Publications HAL de la collection BIOTHE

2024

titre
Unravelling the bottom-up and top-down control of a worldwide chestnut tree pest invader through integrative ecological genomics
auteur
Jean-Loup Zitoun, Raphaël Rousseau, Joris Bertrand, Eve Toulza, Martin Rosalie, Sébastien Gourbière
article
2024
DOI
DOI : 10.1101/2024.11.23.624965
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https://hal.science/hal-04906547/file/2024.11.23.624965v1.full.pdf BibTex

2023

titre
On the use of chaotic dynamics for mobile network design and analysis: towards a trace data generator
auteur
Martin Rosalie, Serge Chaumette
article
Journal of Difference Equations and Applications, 2023, pp.1-18. ⟨10.1080/10236198.2023.2194452⟩
DOI
DOI : 10.1080/10236198.2023.2194452
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https://univ-perp.hal.science/hal-04102157/file/chaos_mobility.pdf BibTex
titre
Assessing the risk of West Nile Virus seasonal outbreaks and its vector control in an urbanizing bird community: An integrative R0-modelling study in the city of Merida, Mexico
auteur
Alheli Flores-Ferrer, Gerardo Suzán, Etienne Waleckx, Sébastien Gourbière
article
PLoS Neglected Tropical Diseases, 2023, 17 (5), pp.e0011340. ⟨10.1371/journal.pntd.0011340⟩
DOI
DOI : 10.1371/journal.pntd.0011340
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https://hal.science/hal-04905657/file/journal.pntd.0011340.pdf BibTex

2022

titre
Upon heat stress processing of ribosomal RNA precursors into mature rRNAs is compromised after cleavage at primary P site in Arabidopsis thaliana
auteur
T. Darriere, E. Jobet, D. Zavala, M.L. Escande, N. Durut, A. de Bures, F. Blanco-Herrera, E.A. Vidal, M. Rompais, C. Carapito, S. Gourbiere, J. Sáez-Vásquez
article
RNA Biology, 2022, 19 (1), pp.719 - 734. ⟨10.1080/15476286.2022.2071517⟩
DOI
DOI : 10.1080/15476286.2022.2071517
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2021

titre
Ecology, evolution, and epidemiology of zoonotic and vector-borne infectious diseases in French Guiana: Transdisciplinarity does matter to tackle new emerging threats
auteur
Benoît de Thoisy, Olivier Duron, Loïc Epelboin, Lise Musset, Philippe Quénel, Benjamin Roche, Florian Binetruy, Sébastien Briolant, Luisiane Carvalho, Agathe Chavy, Pierre Couppié, Magalie Pierre Demar, Maylis Douine, I. Dusfour, Sébastien Gourbière, Yanouk Epelboin, Claude Flamand, Alain Franc, Marine Ginouvès, Emeline Houël, Arthur Kocher, Anne Lavergne, Paul Le Turnier, Luana Mathieu, Jérôme Murienne, Mathieu Nacher, Roxane Schaub, Stéphane Pelleau, Ghislaine Prévot, Dominique Rousset, Emmanuel Roux, Stanislas Talaga, Pauline Thill, Sourakhata Tirera, Jean-François Guégan
article
Infection, Genetics and Evolution, 2021, 93, pp.104916. ⟨10.1016/j.meegid.2021.104916⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.meegid.2021.104916
pubmedId
Pubmed icone : 34004361
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https://pasteur.hal.science/pasteur-03261181/file/de%20Thoisy%20et%20al.%20-%202021%20-%20Ecology%2C%20evolution%2C%20and%20epidemiology%20of%20zoonotic%20a.pdf BibTex
titre
The Ecology of the Genome and the Dynamics of the Biological Dark Matter
auteur
Alheli Flores-Ferrer, Anne Nguyen, Sylvain Glémin, Jean-Marc Deragon, Olivier Panaud, Sébastien Gourbière
article
Journal of Theoretical Biology, 2021, 518, pp.110641. ⟨10.1016/j.jtbi.2021.110641⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.jtbi.2021.110641
pubmedId
Pubmed icone : 33640450
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https://hal.science/hal-03157289/file/Flores-Ferrer%20et%20al.%20-%202021%20-%20The%20Ecology%20of%20the%20Genome%20and%20the%20Dynamics%20of%20the%20.pdf BibTex

2020

titre
Virus-host coexistence in phytoplankton through the genomic lens
auteur
Sheree Yau, Marc Krasovec, L. Felipe Felipe Benites, Stéphane Rombauts, Mathieu Groussin, Emmelien Vancaester, Jean-Marc Aury, Evelyne Derelle, Yves Desdevises, Marie-Line Escande, Nigel Grimsley, Julie Guy, Hervé Moreau, Sophie Sanchez-Brosseau, Yves Y. van de Peer, Klaas Vandepoele, Sébastien Gourbière, Gwenael Piganeau
article
Science Advances , 2020, 6 (14), pp.eaay2587. ⟨10.1126/sciadv.aay2587⟩
DOI
DOI : 10.1126/sciadv.aay2587
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-02557501/file/eaay2587.full.pdf BibTex
titre
Bayesian optimisation to select Rössler system parameters used in Chaotic Ant Colony Optimisation for Coverage
auteur
Martin Rosalie, Emmanuel Kieffer, Matthias R Brust, Gregoire Danoy, Pascal Bouvry
article
Journal of computational science, 2020, 41, pp.101047. ⟨10.1016/j.jocs.2019.101047⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.jocs.2019.101047
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https://univ-perp.hal.science/hal-02421870/file/opti_cacoc_revision.pdf BibTex

2019

titre
Collision Avoidance Effects on the Mobility of a UAV Swarm Using Chaotic Ant Colony with Model Predictive Control
auteur
Jan Dentler, Martin Rosalie, Grégoire Danoy, Pascal Bouvry, Somasundar Kannan, Miguel Olivares-Mendez, Holger Voos
article
Journal of Intelligent and Robotic Systems, 2019, 93, pp.227-243. ⟨10.1007/s10846-018-0822-8⟩
DOI
DOI : 10.1007/s10846-018-0822-8
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https://hal.science/hal-01774001/file/dentler2018collision.pdf BibTex
titre
DACYCLEM: A decentralized algorithm for maximizing coverage and lifetime in a mobile wireless sensor network
auteur
Jean-Matthieu Etancelin, André Fabbri, Frédéric Guinand, Martin Rosalie
article
Ad Hoc Networks, 2019, 87, pp.174-187. ⟨10.1016/j.adhoc.2018.12.008⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.adhoc.2018.12.008
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https://hal.science/hal-01969591/file/main.pdf BibTex
titre
Trypanosoma cruzi transmission dynamics in a synanthropic and domesticated host community
auteur
Alheli Flores-Ferrer, Etienne Waleckx, Guilhem Rascalou, Eric Dumonteil, Sébastien Gourbière
article
PLoS Neglected Tropical Diseases, 2019, 13 (12), pp.e0007902. ⟨10.1371/journal.pntd.0007902⟩
DOI
DOI : 10.1371/journal.pntd.0007902
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https://univ-perp.hal.science/hal-02428680/file/journal.pntd.0007902.pdf BibTex

2018

titre
Detailed ecological associations of triatomines revealed by metabarcoding and next-generation sequencing: implications for triatomine behavior and Trypanosoma cruzi transmission cycles
auteur
E. Dumonteil, M.J. Ramírez, S. Pérez-Carrillo, C. Teh-Poot, C. Herrera, Sébastien Gourbière, Etienne Waleckx
article
Scientific Reports, 2018, 8 (1), art. 4140 [13 p.]. ⟨10.1038/s41598-018-22455-x⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41598-018-22455-x
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BibTex
titre
Evolutionary ecology of Chagas disease; what do we know and what do we need?
auteur
Alheli Flores-Ferrer, Olivier Marcou, Etienne Waleckx, Eric Dumonteil, Sébastien Gourbière
article
Evolutionary Applications, 2018, 11 (4), pp.470-487. ⟨10.1111/eva.12582⟩
DOI
DOI : 10.1111/eva.12582
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https://univ-perp.hal.science/hal-02435120/file/eva.12582.pdf BibTex
titre
Chaos-enhanced mobility models for multilevel swarms of UAVs
auteur
Martin Rosalie, Grégoire Danoy, Serge Chaumette, Pascal Bouvry
article
Swarm and Evolutionary Computation, 2018, ⟨10.1016/j.swevo.2018.01.002⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.swevo.2018.01.002
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https://hal.science/hal-01699298/file/asimut.pdf BibTex
titre
Non-randomized controlled trial of the long- term efficacy of an Ecohealth intervention against Chagas disease in Yucatan, Mexico
auteur
Etienne Waleckx, Silvia Pérez-Carrillo, Samuel Chávez-Lazo, Rafael Pasos-Alquicira, María Cámara-Heredia, Jesús Acuña-Lizama, Fernando Collí-Balám, Javier Cámara-Mejía, Maria Jesus Ramirez-Sierra, Vladimir Cruz-Chan, Miguel Rosado-Vallado, Santos Vazquez-Narvaez, Rosario Najera-Vazquez, Sébastien Gourbière, Eric Dumonteil
article
PLoS Neglected Tropical Diseases, 2018, 12 (7), pp.e0006605. ⟨10.1371/journal.pntd.0006605⟩
DOI
DOI : 10.1371/journal.pntd.0006605
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https://univ-perp.hal.science/hal-02433206/file/journal.pntd.0006605.pdf BibTex