/file/synthese-colloque-fsov-2013-leger_1.pdf BibTex
titre
Evaluation de la résistance du blé à la septoriose provoquée par mycosphaerella graminicola
auteur
David Gouache, Delphine Hourcade, Marc-Henri Lebrun, Thierry Marcel, Lilian Gout, Aurélie Ducasse, Colette Audeon, Henriette Goyeau, Frederic Suffert, Christophe Michelet, Olivier Robert, Valerie Cadot, Smt Ghaffary, Gert Hj Kema
article
FSOV 2008-2011, Mar 2013, Paris, France
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https://hal.science/hal-01189757/file/colloque-FSOV-2013-_1.pdf BibTex
titre
Résistance partielle à la rouille brune : sources de résistance, utilisation en sélection et durabilité
auteur
Henriette Goyeau, Gustavo Azzimonti, Denis Beghin, Sébastien Caiveau, Philippe Du Cheyron, Michaël Cochard, Clément Debiton, Jean-Michel Delhaye, Sylvie Dutriez, Pascal Giraudeau, Mathieu Grare, Volker Lein, Christian Lannou, Philippe Lerebour, Philippe Lonnet, Thierry Marcel, Christophe Michelet, Jean-Michel Moreau, Axel Olivier, Sophie Paillard, Pierre Rigolle, Bernard Rolland, Patrice Sennellart, Jayne Stragliati, Stephen Sunderwirth
article
FSOV 2008-2011,, Mar 2013, Paris, France
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BibTex
titre
Light matters: The transcription factor LTF1 regulates virulence and light responses in the necrotrophic plant pathogen Botrytis cinerea.
auteur
Julia Schumacher, Adeline Simon, Kim Cohrs, Muriel Viaud, Paul Tudzynski
article
27th Fungal Genetics Conference, Mar 2013, Asilomar, United States. p.147
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https://hal.science/hal-01190655/file/FungalProgramBook2013_1.pdf BibTex
titre
Evolution of the pan-secretome among lineages of Magnaporthe oryzae attacking different host-plants
auteur
Elisabeth E. Fournier, E E. Ortega-Abboud, Ludovic L. Mallet, Helene H. Chiapello, Cyprien C. Guerin, Francois F. Rodolphe, Annie Gendrault-Jacquemard Gendrault, Jonathan J. Kreplak, Joelle J. Amselem, Marc Henri M. H. Lebrun, Thomas T. Kroj, D D. Tharreau
article
27th Fungal Genetics Conference, Mar 2013, Asilomar, United States. pp.281
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https://hal.science/hal-01001508/file/FungalProgramBook2013_1.pdf BibTex
titre
Transposon analysis and comparative genomics of the Leptosphaeria maculans-L. biglobosa species complex.
auteur
Jonathan Grandaubert, C.L. Schoch, H. Bohran, Barbara Howlett, Marie-Helene Balesdent, Thierry Rouxel
article
Dothideomycetes Comparative Genomics workshop 27th Fungal Genetics Conference at Asilomar, Mar 2013, Asilomar, United States
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https://hal.science/hal-01189707/file/Dothideomycetes%20Comparative%20Genomics_1.pdf BibTex
titre
Functional analysis of the Mps1 MAP kinase pathway in the rice blast fungus Magnaporthe orysae.
auteur
E. Grund, M.J. Gagey, V. Toquin, R. Beffa, N. Poussereau, Marc-Henri Lebrun
article
27th Fungal Genetics Conference,, Mar 2013, Asilomar, United States. p.179
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https://hal.science/hal-01190651/file/FungalProgramBook2013_1.pdf BibTex
titre
Genome evolution of fungal pathogens from the Magnaporthe oryzae/grisea clade.
auteur
Helene H. Chiapello, Ludovic Mallet Mallet, Cyprien C. Guerin, Gabriella G. Aguileta, Francois F. Rodolphe, Annie Gendrault-Jacquemard Gendrault, Jonathan J. Kreplak, Joelle J. Amselem, Enrique E. Ortega-Abboud, Marc-Henri M.-H. Lebrun, Didier D. Tharreau, Elisabeth E. Fournier
article
27th Fungal Genetics Conference - Asilomar Conference Grounds,, Mar 2013, Asilomar, United States. p.76
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https://hal.science/hal-01001510/file/FungalProgramBook2013_1.pdf BibTex
titre
The phytopathogenic fungus Botrytis pseudocinerea is resistant to the fungicide fenhexamid due to detoxification by a cytochrome P450.
auteur
Saad Azeddine, Alexis A. Billard, Jocelyne Bach, Catherine Lanen, Anne Sophie A. S. Walker, Sabine, Helma Fillinger-David, Danièle D. Debieu
article
27th Fungal Genetics Conference, Mar 2013, Asilomar, United States. p.125
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https://hal.science/hal-01190654/file/FungalProgramBook2013_1.pdf BibTex
titre
Characterization of molecular mechanisms underlying the multi-drug resistant phenotypes of Mycosphaerella graminicola field isolates.
auteur
Selim Omrane, Anne Sophie A. S. Walker, Hind Sghyer, Catherine Lanen, Lamia Aouini, Gert Keema, Sabine, Helma Fillinger-David
article
27th Fungal Genetics Conference, Mar 2013, Asilomar, United States. p.201
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01190656/file/FungalProgramBook2013_1.pdf BibTex
titre
From enzyme to fungal development or how sdhB mutations impact respiration, fungicide resistance and fitness in the grey mold agent Botrytis cinerea.
auteur
Anaïs Laleve, Anne Sophie A. S. Walker, Stéphanie Gamet, Valérie Toquin, Danièle D. Debieu, Sabine, Helma Fillinger-David
article
27th Fungal Genetics Conference, Mar 2013, Asilomar, United States. p.83
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01190653/file/FungalProgramBook2013_1.pdf BibTex
titre
Secondary metabolism in Botrytis cinerea: the grey and pink sides of a pathogen.
auteur
Muriel Viaud, Hind Sghyer, J. Schumacher, Adeline Simon, Berengere Dalmais-Lenaers, Jean-Marc Pradier
article
27th Fungal Genetics Conference, Mar 2013, Asilomar, United States. p. 89
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01190652/file/FungalProgramBook2013_1.pdf BibTex
titre
Efficiency of genetic resistance to wheat leaf rust in France.
auteur
Henriette H. Goyeau
article
United Kingdom Cereal Pathogen Virulence Survey. Stakeholders meeting,, Feb 2013, Cambridge, United Kingdom
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01004256/file/UKCPVS_2013_Invite%20Goyeau_1.pdf BibTex
titre
Dynamique évolutive des effecteurs chez les champignons phytopathogènes: re-séquençage de deux souches de Leptosphaeria maculans.
auteur
Jonathan J. Grandaubert, Marie-Helene Balesdent, Thierry T. Rouxel
article
Séminaire de restitution AIP Bioressources, Feb 2013, Paris, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01004296/file/AIP_programme1_Rouxel_1.pdf BibTex
titre
Les populations de Mycosphaerella graminicola s'adaptent-elles aux modifications saisonnières de leur environnement ?
auteur
Frederic F. Suffert, Ivan I. Sache, Virginie Ravigné
article
8. Réunion REID (Réseau Ecologie des Interactions Durables ), Feb 2013, Bordeaux, France. p.5
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https://hal.science/hal-01004712/file/Reunion_REID_Fevrier2013_1.pdf BibTex
titre
Récurrence interannuelle d'un champignon parasite obligatoire d'une culture annuelle
auteur
Ivan I. Sache, Julie J. Berder, Vincent V. Garreta, Henriette H. Goyeau, J. J. Moinard, Samuel S. Soubeyrand, Frederic F. Suffert
article
8ème Conférence du REID,, Feb 2013, Bordeaux, France. p.8
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https://hal.science/hal-01004713/file/Reunion_REID_Fevrier2013_1.pdf BibTex
titre
Gestion régionale des variétés résistantes (projet Gester).
auteur
Christian Lannou
article
Colloque Ecophyto Recherche, Jan 2013, Paris, France
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https://hal.science/hal-01189716/file/programme_ecophytorecherche_cle01d617_1.pdf BibTex
titre
From genes to molecules.Induction of silent biosynthetic pathway for the expansion of the metabolome in Botrytis cinerea.
auteur
Isidro G Collado, Muriel Viaud
article
16th International Botrytis symposium,, 2013, Bari, Italy
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https://hal.science/hal-01190846/file/Congr%C3%A8s%20Botrytis%20Abstract%20Book%202013_1.pdf BibTex

Book sections

titre
Effector of fungi and Oomycetes : their virulence and avirulence functions and translocation from pathogen to host cells
auteur
Thierry T. Rouxel, Brett M Tyler
article
Molecular Plant Immunity, John Wiley & Sons, Inc, 2013, 978-0-4709-5950-3
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titre
New multiplexing tools for reliable GMO detection
auteur
M. Pla, A. Nadal, V. Baeten, C. Bahrdt, G. Berben, Yves Bertheau, A. Coll, J.P van Dijk, D. Dobnik, J.A Fernandez Pierna, K. Gruden, S. Hamels, A. Holck, A. Holst-Jensen, E. Janssen, E.J. Kok, J.L La Paz, Valerie Laval, S. Leimanis, A. Malcevschi, N. Marmiroli, D. Morisset, T.W Prins, J. Remacle, G. Ujhelyi, D. Wulff
article
Genetically modified and non-genetically modified food supply chains: co-existence and traceability, Wiley-Blackwell, 686 p., 2013, 9781444337785. ⟨10.1002/9781118373781.ch19⟩
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titre
Towards detection of unknown GMOs
auteur
A. Holst-Jensen, K.G. Berdal, Yves Bertheau, M. Bohanec, J. Bohlin, Maher Chaouachi, K. Gruden, S. Hamels, E.J Kok, A. Krech, A.B Kristoffersen, Valerie Laval, S. Leimanis, M. Løvoll, D. Morisset, A. Németh, N. Papazova, T.W Prins, J. Remacle, P. Richl, T. Ruttink, I. Taverniers, T. Tengs, J.P van Dijk, D. Wulff, H. Zhang, M. Znidarsic
article
Genetically modified and non-genetically modified food supply chains: co-existence and traceability, Wiley-Blackwell, 686 p., 2013, 9781444337785. ⟨10.1002/9781118373781.ch20⟩
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Other publications

titre
R-Syst
auteur
Pierre Abad, Marie-Anne Auger-Rozenberg, Agnes Bouchez, Marc Buée, Thierry T. Candresse, Alain Franc, Serge Casaregola, Philippe Chaumeil, Bruno Fady, Eric Grenier, Valerie Laval, Geraldine Roux-Morabito, Jean-Claude Streito, Francois Rodolphe, Sophie Schbath, Jean Yves Rasplus, Frédéric Rimet, Thierry Mateille, Philippe Castagnone-Sereno
article
2013
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Patents

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Use of Colletotrichum tofieldiae for promoting plant growth
auteur
Richard O'Connell
article
Patent n° : EP 2 885 973 A1. 2013
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Poster communications

titre
Expression profiles of Mycosphaerella graminicola candidate effector genes
auteur
Johann J. Confais
article
effectome, Sep 2013, lauret, France. 2013
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titre
Characterization of seedling yellow rust resistance in wheat commercial cultivars, landraces and elite genotypes from Syria and lebanon.
auteur
R. El Amil, Marc Leconte, Claude C. Pope de Vallavieille, M.S. Hovmoller, O. Abdalla, K. Nazari
article
Borlaug Global Rust Initiative (BGRI) Technical Workshop,, Aug 2013, New Delhi, India. 2013
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https://hal.science/hal-01189686/file/BGRI%20Poster%202013%20Inde_1.pptx https://hal.science/hal-01189686/file/BGRI%20Poster%202013%20Inde_2.pptx BibTex
titre
How gene flow between wild and cultivated lettuce can influence the dynamic of adaptation of Bremia lactucae
auteur
Romain R. Valade, Brigitte B. Maisonneuve, Aurore Ducasse, R. Michelmore, Claire Neema
article
1. International Conference Wild Plant Pathosystems, Jul 2013, Olomouc, 2013
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https://hal.inrae.fr/hal-02746835/file/Valade_Maisonneuve%202013%20Wild%20Plant%20Pathosystems%20poster_1.pdf BibTex
titre
A new qPCR method for detection and quantification of Botrytis pseudocinerea in gray mold populations.
auteur
Saad Azeddine, Anne Sophie A. S. Walker, Annie Micoud, Sabine, Helma Fillinger-David, Severine Fontaine
article
16th International Botrytis Symposium,, Jun 2013, Bari, Italy. 2013
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https://hal.science/hal-01190843/file/Congr%C3%A8s%20Botrytis%20Abstract%20Book%202013_1.pdf BibTex
titre
From enzyme to fungal development or how sdhB mutations impact respiration, fungicide resistance and fitness in the grey mold agent Botrytis cinerea.
auteur
Anaïs Laleve, Anne Sophie A. S. Walker, Stephanie Gamet, Valerie Toquin, Danièle D. Debieu, Sabine, Helma Fillinger-David
article
16th International Botrytis Symposium,, Jun 2013, Bari, Italy. 2013
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https://hal.science/hal-01189758/file/Congr%C3%A8s%20Botrytis%20Abstract%20Book%202013_1.pdf BibTex
titre
Characterization of sources of resistance to leaf rust in durum wheat germplasm.
auteur
Henriette Goyeau
article
International Symposium Genetics and Breeding of Durum Wheat,, May 2013, Rome, Italy. 2013
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https://hal.science/hal-01190582/file/Scientific%20Programme%20-%20International%20Symposium%20-%20Genetics%20and%20Breeding%20of%20Durum%20Wheat%20-%20Rome%202013_1.htm BibTex
titre
Botrytis pseudocinerea is resistant to the fungicide fenhexamid due to detoxification by the cytochrome P450 monooxygenase CYP684
auteur
Saad Azeddine, Alexis A. Billard, Jocelyne Bach, Catherine Lanen, Anne Sophie A. S. Walker, Danièle D. Debieu, Sabine, Helma Fillinger-David
article
Proceedings of the 17th International Reinhardsbrunn symposium on Modern Fungicides and Antifungal Compounds,, Apr 2013, Friedrichroda, Germany. 2013
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https://hal.science/hal-01189690/file/Scientific%20Program%2017th%20Reinhardsbrunn%202013-1_1.pdf BibTex
titre
Regulation of the a-tubulin B-encoding gene during early development of the phytopathogenic fungus Botrytis cinerea.
auteur
Y. Faivre Talmey, I.R. Gonçalves, Adeline Simon, Muriel Viaud, C Bruel
article
27th Fungal Genetics Conference - Asilomar Conference Grounds,, Mar 2013, Asilomar, United States. 2013
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https://hal.science/hal-01190647/file/FungalProgramBook2013_1.pdf BibTex
titre
Carbohydrate binding proteins of two Leptosphaeria pathogens of Brassica napus.
auteur
Rohan G.T. Lowe, Bethany Clark, Angela van de Wouw, Andrew Cassin, Jonathan Grandaubert, Thierry Rouxel, Barbara Howlett
article
27. Fungal Genetics Conference, Mar 2013, Asilomar, United States. 2013